4EOUA

Crystal structure of e. coli dihydrodipicolinate synthase with pyruvate and succinic semi-aldehyde bound in active site
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
292
structure length
291
Chain Sequence
MFTGSIVAIVTPMDEKGNVCRASLKKLIDYHVASGTSAIVSVGTTGESATLNHDEHADVVMMTLDLADGRIPVIAGTGANATAEAISLTQRFNDSGIVGCLTVTPYYNRPSQEGLYQHFKAIAEHTDLPQILYNVPSRTGCDLLPETVGRLAKVKNIIGIEATGNLTRVNQIKELVSDDFVLLSGDDASALDFMQLGGHGVISVTANVAARDMAQMCKLAAEGHFAEARVINQRLMPLHNKLFVEPNPIPVKWACKELGLVATDTLRLPMTPITDSGRETVRAALKHAGLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Dihydrodipicolinate synthase
publication title The crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from Escherichia coli with bound pyruvate and succinic acid semialdehyde: Unambiguous resolution of the stereochemistry of the condensation product.
pubmed doi rcsb
total genus 108
structure length 291
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.3.3.7: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase.
pdb deposition date 2012-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4eouA00
2NUXA 3H55A 4HPXA 4RZ6A 5HR7A 1WOBA 3LXCA 3R8RA 5KZEA 2R91A 4Z0JA 1SUXA 2QCDB 2Y61A 4BI7A 3RF9A 3MO7A 3P7YA 3TKFA 5AC7A 3TU9A 4CCDA 4CQAA 4GXMA 2J9ZA 4UNKA 4HPJA 3GXPA 3W1TA 2IQTA 1G4EA 1XL9A 3G1FA 3W1QA 4QSHA 3MHUA 2ZA2A 5CZJA 2I14A 3OHIA 3QPZA 3HG5A 3W7RA 2CW6A 1HL2A 2ZRYA 3G18A 3C4UA 4RLIA 1ZAIA 3PSVA 3GK0A 1N7KA 2QJIA 3DFSA 1H7OA 2EF9A 4TR9A 4JX5A 3S8HA 2YX0A 1KA9F 2H6RA 3QMRA 2V2DA 4YWIA 3I7QA 3IIVA 3EKLA 1ZHAA 3W7PA 4IJBA 3PB2A 1ME7A 1OYBA 4XTIA 1NVMA 2HTMA 4FNRA 4I7UA 3W22A 1X6UA 1ZJIA 3C3NA 2J88A 3LCXA 2ATMA 2DU2A 3LRKA 4AHQA 4M6QA 4C1KA 2WSRA 3PG9A 2QCEA 2VEMA 1VYSX 3W7GA 4A2RA 2JKPA 3QZEA 4Y96A 4WZHA 2ZZ5A 2Y7EA 3MP4A 4LNYA 5H91A 3W72A 3W83A 2XN2A 3G3MA 1G7VA 1XDLA 1OG0A 3MMTA 3PBUA 4CQ9A 3R12A 1A50A 2G96A 1NFBA 2B7OA 3DXIA 5AFDA 3QQ0A 3LI1A 1TJRA 2ZFAA 4A22A 2C1HA 5DELA 5E1QA 1F2JA 3EWUA 2HS8A 2EPHA 3DKLA 3I7SA 4WX2A 3LCFA 4BWLC 1ZAHA 2ZQ0A 4FF7A 4RXGA 4AH7A 3NA8A 1LP6A 3F1QA 3EX1A 1HO4A 1YADA 3OVPA 4FX7A 3DFTA 2R8WA 4RX0A 3W23A 4BI6A 