4EI4A

Jak1 kinase (jh1 domain) in complex with compound 20
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
302
structure length
289
Chain Sequence
GDIVSEKKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKETVKDDRDSPVFWYAPECLMQSKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSNRTSFQNLIEGFEALLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Tyrosine-protein kinase JAK1
publication title Discovery and optimization of C-2 methyl imidazopyrrolopyridines as potent and orally bioavailable JAK1 inhibitors with selectivity over JAK2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 289
sequence length 302
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ei4A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ei4A01
5AM6A 3RCJA 3E64A 2HAKA 3I7CA 2OW3A 4D5HA 5L2WA 4XP2A 3G33A 2HXLA 1BI7A 2PMOX 3F69A 1Q24A 2XK6A 4KA3A 4QRCA 3JVSA 2IW9A 3PXKA 4R1YA 5TKDA 1TVOA 4YBJA 5ANIA 3PIYA 2HYYA 4AZSA 5CNOA 2GPHA 4IWOA 3G9NA 3QRTA 3UOKA 3EN4A 3KULA 1J7LA 5AUZA 5DT0A 4M8TA 4RJ7A 4BCGA 2JIVA 4FVRA 1I44A 5T3QA 3MDYA 3DKCA 3ZOSA 5HCZA 3V8WA 3OF0A 5K3YA 4G3GA 1NW1A 1WZYA 4DA5A 2BMCA 3FI4A 3NCZA 3MVHA 3NR9A 3QKMA 4MK0A 3O51A 3E8CA 4CRLA 2VTPA 1SVHA 2IVTA 4IX5A 1FMKA 4L43A 3ZZWA 1YI6A 1PXKA 3K3JA 3MJ2A 1FINA 4FVQA 3UO6A 3VS4A 3MIYA 2PMIA 3OCGA 4YJOA 1KV2A 4F99A 3FMJA 3ZO2A 2VAGA 5KMIA 3DNEA 3SRVA 4BDAA 5JQ8A 4FT3A 3VNTA 3PZHA 4RSSA 3E3BX 4C4FA 4O96A 4Z55A 4NYEA 4KWPA 3N51A 4DEDA 5HEZA 4B99A 2QVSE 5I3RA 4ONAA 5CU6A 4F7JA 2YIRA 4EL9A 3KF7A 3KGAA 5D7AA 4FIGA 5EW8A 4RVMA 3R8UA 4FG9A 3EL7A 5E7RA 3LFNA 3EIDA 3B8QA 1E1VA 3EFKA 4BBFA 3FC2A 4FIEA 4KRDA 5M4UA 1UKIA 4O81A 1H1SA 2FYSA 2XM9A 4O84A 3AGMA 4EOPA 2O64A 2ITUA 2CCIA 2PVFA 5FXSA 3RALA 1KOBA 2PZRA 4QTAA 4RFMA 2BALA 5BX0A 2CSNA 4LI5A 4LMNA 4OTRA 4F4PA 4QYEA 4DC2A 4IVCA 3FY0A 4BTFA 4LMUA 4L3JA 3CY3A 3HUBA 3F3WA 2R3LA 1CTPE 3QGWA 2XK8A 1H08A 3I1AA 3W2QA 3MY1A 5K5NA 3FXXA 2QOKA 4FEXA 5M07A 4E20A 4FNZA 3QQLA 4M68A 3EQHA 5CALA 3E92A 4AZEA 4E26A 4JX7A 5EDQA 5AV2A 3VJOA 4YO4A 4AA4A 4JAJA 