The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
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sequence length |
110
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structure length |
110
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Chain Sequence |
MVNWAAVVDDFYQELFKAHPEYQNKFGFKGVALGSLKGNAAYKTQAGKTVDYINAAIGGSADAAGLASRHKGRNVGSAEFHNAKACLAKACSAHGAPDLGFAIDDILSHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Neural hemoglobin
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| publication title |
Oxy structure of His100Phe Cerebratulus lacteus mini-hemoglobin
rcsb |
| source organism |
Cerebratulus lacteus
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| total genus |
44
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| structure length |
110
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| sequence length |
110
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-05-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2W6X A; 2D5Z B; 2EVK A; 3WCT D; 1QXD B; 2GKN A; 2MGM A; 4HSX A; 1HGA A; 3K8B A; 2ZS0 B; 3HHB A; 2MYC A; 1CO8 A; 2RI4 B; 3ZJI A; 1V75 A; 1MLS A; 1V4X B; 5HLU A; 3GQG A; 1CQ2 A; 2OH8 A; 5CN5 A; 1MLR A; 1HBH A; 1VXD A; 2V1E A; 3E5O A; 3UBC A; 3NFE A; 4YU3 A; 3ZHW A; 1QPW B; 5EOH A; 4PQ6 A; 2W6Y A; 2QU0 A; 1S5X A; 3D1K A; 3UHW A; 3ASE A; 2Z6N A; 2ZLW A; 2MYB A; 5E29 B; 5AZR A; 1GBU A; 1HGC A; 3S1J A; 4X0L B; 3QM8 A; 1FSX A; 1MCY A; 4TYX A; 1Y7C B; 2O5O X; 3SZK B; 1Y7Z B; 1QXE B; 1G0A A; 1BZZ B; 2MGB A; 4FC3 B; 1MOA A; 1FAW A; 2DXM B; 3KUN A; 1YVQ A; 5KDQ B; 3OZV A; 112M A; 2BNL A; 2GNV A; 1SDL B; 1VXE A; 1HJT A; 3ECZ A; 102M A; 1DKE A; 3AQ5 A; 4FH7 A; 3R5I B; 1BJE A; 2ZSQ A; 1FN3 A; 2FRK X; 3PT8 B; 1MDN A; 3PEL A; 3OZU A; 1MGN A; 3A5A A; 3A0G A; 1MNJ A; 1A4F B; 2DN2 A; 4KN3 A; 1HRM A; 1JZM A; 4ROM A; 1EBC A; 2ZFO B; 1NIH B; 4F6J A; 1Y8K A; 3UHC A; 4O4Z A; 3WCP A; 101M A; 2MGK A; 2B7H B; 2OHA A; 2NRL A; 2D2M C; 4O2G A; 1KR7 A; 1ABS A; 2QSS B; 3MJU B; 2MGI A; 3EOK B; 4ESA A; 3HEO A; 4MQH A; 2D2N A; 2ZLT B; 2DN1 A; 2O5B X; 2RAO B; 4L2M A; 2ZLX A; 5SW7 B; 2D5Z A; 1QXD A; 3WCT C; 1MYI A; 1J7W A; 4HRT B; 1C40 B; 1HLB A; 1DXV B; 1FDH A; 2OLP A; 1YEO A; 1V07 A; 1JWN A; 2ZT2 A; 4AVE A; 5MBA A; 2BLI A; 3A9M A; 3HF4 A; 1QPW A; 2HHD A; 1A9W A; 3GYS B; 4DC7 A; 1V5H A; 2LH2 