4EZ3A

Cdk2 in complex with nsc 134199
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
publication title A Novel Approach to the Discovery of Small-Molecule Ligands of CDK2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2012-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ez3A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ez3A01
4BDFA 3WF7A 5DT0A 3GFWA 5F1ZA 4HVDA 2W5AA 4FL1A 3VS6A 4R7BA 4ACGA 1V1KA 3ACJA 4UYAA 2BFYA 4QMQA 2UZBA 3U9NA 1SVGA 2QOCA 3SA0A 4G17A 4RVTA 2BRHA 3PIXA 4OTWA 4X2GA 5CVHA 3NR9A 4FTJA 3OROA 2PK9A 3OHTA 3PXFA 5TKDA 4QMNA 4FKVA 3VBVA 5GNKA 4WOVA 3O50A 3ZTXA 5DNRA 2X2LA 3DLSA 1OPJA 3JPVA 2HW7A 4L01A 3TNQB 3W2CA 3W55A 2YJRA 5C8KA 4GT5A 3FMLA 4M7IA 5DRBA 3HA8A 5ANDA 4O7VA 4R77A 3UTOA 3CY3A 2ZV9A 1ZRZA 3FZ1A 3EQIA 2UZVA 3F88A 1OUKA 3EWHA 4X21A 4CD0A 3TM0A 2FGIA 2R3LA 4UXQA 4D2WA 4BDIA 4E73A 4AW1A 3KREA 2QD9A 4RLKA 3B8RA 1OKVA 5K3YA 4C0TA 5L2WA 3DTWA 4DGOA 3IOPA 1ND4A 4MBJA 2X7FA 4F0FA 1P5EA 1Y6BA 2X1NA 4E6QA 3R21A 5FTGA 2B9IA 5IA2A 2C4GA 5IA3A 5FXRA 2GQSA 5CT0A 3G90X 3R9DA 2BIKB 4H39A 4I4EA 4KIKA 4MWIA 2OK1A 4IAYA 3BCEA 3R83A 2A27A 5CEMA 1NA7A 3TV7A 4O1PA 3BYSA 1Y57A 3QTXA 4JXFA 4M67A 4D28A 5KMOA 2PU8A 3GCQA 3MSSA 1RQQA 4D4RA 3PLAE 2PVKA 1Q3WA 4EH6A 5CAPA 3CTJA 5C01A 3NEWA 3L8XA 2YLEA 2CHLA 2JKMA 4BWPA 2Y9QA 3A61A 2IPXA 4JIAA 5CF4A 4WRSA 4L67A 4TZRA 4EQUA 4IJPA 1JKTA 3V04A 3QXOA 4GCJA 4I6FA 4IWDA 2HZ0A 3LCSA 3IW8A 3MIAA 3DLZA 2C6EA 2OH0E 3PJ1A 4MNEA 3RALA 4EHGA 3KA0A 2QC6A 4UMUA 3RVGA 3A62A 3G2FA 3QZFA 4D0WA 4J98A 4E7WA 4XRLA 3VW6A 5K5NA 3MJ1A 5IA5A 3ZLWA 2CNUA 3Q3BA 4BDDA 4MXOA 4L46A 2A19B 2YABA 4X2NA 2GS7A 4XV9A 2JEDA 2QKRA 5HICA 4LOPA 3EL7A 3FI4A 2C68A 4HCVA 4QT1A 3RHKA 5A9UA 4GK4A 3A60A 3MVJA 4CG9A 3ETAA 2XZSA 3G9LX 2CDZA 5F94A 3R7GA 4UV0A 5E7RA 4R1YA 2RGPA 1Y8YA 4IVDA 3VHEA 5JQ5A 4FEUA 4I3ZA 4Y85A 5D9HA 2H8HA 4R3CA 3QCXA 4I94A 5D11A 3SXSA 5A6OA 5IEXA 3FPMA 2OICA 2OJIA 3PXYA 4FV8A 3MVLA 