4EIQ | Genus

Total Genus 155

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	155
sequence length	528
structure length	514
Chain Sequence	NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDAMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Putative FAD-monooxygenase
publication title	An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes. pubmed doi rcsb
source organism	Lechevalieria aerocolonigenes
total genus	155
structure length	514
sequence length	528
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-04-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.9.50	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	4eiqA02
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4eiqA03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4eiqA01

3UKLA 1CJCA 4J31A 1GT8A 4HA6A 2JB1A 1VDCA 3DK4A 3D8XA 1GALA 3H8IA 3ATQA 3D1CA 4IVMB 4ZN0A 2VQ7A 3IHMA 5KOXA 3GDNA 2GAGB 4NTEA 1IUXA 1EL5A 2WESA 1PBEA 5FS6A 4REKA 3DK9A 3EF6A 3SGLA 2YLTA 3BHFA 3FPZA 2BXSA 2WDQA 4ECHA 2WPCA 1YQ3A 4OPUA 2R45A 4H2PA 1IJHA 1PJ6A 4H4UA 1GXFA 1IUWA 1E1MA 3ITJA 1PBBA 3QJ4A 4K8DA 2YWLA 3AEGA 2RGOA 3QFAA 3CNDA 2NPXA 4D03A 1NG3A 4APNA 1CBOA 2R0GA 1S2QA 4B1BA 4JY2A 2TMDA 3GSIA 4EM3A 1D5TA 1N4VA 3ADAB 3AEFA 3KKJA 2BS4A 1Q1RA 4BURA 3AEBA 3G5QA 3FMWA 1CC6A 5KOWA 4YWOA 1H7WA 4YTMA 3Q6JA 1NG4A 3M0OA 2Q0LA 1DNCA 4U8OA 1B4VA 2OALA 4X4JA 2ZBWA 2AAQA 1K4QA 2IIDA 3NYFA 5KVIA 4TLXA 3RP8A 1FL2A 4BK2A 3DA1A 4P9SA 2WP9A 1TRBA 2BCGG 2C70A 3NN6X 4A99A 1FCDA 2J3NA 2YLSA 4JDRA 1GRBA 2QAEA 3ZDNA 3ICSA 1H7XA 3EANA 3BI2A 2XVFA 1KDGA 3VR8A 5KWFA 1PXCA 3DJEA 1RSGA 3L1RA 3VQRA 5JCLA 4U8LA 3E1TA 4J34A 1FOHA 3B6DA 4LIIA 2WETA 4OPDA 3OC4A 1CJ2A 2BC0A 2UZZA 3NK1X 4DGKA 4C5OA 4A79A 1Q1WA 1E1KA 1NHSA 1PBCA 5L46A 2WDRA 1F3PA 3UTEA 