4G7EA

Crystal structure of pigeon pea urease
Total Genus 283
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
283
sequence length
840
structure length
831
Chain Sequence
MKLSPREIEKLGLHNAGYLAQKRLARGLRLNYTEAVALIATQIMEFVRDGDKTVAQLMSIGRELLGRRQVLPAVPKLVESVQVEATFPDGTELVTIHDPIACENGNLELALLGSFLPVPSLDKFTANDEIPGEIIVVGGNLVLNDGRKAVILKVVNNGDRPVQVGSHYHFIELNPYLTFDRRKAYGMRLNIAAGNASRFEPGEMKEVLLVSIGGNKVIRGGNAIADGPVNASNCIAAMQAVITRGFGHVEEANAAEGQTGEDASCPFTTVISREEYANKYGPTTGDKIRLGDTALFAEIEKDFAIYGDECTFGGGKVIRDGMGQSCGHPPALSLDTVITNAVIIDYSGIIKADIGIKDGLIHSIGKSGNPDVMDGVFQNMTTGVNTEVIAGEGLIVTAGAIDCHVHYICPQLVYEAVTSGITTLVGGGTGPTAGTRATTCTPAPIQMKLMLQSTDDLPLNFGFTGKGNCAKPDELHEIIKAGAMGLLHEDWGTTPAAIDSCLTIAEQYDIQVNIHTDTLNESGFVEHTIAAFKGRTIHTYHSEGAGGGHAPDIIKVCGEKNVLPSSTNPTRPLTSNTIDEHVDMLMVHHLDANIAEDVAFSASRIREATIAAEDILHDMGAISIISSDSQAMGRIGEVISRTWQTADKMKSARGPLQANDNFRIKRYVAKYTINPAIANGFSQYVGSVEVGKLADLVMWKPSFFGAKPEMVIKGGEVAYANMGDPNASIPTPEPVKMRPMYGALGKAGGALSIAFVSKAALDQRVKVLYGLNKRVEAVSNVRKLTKLDMKLNDALPAITVDPDSYTVTADGVVLTCFVATTVPLSRNYFIF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords urease
publication title Structural and functional studies on urease from pigeon pea (Cajanus cajan)
pubmed doi rcsb
total genus 283
structure length 831
sequence length 840
ec nomenclature ec 3.5.1.5: Urease.
pdb deposition date 2012-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00449 Urease_alpha Urease alpha-subunit, N-terminal domain
A PF00547 Urease_gamma Urease, gamma subunit
A PF00699 Urease_beta Urease beta subunit
A PF01979 Amidohydro_1 Amidohydrolase family
A PF18473 Urease_linker Urease subunit beta-alpha linker domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.150.10 Mainly Beta Ribbon Urease, subunit B Urease, beta subunit 4g7eA03
2.30.40.10 Mainly Beta Roll Urease, subunit C; domain 1 Urease, subunit C, domain 1 4g7eA02
