4F9CA

Human cdc7 kinase in complex with dbf4 and xl413
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
354
structure length
306
Chain Sequence
KKDIEKLYEAVPQLSNVFKIEDKIGEGTFSSVYLATAQLQVGPEEKIALKHLIPTSHPIRIAAELQCLTVAGGQDNVMGVKYCFRKNDHVVIAMPYLEHESFLDILNSLSFQEVREYMLNLFKALKRIHQFGIVHRDVKPSNFLYNRRLKKYALVDFGLAQGTHDTKIELLKFVRAGTPGFRAPEVLTKCPNQTTAIDMWSAGVIFLSLLSGRYPFYKASDDLTALAQIMTIRGSRETIQAAKTFGKSILCSKEVPAQDLRKLCERLRWNEVPDEAYDLLDKLLDLNPASRITAEEALLHPFFKDM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Cell division cycle 7-related protein kinase
publication title Crystal structure of human CDC7 kinase in complex with its activator DBF4.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 102
structure length 306
sequence length 354
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4f9cA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4f9cA01
4AS0A 4DEBA 4BL1A 5B2KA 3VHEA 4D0XA 2J7TA 2JBOA 2R3FA 2UZDA 3ZSHA 4XOYA 3OEFX 1SVHA 3R8MA 3LQ3A 5GJFA 4AGWA 3DJ5A 1YHSA 1PMVA 4TPTA 3K3JA 5IH5A 3HL7A 4U5JA 3HEGA 4TY1A 2J51A 4BIEA 4F7NA 1H1PA 3IW5A 4N70A 2B54A 4FTRA 4F9CA 4RJ6A 3HRBA 4BZOA 3E63A 1GZNA 5KMJA 2CKPA 3UIXA 3LFEA 5I0BA 5ANOA 1WMKA 1H01A 2VTRA 4RQKA 4E7WA 4ORKA 5C9CA 3ORKA 5IF1A 3B2WA 3C4CA 1REJA 4M15A 4ZMFA 4MWIA 2XEYA 3GP0A 2YACA 4ZAUA 4FI1A 4IWDA 3TJDA 2C47A 2RGPA 5ANIA 4BCKA 3UP7A 4DA5A 3IW7A 4ANMA 5M44A 4FV4A 4GG5A 1R78A 2OFVA 4OTIA 1YI3A 5AA9A 5CEIA 4ASDA 2IVVA 4HCUA 5I9ZA 1PMUA 3KRWA 3NPCA 4MF1A 3EQGA 4EH5A 5HESA 3DY7A 3RWPA 3TI1A 5C1QB 1Q24A 4JL9A 4RT7A 3UG1A 4IANA 4HVSA 3EWHA 4GU9A 4HOKA 4YR8A 3F6XA 3NGAA 4GT5A 4RVMA 4AT4A 4F9YA 3A61A 2WMRA 5A46A 2OLCA 5BX0A 5E8TA 4P5ZA 3OHTA 4M84A 4Y46A 2XMYA 3ZDIA 4DF3A 4IDVA 3MB7A 3WARA 4E6AA 3ANQA 2UW3A 3POOA 3QTUA 4CLJA 5B7VA 5BVFA 4LUDA 1YDSE 4NIFB 2JIIA 1H26A 1KV2A 4ZJVA 5IA2A 4FICA 4EHGA 4EEVA 5AWMA 2C6OA 2H34A 3PXQA 5AP5A 2QOOA 3D94A 4BCPA 5DR9A 4BYIA 1OGUA 2VN9A 5EDRA 4CFFA 4K77A 4F1OA 4EK5A 3EFLA 4FTCA 2ZMCA 4OTGA 4Y73A 3RZFA 3EQBA 3KXHA 2ITYA 3Q4CA 1TQPA 2Y6OA 5AAGA 3R71A 3ZMMA 1HOWA 4EL9A 