4FGBA

Crystal structure of human calcium/calmodulin-dependent protein kinase i apo form
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
290
structure length
282
Chain Sequence
WKQAEDIRDIYDFRDVLGTGAFSEVILAEDKRTQKLVAIKCIAKSMENEIAVLHKIKHPNIVALDDIYESGGHLYLIMQLVSGGELFDRIVEKGFYTERDASRLIFQVLDAVKYLHDLGIVHRDLKPENLLYYSLDEDSKIMISDFGLSKMEDPGSVLSTACGTPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVIAYILLCGYPPFYDENDAKLFEQILKAEYEFDSPYWDDISDSAKDFIRHLMEKDPEKRFTCEQALQHPWIAGDTALDKNIHQSVSEQIKKNFA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1
publication title Crystal structures of human CaMKIalpha reveal insights into the regulation mechanism of CaMKI.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 282
sequence length 290
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fgbA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fgbA01
2FH9A 2W4KA 3ETAA 4IC7A 4ACMA 2CGUA 4YZDA 2QG7A 3DK7A 5TF9A 5CEMA 3G9NA 3HV3A 4XP2A 4OTGA 2IZTA 2GSFA 3KXHA 5F20A 4MXZA 2PSQA 2VTRA 4YTIA 3ZLYA 3GU5A 4FV6A 3BYMA 2FSTX 2V7AA 3AT3A 3R0TA 4HCVA 4U7ZA 3SW4A 4BIDA 1OPLA 4IZ5A 3IG7A 2XK8A 3VS4A 4EH3A 3R01A 5M09A 3MH0A 4L9IA 4EOSA 3CJGA 2XJ2A 2OF4A 3HRBA 2C68A 4GU6A 4DFUA 3PXQA 5HLWA 1DAYA 4JDIA 5LMKC 3QTRA 3KMMA 4UY9A 5JZJA 4BKJA 4E73A 4EKLA 4PL3A 4BGQA 4QP8A 5ETFA 5KNJA 2QU5A 4AT5A 3F2RA 3UODA 3MIYA 4ZTRA 1ZYSA 3OG7A 2YCRA 4F9BA 1P4OA 4AA5A 4D5KA 4I5CA 3W10A 3WZJA 5L2SA 2W9ZB 4FYNA 2UW8A 4YZCA 1LR4A 3BQRA 3VUTA 2QC6A 3DT1A 4NIFA 3W2SA 4A9TA 3PDTA 3P7AA 3BLRA 5AV1A 3LM5A 2O65A 5AP2A 3COIA 2WHBA 2VTQA 5AIRA 3EB0A 4ZS0A 2XYNA 5BVWA 4KNBA 2J0JA 3E7OA 4FTAA 3R7VA 3R8VA 2OLCA 4CCBA 1QL6A 3FZPA 3QKMA 3VJOA 4IVAA 3QL8A 1WBOA 3RCJA 4O2ZA 2YIQA 4XV1A 3PWYA 2X2MA 5H8GA 3IDPA 1RDQE 1OPKA 4QTBA 3CE3A 2ETMA 3AOXA 3O8TA 1YI4A 3CPCA 5CAUA 5JH6A 4AGCA 1OKYA 5JGBA 4AW1A 4XRLA 5AAEA 4Y5QA 4DFBA 4XG4A 3LW0A 3QRIA 4G34A 4YJVA 3R7OA 4BDAA 4F9AA 3FSKA 4QP7A 4G17A 4CZTA 3FZRA 4V05A 3FMEA 3P9JA 1V1KA 5CSXA 3W2OA 1UVRA 3PG3A 4G9CA 4I5MA 5IEXA 5M4FA 2W1HA 4FNWA 2JITA 1JAMA 4UWBA 1IEPA 1WBSA 