4G9RA

B-raf v600e kinase domain bound to a type ii dihydroquinazoline inhibitor
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
274
structure length
262
Chain Sequence
DDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATEKSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase B-raf
publication title Pyrazolopyridine inhibitors of B-Raf(V600E). Part 4: Rational design and kinase selectivity profile of cell potent type II inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 262
sequence length 274
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4g9rA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4g9rA01
4CMUA 3R04A 3R7IA 4CKIA 1SVEA 3AGMA 3DBQA 2ITNA 4FG8A 5HVKA 3MS9A 5CEOA 3RAHA 3HGKA 1W0XC 4I5CA 3LJ1A 4GFMA 4CRLA 4AE9A 3EQDA 2EWAA 4ALUA 3DXNA 2OH0E 2OSCA 4MNEA 3AC4A 5L2QA 4FSQA 3C4CA 3I1AA 2GHLA 2I1MA 3BQRA 1KE6A 4G5PA 3VUDA 1URCA 2ETMA 4FSNA 4E73A 1B39A 1PXLA 2QC6A 3QA0A 2HXLA 4LG4A 5E8SA 2CKPA 3QUPA 3ZUTA 4IZAA 5E92A 3P0MA 4O81A 4GIIA 3OY1A 4IWDA 4BCPA 3VHKA 2ITQA 4OUCA 2Z02A 3KB7A 3OXZA 2WZJA 3RHKA 5CF6A 4EHVA 2BDWA 2Y4IB 3ODYX 2PVNA 2WMTA 5FP6A 5HNIX 1YHWA 2NPQA 2PUIA 3BX5A 4PPBA 1STCE 4F08A 5GHVA 5B7VA 3B8QA 5AV3A 4L52A 3RBWA 3IGOA 4IB1A 2GS2A 3OTVA 5IKWA 5CQWA 2FSTX 3RAWA 2UZOA 4PQNA 3OCBA 2I0HA 2PL0A 3PIYA 2J4ZA 5AP1A 3PSBA 4CG9A 4O0SA 4MWHA 3I7CA 2VNYA 3OG7A 3QU0A 3F5PA 3P79A 3QRUA 4AT5A 3GENA 2Q0BA 4EJ7A 3F7WA 4L44A 5I9UA 5GZ8A 3FWQA 4W9XA 2BAJA 2XK4A 2XK6A 3LFFA 4AXAA 2JAVA 3EN7A 4IAIA 4UWBA 4FA2A 5I3RA 5DWRA 5BUEA 4EKLA 1CKPA 3QAME 3F3WA 3KVXA 3IPHA 1CKJA 4AE6A 3DKOA 1R0PA 2B53A 1H27A 1NT2A 4E5WA 2WU7A 5AIKA 4IZ5A 4O7TA 4MHAA 2QG5A 2RFNA 3W55A 2PVFA 3GXLA 1W98A 2W4KA 2HYYA 3PLSA 4XNEA 5LCKA 4YNOA 5KO1A 4I5PA 4FTNA 1OPKA 2Y4PA 3CLYA 1G3NA 5L6WL 1YXXA 2GFSA 4QTAA 1JBPE 4J7BA 5CAPA 2PVHA 3SRVA 4RC3A 1RW8A 3QZIA 4UMPA 2PVMA 5HLPA 1G5SA 3MY0A 2WGJA 3MSSA 3ANQA 4X0MA 3DU8A 3MJ1A 3JVSA 1SZMA 3QZGA 1LP4A 5LVLA 4HVGA 3W10A 3FZ1A 5EDQA 3TEIA 3H9RA 2GPHA 1H1SA 3PXKA 4O0VA 4BCJA 5BVOA 4JDKA 4E4LA 2CKEA 1SMHA 2B1PA 3C13A 3G5DA 4X6QC 3QRKA 2C5VA 5EM6A 4AOJA 2YCFA 3COIA 1QPDA 4Y5QA 2EB2A 2VRXA 2UZLA 4QMQA 2QNJA 2Y7JA 3B2WA 5EYMA 5KZ0A 2P3GX 4ASDA 4EZ7A 4O2ZA 1YDSE 3F3ZA 4PMMA 5D7AA 4BDFA 1H8FA 4I1ZA 2PZYA 4O7SA 3BHHA 3QUDA 5E8XA 4AA5A 4HCUA 3LFNA 2YAKA 4GK3A 4FKGA 4L43A 1R78A 3II5A 4M69B 3VIDA 4L67A 1LR4A 