4FTTA

Crystal structure of the chk1
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
278
structure length
266
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAKRPRVTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
publication title Crystal Structure of the CHK1
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 266
sequence length 278
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fttA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fttA01
3IW5A 4GVAA 2HZ4A 4HYSA 4U79A 2WQBA 2W96B 3PE2A 2GFCA 3OZ6A 5IA5A 3EMGA 4B7TA 3W8LA 2X6DA 4ENYA 2XM9A 4OTPA 3RCJA 3QHRA 2Q83A 2FGIA 3QYWA 3R7IA 4EEVA 4ITJA 3NVMB 1OI9A 1IASA 4M84A 5KMIA 4GFGA 4G16A 3IW7A 5LJJA 4GK2A 3PJ2A 3QL8A 3KCFA 2UZTA 4C36A 1UU3A 4AW5A 4IAIA 4BZDA 3F2AA 3QALE 5FXQA 3AT2A 3NYXA 4QTAA 1JPAA 5I3OA 3ZCLA 2WTDA 4QMZA 4YMJA 2F7EE 4PPCA 3R71A 3ORNA 3C4CA 5CF8A 1V1KA 2PL0A 3QCSA 4GK3A 4DTAA 2I0EA 3QZGA 4MH7A 5IU2A 4KS8A 4PDPA 3DK7A 2ETKA 1OB3A 4TWPA 4E93A 2DS1A 5HO7A 4ZXTA 4QQ5A 3L8XA 3FL5A 4L8MA 4FG7A 5CS6A 4ZY4A 2JKQA 5ANEA 4DFYA 4PNIA 2UZLA 3FC2A 4TW9A 4EOSA 4FIJA 1WBOA 3LFBA 1PKGA 3MH0A 4IB3A 3S1HA 5HU3A 2GQSA 1XH4A 3BLRA 1YXVA 3UZPA 3QRTA 1TKIA 2W06A 3WF6A 4BDJA 4DEHA 4F6UA 1Y8YA 5IEVA 4L7FA 3TDWA 4D4VA 3UQCA 1OPLA 4AZTA 1H1WA 4S32A 4TWOA 3QTIA 4JR3A 2XM8A 5FP5A 5K0KA 2XKEA 4BTJA 5C8KA 4I5PA 3AGMA 2R3RA 2XCHA 2YZAA 4RJ8A 2R3IA 3Q53A 3PE1A 4M68A 3HV5A 4M7IA 2VTAA 3W2CA 3POOA 3TNIA 4F70A 4YHFA 1WBTA 4IACA 3FLNC 1ZYLA 3ZRMA 1OGUA 4OTRA 4ZEGA 3Q4TA 4E5AX 4MQ2A 3D0EA 2QI8A 3MTLA 2B54A 3OVVA 3KQ7A 3EQCA 3HAVA 4EL9A 4LOOA 3GU5A 4RIOA 3UIMA 5IH6A 5J5SA 5LVPA 2G9XA 5IQBA 2Z60A 2JDRA 5ETAA 3VQUA 4XG2A 5B7VA 4RIWA 3NW7A 4BDBA 5A46A 5LMKC 3TEIA 4IAFA 4KSQA 2J6MA 2VTPA 3KK9A 4DBXA 4A9TA 1KV1A 1XH7A 2VWYA 2ZV2A 3V5QA 2CN8A 1Y6BA 2HENA 2RL5A 1OUKA 2XK8A 3B8QA 3BE2A 1YW2A 3EYGA 3I60A 3NYVA 4IAZA 4RG0A 4U81A 5K5XA 3IW8A 4I6FA 1QCFA 3V8TA 3IW4A 2G1TA 3LCKA 2SRCA 3RINA 5HTBA 2PYWA 1OUYA 1YVJA 