4F9OA

Crystal structure of recombinant human hexokinase type i with 2-deoxy-glucose 6-phosphate
Total Genus 335
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
335
sequence length
899
structure length
899
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Hexokinase-1
publication title Inhibitor Sites of Unequal Affinity Linked by Binding Synergism in Mutant Forms of Recombinant Human Hexokinase Type-I
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 335
structure length 899
sequence length 899
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2012-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4f9oA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4f9oA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4f9oA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4f9oA03
4BQZA 2P9NA 4BRIA 4CBUA 1YXQA 3U8XA 4FWNA 4BVOA 1XC3A 2ASMA 5JICA 3RSEA 4PKHA 5E26A 2PBDA 3UB5A 1RFQA 3R6MA 4EHTA 4BRAA 4CZHA 4MO5A 3BP8A 4IZ9A 3GG4A 4EHUA 2FLOA 1CZAN 3UKUB 2IVOA 2YJFA 2PAVA 1TYQB 1SAZA 2HMPA 5BN9A 4FPBA 5AFUA 3FR0A 5AQWA 3VESA 4H5TA 3ZX2A 3IUCA 1MWMA 3O6WA 1OKJA 3O80A 4NB4A 1BG3A 4FL9A 4Z94A 1BU6O 1QQOA 4H0VB 3HBTA 5AR0A 1U2VB 3O5BA 5FPMA 4YDUC 2EWSA 4WQ5A 4CBWA 5BPMA 4H0OA 4A2AA 1KAYA 4BRPA 3KZBA 5AQMA 4BC3A 1K8KA 4AM7A 4BRKA 4MLEA 5AQOA 1ATNA 1YAGA 2P9UA 3L6QA 4PL7A 2FXUA 3MN6A 5EX5A 2V7ZA 2YCHA 4M7YA 1NBWA 3JS6A 3H3OB 4BROA 4JHDA 2Q0RA 3VEYA 3VGKA 5B8HA 4I6MB 1BA0A 2QWMA 3VEZA 1JCGA 3FFKB 4H0XB 4WYBA 3VEOA 4BR5A 3LDPA 1GLFO 5F2RA 4FPAA 5AQIA 3RSEB 1LCUA 3A5OC 3QICA 2P9KB 3ATVA 4AM6A 2GWKA 4A2BA 4CJ7A 1Z6RA 3VF4A 4IO8A 2A42A 3LM9A 2V52B 4H5VA 1T6CA 3M1FA 3KHYA 1MDUB 4DQ8A 1S22A 2F9TA 2AA4A 4BREA 4A62A 1X3MA 3VF6A 1ESVA 2E88A 4B1XB 3WT0A 1V4SA 1G99A 4ISGA 3H3NO 2E1ZA 3H45C 4BVPA 4XH1A 4FSVA 4FOIA 1HJOA 1TYQA 4IWVA 5EY4A 1BDGA 4FWLA 2VCPA 4CZMA 3HZ6A 2P9IA 1HKGA 2QWPA 3M3ZA 4L3QA 4BRMA 4FO0A 4BR2A 3DXMA 2QWRA 3H1QA 4M63C 2Q2RA 4IXCA 4CZLA 4EFHA 1K8KB 2W40A 2HOEA 2GUPA 2AP1A 2QM1A 2ZWHA 3J8AA 1HLUA 5AQHA 3ENHA 5FPDA 1GLDG 3C7NA 3A5MC 5AQGA 1YUWA 1D4XA 3LDQA 5CE3A 