The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
55
|
structure length |
55
|
Chain Sequence |
ELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, brain
|
| publication title |
Crystal Structure of the alpha spectrin SH3 domain at pH 9
rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
11
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| structure length |
55
|
| sequence length |
55
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-05-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WIE A; 2KRM A; 1UFF A; 1SEM A; 3C0C A; 3M0U A; 1SPK A; 2DF6 A; 2DL7 A; 3PE0 A; 3VRZ A; 3A98 A; 1CKB A; 2JS0 A; 2F2W A; 3I5R A; 4EIK A; 5HCK A; 2FPD A; 1ABO A; 2HBW A; 3I9Q A; 1BB9 A; 4ZNX A; 3ULR B; 2BTT A; 2NUZ A; 3M0T A; 4J9D A; 2FG0 A; 2JTE A; 3M0P A; 2EGA A; 3O5Z A; 1GL5 A; 3UA6 A; 1AVZ C; 2KE9 A; 2ROL A; 2EKH A; 2JS2 A; 1WDX A; 3LH5 A; 2J05 A; 1EFN A; 1AEY A; 4JPB W; 3PVL A; 1MV3 A; 2GTO A; 2J7I A; 2MIO A; 3R6N A; 2CH4 W; 1K0X A; 2LNH B; 1QKW A; 2KYM A; 1JQQ A; 1GBR A; 2MCN A; 1VYU A; 2DLP A; 4E6R A; 1WXU A; 2FPF A; 1MUZ A; 1A0N B; 4HXJ A; 3I5S A; 1PWT A; 1GRI A; 2JMC A; 4IIM A; 2IIM A; 1OEB A; 1ZLM A; 2DMO A; 3VS7 A; 1CSK A; 1OOT A; 2ESW A; 2LJ0 A; 2CRE A; 2KRS A; 1RLQ C; 1WI7 A; 4J9F A; 2CH4 A; 2DM1 A; 2YUN A; 3NGP A; 1VA7 A; 2YUQ A; 4DEY A; 4JJC A; 1Z9Z A; 2EYY A; 2VWF A; 1OPL A; 2O31 A; 4J9E A; 4JZ4 A; 1M3A A; 2DYB A; 2FEI A; 3EHR A; 4FSS A; 2LCS A; 2L3Q A; 1SHF A; 2DRM A; 3RBB B; 1VYV A; 2CT3 A; 5IHK A; 1ZUY A; 4D8D A; 1K0S A; 1N5Z A; 2KRO A; 2CSI A; 2EGE A; 4DEX A; 1JO8 A; 1PRM C; 1YNZ A; 1TG0 A; 4RTV A; 1Y0M A; 2RQT A; 4JJB A; 1AD5 A; 1J3T A; 1PKS A; 4LN2 A; 1T0H A; 2L3S A; 1NEG A; 1OPK A; 3VS6 A; 2HDA A; 2HCK A; 2RQV A; 3QWY A; 1X6B A; 1TUC A; 2QDL A; 2AKL A; 4Z8A A; 3NPF A; 1WFW A; 4J9G A; 2GTJ A; 2SRC A; 1GCP A; 1UGV A; 2RNA A; 2BZY A; 1Y57 A; 3QWX X; 1TUD A; 5I11 A; 4CC2 A; 1M3B A; 1X43 A; 4GBQ A; 1SRL A; 4CC3 A; 3H0H A; 1NM7 A; 2PTK A; 2RN8 A; 2DRK A; 2FO0 A; 4HVU A; 5IHI A; 2J6F A; 1UJY A; 2W10 A; 2B86 A; 4JZ3 A; 4RTX A; 2LQN A; 2ED0 A; 1X2K A; 4F17 A; 1PNJ A; 1FYN A; 1UG1 A; 3RNJ A; 5IXB A; 1H3H A; 2A08 A; 3EHQ A; 4IIO A; 2JW4 A; 3UF4 A; 