4FC0A

Crystal structure of human kinase domain of b-raf with a dfg-out inhibitor
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
275
structure length
254
Chain Sequence
DDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGGSILWMAPEVIRMNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSLP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase B-raf
publication title Design and synthesis of novel DFG-out RAF/vascular endothelial growth factor receptor 2 (VEGFR2) inhibitors: 3. Evaluation of 5-amino-linked thiazolo[5,4-d]pyrimidine and thiazolo[5,4-b]pyridine derivatives.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 254
sequence length 275
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-05-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fc0A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fc0A01
2C5YA 3MV5A 3GI3A 3NYVA 2XBAA 2ZM4A 3C0GA 2Y8OA 3NLBA 4IFCA 3HMOA 4HGSA 4KIQA 5AX3A 2R64A 4LOPA 5M07A 3II5A 3EN7A 3RAWA 5M09A 3H4JA 2IWIA 5DMZA 3WZKA 4DH8A 4Z9LA 2ITVA 3UMWA 3JUHA 4B9DA 3EFWA 3ZXZA 3OZ6A 4C34A 4IMYA 3FEGA 1GNGA 4BKJA 4AW1A 5AV4A 3R8MA 5J9YA 5B0XA 1E1XA 3ORKA 3ZONA 1HCLA 2I40A 3F61A 4HYHA 4K77A 2BHEA 5IG1A 3NAYA 4CMTA 4JBOA 4F99A 4U6RA 4XV3A 3RPSA 4R8QA 2Z7RA 3WZUA 3PJ1A 3JY9A 5BUJA 3KN5A 5CQWA 3MESA 3F3UA 2VWWA 5DBXA 5GJFA 5CEQA 3D5XA 3TG1A 5FXRA 1R78A 1WBWA 2C0TA 3GT8A 4M8TA 3S1HA 5IQIA 3NRMA 3PWDA 5JN2A 3TUCA 2X8EA 5EG3A 4C3PA 3G5DA 4F9BA 4N70A 4QO9A 4EHGA 5HIDA 4NL0A 4O81A 2F9GA 3ENHA 4AZWA 3FLYA 2WFYA 4L43A 1OIQA 3HNGA 4MD8E 2OU7A 3DJ5A 1XJDA 4QTCA 4WUAA 3FJQE 3RWPA 3PVUA 4CT1A 5HNIX 3HV5A 2IN6A 2C3JA 4C61A 4JBVA 1IAHA 1YWVA 4IC8A 4FV0A 4AGWA 2WTKB 3IGGA 3PA5A 4CCBA 1JNKA 3EMGA 3OW4A 3VULA 3ZO4A 3FQHA 4FSMA 4G31A 4P5ZA 1O6YA 3CC6A 2IZSA 2REIA 2WMAA 1YI4A 5EKNA 3C1XA 4LOOA 3A4OX 2RIOA 3TTIA 3E3BX 2YAKA 1KWPA 