4FX7A

Structure of sym2 d9v+d55v+d130v+d176v
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
240
structure length
240
Chain Sequence
QRVVVAIVAKRVDGEFMVFTHSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEILLTSIDRVGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIASGGAGKMEHFLEAFLAGADKVSINTAAVENPSLITQIAQTFGSQAVVVAIVAKRVDGEFMVFTHSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEILLTSIDRVGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIASGGAGKMEHFLEAFLAGADKVSINTAAVENPSLITQIAQTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords Imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF
publication title Structure of Sym2 D9V+D55V+D130V+D176V
rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 84
structure length 240
sequence length 240
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.3.2.10: Imidazole glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2012-07-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4fx7A00
3LRKA 4UTLA 1UASA 3VKJA 1QFEA 1H62A 3DHDA 4Y6GA 3NA8A 3IIVA 1VQTA 1TIMA 2NX1A 3CWOX 4YCPA 3NQ7A 3W84A 3W75A 3ATZA 3MP5A 5LNWA 3W1NA 1BEUA 1SW0A 1LBMA 3L2IA 3CWNA 4HSNA 2WNNA 4QIUA 2WNQA 4HT3A 4M6PA 1P0NA 3NQVA 2HS8A 2CWNA 2FTPA 1OJXA 4K8EA 2QCCA 5F2LA 4O1CA 4UCGA 1VHCA 2R94A 2Y7DA 4JTTA 5G4WA 1XBYA 1H7NA 3LCXA 3LX9A 2RHGA 4LVFA 2G96A 4AAJA 1VC4A 2C14A 4C1KA 3NVTA 1QPRA 3M47A 1RPXA 2VEMA 5FF2A 4LVGA 4UFIA 5EMUA 4O1DA 4QQ3A 1TV5A 4FNPA 1HG3A 4NJHA 1K7EA 2YFOA 3GR8A 2B7OA 1S5VA 2BSLA 3CB8A 2A6LA 5EA9A 1QCWA 1Z48A 1OYAA 1G6CA 1P5BA 3PB0A 3GKAA 2RDUA 4JGDA 3QM3A 3U6WA 1FUYA 3GXPA 2X1UA 1G4TA 1KM6A 2GUUA 4Z1BA 1JR1A 3HG5A 3DKJA 4DEFA 3M5XA 1JUKA 2WJZA 4AWUA 3RLUA 2QUTA 2ZZ7A 4ORMA 2JKAA 2DJLA 3VCRA 3KX6A 1L2UA 4K36A 1D3HA 4TO8A 4FNUA 1FCQA 1Q45A 4JTJA 3K30A 2V8ZA 3PG8A 3G0UA 3UPBA 3UZJA 4KFPA 4UFLA 3NNTA 3UYCA 3N9SA 4YMZA 4Z1CA 3W7NA 1ME9A 1I2RA 4Y9AA 1FCBA 5EL1A 4TX9A 2GOUA 4I7VA 1LORA 1WV2A 3O06A 4PEKA 2A4AA 4XTDA 4KKXA 4MYXA 3E96A 5D33A 2CZDA 1OX6A 3E02A 1H7PA 1FX6A 1L6SA 2X2GA 1TREA 3W07A 5DXXA 5HR7A 3DU0A 3SSJA 3NPWA 1JUBA 