4F83A

Crystal structure of the receptor binding domain of botulinum neurotoxin mosaic serotype c/d with a tetraethylene glycol molecule bound on the hcn sub-domain and a sulfate ion at the putative active site
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
416
structure length
413
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNALVDTSGYNAEVRLEGDVQVNTIYTNDFKLSSSGDKIIVNLNNNILYYENSSVSFWIKISKDLTNSHNEYTIINSIKQNSGWKLCIRNGNIEWILQDINRKYKSLIFDYSESLSHTGYTNKWFFVTITNNIMGYMKLYINGELKQSERIEDLDEVKLDKTIVFGIDENIDENQMLWIRDFNIFSKELSNEDINIVYEGQILRNVIKDYWGNPLKFDTEYYMINYNYIDRYIAPKNNILVLVQYSDISKLYTKNPITIKSAANKNPYSRILNGDDIMFHMLYDSREYMIIRDTDTIYATQGGQCSKNCVYALKLQSNLGNYGIGIFSIKNIVSQNKYCSQIFSSFMKNTMLLADIYKPWRFSFENAYTPVAVTNYETKLLSTSSFWKFISRDPGWVEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords Type C neurotoxin
publication title Structural insights into the functional role of the Hcn sub-domain of the receptor-binding domain of the botulinum neurotoxin mosaic serotype C/D.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 109
structure length 413
sequence length 416
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4f83A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4f83A02
1JTCA 2EAKA 4K20A 1GNHA 1LHWA 4AN6A 3O5WB 4R9DA 5H9QA 3FBYA 1DJSB 3UJOA 1A3KA 4LBLA 3CAHA 3OJBA 1GNZA 1HLCA 3AXDA 1SBDA 3BAVA 2GDFA 1IS4A 1DLLA 2ZGMA 4JAWA 5T5LA 3WINC 1LOFA 1OQ1A 3WMVA 2KI4A 1A8DA 2F2FC 3OJ2A 3UD9A 1YXWA 1FV2A 3K1XA 2YZ4A 1GSLA 3RG0A 1UMZA 3CA1A 1QOTA 1JT5A 3F62B 7I1BA 2P3IA 1YRZA 3LSDA 4Y22B 1KNMA 1YYNA 3ILFA 4R9BA 3SISA 1DYPA 4YG6A 1PZZA 3P53A 1IRPA 4IQPA 3CRGA 3CQAA 5GM0A 2VSAA 1LU1A 2ZQNA 2ZQOA 3A4UA 3FJ8A 31BIA 3EF2A 4XZPA 5GZFA 5EYYA 1G8WA 3MALA 2YY1A 2ET2A 2D3PA 1LHUA 1LHOA 2DYCA 