4LV4A 1TPB1 3OVRA 3L2IA 3C52A 1M7OA 3MUXA 1JJKA 4PL1A 3UWZA 4WY0B 3DFNA 2Q3OA 1JQVA 4ZQMA 4E0CA 3R89A 1XI3A 2G95A 1G67A 3LCLA 1WXJA 4JR5A 3R5EA 2YSWA 2A0NA 2RH9A 3PSWA 5D2WA 1C29A 3T44A 3PVFA 1LRTA 3P80A 1EWDA 3EB2A 3W1UA 4LW7A 5F1VA 4JD4A 1U5JA 3E0IA 5DXXA 3B04A 1H1ZA 1Z48A 2X1TA 2YW4A 3EEGA 1PV8A 2P0OA 4C1LA 2WOQA 3M44A 3S42A 1GVSA 5HUOA 2WQPA 2QEZA 4MVAA 4UTJA 3GDRA 5G2HA 5C55A 4LS0A 3K30A 3P62A 2Z2UA 5ABTA 2VFEA 3GLCA 3LXBA 2A7PA 1LOQA 3CIWA 2Q8LA 5D09A 3N9RA 4O53A 1EP2A 3MHFA 2YZRA 2VKZG 4UIOA 3G1YA 3KAOA 4WUIA 5BRBA 3L9CA 1KFEA 3QW4B 3BW3A 4J9JA 1TPC1 2V5BA 4GE8A 4LOCA 1VCGA 2W0UA 3BG3A 4O1BA 1OYAA 1VR6A 2A6NA 1IXQA 2YYUA 1OYCA 4A21A 3KXQA 3EWXA 3W2NA 1DV7A 3CWNA 3N14A 3NNTA 4Z1DA 4L4MA 3VI2A 4RXFA 3LBCA 4CCCA 4OQVA 3O63A 2CLOA 1CI1A 2X1RA 1TPH1 4ADTA 3HOJA 2BXVA 3HGOA 2B7NA 2YDAA 3DU0A 1LLZA 3W9ZA 1V5XA 1FY6A 4JNMA 2J24A 4GNJA 3CT7A 1G69A 3MI2A 3QPYA 4DO6A 1LLWA 2G5WA 4LRTA 2VOMA 4NUWA 1LRQA 2LLEA 1QOPA 4U28A 1JCMP 1W3IA 3L0GA 3L0NA 2GVGA 1O94A 4UC5A 1YLVA 1XCFA 2O7QA 3QH2A 1H7PA 3MI3A 5SWUA 4HNTA 4XWUA 4YMZA 2FFCA 1C9DA 5CPOA 4PH6A 1J2WA 3B06A 3RNDA 4ZMGA 5DCDA 4RR4A 3MYPA 3W2KA 1FUYA 2QCCA 3G1XA 2NWSA 4GBUA 3MBFA 5D02A 5FF2A 2BWGA 4MJZA 3QYQA 2VEIA 3LCGA 3Q58A 3B03A 1XUZA 4FNSA 2QCFA 3TE9A 1FDZA 1S5VA 4HSOA 3TQ0A 3NQAA 3NZ1A 3W76A 1FWNA 3C2VA 3AO0A 1SFLA 4MLJA 3OEXA 3BG5A 4ZQCA 4AWUA 3PAJA 1K7XA 2DZSA 3QC3A 4FNUA 4WY0A 3GR7A 2QJGA 2E09A 3WK0A 3TSBA 5LNUA 2CZDA 4O54A 3W1RA 1SO3A 4DO4A 4CNPA 4Z0SA 4Z1BA 2VEKA 2H3DA 4YLWA 1M6JA 2DZVA 1EA0A 2QR6A 1KM4A 3KRZA 3KVJA 1WV2A 1MEHA 3HG4A 1UJPA 3LB0A 4JTIA 1YTEA 3GXTA 1W31A 2VFIA 2FQIA 3MJYA 1BKSA 4HT3A 3GAYA 1SO4A 1OFDA 3SI9A 4WJEA 4NZJA 4TMBA 3A21A 2WNZA 3HPXA 3KRSA 3LHVA 2H8ZA 3TROA 1JVNA 3EX2A 1HTIA 2W79A 3CPRA 3HG3A 5DY2A 1D3GA 4WOQA 1KLYA 2J6XA 4O1DA 4FEZA 1JCLA 2ATSA 4N9DA 3LGEA 4WD0A 2CLEA 2V2HA 3LOTA 3LRMA 2A1YA 5EY5A 3PUOA 2ZA3A 5I3IA 1F76A 2NX9A 2C15A 1T0OA 1FX6A 3IEBA 4O11A 4XBSA 4LVBA 1JULA 4GJ1A 4LC8A 4CNNA 3CTLA 3NQMA 1DHPA 3PC0A 1S3HA 1C8VA 2P1FA 1H7XA 3T4CA 5AHFA 5D2VA 1O5XA 3PB0A 4UFIA 5J5RA 2V9DA 4RCXA 3LRLA 2JBMA 3G1VA 3SR7A 1Z44A 4LTSA 