1Q61A 4O2ZA 4A9RA 3OF0A 2HW6A 2WO6A 4MXAA 3ORXA 3M42A 4EOSA 5HTIA 3NUAA 2X6DA 4KB8A 4EC9A 5K5NA 3A8XA 4DHFA 1OKZA 1UA2A 5M06A 4U43A 4EQUA 4ZMEA 4J95A 4D0WA 3RMFA 2R3PA 3GU7A 4UMUA 1OIUA 3PWYA 4NEUA 5B2MA 1Q8WA 1KE5A 4ZLYA 3OOGA 5HZNA 4LYNA 4QMVA 5E8ZA 4YNEA 1BL6A 4RVKA 3R7OA 2Y4IC 2ITXA 4RIYA 2R3FA 4XBRA 3R9NA 2HZNA 4AZVA 4V01A 3BGPA 4FTNA 2C6IA 3LJ2A 4R5SA 4YJTA 3ACKA 1GOLA 5FD2A 2OZOA 4FK3A 2QOFA 3GCQA 3Q32A 3DJ6A 2YWVA 4UXLA 5IPJA 3KMWA 2YM8A 2JKQA 2GDOA 1Q99A 4YTIA 4FTJA 5IH5A 3CTQA 4NJ3A 4U80A 3A7GA 3DCVA 3ORNA 5HTBA 5I0BA 5FTOA 3F66A 3DV3A 1W8CA 3FXXA 5CI6A 3SVVA 3BX5A 1FINA 4JQEA 5EW8A 3ODZX 4EHZA 4FKGA 4E4XA 5BMMA 5CYIA 4FTIA 4EUTA 4TYIA 4DGLC 1AGWA 1JOWB 5DLSA 4F08A 4MCVA 4GK4A 4UZHA 3IW4A 3PA4A 2QHMA 3QGYA 4O96A 2WD1A 3H9RA 4M66A 3KF7A 1M2RA 1PKDA 5FM2A 3RCJA 2RF9A 4FTOA 3SLSA 4DTAA 5I9ZA 1WVYA 5DNRA 5C26A 5JEBA 3FC2A 2QKWB 3CD8A 4FEQA 4II5A 4A9UA 5T6KA 4YLJA 1URCA 2W06A 4WA9A 4I24A 4U79A 2JIIA 5KO1A 3F88A 4FTTA 4F1TA 4BN1A 4XEYA 3O23A 4QP2A 4BWPA 4AN9A 4ENYA 4O7SA 5KX8A 2CHLA 3JY0A 4MXXA 3DKGA 1XH9A 1CM8A 4ITIA 2ITZA 4ALWA 2VAGA 3MBLA 2IZUA 4HNIA 3LMGA 3VS0A 1ZMUA 1BI8A 3EH9A 3MWUA 3D7TA 4H1MA 4EZ3A 4PRJA 4F7NA 4NIFA 2WIPA 1H1WA 3P5KA 3N4TA 1PJKA 2VTQA 3FQSA 2Z7QA 2WMXA 2XJ1A 2GFCA 3D7ZA 3FMKA 3Q6WA 3QQLA 1JLUE 3QTSA 4FX3A 4M84A 4OT6A 3R71A 1P14A 4MAOA 4OAUC 3ZEPA 4YBKA 3HX4A 3Q3BA 4FSTA 2XA4A 3KMMA 4BCNA 1S9IA 3D9VA 2O65A 4UMRA 4CVAA 4QRCA 3IPHA 3ZDUA 2VO0A 2F2CB 2AYPA 3QGWA 2ITUA 3QD3A 5A46A 3MYGA 3H9FA 3KXGA 2R3IA 3FSKA 2AC5A 3R21A 3ATTA 5AIKA 3PLSA 4RIWB 2VWZA 4RZVA 4TWOA 4O0SA 3SOAA 2VWVA 2XH5A 2BIYA 5AUXA 2VTHA 2H6DA 4L68A 3SC1A 3W16A 2OG8A 2OK1A 4HW7A 1TVOA 3UP7A 5AUZA 5I9VA 4ERKA 3FMNA 4ZTLA 3ERKA 5A4EA 1ZOEA 3IGOA 3TKIA 5KMOA 2YIQA 3FZ1A 4MBLA 1GZOA 1WZYA 4PMSA 2NRUA 4KABA 3BIZA 3KY2A 3SXRA 4EYMA 4IWOA 3ZLXA 1Y91A 4KRCA 4ZLOA 2V5QA 1O6KA 