3.20.20.140 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Metal-dependent hydrolases 4g7eA04
3.30.280.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Urease; subunit A Urease, gamma-like subunit 4g7eA01
4EPKA 2WM1A 1XRTA 4DZIA 2GWNA 5A6TC 1ONWA 3URNA 1NDYA 1EJTC 4TQTA 3KM8A 2EG6A 1M65A 1W1IE 3F4CA 2R1NA 1V51A 3LGDA 4NP7A 3QY6A 4AC7B 2OGJA 1NFGA 2GSEA 1FWDA 2BGNE 5HMDA 1R9XA 2KAUB 3WMLA 2Z7GA 4R85A 1UIOA 3E0FA 2VM8A 4KEZA 4LAKA 1UBPC 4KIRA 1RA5A 1A5KA 3F2DA 4UB9A 4LALA 2I9UA 1UIPA 2HNHA 1A5MB 1RJQA 2EG7A 3IACA 3LSCA 3NURA 4IFKA 3LGGA 4MUPA 4XD6A 2Q09A 4GC3A 2Z00A 4XD4A 4AQLA 1NDWA 4C6JA 1YRRA 4CNTA 3EGJA 4RDWA 4IFRA 3URQA 1V7AA 1EF2B 4GX8A 1FWFA 4GY7A 2QT3A 3TN3A 3ITCA 2OOFA 3HPAA 4V1YA 3DUGA 3RYSA 2HBXA 4C6NA 1EJVC 4CQBA 3E38A 1FWBB 2PUZA 3MDUA 4WGXA 3EWCA 1FWHB 3F2CA 3GTFA 4GBDA 2QVNA 5E5CA 1A5NB 3ICJA 3MTWA 2FTWA 2Z24A 4HK7A 3UBPB 4RDVA 5HMFA 3E0LA 3GIQA 1FWIB 4C6FA 4LH8A 5FSDA 4C5YA 1FWAA 1POKA 4G2DA 2FVMA 1ITQA 2UBPC 4I6KA 4C6KA 4EPEC 4UBPB 1YBQB 3URBA 4J35A 1V4YA 1EJVA 3GTXA 1IE7B 1FKWA 4J5NA 2Z26A 1KCXA 1FWJC 1GKQA 1EJXC 3K5XA 1RJRA 1P6BA 4CEUC 2WJDA 4AC7A 4DLFA 1J5SA 1EJRA 4B90A 4WHBA 3JZEA 2KAUA 3LSBA 1R9YA 2UBPA 4EPDA 3EWDA 4QS6A 2R1PA 1XGEA 4IF2A 4ICMA 3LS9A 3OVGA 4CEXC 1A5MA 4PE8A 4HA0A 4EP8A 1J6OA 1EJUC 2PLMA 4DNMA 4F0SA 1JGMA 3K2GA 4P5UA 1A4LA 1KRCA 3RN6A 1EJXA 2BB0A 1EJWB 2GWGA 2DVUA 4DLMA 4XAZA 1YMYA 4C5ZA 3OJGA 3GU1A 1EJSB 3IPWA 2R1LA 1FWHA 4PBFA 2I5GA 3S4TA 3UR2A 5G4HB 2ADAA 1POJA 4R7WA 4EPBB 2FVKA 1EYWA 4H00A 4LANA 5FSEA 4CEXA 2P53A 3UBPA 1J6PA 1FKXA 3WZ0E 1EJUA 2FTYA 3LU2A 3PNUA 1FWIA 1FWFC 2F6KA 2CZVA 1XWYA 1A5LC 3A4JA 1A5OC 4V1XA 4ZSTA 3OODA 1R9ZA 3TN6A 4C6QA 1UMLA 1FWGB 3LA4A 3AU2A 4M51A 4C6CA 4UBPA 1E9ZA 1YBQA 2XIOA 2PGFA 1KRAB 3E2VA 4GK8A 4RE0A 1E9YB 5FSDC 1J79A 1FWAC 4C65A 4YIWA 4IQJA 4Z42A 2VHLA 1V77A 3UF9A 3GGMA 4RZBA 