4FIIA

Catalytic domain of human pak4 with rpkplvdp peptide
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
292
structure length
291
Chain Sequence
VSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/peptide
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PAK 4
publication title Type II p21-activated kinases (PAKs) are regulated by an autoinhibitory pseudosubstrate.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 96
structure length 291
sequence length 292
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fiiA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fiiA01
4QPMA 2NNWB 4DH1A 5JT2A 2B7AA 4RJ5A 3PXFA 3ULZA 5CU2A 4TWPA 2B53A 4AA5A 4BR3A 2FSOX 4D2WA 1M52A 1M7NA 3DLZA 3FMNA 2WMRA 3GCQA 5ACBC 3VHKA 3ORMA 3Q4CA 3VBVA 2GNFA 2YLEA 4JJRA 4Q9SA 5H9BA 3FZ1A 4L6QA 4W4XA 1U59A 5IA3A 1OBDA 3NVKI 1NXKA 3ALNA 5FRIA 3AG9A 2QKRA 4FK3A 4TPTA 5HE3A 4DA5A 5I9UA 4FVQA 1RDQE 4RA4A 1ZWSA 4OBQA 1LUFA 4OTFA 1P14A 3BHUA 3GCSA 2WEVA 2GNGA 3ZUUA 2WMAA 4Y46A 5AUWA 3KU2A 3H0ZA 1NW1A 3QU0A 1TQMA 2W1HA 2WIPA 4GG7A 4JBOA 3D2IA 3W33A 4OBPA 3DS6A 3UQGA 4CQEA 1P5EA 5E8WA 2Y4PA 2CGUA 5CI7A 3ORXA 4PTCA 2FYSA 3L9PA 1NY3A 3OMVA 1QMZA 3W32A 2VV9A 3O8TA 1WBOA 2HZNA 4UEUA 4B4LA 4BF2A 3ZDIA 2VU3A 4IW0A 4X0MA 4C59A 2A27A 3V8TA 3LOKA 2BZJA 2XRWA 2W4JA 3GCUA 3QWKA 3UZRA 4QQJA 4RFZA 2YCFA 3KL8A 3KMMA 4M84A 1DI8A 5JGAA 4JIKA 1BKXA 4ZLZA 1IAJA 4QTDA 4HGSA 5D7AA 4RG0A 2J5FA 3VIDA 4PL4A 1Q3DA 1UKIA 2WZJA 3C4CA 2JFMA 3S2PA 3IONA 1OVEA 4U44A 3GI3A 3DCVA 4DYMA 2GU8A 1T45A 3CIKA 4R7HA 3L9LA 4BDIA 3BEAA 2V7AA 2XJ2A 4RIWB 2JKMA 4AT3A 4NTTA 3V5PA 4KKGA 4KAOA 5AR5A 3ID6C 4S34A 2RL5A 3LIJA 2EB2A 4IAAA 3GB2A 4K1BA 4D2RA 3EB0A 2VN9A 2FA2A 3VS6A 4O0UA 4QYYA 4NCTA 2ETMA 3OOMA 3KULA 4AE6A 2GHGA 3G6HA 5CEIA 3BYMA 4IVDA 3FZPA 3U6JA 4AGCA 3V51A 