4FK9A

High resolution structure of the catalytic domain of mannanase sacte_2347 from streptomyces sp. sirexaa-e
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
HHHHHHAIAENLYFQSAAGLHISDGRLVEGNGNDFVMRGINHAHTWYPGETQSLADIKATGANTVRVVLSDGYRWSENSPEDVASIIARCKAERLICVLEVHDTTGYGEDAAAGTLDHAADYWIGLKDVLDGEEDYVVINIGNEPWGNADPAGWTAPTTAAIQKLRAAGFAHTIMVDAPNWGQDWEGVMRADARSVYDADPTGNLIFSIHMYSVYDTAAKVTDYLNAFVDAGLPLLIGEFGGPADQYGDPDEDTMMATAEELGLGYLAWSWSGNTDPVLDLVLDFDPTRLSSWGERVLHGPDGITETSREATVF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Cellulose-binding family II
publication title Biochemical properties and atomic resolution structure of a proteolytically processed beta-mannanase from cellulolytic Streptomyces sp. SirexAA-E.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces sp. sirexaa-e
total genus 119
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4fk9A00
1UOKA 3NSXA 1TZ7A 4HZ6A 3PN8A 4MDOA 3TTQA 4KGJA 3VKKA 5AC5A 2CKSA 5DFAA 3VMPA 2X0YA 4EE9A 3RIKA 1V08A 3MUY1 1E3XA 3GTNA 5DT7A 1KBKA 2WMKA 1C91A 2XFYA 3AHVA 4TTGA 4OOUA 4LYRA 2WWDA 3M46A 4UOQA 1BYAA 2XPKA 4P8UA 1ECEA 6TAAA 2WMIB 1KXVA 1XSJA 3ARVA 2WLZA 5DF0A 1VBUA 3WENA 1E6PA 2EO7A 4GZJA 2J8FA 5I3DA 1JD9A 3AS0A 1CPUA 2QPSA 4B15A 3WQ8A 1TR1A 4TVUA 3NDYA 5HOSA 2EPLX 3BAXA 4ACZB 4D1JA 1CDGA 3WFZA 3WL1A 4GQRA 1GVYA 3W25A 1UKSA 4JKMA 1OSEA 1GJWA 4M82A 5BWFA 4UFIA 2O9TA 2FHBA 4H41A 2ZWZA 1VFFA 1JAEA 3VGHA 4WKHA 3TTOA 3WNNA 4X9YA 3POCA 1ISVA 1CEOA 4WKFA 5CSUA 3SUVA 3DYOA 1WDRA 2CHOA 3FHQA 3BAYA 2DIEA 5D9PA 2PBOA 4JL2A 4WLCA 4RL3A 1GZJA 1UKTA 1HKMA 3WMCA 2UY2A 3GH4A 1CTNA 3PZ9A 3WH9A 3EDKA 4NRRA 1PJ9A 1HN1A 3WEMA 1MWOA 1EO5A 4IM4A 4HA1A 3WF1A 1JYVA 1CGTA 3E1F1 4V28A 1HJUA 3MU7A 2D1ZA 2VC9A 3WELA 1VAHA 4UFLA 4B3LA 2J47A 2O9PA 3PTMA 1UYQA 4MB1A 5A6JA 4E2OA 1W9VA 2DSVA 3ARRA 4PTWA 1BYCA 2QMKA 3N11A 2GK1A 2WMFA 4IISA 1EDQA 5ABGA 1HIZA 5DT5A 2ZE0A 3BXWA 2WB5A 1BLIA 1UD2A 2VZUA 3NYDA 3WKZA 3PZNA 2DH2A 1JDDA 3M6DA 1HJVA 3SCWA 4DWSB 2EBNA 5GNYA 1J0KA 2VZOA 1OGGA 3A4AA 2VVSA 3L2MA 2C0HA 4X0NA 1XD0A 3NIYA 1JYWA 4AZ6A 1QBBA 3AZRA 