4FXRA

Crystal structure of the mutant t159v.r203a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor bmp
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSVRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGASIYLADNPAAAAAGIIESIKDLLNP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Conformational changes in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase: a structure-based explanation for how the 5'-phosphate group activates the enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus str. delta h
total genus 80
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2012-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4fxrA00
3PSWA 4LRTA 1I8JA 1QOQA 4JIQA 5H2ZA 2H8ZA 1SZEA 4CLMA 2WKJA 2H90A 3L0GA 1ONRA 3TFCA 3GXTA 1SUXA 3OG3A 3R2GA 2GQ9A 3EX2A 3GXNA 2PRHA 3P62A 3QZEA 3KRZA 1SZGA 3DI1A 4DEFA 3T40A 5I3GA 3U8GA 2NZLA 4NXSA 4ML9A 5D05A 1KM0A 3HPSA 3GYEA 1XCFA 1FWRA 5C6MA 1YADA 4WY0F 1FUYA 3KX6A 1SO3A 4BR1A 5K4ZA 4JN6A 1MSSA 4DO5A 1IIGA 1S5TA 4L4LA 3HOJA 4KFOA 1D3HA 3FYOA 3A24A 4R53A 3C8FA 5AFDA 3R89A 1I4NA 2A0NA 1SO4A 4JY9A 3E49A 1EP3A 1NF0A 1RV8A 3GDLA 1WBJA 4H6KA 1ICQA 3PSVA 3S42A 1T99A 4BWLA 3LBCA 2ZDRA 3ZR4A 1AK5A 2ZZ7A 1NEYA 4AHOA 3LRMA 1T8XA 3TE9A 5L9FA 2W0UA 3S5ZA 3RNDA 3EWXA 1VQTA 1XBYA 4WJEA 3RK8A 3UWWA 1KM4A 1LRNA 4IMFA 2QF7A 1A53A 2Z2UA 2XN2A 1JUKA 3O07A 4JR5A 5DXYA 1WXJA 3EKLA 4HSNA 4YXGA 1QPRA 1P4CA 1QO2A 3M44A 5F2IA 1KV8A 3ATYA 3RLUA 2ZCGA 1JUBA 2BLEA 3DFOA 2OCZA 5C5YA 1QPOA 3NEVA 3W2JA 3PVFA 2FIQA 5LNUA 2NX3A 3W22A 2NV1A 2CU0A 4QISA 3GR8A 3C6CA 4AF0B 3PR2A 2V81A 5KINA 4NUWA 4AMAA 4JTFA 4UIOA 5LNSA 3OBKA 2VEIA 1DBTA 1OFAA 3LCWA 4AWTA 5F1UA 3LHUA 1EX5A 3PF3A 5FF0A 1KM5A 1L6SA 2A7NA 2CLEA 1FBAA 3TAKA 1S5VA 3DXIA 4ONVA 3HBLA 5KSWA 3V1PA 3KVJA 2RH9A 3W7GA 3W7MA 3QQ0A 4ZVJA 1K7XA 2H6RA 1TMHA 1EA0A 1OYCA 1Q6LA 4K37A 3ELFA 2ZZ5A 3A9IA 3BVJA 3V75A 4WD0A 4MYXA 3W07A 1TYGA 5IBXC 2H3BA 1XXXA 4K8EA 3ANYA 2Y62A 3B4UA 2CWNA 5DBTA 4UFHA 5D09A 1QNVA 3L0NA 3O06A 5K9DA 2YCEA 4LVDA 