1W56A 1OFQA 1MEHA 3W22A 3EX1A 3E49A 4MY1A 3LI0A 1Q6RA 4FIQA 3NQCA 4ZVJA 3QSTA 3MHFA 3STGA 3FEMA 4IJBA 3UWQA 5DCBA 2CLLA 4JDYA 1RR2A 2JGYA 3F03K 2V2CA 3O6YX 2X16A 5F1VA 1H7XA 2BZNA 4IMGA 2ATMA 2QUVA 4FNRA 1TB3A 1PIIA 1J4EA 2V30A 3STFA 3GAYA 2PRLA 1GTEA 3TSDA 3DKLA 1DVJA 3RK8A 1T8XA 4AF0B 1MEWA 1FBAA 1FWSA 3EX3A 1B4KA 3HOJA 4AWSA 2GQ8A 1YDNA 1TPVA 1W1ZA 3JR2A 1LOQA 3BW4A 4TMBA 2Y7GA 3JRKA 2QCDA 2DZPA 2VXNA 1VJIA 3LV6A 5I3HA 4O17A 3B05A 1HO1A 3DZ1A 3NQ2A 3LXAA 4Y8FA 4ZQPA 3LM7A 4YWIA 2CLFA 6TIMA 3NAVA 3GZ3A 4IX2A 3S5ZA 1EA0A 1TQJA 5H91A 2H3BA 1EPXA 1WA3A 2HSAA 2X1SA 5EBUA 3LHTA 3QC3A 4Y96A 4KFOA 4NUWA 4L4MA 3ATYA 5KTLA 4PL1A 5F4WA 1WAUA 5AC7A 1G69A 4GC4A 2GQAA 4BFAA 1SFJA 3NQGA 4ZZ9A 1XXXA 3HG4A 4ZQRA 3P61A 3GXNA 4WOQA 3T4CA 1OFOA 1DOSA 3MUXA 4O13A 1HL2A 1RQBA 3NL3A 4MY8A 1DHPA 3TSBA 1LRTA 5LHFA 1DQWA 3S1XA 3LERA 2RDTA 4UNKA 4YCOA 3IGUA 1M7PA 4IMEA 1ZNNA 1T96A 2CZEA 3W1AA 1OFBA 4O4WA 1SSGA 3W1XA 4WY0A 2FPTA 1KV8A 1OVDA 4Z0SA 5SWUA 2YX0A 3IVUA 1ZJIA 2JKPA 4B5NA 3EX6A 4UFKA 5BRBA 1CW2A 4ORIA 5D2XA 1LP6A 1WDWA 2C19A 1F74A 4DQWA 5L9FA 4LS2A 4ICNA 2PCQA 1H1YA 1IXOA 5CPOA 4H3DA 3R89A 1Q6LA 3PVFA 1ICSA 3W71A 3UY8A 1IXNA 2CU0A 5AC8A 5AB3A 5KSWA 1QDSA 5BNKA 2VEPA 1OYCA 5DELA 3MI2A 3NL2A 4A22A 1R2RA 3I7SA 1X1OA 1H60A 2Z2UA 4P2VA 2Y89A 3T55A 2EPHA 1Y0EA 2QCGA 2Y70A 5EYWA 3N2XA 3L5AA 4KFNA 1O5KA 3PBYA 3EWWA 4O16A 1WYIA 4Q32A 4QISA 2Y7FA 4N2YA 5K4XA 3NQ8A 2DP3A 3C2VA 4BI6A 1EX5A 2B0MA 1EP2A 3TMQA 4I7UA 4X2RA 5AOUA 1EP3A 1YTKA 2C0AA 3QMTA 3TROA 2EKCA 3W7DA 4NNAA 5F1UA 4JIQA 5G2HA 3R8RA 2VELA 1PV8A 3S8HA 4JTGA 5CGQA 3KAOA 3L67A 1G4PA 3O63A 3G8EA 1VCFA 2QAFA 1OFEA 4LU0A 1NAL1 2G95A 1WBJA 3P8IA 3NQMA 5F4SA 3QJAA 3LHYA 3TXVA 4CCCA 2F7FA 3NXFA 1ICPA 3W6YA 5LZLA 4ZQOA 3VI2A 1XBXA 3WJWA 2HS6A 3LRLA 1TCDA 4NX5A 1UBSA 1OX5A 3BW2A 3W7QA 2DORA 2CZFA 5D37A 2B4GA 4LVDA 2Y61A 1AK5A 4MFEA 3W72A 4MYAA 4UMBA 3C2FA 3TC7A 3P81A 3BVJA 1KM3A 1SZGA 1OK4A 2DZXA 1H61A 4UUIA 3F4WA 5CKSA 3UWZA 3FOKA 3RF9A 3QZEA 1R47A 1AW5A 5AHFA 3S42A 2H90A 2NWRA 2RH9A 3N19B 4TR9A 3U8GA 2ZZ6A 1B4EA 1W5OA 3LCIA 1GQNA 2E5BA 3MJYA 2NV2A 1YYAA 