2WTWA 4C02A 2PMLX 4XP2A 5IQAA 4CZYB 2XYUA 3PTGA 3PVGA 3SXRA 2OW3A 4IX3A 3ZXZA 2JBPA 5L4QA 4CG8A 3JXWA 2EB3A 3GOKA 3G9NA 4TY1A 2YIYA 3KULB 2XRWA 2F49A 4EBVA 2P4IA 2Y4IB 5BVDA 4M12A 2IW8A 1NVQA 4DCEA 2PMIA 1U54A 1Q5KA 4AT4A 4BVUA 3PXYA 4ZLYA 5L2SA 3W33A 1OIYA 3E3BX 4LV8A 1BUHA 5AADA 4DT8A 2OJ9A 5BX0A 5M51A 4E8AA 5CEMA 3KMUA 1URWA 2QOKA 3R8ZA 3UC4A 5AP1A 4KWPA 4X6QC 1R78A 1MUOA 2I6LA 3KF4A 5DBXA 3BHYA 4OLIA 5GZAA 1GAGA 2OXXA 4NJ3A 5I5ZA 3ZM4A 2QOOA 4PDOA 3BGZA 4K77A 1JBPE 1KUTA 5F9EA 3EQGA 5KE0A 3RM6A 1WAKA 2P2IA 3LHJA 5ANKA 5GZ9A 4BCFA 1KOBA 4EHZA 2C6EA 3E64A 3WARA 3RMFA 2X9FA 3RTPA 2QVSE 5AR8A 2OXYA 3UG1A 4YLLA 4FIEA 3KY2A 1REKA 3MH3A 5CSXA 2OF4A 3BGQA 1PXIA 3EN6A 4IZ7A 3R30A 4FZFB 4I6HA 3IQ7A 3R9DA 3ZEWA 3LMIA 4UWYA 3BEGA 4IWPA 5IG1A 4P5QA 4KIOA 3DZOA 1G3NA 2RIOA 3EQIA 4QMYA 4ANLA 3ZO4A 4BCJA 3UNJA 4PMPA 4OBQA 5KHXA 3R9OA 3RVGA 2XK6A 3HMIA 4ZMEA 3MDYA 5HNGA 2BDFA 3I5NA 3MBLA 4ZTQA 2R9SA 3FXXA 1ZZLA 2C6MA 1NY3A 2JKKA 3UOHA 4MNFA 3BYSA 3UYSA 2YDIA 2P0CA 2ITUA 3Q3BA 4O6EA 4RFMA 2IG7A 4R5YA 3CKWA 3VS4A 4L3LA 3DA6A 4I22A 1H1SA 4RFYA 2PVRA 3REPA 3NYNA 1B39A 1OKZA 4PUZA 4J71A 2A2AA 5C26A 5IZFA 4S34A 1OBDA 3OXZA 3PJ8A 3WZEA 5M57A 4BZNA 4RJ7A 1Y8GA 3FYKX 4FTIA 1HCKA 3RZBA 3EIDA 2QO9A 2R3MA 4I92A 3TWJA 2JAMA 4FNXA 1JKKA 2YLFA 4FTLA 4PP7A 3GQLA 3PUPA 2F7XE 2W7XA 2WEVA 3BLHA 1P5EA 4YO6A 4ANSA 3DV3A 2OWBA 5CXHA 4YZNA 3ALOA 5HTIA 3SG8A 2QD9A 4HJOA 5E1SA 3UIXA 2A4LA 3DY7A 4XBUA 4YC8A 4YR8A 4D1SA 1A9UA 5DT3A 1G8SA 4LGDA 4TPTA 1QPEA 3KC3A 2OJJA 1XH8A 2PUNA 3PJ3A 2FA2A 5LARA 5L8KA 3TUDA 3KA0A 4DG2E 4G34A 3WZKA 2XK7A 5DR2A 3VAPA 3M11A 4JBQA 5H8EA 1NW1A 3ID6C 5DMZA 4O7YA 1WVWA 3OWLA 5KMKA 2ERKA 4QMVA 3JUHA 4JI9A 4V0GB 5E8TA 5HG9A 4H05A 1S9JA 4DA5A 2JIIA 4PPAA 3BI6A 3KEXA 5HG8A 5I4NA 3L9PA 4CFNA 4IZ5A 4QYFA 4EK4A 4I3ZA 5CQUA 3FLZA 5GHVA 4FL3A 4AZVA 2OIBA 2X4ZA 4O27B 5CTPA 3W8QA 4BCHA 4D2PA 4ZLOA 4JQ7A 4EWHA 3E5AA 4O38A 4BIBA 4BDFA 2ITOA 2G2HA 3GENA 5ETFA 3OW3A 4I21A 3PLAE 