2ISVA 4FNTA 1AL7A 1LZOA 4PTNA 2TSYA 4EOUA 2WV8A 3JR2A 1QPNA 3SR7A 4E2BA 2JBMA 4UTHA 4I7UA 1PCKA 1R30A 1W8SA 1UJPA 3P61A 3G1AA 3THQA 1SFJA 2A7RA 2YX0A 3LXBA 1TV7A 1QMLA 2A21A 1TQXA 3UWVA 1ZALA 4P61A 3MBDA 4JTTA 2CZEA 4Y9AA 3A23A 3M47A 1DORA 5AYZA 3QW3A 4M6QA 1YPFA 2HMCA 2GQAA 1TTIA 4Z1CA 1O95A 4N9BA 4MFDA 3IVUA 1YLVA 2E6YA 1R2RA 4LVFA 4AXKA 5DELA 2H3DA 3S0CA 4BWLC 4B5NA 3UPWA 3I6RA 3M41A 2RDWA 5E1QA 2EPHA 2OX1A 4MPQA 4QAIA 2DZSA 4HHPA 4FO4A 3C2RA 3A22A 3H55A 1C29A 5CZJA 5EA9A 1TV8A 2BSLA 3G1VA 4PODA 3MP5A 3STGA 1OK6A 1RQHA 3HMJG 4NX5A 4JTHA 2HS6A 3W1TA 1Z41A 1YTEA 1SSGA 3W7NA 1G7VA 1DOSA 3NQCA 1XFBA 1G4TA 4U4MA 3NAVA 5DY2A 4I7WA 4IOTA 4MZYA 4OE7A 5HINA 2BX7A 3P81A 2Y7EA 3FIGA 3GZ3A 1SU5A 3CC1A 1WOBA 3C0JA 3O8AA 3TSDA 2Z6JA 2VENA 3G8RA 5KMYA 5D30A 3UYCA 2E6AA 3HPXA 3P5ZA 1W3TA 1FWSA 2FTPA 4O53A 3T4CA 1F7BA 1XC4A 1HG3A 3TH6A 2ZRUA 4OU1A 1DQXA 2YZRA 4CNPA 3WJSA 1THFD 4CCDA 1H7WA 2GOUA 4G1KA 2PRMA 1ZHAA 5F2MA 2VEKA 3LI1A 4S2BA 2QCGA 5F1VA 1JUEA 5BW6A 3G1XA 2DP3A 3DZ1A 3W1MA 1H7OA 4O50A 2JKPA 4XUGA 3FJ6A 4NJHA 2FPYA 3M5YA 3TJLA 1BTMA 3LHYA 4O28A 3H54A 2WNZA 3WJZA 4IUOA 4FNSA 5HWNA 1TPUA 4OV4A 3W9ZA 2CLOA 1O5KA 1S3HA 4L4MA 5F2LA 2VFFA 3OVPA 5LZLA 3KRSA 4UFKA 3EXTA 3TR2A 4X9SA 4ZQPA 5HUOA 2F84A 4O16A 4UMBA 1OX5A 3BLEA 4DPPA 4EF9A 2Y70A 4NZJA 2E5DA 3C4UA 3GR7A 1OX4B 2V2CA 3IEBA 4JDYA 2BTMA 1IXQA 3CQ0A 4XKYB 1T96A 3NA8A 3P5YA 3GX9A 4HT3A 4IWWA 2X1TA 3NPXA 1YTKA 3DHDA 4O52A 5D2YA 1VRDA 3EWBX 1L6WA 1W3NA 3TAOA 2ZZ2A 3S1UA 4UFMA 2CFFA 1FDJA 3QH2A 4YLWA 5HR6A 1FDYA 3OVRA 3U2OA 1VYPX 3W7JA 4TR9A 4C1KA 3W1AA 2Y85A 3LTPA 4NU7A 1XL9A 4IPIA 4AAJA 2HSAA 2V8ZA 5LGZA 1KFEA 3EX4A 3CM4A 2JGYA 1ADOA 4JD4A 2A7PA 3KFTA 3LCHA 3W2LA 3NYZA 2YW4A 3RMJA 1F76A 3ATZA 5KTLA 3LCLA 4AWSA 4JTJA 3EX6A 2JK2A 2YFOA 3O6DA 4IXHA 1CX9A 4N4QA 4YMZA 2A6NA 4FNUA 1AG1O 1LDCA 2Q3RA 2CW6A 3SY5A 3PM6A 2DORA 1UCWA 4LS1A 3IIXA 1SSDA 1TB3A 3PBWA 2QUTA 4E0CA 4OBTA 5DN1A 4OGZA 4BK9A 3WFAA 3M9YA 4AHQA 3LGEA 1AW1A 4AB4A 2UV8G 7TIMA 5LHEA 4I9AA 2YYUA 4K7YA 