3L9PA 4EORA 4F63A 4O7SA 4YJQA 4YPDA 2QLUA 2X4FA 3DDPA 1BX6A 1Q8YA 3CXWA 3DV3A 4YURA 3M1SA 4FKSA 2OXDA 5HCYA 4ERWA 3F5XA 4UYNA 4Z7GA 1G5SA 3HA6A 4IMYA 3TUCA 3F66A 3GOPA 5ANKA 2VN9A 5EYKA 5HG8A 3IKAA 3LJ1A 5CALA 4BGHA 1MP8A 4BDFA 4IAIA 2VAGA 4NH1A 4V01A 2PY3A 5GJDA 3GC9A 4O6EA 3UTOA 5BVNA 5AR2A 2XUUA 3RM6A 1OKZA 4DE4A 5K0XA 1MQBA 3UPXA 3UNZA 5L6OA 3CC6A 3O7LD 4EWHA 4ANMA 4YJSA 1CSNA 5HE3A 4E4XA 2C3IB 1OI9A 3D83A 2YERA 4FF8A 1WVYA 3QHRA 2PUPA 3WYYA 4YR8A 4FOBA 5KHWA 3IDCA 4PMMA 3MTLA 4WUNA 2WOTA 4IAZA 5K0KA 2WTWA 3I7BA 3MY0A 5AX3A 4AE6A 1JNKA 2W1EA 2VWIA 1V0PA 2VTJA 3HV6A 4FKLA 3HDNA 4FTJA 4RVKA 4G2FA 4N57A 4F64A 3EJ1A 3GCVA 3VUMA 2WTKB 4Z55A 4ZTHA 4FG7A 2CKEA 3MFUA 5HO8A 3RZFA 3GCPA 4FR4A 4BDDA 5LMBA 5CY3A 2BRGA 5CQUA 2OICA 3TNWA 4RX5A 4OTQA 3R63A 4L53A 1YOLA 3TACA 2PVLA 5A4QA 2X1NA 3OY3A 3EFJA 4FL3A 1IA9A 4AAAA 4NJ3A 2R4BA 5GZ8A 1PMUA 2RIOA 2QOKA 4G31A 1PXPA 4M13A 1FINA 4GKHA 4Y8DA 2J4ZA 2F4JA 5D10A 2QR8A 1B39A 2WXVA 2E9UA 3FQHA 3QZFA 4ZOGA 4Q9SA 5EKNA 3HP2A 4BFMA 4RRVA 2ITTA 3IW4A 3QXPA 4G3CA 2PMIA 2CN5A 3AC8A 4XBRA 2IVUA 3DLSA 4DGOA 3GBZA 3N51A 4F1TA 5IEVA 3KF7A 4AWIA 4CD0A 3P1AA 4M66A 4NEUA 4X2KA 2JKMA 1BKXA 4J71A 5E4HA 5CZHA 3COMA 4GFOA 4NCTC 2YAKA 3BLHA 3HNGA 3LFEA 1OIUA 4L43A 4MF0A 4RGJA 4DG3E 4WBOA 4BGGA 3C4ZA 4YP8A 4QQCA 4ZY6A 4O7YA 2J0IA 4CFNA 5CEKA 4FV0A 2C0TA 4PDYA 3ULZA 2ZM4A 2ZMDA 4FC0A 3OP5A 3I4BA 1OECA 1LEWA 1UA2A 5FGKA 5H3QA 2C6TA 4FE2A 4A9UA 3U4WA 3IO7A 2X4ZA 5CF5A 1ZZLA 5JRQA 2VZ6A 4IADA 4RWIA 5DG5A 4AG8A 2HAKA 3KL8A 2ETKA 1YWVA 4M0YA 2JAMA 5EQPA 3FSFA 3UVQA 3V5QA 2HY0A 5HG9A 3GEQA 4I5HA 4BI1A 2IG7A 3ZMMA 2R0IA 4X3FA 4P5QA 4XUFA 1ZWSA 2BZKB 5BNJA 2J0LA 3DLZA 3S95A 5I3OA 1AD5A 3S0OA 2BHEA 2HY81 2I0YA 4MEDA 4XX9A 2WTIA 4I0TA 3WZKA 3HMOA 4C61A 5CAOA 1OUYA 3PA5A 5HLNA 3KXNA 4GT3A 3A7HA 5CU3A 2A19B 4EUUA 4JR7A 5I9ZA 3OW4A 4IX5A 5JZNA 1ZZ2A 5D11A 5JFWA 2XRWA 1O6LA 1ZOGA 4MBIA 4D4RA 2YM4A 3KK8A 3PY1A 4X6QC 2QNJA 2GHMA 1P14A 5AV3A 4F6UA 3AQVA 1XJDA 4RFZA 3GXLA 5FEQA 2R3JA 3RMFA 3FWQA 1OL5A 4S32A 5K3YA 2IVTA 4HVGA 1UU3A 5CSVA 2ITNA 2UZBA 