1VRDA 2JGYA 5A5WA 1W3TA 4DBEA 1W5OA 2ABAA 4UFLA 2DZTA 5EL1A 5DLCA 3P8IA 3W7EA 1HG3A 4O4VA 1L2UA 1OVDA 3QFEA 1ZY9A 5L9FA 3WJSA 2FPTA 3P82A 5KMYA 1W8SA 5I3FA 3G24A 4JTGA 4P61A 1TIMA 3HQ1A 4O14A 1YTDA 4BWLA 1GPWA 4JX4A 3QEZA 5AYZA 4AXKA 3W7IA 2QUTA 1OFRA 1IGSA 3GYEA 5BMWA 1YPIA 3KVLA 4CCEA 1YXDA 2C0AA 1DJNA 5BOOA 5HUPA 2D73A 3LX9A 3LDVA 2Y88A 3W75A 5F4SA 1F7BA 4UTUA 2Z6JA 4IMCA 5I3GA 2NXHA 2OT0A 3IIXA 1YTKA 1ICPA 4O1CA 4O0ZA 2QCHA 1A53A 2QCMA 2Z1BA 1KM5A 1Z42A 4E2DA 4RJEA 2QAFA 3FIGA 1OABA 3CIXA 1EWEA 3P61A 2OT1A 4LV9A 4I9AA 3MP5A 2PC4A 2ZZ3A 1GQNA 3STCA 3A5FA 5LHFA 3NQGA 3S5ZA 1ZFJA 2Y89A 1LORA 3EXTA 1W54A 3M41A 3PULA 1PS9A 2C19A 3G1AA 1DBTA 1W1ZA 3DFPA 4S2CA 4A3UA 5IBXC 1RPXA 4LVAA 5CSSA 1LM1A 1SZEA 4YCOA 1TRIA 3SFKA 3PBWA 4U4MA 4QITA 3O8AA 4S2BA 2GQAA 3SIZA 4K37A 5FF7A 5BNKA 4JTUA 3W85A 3G0UA 5AYYA 4O57A 4RK8A 1AW1A 4OV4A 2CZEA 3HF3A 1F73A 2CLFA 1FXPA 4JTLA 3Q94A 1THFD 5E0KA 5G4WA 2YFOA 2E5CA 3NL5A 5TBOA 5LKYA 1DL3A 1FDJA 2QCGA 3W6YA 2VFHA 1VJIA 1DORA 5CZSA 1LROA 3A24A 1L6WA 3GIYA 3W73A 3TX9A 1I2RA 4MJMA 5EA9A 2XN0A 4AVFA 1VLIA 4M19A 3DENA 4GUGA 1W3NA 2BTMA 2OJPA 2R14A 3IV3A 4YL2A 4FX6M 2A6LA 2XFWA 5LSMA 3NXFA 1ML1A 3JRKA 5F1UA 4JTSA 5A8GA 1KFBA 3FA5A 3S5NA 1Q6OA 2P10A 1SZFA 1R2TA 1WA3A 2ZRWA 3JS3A 3TC6A 3FKRA 4S1FA 1UASA 3RLUA 1TYGA 2NXIA 4DELA 4QISA 1I2OA 2TSYA 4DXVA 3F4WA 2V5LA 1KW1A 3TAOA 4ZVJA 3USBA 3UQNA 2CLHA 1A5BA 2PRMA 2C6QA 5HINA 1W0MA 1VH7A 1OFBA 3THAA 1GWJA 1TTIA 2FTPA 3I68A 2KZHA 1SO5A 3NPVA 4O28A 2E6DA 2VELA 3O15A 4YCPA 3FEMA 4ZQPA 3LV6A 3IGUA 5D33A 3W2LA 1LOLA 1P0KA 4KFNA 4X9SA 4NJKA 5HQEA 2X30A 1AL8A 3M5VA 2Q3RA 4LU0A 3KFTA 2WNNA 3NR0A 4DO5A 4MUZA 1O60A 3ELFA 1BWLA 2PRLA 4UTWC 3N3MA 1QPNA 5KZDA 1TPWA 4O50A 3UXAA 3S0CA 2YPIA 3IVTA 2V81A 4FXRA 3TFXA 4ICNA 1X1ZA 1LYXA 3LCIA 1DQXA 5LNSA 2EAWA 4N2YA 3P60A 3PS7A 4CQ8A 3W87A 1LBLA 5HR6A 1FQ0A 1MO0A 4NJHA 3SGUA 3N2MA 3DFQA 4AMAA 1MSSA 1VYRA 4IWWA 3PBVA 1XFBA 5CG7A 1W56A 2H90A 3TMLA 1DJQA 2NUWA 4QNWA 3BVJA 1MZHA 3C0JA 4K7VA 2WSQA 4FB7A 4AEOA 3DI1A 3KRUA 4KFOA 1EPXA 4LUIA 2E1DA 3F4NA 4IMDA 2C3ZA 2DP3A 3RFAA 5D37A 3LHTA 5K3VA 4ZZ9A 3TQVA 4HNVA 1QDSA 