3DAKA 2I0EA 4RJ7A 2PE2A 4D1XA 3MA3A 4YZNA 5K4IA 5D41A 4YJUA 2OXYA 1GOLA 5BUIA 4Y95A 4O7YA 1OB3A 1YOLA 2FO0A 4YNEA 5JK3A 5DWRA 3WYYA 4RIYA 3JUHA 4H36A 1ZMWA 3FMJA 5BVNA 4RIXB 5ETAA 3G0EA 5HICA 3A62A 5CAUA 4FSNA 2WTKC 3DXNA 4QP4A 4B7TA 3KY2A 2WTWA 5JRQA 3MPAA 3C4XA 2UV2A 4U9AA 5HO6A 1NVSA 4RQKA 3MH1A 3BV2A 3KK8A 4HCUA 4XEYA 4IVBA 4XOZA 4IQ6A 5CT0A 2QR8A 3E8EA 3QUPA 5E1EA 3RM6A 2ZDTA 2IO6A 4KRCA 5CWZA 4S30A 1UU8A 3NWWA 4WUNA 3NS9A 5CT7A 5CU0A 1H27A 4JDHA 5BUEA 4O7TA 5JSMA 4YBJA 5FXRA 2OI4X 3PVBA 1XHAA 3SD0A 2J0IA 2YM5A 1O6KA 3OCGA 3QUDA 4RZWA 2E9OA 5EK7A 5CAPA 4FKWA 3CKWA 1YI6A 5ETFA 2VRXA 4G6LA 2WTKB 4EH3A 4FIEA 4QYGA 2R3OA 3QD3A 3QTZA 4JBPA 1K3AA 2YFXA 4WSQA 4RC3A 3TJDA 4O7SA 3FY0A 4K6ZA 4YURA 3WYXA 3WF8A 3N4VA 2OFVA 2QD9A 4BTFA 4AS0A 3CJGA 5HO7A 3F9NA 4KB8A 4LL0A 3DA6A 2PZRA 2ZDUA 3NW6A 3UNZA 3VRYA 4C2WA 5HVKA 1OZ1A 4IB0A 4BL1A 3Q04A 4B9DA 5L2SA 1GZKA 2UUEA 4F0IA 1J7IA 2HENA 2BMCA 3PA4A 4KIPA 5ACKA 2CCHA 3FMHA 4ZTSA 4BWPA 4DHFA 4USFA 5IA1A 3FI4A 3MN3A 3QTXA 3KXGA 2WMTA 4PUZA 5TO8A 4YJOA 1OBGA 2GQRA 2R3GA 4FTMA 4TN6A 5K3YA 3I0QA 3ZSGA 2QOFA 3UC3A 4D4YA 4FOBA 3DKCA 4P7EA 3PWYA 4PDPA 3QTRA 4YU2A 3HUBA 2W9ZB 5DLSA 3BBTB 3MESA 3NR9A 5CVGA 2XS0A 3SOAA 4F09A 4M69B 2CKPA 4AGUA 4FKSA 4C33A 4OT5A 2NPQA 4YJVA 4XCUA 3FHIA 3ATTA 4RWKA 3RHKA 2UZOA 5GHVA 4GW8A 3FLZA 4XG4A 5K0XA 4IX5A 4R77A 4GU6A 5DNRA 5AIRA 1G3NA 5B2MA 2CSNA 1WVWA 2AYPA 3TNQB 2OXXA 2PU8A 4RVMA 3QKLA 4WUAA 4XNEA 2HY0A 1ZARA 3HLLA 2RFNA 3KKVA 3CTJA 1KE6A 2BAKA 2R3RA 5AUZA 3VO3A 3VBTA 2PZ5A 3ATSA 4U0IA 3OXTA 5IUHA 2I6LA 4GIHA 4FUYA 4YJNA 3ZCLA 4KIKA 4EK6A 5JGBA 2IW8A 2QI8A 3SKCA 3LFAA 1OECA 5LCKA 4AZEA 4FKTA 3ZBXA 5HVJA 3SW4A 4QT1A 4M13A 2X8IA 4IH8A 3Q9ZA 3TV6A 3MSSA 2UZTA 3KN5A 2VWYA 4FGBA 3PXYA 4G6OA 4G9RA 5IUGA 4F08A 2P2HA 1GAGA 3NUPA 4GCJA 1URWA 3BV3A 