2JM9 A; 2KBT A; 4CC7 A; 1HSQ A; 2RQW A; 4GLM A; 1OV3 A; 3UA7 A; 1AZE A; 2X3X D; 1K1Z A; 1UDL A; 1UHC A; 1W1F A; 2CT4 A; 2DIL A; 2KT8 A; 1NG2 A; 2A36 A; 2CDT A; 2M51 A; 1GCQ A; 2C0I A; 5L23 A; 1GCQ C; 2ECZ A; 4AG1 C; 2VVK A; 1K4U S; 1B3Q A; 2MOX A; 1UHF A; 4CC4 B; 2OAW A; 2C0O A; 1QWE A; 2FRY A; 4AFS C; 4AFQ C; 2CUB A; 2OJ2 A; 3VS3 A; 2KRN A; 2JMA A; 2OI3 A; 1X69 A; 1SHG A; 2DJQ A; 4AFU C; 1JU5 C; 2EYX A; 1RLP C; 2K7A A; 1HD3 A; 2ENM A; 1YN8 A; 4AG2 C; 4OMM A; 5IXF A; 1BBZ A; 1WXB A; 3VS1 A; 2X3W D; 2CSQ A; 4AFZ C; 1NYG A; 2YDL A; 3H0F A; 1IO6 A; 1U3O A; 2EBP A; 2VKN A; 1ARK A; 1ZSG A; 3VS4 A; 2SEM A; 1K9A A; 3EG3 A; 2JXB A; 3TSZ A; 1JEG A; 1GBQ A; 4RTW A; 1ZUU A; 2D1X A; 4HVW A; 1U5S A; 4J9B A; 2C0T A; 2KR3 A; 2EQI A; 1MV0 B; 2O2O A; 3SEM A; 4HVV A; 5FWC A; 1NYF A; 2K2M A; 4F14 A; 2W0Z A; 1UE9 A; 2EYW A; 1ZBJ A; 4K11 A; 2BZX A; 2AZV A; 2ED1 A; 2O9V A; 1FMK A; 2L0A A; 1NEB A; 2YT6 A; 2LMJ A; 2V1Q A; 1BU1 A; 1X2Q A; 2EYZ A; 2LQW A; 2K79 A; 3NHN A; 2V1R A; 2EPD A; 3H41 A; 1I0C A; 2RQR A; 3VRY A; 4RTU A; 1PKT A; 4OMP A; 1HJD A; 4LE9 A; 3GBQ A; 4Z89 A; 2I0N A; 1E7O A; 2LJ3 A; 2PZ1 A; 5EC7 A; 2KYB A; 5IH2 A; 1T3S A; 2DBK A; 1T3L A; 1WLP B; 1I07 A; 3KFV A; 2HSP A; 2DL4 A; 2F2X A; 4A63 B; 5FWB A; 4OMN A; 2LZ6 B; 2DVJ A; 2GBQ A; 1XOV A; 1E6H A; 2KXD A; 1UEC A; 4RTT A; 3ZL7 C; 1V1C A; 2RF0 A; 2O9S A; 2H8H A; 1I1J A; 3VS0 A; 2DL5 A; 1GFD A; 4KRT A; 3VS2 A; 2DL8 A; 2YSQ A; 1KJW A; 4LUD A; 1K76 A; 1JXM A; 1SSH A; 3M0Q A; 2LP5 A; 2YUO A; 3U23 A; 1G2B A; 3REA B; 1AZG B; 1YWP A; 2AK5 A; 2DL3 A; 1AOJ A; 1W6X A; 4ORZ A; 1T0J A; 4JJD A; 2L2P A; 2HEQ A; 2K3B A; 5GJW B; 2D8H A; 4R0K A; 2JM8 A; 2GNC A; 5GJV B; 3UAT A; 1ZUK A; 4J9C A; 1WA7 A; 2PNI A; 1QCF A; 2RPN A; 2KT1 A; 4HCK A; 1ABQ A; 4ESR A; 4OMQ A; 2BZ8 A; 3M0R A; 2RMO A; 3EGU A; 4LUE A; 3REB B; 1YP5 A; 2A28 A; 2FRW A; 4QT7 A; 3CQT A; 1CKA A; 1QLY A; 1ZX6 A; 1AWX A; 3VS5 A; 4RTZ A; 1NLP C; 2RQU A; 2DNU A; 1M30 A; 2DA9 A; 1VYT A; 1BK2 A; 3FJ5 A; 3THK A; 2ABL A; 2D0N A; 1X6G A; 2KEA A; 2LX7 A; 4OML A; 4Y92 A; 2ROT A; 1KFZ A; 2M0Y A; 1S1N A; 2J6O A; 1H8K A; 2AZS A; 1WX6 A; 3IQL A; 1X27 A; 3H0I A; 2K9G A; 3M0S A; 2GGR A; 5ECA A; 1YCS B; 