4BV6A 1OJDA 2GMHA 2FJDA 2XLTA 4X9MA 4YSHA 3HZLA 3UCLA 1LJ1A 5J7XA 1GETA 1JEHA 1CC4A 4YSYA 2X50A 1E1NA 2FJEA 4YKFA 5GRTA 3AE6A 1VG0A 4K2XA 5JCIA 4H4RA 2GRTA 1D4EA 2GR0A 2XFOA 4JQ9A 1D4DA 4E0VA 2X3NA 3AEAA 4AP3A 2RGHA 2V5ZA 2YR6A 2RABA 2IVEA 2WQYA 3K30A 2ZZBA 3LXDA 1L0VA 5EB4A 1O94A 2JK6A 1XDIA 3CNPA 4A6NA 5HYMA 4H2QA 1FECA 1CHUA 1DOCA 3V3OA 3NLCA 2C3CA 2FJAA 1JU2A 4NTCA 1KNPA 2BACA 1KNRA 3UKKA 1GRFA 2WOVA 3NK2X 3AE3A 4CCRA 2YLZA 4OCGA 1KSSA 2Y6QA 4LA1A 3KD9A 4O5QA 2YLXA 1BZLA 1GTHA 1VQWA 2YG6A 4H4VA 2BS3A 2R46A 1GRGA 4H4QA 2YG4A 5CKUA 4A6NB 3G5SA 2QA2A 2YVJA 2R4JA 4KX6A 5IQ4A 2BABA 2Y6RA 1NEKA 2WBAA 1IUSA 3AE5A 2VOUA 3ISHA 2WS3A 5JCKA 3QSEA 4Z2TA 5EBKA 5U63A 4U8MA 4A65A 2OAMA 3II4A 4BK3A 2YR4A 1O5WA 1JRZA 2ACZA 2DKHA 3R9UA 4H4YA 5DBJA 2YVFA 5IPYA 3AEEA 3G5RA 4BK1A 2XVJA 3CPJG 3AD8B 4Y4NA 3ICTA 4U2LA 3NYCA 3DH9A 4GR1A 2I0ZA 2R4EA 3CNSA 1JNRA 4I58A 1V59A 3GD4A 2XFUA 1XHCA 2WPFA 4OPTA 2YQUA 4U8IA 1GRAA 3UP4A 1F8WA 3P4SA 5GSNA 2YLWA 4U8JA 5IQ1A 4YSZA 5HHFA 1E39A 4ICYA 3NH3X 2CVJA 4XWZA 3QVRA 4UP3A 2EQ6A 5HY5A 2V6OA 3UKQA 3UKAA 4A5LA 2XLSA 4IVOB 2YG5A 4YXDA 4CY8A 1ZDLA 2WU5A 4UDQA 3VRDB 3CPIG 1K0LA 1X31B 3GD3A 1K0IA 5KXJA 1ONFA 1S3BA 4EQWA 2C7GA 4GRTA 1DODA 3AD7B 4H4ZA 2GVCA 2QCUA 4Z26A 1KFYA 1QJDA 4C3YA 4YSXA 4UDRA 1YY5A 4DSHA 1GRHA 2WU2A 1QLBA 1NHPA 2XFQA 4NEVA 2GB0A 4Z44A 3P4PA 3BNUA 3CGDA 2BK3A 2X8GA 1PS9A 4AT0A 4Z2UA 1B5QA 1IUVA 1Y56A 1Z6LA 4U2TA 5FMHA 3EAOA 1OJ9A 1ZOYA 2C64A 1MOKA 2YVGA 3FBSA 1E1LA 1OJCA 2XYOA 5U1OA 2B7RA 2C76A 4I59A 2V3AA 4UDPA 3C4AA 2GMJA 3NIXA 1NENA 3I6DA 2YG3A 4CBQA 3S5WA 3V3NA 3PVCA 3AD9B 4PABA 3QFBA 3RP7A 1DJNA 1FEAA 1Y56B 2Q6UA 4AT2A 4H50A 4HB9A 1CL0A 3CGEA 4PAAA 4N9XA 3IHGA 2B7SA 2H88A 3AECA 2XVHA 3FIMB 2WP6A 2VVLG 3UKFA 3ZYXA 1LVLA 3GRTA 4TM0A 1NAAA 4JY3A 2GR1A 