3QRTA 2ONLA 1GOLA 5T3QA 4J52A 5AAFA 5BVNA 4R77A 1R3CA 3CTJA 3ZBXA 2R3QA 4RMZA 1JKLA 3SQQA 1Y57A 3HRFA 1GZKA 2UVZA 3MGYA 4FT5A 3UBDA 1RW8A 2VTTA 5JFSA 2W1IA 3F5UA 2PVMA 4ENXA 4ZMEA 5AR7A 5GIOE 3LJ0A 4AE9A 1YOLA 4ZZOA 2JITA 2VWUA 2XK4A 2WQOA 2J0JA 2BRHA 4PNIA 3NCGA 2FVDA 3B8RA 3Q4ZA 3BYSA 4QYHA 4O7NA 2OZAA 2C68A 1YKRA 3CE3A 1XH4A 4XMOA 2C6DA 5HVJA 4C33A 1VJYA 3AT4A 1Q8TA 5BYZA 1WVYA 2FSLX 3FI3A 2ZAZA 4MBJA 2C0OA 5H2UA 1SZMA 4H3BA 4NYEA 1W83A 4EK3A 5HO6A 4CZTA 1P4FA 4DGNA 3S95A 1M2QA 3UC4A 5HBJA 4UMPA 4FIGA 3A8WA 3N4VA 3A2CA 4UWYA 4TWPA 4I3ZA 4AT5A 1LPUA 3DKCA 4R7IA 4ZZMA 3OS3A 3R1QA 2UUEA 3DK3A 4AZSA 4Y72A 2Z02A 4QMSA 4RX9A 3WF6A 3T9IA 4I21A 3D5WA 4GUBA 4B7TA 2GFCA 3EYHA 2BRBA 3PSBA 3QBNA 5B2MA 1Y8YA 4QMZA 5A6OA 4Z55A 5TOZA 5CAQA 3CPCA 4WA9A 1SVEA 4ARKA 4FTLA 3FXZA 4YJSA 3QCSA 1UNLA 4NSTA 2FB8A 2VGPA 5FEQA 1V0PA 5LVOA 2OXYA 5DMZA 1Q97A 5J9LA 4FZAB 5A6NA 5IEYA 3MJ1A 2WQBA 2OJ9A 3Q9XA 5HU9A 4LYNA 4DTKA 3TKIA 2YLEA 2XP2A 4OBOA 4Y95A 4S34A 3DK7A 3NS9A 1CMKE 4GT3A 4HVGA 2B7AA 3BU3A 5FD2A 4EJNA 4Q5HA 2BKZA 4C57A 2OJJA 4DLIA 4ZY5A 2W1ZA 3W2OA 3UPXA 5CSXA 3O50A 4FKPA 1O6KA 4ENYA 3NNVA 3F69A 3C5IA 4OT5A 3PPZA 3WZUA 4FG9A 3F7WA 2IJMA 5C8NA 2EB3A 3ZXTA 4B0GA 2ZV8A 3L8SA 3R1YA 4RVKA 4CKIA 3LFAA 2GTNA 3ZRLA 3WE4A 4AXAA 2VWBA 5A4TA 4OTQA 1Q5KA 4FSUA 5EQYA 4LUEA 4QMQA 4WIHA 4X7QA 5E8YA 3IW4A 2JLDA 2PVNA 4YJPA 4W4YA 5HTBA 3I7CA 2YJRA 4I22A 1XO2B 4O0RA 1U59A 3QD0A 3F3VA 4QYGA 5FBOA 4AQCA 3Q6UA 4EORA 3DFAA 1TQIA 2O65A 3QL8A 4D2RA 1DS5A 2CDZA 4WUAA 3SOAA 3ENHA 2XNEA 3ZO1A 4D5KA 2SRCA 3TDVA 4GG7A 4N4SA 3ZS5A 3FXXA 4J1RA 3ZEWA 2EXCX 5IA3A 4H05A 2YIXA 2W1HA 3COIA 1MQBA 3F7ZA 1B39A 2X81A 2OICA 1M14A 3WF9A 4BKJA 1ZOGA 4PP9A 2DYLA 4FOCA 1ZOEA 3F3ZA 2X9EA 3K54A 4BCQA 3KCFA 3W55A 2W0JA 1Q8UA 2I40A 3BKBA 4QP2A 5E1SA 3UO6A 2B55A 3BPRA 3FI4A 3AT2A 3FQEA 3RP9A 1IRKA 3F66A 3NIZA 4ASZA 4C36A 4R5YA 4G6NA 2XH5A 5FM3A 1UV5A 3D7TB 3T9TA 3K2LA 3V5PA 5IPJA 4CLIA 2IZTA 2IN6A 3G33A 4FL3A 4M7IA 4MK0A 3V5JA 3I81A 1SVGA 4N57A 3OBJA 4JBPA 4D2VA 5CI7A 3E8DA 4YLJA 3ZC6A 3HA6A 4G3FA 2XK9A 5GHVA 4AOTA 