2C5VA 2JDSA 4DEIA 3BYUA 3ZLWA 1VEBA 4JNWA 3C7QA 4P4CA 3VJNA 4I93A 4Q5EA 2ITVA 1PYXA 4RZVA 3W2SA 1E1XA 5EQYA 2R3GA 3ZC5A 3DK6A 3ZRMA 5ETIA 4MBJA 3GU8A 2B9HA 3PJ1A 1FGKA 4DE4A 5B2KA 4RRVA 4ASDA 3KRLA 3EHAA 2PL0A 3F3ZA 2R5TA 5HX6A 1WBNA 5J1WA 4QD6A 1YWRA 3LLAA 4AZFA 3UTOA 3VUHA 4FZFB 2R9SA 3G0EA 2G9XA 4JL9A 4DN5A 2YZLA 4PUZA 4AOTA 3DAEA 1MRVA 4JIAA 4OTIA 1BL7A 2R3KA 2J5EA 3LAUA 2QURA 4MHAA 2ESMA 3ZO1A 4NFNA 1U54B 3VUDA 4X7QA 1VJYA 2WMWA 2WNTA 3BZ3A 4MEDA 3OUKA 4XV2A 4BCHA 1NT2A 4DH8A 3SW4A 2UZEA 1PMEA 3UO4A 5EG3A 1K2PA 2WEVA 4BGGA 4O82A 3A8XA 5AR2A 2VNYA 3NUUA 1Q8TA 4R7BA 5DT4A 4JG7A 2JDRA 1SMHA 5KMMA 4FEWA 3PY1A 3VHKA 2OWBA 4OT5A 5JKGA 5IG1A 2OSCA 5AX9A 2BROA 5H3QA 2ZM4A 4ZTNA 3LXLA 5TOZA 3FLNC 4YZCA 2W5BA 3QD4A 4TKSA 4XP0A 4O7VA 2JKKA 4XOYA 2QO2A 5F9EA 4EHZA 1SNUA 3U6HA 3ZLYA 1KSWA 3KCKA 4BCQA 2Z8CA 3N9XA 4LM5A 1YWVA 2FA2A 2VO7A 3WBLA 4HVGA 5CU0A 4BDCA 4FR4A 4XYFA 2J0IA 3OFMA 1U5QA 1HCLA 1H4LA 4LQMA 1F3MC 1OKZA 3PDTA 3LFBA 4M97A 3BPRA 3BV2A 5KHWA 4TXCA 4L68A 5CWZA 3AT4A 5GJDA 4YJUA 3CSVA 4JXFA 1JWHA 2A2AA 1OIYA 4J96A 1RDQE 2YDIA 3PA4A 3KRJA 4RVTA 1IASA 1CKJA 4D5KA 4MYGA 3BEGA 4DINA 4RX9A 5CLPA 3ODYX 3UC4A 2CKPA 2YWVA 3SLSA 3R9HA 3N4VA 4AS0A 2Z7SA 4AFJA 3PTGA 2DS1A 5DMZA 2YN8A 5HE2A 4GU6A 4ACMA 4BYIA 4CT1A 2PVRA 4FIIA 3FMEA 4EH7A 3W2CA 1YXSA 5DR2A 2CMWA 3C4CA 4LRMA 1U5RA 4JBQA 3MPTA 4U44A 2PZIA 4APPA 3W8LA 4K8AA 4RIXA 5DPVA 4DITA 1QPEA 4ZLZA 3OVVA 3R0TA 5EYCA 4PL3A 1OKWA 4U80A 1PXJA 4FTNA 3BWFA 4AOJA 3OROA 4K6ZA 3UYSA 4C3PA 4ZZOA 5BPYA 2OIQA 5CVGA 1Q99A 4EZ3A 2H6DA 2C6DA 3UPZA 4GIIA 4DT9A 3SV0A 4PRJA 5ANGA 3LJ2A 3DY7A 3PG3A 3FI3A 1PW2A 5F20A 2FH9A 4LV5A 5AWMA 3NCGA 5AV1A 2YWPA 4R78A 3VAPA 3EQPA 2CHLA 2X9EA 3ZMMA 1L8TA 2OJJA 3F88A 4M7IA 2HCKA 5ETAA 3UIMA 3HMMA 3Q4TA 2O65A 3TKHA 1W0XC 4G9CA 2ONLC 2GNFA 3CEKA 3HP5A 4RLKA 4PMTA 3CC6A 4C4JA 4Q2AA 4IWPA 2X0GA 3OG7A 2C47A 2WTWA 2XNPA 1CKPA 5DHJA 4FBXA 4RIYA 3SDJA 4GG5A 2VWUA 4O7TA 4ZK5A 4X2GA 4HYIA 2IZUA 3ROCA 5K9IA 4ZSAA 3R04A 4PDYA 3VUGA 2A19B 4QPAA 3KXXA 4CV9A 5TE0A 1UNHA 2VWWA 