5BRTA 4RSLA 2ARDA 4CY6A 2C3DA 3GWDA 3GYJA 1F6MA 4MJWA 1PXBA 4H4PA 4ZCDA 1P2HA 5M0ZA 3RNMA 3GWFA 5TR3A 1PBDA 1ZMCA 3AE7A 3P4RA 1TDNA 2CDUA 4GCMA 2EQ8A 1JRYA 4K7ZA 5BUKA 3DGZA 1DJQA 2A89A 5BULA 1XPQA 1P2EA 4J33A 1GRTA 1LPFA 2Q0KA 3GRSA 1YKJA 2XDOA 5C2TA 2X8HA 4RG3A 2AR8A 3OZ2A 4AOXA 3IC9A 2X99A 1LQTA 1IUTA 1N4WA 2YM1A 1O95A 3NKSA 4U2SA 4AP1A 4K5RA 3NTAA 2XFNA 4H2NA 2WDVA 1PN0A 5FS9A 3UOYA 2C65A 2R0PA 4C3XA 1Q9IA 3AEDA 1H81A 4FK1C 4CNJA 3REDA 2JBVA 3B3RA 3URHA 4NZHA 3GYIA 3KA7A 5EOWA 1COYA 1TDKA 3BNMA 4FX9A 2GEWA 4OVIA 1H86A 3NG7X 3LJPA 2C66A 2BK4A 4EIQA 4Z24A 1S3EA 3VRAA 4B69A 1NPXA 3AE8A 2ZZCA 4XXGA 1JNZA 2O9ZA 2V61A 2VRLA 2HQMA 3KU9A 3KLJA 3LOVA 4A9WA 4DSGA 2BS2A 2C73A 3Q9TA 4H4TA 1GNDA 2VZ2A 2YR5A 2YM2A 3RP6A 5HXIA 1DXLA 1SEZA 2C72A 1H82A 1PBFA 1ZP0A 2JAEA 5JCMA 1DOEA 1D7YA 2H89A 4J57A 4B68A 4H4SA 1Y0PA 5KVHA 1H84A 1NHQA 1XANA 3LB8A 4USQA 1BKWA 3CIRA 2E5VA 4J56A 2W0HA 2BK5A 1S2YA 2GF3A 1CF3A 4EIPA 2NVKX 4ADWA 3QVPA 3ALLA 2VVLA 2Z5YA 2WHDA 4CNKA 2C67A 5ER0A 1B8SA 2DKIA 4K5SA 3WE0A 4H7UA 3QSSA 2XLPA 4Z25A 5FS8A 1ZX9A 3DJJA 1NHRA 3F8DA 3AE2A 2WEUA 3P4QA 3CGBA 4U8KA 4YKGA 1HYUA 2JB3A 3IF9A 1QO8A 5FS7A 3EPTA 2OA1A 3AXBA 3S61A 1FEBA 2GQWA 2PYXA 1YQ4A 2E1MA 3SM8A 4EMJA 2B76A 3VR9A 1NDAA 2APGA 3DGHA 3IWAA 3LZWA 4YTPA 3C96A 3DMEA 4KPRA 3L8KA 4TM1A 3M12A 1CC2A 1PXAA 3JSKA 3NRNA 1OJTA 1YQZA 2JB2A 3AYJA 2BA9A 3CPHG 4FK1A 1L9EA 3CGCA 2E4GA 1D4CA 3AE1A 1GREA 1DOBA 3KPFA 4OPGA 1ZOVA 4H4WA 1JOAA 4CRTA 4IA6A 3UOVA 3ALMA 3NT6A 4EMIA 2GQFA 4B63A 1LV0A 1KSUA 1N1PA 3ALJA 2FBWA 3AE9A 1ZKQA 3ATRA 3NHOX 4LU6A 3UTGA 3KVEA 4B67A 4YT0A 5U25A 1TDFA 3NYEA 1LQUA 4C74A 1L9DA 1OJAA 4USRA 1GV4A 4WX1A 1GERA 1GOSA 2XFPA 1JRXA 2JKCA 1BWCA 2OLNA 3F8RA 4OPIA 3I3LA 2BXRA 1L9CA 1D7LA 1H83A 3K7TA 1H6VA 4J36A 1EL8A 2XLUA 