3I35 A; 4X1V A; 5IHN A; 1PHT A; 2J06 A; 1YWO A; 4J9H A; 4M4Z A; 2JT4 A; 2LJ1 A; 4WCI A; 1QWF A; 1U06 A; 2F2V A; 2KNB B; 4RTY A; 3EG0 A; 1LCK A; 2P4R A; 2EGC A; 5I22 A; 2GQI A; 1AWJ A; 2XMF A; 3TVT A; 1KSW A; 4J9I A; 1KIK A; 2DX1 A; 2EVR A; 1NLO C; 2KGT A; 5FW9 A; 1RI9 A; 1M27 C; 1SRM A; 2AKK A; 1M3C A; 2DBM A; 2O88 A; 2CUD A; 2J6K A; 2FPE A; 1QKX A; 4OMO A; 1UTI A; 3TSW A; 3JV3 A; 1JXO A; 2A37 A; 3PVQ A; 1UUE A; 2DE0 X; 3EG1 A; 4LNP A; 2NWM A; 4F16 A; 1AWW A; 1G83 A; 4D8K A; 1WXT A; 1E6G A; 1WYX A; 1AWO A; 4Z88 A; 1PRL C; 2YUP A; 2L3P A; 1RUW A; 2K6D A; 2EW3 A; 2E5K A; 4RUG A; 1M8M A; 1GFC A; 2KXC A; 1H92 A; 1B07 A; 1W70 A; 2D8J A; 3SHW A; 3NMZ C; 2G6F X; 1Z9Q A; 1UJ0 A; 3EG2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KC8 U; 2QA4 Q; 4DA4 A; 4J5Y A; 1SPK A; 1VQ7 Q; 4XTY A; 2DF6 A; 3CME Q; 2MK5 A; 3ME9 A; 2JS0 A; 1Q86 R; 4C0D B; 5HCK A; 2COW A; 2LCC A; 3UPU A; 2NUZ A; 1HYO A; 2PVD B; 3TEE A; 3JCM Q; 3G71 Q; 1GL5 A; 5GAN 2; 2HNI A; 1LVK A; 1AVZ C; 3R6O A; 2KE9 A; 3CCS T; 2KY9 A; 4J7I A; 1NJI C; 2XDB A; 2FVU A; 1QVG A; 5LL6 S; 3PVL A; 1AEY A; 4PJO C; 1MV3 A; 2OTL A; 2VYT A; 2CH4 W; 2R58 A; 4JS4 A; 3CCR T; 2MCN A; 1TSF A; 4A4E A; 4JDS A; 3EGD A; 7AT1 B; 2Z0W A; 2FPF A; 4XU2 A; 1UB4 A; 4BY6 B; 5GAN j; 1OX9 A; 4M7D B; 2HL3 A; 1A0N B; 1GRI A; 4A4G A; 2MMP A; 1TOV A; 3Q1J A; 2D6F A; 4IIM A; 1M2V A; 1QCO A; 4IKF A; 1ZLM A; 2DMO A; 2ESW A; 2RHX A; 3EFO B; 4OP0 A; 4M7D D; 2LC4 A; 4C8Q B; 3FRN A; 2DM1 A; 1NZ9 A; 3X24 B; 3L1A A; 2YUQ A; 4DEY A; 4M7D F; 2ZZD A; 1Z9Z A; 4HCC A; 1VQM T; 5C6S A; 2VWF A; 3RES A; 4C0G A; 2K57 A; 1G8X A; 4J9E A; 4JZ4 A; 4FSS A; 1MND A; 1WHM A; 5IHK A; 4C8Q D; 2WAC A; 1VQ7 A; 2CSI A; 4DEX A; 4L5G A; 3CME A; 3UDC A; 5KE2 A; 4C8Q F; 4M78 B; 1Y0M A; 1Y07 A; 2K5I A; 3ASK A; 1BYM A; 3SDZ A; 1J3T A; 1Q86 U; 3M58 A; 3OMG A; 4BUG A; 1NEG A; 3CBO A; 3E9G A; 1X01 A; 3G71 A; 1MMG A; 4EDU A; 3TU4 K; 3AHU A; 5GMK j; 3QWY A; 1TUC A; 2AKL A; 1PM3 A; 3NPF A; 4M78 D; 2SRC A; 3LWH A; 4N4I A; 5CR2 A; 4C92 G; 1UGV A; 2RNA A; 4Y28 E; 2EAY A; 2DET A; 4CC2 A; 4M78 F; 1YJN A; 3X20 B; 2K4Y A; 5A0D A; 2BKD N; 2PTK A; 1IRX A; 2HL5 C; 3E19 A; 3FC3 A; 1UJY A; 1X2K A; 3M57 A; 