4ZIMA 5AA8A 3U8WA 4W4VA 3CTHA 2VGPA 4NWMA 4HYSA 3C5IA 3LKMA 3CJFA 4ZSEA 1X8BA 4LI5A 4TNBA 1XQZA 3F5UA 5FG8A 3RTPA 3IOKA 3D5WA 3KGAA 4YC8A 4XLIA 3F9NA 1K3AA 2P3GX 4XV9A 4ZSAA 3LCKA 4NM3A 4P90A 2HZ4A 5EDPA 3RBWA 4WG5A 4PP7A 3ROCA 2Y4PA 3WE8A 5IZFA 3PPKA 3W2OA 4C3FA 3FKOA 4TYHA 4BDJA 2OJFE 3BYOA 4RVMA 2RL5A 3V3VA 3AD6A 4ID7A 2XB7A 3IW6A 3GXLA 4NFMA 1TQPA 4MNEB 3UMXA 2WNTA 1OVEA 4G6NA 2GTNA 3LFBA 3OVVA 3BEGA 2OIBA 4PNIA 3UVPA 3BE9A 2GU8A 2Y0AA 4EOPA 3ZM9A 5HORA 3CSVA 4BCPA 3PFQA 3O8UA 4X21A 3C4FA 5HESA 2B4SB 4RJ7A 4W9WA 5EM7A 3WZDA 3EQBA 1OZ1A 2JBOA 4PX6A 4ZTRA 1SZMA 3HEGA 4FTQA 3VS3A 3DAEA 3R01A 3UNZA 3RK7A 4O84A 3IS5A 1P4OA 5IA3A 3ZEWA 5IA4A 4FIEA 5IQFA 2R0IA 2XEYA 3QCYA 3QHRA 3NW5A 4IZ5A 3RWQA 2WGJA 4G16A 2R3LA 4IVBA 2BZHB 4NM7A 4UXQA 5JRSA 4MXOA 1OL6A 4XP2A 3RAHA 2Z8CA 2UZWE 3QA8A 5EI8A 3D5UA 4D9TA 4O2PA 5LJJA 4RX8A 3CXWA 1VYZA 4OTFA 1KOBA 4RRVA 4MF0A 4RWJA 2JFMA 1JWHA 1UV5A 2HYYA 3WI6A 2A4LA 3DFCB 4HNFA 4QMSA 4RJ5A 4W4WA 5E8XA 3QRJA 4C0TA 5IQGA 3CD3A 2C6EA 4PTGA 5K5XA 4D4VA 5HKMA 4RQKA 2PUNA 2HOGA 4RPVA 3P08A 4BKZA 3UQCA 4YJUA 3MH3A 4FOCA 3GC8A 4GH2A 5L8LA 4X2KA 5D9HA 4B8MA 5LMKC 3BKBA 5ITAA 2PMNX 4G6OA 2R3RA 4JJRA 3AMBA 4KNBA 1LP4A 4Q5EA 4XG8A 3RNYA 1ZY4A 2CJMA 2PMIA 3GFWA 3HP2A 3P23A 4XG4A 2OICA 3HECA 4PNKA 3LQ8A 1BLXA 2WAJA 5M4UA 1XHAA 3UDBA 4Z7GA 2XVDA 2OF4A 5ANEA 4QYGA 3L1SA 3FMMA 4D2SA 5A4CA 2YCQA 4ZTQA 3ZHPC 3LLAA 3DKCA 3FPMA 1XH8A 3K2LA 3R1YA 4IADA 4LG4A 2PUIA 4YBJA 4L7FA 2RKUA 4ALVA 3EYGA 1PRYA 4IJPA 3N4VA 4D2RA 2QO7A 2OZAA 5M4IA 1H1RA 1KE8A 3SRVB 3U55A 3UO4A 2P4IA 2VNWA 3S00A 5BMSA 3V5TA 5B2LA 2W4OA 4K0YA 3VBWA 1XR1A 3OWLA 2UZOA 1WBVA 4FKUA 1U5QA 2RG5A 2EU9A 3Q9ZA 3QXPA 3SD0A 1H01A 3SV0A 4BHNA 5HBHA 3DK3A 2G1TA 2FH9A 2IW9A 4FV8A 3G9LX 4LOQA 1KE9A 3OMVA 4JAIA 2IW6A 2VTLA 3PXQA 2OXXA 2UZDA 2QO9A 3PXYA 2Q0BA 4ZY6A 4L6QA 5IDPA 1T45A 3PIYA 3PP0A 