A; 1X9F D; 1J41 B; 1RQ3 B; 4TWU A; 1EW6 A; 2G10 A; 1MZ0 A; 1Y2Z B; 2QMB B; 2MHB B; 3O89 A; 1BZ0 B; 1MLM A; 4U8U D; 4B4Y A; 4X0L A; 1VRF A; 1GCW B; 2HCO B; 2MGH A; 1Y7C A; 1YHU B; 2MBW A; 3SZK A; 4H2L B; 1MYT A; 1QXE A; 3ZJQ A; 3WCV B; 2ZFB B; 4FC3 A; 1FHJ A; 2DXM A; 3QM9 A; 2GTL B; 1V4U B; 5KDQ A; 3S66 B; 1LFL B; 3UHR A; 1YZI B; 1VXH A; 2ZSZ A; 2GRF A; 2R1H B; 1SDL A; 2EF2 A; 3VRF B; 2WTG A; 5CHQ A; 4F6B A; 4ODC B; 2QLS A; 3R5I A; 3WCW B; 1HCO A; 4FH6 A; 3W4U B; 111M A; 2FRF A; 1CPW A; 1A4F A; 1GLI B; 1EMY A; 4KMV A; 2E2Y A; 1Y83 A; 2AUP A; 2ZFO A; 1M9P B; 1OUU A; 1S56 A; 1NXF A; 1I3E A; 4N8T B; 5EE4 D; 1VWT A; 3ED9 A; 2B7H A; 2QFK A; 2VEE A; 1N9H A; 2EB8 A; 1MYG A; 1MYM A; 2QSS A; 2LH1 A; 2ZLT A; 1XZV B; 1HDB B; 2GRZ A; 1HBS B; 3QJB B; 1RQ4 B; 1ECD A; 3OGB A; 1YH9 B; 2R50 A; 3VAU A; 5SW7 A; 1JP9 A; 2V1F A; 4H07 A; 4F69 A; 1J52 A; 1SI4 A; 1XZ5 A; 2HBF B; 2GDM A; 4HRT A; 1C40 A; 3M3A A; 1CP5 A; 5IKS A; 2ZS0 C; 1S69 A; 4B3W A; 1RTE A; 5CN4 A; 2W6W A; 1KD2 A; 3LHB A; 108M A; 1JF3 A; 3TM9 A; 3HXN B; 4MAX A; 2AV0 A; 3GQP B; 3DR9 A; 1IWH B; 3GYS A; 1MBO A; 104M A; 3WTG B; 4NK2 A; 3IC0 B; 4ZVA A; 4SDH A; 1YOG A; 1J41 A; 1RQ3 A; 4WJG A; 3LB4 A; 4WCH D; 2VRY A; 3HHB B; 3UHH A; 1Y8I B; 2HHE B; 3CIU B; 1Y2Z A; 3OZW A; 2ZS1 A; 1BZ0 A; 3GQG B; 3H58 A; 2HCO A; 3LB3 A; 4NI1 B; 1YHU A; 3NFE B; 4H2L A; 2XKH A; 2G0V A; 3PIA A; 3WCV A; 2ZFB A; 1DO4 A; 1A01 B; 4MQI B; 1AJH A; 1S61 A; 2GTL A; 1V4U A; 3S66 A; 3EDA A; 3AQ7 A; 1N9X A; 1LFL A; 1SHR B; 1YZI A; 2QU0 B; 1S5X B; 3ECL A; 1Y45 A; 1YEN B; 3D1K B; 1MYF A; 1MLG A; 2HBE B; 2Z6N B; 1I3D A; 3VRF A; 1Y46 B; 3WFX A; 4ODC A; 2W31 A; 1CMY A; 1BBB B; 3WCW A; 3UHY A; 3W4U A; 1LUE A; 2R80 B; 1GLI A; 3V2Z A; 1HBI A; 4ZVB A; 1FAW B; 3A59 B; 1BUW B; 1M9P A; 1NZ3 A; 4JYQ A; 2LHB A; 4NI0 B; 3B75 B; 3QJC B; 2BMM A; 4HHB B; 4N8T A; 5CHR A; 1A6N A; 1YG5 B; 1MYH A; 3D7O B; 2BW9 M; 1DO3 A; 1OFJ A; 1BZR A; 1GJN A; 1MOC A; 1FCS A; 1GDK A; 2NSS A; 1XZV A; 1HDB A; 1OBM A; 5JDO C; 1ECA A; 1HBS A; 5B85 A; 1T1N B; 2Z6T A; 3QJB A; 3GKT A; 3QZZ A; 3IC2 B; 1H97 A; 4NXA A; 1YH9 A; 3GK9 A; 3M38 A; 2DN2 B; 1JDO A; 2HBF A; 2R4X A; 3DHR B; 3V2V A; 5EYJ A; 4NZI A; 1Y8K B; 1MNO A; 1OUT B; 2YRS B; 1ASH A; 3RJ6 A; 1A00 B; 2LH7 A; 1NZ2 A; 4H0B A; 2D2M D; 1YCB A; 1A0U A; 2H8D B; 3HXN A; 3R0G A; 1NQP B; 4ESA B; 2D2N B; 4DC8 