4U8PA 1UKVG 4B64A 1AOGA 4D04A 1ZK7A 2XVIA 1EBDA 4EQRA 2PHHA 1E6EA 3GMCA 3AYIA 3NGCX 1TDOA 1REOA 4Z2RA 3F8PA 4Y4LA 2B9XA 3DK8A 2VQBA 4B65A 2WP5A 2YAUA 1TYPA 4GDPA 2V3BA 5J60A 1IUUA 3NN0X 1PHHA 4J2WA 1VRQB 3LZXA 4U8NA 2QA1A 4ZCCA 1BF3A 1K0JA 2BYBA 1MO9A 1PJ5A 3UOXA 3NK0X 2CFYA 3BI5A 1GESA 4OPCA 2R0CA 4RG4A 5KRQA 3NTDA 1RP0A 3SQPA 4TLZA 3COXA 1E7PA 3ICRA 3AWIA 4OPLA 2RGJA 4XWRA 2R9ZA 2FJBA 1EL7A 2VVMA 2GR3A 2WOWA 2Z5XA 4IV9A 5M10A 3CNTA 4TM4A 5C3JA 4M52A 3V76A 1MXTA 1TYTA 4EM4A 2A87A 4TM3A 1KF6A 2XCGA 4C77A 2GR2A 4JNQA 3M13A 1W4XA 1GSNA 3RHAA 3K7QX 1BGNA 3UTHA 2WPEA 2OLOA 2YLRA 3UP5A 3AE4A 4Y4MA 4GF7A 3DJDA 3P1WA 3C4NA 3LADA 4GUVA 4IA5A 2XLRA 1RYIA 3ABVA 1PJ7A 3CN8A 4O5UA 2CULA 2GV8A 4WCTA 3QSMA 2A8XA 4H2RA 3P9UA 1BGJA 3CNJA 4JN9A 3UTFA 1GEUA 2AQJA 3AB1A 2GH5A 2BC1A 1F8RA 3PO7A 2EQ9A 3VRBA 4EQXA 5LV9A 4FDCB 1GTEA 1CJ3A 1ZMDA 1ZY8A 3BHKA 3SFEA 2B9WA 1B37A 1CJ4A 3NNEA 4BJYA 1M6IA 4DNAA 2B9YA 4BJZA 4YTNA 2XVEA 1PDHA 1VG9A 4CCQA 4Z43A 1LTXR 2YG7A 2TPRA 1TDEA 2C75A 3GMBA 2EQ7A 5EB5A 3AYLA 4GDEA 2IVDA 1ELIA 3H8LA 3FG2P 4NEWA 2ZZ0A 4H4XA 3CTYA 1N4UA 2VRMA 3GDPA 4X9NA 1EL9A 2F5ZA 1F8SA 5CQFA 4EQSA 4JNAA 2Q7VA 2WOIA 4AOSA 2BCPA 3DJGX 3O0HA 3H4KA 2X8CA 2GAHB 4EMWA 3PS9A 3T37A 3UKHA 4A7AA 1GPEA 3BI4A 4K22A 2V60A 4B66A 3SFDA 4NTDA 1M64A 3K7MX 5BVAA 3UOZA 5JCNA 3UKPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

4WR4A 1SK1A 2VIMA 1CJCA 3H8IA 1VF2A 1GALA 1YQ1A 4IVMB 4ZN0A 2GSQA 2VQ7A 5KOXA 3GDNA 2WESA 1Z3EA 3KP9A 1T4YA 3D4TA 4BVXA 1V40A 2VCTA 3T2YA 4ECHA 2VCXA 1I9DA 2CV4A 3LORA 1AIUA 1PBBA 2OBIA 2DMLA 2YWLA 1O8WA 2HZEA 4XRDA 3TB2A 2IMKA 4JR6A 5J3RA 1ZYEA 1T3BA 5AIXA 2VCVA 2HRFA 4EM3A 4N30A 1D5TA 3Q74A 4DSQA 1Q4JA 3KKJA 3G3EA 1H4OA 1OC9B 2DIZA 4E8EA 5KOWA 1SK0A 2C0GA 4K8MA 4DSRA 4YWOA 2Q0LA 1DNCA 