5JMSA 4FTRA 4YTIA 3TTJA 2CKQA 3CEKA 5D11A 3ZMMA 3QTRA 4U9AA 3ZM9A 2WMSA 2XJ0A 3MB6A 3UC3A 3FPMA 2OBJA 4NCTA 4BR3A 2O5KA 2B52A 2Z7SA 5L6OA 4EK3A 3SOAA 2NRUA 3IOPA 5JN2A 4XV2A 2JDOA 3FZSA 2O63A 3DKFA 5CI6A 1I44A 3ZONA 5CNOA 3F7WA 1ZY4A 4O7WA 4BDIA 5DEYA 3PXZA 3MFTA 5EM6A 5HGIA 2KULA 3RAHA 4V05A 4E6CA 3DB8A 5A4CA 1MQ4A 2W0JA 2C3KA 1R0EA 1ZYSA 2CKEA 2J0LA 4D9TA 2F57A 2RFDA 3MPTA 2WIHA 4FT7A 5M4UA 2IPXA 3EHAA 4IMYA 4IHPA 3HZTA 5AR2A 3G90X 4HGEA 4RQVA 3FLSA 3H9FA 3EFKA 2C30A 1JKLA 2LGCA 2C0IA 4O0VA 3ZLWA 3V6RA 5AUZA 5JFVA 4J1RA 4N6ZA 1Z57A 4BCMA 4G9CA 5J7BA 2V55A 3QQKA 4L43A 5CZHA 1F5QA 2GPHA 4NK9A 4MHAA 2OXDA 2VWIA 2R5TA 1SNUA 1W7HA 1SMHA 2QLUA 2WQOA 3I79A 3BWFA 3T9IA 1P4OA 4C4EA 4RPVA 1LEZA 3GU6A 2YEXA 3QKLA 4K0YA 4ZOGA 5HHWA 3VVHA 4FZ6A 4ACMA 5JZJA 3KRLA 4YJVA 5CYIA 4F1OA 2GQRA 3PZHA 4WIHA 5HCYA 4O7ZA 2R7BA 2QG7A 4NT4A 3NDMA 4EJ7A 3ZS5A 2BZKB 2GHMA 3Q2JA 4EK8A 3MESA 4D1ZA 2X8EA 3D4QA 3OT3A 3BYUA 3DK6A 3R7GA 4ZJVA 4KBKA 3EL8A 4MF0A 3NVKI 4NUSA 1AQ1A 4BHZA 3MY1A 3H10A 5IQIA 2V22A 5EOBA 4IIRA 4OUCA 4C4FA 1REJA 4DYMA 3H0YA 3JY9A 4FSUA 4NJDA 2QURA 2W1FA 4IM2A 4ZZOA 3KCKA 4M97A 3I5ZA 4Z7GA 4YZCA 1U59A 4RC3A 1OZ1A 5JKGA 4QRCA 3U87A 5LVNA 3DDQA 4FIHA 3RWPA 3WOWA 4RX9A 1GY3A 3HDNA 2PY3A 3W18A 2ZV7A 3ZSGA 1YRPA 3W2SA 3ZRKA 4ZP5A 1J7LA 5LMAA 5IUGA 3R6XA 2V62A 2YFXA 3QWKA 3HECA 2HW6A 3U4WA 4R3PA 2VWWA 3TZ8A 4USFA 4ANNA 2JD5A 3ZUUA 4DFXE 4MCVA 5EFQA 2YWPA 2YERA 3DPKA 1SVEA 2PE0A 4FV2A 4KKHA 2OZAA 2XMYA 5CEQA 3VBYA 3EFJA 3QD4A 3MVJA 3Q5ZA 4CFUA 4MVFA 3FMNA 4QTDA 3SG9A 5HO6A 4L9IA 4D4RA 2XK3A 2XNEA 4I1ZA 4TWNA 2JGZA 4WRSA 3LCDA 3PYYA 4XOZA 5HX6A 2HAKA 1LR4A 4FSNA 3F5GA 2XKCA 4QMMA 2ZM3A 3NIZA 3OWPA 4D2WA 1RJBA 2HWOA 4OBPA 4WD5A 3SC1A 2EB2A 3BQRA 4OTQA 2QNJA 2WD1A 3FMMA 3ZH8A 4A4LA 4AQCA 3PSDA 3G5DA 2EXMA 3EN9A 4QP1A 3HV7A 3PA5A 5E91A 4BBMA 5L3AA 2YM6A 3LJ0A 3COMA 4R5SA 4F7SA 4IBMA 2BRBA 5E8XA 1NT2A 3ORKA 2A19B 4I20A 4AGUA 1ZYCA 2QOLA 4OTDA 3MPMA 3WI6A 4JAIA 4QYYA 4JT3A 3LMHA 