4FZ6 | Genus

Total Genus 88

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	88
sequence length	277
structure length	266
Chain Sequence	VYLDRKLLTLEDKELGSFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVNEGHH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords	Tyrosine-protein kinase SYK
publication title	Rational design of highly selective spleen tyrosine kinase inhibitors. pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	88
structure length	266
sequence length	277
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2012-07-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07714	Pkinase_Tyr	Protein tyrosine kinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4fz6A02
3.30.200.20	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Phosphorylase Kinase; domain 1	Phosphorylase Kinase; domain 1	4fz6A01

2X0GA 4FV4A 4RC4A 2HZ0A 5TKDA 3LFQA 2UW8A 4FSZA 5EOLA 5E92A 4DGGA 2BDWA 2W4JA 1B39A 1KE6A 4UWYA 2J0KA 2Y0AA 3I5NA 3UQGA 3RPRA 4U0IA 1OL5A 3RVGA 1O6LA 2XKCA 3NCZA 3V5PA 2IPXA 3WF7A 5KKRB 3FY2A 2VTAA 3DDQA 4O7RA 4BDGA 2XCHA 1FMKA 4F9CA 5FD2A 4KA3A 4RVTA 3FLSA 1PXIA 2P4IA 3EKNA 5M09A 1FGKA 3AMAA 5CNNA 1AGWA 1RW8A 3BYMA 5DA3A 4YGAA 3ORTA 5JZNA 4WSYA 2PVNA 5L6WL 4JI9A 4GS6A 2I7QA 3AGMA 1BUHA 3KCKA 4RJ3A 2AC5A 4CYIA 4JG8A 5LOHA 3RP9A 5FXRA 3TTJA 2JAVA 2PZRA 2XIXA 5CEIA 4NUSA 4FIHA 1YDRE 3NNVA 4YPSA 5CSHA 4CKIA 2XF0A 4A06A 4C57A 1ZZLA 3BWJA 4H36A 3QLGA 3MV5A 2QURA 4BCQA 3OVVA 1FVVA 2XM8A 1XR1A 2WTKC 4CD0A 3F88A 2DQ7X 2REIA 4CZYB 4EKLA 5C8KA 2R9SA 3ACJA 4HCUA 2XNEA 3GENA 5AMNA 4ACHA 4RFZA 3OXTA 2QKRA 2OZOA 4MK0A 2J6MA 2X6EA 4I92A 4GKIA 4IB0A 5CEOA 3RNIA 3LFBA 2GQGA 3JUHA 3QUPA 1PXLA 2CLQA 3NUYA 3TXOA 1JAMA 2PTKA 1S9IA 5ANGA 5LMKA 3Q3BA 3ZZEA 4NIFA 3D15A 3R7VA 3KK9A 1OBDA 1I44A 4IWDA 1Y6AA 3VJOA 3OROA 5BYLA 4PDSA 5J95A 4ZSGA 5HHWA 3FDNA 1OBGA 3OCGA 5HEZA 3LM5A 1L8TA 4R5SA 4QMUA 4XRJA 1H27A 5IH6A 2RGPA 4I5PA 5DR6A 5IA3A 1WBSA 1V0PA 5T68A 2R0IA 5E8XA 1UNLA 1LR4A 2XK6A 3FZPA 4JRVA 2R3GA 5E7RA 4MBLA 3JVRA 3MYGA 5IQFA 2QOKA 1XH4A 3UIXA 