4FTMA

Crystal structure of the chk1
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
278
structure length
263
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAKRPRVTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
publication title Crystal Structure of the CHK1
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 263
sequence length 278
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ftmA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ftmA01
2VWYA 4W4WA 3BWJA 4MNEB 3QCSA 4F7JA 4AFEA 2ZOQA 2XKEA 4YTFA 4QYFA 4U8ZA 5AP4A 3PP1A 3U54A 4OTPA 2BRHA 1AGWA 2R3HA 3BGPA 3MB7A 1UV5A 3V5WA 2XIYA 1PMEA 3F5GA 3DXPA 1ZLTA 4AW0A 5CSVA 4DH1A 2PL0A 1YHWA 4PNKA 1OPLA 3VS0A 2OJ9A 3NYXA 2OIQA 3ZEPA 3HRFA 3NUYA 3V5LA 1WBOA 3QZGA 1H07A 5AR8A 4YJSA 5AUWA 4EH8A 3R21A 4RIYB 1OUYA 5FBNC 5EH0A 4KRDA 1IRKA 1A06A 4Z7HA 3P0MA 4OTFA 2OJGA 4IC8A 5CY3A 4RVTA 3EIDA 1XKKA 3PZEA 3A61A 2WFYA 3EFLA 1JLUE 4YJQA 5CU6A 3EN9A 4FV1A 4C34A 4BGHA 4HVHA 2UZEA 5E91A 5AWMA 2ETRA 3NIEA 3UP7A 3IOKA 1JWHA 5DBXA 2W1DA 2CPKE 4XP2A 4ZTLA 1F0QA 3D83A 3TTIA 2YN8A 3CE3A 3R8MA 4KIQA 3R8VA 2WU6A 2Z7LA 2Q0NA 2CSNA 5J7HA 5J1VA 3LAUA 3JY0A 5E8TA 3OT3A 4IAYA 1WBWA 3GC9A 3AC5A 4FZDB 2OF2A 4BDAA 2VRXA 2BALA 4IADA 4XS2A 1H1PA 1OPKA 4O1OA 4PTCA 5J9LA 3QKLA 2WU7A 4QMZA 4K77A 3QKKA 2W1GA 4PPCA 4AA0A 4ZSLA 2JFLA 5JZJA 4WNMA 4BBFA 3QD2B 1M17A 4BCIA 2Z8CA 3DZOA 3A7FA 2R9SA 1JOWB 3TI1A 3ZRKA 1IA9A 2GHLA 2NO3A 4IM0A 3ZDIA 4PNIA 3HMIA 4C4IA 2BIKB 2NP8A 3I0QA 2IG7A 1P4FA 3LXLA 3PSBA 1HCLA 3CQUA 3FI2A 3TTJA 4DEEA 4E5BA 4F0IA 1YHVA 4RWLA 1CDKA 4MD7E 4LOPA 4F1OA 5EKNA 4DT9A 4HJOA 4PL4A 1Q8TA 4ANSA 4CG9A 3NEWA 4YJNA 5K4JA 4ZZNA 4QP7A 3QUEA 4ALWA 3P9JA 3G51A 1WFCA 3HRBA 1GZOA 3Q04A 1UNHA 1UVRA 2WTDA 5CI7A 5DIAA 4ENXA 4LGHA 4JDJA 4L46A 5DR9A 4ASZA 4JRNA 4EC9A 5HD4A 3PJ8A 3VUGA 4YZBA 3KMUA 3RCDA 5JQ8A 3ORXA 2W5AA 1Q41A 3DB6A 4YLKA 4ASXA 2BKKA 1PMUA 5CXZA 4L3JA 3W2RA 4DGOA 3R1NA 3KXZA 2BVAA 4ZJIA 5AM6A 4C33A 4D2TA 