3HTWA 4G7EA 1O12A 3S2JA 1A5LA 4C6BA 1A5OA 2PGRA 4CNUA 4PCPA 4GOAA 2Z2AA 1FWEB 3CS2A 1FWCB 1I0BA 1KRBB 3QGAA 3AU6A 4FURA 2Z27A 3E74A 4AC7C 3D6NA 3FDKA 3SFWA 1EJRC 3B0YA 4QRNA 1S3TB 1P1MA 2KAUC 4ZSUA 3TN5A 4ERAA 4QTGA 3GG7A 2Z4GA 4JOMA 4EPDC 4H9MA 3DCPA 2GOKA 2Z29A 4OFCA 4IG2A 2GZXA 4BKNA 2HBVA 3PBMA 4CNSA 1A5MC 1EJSA 1WXYA 2VC5A 4EP8C 2HPIA 3URAA 4KESA 1KRCC 3MDWA 3B0XA 1FWDB 1ZZMA 3MVTA 4DI8A 4RDYA 1RAKA 2VR2A 4XAYA 1EF2C 2G3FA 2EG8A 1M7JA 1RK6A 2AQOA 3PNZA 1RJPA 2YB4A 3DC8A 4J2MA 3QGKA 1A5KB 4WVXA 1FWBC 1QXLA 2P50A 3GU9A 3ORWA 3IARA 4GX9A 1FWHC 4IH3A 1FWGA 3MPGA 3QY7A 1A5NC 3GRIA 4IFKB 5A6TB 3OQEA 4KQNA 5FSEC 2DVXA 1EJTB 3UBPC 4GY0A 4F0LA 4LFYA 1HZYA 3HM7A 1FWIC 4ERGA 3K4WA 3O0FA 1ADDA 3G77A 4QS5A 4QSFA 3FEQA 5LXXA 2FFIA 4KETA 1EF2A 5HMEA 4DZHA 4C6OA 1ITUA 4E3TA 1UBPB 4UBPC 4HJWA 2Z28A 1BF6A 2AQVA 2R1KA 3IJ6A 1FWBA 5CH9A 4GZ7A 3S2MA 1IE7C 1WXZA 2R1MA 3IGHX 1P6CA 3N2CA 1FWEA 3PAOA 1A5NA 3CJPA 2VUNA 1KRBA 2IMRA 4C6PA 4Z42C 4NI8A 3QY8A 4XAGA 4BY3A 1S3TA 4C6IA 4IGMA 4INFA 3O7UA 3NQBA 4IFOA 1EJVB 4LAOA 3T8LA 3S2LA 4R88A 4HK5A 1EZ2A 4D8LA 2WJFA 3QGAC 4B3ZA 4RDZA 2D2HA 1IE7A 4GXWA 4PCNA 2Q01A 3ISIX 1EJRB 1RK5A 4L6DA 4GY1A 2D2GA 3IV8A 4CQCA 1RA0A 3OU8A 3T1GA 1EJWC 1ONXA 2UBPB 2OB3A 4EPDB 2YXOA 1GKRA 4LCQA 2HPMA 4H9VA 3TNBA 1YNYA 4EPEB 1EJSC 2E1WA 4C6LA 4NG3A 2VC7A 4H9XA 5G4HC 4EP8B 1YIXA 1DPMA 3IRSA 5A6TA 4EPBC 2YZ5A 3C86A 4DO7A 2WJEA 1EJTA 2PAJA 1FWJB 1KRCB 2W9MA 3F2BA 3TN4A 1EJXB 4CEUB 1PO9A 4PBEA 4LCSA 4ERIA 3QGKC 1A4MA 1I0DA 2D2JA 2P9BA 4CQDA 4KEUA 4H9UA 1FWGC 1VFLA 1K70A 4F0RA 1EJWA 3GIPA 3LY0A 3GU2A 4LEFA 1UBPA 3T81A 3ID7A 1K1DA 3NEHA 1KRAC 5FSEB 2ANUA 4CEXB 5G4HA 4C6MA 3MKVA 3B40A 2FVHA 1EJUB 3FDGA 4EPBA 1NDZA 4GYFA 1NDVA 2RAGA 4KEVA 4L9XA 3UPMA 4B91A 3WYZA 3S2NA 2HQAA 4KF1A 3UR5A 3AUOA 4I6VA 4LAMA 1K6WA 1E9ZB 3LNPA 1PTAA 1PB0A 4DYKA 4QROA 4H9TA 1FWEC 2DVTA 1FWCC 2UZ9A 