3ARPA 1TUXA 3SCVA 2J25A 4PMXA 1C8XA 5A2CA 3UERA 1KGWA 1ITXA 5CXPA 1K9EA 1BTCA 4UOJA 1VJSA 3J7HA 1R8LA 1MXGA 4M29A 3NUKA 1E0XA 3CO4A 2ZX5A 4WKAA 3FN9A 2XGBA 1AMYA 3U7BA 1NP2A 3KEHA 2CITA 2DIJA 4IPNB 1Q4NX 1P6WA 3PZTA 2YLLA 1JXKA 1UQZA 4PMNA 5BXPA 3ZMRA 3N1AA 2PWEA 4JFSA 2BY3A 3O2LA 3MSGA 1CIUA 3AISA 4LGXA 4HMCA 1GHSA 4EANA 1H41A 2F8QA 4CD5A 4AZHA 3EDFA 2W5FA 1PX4A 1DHKA 2RGMA 1B2YA 1XH0A 1Q6FA 3T2QA 1KQZA 2JALA 2X09A 1GJUA 1MFUA 3WF2A 1DWAM 1ZBVA 1C7TA 1V6WA 3QR3A 1LWJA 1E5JA 4M1RA 5AYIA 4BCEA 2VX4A 3M7SA 1E72M 3MUAA 5E9AA 2G41A 3GNRA 2A3EA 2VRQA 3ARUA 4PCTA 1VFUA 1RD6A 4HMEA 4X0VA 3RCNA 2VZVA 3MMWA 4W85A 1WDSA 4HTYA 2YDRA 2ESCA 4GQQA 1CZ1A 1W9DM 5JIPA 2WNWA 2J78A 1V3LA 2J7CA 5A6KA 1ITCA 4AISA 4QLLA 1J12A 3ZT5A 1XV8A 4D6IA 5JBDA 2WAGA 4IUGA 1OWQA 5I77A 2DQXA 3RM9A 1CGYA 4R27A 4DM1A 3WEZA 3SUTA 3EDJA 2OSWA 1KXTA 4AIEA 5LA0A 4ATDA 1C92A 2XYLA 1H0IA 5ABEA 2J7GA 2J4GA 3S2CA 2J75A 1HKJA 2QMJA 4UFKA 3VVGA 5A94A 1QNRA 1QHZA 1BQCA 3FAWA 1Q6DA 4C7DA 1VEPA 2VCBA 4AY1A 1JYNA 1HJXA 4GINA 1TVNA 4R5EA 5BRQA 3W53A 4YHGA 2X2YA 1OD0A 5E09A 2WCGA 2PBGA 1CECA 1XD1A 4TX8A 4GIAA 3SURA 3MS8A 1KCLA 1GUVA 3WSUA 1FH8A 5I0DA 1TA3B 1YQ2A 1BG9A 1QBAA 4OZOA 4YPJA 3WDIA 4FLSA 4AMCA 1IZJA 1EIBA 5A8PA 1OCQA 2ZIDA 4AD5A 5BXTA 1EH9A 5D9OA 2WLYA 1W9PA 5FKYA 4PMVA 4UTFA 4H7VA 1XSIA 4MJ4A 4UQCA 3UR7A 1UWSA 4NF7A 1QI4A 2DT2A 3BH4A 3PZMA 1B3VA 4CU6A 4PUEA 3WH5A 2W67A 4AZ7A 3IJ9A 2ZUTA 4D6GA 1HNYA 3VD5A 4XX6A 3WN6A 1GQKA 2XTKA 3CIVA 5FL0A 4M8UA 5AY7A 2E3ZA 3QOKA 4CCCA 1MYRA 1QOXA 4OBRA 4DUWA 1QHPA 2JIEA 3QGVA 1C8QA 4U5IA 1ZS2A 4UR9A 1HP4A 2XWEA 1XH1A 4QFUA 1JF5A 1XCWA 1J10A 3D5HA 2UY5A 4OOZA 4EAMA 1B9ZA 1HX0A 3RO8A 3UCQA 4LYQA 3A47A 1G5AA 5C70A 1SYTA 2A3AA 2EQDA 1CGXA 2XVKA 3W28A 2D0FA 2CIPA 2BHYA 4AEEA 4L4PA 3VMOA 3DC0A 2O9RA 4GI8A 3NDZA 4YHEA 2BY2A 3FY1A 4MAZA 1H5VA 3B9DA 1E71M 1JNEA 5IFPA 4MADA 3W6MA 4JKKA 4CCEA 5CZKA 3MMDA 3CTTA 4J3UA 4N0RA 4CUCA 3PZIA 3AICA 5FL1A 3N18A 4U33A 3K8MA 3ARWA 1C8YA 4PCSA 2BNJA 1ZL1A 1UKQA 4FK9A 3VPLA 5JBFA 3OGSA 4B9ZA 4J3SA 4P8XA 2NSXA 1CYGA 2WBGA 3BAWA 4NI3A 4W84A 5JUVA 1JAKA 