4FIKA

Human carbonic anhydrase ii h64a complexed with thioxolone hydrolysis products
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGAAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Synchrotron Radiation Provides a Plausible Explanation for the Generation of a Free Radical Adduct of Thioxolone in Mutant Carbonic Anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2012-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4fikA00
1YDBA 1YO1A 1ZSCA 1ZSBA 4KNIA 1TTMA 4M2RA 3HKNA 2IT4A 4BF1A 3OY0A 1KWRA 4KP5A 3N3JA 1CVFA 3MZCA 3M2NA 3BL0A 4ZWYA 3PJJA 1CIMA 4E5QA 4Q7PA 3MNUA 3P5LA 5G01A 4R5AA 1G54A 4MLTA 5DSNA 5JG3B 1CAHA 3K2FA 3B1BA 5EHWA 3M04A 3FW3A 5SZ7A 1CCSA 3T5UA 5FDIA 3S76A 4K13A 3N2PA 4QK1A 5J8ZA 3S78B 1FQRA 4KNMA 3D0NA 1BCDA 4YXIA 3P5AA 2FOVA 1I90A 3P55A 1RJ6A 4IWZA 5JQTA 4G0CA 1CRAA 4KUYA 5JESB 4Q8XA 4PQ7A 1A42A 2NNVA 3P3JA 5E28A 3RYZA 3JXGA 4ZWXA 4YVYA 1HUGA 5IPZA 3DC9A 2X7SA 2WEJA 4KAPA 3PO6A 3U45X 5EOIA 5EKJA 3V5GA 1CAOA 4K0SA 3Q31A 1HVAA 5JGTB 5DSQA 1XQ0A 2POVA 4DZ9A 3V3FA 5AMDA 4YYTA 4QJOA 4YXUA 5FLTA 5FNKA 1CVCA 2HKKA 3MNHA 5DOGA 1TB0X 3SBHA 3DA2A 4QTLA 5DSJA 3SAPA 5A6HA 1Z97A 5EH7A 1BN1A 3RZ1B 1IF4A 4MO8A 1LG5A 4QSJA 5DSIA 5HPJA 3IBNA 2FMGA 1H9NA 2QO8A 3KLDB 3CAJA 3M2ZA 1CRMA 2HNCA 2NWPA 4XFWA 12CAA 3D93A 5E2NA 5EH5A 3MNKA 4ITOA 4Q99A 2FNNA 4YWPA 3MNAA 3M1QA 3S74B 3K34A 5FNIA 5EZTX 1JD0A 8CA2A 5E2KA 4QSBA 3CYUA 1G1DA 3V2MA 2Q38A 1HCBA 4Q87A 2W2JA 1BNNA 3IGPA 5CJFA 4LP6A 3S8XA 4JSSA 4N0XB 1I9LA 2WEOA 3D92A 2NXRA 3P58A 4LU3A 1CNHA 3RZ7A 2H4NA 1ZFQA 1OKMA 4TWMA 5DRSA 2QP6A 4Q7VA 4XE1A 3U7CA 2AW1A 1TH9A 1T9NA 1YDAA 2CBDA 1IF9A 1LZVA 2NNSA 4RFDA 2WD3A 1FSRA 3RGEA 2NXSA 5AMGA 5SZ1A 5JEGB 1ZGEA 1TBTX 3MHCA 1CNBA 1UGGA 4QY3A 1HEAA 1UGBA 1TEQX 3KNEA 3NB5A 1AM6A 4PZHA 3V3JA 5C8IA 5FL6A 1RZBA 4Q09A 5JQ0A 1YDDA 1IF7A 5E5RA 4KUWA 5DSMA 4KUVA 3RYVB 4JSWA 1CAKA 1G0FA 3CZVA 1ZFKA 5EKHA 3RLDA 5FNLA 3HFPA 4YXOA 3R16A 3DV7A 4L5WA 3W6IA 1YO0A 4M2UA 4E3DA 4QSAA 4ITPA 4E49A 1RAZA 4HT0A 4Q06A 4YGFA 4ZAOA 3M98A 1BZMA 1I9NA 1TG9A 2CBAA 2WEGA 4MLXA 3L14A 1CNGA 1KEQA 1KOQA 3T83A 3JXFA 