4LC8A 5FF3A 4E38A 2GQ8A 3NL5A 3TQVA 3TQKA 3G18A 4GUIA 5A5WA 5FI8A 3RFAA 3IRDA 5K9XA 1CW2A 1IXOA 3LHWA 4ORIA 2E1DA 4GFSA 1PV8A 5CPMA 2E6FA 4GNJA 4TU1A 1X8FA 1VJIA 4H3DA 2X30A 2E6DA 1N55A 2A1YA 4LS2A 5AB3A 1Z42A 3MHUA 4KWVA 4FB7A 1UUMA 1IXNA 1LLWA 1LOQA 4KWWA 1H7PA 3QEZA 1PIIA 1DKWA 1Q6OA 1VZWA 4HPJA 4BI7A 1QR7A 2BXVA 1XDLA 4FIQA 3HQ1A 3TKFA 3R8RA 2QCDA 1RZMA 5LKYA 4JIPA 1X1ZA 1VCVA 4RZ6A 3PBYA 3SW6A 5E93A 2VOMA 4RCXA 3W2KA 1XM3A 1H7RA 3LI0A 3PB0A 4O14A 2A6LA 1VCGA 4LVGA 4RX0A 1TPH1 3OVQA 1B4EA 4MUZA 1G4SA 4O8RA 4PH6A 5HUPA 2VELA 2A85A 2KZHA 1JRCA 2C15A 3PC0A 3E12A 3NQ6A 2V2HA 3W1XA 2GUUA 3NQVA 4UNKA 1AW5A 2VEMA 2ZZ4A 3C2EA 4XTIA 1KM2A 4AHPA 4UTIA 4CCCA 3LXAA 1Q6RA 3N14A 3S1WA 4IQLA 5KITA 3HGSA 4XTDA 1AMKA 3NQEA 1MEHA 1YPIA 1Z48A 2RDTA 4I7VA 1GTEA 3DFQA 1ICPA 1H61A 1SPQA 1YYAA 3W87A 1W3IA 4PA8A 2ZYFA 4FNPA 4MIMA 4JX4A 1FWNA 1M7OA 2J9ZA 5LGXA 1R2TA 3FFSA 5DCDA 4AWUA 3GK0A 5IBXA 2A5HA 3P7YA 4W9TA 4EVZA 1NAL1 1BEUA 1UB3A 1QOPA 4XBSA 2GVJA 5HMSA 5FEPA 2TPSA 1OFRA 2RHGA 1OFBA 4ADSA 4M6PA 3S8HA 4O10A 3C2VA 4K7VA 2C1HA 2QCNA 3M7WA 3VKJA 3MJYA 3PG8A 4GUFA 1ZY9A 4RK8A 5HWJA 4A22A 4YCOA 5BMWA 2QDGA 3E9AA 2TYSA 1HO1A 2X1SA 3G8EA 4MY9A 3P60A 4N2YA 3M5XA 4AF0A 2YFNA 3FJLA 4Q33A 5AHMA 1MXSA 3LOTA 5G2IA 3GLCA 3N2MA 1LRTA 4IMDA 3PB2A 2YXGA 1H7NA 1FWTA 5DCBA 1ALDA 4RXGA 3W7DA 1KFKA 1TCDA 1GYLA 1WX0A 3S5NA 1LLZA 2WSYA 5F4XA 3T78A 2J6XA 2ZRZA 1C9DA 1OX6A 3N2XA 4KFPA 1TTPA 3H53A 4JTSA 5K9CA 3QQ1A 5CKSA 4N4PA 4R7JA 3SZ8A 3T7VA 2LLEA 2EGZA 3IV3A 1EWEA 1VCFA 3BW3A 3F03K 4GXMA 3ABOA 2VXNA 3DKLA 3TC6A 1SW3A 4LUJA 1GVQA 3STFA 1DJQA 3CT7A 5FESA 4O11A 3I65A 4S2CA 5K3VA 1X7FA 4OT7A 3NPWA 3TXVA 3TXZA 3C52A 2YW3A 4RV8A 3IIOA 4NNCA 5L6UA 1LBLA 1G69A 4Z0JA 1KLYA 2OT0A 5C2XA 2ZRXA 2C0AA 2RKXA 2G97A 1XI3A 5CSSA 2W6RA 2CLFA 3JS3A 1B9BA 3W7IA 1ZNNA 3B0PA 4MY8A 1OFOA 1GVFA 1VYRA 3UWQA 3L9CA 3CWNA 4A29A 2ZRYA 4ZQRA 2X1RA 4N6FA 1O94A 1EEPA 1IF2A 1NFBA 3P8JA 1H63A 1TRDA 3WK1A 1HUVA 2CZFA 4Z08A 2V9DA 5FF2A 5CPOA 2C19A 3L21A 4O18A 4DO4A 2CLHA 4JY8A 