3R9NA 3VUGA 5IQBA 2PVJA 4F65A 2F4JA 2EXCX 3LQ8A 5DIAA 4RX5A 3RNIA 4I5PA 1YDSE 3NCGA 5CEPA 4AT4A 3U51A 2XNBA 2WTJA 5GIOE 1OL2A 1WVYA 3G0FA 1W98A 4YJPA 3DAEA 2B1PA 4JAJA 3VHKA 2YM5A 4HGSA 4YU2A 5H8GA 2ITTA 3HV3A 5DOSA 2W4OA 3P7CA 3UO5A 3TZMA 3QZGA 4O7RA 2Z7RA 2WOUA 1OITA 4YGAA 4N6ZA 2R3OA 4YJVA 4IX6A 3KGAA 3ZO2A 2YWPA 2CN8A 5L2TA 3OWPA 4RWLA 4YNOA 3NZ0A 5JZJA 4K11A 3ZFXA 4BKYA 4JDHA 1H1RA 5I9WA 2YZAA 3TCPA 3V8WA 4AXAA 4G3EA 4WO5A 4U45A 3KY2A 5B2LA 5DI1A 5I5ZA 5HG7A 3UVQA 4A07A 4UWYA 4BI1A 3DK6A 2PY3A 4FSNA 3EQFA 2YM3A 4G3DA 3VRYA 3SHEA 3CP9A 4XCUA 4HGEA 2Y6MA 5I4NA 4DTBA 4XOZA 3ZO1A 3SOCA 2BDFA 3SRVB 5FD2A 4AFJA 3EZRA 3FMHA 4YLJA 3FQHA 4UMRA 2GQRA 3CQUA 4NSTA 2W0JA 1J7LA 3CD3A 4E3CA 3MV5A 4LMUA 1AQ1A 3V5PA 3F3UA 3LM0A 3Q4ZA 3E8DA 4YZMA 2R3PA 4I6QA 1BI8A 3HRCA 1UU7A 3UPXA 4B7TA 1L8TA 1XR1A 4BVUA 3IK3A 1V0OA 2CMWA 3A99A 3O96A 5L8KA 2OJGA 3UBDA 3KC3A 3PIZA 4L7FA 1R0EA 4YC6A 5IEYA 3WZKA 4DH8A 5BUEA 5JGBA 4AF3A 2YDKA 5ITAA 4IQ6A 4FV2A 4IAAA 3HUBA 3PPZA 4G3CA 5GZ9A 2YM4A 2R3KA 1ZMVA 2WXVA 4S34A 2X7GA 3HDNA 2QURA 3UZPA 3WE4A 3CXWA 3BELA 4ZAUA 5CASA 2R0UA 2R7BA 3IGGA 1ZYLA 4BWXA 4LV8A 2E9UA 3ITZA 3GCPA 4LFIA 4FGRA 3R8LA 2WD1A 3QX4A 3TN8A 1NY3A 1W8CA 4MKCA 4ENYA 5ANKA 5IUGA 3DNEA 4AG8A 1ZARA 1KSWA 3PRIA 2BZJA 4ZTQA 4WA9A 4ZY4A 1JWHA 3HUCA 4BGGA 3BEAA 2XS0A 2W4JA 4LMNA 3BBWA 3QLGA 3FKOA 3UZTA 3RJCA 3QQJA 4TT7A 4AE9A 4BCIA 2R3FA 5IMEA 4UZHA 3QKKA 4CXAA 2HWPA 4HW7A 4WRGA 3ZM9A 4FYOA 4DGMA 3L9LA 3UC3A 1H26A 4TPTA 4DFUA 2BCJA 4CQEA 3ACKA 3BV3A 3L8VA 1ZOHA 4MXAA 3FBVA 5HORA 1YW2A 2BROA 4K1BA 4AOIA 4PNKA 4RLLA 3G51A 3EKNA 4WBOA 5M55A 3DQWA 5BPYA 1VZOA 4GIIA 4M97A 4RFZA 4MF1A 1W84A 5G1XA 4CKIA 4FTAA 3TUDA 4ERKA 3SW4A 4CZYB 4IWPA 2BAQA 2C6TA 3EQGA 3JXWA 5FDXA 4ZJIA 3C1XA 3H9RA 4BKJA 4C35A 4QQ5A 3W33A 4U97A 4B8MA 2GSFA 4FVPA 3KXXA 1YHVA 1Q8UA 3EQBA 5F20A 4PMPA 5BVDA 1URWA 5A3XA 3TWJA 2PYWA 4Q5HA 5BQ0A 2XVDA 3EQPA 1CM8A 3GOPA 4Y83A 1LEWA 3AGLA 