1VB9A 1L0PA 3AIUA 3SUWA 3AZTA 2DH3A 1H11A 2JE8A 5CPQA 1E15A 2AAAA 1U2YA 3MUZ1 2JF7A 5BXSA 4XZBA 2VMFA 2CBIA 3NSNA 4JKLA 5D9NA 3ZO9A 4F9JA 4W88A 3PBGA 1KXHA 3CHFA 1EO7A 3VIGA 3VGFA 4ATLA 2BXZA 3RDKA 1UWTA 4AIOA 1MVYA 3FHAA 1SR0A 1FH7A 4PUDA 3CUHA 1Q6CA 3B9AA 1OGSA 3WD0A 3ZSSA 2CESA 5BRPA 4XB3A 3F5JA 3POHA 5LA1A 4PYSA 1UR0A 4W8AA 3ARQA 1BF2A 3WH7A 5AYBA 4H8UA 4C7FA 3PHAA 4GZEA 3VGGA 1V3KA 3WL0A 2XHYA 3U57A 2OWCA 2ZX6A 3K4AA 1QI5A 1JI2A 2W61A 1AQHA 4AZBA 1E6ZA 1WAWA 3KZSA 2D24A 2E8ZA 1UWIA 3WNLA 1Q6EA 3AIVA 4JHOA 4Q22A 4CVWA 3VIIA 1CNVA 1K9DA 1V02A 3KE0A 4CD4A 1W32A 2DSZA 4MNKA 1IZKA 3WNKA 1SMDA 7CGTA 4UZSA 2FGZA 3L4VA 1B0IA 2CBJA 1WZKA 3TA9A 4AZCB 5GQBA 5HDRA 3SCQA 4RE2A 3BLKA 1GQJA 2IUZA 2PB1A 2FDMA 1MW1A 4D6DA 1GOIA 3PTQA 2OSXA 3VD3A 1ISZA 3JUGA 4TVDA 4MB3A 2IXVA 1UD5A 3W82A 1WCGA 3T0AA 1ZBKA 2D23A 5TD4A 9CGTA 3UETA 3I3EA 5I24A 4LXFA 3D3AA 1D3CA 5IDIA 2OSYA 5CJ5A 2ZX9A 3VIKA 3ZJ8A 1UWQA 4U3AA 1TE1A 3WNPA 2WVTA 2VCCA 3PZOA 5IFTA 2YLAA 3EMCA 5JIWA 4H2CA 3OLGA 2DGAA 8CGTA 4W7UA 1DWIM 1MQPA 3AIEA 1WNOA 4HMDA 3U5UA 5CQ1A 2VX6A 1E6XM 1EHNA 1I1WA 1JF6A 1A47A 1Q6GA 2J77A 2QV4A 1VRXA 4BQ2A 1E4NA 1WP6A 3FXYA 4W7WA 4RE4A 5EFDA 2ZXAA 2CBVA 5EMYA 2VT0A 1B3ZA 3NSMA 3VGEA 4AZGA 1QW9A 1ZB5A 5IHRA 1JZ8A 4B16A 5A2AA 1LQ0A 4FLRA 4QCFA 3AXHA 5C71A 3WUGA 4JIEA 1MXDA 4Y7EA 3MANA 3N12A 1TCMA 2WCAA 4TVCA 1JZ7A 3TOPA 3L4WA 7A3HA 4ZXLA 3WDRA 3UG4A 2DT3A 1WPCA 3OBAA 4JL1A 3N13A 2ZUNA 3I3DA 1NH6A 2WMIA 3ZIZA 4CU8A 5DEZA 1EA9C 2V3GA 2YKKA 3CZEA 3ZR6A 1CXFA 2QHAA 4W93A 3CZGA 4M81A 1J0JA 4JAWA 4ACZA 3THDA 4F9DA 4XZWA 4A4AA 4H04A 2D0HA 5HNNA 1UR8A 4MTVA 4FLQA 2C8NA 1ESWA 1HVXA 2EPNA 4CU7A 1O7AA 2WM0A 3GYCA 4LX4A 4PBGA 3RM8A 2WW5A 4PMQA 4GPNA 1VIWA 5HBFA 2BFGA 2WANA 3VDAA 1C3FA 3G6LA 3TTYA 1K6AA 3HN3A 2VO5A 4Z2JA 1V0LA 1E73M 2OYLA 4UQEA 2GJRA 3VX0A 2W91A 4K68A 1GCYA 4TXEA 1RP9A 1MW2A 1V6YA 1V6VA 1YHTA 4UFMA 4D1IA 2XWDA 1GOWA 3AHZA 3GZAA 1D7FA 3EDEA 4P8VA 1UA7A 5GNZA 3SCNA 3GXFA 3AMCA 2XVNA 4UQDA 5CPTA 3CHDA 2W92A 3SEPA 1RH9A 2VQTA 4KRTA 5I79A 2VZTA 4TUFA 2YDQA 4CN6A 3T09A 1GHRA 1WE5A 4HPHA 2W66A 1TVPA 