2ZC1A 1KRBC 3PANA 2QS8A 4C6DA 1KRAA 2ICSA 3GTIA 1V79A 1XRFA 2AMXA 4B92A 5AKQA 4Z42B 3F4DA 1E9YA 2OQLA 3A3XA 2A3LA 4IGNA 1S3TC 1O5RA 2Z25A 3MSRA 3A3WA 1FWFB 1GKPA 2O4QA 4XD5A 3GUWA 4G7EB 4XAFA 3BE7A 1A5LB 1A5OB 3SO7A 4DI9A 4KERA 4C6EA 3E3HA 4EPEA 2YB1A 3GTHA 3RCMA 3MVIA 3MJMA 1FWCA 4C60A 4DIAA 1KRMA 3R0DA 3V7PA 1FWDC 2OODA 5FSDB 1QW7A 2Z2BA 1FWJA 4H01A 4H9YA 1FWAB 3OOQA 1PSCA 4BJHA 3CAKA 3RHGA 2Y1HA 1M68A 2E25A 4XD3A 4CEUA 4IG2B 2O4MA 1A5KC 4HK6A 4LCRA 4H9ZA 2QPXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ASLA 6XIAA 2AGPA 4G7FA 4IIFA 3WLRA 3WJZA 3MP3A 1U83A 4DL2A 5KG7A 2BASA 2VWTA 1WE5A 5BU9A 1W5PA 3PB2A 4Q6XA 2E4TA 3U2OA 2EPLX 3FY1A 2LLEA 1A5KA 4PTVA 3VGFA 2YXXA 2WZMA 3IACA 3EWYA 3CUZA 3PBUA 3R43A 2Z00A 5CC7A 3W1RA 2FB3A 4GJJA 3M0KA 2WZIA 1NOWA 5LZLA 1LOQA 3G1XA 1KQYA 4K36A 1D2KA 3EXTA 5DCDA 3TJ4A 1SFSA 3KOYA 2PS2A 3WDRA 5CXPA 1WZLA 4S1FA 4FS2A 1KXTA 1V5XA 2GJRA 1OADA 3DFYA 4O1DA 4LH8A 4TTUA 4K8GA 1QOPA 2UBPC 4R9XA 3P0WA 2V5BA 1EEPA 4EPEC 4Q4KA 1Q6FA 2CHNA 2E68A 4Q22A 5D2VA 3AIBA 3UESA 1FKWA 1KBLA 1MZRA 3NWRA 1KCXA 1CXKA 1JG9A 5FJJA 1JDEA 1S2CA 3QC0A 5T91A 3HG3A 3OB8A 1DXIA 1KFJA 4J3SA 2OR2A 3EX6A 2ZKMX 1LT8A 3W1UA 3GR7A 4O13A 2W0UA 2UY3A 1A47A 5D2TA 1JQXA 1KC7A 3VNLA 2PWGA 4JTIA 1TQXA 4GIYA 4LBUA 2B31A 1XCXA 3RO6A 1ZAJA 3E49A 3HQPA 4IX0A 2X0YA 4FA3A 4GA8A 1TV4A 2ASHA 2QCNA 4GHRA 4C5ZA 1TUFA 3EWZA 4J9RA 4Z2KA 3VVGA 1W9DM 3L2IA 5KFJA 5I3HA 1PIFA 2Y0FA 4MY9A 2CLHA 3S6DA 3C56A 2FTYA 3WDPP 4NZ1A 3DFQA 3VILA 3QHOA 3CWOX 1JCMP 3M0JA 2GK1A 1OF8A 1R9ZA 3P0XA 4O3SA 1ZRQA 2J6XA 5EMKA 3OIXA 4C6CA 3SRKA 4K8HA 1FX6A 1AZ1A 4OBTA 1XC4A 5ABFA 3V1HA 2XM1A 3WQVA 3WD2A 4LY8A 8XIAA 5FSDC 2FTPA 3A22A 3L4TA 3CEPA 4PMYA 2E67A 3NUKA 4IIHA 5LIYX 5HNUA 4S3CA 3M0HA 4QWBA 2CPUA 2ZUTA 3SN0A 1E4MM 4PCPA 3RO8A 1HKVA 4Q8TA 4WXZA 3TQ0A 4GFIA 3NSMA 2F9RA 4ZSUA 2CLOA 4ZO7A 3TOPA 3BICA 1TYGA 3DKLA 2CBIA 