2EZ7A 3RG4A 4DZ7A 1I9QA 4Y0JA 3IEOA 3M5EA 5FLQA 4Q07A 5A25A 3F7BA 5L6KA 4RUYA 4N16A 5FDCA 1XPZA 1G3ZA 3HKQA 1BV3A 2X7TA 4Q49A 1DCBA 5E5UA 2HL4A 3P44A 3RJ7A 4FVOA 5FNGA 5CACA 1BN4A 4M2WA 4ZX1A 2CBCA 3M67A 4M2VA 4HEYA 3MWOA 4MDGA 1CAJA 2NWZA 3OKVA 1UGCA 2X7UA 3KS3A 4MTYA 4Q7SA 3UYQA 1V9IC 3IBUA 2NMXA 3T5ZA 3M14A 1IF5A 4K0TA 3RYJB 1ZE8A 3MDZA 3M5TA 4KV0A 5DSLA 1OQ5A 3MMFA 3K7KA 4KNJA 3F8EA 3M1WA 3TVOX 2NWYA 1CVAA 4MDLA 3OIKA 3OKUA 4PYXA 4QK2A 4QSIA 3DVBA 4QJXA 4YGJA 3T82A 1RAYA 5BRWA 1J9WA 1MUAA 1CA3A 1I91A 1V9EA 4XZ5A 1CNKA 4ZWZA 1AVNA 1BNWA 1XEGA 2NWOA 5E2RA 3S72B 1FQMA 1I9OA 4YHAA 5EH8A 3F4XA 1ZSAA 5SZ5A 4X5SA 4C3TA 2NNGA 1RJ5A 4JSAA 1DCAA 4HEWA 1CAZA 1LGDA 2VVBX 2FOUA 3KWAA 4WUQA 4HEZA 1CANA 3D9ZA 3R17B 3KOIA 2FMZA 5FNMA 3HKUA 2CABA 5SZ6A 9CA2A 1G0EA 3ZP9A 4XIXA 3EFTA 4WW8A 4CNWA 2ILIA 1IF6A 4WW6A 4RIVA 1TEUX 1FSNA 1G4OA 4WUPA 4Q08A 3TMJA 3MNJA 4HBAA 2NN1A 3DVCA 1FLJA 2NNOA 3MHMA 4HF3A 1BNQA 3OIMA 3RZ0B 3DAZA 4QIYA 1FQNA 3MHLA 4CNRA 4QIZA 1G45A 4ILXA 3JXHC 3M1JA 5AMLA 5E2SA 3KONA 2ZNCA 3D8WA 2NN7A 4RFCA 2FNMA 4Q90A 1CILA 4E4AA 3S9TA 5BRVA 4CA2A 3BETA 1CNJA 1G48A 5FLSA 4Z0QA 3DCCA 1HEBA 3T85A 2AX2A 1BNTA 1LG6A 3IBLA 1BNVA 3DC3A 4YGLA 3OYSA 3V7XA 4G7AA 1CZMA 4QJ0A 1Y7WA 1TG3A 2NXTA 3P3HA 3N4BA 3SAXA 4UOVA 1CNWA 3U47A 1G52A 4Q8ZA 3KIGA 2ABEA 4MDMA 3TVNX 4R5BA 1ZH9A 4Q6EA 3M96A 3B4FA 3MNIA 2QOAA 1CAYA 1URTA 1IF8A 3PYKA 4COQA 2GD8A 1CCUA 3MYQA 1JCZA 1H4NA 4RIUA 5FLOA 4BCWA 5JG5B 2OSMA 3NI5A 6CA2A 1UGEA 3KKXA 1CALA 5LMDA 1KWQA 4E3HA 2VVAX 1OKNA 3M40A 3FFPX 1DMYA 5CA2A 3P4VA 5JGSB 1AZMA 1HEDA 4JSZA 4RUXA 2F14A 2HOCA 4HT2A 2FW4A 3ML5A 3ML2A 1G6VA 1UGFA 1CAMA 4R59A 5DOHA 2Q1QA 3RYXB 4L5UA 2WEHA 3T84A 1XEVA 5DVXA 4FPTA 1OKLA 5G03A 3KOKA 3N0NA 3DD0A 1BN3A 1UGAA 1LUGA 1KOPA 1H9QA 3DCSA 3DCWA 4CNXA 2O4ZA 4FIKA 4Z1JA 4E9OX 4BF6A 4Q8YA 1ZGFA 4XIWA 5DSPA 4HU1A 4Q81A 1CNXA 1I9PA 4QK3A 4ETQC 5JEPB 1FR7A 3HKTA 4K1QA 5CLUA 1RZEA 1CCTA 5EHEA 5BNLA 5SZ3A 1FR4A 3OYQA 5G0BA 1CAIA 5FLPA 3OILA 5L3OA 1CA2A 3M5SA 4Q83A 2CBEA 1I8ZA 3EFIA 4JS6A 4Z1NA 4PYYA 5FLRA 4Q0LA 2FNKA 3RZ8A 5SZ4A 1BNMA 4ZWIA 5JEHB 5EIJA 3S71B 