4QYEA 4AW0A 5A4TA 2IJMA 4FVPA 3EQDA 2QOOA 2VWXA 4O2ZA 5HBHA 5IH4A 4FG8A 5EOBA 5HLWA 3CS9A 3MY1A 3PLAE 1S9JA 3ZXZA 4FK3A 1Q97A 4MXYA 3RZFA 2G2IA 3PPKA 4FKPA 2OIBA 3F3UA 1ZMVA 3E64A 4XHKB 3DKGA 3ATSA 2B54A 4EOLA 1PYXA 2QG5A 4ACCA 4L43A 4CZTA 4F63A 3RINA 3HUCA 3NUXA 4CKRA 4MCVA 4C4IA 4D0XA 1PMVA 2W1EA 3EQPA 3HYHA 5KMKA 4FT3A 4JX3A 1YXUA 4NKSA 5HO8A 5E8TA 3VBXA 4E1ZA 1Y6BA 5EKOA 5HBEA 5M56A 4NT4A 3EFLA 3BV3A 4AQCA 5LWNA 4EQMA 2FSTX 4BFMA 3UG1A 2J4ZA 4AGUA 3IGGA 3N51A 2PWLA 2R3IA 2Q0BA 5CAPA 2XBJA 4AOTA 4OBQA 4IFGA 5IF1A 5IUHA 4YJSA 1QL6A 4O0YA 4YSMA 4CV9A 2E2BA 4ASDA 2PZYA 3TNHA 2VN9A 4G1WA 4BCMA 5M07A 2Z7LA 3QQHA 3KMMA 2WTWA 2UW0A 3R8PA 2WTIA 4EBWA 1ERKA 5HQ0A 5HTCA 3MH3A 5KMIA 4XBUA 2HW6A 5AP4A 3EQCA 3AD5A 3Q53A 4OTDA 4O7ZA 3QRIA 3OUKA 3QUDA 5CZIA 2ITZA 4L42A 4FOBA 4WOVA 4EYJA 3U9CA 3DXPA 4Q2AA 3W2QA 4CSVA 1DI8A 2JLDA 3FJQE 4II5A 3I6WA 2O8YA 1ZARA 4RX9A 3MPMA 2JDRA 4YMJA 4EH6A 3SLSA 3F61A 4FTQA 4L3PA 3ZLXA 3ZRMA 4OLIA 4ALWA 2VUWA 3GC8A 4FEUA 4FZFB 5HIDA 2RL5A 5GZ8A 2ZDTA 3UDBA 4F4PA 4IW0A 4AW2A 3FLQA 4A7CA 2X39A 2FO0A 3KGAA 4J8NA 4ZTLA 3QGYA 3F5PA 5ANJA 2YLEA 2PUPA 2PYWA 4C35A 3Q52A 4L7FA 4EH8A 4DC2A 1YQJA 5I3OA 2NO3A 4R1VA 4PTGA 2WIPA 2GQRA 3MPAA 5I4NA 4YZDA 4O7NA 5FWKK 4ERWA 5JEBA 2BTSA 3NZ0A 2E9PA 4C38A 1PMEA 4EHVA 3FSFA 5KUPA 4JDHA 3BWFA 3D83A 4X3FB 3D5XA 3P86A 1BYGA 4BDJA 4D55A 2ITYA 3PXKA 5DGZA 4ERKA 3R21A 1PKGA 3QUEA 2ITNA 3DK3A 3GNIB 2ZV2A 2YA9A 2H34A 2UVZA 3UYSA 1W98A 4YZMA 3BHYA 4O27B 4I0TA 3GCUA 3VO3A 5EDPA 4R7IA 1U5QA 3L9MA 4X6RA 4GG7A 5BVNA 4CTCA 3FI4A 5L4QA 1QPDA 1P2AA 2UZDA 5CAUA 5L3AA 3PIYA 5FEEA 2C3IB 4RC2A 3S0OA 4FE2A 2NRYA 3DY7A 5CSWA 5M4IA 3PXYA 3QTZA 4R78A 5CSVA 3II5A 2LAVA 4KUJA 4OW8A 3EOCA 3QTXA 1ZRZA 3LXKA 4NWMA 3OHTA 1GZ8A 4MH7A 4Z55A 2GNFA 4I93A 4FKWA 2YCFA 5CQWA 5K5XA 3DBEA 2GNIA 2OXDA 2FGIA 3DNEA 5EYKA 3ORPA 4QYFA 4KINA 3UZRA 3V5JA 3QHWA 3TNWA 4IHPA 3G15A 5JQ5A 4Y85A 4ANBA 5HIEA 4PY1A 5IQCA 2X9EA 1KOBA 1U5RA 3D5VA 2YJSA 4A4XA 3UGCA 4LM5A 4DH3A 4EJNA 4CGAA 2B4SB 3R28A 3MFRA 1FVTA 5L2WA 2YCQA 2P2IA 2XMYA 2CLXA 5DWRA 3TIZA 