4EVZ | Genus

Total Genus 79

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	79
sequence length	258
structure length	254
Chain Sequence	MLAKRIIPCLDVKDGRVVKGNLRDAGDPVELAARYDEEGADELVFLDITASHEGRETMLEVVERTAEQVFIPLTVGGGIRSVEDASRLLRAGADKVSINTAAVKNPELITEAAEEFGSQAVVVAIDAKRVGGGWEVFTHGGRKPTGLDAVEWARKVVELGAGEILLTSMDRDGTKAGYDLELTRAVSEAVSVPVIASGGAGELEHFAEVFELEGADAALAASIFHFGEITIREVKAYLRERGIEVRLEHHHHHH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	HisF-LUCA
publication title	Evidence for the existence of elaborate enzyme complexes in the Paleoarchean era. pubmed doi rcsb
total genus	79
structure length	254
sequence length	258
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-04-26

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4evzA00

4KFNA 1GT8A 4ADTA 4BI6A 2G95A 3O1NA 5G5IA 5GVJA 3MYOA 5BMXA 4X3ZA 3VI2A 4N6EA 1OF6A 3R5EA 5I3JA 1F6KA 5HWMA 4NJKA 5I3KA 1WBJA 1IXOA 4EF9A 4AWSA 1F73A 1OVDA 2QJHA 3KFTA 4ZQPA 4UTKA 3ATZA 2A6NA 3GLCA 4LY8A 5CPNA 1AW1A 4JXCA 2QCDB 4R53A 1DHPA 2CLLA 3M0ZA 3ELFA 3HQ1A 2PRLA 4O13A 3TJXA 3IV3A 3SECA 5D2YA 4CQ8A 3NL2A 3TH6A 1EIXA 3C2RA 1X1OA 4JTGA 4M5PA 4DELA 2A6LA 3F4NA 1FUYA 2C18A 1XBZA 3R89A 3T78A 3PBWA 2J24A 4BF9A 4RK8A 2GUUA 3NG3A 2C15A 2E68A 4DPPA 1TTQA 3G1DA 3M9YA 4YCPA 5A5WA 3WK1A 3VNDA 2A7RA 2G96A 3W7NA 1DORA 2CW6A 3TC7A 3PC0A 3G3DA 2CZ5A 4UCGA 4LS1A 5D2VA 2Y7GA 1JCMP 2WV8A 1F74A 3HPXA 1VZWA 1DBTA 3LXAA 1ME8A 2BWGA 2Y6ZA 3LERA 4CCEA 2H3BA 5J5DA 4LVDA 2Q3RA 3W7QA 3S9YA 1WYIA 1LYXA 4MKNA 4AF0A 4LVFA 3L0KA 5K9CA 3BK0A 1G7VA 3DGRA 2Y61A 5C2XA 3PUOA 2WSYA 2DU2A 3GB6A 3OG3A 1S3HA 2FTPA 3LHYA 4K6AA 2JKAA 2Q8LA 2E5DA 3C2EA 3RMJA 1Z42A 1W5QA 1XUUA 1FX6A 1SW0A 1W1ZA 1TQXA 1Q6OA 2FLIA 2FQIA 3B06A 3A22A 4GUIA 3PB0A 5F2IA 2V8ZA 3KVJA 3W84A 1KFLA 4YLWA 4FF7A 3QQ0A 1H7NA 4K7VA 1VLIA 3OVRA 2A21A 2TYSA 5D30A 3P60A 2HS6A 4BI7A 1F05A 2QCNA 4I7UA 4CQ9A 1KFBA 2GQ9A 1YADA 5D05A 1DL3A 3W7JA 1EA0A 3W3OA 2FIQA 2G97A 4MZ1A 2E77A 3S5OA 1KW1A 1KBIA 2H90A 2ZZ2A 2NUWA 1I2OA 4PODA 3NQ7A 3MBFA 4XUGA 5HR7A 4MLJA 4WOZA 2DZPA 