1GZ8A 2PMNX 3H4JA 4FEQA 4IE9A 4S32A 5E8TA 3LCKA 5ETCA 2J50A 2P0CA 3KQ7A 2XK6A 3DTCA 3MFTA 3OCTA 4JQ7A 4QQCA 1A06A 4EHZA 4ZZOA 4FKJA 2HY81 2Z7LA 4HGLA 4ZJJA 4CCBA 2WTCA 2ETMA 4XG9A 2ZAZA 3V5WA 4HVSA 4O84A 1OI9A 2IN6A 4OBPA 2XKDA 3BGZA 5J95A 3TTJA 5EW3A 2QOFA 3FKLA 3BLQA 5BVWA 2DUVA 4A4LA 4CMUA 3DAKA 4FTRA 4C8BA 4FIEA 4ZMEA 3RINA 2F2CB 2JD5A 1MRUA 3EYGA 2R3GA 4IDTA 2OKRA 2W1ZA 2BRGA 4QP4A 4QPAA 4YJOA 3ZCLA 2R3QA 2YLFA 5ANJA 3UQGA 5IPJA 5EHYA 4TWNA 4H58A 5AR4A 2EB3A 4J1RA 2ZYBA 5ANEA 4X2JA 4ZSEA 3RP9A 4EYMA 4BDBA 4O7ZA 5IQDA 1SNXA 4MD7E 4QYFA 3OEFX 4USEA 4FV9A 3LKMA 1V0PA 1PRYA 3ZBXA 2ERKA 3IS5A 5HLWA 2RFEA 3BU6A 5F4NA 4MXZA 5EM5A 3GFEA 1YOJA 5GINE 4CEGA 1KUTA 4QOXA 3R22A 5JZNA 4DG2E 4BCJA 3CC6A 3MB6A 2PVHA 4I23A 5AIRA 4I0SA 4R5SA 4C62A 3Q2JA 4GVAA 4EQCA 2JDTA 2QO9A 5EHOA 3L1SA 4AGUA 4IIRA 2VWZA 4UY9A 3TG1A 4YSJA 5CEKA 3VBWA 3RZBA 5BVFA 3V5JA 3A4PA 2ZV7A 4M69A 2W1IA 3Q5IA 4NM0A 3TJDA 3W1FA 2BTSA 3GP0A 3O2MA 5JFVA 1O6KA 4KBCA 4AOJA 3P0MA 5L2IA 4EUUA 2P2IA 4X6QC 3RAKA 3UDBA 4EOKA 3BX5A 5LVPA 1ZYDA 5JN2A 4IFGA 4OTPA 3LFNA 4TYIA 4BBMA 3KF4A 3FHIA 4FTNA 2FSMX 3FSFA 5JGDA 3VJOA 1W82A 3DBQA 4GG5A 5CAOA 4JX7A 5BX0A 1DS5A 4DH5A 4PL4A 3R7OA 5EOBA 3VS1A 4BDKA 5EQYA 4LGGA 2BFXA 4LM5A 5CX9A 5EM8A 1ERKA 5IQFA 3NNUA 5GJFA 3IG7A 2O63A 4QP2A 5E92A 3TZ7A 4BGHA 4FKWA 3VF9A 4BCOA 5IDNA 3PXZA 4AZWA 5LMAA 4L6QA 4Q5EA 3NSZA 5HQ0A 3LCDA 3ZUUA 3K2LA 4A06A 5JSMA 5KE0A 3HAVA 2IZTA 4U40A 1BYGA 3MPTA 3AC2A 2PZ5A 3KXNA 4W9WA 4UBAA 4WT6A 3DGKA 4MQ1A 5HIDA 3H9OA 4X3FB 2ERZE 5HO6A 4CTCA 2VWBA 1HCKA 3FZOA 3TL8A 4AA5A 2RF9A 3UIXA 5BUJA 4G1WA 2RSVA 2XF0A 2PVMA 3E62A 3QA8A 2QODA 3NYOA 2SRCA 3EFKA 2YAAA 3PE2A 2GU8A 3DOGA 1JSTA 3MA3A 5A46A 5KMLA 3P79A 3QHRA 4O0RA 2XYNA 4RA4A 2C69A 2JIUA 4RIXA 1U54B 3F3ZA 4RG0A 3E8CA 4IX4A 3CEKA 4FYNA 4FEWA 4C59A 5HU9A 4U0IA 4JDJA 3OXTA 3F2NA 4IZ5A 2YFXA 3DB6A 3JR1A 4M12A 4GUEA 4KRCA 3UVPA 4ASZA 4E6DA 4W4YA 3TXOA 5LOHA 1H0VA 2GS2A 3OF0A 