2W96B 3F69A 3GC7A 2XM8A 2B53A 1VYWA 1BI7A 4TTHB 4RJ7A 4AZTA 5E8UA 3S1HA 5EG3A 2QR8A 3QYZA 5BUEA 3FPMA 4GL9A 2YM6A 2HELA 4I94A 4ZSEA 3UP2A 1GZNA 2XKDA 3DK7A 3MIYA 4UZDA 3A7JA 2YITA 4DTKA 4ZLOA 1FPUA 2WTIA 5ANOA 5DRBA 4JIAA 2HWOA 4AGWA 3DZQA 4MXXA 1URWA 2QC6A 1HOWA 4KS7A 2BFYA 3I0OA 5AV2A 3F3UA 2WNTA 4F7SA 3QTZA 4UALA 1UWJA 2CN8A 5FBOA 2VTTA 4XEYA 1P14A 3HYHA 2RSVA 2OJFE 2CN5A 3DBQA 5BMSA 5LVOA 4CV9A 3ZC5A 3IS5A 4IWQA 5BVNA 2CJMA 4BCGA 2C5VA 4G3FA 3EQCA 5EYDA 5D1JA 3TNWA 4FSTA 3TV4A 4DFXE 4CFUA 3I7BA 4TYJA 2PVYA 3FLWA 3CP9A 3ALNA 3H9FA 3LFNA 1JAMA 4JR3A 5CF4A 3A8WA 2YCRA 5IMXA 5D11A 2QNJA 4BCHA 3A99A 3RZBA 4XG7A 3BU5A 3R1SA 3QA0A 4YJOA 3SVVA 5ANJA 3BHVA 4IWOA 2ITXA 2PPQA 1PMNA 3R9OA 5KHWA 4R3RA 5LWNA 4V0GB 3VJNA 4FSUA 3D94A 2X8DA 2XKFA 3TDVA 3TKIA 1BI8A 2H8HA 4O84A 3QUDA 1L8TA 5FG8A 2ERKA 1H28A 3F3ZA 1JSVA 5D10A 3W16A 4AP7A 5HU9A 4JBPA 4QMVA 3ZYAA 3GOPA 2FYSA 4FT3A 2C6TA 3TIYA 4OTIA 3QX2A 4YGAA 4IVDA 4C2VA 2X6DA 2O64A 4GEOA 3OHTA 3RALA 3FMNA 3GCVA 2GNJA 3Q9WA 2BRBA 4LQMA 5D7VA 5AUZA 4AG8A 3TV6A 5JGAA 3AGLA 4MEDA 3TM0A 2Y4IB 4G31A 4I23A 4B4LA 3TUCA 2J9MA 2R3NA 3F6XA 3CQEA 3QX4A 4JT3A 2VAGA 4AZWA 3BLRA 3CKWA 1ZY4A 2WQBA 2X7GA 4X3FB 5H8GA 3F2RA 3OXTA 4FV5A 4TW9A 1KOAA 4FIJA 4CZTA 4D2WA 5HG8A 5IUGA 2W1HA 4FR4A 5EFQA 3RTPA 4EZ5A 2XUUA 2WOTA 4QP4A 5AAGA 2ZV2A 3IDBA 4LRMA 2VTNA 5HVJA 5L2TA 2C3JA 2YIXA 3PVGA 3L9MA 4FTCA 4JS8A 4R7HA 5DT3A 4RIXB 2FSTX 5GZAA 1VZOA 2UW4A 3REPA 3HP2A 2W1IA 3PPZA 4O83A 4HVDA 4FTJA 3Q53A 2VN9A 4LI5A 5JFSA 5KKRC 3BU6A 1CSNA 4FYNA 2CKOA 4FZ6A 4FV2A 3FQSA 5K9IA 2W99B 4BHZA 5DYJA 5LMAA 3QRJA 3BYMA 5JQ5A 4IDTA 4O96A 3PWYA 5T6KA 3DY7A 3GQLA 4FEVA 4GJ3A 3C5IA 3WF5A 5ACBC 2CGUA 4E6QA 3NYOA 3KREA 2Z60A 4UYAA 5L2QA 1OGUA 3AMAA 2UZBA 2ZM1A 1E1VA 4EONA 4O7RA 3OCSA 4WIHA 3R6XA 3UOKA 2A19B 4YPSA 1XJDA 2C0OA 3CTJA 4KBAA 4QMXA 5GJFA 3RK7A 1JVPP 4UWBA 2W1CA 3G9NA 1ZOGA 3Q32A 3R02A 3UC4A 4DN5A 5F4NA 4IM2A 2ZDUA 3E7OA 3UVQA 5I9XA 3O8TA 4KNBA 5CZIA 2OICA 