1DE6A 4JOMA 4S39A 2UVRA 3VNYA 3STPA 4ZE5A 3AMGA 1KV5A 1TPH1 4C91A 4N6EA 1KA9F 4GYPC 1UKSA 1H7OA 3JRKA 3B0XA 4NF7A 3S9ZA 4WIWA 1IYXA 1RR2A 1QDSA 1JAKA 3H4XA 4ML9A 3M9NB 1HP5A 3LTSA 1VRXA 1JCLA 3N19B 4AH7A 3GDLA 3NGFA 1Z9AA 3H55A 4DJEA 2QQ6A 4LYQA 4Q6JA 3NGJA 1OQFA 3P62A 4FF5A 3WIJA 4FR1A 2HK1A 1FWTA 2WVSA 1FWIC 2YCJA 5KG6A 3FYPA 3VA8A 4AUBA 1H61A 3FXYA 4HHHA 4KETA 5BRBA 2W79A 1FCBA 1LQ2A 1SSDA 3OHBA 3H2FA 3VKBA 3W2MA 3CUGA 2JIWA 4IX2A 4DBUA 3QR0A 4A35A 2BY0A 4GZIA 3F1QA 2FDSA 2Y7GA 1H0IA 4GUGA 4LW7A 5KFBA 1PX8A 1KM1A 3IUHA 2DSWA 2KX9A 4ZB2A 1X6LA 5IHSA 3IGUA 4I9JA 4A8IA 1AW5A 2VX6A 4IFOA 4MB3A 3Q58A 6PTDA 2YIHA 3BLDA 1S46A 4HK5A 4QEEA 4O54A 4UOZA 3OZPA 1NAL1 2OU4A 3ISIX 3G8RA 3PN8A 5D33A 4J3XA 1XX1A 3G6YA 4C1NB 2PWHA 3V16A 3N4EA 3IANA 4NG3A 2OZ8A 3EDKA 4KWVA 4F2BA 2HWGA 1DPMA 2C2DA 2Y61A 2WVTA 3E1F1 3LPGA 1DQWA 4FNUA 1FWJB 3PS7A 3W85A 5A3HA 3RCNA 3SFKA 4AVOA 2H3BA 1B30A 5DMMA 3C3NA 3GU2A 5KFNA 1EL3A 3TAOA 2ALRA 1SMAA 3SY5A 2ABBA 4JL1A 1VD6A 3UWEA 2VGIA 4PSRA 5E0KA 4AG0A 3KFTA 3CTLA 5EPDA 4RR4A 1QBAA 2BVWA 4DF1A 1PTAA 4HZ7A 3KVJA 5LNWA 1J0IA 2YW4A 3G2GA 1FWEC 1Q8JA 1LP6A 3WK2A 2PDYA 4HJFA 3FIGA 3ALFA 2E5CA 2Y2WA 5AKQA 1BHGA 2JEQA 4K38A 1FP9A 1F61A 3MSRA 1FP8A 1QNSA 3GUWA 1Z32X 3GXIA 1K8XA 3TTQA 3GNPA 5FF3A 2UVUA 1QK2A 2O9OA 2FIQA 3W1PA 1F8IA 1GTEA 2POZA 5K4XA 4JTFA 3R0DA 1FWJA 3R4IA 2VDGA 3S1XA 4BJHA 1M68A 2GSJA 3CB8A 2OSXA 1GTHA 1W5MA 3AWOA 1BTCA 4R9OA 4DHGA 3EDEA 5A6TC 1H2JA 1U5VA 4ZO9A 6ENLA 2FZ8A 3GLCA 2VTFA 1XLBA 1B3VA 2AGTA 2ACSA 4H7VA 3QY6A 4AC7B 2OGJA 3O15A 4XV0A 5KFOA 5LIXX 1FWDA 4WK9A 5J5DA 3KBNA 3N2MA 3UWZA 4PR4A 1M1BA 1RJQA 3I4EA 4GD0A 4MIMA 2WVVA 1XXXA 4F66A 5A6KA 2Z0IA 1HKIA 1LQAA 1NDWA 1UH4A 3KW3A 1Q7ZA 1PL9A 3R13A 3W1XA 1LLZA 3GV8B 3TAKA 3QR1A 3QYQA 2G3MA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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