3W1LA 3LTSA 1DQWA 3A5VA 4DBDA 1U83A 3M16A 3EXRA 2YR1A 1K03A 4K38A 3THAA 4RZ5A 3FOKA 1LBMA 4XZ9A 1R46A 3DFTA 5D03A 3Q2DA 3LTYA 2O7QA 1I2QA 4M5PA 2ABBA 3MMTA 3W83A 4WOZA 3TW6A 2VFGA 2NUXA 4UTKA 1OYAA 1RD5A 3EXSA 1SO6A 1WA3A 2TMDA 5FF4A 4MFEA 3NQFA 2G95A 2R8WA 5CG7A 3GDMA 1KW1A 4QIUA 1GG1A 3DFNA 1EUAA 3UY7A 1GT8A 5DBUA 4AVFA 2ZZ3A 3FLUA 3W76A 1QWGA 3DH7A 3IIVA 3O1NA 1ICSA 2XN0A 1BKSA 4NNAA 2V5LA 3TROA 4UC5A 4WY0B 5C55A 1A5BA 3S1VA 2Y7GA 3BARA 4UTTC 2OT1A 1SFLA 3OA3A 1OHLA 1CI1A 4AH7A 1KFCA 4IXXA 1S5WA 4Q32A 3W73A 4PL1A 1KA9F 3TIMA 2PC4A 4UTWC 3PS7A 3NPUA 3LCFA 3WK0A 3LLDA 1J2WA 3NQ8A 1OFQA 4ZQMA 4Y96A 5AHEA 3B04A 4O1DA 2WPBA 1LBFA 1LM1A 4XWUA 3TUUA 3GKFA 2EF9A 2DZUA 4JTEA 3I7QA 3MI3A 3UZ5A 3QPYA 1V7YA 2PURA 4JYDA 4KFNA 3RU6A 4ADTA 4UXDA 1NF7A 3BGGA 4OWGA 2DU2A 4UTMA 2V0TA 2QJGA 3HO8A 4Q4KA 3F4WA 2DZPA 1EPXA 2A4AA 3DI0A 1X1OA 4QSHA 3LHTA 3O15A 1D3GA 1ML1A 2ALDA 3UD6A 1JCJA 4LRSA 1XUZA 4K6AA 2YDAA 1SW7A 3MUXA 4LW7A 2NXIA 2VFHA 2H8XA 3W88A 4O1BA 3RLVA 2Y7DA 4IX0A 3W7QA 3W1PA 3TU9A 1XBXA 1HO4A 2DZWA 1W5NA 4X3ZA 1TTQA 3SECA 1LYXA 3G1YA 1V5XA 4GE8A 1IIHA 3NVTA 4K36A 5G4EA 3C2OA 4Z1AA 2ISSA 3LRLA 5HR7A 4M6VA 4O54A 1YTDA 3QJAA 5AYYA 1OX4A 3I7RA 3TA6A 1P1XA 3FS2A 4FHAA 2Z0IA 1KV5A 4JX6A 3LM7A 2CZ5A 4MJMA 3PAJA 1FDZA 4XKYA 5T26A 3BLFA 3QMRA 1G67A 1IGSA 5I3HA 4PC8A 5TBOA 3MWAA 3E96A 5K7JA 3NM3A 1N8FA 4WQ6A 3S5OA 3UWZA 3NO5A 1KLZA 2QCFA 4EIVA 1VH7A 2E09A 1VYSX 1XKYA 1XBVA 5D04C 5D2TA 3USBA 1K8ZA 3BG3A 1FCUA 1LROA 4HNNA 2E77A 3BPWA 2R14A 1VS1A 3M0ZA 4O17A 3TJXA 4NQ1A 3O05A 1GG0A 3WJXA 4A3UA 5AHIA 3GDKA 3FA5A 5G1TA 1MZHA 1D9EA 1LORA 5EL1A 3DKJA 1X6UA 3PUDA 3MP4A 1W1ZA 1LOSA 1XBZA 2QJIA 2ZRWA 2V30A 4LVBA 5HNRA 3STCA 3NOEA 4DO6A 5BNKA 1BWLA 5G2HA 5K4XA 4BI6A 4RR4A 5HQEA 3CEUA 2ISWA 2G96A 4JTIA 3UY8A 3NZRA 3PBUA 4NJGA 3M43A 5CPNA 3IVTA 5CGQA 3Q58A 4UTJA 3SGZA 3HF3A 3NQDA 3AJXA 3BW2A 2E5BA 3FKKA 3K30A 2DZVA 2VC6A 2AAMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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