1FGIA 5FP6A 4YSMA 2HZNA 4GK4A 4XG4A 5M4CA 2WGJA 3ORMA 2ITQA 2G2IA 4RWKA 5G6VA 2UVXA 2J51A 4MYGA 4NM7A 4Y46A 4BCKA 2H34A 4EOOA 3VBWA 3FSKA 1V0PA 4O0RA 3IQ7A 4JDKA 3H10A 4X2FA 4GIHA 2X7OA 3E3BX 2WELA 1PXPA 3EFKA 3TG1A 2WPAA 3THBA 5JFXA 2ITYA 5AR5A 2J90A 2OJJA 5KCVA 3L9LA 3R9DA 2CGVA 5AP1A 4AZSA 4PF4A 3QTXA 4AZFA 4C4GA 2R3OA 3RI1A 4O0VA 3MJ2A 1APME 3HA6A 4J1RA 3VC4A 3G5DA 3DV3A 4PL3A 1R39A 4NTSA 4Y5QA 4Y95A 1DS5A 3HA8A 5CI6A 4IQ6A 4WNPA 4QMQA 2FGIA 3OBJA 5KHXA 2CKPA 1M7QA 3LJ1A 3R00A 4UWYA 3LLAA 2O65A 4BY9E 3RPSA 3MDYA 4F9AA 4OT6A 3LLTA 4PMTA 4S30A 5KX8A 5FTGA 4BCFA 2W4KA 4FTAA 3AC8A 5E7RA 1KE7A 3QTWA 4XP3A 4PDYA 3CY3A 4ZS4A 1OIYA 1RQQA 3ENHA 4XG9A 1IAJA 1BL6A 4GW8A 2G15A 1QMZA 3AC4A 3MPTA 2IPXA 3VO3A 2J0LA 2OZAA 3KMMA 2QLQA 4BDBA 1KE8A 4U45A 5ETCA 2YDKA 5JRQA 3NUXA 3KGAA 1Q24A 4O0SA 4NJ3A 3SD0A 3R7IA 3FZSA 1UU9A 1ZAOA 3R7OA 2HXLA 3ZOSA 4OAUC 3W8QA 4C4JA 5FGKA 3VF9A 1NVRA 1NXKA 3E92A 2VX0A 3H9OA 3KULA 5CEIA 3S95A 4V01A 2WMBA 2F57A 4CCUA 4RLKA 5LMBA 4NTTA 1M7NA 5HX8A 4IX6A 3HEGA 3LMGA 5DG5A 2JKMA 5HGIA 3FZTA 2BZJA 3IG7A 3QQUA 4NEUA 4FMQA 3UOLA 4BWPA 2IO6A 4RG0A 3MY0A 3RP9A 3KMWA 2CNUA 4J8NA 5CX9A 3DLZA 3S4QA 4AS0A 4FTIA 4IVAA 2O5KA 2WQMA 3FI3A 3QWKA 4FSWA 4MXZA 3VS2A 5AV3A 4EK8A 2A4LA 2C5OA 4FV4A 1PYXA 5KBRA 4Q2AA 4R1YA 4XCUA 4IH8A 3R28A 3SHEA 2XEZA 2XYNA 3FKNA 3H30A 5CALA 3ZO4A 3RPOA 2ZB1A 3KVWA 3ZLWA 1IASA 4F6SA 4BIEA 4CFNA 4KA3A 2DUVA 1S9JA 3LXNA 4EQCA 5DHJA 3RBWA 3OEFX 3QAME 4LL5A 3QHRA 1YWRA 4LGDA 5EOBA 5C03A 5CAOA 4CLJA 4JOAA 1YI3A 2X4FA 3EOCA 3GU7A 4HYUA 2JDOA 4DYMA 3C4ZA 4OTHA 5A4CA 3Q9ZA 4IVCA 4DEBA 1Q8UA 1G8AA 3DA6A 5CU4A 4NZWB 4YNOA 3GCUA 3LM5A 3DTCA 4G17A 3QLGA 4OTRA 4Y83A 2F7ZE 5F95A 5EYCA 1OL1A 2DYLA 4EHGA 3U6JA 2UW6A 3UMXA 4E20A 4X21A 3PLSA 3UOHA 1BUHA 2YDIA 4FT9A 4IVBA 2VU3A 3FDNA 3BYVA 3PUPA 4K18A 4EBWA 3QZIA 4BB4A 1K3AA 5I9WA 3PY3A 1XHAA 1W0XC 1RDQE 2QU6A 3F61A 2QONA 3OEZA 5IZFA 4GMYA 4MXYA 4M13A 5JGDA 3LIJA 5TOZA 4GS6A 5M07A 2PVJA 4RC2A 1JSUA 