2Y9GA 3BAQA 2V5YA 1V6UA 1CESA 1Q8VA 2RSTA 1DHKB 1M16A 2R1BA 4QKSA 2A3WA 2PHFA 4PCRA 3IKWA 1BFBA 5E24E 2W68A 3IM0A 2JECA 3OBTA 1Z0HA 2A75A 4DENA 3FLTA 3Q7WA 4YM0A 2FFVA 4LO2C 2UU8A 4AVTA 3T2TA 1GICA 3WOGA 1RY7A 4XFSA 1WW4A 4YOLA 5IK4A 2ZGNA 4L4IA 1Z78A 3AZXA 1LGBA 4CRQA 4Y1XA 2ZGOA 1AXMA 2KKIA 4FPOB 4BOWA 1ULDA 4MYEA 8I1BA 2PHWA 4CZSA 4DRVA 1WBLA 1NUNA 1RMLA 2GZBA 3CA4A 2E6VA 4I4XA 1QKQA 1LEMA 2WKKA 3KMVA 2ZAAA 1ONAA 3I29B 5BXPA 1SBEA 2D23A 4FPHA 5DZUA 4K1ZA 3A07A 1N1SA 3WMUA 2X2TA 1MS4A 2DRZA 4CTEA 4XIKA 3BRDA 2ZHKA 2ZGLA 2G4IA 1SR4C 3V64A 3WHTA 1HWMB 5GZGA 3OPZA 1M2TB 2R1DA 2GNMA 2JKBA 3HOMA 1G9DA 4LBQD 4Y1VA 1Z4SA 3UJ4A 3M3OA 2ZGPA 1MS5A 5H9PA 2IWTB 4ZFYB 1MACA 1W6NA 4DQAA 1LJ7A 1GANA 1LCLA 1TEIA 3WUCA 4GP0A 4R9CA 3VWCA 3BODA 1VAVA 4XE9A 1ITBA 1NZKA 1C4RA 2EXJA 3CA3A 1ILR1 2A6ZA 2YV8A 1UN1A 4FPEA 2Z48A 2FHRA 2WBCA 4HJJA 3AH4A 5IK8A 1O4ZA 4II0A 2MLLB 5BXSA 1GLHA 3WDWA 2E53A 4I4RA 1ULGA 1CQ9A 5HCFA 3ENRA 3N3HA 4Q9GA 2GNTA 4Q91A 4BQ1A 2ZBJA 3AYAA 1Q8OA 2W08A 2DVGA 1UX6A 1G7YA 4ZXKA 2AH2A 3B00A 3KQRA 2PHUA 5LK5A 5H9SA 2NMOA 4M3CA 3ZYPA 2AUYA 1EYLA 4R9AA 1TP0A 2YMZA 2ZKNA 1GGPB 1FX5A 4YFZA 3WG3A 3NJ5A 4Y1ZA 3WDXA 1QXMA 3P6JA 3FJCA 5FNWA 2ZGQA 1IOAA 1C1FA 1ZA4A 2GNDA 4F83A 2CTVA 5B2HA 4L8QA 1DQ4A 4XJWA 3E8LC 5T5JA 4JC1A 1LOCA 3FJEA 2D6PA 3POYA 3OJMA 4JRAA 4GA9A 4Z8BA 1VAMA 4YZ5A 1URXA 1HCDA 2V73A 3NV4A 2DWRA 4LO7B 4XHXA 2HZ9A 2KI6B 1N1TA 5CA6A 1CPNA 1BFFA 3POSA 4XTPA 3ILNA 4LBQB 4AVSA 3VT1A 2MIBA 2GO2A 1FQ9A 1CONA 2DUOA 2IHOA 3AP6A 1JUIA 5F9TA 3Q7XA 5AVAA 3SH5A 2GALA 3IN9A 3BX1C 3FJAA 1GZWB 5DG2A 1LGCA 5F8SA 4X38A 5DUWA 4I4QA 1ZM1A 1LOFC 1JN2P 3PUBA 2A5ZA 1LGNA 4H9WA 1Q1UA 1SBFA 1PZ9A 3F1RA 2I2SA 3H6SE 2D1ZA 3IM7A 1JLYA 3RS6A 4FQZA 4QALA 2XB6C 2VY0A 1SACA 1AX2A 3RTIB 4GWNA 3O3QA 1YI7A 2D6MA 