3HTVA 3VEXA 4PKIA 2HF4A 3BUZB 3M6GA 1NGFA 5AQZA 3QMLA 4FOEA 1S3XA 2A6AA 1TUUA 2QWOA 3CQXA 4HWIA 3WXJA 3DWLA 1GLEG 4BQLA 1KAZA 2P9SA 4H5RA 3DJCA 3LDNA 4CZJA 2F9WA 3BEXA 3AAQA 3IMXA 4BC5A 3WQTA 2YHWA 5AQLA 2P9KA 3IDHA 4GY2B 5AQYA 4WQ5C 1DKGD 5AQUA 1NGAA 3S41A 4BG9A 1ATRA 3CJCA 1ATSA 1YVNA 1QHAA 4JN4A 4Y0WA 5AZJA 2ZGZA 1H1VA 4K25A 4FWPA 4XEIA 1HUXA 2P9IB 4O5FA 2P9PA 2ZGYA 3LL3A 4J8FA 5AQFA 1EQYA 4GNIA 3W0LA 5BN8A 3SK3A 3H1VX 1NGGA 3DXMB 4JNEA 3U4LA 2FSKA 1NGCA 3WUHA 4CD3A 1LOTB 3VGMA 4DCHA 1NGIA 5ELZA 1KXPA 5EOYA 3DAWA 2Q97A 2YHYA 1BOTO 3MN7A 3O8MA 4IJAA 1Y64A 1ZBSA 3C7NB 3SMSA 4CI6A 3O1BA 4EIAA 3HI0A 4NO7A 2IVNA 4BR9A 3FZFA 1ZC6A 1NGJA 1GLAG 1IJJA 4C23A 5JLHA 1NM1A 3G25A 2UYTA 2A3ZA 1GLBG 2P9SB 4BRHA 3CJAA 3L0QA 1T44A 3O4WA 3EL2A 3QB0A 3UKRA 5LJWA 2GTDA 4BC2A 3CJ1A 3CQYA 4EAHD 1E4FT 1X9JA 2QW9A 4B1YB 5BPLA 4B1WB 3DXKA 3ID8A 4H5NA 4B9QA 5JLFA 3EO3A 5AZJB 2E2QA 5EVZA 2A5XA 5FPNA 2CGLA 1WUAA 2J4RA 3QBWA 3QBXA 3EZWA 3ENOA 2E2OA 2NZTA 2P9PB 1QQMA 3AAPA 5LY3A 2QXLA 3P4IA 3WEEB 3F9MA 4JD2B 3D2EB 1NWKA 5I9EB 3A5NC 4M7XA 4BRLA 3TU5A 4BRCA 1X3NA 4XH5A 3VENA 4DB3A 4JAXA 2D0OA 1HKBA 3ZETA 1BWFO 3EN9A 4BRNA 3LM2A 4MLHA 4BC4A 4CZKA 3KVGA 2D4WA 3WXIA 3ZX3A 2IIRA 3WXKA 3HSCA 5AQXA 5F0XA 1QQNA 2BTFA 3MK6A 2P9LB 1BO5O 4CZIA 3VERA 4CBXA 1IG8A 3O08A 4BR7A 1NLVA 1RGIA 1BUPA 2D0PA 3CIPA 4BG8A 1HPMA 3OHRA 2IVPA 2I7PA 4WQ4A 3HM8A 3UKRB 3MDQA 4E1JA 3VEVA 2DPNA 2Q36A 3MN5A 1Q18A 4BGBA 4IJNA 4FWQA 5E84A 4QS9A 5AQVA 5BRDA 5KPTA 3MN9A 5AZIA 3DXKB 2GELA 3FE1A 1DGKN 4BRDA 1NMDA 1XQSC 3D2FB 4B1VA 1TUYA 2Q31A 2ASOA 3GDQA 4CD1A 2HF3A 4LC9B 2GWJA 2ITMA 5BREA 5KPZA 1JCFA 3FLCO 3MCPA 2D1KA 5AQTA 1NGDA 4B1ZA 2CH6A 2A41A 5LJVA 2V7YA 2FF3B 5EXWA 3ZETB 4BRQA 3WEEA 3FZHA 4JD2A 3D2EA 2CH5A 3SMPA 1WOQA 2YHXA 3L4IA 3GL1A 3BF1A 2OANA 3I33A 4QS8A 3FZKA 3WQUA 2CGKA 3CJ9A 5KPRA 1SZ2A 4XH4A 3ZX0A 4KBOA 2GEMA 3I8BA 3WXLA 2YI1A 2VWBA 3U9ZA 2ASPA 2KHOA 5AQSA 1ZXOA 1QZ5A 2CGJA 1NGHA 3GE1A 2E2NA 2QWLA 2E1YA 4RWTA 3QFPA 3UE5A 1V4TA 4QS7A 1RDWX 5BRHA 3B8AX 3VOVA 2P9LA 3ULEA 4DHYA 5JMVA 3ATUA 2VYPA 1GLLO 2E2PA 5AQJA 2W41A 1U6ZA 4B1UB 