1C9DA 1TV8A 2OMAA 4JTUA 2DORA 3GDMA 1BWLA 3T44A 1QWGA 3I65A 5EPDA 4MY8A 1Y0EA 3P61A 4X22A 3AO0A 3SR7A 4BWLA 2ZRYA 1YPIA 4H3DA 3NPUA 1GTHA 1G7UA 1VC4A 3NNTA 3P5ZA 3FEMA 2B7PA 4IUOA 3R2GA 4PH6A 3LI1A 3GXNA 3CU2A 3SGZA 5T26A 3W1LA 4NJHA 1LLWA 1SFLA 2R14A 1D3GA 4IPIA 4HNUA 3ABSA 5C5YA 2YGYA 2GQAA 1BTMA 1HO4A 3UY7A 3LHZA 3NPXA 1A50A 3NL3A 4UMCA 3FLUA 4UFHA 3FIGA 3N2XA 4JDYA 1VYSX 1LORA 3TU9A 1JUKA 3CC1A 1JCJA 2E1DA 4DO5A 1KTCA 4O19A 3IGSA 3BVJA 3DI0A 4FXSA 3P80A 3O05A 5EBUA 1SO5A 4XTDA 3TDFA 3LGEA 5CKSA 1LRQA 3BPWA 3LV6A 2V5BA 4JTKA 3ZFHA 3D0CA 2VEMA 1LOQA 1WA3A 1NF0A 3ZWTA 3P67A 2NUXA 3BLFA 4R7JA 4JR5A 1JCNA 1QOQA 3NPWA 1EP1A 1GVRA 2YR1A 3THAA 4K39A 4JX6A 4UC5A 1ME7A 1CI1A 4FNTA 3UPWA 3BW3A 3O6DA 4A21A 4A2SA 1TPH1 3S8HA 1OFEA 3R8RA 1VJIA 2DZUA 1Q6QA 4Z1DA 1FCUA 4AB4A 4UTWC 2NWSA 4JY9A 4MJZA 2Z6IA 1VCVA 3GX9A 3HO8A 4LT9A 2YW4A 4WY0A 4K7YA 1RZMA 3N2MA 1ZJIA 4TO8A 2JKPA 3LOTA 1VCGA 3G1YA 1W37A 3OHIA 1JUBA 2I14A 3TA6A 3W7IA 5E93A 4FIRA 3FKRA 1EB3A 3I68A 3MBDA 1KV8A 1XFBA 4X2RA 3LHUA 3FJ6A 3M5VA 3PUEA 4PFMA 2CLFA 4GXMA 5AB3A 1WAUA 2QJGA 3MO7A 1DQWA 1J4EA 2A7PA 3P84A 4JTTA 1K03A 4RLIA 3S0CA 1EP2A 1L2UA 3PBVA 3C4UA 2OT1A 1ONRA 2ZZ6A 3QQ1A 2QCMA 3QM3A 4UMAA 2CLOA 5HINA 4E2DA 1QO2A 2A5HA 4IMEA 4WZHA 3NDOA 4UUIA 2A85A 4BFAA 2VEIA 4Z1CA 4L4MA 3W74A 4LVGA 1UBSA 3SY5A 2BLEA 3GDTA 2VELA 5I3HA 1TSIA 3G1AA 4ZL1A 1DQXA 1IIGA 3O63A 1IIHA 3H55A 4QSHA 4MZ8A 2CWNA 1FWSA 5D2WA 7TIMA 5HQEA 3CIXA 5F4WA 1M5WA 4A29A 3GR8A 2J9YA 1O5KA 4WX2A 3TXZA 3V75A 3WJWA 5KSWA 3TFCA 3LHWA 3PY2A 3PG8A 2B7QA 1XXXA 3M41A 3HG3A 1JR1A 1TV7A 1MEIA 2GQ8A 4MFDA 4CQAA 3B04A 2VEPA 3TR2A 1R2SA 3U2OA 1IF2A 2Y70A 5F2GA 4P61A 3UD6A 3LTYA 1T96A 2LLEA 2PURA 3S42A 3DFPA 3LCFA 3TQKA 4LW7A 1GVOA 3THQA 4U28A 3CB8A 3PR2A 1G4TA 5CG7A 2Z2UA 1I4NA 2VFFA 3EWYA 1JCLA 3W7RA 3E12A 1PCKA 1GOXA 2ZCGA 3GNDA 1UUOA 4PTNA 4UTJA 3MWAA 4LVAA 1PE1A 3L0GA 2F84A 4OGZA 4QNEA 5D37A 3UYCA 1XBVA 2OX1A 2ZTJA 4LWWA 3G0XA 1F76A 3G1HA 4FNQA 2YDAA 3L9CA 4PCFA 4ZQMA 3TCEA 5U7SA 4N2YA 3NL6A 3PBUA 4I7WA 4UR8A 5LNUA 2RDUA 