3DB8A 3PLSA 5AIRA 1M17A 5IUHA 5BVDA 4I5MA 1QMZA 4C02A 1W98A 1HCKA 5B2MA 3NPCA 3DKOA 3EFWA 2F7ZE 1URWA 3HAVA 4GL9A 4LOQA 3V6SA 5E92A 2Q83A 3D5UA 4E4MA 4HOKA 5EHLA 2LAVA 3TUDA 1Q8YA 1ZZ2A 4V05A 1H24A 4ZS0A 3SW7A 2ZB0A 4D4RA 3D14A 3P9JA 4P90A 3ALNA 1Q5KA 4QMVA 3NMUF 2UVYA 3IDCA 4W8EA 2HENA 4JDHA 2OJ9A 2QG5A 3DV3A 1BKXA 3OHTA 4IW0A 4NKAA 3ZC6A 4EOJA 4PNIA 3NDMA 4C61A 4DH5A 4O7WA 3MYGA 5HD7A 3NAXA 5CYIA 2ZM1A 5CT7A 3VUMA 3ULIA 3C4FA 4ZAUA 2G15A 5DT3A 2VX1A 1JLUE 2W1EA 3PSDA 4TWOA 4BZDA 4U79A 4DTBA 4GK2A 2UVXA 4S2ZA 4RVKA 4DHFA 4QP7A 4FSZA 1KE9A 1Q8UA 3S2PA 3OBGA 1R78A 2OH0E 4FYOA 3JYAA 4G1WA 1B38A 5EDPA 3EKKA 5KMJA 4WNMA 2IN6A 1JBPE 2YIQA 3AD6A 2C6OA 1H0VA 1U59A 2W06A 2C5XA 2ZDTA 3L9PA 4JAIA 4KKHA 4QYHA 4AG8A 4ANQA 5AFVA 1UNLA 4DH3A 2EU9A 4GIHA 5IQDA 5EKOA 3GNIB 4C57A 5AR4A 2PE2A 4NM5A 2YLFA 3TWJA 2R3OA 3W33A 4DG3E 1YHSA 4BKYA 4GSBA 1IR3A 4TTHB 3HV7A 5HG7A 2XNEA 5AA8A 3RJCA 4QMQA 5CQUA 3QYZA 4HCVA 3P86A 4CRSA 2X39A 3KFAA 4CTBA 3NW5A 4N4SA 1Q8WA 5CT0A 5CZIA 3Q53A 2X2KA 4LUEA 2ZYBA 4AAAA 3D7TB 4II5A 4U8ZA 5CENA 3FKOA 4YLKA 3SQQA 3A4OX 3Q60A 4M84A 4WUNA 5IA5A 3NSZA 2QOLA 4FSRA 3HP2A 4IDVA 4G34A 3EFLA 4USEA 1S9JA 5I9XA 2YDJA 2WTCA 2YCFA 3MWUA 1O6LA 4O22A 3TN8A 1QPJA 2YISA 4I5PA 4H1JA 3NUSA 3PVUA 3PPZA 4BR3A 5KMKA 4LGHA 4I5CA 5LARA 5LVMA 2E9UA 1SVEA 4Z9LA 4IWQA 3HUCA 4XV1A 3QD3A 5ETCA 4X2NA 2PVKA 3DKFA 5FG8A 3O17A 4U42A 3DDQA 3Q04A 5I0BA 4LL5A 5IUIA 3SAYA 5H8BA 3UNKA 2OG8A 3OCBA 4X3FA 5M44A 1R0EA 4D9TA 3KXZA 4TYHB 4TZRA 2UW6A 5DEYA 4OTGA 3PPJA 3N4UA 5HD4A 3R9RA 3ULZA 3KK8A 3ORLA 3SX9A 2IVUA 4AW2A 2YACA 3HEGA 3Q9ZA 3VS7A 1FOTA 2DQ7X 3CTHA 3EWHA 2CGXA 4TPTA 3ANQA 3FL4A 5DR6A 3RNYA 2PMNX 4W4WA 4FMQA 2GQRA 4IANA 3BGZA 3KRRA 5LMAA 4E6CA 2OFVA 2P2IA 4L3PA 4ZSLA 3RZBA 3QTSA 4NUSA 4ZTRA 4EHGA 4IACA 1XH9A 1J1BA 1YXTA 3KMMA 4XX9A 4FK3A 4Q5HA 4TY1A 5JK3A 2I7QA 4QPSA 2PUNA 2ZOQA 3LKMA 2JBPA 4HGSA 3ZUVA 4FV1A 3QQHA 5ICPA 4RT7A 2F7EE 2R2PA 4D1SA 3NYVA 2XIKA 3A7FA 3NW7A 4PY1A 4WA9A 1WVXA 4AOIA 5KKRC 3HAMA 4F7SA 2X7FA 4YZBA 3PXRA 2XK7A 2YCSA 