4F7NA 3M11A 5F9EA 4RC2A 3S00A 1JWHA 5G6VA 3LLTA 2W1FA 3C0GA 4F1MA 1HOWA 5KX8A 1H1QA 4ORKA 3D2KA 3ZM4A 5J9LA 3I7CA 2IO6A 1MQ4A 4I24A 4BDBA 2WKMA 2ERZE 1WZYA 3BU6A 5ACBC 3AC5A 3QQLA 3WF9A 3AD6A 3ZFXA 4AZTA 5C4KA 4OAUC 3NNWA 4FV5A 2AUHA 5I9XA 3DDQA 5KHXA 1UWHA 4PY1A 3NUAA 3SG9A 4Y85A 4C34A 2JBPA 5AA8A 2BTRA 4YJPA 2R3RA 3KK9A 2REIA 3PFQA 3Q04A 4DH3A 3UPZA 2IN6A 4IACA 3KCFA 1R0PA 4L42A 3DTWA 3HMNA 4U44A 3RZBA 4EK6A 2XIYA 3EFKA 5ANOA 4NFNA 1LP4A 4KBCA 4YNEA 3U87A 4FZ6A 3EQFA 1H01A 2Y4IC 4FUXA 4FV2A 3ROCA 1GIIA 3PY0A 3UO5A 3VW6A 3PIZA 2QOOA 5JQ5A 1OL1A 4U9AA 3ZTXA 4IBMA 2GFSA 4WO5A 2WGJA 5CF4A 4CKJA 4NZWB 4F4PA 5HIDA 2VTMA 2PZRA 2W0JA 3QFVA 4TW9A 4CV8A 3E8NA 3LFDA 1ND4A 4UYAA 3MFRA 3TXOA 5JMSA 4JAJA 4U80A 5M56A 3HX4A 4O7WA 3ANQA 2BAQA 1BI8A 2VTLA 3C0HA 4E5WA 4DAWA 5A6NA 2BAJA 3GC7A 2YWPA 2OWBA 2XZSA 3PVUA 4ITHA 5M44A 5M06A 3DK6A 5KKRC 1PYXA 1H08A 2XBAA 4GK2A 3OTUA 4MTAA 4B4LA 1XO2B 3HL7A 2H96A 3K2LA 3NEWA 3FJQE 4KS8A 4OAVB 4DTAA 2Z7SA 4C02A 3RNYA 4U3YA 4F9WA 5FM3A 2Y6OA 4J97A 3V6RA 2BZHB 3F3WA 2WQMA 4WNPA 3P7CA 4D9UA 4R7IA 4E4MA 4AA4A 1PXJA 1Q24A 5E92A 4BC6A 4E5AX 4EZ5A 4RJ4A 5CSHA 3UQGA 1H28A 2C5YA 2XKEA 4FUYA 2OF2A 2JD5A 4IZYA 5AP6A 5BYLA 3LHJA 3FBVA 2XCKA 4EHEA 2GNIA 3GQIA 5AV4A 3K54A 3RGFA 5ACKA 4I6FA 1SYKA 3H4JA 5FBNC 4FODA 1PXKA 4L3LA 5KZ0A 5L8JA 4AOJA 2QODA 1Z57A 3Q9WA 4GK4A 3LXPA 4HGEA 4RWJA 3R73A 3DJ5A 2QR7A 2X6DA 1H07A 4IX6A 1PYEA 5FXRA 3KMWA 4MBJA 3EHAA 3P86A 3WZUA 1SVHA 3NUYA 4M3QA 4R7HA 4F7SA 3KRWA 2CKQA 3D94A 1YHWA 3E8DA 5EW8A 4FT7A 4D0WA 3A60A 1UV5A 5L6PA 2OJFE 3ZDIA 4NK9A 3KFAA 3KA0A 4HPUE 4IM0A 2VO3A 3QUDA 4ASXA 2A27A 4MNEB 3TZ8A 2YIXA 3VWAA 3RI1A 1ZYJA 4ACCA 2BRBA 3ALNA 4C0TA 3TUDA 1V0OA 3D7TB 2OJ9A 1JSTA 3ORLA 4FTOA 5JGAA 5M53A 3DPKA 2CLQA 2BRNA 4FTUA 2PWLA 5FDPA 3SOCA 2UZUE 4O0UA 5HX6A 5IH5A 3GU6A 2QI8A 2OU7A 3BU5A 4QMTA 4QQTA 2X9FA 4LV5A 3SW7A 3BE9A 4FMQA 4BTJA 3QQGA 2A4LA 2WQOA 3MGYA 4LMNA 4R1YA 5DWRA 3SD0A 3ZZEA 3OFMA 4KRDA 5DEWA 3BPRA 2B4SB 2VO7A 4KIPA 3B8RA 1PRYA 2C6OA 3FMDA 3TDWA 2QURA 1GY3A 4WOVA 1NVQA 4EL9A 4P5ZA 4E1ZA 3E8CA 3QHWA 