4RJEA 3NQCA 4R34A 5AHMA 5AHNA 2YCEA 2UV8G 5EL1A 3RLUA 2DJXA 2A0NA 1B57A 3LCGA 1QNVA 2QCCA 3UWUA 6TIMA 1GVQA 3IIVA 2R91A 3O6YX 3S1XA 4MFEA 2H8ZA 3P5YA 4MZYA 1YTKA 3E02A 5FF3A 1R46A 3OVPA 3DXIA 4OU1A 3NR0A 4POCA 3PULA 1Q3NA 2Y7EA 3W07A 2RH9A 2Y63A 1SQ7A 3MUXA 1W5OA 5AHIA 2YPIA 3R12A 3EX1A 4NNBA 5CZSA 3VE7A 1M7PA 2Z1BA 4LS2A 1W31A 1MZHA 3TIMA 3B03A 2BXVA 4LNYA 3BG9A 1XBYA 1YXCA 4KWVA 4JICA 2B0MA 5EA9A 5K2ZA 1W54A 3EXSA 3L0NA 3TMLA 1K7XA 1RQHA 3PS7A 4JDBA 5KTLA 5AC6A 5AFDA 3TSDA 1TJPA 2VKZG 3KRZA 1T8XA 3HGJA 5AYYA 3NOEA 4FNUA 5HULA 2QAFA 3STFA 3W7EA 5HUOA 1OYBA 3TSBA 3VKJA 5DCDA 4ZQNA 4DF1A 1SU5A 1ICSA 1O95A 3EKZA 4HHPA 1VR6A 3L5LA 1R2TA 5K7JA 2ABBA 1RQBA 3GDLA 4IWWA 1WBHA 2WPBA 5G1TA 1CW2A 1WXJA 4JTJA 4O18A 2JGQA 5HMSA 3I7SA 4AMAA 4LUIA 4IJBA 4RZ5A 3P8JA 4MPQA 2PE4A 2ISSA 3NM1A 4XZ9A 1JVNA 4LRTA 1G4EA 3GNNA 3FKKA 3W1XA 3B0VC 4LV9A 1XDMA 4UTWA 4IX0A 3CPRA 3BLEA 4PL2A 5IM51 1B4KA 4O28A 3QC3A 1OFBA 1NAL1 1OFRA 3KVLA 3LV5A 5CSSA 4IGHA 3W7OA 1RD5A 2YX0A 4E2BA 2EHHA 4TMBA 4EWND 1Z44A 2QDHA 4JIPA 5ABTA 2Q8ZA 4KFPA 1SSDA 4WY0B 3Q37A 3W87A 1AK5A 3UY8A 2H8XA 3L5AA 1FWWA 4NZJA 3ZS4A 2QEZA 3TE9A 1LBLA 1EWDA 1OK4A 2PCQA 1QPQA 2B7OA 1LZOA 1L9WA 3HIJA 4W9TA 2X2GA 5BMWA 3UWZA 3DBPA 1B9BA 1F2JA 1TTPA 1XDLA 3HPSA 1YTDA 4DO4A 4O50A 4IXHA 1KLZA 1U83A 3QW3A 1DOSA 2X16A 5TIMA 1HTIA 4UFLA 1LBFA 5K9XA 3TQVA 3W1QA 5LZLA 2QJIA 1X7FA 5D02A 3PB2A 4QQ3A 1I8JA 5KINA 4CLMA 2A7NA 1IGSA 1FXPA 1TPVA 3L66A 2Y89A 4UIOA 2WKJA 5C55A 4JYDA 1ZENA 1TYGA 3DENA 5C54A 4JTSA 2ISVA 4G1KA 3CLMA 3W85A 4FB7A 3ZWSA 1H1ZA 3W76A 3C2FA 5FESA 4OE7A 5FI8A 4MY9A 3I7RA 3QMSA 4DBEA 3IIPA 5LHFA 3EXRA 4TX9A 2OJPA 3L21A 1DKWA 2YZRA 3UXAA 4JTFA 3LXCA 1FWNA 1I2QA 3NQAA 4UTUA 3LM7A 1G4PA 1FWTA 5F4SA 1GVFA 2CZEA 3NQDA 3W83A 5LNSA 3L68A 2FPVA 2QAPA 3DKJA 3LI0A 2ZFAA 1RQEA 3W7KA 3GDRA 3SFKA 3M1ZA 3NM3A 1YDNA 1H7WA 3HGOA 3UZ5A 4DQWA 1G6CA 3NQ8A 3GR7A 4DPQA 4LOCA 3TV8A 4I7VA 4O15A 1TB3A 4HPJA 1A5SA 4R33A 4D2JA 2AAMA 2ZRXA 4HNTA 1VPXA 4JX4A 3KVMA 3PSWA 1KTBA 5FF0A 2E6FA 4HNNA 3NAVA 4HKPA 1AL7A 3JRKA 4GNJA 