4TKSA 3PDTA 5AA9A 5JRSA 3OXZA 3R1YA 4D9TA 3HMMA 3D2IA 4FG9A 3RM6A 3MFSA 4AT5A 4O2ZA 2R64A 3LQ8A 1KOBA 3N9XA 2C4GA 5GJGA 4FKIA 3FXZA 1CTPE 3COMA 4FKOA 2VX3A 5I3OA 3VN9A 3T3VA 4J7BA 1GAGA 2ITPA 1JKSA 3D7ZA 2X1NA 1ERKA 3WZEA 5AUUA 3LZBA 3ZLYA 2VTJA 4O0YA 4PRJA 4P2KA 4BIBA 4RFZA 5H8EA 3QTUA 4ZZMA 3ATTA 2XM9A 1YDRE 5L8LA 4FTLA 3DJ5A 3W55A 2XK6A 4FOCA 2W9FB 4XLVA 3BE9A 5GIPE 4XJ0A 2W1FA 1OB3A 4H1JA 1ZMWA 5HE3A 3FMDA 4MWHA 4F9YA 1URCA 3UPXA 4DAWA 4JDHA 3EKNA 1R1WA 4MK0A 4D0WA 3F5PA 1F5QA 3DDQA 4XX9A 3TEIA 3NUAA 5EM7A 2OBJA 2XB7A 4O27B 3IECA 3II5A 2HW6A 3QQKA 3MVHA 5EHOA 3GVUA 4AGCA 1WBNA 2IVUA 5TKDA 3HV7A 3O17A 4BKYA 3RPVA 4QTCA 5L2WA 1GIJA 4WNKA 2XP2A 2ZDTA 4QP6A 5HIBA 4RSSA 2YIWA 3JR1A 2HY81 4DHFA 5A46A 3DJ6A 4PMPA 4EKKA 3ZO3A 3HMOA 5HVKA 3D5WA 1MUOA 1ZARA 3V6SA 2PZIA 4EK6A 3PG1A 3OD6X 4R7IA 3LFFA 2HY0A 3QZHA 1JSTA 3FMLA 5J9ZA 3IW4A 3UQGA 3ITZA 2QLUA 4FKUA 4FC0A 3FL5A 5C9CA 3G15A 4AUAA 2JEDA 3FLZA 3ODZX 5ETAA 2CLQA 3I4BA 3D5VA 2I40A 4L67A 5E8VA 3CIKA 3R8PA 3C4WA 1I09A 4PY1A 4YZNA 2YJRA 4AW1A 2XK7A 3MPAA 2IWIA 1PJKA 3E87A 3O2MA 5ANIA 5KZIA 4F64A 5HTBA 4Q5EA 4BVUA 3BBWA 1P2AA 2GNIA 1LR4A 3DOGA 3KXGA 4G6OA 4FA2A 2E2BA 3OROA 4ID7A 4ZSGA 3PSCA 3NW6A 1WBPA 4FNZA 4BRXA 5ITAA 3UIXA 2VTSA 3CJFA 3BEAA 5GZ8A 4IBMA 4YMJA 3TJDA 4QNYA 4DLJA 2OH4A 2CMWA 4DBNA 5FXQA 3R9RA 4DA5A 1Q8WA 4NSTA 4YJRA 5FEEA 2R3JA 4GYGA 3UO5A 4EJ7A 4FSNA 3D7TB 3G0FA 4MBLA 4M14A 1IEPA 3FV8A 3OUNB 4ZTNA 4YHFA 3NLBA 5FLFA 3RVGA 2HW7A 4IWPA 5HIEA 2P3GX 2YIYA 4BDDA 4DGMA 4E4XA 5TO8A 2B0QA 3T8OA 1GY3A 3OT8A 4BFMA 4OTQA 3DCVA 4BBEA 4CFWA 3W8LA 2VTHA 2CGWA 4L7SA 5ANEA 2PYWA 2XEYA 4U3ZA 2JKKA 3I81A 3WI6A 2F2UA 4O0XA 4M69B 4I3ZA 1DI9A 4XH6A 4DEHA 5IQBA 3ELJA 3TN8A 2OZAB 5LVNA 3LKMA 4FE2A 2IZSA 3QTSA 4G2FA 4A9YA 4FKJA 3UNKA 1H0VA 4K6ZA 3OTVA 5LWMA 3MESA 4ERWA 4HZSA 3GEQA 3EKKA 2X9EA 3V5TA 4LM5A 2F2CB 4KIPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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