2FSNA 4CZFA 2Q1NA 4FWKA 3CI5A 5AZIB 1E4GT 3CERA 3FZLA 3GBTA 2E8AA 4K42A 1HX1A 1BA1A 3H6EA 1DEJA 4A61A 1NGBA 5BR9A 4CZGA 2V51B 1Z05A 2BUPA 4F9OA 3EKUA 3SJHA 3ZEUB 5ADXH 3AY9A 2QWNA 1GLJO 3D2FA 1GLCG 4FWMA 4YDUA 5F1XA 2P9NB 5KQDA 3R8EA 3CJBA 1T6DA 1MA9B 4BRGA 2FF6A 4BGAA 4HTLA 1KAXA 2ZF5O 4H03B 5AQRA 1HKCA 3VF2A 3BF3A 2E20A 4WQ4C 1C0FA 3O1WA 1XUPO 2QWQA 4BR4A 4BRFA 3QDKA 3CHWA 3TPQA 4FWSA 5TKYA 3IFRA 3A5LC 5AFUH 3JXUA 3A0IX 3ULEB 1C0GA 3CJ7A 3UKUA 5AQQA 3U9DA 1SQKA 4H0PA 4K41A 2FSJA 3R9PA 3AARA 4MO4A 2Q0UA 2NLXA 3H46O 5BPNA 4RTFD 4RCHA 1P8ZA 5AQPA 3CETA 1QZ6A 3D7EO 2H3GX 4H5WA 1NGEA 2I7NA 3LDOA 3VPZA 3A8YA 1U2VA 3SLCA 4PL8A 3VETA 5AQNA 2P9UB 1MWKA 5FPEA 3QFUA 5BRFA 4K43A 1J6ZA 4FWOA 2WUSA 2YJEA 4JHDB 4CZEA 1JCEA 3GOIA 3VGLA 4BR0A 4ISEA 3LDLA 4O8KA 3W3DA 4PKGA 3FZMA 4ISFA 5KQ8A 4FWRA 5ADXA 3VEWA 2NRHA 4H0TB 3MMVA 2A40A 1R59O 3C0BA 3EKSA 3FGUA 4I6MA 3ZEUA 4H0YB 5AQKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CBUA 4BVOA 2NRTA 4KHSA 4AHCA 5E26A 4FW1A 4CZHA 3L2VA 3PX4A 3LZJA 1BQNA 1YITN 2W42A 1ASWA 2YJFA 5C42A 1FXXA 5BN9A 4ILHA 3FR0A 3QIOA 3V1RA 3CC4N 3VQBA 5AQWA 3CCRN 3O6WA 1OKJA 3HOSA 4A57A 3CCQN 1VSLA 3PX0A 4KPYA 5CY4A 1RT5A 2HVIA 3LP1A 4ZHRA 4YDUC 2F96A 5C0YA 4CBWA 2P5GA 4BRPA 5E41A 4AM7A 2ZE2A 4ID5A 1YAGA 4KHQA 2P9UA 4C8MA 2UXCK 1NBWA 1HNVA 3H3OB 2HBLA 3THYA 2Q0RA 3PV8A 3T69A 5LMNK 4I6MB 4B9LA 1YT3A 3FFKB 3VEOA 2OCEA 1EXQA 3D6RA 3V4IA 4FPAA 3FFIA 1LCUA 5GAGP 2XY7A 4GKKK 4CGGA 4CK1A 1N8RO 4JKEA 2XY8A 1J53A 3SZ2A 4MFBA 4DV2K 1U45A 4KH6A 4H5VA 4DU4A 4DF4A 3RMAA 3M1FA 1YIJN 1QHTA 2W6LA 3O3GA 3WT0A 1V4SA 1RT2A 3RVCA 3H45C 3NAEA 5C10A 4R79A 1TYQA 4KHNA 3VQPA 4AF1A 2O8BA 1RBSA 2IDOA 3SV3A 1EKEA 2WOMA 3LANA 4BR2A 4CHZA 2QWRA 3DM2A 3ZT2A 4O55A 1ITGA 3P38A 4IXCA 4E7LA 4BE2A 2GUPA 4CEEA 1WBDA 2ZWHA 5AQHA 4JKAA 3ENHA 5FPDA 2XY6A 5K14A 3NF9A 2AJQA 4AQYK 4NYNA 4DS4A 2D5RA 4IOAL 1D4XA 1QE1A 5CE3A 3VEXA 2HF4A 3S3NA 1NK8A 1S3XA 1DLOA 2QWOA 4HWIA 3P31A 2UUAK 2O8EB 4DR4K 2P9SA 2D0CA 1ZBUA 2F9WA 1N34K 3AVKA 3BEXA 4JI5K 3C95A 4BC5A 1L5UA 3WQTA 1QSSA 3P39A 2P9KA 3KTQA 4CEBA 1IBKK 4CJ5A 4WQ5C 