1NARA 2YIHA 1C90A 4J3VA 1UZ4A 1I1XA 5EBAA 1GOQA 3LPFA 3VDHA 1CLXA 4N42A 2ZUWA 3G6MA 1JNDA 1JZ5A 2J7BA 2E40A 1KWKA 1JZ4A 4GKLA 1FH9A 1QNSA 1JDCA 1TFVA 2VR5A 3LPOA 2HISA 2DEPA 1FHLA 4D6JA 2ZX8A 5A8MA 2ZICA 4C7GA 4UFHA 2HVMA 2EJ1A 3FW6A 4ZXOA 1W1YA 4KH2A 1W3LA 1OM0A 1EHAA 1QW8A 2W4XA 4MDPA 1VF8A 2D22A 3T2PA 4W87A 4U2YA 2WC3A 4B3KA 2PWDA 4Q7NA 4JFUA 2J79A 5I6SA 3AYRA 5DMYA 3QOMA 4MNJA 1WKYA 2VX7A 4J3WA 4J3TA 2GJXA 1M03A 1EGZA 5A95A 5CGTA 1DWJM 2FHCA 2XVPA 1BGGA 1CWYA 2WC4A 4P7QA 1B3XA 5A6BA 2PWFA 2Y2WA 3DHPA 1XYFA 1CXLA 4PSRA 3PTKA 4WJXA 2A3HA 4KGLA 4U2ZA 2YL5A 2PI6A 1E3ZA 2X0HA 5D4YA 1KFWA 4BF7A 2CERA 1GOOA 4HA3A 5E70A 5E0FA 1ZJAA 4JHZA 2VRKA 3W26A 3AMGA 3T0BA 4QCEA 1X1NA 2JFEX 4HPGA 4U5KA 3RILA 1M04A 1WDPA 3AI0A 2J7DA 1UH4A 2VCAA 2WMHA 2FH6A 1V0NA 3WMBA 2WMJA 1KXQA 2CHNA 1KCKA 1ISXA 3AMLA 3WQVA 2JEPA 3W24A 4D6CA 4MNLA 4JCMA 4JZ5A 4AD2A 1JI1A 1B3WA 1JDAA 2UY4A 1C93A 3K4DA 3U7VA 1HF6A 1NM9A 1UD4A 2G3NA 1ODUA 1JXJA 4L4OA 4PMDA 3ARXA 3EBVA 2WZHA 5CLTA 1K9TA 1VBRA 5AC4A 2XIBA 4AZ5A 3ZOAA 2X05A 1UWRA 3FNDA 3GH5A 1ISWA 1LF1A 4MPKA 2W62A 2V3DA 4CVUA 1L8NA 1B3YA 2V5DA 3VUPA 5FIPA 1UR4A 2GUYA 4CN4A 3K46A 4JFWA 4DM2A 4J3XA 3WQ4A 2UWFA 5CLWA 3OLIA 3MV11 1UUQA 3WNMA 1B31A 3BMWA 1JYXA 3T2OA 3I3BA 1MFVA 5HPOA 1GOKA 5GNXA 1FFRA 1LL7A 1TA3A 3EMZA 3WDQA 3HMCA 3VIPA 2XG9A 2XFRA 4J28A 2ZUMA 1JZ2A 3IANA 3FAXA 2ZWYA 2CETA 4PTVA 5I2UA 1E1FA 2EPKX 4ZE4A 2WPGA 2GJPA 1M01A 2D20A 4OIFA 3WDHA 3BAKA 3ZJ7A 1DWFM 3OLEA 1CENA 4KWUA 2VNCA 1PZ2A 2E8YA 1CXEA 3VDCA 1WZAA 1DWGM 3ARTA 1HJQA 1V3MA 3CUFA 3RPMA 4AD1A 3ECQA 3IAPA 3PZGA 4BQ3A 2WC7A 3WH6A 1UG6A 3ARYA 3AS1A 4UQBA 3ZM8A 2WVUA 4J27A 2DDXA 2EPOA 1AQ0A 1E6SM 1W9XA 2CNCA 2XGIA 2QLYA 2Z1KA 3CLWA 2OYKA 2Y8KA 4HOWA 2XIIA 1QNOA 4GO9A 1SFSA 2DSUA 2J7FA 1XYZA 3L4ZA 2GDUA 1KWGA 2BHUA 5BXRA 1UA3A 3ZT6A 1MQQA 1OGBA 1I75A 1KR0A 1Z32X 1E4LA 3F5LA 1W9UA 4LYPA 1E0VA 4FF5A 2ZXQA 5BYWA 2DT1A 4W5UA 3A4WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UOK A;  3NSX A;  1TZ7 A;  4HZ6 A;  3PN8 A;  4MDO A;  3TTQ A;  4KGJ A;  3VKK A;  5AC5 A;  2CKS A;  5DFA A;  3VMP