4QTEA 2BAKA 2OKRA 4Y46A 4F1MA 5CEPA 3SXFA 1YWVA 5EG3A 5LVLA 2CMWA 3QQUA 5HE1A 3SOCA 2XKFA 4XG4A 2WZJA 4P4CA 3F5XA 4GG5A 3VS5A 3P23A 3SD0A 3C7QA 4WBOA 3ZO4A 2P0CA 3EN5A 3LMGA 2QD9A 3CC6A 3QKKA 4XLVA 5C8NA 2B53A 3R8MA 3F5GA 3VC4A 4MXXA 3O7LD 3QD4A 4LL0A 3E7OA 4KKEA 1AD5A 4M7IA 4DEAA 3G0FA 4QP7A 5C1QB 4CMTA 4UMUA 3H30A 1EH4A 2JIVA 3H9OA 3QD2B 4TN6A 4RLKA 4ANOA 5IA0A 4BR3A 5M06A 1YDSE 3H0YA 5IUIA 3TG1A 3IW8A 3BLHA 3G6GA 3IW4A 3COMA 3L8VA 3VUHA 4BYIA 2BUJA 1WZYA 1A9UA 2Z2WA 2ZYBA 4FF8A 4FGBA 5FGKA 2GHMA 2UZNA 1W7HA 3DXNA 3FC2A 3FKNA 3QF9A 4FV3A 4GK2A 4M0ZA 3VVHA 2J51A 4U97A 4QTDA 3PY0A 5I9UA 1J3HA 2F2UA 3OWJA 1M2PA 2YM8A 3A7GA 3QALE 2VTTA 4EK5A 2B1PA 2XRWA 4Y5QA 5B2LA 3TUCA 4C4EA 2ITPA 4LYNA 5DOSA 4K1BA 3LOKA 4WG3A 5DH3A 4WD5A 1JPAA 3R00A 1VZOA 3R22A 4AFEA 2CNVA 2VTPA 3AT4A 4IX3A 3FQSA 3VUKA 5CLPA 3FPMA 4BCIA 4FEXA 2IVVA 4KD1A 3HMIA 1Q99A 4RQVA 3RAKA 4DBXA 4BYJA 3PA5A 4E4MA 5JFSA 3DU8A 4C2WA 4YR8A 2ONLC 5I9WA 4IAAA 3L8SA 5DIAA 3F2NA 3R7GA 5J5TA 3FBVA 2PUNA 3ODZX 4C7TA 4IVCA 1VJYA 2YISA 3UIMA 1MUOA 3DTCA 3EQRA 2F9GA 5F95A 3QC4A 4D4RA 1AQ1A 1BLXA 4OR5A 4QP9A 1ZZ2A 2JIIA 2F49A 3VS2A 2XEZA 3Q9XA 5BPYA 4XCUA 3TJDA 4M69A 4J96A 3AC2A 3ALNA 4AE9A 5BMMA 1BL6A 1V0OA 3P5KA 2XM9A 4FOCA 4LQMA 4F6UA 3D2KA 2WKMA 2UVYA 4G31A 4HYHA 4MBJA 4Q9ZA 3GEQA 1FPUA 1NVQA 4HCTA 4XV9A 2JAMA 3MFSA 5HCXA 4DGOA 4EC8A 2IG7A 4FMQA 2YM5A 5AR3A 4RA5A 4G6LA 4BVUA 3NYXA 2W1FA 4D2PA 2XCKA 4JQ8A 4GIHA 5KKRC 4I41A 4ZTMA 2GHGA 3BHUA 4FL2A 1YXTA 1DAWA 2W4OA 2XB7A 2B7AA 3H4JA 2QOBA 4DN5A 4WHZA 5IDPA 4NZWB 3RWQA 2XBAA 4DFYA 3A7JA 3TTIA 1CMKE 3FLWA 4YO6A 2ZDUA 4HYUA 4I5MA 2YLFA 3CKWA 4QMTA 4CLIA 4EWHA 1OZ1A 1XH9A 2R2PA 4FKQA 3RHXA 4GU6A 2R3OA 2J0MB 3MY0A 4JG6A 4NTTA 4E6AA 5CALA 1SNXA 5DRBA 5HO7A 4QPMA 3K2LA 2PE0A 5CT0A 2YHVA 4E4XA 2ZV8A 3D4QA 3KQ7A 3VUDA 2XK4A 3Q6WA 3CTHA 3OF0A 5AP2A 5A54A 3DPKA 4EOOA 1GZOA 5JT2A 2FSOX 5KE0A 3K3IA 5JMSA 1GIHA 3DAEA 5M57A 4DYMA 3FI3A 4LV5A 2XJ0A 4LGDA 1REJA 3SC1A 3CY2A 4HGSA 4FSWA 4ENXA 1O9UA 1Y57A 1XH7A 3BI6A 4HGTA 3TNPC 4CG9A 2ETKA 3TZ8A 3SW7A 4OTIA 4EH7A 5AM6A 