3PJ8A 5HNGA 4HNIA 2XIZA 2XA4A 2VTHA 3BZ3A 3Q60A 1MUOA 1XH4A 4UV0A 3Q96A 2PHKA 4H3QA 5F95A 3R1SA 3WF6A 4O0YA 2OLCA 3DJ6A 5GIOE 3DBDA 3D14A 4Z16A 2ZM3A 4CMOA 4AT4A 4CTBA 4M3QA 4EOPA 3QRIA 3NUYA 5J8IA 1P4FA 4ANSA 3KMUA 2VWBA 1XH9A 4O38A 2QO2A 3F61A 3NUXA 3P79A 4ID7A 4XUFA 3O50A 3VVHA 4PMSA 3WOWA 4B99A 2HOGA 4EK4A 4CKJA 2I1MA 3AC5A 2F7ZE 2VX3A 3C0GA 2VWXA 3GENA 3I6WA 3SOCA 4AAAA 4FL3A 5C8KA 4IXPA 4PL5A 3ZH8A 4XRJA 2G1TA 3EQIA 3KRJA 3QQFA 4KSPA 1K9AA 2EUFB 3I4BA 2J0JA 3AC8A 4ZEGA 4MXYA 1Z9XA 4L9IA 2JDTA 2PL0A 1FPUA 5BUJA 5CANA 4GV1A 3QKKA 4I92A 2GNJA 4JR7A 2XRUA 2YDKA 5DOSA 3VJOA 4NIFB 3DNEA 4JX7A 3HMPA 5E8ZA 4XG3A 2R9SA 5GJGA 4RWJA 4DEHA 5J1VA 2OU7A 3HV5A 4EQMA 5ITAA 2BDWA 3BGQA 5JQ8A 2XIRA 2W99B 3MPTA 5CAOA 1MRVA 3P9JA 4C4IA 2XKEA 4BCGA 3DXPA 2Z7LA 3LFBA 4P90A 3WZDA 2BROA 2C6EA 4IAZA 4FE2A 4QQCA 1OIYA 3SHEA 2Y7JA 4K77A 1PXPA 4PDOA 2A0CX 4J8MA 5L8LA 2ZB1A 3ORLA 3SX9A 3QTSA 2JC6A 1DAWA 3JVSA 4N4SA 2JITA 3MVJA 5DG5A 3RINA 3FMEA 3TKUA 4CG9A 5HG5A 2VTAA 5A9UA 2KTYA 3WZEA 4J71A 5E9EA 4TT7A 4PP7A 1ND4A 4E4XA 3C50A 2YCQA 4D2PA 2E9VA 2QOBA 2UW5A 1ZMVA 2JBOA 3QQJA 4N70A 4E6DA 5TKDA 1ZZ2A 4QMXA 3DPKA 2QOLA 2R5TA 4C0TA 5KMLA 3UMXA 4CFFA 3KFAA 2UZUE 2J0MB 4ACMA 1QL6A 4FSZA 5C4LA 3BKBA 4HYSA 4PNIA 4D5KA 4HVDA 2BR1A 4E5AX 2BFYA 3KK9A 4HJOA 3O96A 3HVCA 3OXIA 4OUCA 3ZO2A 2UW4A 3ULIA 4D1ZA 4GKIA 5CU6A 3R8LA 3R83A 4CZTA 3P5KA 1APME 5FQDC 4C3RA 3DFAA 1FVTA 3FLYA 4GK3A 4YJRA 2FB8A 4PV0A 1JBPE 4IM3A 4HYUA 5CEMA 2VZ6A 1OKWA 5FEEA 3RCJA 4FIIA 2OH0E 3RAKA 2P3GX 3KF7A 4IDVA 3TXOA 5CSXA 3QRUA 5FTQA 4K9YA 2YJSA 3U55A 5ETCA 2F49A 5DPVA 4EORA 3SG9A 4L8MA 3PY1A 3D7ZA 4LV8A 1PYXA 1Z57A 2C69A 4R7BA 5CI6A 2C5NA 3KF4A 2V0DA 4R3CA 1OIUA 3LFFA 3QRTA 4C3PA 3GEQA 4LRMA 3G6GA 4QNAA 1T46A 5IQGA 5G1XA 1R0PA 1XKKA 2J5EA 3ET7A 1KUTA 3G15A 5M56A 1BI8A 