A; 3SDH A; 1IWH A; 4OF9 A; 3WTG A; 3IC0 A; 3GKV B; 1FDH G; 1NWI A; 1VHB A; 1DWT A; 1K0Y A; 4ROL B; 2O5Q X; 5C6E B; 1J7W B; 1O1K B; 3ZJH A; 3D4X B; 1Y8I A; 2HHE A; 3CIU A; 4PQC A; 3UHQ A; 2JHO A; 2WY4 A; 1SWM A; 3WFW A; 1MLK A; 2ZT3 A; 1G9V B; 1HHO A; 5M3S A; 2W6V B; 1Y4F B; 4NI1 A; 1YEO B; 1MYJ A; 1A3N B; 1YDZ A; 4G1V A; 1DLW A; 2OHB A; 3HF4 B; 2GLN A; 1O1P B; 2HHD B; 1A01 A; 3A5B A; 4MQI A; 4FWX A; 5CN9 A; 1GZX B; 1EWA A; 1SHR A; 2PGH B; 3A5G A; 3DHT B; 1YEN A; 4XDI A; 3UHZ A; 2HBE A; 1C7B B; 1COH B; 4VHB A; 3BA2 A; 1YVT A; 1HDA B; 1Y46 A; 2MGG A; 4AVD A; 1A6G A; 2AUR A; 1BBB A; 4L7Y A; 1DLY A; 5KER B; 1RTX A; 3WCW C; 3MJP A; 2R80 A; 2MB5 A; 1VXA A; 3UH3 A; 1FHJ B; 3HC9 A; 1MOD A; 5EUI B; 3UHG A; 3A59 A; 1BUW A; 5JDO F; 4NI0 A; 3B75 A; 2ZSS A; 3QJC A; 3TLD A; 4HHB A; 5CN6 A; 1LFY B; 1MTJ A; 1YG5 A; 4O4T A; 3D7O A; 1EBT A; 2QLS B; 1O1J B; 3WI8 A; 2VM0 A; 1ABY B; 1HCO B; 2FAL A; 5EET A; 1T1N A; 3G46 A; 3IC2 A; 3PI1 A; 1N9F A; 3MYN A; 2G3H A; 2Z8A A; 1UT0 A; 3KMF C; 4M4B B; 3S48 C; 3D1A B; 2LH6 A; 1Y83 B; 3DHR A; 1A3O B; 2GKM A; 4FWY A; 3MOU A; 1OUU B; 1OUT A; 2YRS A; 1YEV B; 3ZJL A; 1VWT B; 1A00 A; 3TM3 A; 1O1O B; 3ZJM A; 2G0X A; 1MNI A; 1MWB A; 1UVX A; 2VLY A; 2V1H A; 2H8D A; 5HLQ A; 1NQP A; 2VLZ A; 3OJ1 A; 1URY A; 4NS2 A; 1Z8U B; 1UX8 A; 3GKV A; 4ROL A; 4JAC A; 1SI4 B; 3G4W A; 1XZ5 B; 5C6E A; 1O1K A; 2EKU A; 3D4X A; 2MYA A; 2ZS0 D; 1JL6 A; 2C0K A; 4IRO B; 1U7S A; 3GDJ B; 1UIW B; 1G9V A; 3AT6 B; 2W6V A; 1Y4F A; 1KD2 B; 1YIE A; 1Y8W A; 5CMV A; 4F6G A; 1ABW B; 1MLF A; 1A3N A; 110M A; 1O1P A; 2ZT1 A; 1HAC B; 1GZX A; 1MKO B; 2D60 B; 2FRI X; 1IRC A; 3S65 A; 3WCU B; 2PGH A; 3IA3 B; 1UFJ A; 3DHT A; 1J40 A; 3BCQ B; 4MPM A; 3PI2 A; 3ZJP A; 1S0H B; 1C7B A; 1COH A; 1HDA A; 1X9F A; 1YCA A; 2ZS1 B; 3BJ2 B; 2BLJ M; 2DC3 A; 1CBL A; 4GZG A; 1CQX A; 1Y01 B; 1GDJ A; 2VYY A; 3QM7 A; 5KER A; 2G14 A; 3PIA B; 4N7O A; 2MGL A; 3UH5 A; 3PI4 A; 1HDS B; 2VLX A; 3PT7 B; 4XS0 B; 5EUI A; 4QAU A; 1G08 B; 3DUT B; 1A6K A; 1S5Y A; 3LR9 A; 4MU5 A; 1Y45 B; 5E83 B; 3ARK A; 1LFY A; 3MVC A; 2EB9 A; 1YHE A; 3G4R A; 3D17 B; 1Y0W A; 2M6Z B; 1O1J A; 4MXL A; 1CMY B; 3RJN B; 1VXF A; 1ABY A; 1JP8 A; 2G11 A; 1CH2 A; 1YEQ A; 4MQJ B; 1JF4 A; 4UUR A; 2D6C A; 1C7D A; 1UVY A; 2H8F B; 1HGB B; 1Y4V B; 1NEJ A; 1MBN A; 2HBC B; 2XKG A; 3VRG B; 4M4B A; 5HBI A; 3D1A A; 1LJW B; 