A;  2X0Y A;  4EE9 A;  3RIK A;  1V08 A;  3MUY 1;  1E3X A;  3GTN A;  5DT7 A;  1KBK A;  2WMK A;  1C91 A;  2XFY A;  3AHV A;  4TTG A;  4OOU A;  4LYR A;  2WWD A;  3M46 A;  4UOQ A;  1BYA A;  2XPK A;  4P8U A;  1ECE A;  6TAA A;  2WMI B;  1KXV A;  1XSJ A;  3ARV A;  2WLZ A;  5DF0 A;  1VBU A;  3WEN A;  1E6P A;  2EO7 A;  4GZJ A;  2J8F A;  5I3D A;  1JD9 A;  3AS0 A;  1CPU A;  2QPS A;  4B15 A;  3WQ8 A;  1TR1 A;  4TVU A;  3NDY A;  5HOS A;  2EPL X;  3BAX A;  4ACZ B;  4D1J A;  1CDG A;  3WFZ A;  3WL1 A;  4GQR A;  1GVY A;  3W25 A;  1UKS A;  4JKM A;  1OSE A;  1GJW A;  4M82 A;  5BWF A;  4UFI A;  2O9T A;  2FHB A;  4H41 A;  2ZWZ A;  1VFF A;  1JAE A;  3VGH A;  4WKH A;  3TTO A;  3WNN A;  4X9Y A;  3POC A;  1ISV A;  1CEO A;  4WKF A;  5CSU A;  3SUV A;  3DYO A;  1WDR A;  2CHO A;  3FHQ A;  3BAY A;  2DIE A;  5D9P A;  2PBO A;  4JL2 A;  4WLC A;  4RL3 A;  1GZJ A;  1UKT A;  1HKM A;  3WMC A;  2UY2 A;  3GH4 A;  1CTN A;  3PZ9 A;  3WH9 A;  3EDK A;  4NRR A;  1PJ9 A;  1HN1 A;  3WEM A;  1MWO A;  1EO5 A;  4IM4 A;  4HA1 A;  3WF1 A;  1JYV A;  1CGT A;  3E1F 1;  4V28 A;  1HJU A;  3MU7 A;  2D1Z A;  2VC9 A;  3WEL A;  1VAH A;  4UFL A;  4B3L A;  2J47 A;  2O9P A;  3PTM A;  1UYQ A;  4MB1 A;  5A6J A;  4E2O A;  1W9V A;  2DSV A;  3ARR A;  4PTW A;  1BYC A;  2QMK A;  3N11 A;  2GK1 A;  2WMF A;  4IIS A;  1EDQ A;  5ABG A;  1HIZ A;  5DT5 A;  2ZE0 A;  3BXW A;  2WB5 A;  1BLI A;  1UD2 A;  2VZU A;  3NYD A;  3WKZ A;  3PZN A;  2DH2 A;  1JDD A;  3M6D A;  1HJV A;  3SCW A;  4DWS B;  2EBN A;  5GNY A;  1J0K A;  2VZO A;  1OGG A;  3A4A A;  2VVS A;  3L2M A;  2C0H A;  4X0N A;  1XD0 A;  3NIY A;  1JYW A;  4AZ6 A;  1QBB A;  3AZR A;  3ARP A;  1TUX A;  3SCV A;  2J25 A;  4PMX A;  1C8X A;  5A2C A;  3UER A;  1KGW A;  1ITX A;  5CXP A;  1K9E A;  1BTC A;  4UOJ A;  1VJS A;  3J7H A;  1R8L A;  1MXG A;  4M29 A;  3NUK A;  1E0X A;  3CO4 A;  2ZX5 A;  4WKA A;  3FN9 A;  2XGB A;  1AMY A;  3U7B A;  1NP2 A;  3KEH A;  2CIT A;  2DIJ A;  4IPN B;  1Q4N X;  1P6W A;  3PZT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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