3HEGA 4YZ9A 5L4QA 4O21A 5CLPA 2HXLA 1WMKA 1YOMA 2Z8CA 4FZ7A 2B9HA 2CGVA 4FBXA 4AA4A 1WFCA 4H05A 3PJ3A 4FKLA 3G9LX 2C6DA 4ARKA 2AC5A 4C58A 5JEBA 3BIZA 4G34A 3S3IA 5CQUA 2VO7A 3WI6A 4ASXA 3Q4UA 4NM0A 3W55A 4ASEA 5EQPA 2OFUA 3DB8A 4C4HA 1WBWA 2ZMDA 3ELJA 2BKZA 4L43A 4KS7A 1OIRA 4AZTA 5CX9A 4EC9A 4CRSA 1W98A 4GYIA 2VX0A 4L3LA 4RJ8A 3OVVA 4M68A 5DYJA 2OICA 4FT9A 4JI9A 4BTMA 2Y6OA 2RG5A 2V5QA 1YKRA 4F0GA 5IQBA 3R1QA 5ANEA 2DQ7X 2Z02A 4XH6A 2JBPA 2ZV7A 4G5JA 2O2UA 4FTNA 5B2LA 3TDWA 3Q5ZA 4YJPA 5E8UA 4AW2A 2R3PA 5H8BA 4DG3E 1J7LA 3UMWA 4PX6A 4FEXA 3QQKA 1QPEA 4CLIA 4D55A 4EOIA 2G15A 2JDSA 3P78A 1ZLTA 2QR7A 3IK3A 2YIRA 5C4KA 1XBAA 2R2PA 1NT2A 3SXFA 4XRLA 3DFCB 3FSFA 4J96A 3RZFA 3RPYA 1WBPA 3UO4A 3ZHPC 4EHGA 4FMQA 4JNWA 4AW5A 5L2WA 1JOWB 1XH5A 3ZEWA 2GSFA 3ETAA 4NL0A 4FV6A 2CMWA 3U9CA 5CXZA 2YM3A 3DQXA 3D2KA 4IX6A 2C3KA 4E5BA 3C5IA 4TZRA 3OUKA 4I93A 3FZTA 4NT4A 1GNGA 5H8EA 2IVVA 1AGWA 3OC1A 3MA6A 2WPAA 3NYOA 3LXKA 4HGLA 4FKUA 4IACA 4XP0A 3UG2A 4UZHA 5L8JA 4QYEA 3EYHA 2PVRA 1KE9A 4E1ZA 2ITTA 2X0GA 4IAIA 3VF8A 2WQNA 1QPDA 4BZDA 4BCPA 4G3DA 3MS9A 3QL8A 3UZTA 4BGHA 4O84A 2H8HA 4PMPA 3FLSA 2GPHA 3MI9A 3EQDA 3IW8A 5AP3A 3H9FA 3EKKA 3ROYA 4CGAA 3AC4A 4GMYA 4CSVA 4I20A 2WMSA 4NU1A 4O0WA 5BNJA 5KMKA 4GU9A 3MJ1A 3LFSA 4GT5A 4J95A 4L45A 3UZPA 3DDQA 2WELA 3P4KA 2QURA 3C51A 2R3JA 4RGJA 3UO5A 2IG7A 5KKRC 3DDPA 3GOPA 1Q8WA 3F2AA 3P0MA 4DGOA 3P7BA 1SVEA 2PY3A 4L46A 3ROCA 4BGQA 4QMYA 4CV9A 5EQYA 4G3GA 4H39A 4BY9E 4MYGA 2X81A 1QPCA 5E4HA 3VW6A 5IA4A 5HBEA 3PYYA 5DEWA 4QTCA 1E9HA 4X21A 3QGWA 3DJ7A 1IEPA 3RZBA 4XG6A 5AP7A 5J87A 2XIYA 4UWYA 3QTWA 1ZOGA 4S2ZA 2GFSA 4QQTA 4LRKA 5A4CA 2C5XA 1DM2A 4O6EA 4DGMA 2BHEA 2JKOA 4ALWA 4BBEA 4W4YA 4M67A 4D2TA 1G8SA 4IFCA 2B9JA 2YWPA 3QUEA 2RFDA 4F1OA 2XVDA 3I0OA 5IH6A 3MTLA 4R8QA 1BUHA 3UYTA 5C1QB 2J50A 