4IFEA 5AQUA 3TABA 3S41A 4JRPA 3CJCA 1ATSA 5FLXO 4F4KA 2PFUA 3VQQA 3HXMA 4Z4GA 3BY5A 5AJ3K 4CGHA 1HUXA 3AO4A 4LFBK 2P9PA 1EQYA 3SQ2A 4GV3A 3U4LA 1NGGA 3DXMB 3S3MA 2JWLA 2F4VK 1NJYA 3AA5X 3VGMA 4YFUA 2O8CA 1NGIA 5ELZA 4M3ZA 4A5BA 5DM6L 5SWMA 1E3MA 2Q97A 4DF8A 2YHYA 3O8MA 1FKOA 4DMNA 3K57A 4DR2K 4IKFA 1OH5A 1K73O 4B3SK 2EHGA 3T1AA 4EIAA 2NRVA 3AO1A 4KREA 4KH5A 3OYLA 1U48A 3HT3A 5M1OA 1IJJA 4C8LA 1BGXT 4CF1A 1TK5A 2ITGA 2VWKA 3OYGA 4CEFA 3J80O 2E4LA 1TV6A 4N56A 1IH7A 3CC2N 4JI2K 4CGFA 3UKRA 1NJWA 4DV3K 3LAMA 4CJVA 4C8KA 3CQYA 2YNGA 4EAHD 1E4FT 1X9JA 4B1YB 5BPLA 1EO1A 1XNRK 3ID8A 4H5NA 4B9QA 3HJFA 3CC7N 5D3GA 3TAEA 4DTNA 2QXLA 1S1WA 1S6QA 4FZYA 4NCGA 3TU5A 2QKBA 5CHIA 1X3NA 5JVHL 4JS5A 3ZETA 4CJFA 4CFBA 3LAKA 3ZX3A 2IIRA 4C1NK 4YHHK 1O13A 3HSCA 5HRNA 2DFHA 3K58A 5F0XA 4CJRA 3V9ZA 4CFDA 4E7IA 1RBVA 3SNNA 3SUPA 4CZIA 4KB0A 3LP2A 4CBXA 1TK0A 1EX4A 1JLCA 3VQCA 4CJWA 1NLVA 3M8RA 4DTMA 5HRSA 4AHTA 4BG8A 2I7PA 1FW6A 4Z4FA 3DOKA 1KLNA 3CQ8A 4E1JA 2DTUA 3QNOA 2QTDA 3I0RA 4IJNA 5AQVA 3MN9A 4I9LA 4W5RA 2R7YA 4KHYA 1F21A 2QEXN 1JLQA 3D2FB 4B1VA 4Q0BA 3GDQA 4ID1A 5KGXA 2O8FB 3PO4A 1SV5A 2HB5A 1HYSA 3IKMA 3LDSA 4DTXA 4H4OA 4CE9A 5GAEP 3WEEA 3CPEA 1LAWA 2OANA 5M1PA 3WQUA 1CXQA 3CJ9A 1XNQK 2GEMA 3I8BA 3WXLA 4BWMA 4FM0A 3U9ZA 2VWBA 1NK0A 4JKBA 3GE1A 4FJLA 4CFAA 4W5NA 4AHUA 3TSPA 1RDWX 4UQGA 1VQNN 2HBKA 5BRHA 3B8AX 3QEWA 2P9LA 4DHYA 4LSNA 2UXBK 4IDHA 5DM7L 3OYFA 2VYPA 4FW2A 3O3HA 1U4BA 1U6ZA 3LWLA 2FSNA 3O3FA 3KK1A 5I42A 1VQON 3QEPA 5AZIB 3R3LA 3CERA 2KKZA 4LF6K 3AVIA 1HX1A 4ELUA 1DEJA 2HHXA 4CZGA 3K2PA 4HCBA 4IDKA 3V9XA 1UWBA 3ZEUB 5ADXH 1GLJO 4DQRA 4DR1K 4YDUA 3AGKA 3AGRA 1NOZA 3CJBA 2F7TA 1CZ9A 1VSFA 1KAXA 3NBPA 2ZF5O 4DLGA 4H03B 5AQRA 4DWIA 1LW2A 3BF3A 2FC0A 3VF2A 2E20A 4WQ4C 1D9FA 2UUBK 3AO2A 2KFZA 2RKIA 3QEVA 1XUPO 2QWQA 4JKDA 2O8DA 3DYAA 3A2FA 3ZCMA 1KRPA 3CD6N 1HRHA 3L2UA 3JXUA 1JL1A 3VQEA 5AQQA 3EEQA 1NNEA 4IG3A 3THXB 2HHQA 3H46O 4ELVA 1WB9A 1QZ6A 3D7EO 3OYMA 2HNYA 1WLJA 1NGEA 3TTCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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