4AN7B 1S0FA 4BM8A 4P0LA 3ZYRA 1AXYA 3PHZA 4OZXA 4ZA3B 1Q8PA 1ISVA 5KXCA 2D6KA 4M3CE 1BQPA 1XHBA 1QNWA 1S0CA 3ZSJA 4I2SA 1WW6A 1MD6A 3S8KA 5T5PA 2AREA 3JRRA 4DFSA 3MPPG 2WT2A 3R4SA 3FJDA 2GMMA 4FP3A 3WCRA 3N36A 1AJKA 4JP0A 2YUGA 1U0AA 3AP5A 5F5QA 1P63A 4H04A 3NV2A 3BAGA 3C2UA 1H9WA 2E51A 5DUVA 2OUJA 2HW9A 4XTMA 2KLLA 2EF6A 4YM3A 3WDVA 3AKIA 1RINA 1W6PB 3TAYA 2ZACA 3O4OA 3B01A 4YGCA 3HR9A 4XFTA 1AX1A 2C5DA 1Y7BA 1I1EA 4LBJA 2YROA 4PQ9A 1MC9A 3L2YA 3VUOA 3FJBA 3AYCA 3NBEA 2EXIA 1RG8A 2ZHMA 3WO3A 1OFSA 3ZXKA 5CNAA 4LO1A 2BFHA 2ZMKA 1IJTA 3MW3A 1F9KA 2PHTA 2AFGA 4QKRA 4UW3A 4QO3A 1LOGA 1UL9A 4QD2C 5KXEA 3O12A 3WG2A 1TWEA 3IIRA 1FAYA 1WUVA 3WO4A 3AZZA 4YW2A 2A6XA 5E88A 4OUJA 4YM2A 4C1WA 1JT4A 5GZDA 5FNXA 3RMXA 1W6QB 2D6OX 4XYXA 4FQ4A 1V6IA 2Y9WC 2W39A 2E7QA 3V0AB 3CU1B 4YGEA 1EVTA 4I96A 1FNYA 2CWSA 5GLZA 3I2XA 1AVAC 5CB7A 4YW1A 2D7RA 1MVEA 3ZC9A 3O44A 4ZFWB 2VU9A 2H0BA 4I4SA 4FOWA 1QNYA 1BA7A 2K43A 1KDKA 2ENRA 4I37A 5D62A 2BQPA 3Q9OA 3B9UA 1R8OA 2ZMLA 1BFGA 3PVNA 4AGGA 3AX4A 1G82A 2ARBA 2ES3A 3NV1A 2ZHNA 1DFQA 3M2MA 3O0VA 2E4MA 4GOVA 4LBQA 5BXRA 4LBOA 4M00A 1MS9A 4HA2A 4YW3A 4WVWA 5HCAA 2D7FA 1FMMS 1K5UA 2CNAA 4XDQA 3AZWA 3OY8B 4GKYA 1J0SA 4IZXA 1LHVA 3M3CA 1JLXA 2DREA 3N7LA 4ZLBB 3SNMA 4ATEA 4OWKA 4Q26A 4YFWA 1I3HA 3N0KA 2UWAA 1YO8A 1JT3A 3WLUA 2PHXA 4YM1A 1W6OB 1V6VA 2ESUA 2KH2A 2AENA 2WSVA 1AJOA 3VEQA 2C9AA 4FPKA 4P14A 2ZGRA 4P0KA 5IK5A 2P3KA 4Q27A 4YGDA 2EIGA 1K5VA 2Z49A 3ZX7A 1APNA 3N7KA 4OEFA 5L73A 1TIEA 4RL7A 5GJ6A 1ABRB 2D24A 4XBNA 4I4VA 4XJ8A 3HBWA 1QOOA 1LOAA 5EYXA 1V6XA 3JUUA 1LOEA 3B9CA 4CJMA 3BRGC 4EKXB 3KM5A 1X50A 2OUHA 4GALA 2NZ9A 3WVJA 4USPA 3ZXGA 1KJRA 3SITA 3AFKA 3APBA 3POWA 1HCEA 3CRIA 4J2YA 3O49A 3SNVA 1XYFA 3FJIA 4LO0C 4FPYA 3M3EA 3DGTA 3FJFA 2CWMA 1N4KA 5EHAA 3BRFA 