3O07A 1SO3A 5CPLA 3TAKA 3WK1A 4LV9A 2VFFA 3BPWA 3PM6A 1RQHA 1F7BA 1EUNA 2C13A 4IWWA 1SPQA 3L0GA 4OBTA 2ZDRA 1W54A 3CHVA 3IIZA 4CCEA 4PH6A 4Q4KA 3TJLA 4X3ZA 1FDZA 2ZZ5A 3N14A 2OMAA 2ZRYA 2A5HA 1SW7A 1TMHA 1TJPA 3CIXA 3E12A 5K9XA 3Q2DA 3B4UA 4LRSA 4WX2A 1JRBA 3E0IA 4R34A 1NFBA 4DO5A 3A5VA 3OA3A 2NLIA 2BLEA 2QCEA 3HGRA 4DELA 5MHBA 2HMCA 3PUOA 4FHAA 4ZMGA 3LRMA 4S1FA 1BWLA 2Y85A 4EWND 4WXZA 4OQVA 1ME8A 5FF0A 3L21A 3FJLA 4IPIA 4FIRA 3SECA 2QJIA 3FKRA 3L5MA 5CZ0A 4RCXA 4PA8A 2P10A 3G1XA 1PHQA 2Z6IA 3W83A 2C15A 1LLWA 1K8XA 2E5DA 4LTSA 3TIMA 3SGUA 3RFAA 1QWGA 1TRDA 1KFJA 3EKLA 1R46A 1GVQA 3ABSA 1YADA 4NNCA 4WJEA 3TV8A 1P4CA 3M5ZA 3VFLA 3W1TA 2E09A 4AWTA 3FJ6A 5D04C 3OVQA 3DHFA 2A0NA 2ZRUA 3G18A 3IVTA 1UUMA 5FF3A 3LHUA 3TE9A 1TPFA 3UWVA 3W7MA 1LOSA 3LCHA 5KITA 3PSWA 5HINA 1TPUA 3SIZA 3GDLA 3W3OA 2Q3RA 3IRDA 3SFKA 3EWYA 4XKYB 3EB2A 3HQ1A 3HIJA 4K38A 1TO3A 1YTDA 5FF4A 2OJPA 2ZZ3A 1LYXA 5HWMA 3BW3A 4RR4A 7TIMA 3G0XA 2Y88A 4LV4A 3QFEA 3SJ3A 3P67A 1Z44A 3WJXA 1WOBA 3P84A 4I7WA 1SZEA 3I68A 3UXDA 1GWJA 4S2BA 2NUWA 3LCFA 4LOCA 4UC5A 2VENA 3H55A 2V81A 4A3UA 1R2TA 5LGZA 3I65A 3O16A 1PCWA 1A5AA 2I1OA 5FEZA 3A5FA 2FQIA 5K9DA 5F2IA 1W8SA 5HUOA 5LGXA 1PVNA 4JTUA 1XBZA 3HPXA 1LCOA 1M5WA 2A7RA 1ZAIA 1KFCA 3NQEA 3B0PA 4DBEA 3TQ0A 3FA5A 2R8WA 3RLVA 5K4ZA 3O15A 3UQNA 3BLIA 3MHGA 1GOXA 1TTJA 4JY8A 5DLCA 4C1LA 2H8ZA 3OEXA 1ML1A 4UTKA 3B0VC 1KFBA 4E38A 3W2NA 3LXCA 3DFTA 1KW1A 3TXZA 3TAOA 4O0ZA 3HG3A 3EX2A 5G1TA 4IPJA 3MI3A 1SZFA 4IXHA 1D3GA 1ZFJA 4M7SA 4CNPA 4O19A 2FB2A 4KWVA 1MSSA 4JTHA 2ZZ4A 1PL9A 2QUUA 1FXPA 1OFDA 1G4EA 2G97A 3DENA 3THQA 1KM4A 2NXIA 5AYZA 4RZ4A 2E77A 1VS1A 2CLOA 1QAPA 4DO6A 3FKKA 3LCGA 4MLJA 4MLRA 1GYLA 3I6RA 4PFMA 5KZEA 3P60A 4O4VA 2C18A 2R91A 3FFSA 3F1QA 4RZ6A 1H51A 3NL5A 2PURA 4J9JA 1VYPX 1MEIA 3MI6A 3HGJA 1VYRA 1W5QA 3I7RA 3G1HA 5D2TA 3PWAA 1PS9A 3W7OA 4NNBA 3DGRA 3HB9A 4IXXA 5ABTA 2QCHA 3FIGA 3DBPA 4O54A 1GG1A 1GYNA 3G1YA 3CIWA 4XQ6A 3M43A 1THFD 3GDRA 3MWAA 2NZLA 5D02A 1VCVA 1KFKA 4NQ1A 1GG0A 2BTMA 4NVTA 4HNNA 3W2JA 1OYBA 1KFEA 3CEPA 4LW7A 1C8VA 2VC6A 1XDMA 2ZA3A 3M6YA 3A21A 3G1FA 