3NZ0A 4GYIA 3KVXA 3WZJA 4E26A 4B0GA 3LLTA 4IWDA 4CV8A 2EB3A 1IRKA 3VS6A 3KRRA 4CZUA 2F7ZE 4G3FA 4AACA 2PVRA 4CT2A 4FV5A 3CP9A 4MBJA 4U97A 4AX8A 3OY1A 5AWMA 3QF9A 4DFZE 5AV0A 1ZYJA 3T3UA 3U4WA 3CR0A 3Q52A 4WG4A 3GENA 4AZEA 2PUPA 2FYSA 2BR1A 5EI2A 4BDHA 5KKRC 3CCNA 1W83A 3DXPA 2OBJA 4EWHA 4PL5A 4R7BA 3NMUF 5IEXA 3FYKX 1GIJA 5HNBA 4JXFA 1PYXA 4BCJA 4I41A 3G0FA 2C6MA 5HG5A 4LGHA 3PVGA 4HGLA 4AGCA 1M17A 2QR7A 3MY5A 3V6RA 2IO6A 2CGWA 3QYWA 2PU8A 4YO6A 1J7IA 2J7TA 4EJ7A 2W7XA 3CJGA 2B1PA 3E92A 2BRBA 3OOMA 5JFVA 4XP0A 3ZOSA 4R77A 4NCTC 5FUTA 4G3DA 1YKRA 4YP8A 5CNNA 1KV2A 2W1IA 2FB8A 3JS2A 4X0MA 4XG3A 4BBEA 3ORTA 2NRYA 3LCSA 4OBPA 4ZS0A 4N57A 5CAPA 4EOMA 4OW8A 4ZY5A 4TYGA 3VUHA 3REPA 2IPXA 1CSNA 3KK9A 4FT7A 4ANQA 4QD6A 3VBVA 2J0JA 4MXZA 2V55A 5FXSA 3W33A 4BZDA 4XX9A 1F5QA 2O3PA 2R3OA 3SKCA 2W9FB 2V62A 3Q4UA 4QTAA 1ZZLA 2UZUE 5HX8A 2BKZA 2GMXA 4EOOA 3VIDA 5D10A 3OT3A 4EH7A 2OJ9A 3KN6A 3VRYA 3BYUA 3QALE 3MPMA 4B8LA 3QRTA 2W4JA 2WHBA 5GZ8A 4DH1A 2X2KA 3BQRA 3E8CA 4BTFA 3SGCA 3O17A 4TWNA 3E8NA 3DA6A 3QWKA 4M13A 4EH5A 3FZOA 3UIUA 1Y6BA 3FKNA 4R3CA 5CVGA 2VUWA 1ZY5A 2XNEA 5D11A 3C4EA 4GIIA 4O86A 3VHEA 4XRJA 2C6LA 4YC3A 1HOWA 4HVHA 5CF8A 4V04A 4DG0E 3GVUA 3B2WA 5EYKA 3LZBA 1JSTA 4USDA 2GFSA 2QOBA 4JNWA 1SVEA 1YOMA 1YXSA 2PK9A 2XEZA 3QZIA 4GK2A 4ANBA 4YMJA 4ZY4A 1CKPA 2DYLA 1W82A 3WYYA 4JX3A 4E4LA 4IWQA 4BIDA 3THBA 4I6QA 3CEKA 3TV6A 1ZOGA 4ANNA 4EJNA 4QPMA 2W1FA 1TQIA 2BCJA 4FEVA 5IQAA 2OLCA 1XO2B 2QOQA 4YR8A 4H05A 3EJ1A 5ANOA 4EQMA 1IR3A 3R9RA 4Y95A 5GZAA 1OM1A 2DQ7X 4S34A 1JSVA 3D7TB 3RPVA 4CFXA 5HCYA 4DH5A 4DT8A 4MXYA 4XS2A 2BZKB 2VWYA 1PXKA 4CFVA 3QFVA 3G90X 3NUNA 3PSDA 3BWJA 1LR4A 4FV3A 5FRIA 2Z02A 3FI2A 5CZIA 3TDWA 3F5PA 3WF9A 4FG9A 1SVHA 1IEPA 2JAMA 2JFLA 2JITA 3O51A 4HZRA 1XH5A 2R5TA 4KD1A 4YZ9A 3RGFA 4D2PA 3UO5A 3ENMA 5D7AA 4ZSLA 3ZRMA 3VUGA 1MRYA 2J0MB 4LUDA 5CEIA 