3YPIA 4GBUA 4NX0A 4LV4A 2AQWA 3DHFA 3RF9A 2E5CA 4MYAA 1LRTA 1VRDA 3QH2A 4UMBA 3W72A 4LS0A 5K9DA 3DH7A 2CZDA 3B0PA 3W1PA 3TKFA 3WJXA 4DF2A 4S2BA 3C0JA 4ZMGA 4MIMA 4ALDA 4PL1A 4UXDA 3UWVA 2I9EA 1M7OA 1R2RA 1XI3A 4QISA 3AJXA 2HSAA 1OFPA 3GAYA 3CHVA 1EWEA 3W75A 4XQ6A 3DFTA 1TQJA 3B0UX 1NSJA 5H91A 4O54A 4OT7A 4CNNA 1FCVA 2JBMA 4O1BA 2ZA2A 1HFBA 3N14A 4BR1A 3JR2A 4TU1A 2DZXA 4H4IA 3WK2A 1RV8A 3N3MA 3QPYA 2YFNA 2QUVA 4ORMA 1FBAA 5D32A 1QAPA 4IMFA 3BG5A 3I6RA 3W9ZA 4Y8FA 3MI6A 4L4LA 3W7MA 3DHDA 1YDOA 3MYPA 4LUJA 3RLVA 3CEPA 1TMHA 3S5NA 1IXNA 3BW2A 4EVZA 4JX5A 1VCFA 4HNVA 1TCDA 3G0SA 3QRHA 3G1SA 1OG0A 1A53A 2A2IA 3OBKA 1GEQA 2ZZ3A 1DJQA 5AN7A 4WJEA 4Y9AA 3STEA 1YTEA 2XN1A 5CGQA 1O94A 4XBKA 1KM0A 1K3UA 2GOUA 1QDSA 1XUZA 5LNRA 5DCEA 4JS3A 2X30A 3IRDA 2J9ZA 2FPTA 4AEOA 4OBTA 3H54A 3FS2A 4O0ZA 4AVFA 1LOSA 5DLCA 1T99A 1C8VA 1W8SA 3TNOA 3EX6A 4IX2A 5MHBA 2P1FA 3TAKA 5HWNA 2VOMA 4UTHA 1ML1A 2NZLA 3HGSA 1TTIA 1OYAA 1PL9A 4JTLA 2EGZA 4XKYA 1S5WA 5AYZA 3FJLA 1MXSA 4GUJA 4I9AA 1JRBA 4WOQA 4WQ6A 5I3FA 1SPQA 1EUNA 1QPOA 1SZNA 3VFLA 3W7GA 2ZBTA 3W1MA 3P62A 4IXXA 3MP3A 1OK6A 1Z41A 3KRSA 3LBMA 1F7BA 1PVNA 1TPFA 4AXKA 2WOQA 2YYTA 2ZA3A 3UZJA 2ISWA 1YPFA 2J6XA 4Q4KA 3W70A 3S1WA 5FF2A 3B05A 1MEHA 2P10A 4O1CA 1VHNA 2FB3A 4IPJA 5E0KA 3BGJA 1UCWA 5CZ0A 1LM1A 1VLWA 2QR6A 3EX4A 1RPXA 4ZQCA 5AOUA 3GYEA 5AHLA 4ADSA 5CPLA 3QMTA 1H7PA 1F6PA 4LU0A 1KV5A 4A22A 1NF7A 1ZAJA 1TJRA 3QF0A 2WSQA 2CU0A 2QCGA 1FCQA 5DN1A 5LNWA 3E49A 4UFIA 1OFDA 3LRMA 4PA8A 1MO0A 4UNLA 2PRHA 2V81A 2W0UA 5I3IA 2C16A 2V82A 5D04C 3O15A 3G1FA 3IVUA 1ZNNA 4FX6M 5K3VA 4O53A 3KXQA 1B3OA 3L65A 1GTEA 2V30A 4TR9A 4GJ1A 4O1AA 4WXYA 2YYUA 3O07A 4DEFA 4Z08A 3O6CA 5KZEA 2XN0A 3SW6A 3W2MA 4RXGA 3W71A 2GJNA 4AHQA 4XWUA 3LCHA 3UWYA 3L67A 4ORIA 3EWWA 5HUPA 1EX5A 5DY2A 2E5BA 2QCLA 4WD0A 3O06A 4MLRA 3QW4B 2HTMA 4C1KA 2NX9A 4ZQOA 3TW6A 4BK9A 5AC7A 3QMRA 1G67A 2WNZA 2JK2A 1WV2A 3LRLA 4JTHA 1RR2A 3BO9A 2V2HA 1BEUA 4JTIA 2VC6A 3KRUA 4IMGA 1EPXA 2Q3OA 4N6FA 1A5AA 1X1ZA 4NNAA 1O60A 3SIZA 1R47A 3MP4A 3W22A 1ICPA 4AF0B 3KX6A 