3QRJA 3Q96A 2R3OA 4GFGA 3JUHA 5LWMA 2WTDA 3HMNA 3AT3A 2GS6A 3AMBA 4XS2A 2R9SA 2O0UA 4GVJA 4QD6A 5KHXA 4EH8A 1SYKA 2QKWB 4PF4A 3R9HA 3HDMA 3V6RA 5J5SA 4IM3A 3LCDA 1YI6A 3QQFA 1XKKA 2XNNA 3G90X 5I5ZA 2WTKC 3QWJA 3AG9A 4V05A 5CF4A 3HGKA 1V0BA 4GUEA 4WBOA 3CCNA 5I4NA 4OR5A 3WZJA 3PXFA 2YM4A 3TNIA 3OC1A 2YM8A 3BWFA 3UMWA 3MN3A 3SW7A 3GUBA 4HVDA 2Q0NA 4JX3A 1IR3A 2JAMA 4G6LA 2PE2A 2GDOA 3VUMA 1A06A 3VRZA 3ZSIA 1YXVA 2WOUA 2OFUA 3ULIA 2CGXA 3RWQA 1XH9A 4DEAA 4F65A 2CMWA 4UALA 3FC1X 4TWNA 4XP2A 2OJGA 1KSWA 5BUJA 5KBQA 5BYLA 3L9MA 2C0IA 1EH4A 1PW2A 4I5HA 3RPRA 3ZZEA 4EYJA 3Q9YA 2H6DA 3MJ2A 4LI5A 4LFIA 5FXQA 3C9WA 3EB0A 4QYYA 4Y8DA 4BYJA 4EHEA 4EOJA 1JAMA 3VQUA 4U43A 1XHAA 3D15A 4YPSA 5L8KA 2V0DA 3KA0A 4IBMA 2C5OA 2J90A 3CD3A 5LJJA 3PLSA 1DI8A 2PMIA 3NSZA 4WG5A 5E1EA 3R8PA 3UNJA 4AAAA 4GFOA 2W99B 4IVBA 1LP4A 1YQJA 2XCKA 2XUUA 5K4IA 4N0SA 4UBAA 4A7CA 5C8KA 2PUIA 3BE2A 3EKNA 2V22A 2WZJA 3Q60A 5L6WL 3GCVA 2XK6A 3NW6A 1NA7A 3GI3A 5JFXA 4NK9A 4L9IA 4O7TA 4X3JA 5FTQA 3PXKA 4R8QA 4YMJA 4J8NA 2BTSA 2E9UA 3KRLA 2B9HA 3QTWA 3DXPA 4O7WA 2BRMA 4EH9A 4E73A 2PZYA 2G2HA 2XNPA 2I7QA 2WTIA 4RJ7A 4GJ2A 2GS2A 3THBA 4FTUA 4G9CA 3ATTA 1CKJA 5IQGA 3REPA 3W2SA 3P9JA 2C5YA 4OTHA 4FTOA 1OL2A 2CHLA 3KN5A 5HD7A 4D2WA 4QYEA 4U79A 5BQ0A 3NMUF 3BLRA 4LRJA 3VULA 3ORPA 5JGBA 3RVGA 3PVWA 4J95A 2Y6MA 5EH0A 4FSRA 5AIKA 2BZKB 4D1ZA 2QU6A 2ONLC 5KE0A 1ERKA 3LHJA 1PMEA 4QMWA 4BDEA 4PDPA 3E7OA 2KTYA 4MD7E 5HEZA 3AC5A 2R3JA 4HPTE 2QG7A 4OGRA 5ETCA 1GIHA 1QPCA 4XUFA 2XA4A 2XIZA 3Q2MA 3V04A 3FMJA 4YTCA 3IG7A 5CASA 5CAUA 4AZWA 1RDQE 2GSFA 1XH7A 2F7XE 4FIIA 2C6IA 3EOCA 3QC4A 3AMYA 1KOAA 4FG7A 2BFYA 3D0EA 3FE3A 5FEDA 3C50A 2XRUA 3RBWA 4I92A 2VZ6A 3COHA 2OH4A 3LPBA 4LV5A 3TZ8A 4ZLZA 3NUSA 3G2FA 1GJOA 2FSOX 5G1XA 4E4NA 1I44A 4AU8A 4F08A 2NNWB 1BI7A 3QTQA 2UW8A 4AA5A 2ACXA 3GQIA 3OXZA 2YM5A 5DT4A 3O23A 4RSSA 3U87A 2C3IB 3NUPA 3OTVA 3KRXA 3F5GA 4UXLA 1OKWA 3KB7A 4M0YA 3LOKA 3NYVA 2VTMA 3VBWA 4DEEA 3FPQA 3ENMA 1SM2A 1S9IA 5KMOA 2R3MA 3RPSA 3O7LB 4RA5A 5K5XA 3Q32A 2W05A 4KIKB 2GNIA 5CZHA 3TL8A 4U81A 5DVRA 4C3FA 