4CGAA 1JAMA 2YIYA 4RFZA 2G2FA 3D5VA 2YACA 3GQLA 4UY9A 5TF9A 4FNXA 1GIHA 4GMYA 4MD9E 2WTVA 3KC3A 4TL0A 2PZPA 2YDKA 4YO4A 2ERKA 3DZOA 3VUTA 4TT7A 1FBNA 4ZS4A 4BTMA 4FZFB 4G9CA 4C02A 1Y8YA 3NW7A 4GT3A 2PVKA 4MWHA 3QQUA 3DAJA 4NJDA 4D2WA 4KBKA 4L53A 2Y9QA 4BVUA 3TKHA 5IQHA 4WKQA 4QP7A 5DN3A 5AR4A 1MUOA 3DDPA 2XK4A 1OITA 3D4QA 3FLQA 4AQCA 2F7XE 3VS4A 1OL7A 2C0IA 3DBQA 4QNYA 4L44A 2C1BA 1M14A 4AFEA 2X2MA 3LW0A 1JQHA 3D94A 2Z7SA 4F4PA 3A8WA 4QQ5A 4QMTA 4CTCA 4WHZA 1OIYA 3LMIA 1NVRA 3UZRA 3IK3A 3MJ2A 4QP8A 4H3PA 4BTKA 4DGMA 5M51A 1UWHA 3QTIA 3N4UA 3IW8A 3M1SA 3R00A 5AR7A 2FSOX 4HPUE 1PW2A 2EXEA 2J9MA 2XBJA 3MB7A 3F3ZA 4IX5A 3GNIB 4MK0A 4ZTSA 3P79A 4KA3A 4NKSA 4RJ4A 4EZ7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3HNG A;  4MD8 E;  2OU7 A;  3DJ5 A;  1XJD A;  4QTC A;  4WUA A;  3FJQ E;  3RWP A;  3PVU A;  4CT1 A;  5HNI X;  3HV5 A;  2IN6 A;  2C3J A;  4C61 A;  4JBV A;  1IAH A;  1YWV A;  4IC8 A;  4FV0 A;  4AGW A;  2WTK B;  3IGG A;  3PA5 A;  4CCB A;  1JNK A;  3EMG A;  3OW4 A;  3VUL A;  3ZO4 A;  3W0R A;  3FQH A;  4FSM A;  4G31 A;  4P5Z A;  1O6Y A;  3CC6 A;  2IZS A;  2REI A;  2WMA A;  1YI4 A;  5EKN A;  3C1X A;  4LOO A;  3A4O X;  2RIO A;  3TTI A;  3E3B X;  2YAK A;  1KWP A;  1Q61 A;  4O2Z A;  4A9R A;  3OF0 A;  2HW6 A;  2WO6 A;  4MXA A;  3ORX A;  3M42 A;  4EOS A;  5HTI A;  3NUA A;  2X6D A;  4KB8 A;  4EC9 A;  5K5N A;  3A8X A;  4DHF A;  1OKZ A;  1UA2 A;  4LDT A;  3TMO A;  4U43 A;  4EQU A;  4ZME A;  5M06 A;  4J95 A;  4D0W A;  3RMF A;  2R3P A;  3GU7 A;  4UMU A;  1OIU A;  3PWY A;  4NEU A;  5B2M A;  1Q8W A;  1KE5 A;  4ZLY A;  3OOG A;  5HZN A;  4LYN A;  4QMV A;  5E8Z A;  4YNE A;  1BL6 A;  4RVK A;  3R7O A;  2Y4I C;  2ITX A;  4RIY A;  2R3F A;  4XBR A;  3R9N A;  2HZN A;  4AZV A;  4V01 A;  3BGP A;  4FTN A;  2C6I A;  3LJ2 A; 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