4YG3A 9ILBA 5FZUA 3QYDA 1WLDA 3RSJA 3M3QA 4XIOA 1IS6A 4FOQA 1PUUB 1BFCA 4FPLA 1N3OA 1V6NA 1S0GA 2WJSA 1AZDA 5JVVA 1AFCA 1VCLA 4TLPA 3BAOA 5T50A 1N1VA 4ZOTA 4PBOA 1GYKA 3R05A 4LO8B 1N3QA 1JHNA 1J1TA 3OBRA 4YZ4A 2RHPA 3O0XA 4LBKA 3V65A 1I1BA 4GP3A 3LLPA 4JCKA 1FWUA 1IS3A 2NMNA 4W65A 5DUUA 4UW4A 3H6RB 3Q7YA 4ASMB 2ZMNA 4JKXB 1IOBA 3AJ5A 1TWMA 4XMAA 3ZVXA 4IONA 3AP4A 1LTEA 4X37A 4OEEA 1S0BA 3AZYA 4PF5A 2HWAA 3FLPA 2B7YA 5DG1A 4GAIA 21BIA 4BLJA 1HQWA 1HQLA 4Z8SB 4NOTA 2OVUA 4DCKC 1O4YA 1WW7A 2R0HA 5H9RA 1VLNA 1MS0A 3UJQA 2A3YA 4EB2B 1DQGA 1AVWB 5DUYA 5T54A 3AP9A 4GWMA 4ZGRB 3BAHA 3PVOA 4KEJA 3UDAA 4FPGA 2Y9XE 1SLBA 2ZGUA 3PJQA 2NTDA 4WZFA 1S0EA 4LO1C 1LHNA 4OW4A 2VLCA 1V6JA 3D5OA 4Y22A 1DQ0A 5E89A 4F34A 1FN0A 1AXZA 3LTQA 1KDMA 1AXKA 1HIBA 3HMYA 1UKGA 4DS0A 3O4AA 1AVBA 3JU9A 2WT1A 5F8YA 2UWCA 3ZXLA 3ZXDA 1QMJA 2AGSA 5GAQA 3FUOA 4M3CF 5GZEA 1WLCA 1T4QA 4I1BA 1DZCA 3D4KA 3M1HA 2I1BA 2GMPA 5JOXA 1XQNA 3ZSMA 4LO3A 5FREA 3WV6A 3WO2A 4G9NA 3LCPA 1DQ6A 4WBCA 2D22A 4G6JA 1JBCA 2QN4A 4YW4A 2A6YA 3UK9A 2JE9A 4PBPA 4X39A 4EEEB 2AR6A 1H30A 3USUB 1F5FA 4SLIA 3AKFA 4I30A 5GLWA 2J3PA 2E4MC 1SFYA 1SLLA 2ZA9A 2A3XA 4A7ZA 3NBDA 5HPZA 5BP5A 2YXSA 3TB0A 5GLUA 4EFQA 2EXHA 4XOGA 3WZ1A 3UD7A 4M01A 1QQLA 4ZBVB 5DZEA 2P23A 2DVAA 3FJ9A 5EG6C 4ISRA 1ONKB 5GALA 2DUPA 2BEBA 2D44A 2CL2A 3WUDA 4BPZA 1SLIA 4GOYA 3WG4A 4K21A 4XJUA 4I4OA 1V6LA 1W3FA 1ULCA 2WT0A 1LESA 2FFUA 1KJLA 3ASIA 3AJ6A 2FMDA 3IPVB 4XXPA 1WBAA 5BXTA 3ZXEA 2NP0A 3P6IA 3FJKA 3UD8A 4QD2B 3IAGC 1GZCA 2VW1A 1MR5A 2SBAA 2PELA 3VT2A 3BADA 3T8SA 3IM6A 2UURA 1SLAA 2XG3A 3B3QE 5JMCA 3VKLA 1DBNA 2AXMA 4OEGA 2UWBA 1Q8QA 3PG0A 2JJ6A 4HR6C 2VXTI 4HANA 1BASA 4QBVA 1AVXB 3QCWA 3OJVA 3WA1A 1FNZA 3SH3A 1SZ6B 5JDBA 1MS1A 3VKFC 1V00A 2LIQA 1PZ8A 5JOZA 3W58A 5IUQA 4YZ2A 