1FYN A; 2XKO C; 2XD0 A; 1IZ6 A; 4PK4 A; 1H3H A; 1LNX A; 2EJ9 A; 3OYJ A; 3E9F A; 3ZBD A; 2F5T X; 4CC7 A; 2EWN A; 4GLM A; 3UA7 A; 2X3X D; 5HK3 A; 4NL2 A; 1UHC A; 5LJ3 h; 2KT8 A; 5GAO p; 2M51 A; 5D6W A; 2YRD A; 1AHJ B; 3CXC A; 4FSX A; 2C0I A; 2FYK A; 5FLX E; 5A0G A; 3CEY A; 4BAC A; 1B3Q A; 1UHF A; 1H64 1; 2C0O A; 2DPP B; 2CUB A; 2OJ2 A; 1QVG P; 2KRN A; 2JMA A; 3QPH A; 2JJ9 A; 4AFU C; 1JU5 C; 2EYX A; 2QK0 A; 4FU6 A; 1KD1 R; 4F7U B; 1YN8 A; 2RK1 A; 3A8H B; 1BBZ A; 2JUF A; 1VQ5 T; 2FL7 A; 2PUO B; 2X3W D; 2CSQ A; 4AFZ C; 2HKQ B; 1IO6 A; 1HK9 A; 1P92 A; 2RHI A; 2QAS A; 2VKN A; 1ARK A; 4FL6 A; 1M4Z A; 4F7U F; 2AIR B; 2JXB A; 2XDD A; 3OW2 P; 1GBQ A; 1ZBX A; 2M16 A; 2IG0 A; 3GP8 A; 5KYU B; 5LJ5 j; 2KR3 A; 2EQI A; 4PL6 A; 2K2M A; 2W0Z A; 2EYW A; 3JCM X; 4OB3 B; 4JRI A; 3G7Z A; 3CMA T; 4DOV A; 1M1K R; 4M7D A; 1PKT A; 1WHG A; 2XK0 A; 3J81 E; 5GAM j; 4Z02 A; 2CS7 A; 2HQE A; 2I0N A; 1TTH B; 3EFO A; 1VQM Q; 3JCM P; 5EC7 A; 2KYB A; 3T9N A; 4C8Q A; 5IH2 A; 2RHY A; 2E6Z A; 2DBK A; 1WLP B; 3CCJ Q; 1I07 A; 3RIR A; 1PCX A; 4II1 A; 3X26 B; 2LZ6 B; 3V8L A; 5GAN h; 3M9Q A; 4IUQ A; 3FIF A; 2CZ1 B; 2QQA A; 3OMC A; 2KXD A; 1UEC A; 1VQO T; 2CZ7 B; 2ZPF B; 1GFD A; 4CRI A; 4KGX B; 4M78 A; 1KD1 U; 2DVE A; 2EJF A; 4IUR A; 1K76 A; 1UGQ B; 2KVQ G; 4ELZ C; 1UGS B; 3JCM g; 3EGX B; 2JNG A; 2V8J A; 3U23 A; 3MEW A; 3PGG A; 3BW1 A; 3CCL T; 3CC4 Q; 4JJD A; 3JCM J; 3GOX A; 2DER A; 1FMW A; 1KQ2 A; 2LRQ A; 1WJR A; 4RG2 A; 3UAT A; 4A4F A; 3CXC P; 2VXE A; 1KQS P; 3G6E Q; 3C12 A; 2E1H A; 1UEB A; 2QQR A; 1M1K C; 1RAI B; 4O5V A; 3G4S Q; 4A54 A; 2MF2 A; 2K2V A; 3EGU A; 2BUD A; 5GMK h; 4LUE A; 3JCM e; 3GF5 A; 2P0Q A; 4F7U E; 4DBF A; 1CKA A; 1ZX6 A; 2RJF A; 4RTZ A; 2COZ A; 4HCZ A; 3HL8 A; 1C0M A; 1KHC A; 1YJ9 Q; 3FJ5 A; 1VQK T; 2K3Y A; 4M77 C; 3OS2 A; 2LX7 A; 4M7A E; 3BFM A; 1VQM A; 4LDY A; 1XQH A; 1KFZ A; 1F1B B; 1S1N A; 4PJJ A; 1S72 Q; 1H8K A; 3OY9 A; 4JJN K; 3CCJ A; 3CCU Q; 2K9G A; 3M0S A; 3RMS A; 1EIF A; 2GGR A; 3I35 A; 4X1V A; 1KQS S; 4UC4 A; 4J8O A; 1YWO A; 4M7D G; 5GMK i; 1QWF A; 2EKO A; 3FEO A; 2BIV A; 4BI4 A; 4RTY A; 4F7U A; 1LCK A; 2EGC A; 2GQI A; 5GAO n; 3MEA A; 3TVT A; 4BE2 A; 1KSW A; 2DX1 A; 4C8Q G; 4B6M