3QFVA 2W05A 3R71A 4FNZA 1IA9A 5TE0A 4P5QA 3HP2A 4GH2A 3BQCA 1OL6A 5GNKA 4BZOA 4F0GA 4AUAA 4B4LA 2CGUA 2ONLA 3LW0A 4QMQA 2GQSA 2DS1A 3PXZA 2UZLA 5IEXA 4W9WA 4HOKA 5AJQA 4DEGA 3BE9A 3U4UA 5HKMA 3IGOA 3GU5A 3KEXA 3O2MA 4P90A 3FLNC 3R9DA 3NSZA 1T46A 4S30A 5CTPA 2PE1A 1PXOA 2WMQA 4FZAB 3E3BX 3BRBA 4FKVA 3UE4A 4QMYA 4R5YA 3R2YA 3EKKA 4AA5A 2I40A 5AAEA 3CY3A 4KBKA 4F9BA 3QZHA 4EJ7A 3E88A 1TQPA 3CQEA 4TY1A 4BTKA 2PUUA 5BQ0A 2EXEA 3NNWA 3OCBA 5GJDA 2C6KA 4FV9A 4IWQA 4BIDA 4PNKA 4IXPA 3CBLA 3KRWA 1MRUA 3MA3A 3NPCA 4YZNA 2W1HA 3WZUA 3CR0A 3G5DA 3QQGA 4W4XA 3TKHA 5LVNA 3QCYA 3D7TB 4ZSEA 2QLUA 3VHEA 2QODA 4IM3A 2WU7A 4N57A 2BIKB 4LL5A 1MP8A 4YLKA 4FUYA 2J0JA 3OT8A 4F65A 2GPHA 4PNIA 2Y6OA 3KRRA 4RIOA 4J52A 5FEDA 2R3JA 1BL7A 2UZOA 3JPVA 5HNIX 4RJ7A 5AX3A 3CQUA 4DTAA 4C59A 2WU6A 3OCTA 4M0YA 4FV6A 3UNJA 5CQUA 3DK7A 2C68A 2CPKE 2F7ZE 2UW3A 4D28A 2ZVAA 2JKOA 3BIZA 4UZDA 1KE8A 3HA8A 3A7IA 4JT3A 1SVEA 2V62A 3PWDA 3W2PA 5IG1A 3UVQA 2XNMA 3EFWA 3FL4A 3IW6A 2HZIA 4LRJA 3V5WA 3I79A 4NJ3A 3HECA 4RBLA 4EONA 2BIYA 4BDBA 1W0XC 1JLUE 2UZBA 3DZOA 3QU0A 5EYCA 3PA4A 2XJ2A 4BTMA 3NS9A 2YABA 1Q3WA 3RM6A 2VO6A 3ZSIA 4AFJA 4PTEA 4WNPA 1NY3A 4BKYA 2HOGA 1FBNA 4MQ2A 2UZVA 2R64A 3BHVA 3GCQA 3QRJA 3TZ7A 5HD4A 4PL5A 3F7WA 1ZY5A 3N4VA 3OBJA 4U5JA 2ZAZA 5HNGA 3RNYA 5KBRA 4G6NA 4ZS4A 4RX8A 3LFSA 3NW5A 5GZAA 3VW6A 4RVKA 4OTRA 1M2RA 2WHBA 3FXWA 4FSQA 4EC9A 5GJGA 4IFCA 3HLLA 5HU9A 4FGRA 4FTOA 5HCZA 4NK9A 3SX9A 3B2WA 4H3QA 1PXNA 2WMWA 4BN1A 4G5JA 3PTGA 2QC6A 2WNTA 4Y73A 3GGFA 3AG9A 3PYYA 3R30A 4YC3A 4B7TA 4GKHA 1OPKA 3E3PA 4XG6A 2ZV9A 3ZRKA 2RF9A 4FZDB 1H07A 4G5PA 3FI2A 5FXQA 3CD8A 3NDMA 3POZA 4WKQA 3G9LX 3O17A 5IZFA 4RIWB 4RVMA 2WQNA 4EBVA 1ZLTA 2PMLX 2Z8CA 3F5UA 3HL7A 3KN5A 5CT7A 5BVEA 4AE6A 2V55A 4IVBA 1KOAA 3NYVA 4KSPA 3UOLA 1V0BA 3NNXA 2R0UA 4OAVB 2W7XA 2VTHA 1H00A 2IW6A 4LV8A 4CQGA 2VV9A 3R63A 2GS6A 4PTCA 5EI2A 2BZHB 2IW9A 4RFYA 1JKKA 3F2RA 1UKIA 3FHIA 3NYOA 4C62A 4C2VA 1IRKA 2G2FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4FZ6A

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