5DZFA 4Q1RA 1V6OA 2F8XC 4YW5A 3W59A 3A21A 3IMNA 4Y26A 3SH4A 1HKNA 3TC2A 1WD3A 2DS0A 5BQUA 2NM1A 2VXRA 1RITA 2D3RA 2DU1A 2FO1A 5FRAA 2M49A 1CVSA 1W0PA 1JXNA 3BA4A 1W0OA 4K1YA 2MC2A 1WBCA 1ENQA 2LALA 4IHZA 1CE7B 4I4UA 1NXD1 4DEPA 1MZ5A 2DVFA 2A7AA 2RG9B 4Q1PA 3AH2A 4Y24A 3D7WB 1PWAA 4IY9A 3S8JA 4OWLA 3FJHA 4FVVA 3MW2A 4YZ1A 5BVPI 4EFPA 4IY8A 2GNBA 4FPJA 2WSUA 1RZOB 1QDCA 4KBBA 1IILA 2WRYA 1FYUA 2VW0A 4M3CB 4XKIA 3LSEA 3RRDA 5F90A 1BJQA 2DVBA 1TOOA 4AGVA 3AKHA 4I1EA 2EALA 1WLWA 3WCSA 1XZZA 2VH9A 1V6KA 1Q8SA 5KXBA 2FGFA 1GZWA 2CYFA 3QR5A 1LULA 1H9PA 4WVVA 1AF9A 1KITA 4AYUA 4I6IA 4I3NA 3U4XA 1PUMB 4C1XA 2TEPA 2P2KA 3AK0A 3RQ0A 1ENSA 2P39A 5BYNA 3VT0A 3A0KA 1IKQA 1MS3A 3AYDA 4FPFA 2AAIB 2JD4A 3HN1A 1HKDA 3OYWB 2D6LX 1CPMA 3USUA 1JOJA 2VW2A 4Y1UA 1L2HA 4P9WA 3WDYA 4ZFUB 1EPWA 4XBLA 4U2AA 4JPZA 1FGAA 5I1BA 2R0FA 4KC3A 1JYCA 4QBCA 4GKXA 2DU0A 1T9FA 1WBFA 1DYKA 1Q03A 4DPNA 2JE7A 3AXEA 1GBGA 3O4BA 4XBQA 4D0ZA 3WDTA 2L5XA 1JY0A 1LODA 3B69A 4LO3C 4ATFA 2NN8A 4G9MA 3H6QA 4Y1YA 3RMYA 4IYBA 4J2SA 2LIEA 5DZGA 2W52A 3N7MA 3BAUA 2EXKA 4J2XA 3NBCA 1LEDA 3PMEA 4Y20B 1IRAX 6I1BA 3ZSLA 4P6AA 2A6VA 2LTNA 4UW5A 4I8MA 3IPVA 1W6PA 4WV8A 1IKPA 2K4AB 2AQZA 3D6EA 4P9YA 2D20A 1DZQA 5EXOA 2P3JA 5IT6A 3UJ0A 3JUTA 4XILA 3T1LA 4GAFA 4JKQA 1GZ9A 3A23A 4TZDA 1DIWA 3T1MA 1LENA 5HCBA 1UZZA 3O0WA 3RTJB 2ZR1B 1BARA 1KQRA 5BP5C 2WLQA 2D43A 2K8RA 1AX0A 1JQZA 1IS5A 1DGLA 3BA7A 4XFUA 5DSSB 1W3GA 1SLCA 2A71A 3FFZA 1YF8B 4YG0A 1B09A 4EFRA 4BMEA 3POKA 2VUAA 2HYKA 3ZSKA 3BTAA 2ZGSA 2UUSA 2D7IA 3ILAA 4XMIA 2DRYA 2DURA 1ENRA 2AYHA 5DXDA 1CJPA 3OGGA 4Z9WB 3WINA 1ISZA 2F2FA 1W6QA 3GALA 2PHRA 2DTYA 4U36A 3N35A 2DVDA 3V0AA 1S0LA 2DUQA 1W6MB 3N7JA 1DQ2A 3A0NA 1MVQA 1FWVA 5G00A 2R49A 3ZC8A 1CR7A 1EV2A 1S0JA 1MZ6A 1FV3A 2WNEA 1HDKA 2D3SA 