3S5YA 4LC6A 3RLVA 4MYAA 4CLMA 3KHJA 3VFLA 4BI5A 4ML9A 3FYPA 3PWAA 4AF0A 3LCHA 1TPFA 3JR2A 4N02A 1KM2A 1B57A 3N9SA 3BO9A 1LDCA 3KVKA 5F4WA 5K4XA 1A5AA 2Y85A 4UR8A 1B4EA 4IPIA 5AYXA 2QDGA 3ABOA 3W7CA 3P74A 4OU1A 4QIUA 3G1HA 4Z1CA 3FLUA 3LXAA 4TIMA 2CZFA 3E96A 5G5IA 4R53A 2GOUA 4O16A 8TIMA 3G1SA 3CU2A 4PTNA 2A85A 1TCDA 2FPVA 3P81A 3WK1A 4XQ6A 2QCLA 1OF8A 3LCWA 4JTFA 1PCKA 2Q8ZA 3GR8A 3M7WA 2E5DA 1VHNA 3TJLA 3L0KA 1SW3A 3NM1A 3S1WA 3GDLA 1LBMA 3TAKA 1K7EA 5L6UA 4XZ9A 1OFQA 1FCBA 4QQ3A 5DCEA 4BF9A 1I2QA 1QCWA 3LTPA 3TJXA 5F2MA 5LNWA 3TH6A 1OFPA 3LLFA 3UNDA 2VFGA 1F05A 1XXXA 3HGJA 3W88A 3IGSA 4LRSA 1GZGA 5MHBA 1A5SA 4BFAA 2DJXA 3B05A 4OE7A 3W07A 4KKXA 3KX6A 1OX4B 2C16A 3SSJA 1PL9A 3EX3A 3G22A 5IBXA 4JIPA 1I2PA 2ISVA 4JYDA 1JCXA 1BTMA 3UWUA 5FEXA 2GJNA 1H61A 1TPVA 1GEQA 3B0VC 1AMKA 5CZ0A 3C56A 3DH7A 3E49A 3SY5A 4NX0A 2NZLA 1TV7A 1CX9A 3YPIA 2E5BA 1Q3NA 3DHFA 1OJXA 5FEZA 3TW6A 1HO1A 2I1OA 5C54A 2WV8A 1ICSA 3E9AA 3NAVA 1B3OA 4KWVA 4W9TA 4KWWA 4K7YA 1FWSA 1RD5A 2TPSA 4FX8A 4R34A 1LCOA 3GNDA 4ZQNA 1UUMA 3GDTA 4Y6GA 3BK0A 4GUJA 3HG2A 1QNVA 3NQVA 4CNOA 4M7TA 1J4EA 1MEWA 4OHQA 3TMQA 4JTKA 2F84A 1SO6A 2B4GA 3DKJA 3NM3A 4JN6A 4RV8A 2WJZA 2RDUA 1VCVA 4IX2A 1TPUA 4H6KA 3L5MA 1TTPA 5DY3A 3H53A 2AQWA 3PUDA 1VCFA 3GAKA 4KFPA 1LOSA 1TREA 4PEKA 3G8RA 1KFLA 4IXXA 4O10A 2ZA1A 1L9WA 1IIGA 1KM1A 3L5LA 4JIQA 2V2CA 4DBDA 2WO5A 5K9DA 4A2SA 4TMCA 3NOEA 4H3DA 1LRNA 1ZAJA 1FWWA 3O05A 3TQKA 4TO8A 3W1LA 5G2IA 1H7NA 1G6CA 1GVFA 5G4EA 1BWKA 2NWRA 3NEVA 4OV9A 3M5ZA 1YXCA 1JQXA 3DGRA 5AB3A 4N6EA 1KTCA 4JS3A 4K8EA 5D04C 1TPDA 4LY8A 3L67A 4PFMA 3Q37A 4NJJA 3C6CA 5CPNA 1VGAA 1SZNA 1JCYA 1GG0A 4HIBA 4GRSA 3MP3A 3NL6A 2AAMA 3O16A 1ZCOA 1KTBA 1LBFA 3BGJA 5HWNA 3L21A 1HUVA 1NF7A 2VC6A 1IIHA 2CZ5A 3CWOX 1SR9A 1YYAA 3FOKA 4UTWA 3NDOA 2CLMA 1PHWA 4FXSA 3QJAA 2QJHA 4MIMA 3WJXA 4MY8A 2DZXA 4UMAA 5D38A 1GTEA 3OG3A 1R2RA 4NJGA 1JRBA 3CQ0A 3FJLA 1SSDA 1VQTA 2GVLA 1OX4A 4DF0A 1K03A 1SQ7A 3M9YA 1G7UA 3I6RA 4M7SA 2BX7A 3N34A 3EX6A 3NG3A 4IUOA 4XKYA 2ZZ2A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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