4IQLA 4XTIA 4UTJA 4P61A 4AB4A 1H7RA 4K7YA 1NSJA 1T99A 3C2OA 5J5DA 4LS0A 3S6DA 3O05A 2NUYA 4BF9A 3S1VA 3RNDA 2BWGA 3F4NA 4JXCA 3S9YA 6ALDA 1FDYA 1VYSX 4HPJA 5A8GA 4I9AA 5LNVA 3EKZA 1EP1A 3DH7A 2W6RA 3GDKA 2WSRA 3IGSA 3MBDA 2YGYA 3PF3A 5AN7A 1JCJA 2VFGA 1TPH1 3M41A 3TH6A 5I3FA 3UWWA 2QCDB 3EWXA 5HQEA 3T44A 3C6CA 1F6PA 4HKPA 4GRSA 3WK0A 2HTMA 3HPZA 4LWWA 1GZGA 2Y62A 2ZYFA 3MYPA 5F4XA 3TK7A 1TYGA 1JJKA 3M16A 4BI7A 3YPIA 4NZJA 3W7EA 3NQ6A 4K7VA 4UXDA 4LS1A 1KTNA 4UFMA 4MOZA 1H63A 1Q3NA 2F84A 4MZ8A 4D2JA 3GKFA 1QPQA 3UZ5A 4NT0A 2TPSA 1ZY9A 3L0KA 3TX9A 4QITA 3W7RA 5IBXA 3LCLA 1ADOA 1N8FA 1PCKA 1SFLA 3AO0A 3W1LA 5KINA 2VKZG 3CEUA 2C1HA 1TTQA 3QEZA 4Q33A 1B3OA 4O15A 3W73A 3H53A 5HNRA 1OABA 2X1RA 1XUUA 3QQ1A 3HGSA 3V75A 3W76A 1FWWA 4E2DA 2ZTJA 1DJQA 2FJKA 2PC4A 1CI1A 3PR2A 3S5OA 3DFQA 1NVMA 4M5PA 3NL6A 1OFPA 3L65A 4O28A 4WY0B 3HG2A 1NF7A 2C16A 3PC0A 2ZRZA 2CLEA 1QR7A 1ICQA 3A9IA 4GBUA 1EUAA 2GJLA 1J2WA 1YXDA 4X9SA 5C54A 1UB3A 3LLDA 4UFHA 4MUZA 1GT8A 3S1UA 3T7VA 3PULA 4K39A 2NUXA 1CX9A 5U7SA 4MZ1A 1Z42A 2J6XA 3TKFA 3CC1A 1FCVA 3KRUA 4LC8A 1ZAHA 5HULA 3MW7A 2UV8G 1VPXA 1K02A 3PSVA 4AF0A 1TRIA 4UTMA 3LHWA 4QM1A 4UTIA 3KHJA 4IMDA 1W0MA 3W70A 2Y7EA 4DBDA 3W85A 4O12A 4JTIA 4MPQA 3GAKA 5KZMA 3FYPA 4JX6A 4ONVA 3THAA 3PG9A 3M5VA 3GVGA 2YW3A 4OWGA 3G1AA 3PUEA 4MFDA 3R2GA 1FWRA 3LXBA 3TW6A 3W1PA 2TSYA 3TJXA 1TJRA 3C2EA 1YDOA 1DJNA 4Z08A 3EWZA 2B7PA 4RV8A 5D2VA 4MIMA 1OX4B 5FEWA 4W9TA 4MY9A 2ATSA 4JIPA 1OFRA 4JX4A 2J24A 2VFHA 1F2JA 2P1FA 1AL8A 2X1TA 3TU9A 4O14A 3L66A 3DI0A 3Q58A 5CZSA 4LUJA 1DKWA 3STEA 3L9CA 1Z41A 2DZWA 2TMDA 1A53A 1EIXA 5GVJA 1XM3A 3NYZA 1ZAJA 3STCA 2ZBTA 1ALDA 3VNDA 3NPVA 4K37A 1D9EA 4OT7A 2B7QA 1GVFA 2AQWA 2QKFA 3LTSA 1KA9F 2E68A 4TU1A 2YYUA 5LSMA 4IX0A 1KM2A 3FS2A 1UUOA 4MJZA 1H1ZA 2JK2A 1RV8A 3W2KA 4NJJA 4UR7A 3KVLA 1AW2A 3KVJA 3NGJA 4AHPA 5EKYA 3CLMA 3IIPA 2H6RA 3LHVA 2YDAA 4O10A 3RU6A 2EAWA 5C55A 1TPEA 3DXIA 3S5YA 2Z1BA 3UY7A 5TIMA 3LTPA 5DBUA 3W7IA 1FY6A 3R12A 1O94A 2DJXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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