1CVBA 3FE4A 2HFWA 4ZX0A 3RYYA 5DSRA 4KP8A 1G46A 1I9MA 3GZ0A 2EU3A 4RH2A 4TWLA 1MOOA 4Z1EA 1HCAA 3S97A 3S73B 5SZ2A 3IAIA 4GL1X 2POWA 3M2YA 5DSOA 1FQLA 1RZAA 2POUA 4YGKA 3RZ5A 1JV0A 4Q78A 3DBUA 3W6HA 4CQ0A 2OSFA 4QJPA 3M3XA 5G0CA 2CBBA 1G53A 5EHVA 1CINA 4CNVA 3M1KA 3NJ9A 3M2XA 1HECA 1Z93A 4YGNA 2FOQA 4KNNA 4RUZA 4Z1KA 3DVDA 5BRUA 7CA2A 4CACA 4YX4A 4QJMA 4E3GA 2H15A 4WL4A 1BICA 4QJWA 1ZNCA 3UYNA 4E3FA 1YDCA 1CVEA 1CVHA 2WD2A 1RZCA 4FRCA 1CNIA 4Q7WA 3QYKA 3CA2A 4K0ZA 4LHIA 5FNJA 3ZNCA 5FL5A 4QEFA 2HD6A 5BYIA 5FL4A 3VBDA 3MHOA 4WR7A 2FOYA 5DSKA 1F2WA 3V3IB 4RN4A 2Q1BA 3IBIA 3S75B 3V2JA 1G4JA 4PXXA 3BL1A 1CNYA 4Q9YA 1EOUA 2CA2A 4FL7A 3SBIA 3C7PA 3MHIA 5SZ0A 1UGDA 1YO2A 2EU2A 4FVNA 4Q6DA 3V3HB 1HUHA 1Z9YA 1THKA 3S77B 1CVDA 3U3AX 3LXEA 4FU5A 5FNHA 3RG3A 5JDVB 4IDRX 1DMXA 3V3GB 3HS4A 1FSQA 4L5VA 1CNCA 3F7UA 2GEHA 2FOSA 1TE3X 5E2MA 1BNUA 3HLJA 1RZDA 3DD8A 5EKMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1YDB A;  1YO1 A;  1ZSC A;  1ZSB A;  4KNI A;  1TTM A;  4M2R A;  3HKN A;  2IT4 A;  4BF1 A;  3OY0 A;  1KWR A;  4KP5 A;  3N3J A;  1CVF A;  3MZC A;  3M2N A;  3BL0 A;  4ZWY A;  3PJJ A;  1CIM A;  4E5Q A;  4Q7P A;  3MNU A;  3P5L A;  5G01 A;  4R5A A;  1G54 A;  4MLT A;  5DSN A;  5JG3 B;  1CAH A;  3K2F A;  3B1B A;  5EHW A;  3M04 A;  3FW3 A;  5SZ7 A;  1CCS A;  3T5U A;  5FDI A;  3S76 A;  4K13 A;  3N2P A;  4QK1 A;  5J8Z A;  3S78 B;  1FQR A;  4KNM A;  3D0N A;  1BCD A;  4YXI A;  3P5A A;  2FOV A;  1I90 A;  3P55 A;  1RJ6 A;  4IWZ A;  5JQT A;  4G0C A;  1CRA A;  4KUY A;  5JES B;  4Q8X A;  4PQ7 A;  1A42 A;  2NNV A;  3P3J A;  5E28 A;  3RYZ A;  3JXG A;  4ZWX A;  4YVY A;  1HUG A;  5IPZ A;  3DC9 A;  2X7S A;  2WEJ A;  4KAP A;  3PO6 A;  3U45 X;  5EOI A;  5EKJ A;  3V5G A;  1CAO A;  4K0S A;  3Q31 A;  1HVA A;  5JGT B;  5DSQ A;  1XQ0 A;  2POV A;  4DZ9 A;  3V3F A;  5AMD A;  4YYT A;  4QJO A;  4YXU A;  5FLT A;  5FNK A;  1CVC A;  2HKK A;  3MNH A;  5DOG A;  1TB0 X;  3SBH A;  3DA2 A;  4QTL A;  5DSJ A;  3SAP A;  5A6H A;  1Z97 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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