2GHGA 5E91A 5HLPA 4ZIMA 3UQGA 3WZJA 5E8YA 4NCTC 4B4LA 5CAQA 3VIDA 3UZRA 5L8LA 1GZOA 3TTJA 1FVVA 3GC9A 4YC3A 4XG7A 4F0IA 4USFA 4IAZA 4M13A 4QQCA 4YNEA 3TJCA 4ZY4A 3B2TA 3BQRA 3TNHA 3A99A 3FLQA 4J98A 3RPSA 3COMA 1R39A 5AV4A 1XH8A 1M2QA 4FTOA 5HBHA 4CT2A 1ZMWA 2JBOA 4IZ5A 4XJ0A 3TCPA 2XRWA 1S9IA 4I6FA 2UVZA 4PTGA 3ODZX 2YA9A 3AGLA 2O0UA 3GVUA 3II5A 4X0MA 5BVEA 3ZM9A 4F6WA 1PKGA 4IJ9A 4RQVA 2X9FA 4O0YA 2W0JA 4GYGA 2XIXA 3FLSA 3VVHA 4C2WA 2QOOA 4N6ZA 1H0WA 3HL7A 4DEEA 4FTMA 2WMBA 3QTQA 1ZOGA 2WGJA 2YIWA 4F64A 3CR0A 1TQMA 5IA2A 3BU3A 3V8SA 4QTDA 4JVGA 4QP1A 1E9HA 2Y8OA 1P4FA 1ZOEA 3UVRA 5KMNA 4ANNA 3V6RA 3SC1A 3VS6A 4QP2A 5J7BA 5JN2A 5IKWA 3S1HA 3G0FA 3R7EA 5CAPA 2I0VA 2C6EA 2ITWA 3BBWA 3BV3A 3QTZA 4GVAA 3DU8A 3HMNA 4U3YA 4ZY6A 2QU5A 3ORMA 3WIKA 4DLIA 4F1TA 2YAAA 2WO6A 1SZMA 2AYPA 4AN2A 2Y0AA 5L3AA 1OBDA 3CQUA 3C0GA 3PYYA 4FKLA 2JEDA 5AUTA 1ZXEA 4O0RA 4USDA 3LFCA 1OBGA 3SXSA 5LWMA 4U9AA 5GHVA 3GC8A 3WIGA 4JDKA 4R7IA 3GU5A 1H01A 3OS3A 3GXLA 5CTPA 4RFZA 2VWBA 3OW4A 4XOZA 3ZRLA 4LG4A 1CM8A 2J0KA 3V5QA 2UZVA 3IG7A 3ETAA 2JFMA 3WZUA 3KN6A 3PJ3A 4FKGA 3SGCA 1FMOE 3BX5A 1YXXA 2ZM3A 2P33A 3CQEA 4DEAA 4PL4A 5FM2A 3THBA 5IH5A 4EI4A 3PG1A 3W16A 4BHNA 4MD7E 1FBNA 4J53A 4IMYA 5A54A 2WEIA 2GHLA 4KIOA 4NW6A 1KOAA 2O3PA 2HK5A 3O50A 4XG6A 3ZXTA 3MH0A 4K18A 4CKIA 2BZJA 5HI2A 3PLAE 2OJIA 2VTLA 2V55A 4QYYA 4RGJA 4CCBA 3TV6A 3NLBA 1YOMA 3R63A 4FKOA 4FT5A 5HVJA 3UNZA 2OZOA 2ZAZA 3P79A 4HVSA 3MJ1A 4U0IA 4GT5A 2C68A 2WIHA 4I21A 2QOFA 3UMWA 5IQFA 3C0IA 5I9VA 3ZDUA 3EYGA 3OUNB 5BUIA 3NNUA 3RAKA 2EXEA 3CY2A 1F5QA 2JAMA 3VO3A 5JZNA 1K9AA 1FVRA 3LQ8A 4I5HA 1L3RE 1PYEA 5JGBA 4YJPA 4GW8A 4D2TA 4RQKA 2OJGA 3OOGA 1Y8YA 1J7IA 3BYSA 5E8SA 4XRJA 2BTRA 3Q9YA 2RFDA 3QWKA 5J8IA 3ZDIA 3H10A 1A9UA 1FPUA 4FV8A 4DLJA 3QCSA 1WCCA 4RIWB 3KB7A 3C13A 3Q4CA 4RWKA 4UEUA 5ANKA 2XNMA 3ZHPC 2CPKE 3LZBA 1SVGA 4AZTA 2XCKA 3HV3A 2OO8X 4F1OA 3GT8A 3TDVA 1Y57A 4FX3A 4D2PA 2W99B 4IAAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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