A; 1BI1 A; 1MHN A; 1RI9 A; 1M27 C; 2AKK A; 1FX7 A; 1M3C A; 1HXD A; 3RER A; 3CC4 A; 2O88 A; 1RAH B; 1JJ2 A; 2RA2 A; 2NUT B; 2FPE A; 3C95 A; 1YBY A; 2A37 A; 5KYU A; 2CZ0 B; 2HZY A; 2OTJ A; 3G6E A; 3PVQ A; 3NTK A; 4M78 G; 2M02 A; 2DE0 X; 1VQ7 T; 3EG1 A; 2NWM A; 3CME T; 3DLM A; 4ZN1 A; 3G4S A; 1Q82 R; 3CBM A; 4KUL A; 2MPX C; 4R55 A; 4JRQ A; 1Q95 G; 3VKI A; 4C0F A; 1JB0 E; 5LJ3 g; 2KSS A; 1M90 R; 2L3P A; 1RUW A; 3G71 T; 2E5K A; 3NFC A; 1BIA A; 3L2R A; 4KUD K; 3QZ5 B; 2KXC A; 3EFR A; 3BE3 A; 3NMZ C; 1YJ9 A; 3EH1 A; 1UJ0 A; 5KYW B; 4C92 C; 2KMT A; 1VIF A; 2CP3 A; 2KRM A; 3H8Z A; 3JB9 F; 1YJN T; 3C0C A; 1S72 A; 1Y71 A; 3BDU A; 1SKU B; 3CCU A; 3S3N A; 1Y7X A; 1IGU A; 1CKB A; 2QQS A; 3I5R A; 4M75 E; 2EQM A; 1BKB A; 1V29 B; 2RHZ A; 5LJ3 e; 2BTT A; 4RCC A; 2YRC A; 1DJ7 B; 4J9D A; 3M0P A; 3QO3 A; 2RJE A; 4M77 E; 3UA6 A; 1TXQ A; 3JCM d; 5DY9 A; 2ROL A; 3M4Y A; 3CCL Q; 2EYQ A; 2X4W A; 3EGX A; 5CKE A; 2VGM A; 3OB9 A; 2RHU A; 4E7H A; 3OYL A; 5FU7 B; 5GAM f; 2RK2 A; 3I56 T; 2VUB A; 1QKW A; 1N8R R; 3SWN B; 1OZ2 A; 2RB6 A; 1OYX A; 4OVA A; 1MUZ A; 1VQP Q; 4F7U G; 4HXJ A; 5I2S A; 2ZPI B; 5I21 A; 5A0L A; 1M90 C; 2PVG B; 4EMK B; 1Q82 U; 1VIE A; 2IIM A; 4PKC C; 1CSK A; 2EQU A; 1RAG B; 4A4K A; 2LJ0 A; 1VQK Q; 3JCM W; 2CRE A; 2KRS A; 1M90 U; 2YUN A; 3QG1 A; 1VA7 A; 5GAO m; 3KXT A; 1LJO A; 2DIQ A; 4E7J A; 2R5M A; 4LD9 K; 5AYF A; 1OPL A; 1IB8 A; 5GAN g; 3RBB B; 5J26 A; 3M5A A; 1OZ3 A; 2EGE A; 1JO8 A; 3A8L B; 1PRM C; 4NS5 A; 1TG0 A; 3V8J A; 2QYZ A; 4OF1 A; 1JJ2 P; 2RQT A; 1AD5 A; 8AT1 B; 3JRZ A; 1PKS A; 1BI2 A; 2E64 A; 1T0H A; 4DBH A; 1D1C A; 1U1T A; 1X6B A; 4Z8A A; 5CCA A; 4J9G A; 4X34 A; 3QXE B; 1GCP A; 3M56 A; 2BZY A; 1TU0 B; 3QWX X; 1TUD A; 3MO8 A; 3OYK A; 5GAN e; 1H3Z A; 5FU6 C; 1M3B A; 2XU8 A; 3RUX A; 1KC8 C; 4GBQ A; 3PIO A; 1K8A R; 2E4H A; 3VUZ A; 4ZGD B; 1NM7 A; 2E6N A; 3M55 A; 2FO0 A; 4ME7 A; 3OSV A; 2NUT A; 2B86 A; 4JZ3 A; 2ED0 A; 3LH0 A; 4F17 A; 1N8R U; 3RNJ A; 3HFO A; 2HKN A; 4ANJ A; 3CC7 T; 1TH7 A; 2KBT A; 1VQP A; 1HSQ A; 3JCM b; 2ZCF B; 2X35 A; 3QJY A; 1WQW A; 4PJO B; 4QQD A; 1ZA1 B; 2CT4 A; 2F69 A; 2LX9 A; 3VV0 A; 1VQK A; 3CCM Q; 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