4EJ7A 3O51A 5KKRB 2CN8A 3OY1A 5AP5A 3TUCA 1JAMA 4I6FA 4MF1A 1XO2B 5KBQA 3D94A 4OAVB 3UP7A 4YLJA 1VZOA 1HCKA 2W5HA 2XIXA 3MV5A 4FIJA 3QCQA 4JRNA 4KIOA 5ANDA 3VS7A 4BCOA 4BCQA 4HZRA 4CD0A 4E20A 3MWUA 2OJFE 3FY2A 3FMLA 3Q2MA 4OR5A 5BVEA 4ANOA 4D28A 3HX4A 4ZS4A 4QMQA 5I9YA 5FBNC 3FHRA 1VJYA 4GUBA 1GZ8A 4AGDA 1H1SA 4C3FA 4YPDA 5KZIA 5CF8A 5EOBA 5LQFA 5F94A 5ICPA 4EUTA 3QFVA 4RFMA 3N4TA 3F7ZA 3IOPA 2PZIA 2W1ZA 2BAQA 1B6CB 1MQ4A 3SAYA 3FLWA 3RK9A 5DH3A 5AFVA 2VTTA 5TR6A 1CKIA 5M4FA 3FUPA 4UZDA 4BKYA 3E92A 2A1AB 3EMGA 3K54A 3W10A 4CFWA 2R3NA 5CENA 3F3VA 4J98A 5FDPA 5LWMA 3D5UA 2C47A 5BVKA 5GIPE 1H1PA 4RLKA 2IVSA 4ITHA 3BI6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4QPM A;  2NNW B;  4DH1 A;  5JT2 A;  2B7A A;  4RJ5 A;  3PXF A;  3ULZ A;  5CU2 A;  4TWP A;  2B53 A;  4AA5 A;  4BR3 A;  2FSO X;  4D2W A;  1M52 A;  1M7N A;  3DLZ A;  3FMN A;  2WMR A;  3GCQ A;  5ACB C;  3VHK A;  3ORM A;  3Q4C A;  3VBV A;  2GNF A;  2YLE A;  4JJR A;  4Q9S A;  5H9B A;  3FZ1 A;  4L6Q A;  4W4X A;  1U59 A;  5IA3 A;  1OBD A;  3NVK I;  1NXK A;  3ALN A;  5FRI A;  3AG9 A;  2QKR A;  4FK3 A;  4TPT A;  5HE3 A;  4DA5 A;  5I9U A;  4FVQ A;  1RDQ E;  4RA4 A;  1ZWS A;  4OBQ A;  1LUF A;  4OTF A;  1P14 A;  3BHU A;  3GCS A;  4AAY A;  2WEV A;  2GNG A;  3ZUU A;  2WMA A;  4Y46 A;  5AUW A;  3KU2 A;  3H0Z A;  1NW1 A;  3QU0 A;  1TQM A;  2W1H A;  2WIP A;  4GG7 A;  3BL7 A;  4JBO A;  3D2I A;  3W33 A;  4OBP A;  3DS6 A;  3UQG A;  4CQE A;  1P5E A;  5E8W A;  2Y4P A;  2CGU A;  5CI7 A;  3ORX A;  4PTC A;  2FYS A;  3L9P A;  1NY3 A;  3OMV A;  1QMZ A;  3W32 A;  2VV9 A;  3O8T A;  1WBO A;  2HZN A;  4UEU A;  4B4L A;  4BF2 A;  3ZDI A;  2VU3 A;  4IW0 A;  4X0M A;  4C59 A;  2A27 A;  3V8T A;  3LOK A;  2BZJ A;  2XRW A;  2W4J A; 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