1SJ6A 4G73A 3HD5A 1Z5YE 1K4QA 3UARA 3DA1A 4MDCA 1JZWA 1K3LA 3NN6X 3EMPA 3G7IA 3F9UA 2XVFA 5KWFA 4TR0A 5FWGA 1RSGA 4U8LA 3E1TA 3CXGA 3CYNA 2FWHA 4OWYA 2FLSA 3IDVA 3NK1X 1FO5A 4DGKA 4C5OA 4A79A 4YJFB 2FA4A 4QL7A 2DU8A 1F3PA 3CSHA 3H79A 2R3XA 3HZLA 4DEJA 3FR9A 1LJ1A 5IMDA 3UCLA 2V41A 2FJEA 3FYGA 3D5JA 4MZCA 3AE6A 2LUSA 1EEJA 4V2MA 3GV1A 2O89A 4K2XA 4ZBBA 5JCIA 2VOCA 5ECLB 1D4EA 5EVOA 3AEAA 3MYDA 4NPBA 5EB4A 3FW2A 1CQHA 3G9BA 1THXA 3F3RA 4H2QA 4F9ZA 4ZBDA 3V3OA 1DOCA 3NLCA 2YV7A 1TTZA 4EKZA 5ELAA 1WJKA 3NK2X 2YLZA 1BYEA 1KSSA 2OJLA 2YWIA 1YKCA 2YLXA 4ECBA 1K0OA 1GTHA 1WPIA 2R46A 3FR3A 5COHA 2H0GA 2QA2A 2R4JA 5IQ4A 5G1LA 1J08A 2WBAA 5JCKA 2VOUA 2WS3A 3QSEA 1NM3A 4Z2TA 3NIVA 4H4YA 5DBJA 2YVFA 5IPYA 1MDIA 2E0QA 3TJGA 2YJHA 3ICTA 1GNWA 1MD3A 3DH9A 1BX9A 2VD0A 1XBSA 4GSSA 2R4VA 1V2AA 2HXKA 3JCML 1XHCA 2WPFA 5ECHB 1GRAA 1F8WA 3HYWA 3PINA 1U3IA 5IQ1A 5HHFA 5IMZA 4ICYA 1E6BA 3NH3X 1SU9A 2XC2A 4UP3A 2GS3A 3NZNA 6GSXA 3KTLA 4A5LA 2GSTA 4IVOB 2YG5A 4YXDA 1ZDLA 4UDQA 1YZXA 3GD3A 2VUPA 4KUNA 1S3BA 2PN8A 5KN3A 3ZITA 5B6MA 3AD7B 4Z26A 3ZL5A 2WCIA 1ZYQB 1QLBA 1MTCA 1OC3A 2X49A 3L0HA 1GSSA 3CGDA 2QKEA 1X9MB 2BK3A 3EYTA 3TKSC 2DJJA 3HYPA 3U6VA 3MDKA 1B5QA 3EAOA 2H71A 1A0FA 4IELA 2C64A 1E1LA 3GTUA 3LXZA 3PR8A 2PERA 1AN9A 2F8AA 1JLVA 3S5WA 3PVCA 4PABA 3RP7A 2Q6UA 4H50A 4F0BA 4XS4A 2A4HA 3IHGA 5EY6A 4N9XA 3C73A 2A2SA 2XVHA 3FIMB 2WP6A 2QSIA 3GRTA 3D21A 5BRTA 2C3DA 4KE3A 4H4PA 2XBIA 1ZMCA 1TDNA 2H0HA 4OFNA 4GCMA 3IBHA 3A5WA 5J5NA 3IC8A 2AB6A 2XDOA 4RG3A 4A5PA 2IFQB 2DSAA 3ME8A 1PN0A 1USBA 2WJUA 1X5DA 1Q9IA 3AEDA 4FK1C 1SYXA 3ZIVA 5F0GA 5EOWA 3GYIA 1ON4A 1COYA 3HVNA 1TDKA 3RHBA 5GAPD 2GEWA 4OVIA 4K7OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4EIQA

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