2XK9A 4JG8A 2R3NA 3D7ZA 1KE7A 3G33A 2UUEA 4FTMA 4R6VA 5D41A 5A4QA 2GNGA 4FK6A 2WHBA 1OMWA 4TWCA 2OW3A 4GFGA 2YJSA 3PSDA 4E4MA 2Z60A 3WZDA 3IQ7A 3SXFA 4A4OA 4FZ7A 4RBLA 4XP3A 5AR8A 3UOJA 3CGFA 2W17A 2VNYA 3DJ6A 3MGYA 3PSCA 5H3QA 2OLCA 3LLAA 3T9IA 3E64A 1FVTA 3JS2A 2XK8A 4GW8A 3TDWA 5CXHA 4EEVA 4ZTNA 5FBOA 4DEIA 1NW1A 2A1AB 4BCHA 5J7BA 2P33A 3E8EA 4C36A 2QOKA 2VAGA 5K0KA 3QTIA 3QC9A 4FKSA 4DCEA 5AV3A 4FEVA 4IADA 5E8XA 3SC1A 3EQHA 3HP5A 3DZQA 2X6EA 5IKWA 4DLIA 4DLJA 5M44A 4G5PA 5I0BA 2WEVA 5L8LA 4L00A 4DH1A 3JUHA 2R4BA 5AP1A 3HMOA 1H24A 1L3RE 2ZM1A 3KRJA 3QKMA 4OTDA 5TE0A 2IZRA 3DFCB 2A4LA 4IX5A 4BGQA 1OL1A 1GIJA 3VBXA 3QTQA 2CNVA 1QL6A 3GBZA 4QPSA 2Z02A 4G9CA 3IONA 3FMEA 3MIYA 3NNVA 4O0UA 4UYNA 1O6LA 5EG3A 1BUHA 4M13A 4HCUA 4U8ZA 4C3FA 5H8EA 1Y6AA 3TNWA 2HY0A 4GIHA 3AD4A 4HPTE 5E1EA 4XJ0A 4C4HA 3HMIA 4FTCA 3QTRA 3HLLA 1MQ4A 4KABA 3BYOA 3OOGA 4JDKA 4L42A 2YERA 2YIQA 2XK4A 3KMUA 5EM7A 1T45A 4V0GA 4Q9ZA 4YHTA 1H25A 4QTCA 4ANQA 1P4FA 4WHZA 3SV0A 2XNEA 3BKBA 3LXKA 4K0YA 1TKIA 5CNOA 5AJQA 3ZBFA 5H9BA 2PVNA 3D5XA 3UC4A 4RRVA 3R8ZA 3QD0A 2XM9A 1TQMA 4YMJA 5IH4A 4PTEA 1WBOA 3PJCA 4I6BA 4EOMA 3PVUA 3VW8A 3OG7A 5FEDA 5B0XA 2C3IB 5CVFA 2G9XA 3RWPA 3U6IA 1UWHA 2XIYA 4RJ3A 5JKGA 3KXGA 5HD7A 3FXXA 4NM5A 1GIHA 5EOLA 3ZRLA 2XIKA 4LI5A 2WMQA 3RM7A 3HVCA 4FKUA 3K3JA 4KINA 4RIYA 2ITXA 3UP7A 1G8SA 5ACKA 3RPOA 4TTHB 4I21A 3DBDA 2V7OA 4IAZA 1OIYA 1J1CA 3F69A 4YTIA 2WQOA 4EK8A 2XEZA 1KE5A 1WVWA 4ITIA 4CFXA 3IO7A 4GT4A 3QALE 3OT3A 4EH7A 2WMBA 3A8XA 4PMSA 4G34A 1P2AA 1XHAA 2I6LA 1ZY4A 2YA9A 4IFCA 2F49A 4BYIA 2GHGA 1CSNA 3PJ2A 3TDVA 3VS5A 1XH6A 3F7ZA 5AX3A 4BDCA 5I9YA 3WZUA 2OIBA 4MCVA 2YCQA 5AP0A 2PVYA 3I0OA 4IAFA 2VTJA 3CQEA 2UZEA 4NW5A 4QRCA 3ZSIA 4GUBA 3D2IA 4C33A 4O27B 2R0IA 4RFYA 3E7OA 4M3QA 2VWVA 5HTBA 5J1WA 2JC6A 5C1QB 2HZIA 3C4ZA 3L8SA 4AA4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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