4PUZA 3T3VA 4GT4A 4H36A 3C7QA 3DXQA 3LCDA 5HBEA 4Y5HA 4FSWA 3PJ8A 3V5PA 4D4SA 4FL2A 3LXLA 3FHRA 3O17A 1PJKA 3FXXA 1YXXA 4G16A 3GU8A 3TKUA 4A06A 4EEVA 5J1VA 2KULA 3VO3A 2F49A 1W8CA 2GS2A 5K4IA 4BZNA 4R7BA 3EYHA 4YU2A 3DNDA 5IUGA 4Y73A 1XH5A 5M4CA 3FI8A 5TKDA 3COKA 5DIAA 4AX8A 3ATTA 3GT8A 4XYFA 4Q9ZA 5J79A 4C7TA 4K18A 3GQLA 4BN1A 4E4NA 3FLNC 4XOZA 3S3IA 5CVGA 2AC3A 4TWCA 3H10A 4KB8A 4FSMA 2E9NA 4R5SA 5CASA 5DMZA 3FHIA 2OI4X 2HXQA 4L45A 5AMNA 4I5PA 4PPBA 4DFNA 4EZ7A 2R3PA 2WU7A 2J51A 1PKGA 2RG5A 3WF6A 3NIEA 1ZMVA 2F7EE 3F88A 1KV2A 4CZUA 2CCHA 2UW3A 3MH3A 3O8UA 5TO8A 4FIFA 3ZLXA 4QD6A 4M97A 5BVFA 2OO8X 3DU8A 4QP1A 5D12A 4A4LA 4V04A 4RIXA 4IX4A 4UEUA 3OMVA 4U45A 2CNQA 1H0WA 3C4FA 1H1PA 3R02A 4LUDA 4TRLA 2R3FA 3ZBXA 4DEGA 4IJPA 4A4XA 4ALVA 3R6XA 3VC4A 4BZOA 2ZM3A 1XH9A 4FSYA 2R3OA 3EN6A 3WIKA 2Q83A 4R6VA 3R1YA 2PVRA 5HE2A 3G2FA 5CEOA 3EQCA 4U3ZA 3EQRA 4L3JA 3AT2A 2YAAA 4RJ6A 2HENA 5AWMA 5IQAA 2EUFB 4UMTA 3PIXA 2NNWB 4IIRA 5EDQA 4BI0A 2OZOA 4H3QA 4PDSA 3BYSA 3F2NA 4KBKA 5EHLA 3AC3A 3QUEA 3LMGA 4GFGA 4U6RA 3EQGA 3IW7A 3HV7A 5CVHA 1ATPE 2WFYA 3HMPA 2Y6MA 4HYUA 2Q0BA 5D1JA 2WMVA 2QOIA 3NUXA 5DT3A 3G6GA 4WNMA 4XG9A 2BR1A 3MY1A 1FGKA 5ANIA 3ZEPA 4ASZA 4CEGA 4M0ZA 5KMMA 2DS1A 3A4OX 3G0FA 3V3VA 1QPJA 4TWPA 5IMEA 1OITA 2XVDA 5CZIA 4DGGA 4L68A 3ACKA 1VR2A 3I60A 3KY2A 3OWPA 4YO6A 4RFYA 4ANQA 4IVDA 4KKEA 4W8EA 4U42A 4N70A 4UXLA 4C2WA 5CAPA 3TM0A 1JLUE 3VUHA 1L8TA 2R3KA 1JKKA 4BR3A 1Y6AA 1KE7A 2I1MA 2PZ5A 3UO4A 3BKBA 3RVGA 4ANLA 4EYMA 4DCAA 1KSWA 4XG3A 3FMKA 5F1ZA 4O0RA 4TNBA 1W7HA 1Z5MA 2B52A 1H00A 5DPVA 3VUIA 3RALA 3UO6A 3UQFA 5C8MA 1Q8TA 5E8ZA 3LQ3A 4ZS4A 3L1SA 3GB2A 2XNGA 3PJCA 3RPYA 5FG8A 4XLIA 2E9PA 5LVOA 1V0BA 4GYGA 4ACHA 2BTSA 2P4IA 2R2PA 4LV8A 2PVNA 3ZUTA 3ATSA 1U5RA 3HYHA 3NUUA 4JBVA 5DFPA 4ANNA 3WF8A 3PJ2A 4MD9E 4CTBA 3A62A 3HMMA 5AEPA 4WA9A 3JR1A 3F9NA 1MUOA 4ZY4A 4GVAA 4IEBA 4C58A 2GNHA 2P0CA 3E93A 1SNUA 3VNTA 3G0EA 5HKMA 4EBWA 4TZRA 1MRYA 4C4JA 1XR1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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