1O16 A; 5HAV A; 2HBG A; 5D5R A; 1D8U A; 1DTM A; 1A3O A; 4C0N A; 2ZFO D; 1XZ4 A; 1F5O A; 1YEV A; 5E6E A; 5JGG A; 2DN3 A; 3UGZ A; 3CY5 A; 1O1O A; 4F6I A; 1CIK A; 2QSP B; 2SPO A; 3AT5 A; 5JDO D; 1RPS A; 1H1X A; 3LB2 A; 1J7S B; 1Y22 B; 1JEB B; 2D2N C; 2GL3 A; 2ZWJ A; 1Y35 B; 2KSC A; 1UMO A; 2WTH A; 3NMM B; 2VYZ A; 2G0Z A; 2O5L X; 1Y5J B; 3UI0 A; 4HBI A; 4IRO A; 1M6C A; 1Y8H A; 3GDJ A; 1UIW A; 3AT6 A; 1CH9 A; 3ZJO A; 1VXG A; 1YGF B; 1ABW A; 5CNB A; 1A0U B; 1Y4R B; 1BZ6 A; 1KFR A; 5HU6 B; 5KKK A; 5CNF A; 1HBA B; 3VRE B; 1HAC A; 1MKO A; 2D60 A; 1BIN A; 1BZ1 B; 1LHS A; 3WCU A; 1Y5F A; 3BCQ A; 1K0Y B; 2ZLU A; 1K1K B; 1HLM A; 1F5P A; 1S0H A; 3P5Q B; 1LFV B; 2EVP A; 4O1T A; 2NSR A; 1PBX B; 1QSI B; 4HRR B; 3BJ2 A; 1Y5K A; 3BJ1 B; 3WCT B; 1MLL A; 1HHO B; 1WLA A; 3EDB A; 2O5M X; 2XYK A; 1CG8 B; 1YEU A; 1LH3 A; 1YHU D; 1YDZ B; 1HAB B; 3ZOL A; 3UHT A; 2EKT A; 3O7N A; 1HDS A; 4XS0 A; 1IOP A; 3PT7 A; 1Y4G A; 3WCV D; 2MGE A; 1G08 A; 3DUT A; 5JOM A; 1Y4P A; 1DWR A; 2GTL D; 3UHX A; 5E83 A; 1GDI A; 3UHU A; 4KMW A; 6HBW B; 2V1J A; 1CBM A; 1YVT B; 1Y7D B; 3LQD A; 3D17 A; 2M6Z A; 2ZSX A; 1XCH A; 3ARL A; 4L7Y B; 4MQJ A; 3WCW D; 1A0Z B; 5ILE A; 1B86 A; 3MJP B; 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1RVW B; 1ECN A; 3G52 A; 3WCV C; 3S65 B; 2ZLV A; 2BLH A; 2MYD A; 1LFZ B; 1J40 B; 2GTL C; 1F65 A; 1CH5 A; 3ODQ B; 3UHB A; 3ZJR A; 1RQA B; 6HBW A; 1DXC A; 5B84 A; 1JZL A; 1NWN A; 3OO4 B; 1N9I A; 3NML A; 1X9F B; 1RSE A; 1Y7D A; 1GVH A; 1IRD B; 2HBS B; 1JY7 B; 4MQC A; 1A0Z A; 2O58 X; 5AB8 A; 1MBC A; 3OK5 A; 2MGJ A; 4N7O B; 1V9Q A; 4U8U B; 1MBS A; 1XZU A; 1XZ7 A; 2SPL A; 3GOU A; 1X3K A; 1XYE A; 1Q1F A; 5EYS A; 3WR1 B; 3E5I A; 1S5Y B; 1J3Z B; 3EU1 A; 3FS4 A; 5EV5 A; 1HV4 A; 1J3Y B; 3HRW B; 1J7Y B; 3UHI A; 1LH5 A; 1XZ2 B; 3M3B A; 1BAB B; 1JW8 A; 2DHB B; 3G53 A; 4O35 A; 2R4Z A; 1YHE B; 1YIH A; 1Y0T A; 1THB A; 1HBR A; 5ILM A; 1Y4Q B; 1DWS A; 2HBD A; 4NK1 A; 1DXU A; 1Y0W B; 4YU4 A; 2AV3 A; 1CLS A; 3WFT A; 1MYZ A; 1YEQ B; 3OO5 A; 1MLH A; 2BKM A; 1G0B B; 2V1G A; 1C7D B; 1XQ5 A; 4WJG 1; 1NEJ B; 2LH5 A; 3K3U A; 1Y0D B; 1O1L A; 2ZSN A; 5HY8 A; 1R1X A; 1YE2 B; 1S6A A; 3UGY A; 1LFT B; 1GCV A; 3QJD A; 1XZ4 B; 5JGG B; 5E6E B; 1DXD A; 2AUQ A; 2DN3 B; 1LTW A; 3CY5 B; 1R1Y A; 2W72 B; 4G51 A; 4N7N A; 1YGD A; 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