5F8WA 1QOSA 1ISXA 4ISQA 2Z42A 4OWJA 4P9XA 2JDZA 1LECA 4GXLA 3OGFA 1LU2A 3V0BB 1ISWA 5T52A 2DV9A 1FATA 4PC4A 1N1YA 4G1RA 1GKBA 3ILRA 4KEKA 4I4PA 2NYYA 1C1LA 3AJYA 1BKZA 4I4YA 3WNXA 4ZKTB 3BIWE 1G9FA 3IM5A 3CNAA 4IZEA 1D0HA 1QGLA 4XJAA 2R9KB 3MEPA 2Q5TA 3BB2A 1WW5A 1SCSA 5BQUC 3FLRA 1C57A 2ERFA 3WG1A 1BYHA 3UL2A 1ULEA 3OY8A 5EWSA 4LO2A 3NBNA 1PZ7A 5E8AA 5DUXA 1G9AA 2FDBM 1DQ5A 2NVHA 1V6MA 5D63A 2OW4A 3QLQA 5JLVA 4BMBA 1CIWA 1WD4A 5GLTA 4XXAA 3GNEA 1W3AA 3FJJA 1G9CA 5KXDA 4G6MA 3R4UA 1W6OA 4RA0A 1N3PA 3OYWA 3CRHA 5SV8A 1BLAA 5JOYA 2ARXA 3O4DA 1JT7A 2WQZC 3W9TA 3V79C 1IHKA 3O4CA 4YGBA 1NLSA 41BIA 3NWKA 4AGRA 1UPSA 4NO4A 3C9ZA 2VSEA 3WDUA 4FGFA 1G9BA 2QYIB 2CY6A 3AKGA 4LO0A 3VSFA 4DRRA 2ZGKA 5EC5A 2ZGTA 1BLDA 4LO7C 4AWDA 4Q8KA 3A22A 3NV3A 1N47A 4YZ3A 2RQ9A 1G86A 2Q3NB 3I2AA 4HL0A 1DQOA 1KRIA 3AZVA 2Y9FA 2ERMA 1LOBA 1SR4A 1BXHA 4J2KA 1E0OA 2GN3A 4KEIA 1II4A 1YIFA 4FPCA 4A7YA 5DVHA 1MS8A 1DFCA 2DTWA 4XHBA 4A7KA 1SLTA 1F31A 3ZXJA 3DUIA 1QF3A 3ZXFA 5FZZA 4Y20A 4TYSA 4L4HA 3BOPA 4Q2FA 4LBNA 1Q56A 4H55A 3VKOA 5JOWA 1A78A 2SLIA 1YTOA 1CVNA 3FUQA 1VIWB 1AVUA 3BA5A 1ULFA 1TTUA 2ZZJA 4FOYA 2P37A 1CN1A 4QC4A 5CBLA 1QU0A 4Q9PA 3MW4A 2D6NA 1QQKA 5GZCA 3I8TA 1JW6A 3ZPYA 5T55A 2BEAA 1UAIA 3INAA 4ITCA 1R1ZA 1QDOA 3FGMA 3H0OA 3I4IA 1HWOB 1SCRA 5D61A 1D2SA 3WHUA 4FP2A 4YLZA 3H6RA 3O5SA 1R8NA 2GMEA 3VKNA 1OKQA 4UW6A 1VALA 4P0JA 3CA0A 1RIRA 2GN7A 1S1AA 1IT0A 5BOWA 5T5OA 1FMZA 4R6UB 1WCSA 1UZYA 4ENDA 3HSMA 2ZABA 4I0YA 4D69A 1TFMB 4BLIA 2Q9XA 1HWNB 3VKMA 5IK7A 5CAZA 1Q04A 2A6WA 3ATGA 1W6NB 4Q8LA 1V6WA 3HALA 4JQ0A 3AYEA 4I7IA 5GLVA 1W6MA 4XJ9A 1HWPB 3AH1A 4XJZA 2HWMA 4D8HA 3PVEA 1PC8B 1XG6A 3CA6A 3CA5A 2XOAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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