1VR2A 4O7ZA 3ODYX 5CF5A 5HQ0A 3MESA 2ZV9A 3LMHA 3BRBA 2OJFE 4D28A 4CVAA 2J0LA 4JBQA 4FYNA 3NUAA 3QTRA 1CDKA 1ZARA 2F9GA 3DBEA 4ZOGA 4EUTA 3AD5A 3KVXA 5CQWA 2J5EA 4OBQA 4AGCA 5DR2A 3BU5A 2HK5A 4FGBA 3BLHA 4HZRA 3I6WA 3E62A 5LQFA 4O2ZA 2VTLA 3ZBFA 3UVRA 1PXLA 3DA6A 2GPHA 3BZ3A 2X6EA 3UVPA 3FXWA 3D7ZA 3TUBA 4DYMA 2HY0A 4MBIA 3R2YA 3LZBA 1R39A 3QCQA 4TWOA 3DBCA 3E87A 1OKYA 3KCKA 3O2MA 4ZY6A 4A06A 3MBLA 3E92A 1H25A 5EHOA 4DEDA 2VTPA 5AFVA 3OCSA 4ANNA 1Q8YA 2YEXA 3VS7A 1JSVA 2BDFA 3PA3A 3C0HA 3VQHA 3O8UA 1UU8A 2QG5A 1HCLA 4FZ7A 5J87A 3L1SA 3ID6C 5AM6A 3V5QA 4UYAA 3OMVA 5HICA 4C0TA 3AGLA 4ALVA 3F5XA 2VTOA 3L9NA 3QA0A 2O64A 4GW8A 5AUWA 3ZDUA 2VGOA 4H39A 1OKZA 2ITQA 2YABA 3CIKA 4G3EA 5E91A 3NRMA 5FBNC 2QC6A 4MTAA 2JD5A 3ALOA 2C69A 2X2KA 3HKOA 4IEBA 4DH1A 2YM7A 3NIEA 4AN3A 4XRJA 2UV2A 4DN5A 4R3RA 3U55A 3QLGA 5A54A 1J91A 2HZ0A 1U46A 3Q9WA 3R2BA 4CKRA 4M66A 4S33A 5C03A 4BRXA 4EOQA 2UZTA 2O63A 5AR4A 2RKUA 3Q52A 3LM5A 1FPUA 4RA4A 2Y9QA 4UMTA 4HVIA 4K33A 4MCVA 3EFKA 3RNIA 4G9RA 1PXNA 4O7RA 1JNKA 1STCE 1Y6AA 3FDNA 2G2FA 4FNWA 2NRUA 4GYIA 5CLPA 2W96B 5H9BA 5HNGA 4IIRA 5FG8A 4FV2A 4F7LA 3U9NA 2W9FB 5CENA 4YJRA 4YZCA 3RTPA 2OSCA 2WTWA 4NZWB 3SG8A 4DFXE 5E8WA 2J2IB 2VO0A 3CGFA 1PKDA 3LXNA 4I6HA 2YCRA 5EM7A 1CTPE 1H00A 1OIYA 2G15A 2VNWA 3ORMA 4D5HA 4W8DA 5K5NA 3UQCA 4EBVA 2WAJA 3R8ZA 3OEZA 3QYWA 5GJDA 3O17A 2R3LA 5B2LA 5C4KA 4FIEA 1A9UA 4FC0A 4FX3A 4M67A 4O91A 3BWJA 4FKVA 2CCIA 3C4WA 1HCKA 5D12A 5DA3A 4CFNA 3MFUA 3JVRA 2OF4A 3UQGA 3V3VA 3D9VA 3G6GA 3NUNA 4NM0A 4BTKA 2OO8X 4FSTA 3U8WA 4IJ9A 5AP3A 2Y4IB 2XNGA 5CSHA 4U45A 3VVHA 4AW1A 2HZIA 2UZLA 3QRUA 4P7EA 1CM8A 3EKKA 5F4NA 3SRVA 3L8XA 4DT9A 4O81A 3RPYA 4RC4A 1FBNA 5AR3A 1B38A 2X8IA 5AV1A 5HG7A 4EOIA 4QTAA 3VF8A 2JDSA 5EW3A 4X2GA 3B8QA 1UNGA 4FKLA 3QTXA 5KZIA 4CMTA 2AC3A 4RIYB 4FEUA 3GC0A 3CY3A 3LFBA 4YZDA 2X8DA 4ZTRA 5JFWA 2F7ZE 3DKGA 1OBDA 2PY3A 4L00A 1XH6A 2QLQA 3TTJA 3QCXA 4AACA 2ZM4A 3KXXA 3NUUA 4OTPA 3AD6A 2QVSE 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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