4M13A 5AIKA 4W9XA 3UVRA 4ERWA 2HELA 5KX8A 1UNGA 4HVDA 4E6QA 3PJCA 5TKDA 2C3IB 3E88A 2B4SB 4ZZMA 4L01A 4ZSLA 4BL1A 4X7QA 3HP2A 5HE2A 3WYYA 4M69B 3LFAA 4M15A 4PTGA 5FDPA 4FF8A 5JFXA 4O81A 2XIYA 3LVPA 2VO7A 1M2RA 3FKLA 4CMTA 2HOGA 4XS2A 1UKHA 1BKXA 3FC1X 5KBQA 4R7BA 4JJRA 3OOMA 4JRVA 1PW2A 3DJ7A 3U6IA 5KMOA 5AUUA 2BZIB 3Q6UA 3RAKA 2WZJA 5CALA 3SXSA 3HUBA 4YHTA 4E5WA 4C62A 2YACA 1OKVA 4GV1A 3NGAA 5E1EA 1STCE 4BB4A 3SW7A 5LMKA 3RPSA 4BY9E 5A3XA 2QC6A 3F3ZA 2YM8A 3Q04A 3M42A 1H0WA 3ELJA 2VX1A 3GP0A 3KN6A 1H0VA 3PPZA 3QD0A 4O1PA 4TWCA 5B2KA 5AP3A 3EQHA 4CKJA 4WBOA 4AA0A 4OT5A 4MD8E 4CNHA 1LEWA 2XS0A 4D4YA 5LQFA 4IH8A 5HOAA 3R9RA 3FMJA 3G0FA 4LM5A 4IVBA 1WMKA 5JEBA 4XOYA 2UW3A 3LW0A 3C5IA 4KSPA 4BBFA 4L00A 4Z7HA 2BFXA 2FUMA 3QZIA 2QLQA 1M17A 3TT0A 2WPAA 4BCIA 2XK4A 4MQ1A 4JNWA 3R7EA 4YBJA 2XCKA 5A54A 2YJRA 4FTQA 5IQDA 4LGHA 2RG5A 2Y4IC 1BI8A 2YLEA 4NM5A 5DGZA 4R78A 4H3PA 4TYEA 2P3GX 4LOPA 3RK9A 5CF4A 1ZOHA 3MN3A 2IVSA 5EW9A 4MTAA 2HW7A 3RHXA 3FI4A 5GJFA 4CCUA 3CTHA 4TNBA 5J87A 3P08A 4QYEA 5LMBA 4YP8A 1R1WA 4U40A 2OIQA 2W1EA 1L3RE 3K54A 5EKOA 3SLSA 3SRVB 5CU6A 4CTBA 4ZTMA 2R3QA 5FBOA 2XUUA 5HI2A 5JQ8A 2R7IA 2QOIA 4BDCA 5CXZA 3OS3A 5ANJA 4IC8A 2HY0A 3ORIA 3ZHPC 3DBQA 3P1AA 3R02A 4JS8A 5CVFA 5AAGA 2Q0BA 2KTYA 3WYXA 2BDJA 2Y9QA 3TV6A 4FV4A 3ZXTA 3L9MA 1Q41A 3LAUA 4RIXA 2QG5A 3LZBA 4FG8A 4L44A 2JLDA 4E4LA 5AFVA 4FTUA 5J8IA 4IWDA 2HCKA 4U42A 5F20A 3JS2A 3PSBA 4FSRA 4NW5A 1Q61A 2YM4A 3AC8A 4FUXA 4UMRA 3DZQA 4ARKA 4ORKA 3H30A 4Q5EA 4OAUC 4ASEA 1S9IA 5CAVA 2I0HA 3MYGA 2ZMDA 4X2FA 5IQCA 1DM2A 3N9XA 4NTTA 3VUHA 5A4LA 2ITQA 4FTAA 2XBAA 2UW6A 2ACXA 1J1CA 2OLCA 2XNOA 1FMOE 2VX0A 3FHRA 5AX3A 3DCVA 4BWXA 4CRSA 3ET7A 4EHVA 5FQDC 3CSVA 4DE4A 4U6RA 3PY1A 3KKVA 3B2WA 4NM7A 3CP9A 3DFCB 3ORXA 3PA3A 4EOMA 4QQCA 4E4MA 1L8TA 3RWQA 1W98A 5L8LA 3GCSA 3PXRA 4F0GA 3CS9A 5KNJA 3P5KA 4CGAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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