3T40A 2YXGA 3H53A 3G24A 4FNSA 3GDKA 1E51A 4GFSA 4TIMA 1GYNA 4TMCA 1B4EA 2BSLA 5DY3A 1H7OA 3GKAA 2Y85A 2ZTKA 1NEYA 1LP6A 3LRKA 2ZQ0A 3N9RA 4Y6GA 3LLFA 5KZMA 4S2CA 1AG1O 5IBXC 3A24A 2FJKA 1H63A 5K4XA 3M7WA 3S1VA 4Q33A 4CCCA 2YSWA 3MP5A 3W73A 2NX3A 2VEKA 4OQVA 1A5BA 3LX9A 3B4UA 3W23A 1DJNA 4O16A 4M6PA 3NXFA 5LNVA 3BGGA 3EWZA 2X1RA 3PVFA 3DAQA 4NT0A 2W6RA 2ATMA 1KFJA 3HGRA 1HG3A 3RNDA 1JCXA 4X9SA 4EF8A 3WJSA 4QJ1A 3IIXA 4M19A 3TQ0A 3G18A 4Y90A 1YLVA 4E38A 3A5VA 1J5TA 5DXXA 3HMJG 5CPOA 1OX5A 1JCYA 5G1YA 3HG2A 2ZYFA 4KWWA 4WY0F 2RDWA 2A4AA 4NVTA 1KFCA 4NXSA 3UXDA 3A5FA 3C52A 3TW7A 3TUUA 3S1UA 3NQGA 2PRMA 3P8IA 2ZRWA 3R13A 3GXPA 3C3NA 1LCOA 1OYCA 1ZAHA 4ONVA 3SJ3A 1CX9A 3UQNA 3W1RA 3W2JA 3LBCA 1K7FA 3MI2A 2NUYA 1VH7A 1P4CA 3HG4A 1H50A 1SUXA 4ZZ9A 3TAOA 3IEBA 3Q94A 1W3TA 3KVKA 3GIYA 1V5XA 4LTSA 3INPA 4FX8A 4B5NA 2Z6JA 5DBTA 1TPDA 3DZ1A 4JYFA 1SR9A 5D33A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1LDC A;  3W2K A;  1C29 A;  2O7S A;  4AWT A;  1H7X A;  3QJA A;  4RKA A;  1N55 A;  1KA9 F;  4Z1B A;  1HO1 A;  2ZA1 A;  4NQ1 A;  4WXZ A;  4NU7 A;  1K8Z A;  1QOP A;  1EP3 A;  3UWQ A;  2DZW A;  4M6V A;  4JY8 A;  5H2Z A;  3GVG A;  4N02 A;  3PM6 A;  4O4W A;  2YW3 A;  4DBD A;  2E6D A;  4A3U A;  3G22 A;  1W5N A;  2WSR A;  4XTI A;  1JUE A;  4FX7 A;  1TPE A;  3W2N A;  4JTE A;  1ME9 A;  1I2P A;  1ZHA A;  2NXG A;  1FDY A;  5BW6 A;  1MSS A;  3T7V A;  3FYO A;  1TRE A;  1J2W A;  3EB2 A;  5BRB A;  3DI1 A;  3LB0 A;  4Y96 A;  1QPR A;  4K8E A;  3MMT A;  2FFC A;  1JUL A;  3C2O A;  4IQL A;  5I3G A;  3UPB A;  2BZN A;  1OFQ A;  5F1V A;  1PV8 A;  2V0T A;  3GKF A;  4O17 A;  3EX2 A;  3VE9 A;  3LHV A;  3M16 A;  2I1O A;  2GVG A;  3BG3 A;  3A21 A;  1X6U A;  1PHQ A;  5FEW A;  3M47 A;  3HF3 A;  1H61 A;  2WO5 A;  5G2W A;  4FXR A;  3MJY A;  3S6D A;  2PC4 A;  2NXH A;  5FEX A;  3NO5 A;  2TMD A;  3NQ2 A;  4K8H A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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4EVZA

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