4QP1A 4QMYA 3QX4A 2YZAA 4O7VA 3PVGA 2XRWA 1ZWSA 3QWKA 2WTCA 5ETAA 2F4JA 4YJPA 4FIGA 4ANNA 4G2FA 3L8VA 3U9CA 3EJ1A 3BYMA 3WE8A 3FL5A 2G1TA 5CY3A 3O7LB 4GVAA 4E93A 3ZO4A 4RWKA 4FKVA 2CGWA 2JFLA 3TIYA 2OZAA 3TNWA 3UNKA 2QQ7A 4PPAA 2FUMA 4UBAA 2ZDUA 5DFPA 3D2KA 3DGKA 3ORPA 2PVKA 3EL7A 3PXFA 4TPTA 4UYNA 2C5NA 4KRDA 1ZOGA 2ZVAA 3A62A 4YC8A 3RPVA 3TZ9A 4FTRA 1J3HA 5BMSA 4RVLA 2C6EA 3K3JA 4R7BA 1VYZA 2EUFB 2VUWA 4MKCA 4JLCA 4L01A 5GJDA 4LUDA 3D14A 4JS8A 1FINA 2XIRA 1BX6A 3MGYA 4YMJA 2C0TA 5IQFA 4DEEA 3QF9A 5EHYA 3R8MA 2XKFA 4HYSA 2RG5A 4E1ZA 1JQHA 1A06A 1MRYA 4A9SA 1PF8A 2QCSA 4IX6A 4CZTA 3VULA 1QPEA 2ETRA 4BZOA 4EOOA 2JEDA 4GEOA 4MX9A 1S9JA 2I40A 4XYFA 3BBWA 2UW5A 4BC6A 4BKJA 4C2VA 3WYXA 2YWVA 4CKJA 4RIYA 5K5NA 4FV8A 3L8SA 1H1RA 4OTFA 3H30A 2R3FA 3BLQA 2OXYA 5F9EA 2R4BA 5D11A 2E9PA 3QHRA 3NWWA 3TNQB 4OTRA 3VJNA 3VNTA 5I9ZA 1KOAA 2QO2A 3VW8A 1UNLA 3QZHA 1BLXA 3Q60A 3UVPA 4F64A 2X1NA 3DBEA 4UY9A 2B9IA 3JPVA 4NJ3A 5D7VA 5C8NA 3C1XA 3C4EA 4EOKA 3ZZWA 4DGGA 4USFA 5TOZA 2B52A 1WBOA 3FBVA 4H39A 3FZTA 2Y6OA 1GNGA 2OFVA 1F3MC 2OG8A 2ONLA 2XNPA 4ZTNA 4U0IA 2HENA 3ZFMA 4C02A 1BL6A 3EYHA 4EQUA 4BCNA 5F95A 2IVTA 5JK3A 3MB7A 2OIBA 4YP8A 4DG3E 5LWMA 5H9BA 3AGLA 3WZKA 3F3TA 3JY9A 3ZS5A 5HLWA 4O1OA 1LPUA 4AQCA 2J5FA 4J96A 4QNAA 3LFEA 3QQKA 2VTQA 4DFLA 4IACA 5EW9A 4DH1A 2O64A 2QOKA 3MPAA 3GU5A 3QKMA 5IDNA 3L9PA 3WE4A 4YHTA 4PDSA 3F7ZA 2BRBA 3OY3A 1OIUA 3PZEA 1XBCA 4KAOA 5CVFA 5CZIA 5HVYA 4PL3A 3OP5A 4PWNA 4CYIA 1Y57A 2ESMA 3COKA 4TN6A 4FYNA 2UW4A 3KQ7A 3D2IA 4I6FA 4PTGA 4Q5HA 1PKDA 3DKFA 1WBSA 1E9HA 5CAQA 3RHXA 3QTQA 4UMQA 5K0XA 4KIKA 2JKMA 4LM5A 4EH7A 3MVLA 4DF3A 2F7EE 4FUXA 4FKTA 4FUYA 4U81A 4UALA 3N4UA 4WNPA 1WZYA 4K8AA 2PU8A 3FPMA 4IX5A 2R5TA 2X39A 1Z9XA 4X21A 4TYJA 3DXPA 2WQEA 3DLZA 3IG7A 3NYXA 3CD3A 3QC4A 2O3PA 3OOGA 3QD2B 3I0QA 3QRTA 4IX4A 4RJ8A 5FBOA 4AW1A 3SRVB 2B9JA 4MQ1A 4MYGA 1ZYSA 3CJFA 4GT5A 3VBVA 2WOTA 4LGHA 2C4GA 3ATTA 3PJ2A 4YZCA 4Q9SA 2YZLA 2Q83A 2HOGA 4IH8A 3NUAA 4C34A 2R3RA 4F9BA 2R3GA 4K11A 4ZMFA 3A7IA 2E9OA 1FGKA 3C51A 4XCUA 2V5QA 2QURA 4M13A 5J1WA 2ZAZA 2Z7RA 4ERWA 5IPJA 4W4XA 4OAUC 3V8WA 3POZA 3DJ7A 3PIXA 5AUZA 2JAMA 4BGQA 2G2HA 2GS6A 1IAHA 3KRLA 4B6LA 4CCBA 4ITHA 4XBRA 4DBXA 3ORIA 5HI2A 2V62A 4NCTA 3W18A 3A7HA 2X8EA 3QTUA 5IZFA 1SNUA 2ITWA 3LAUA 4D0XA 5AFVA 3UYTA 4XG7A 2J2IB 4WKQA 4M0ZA 4RC4A 5AR4A 3NNXA 5JRSA 1H08A 5CU4A 4MF1A 4BDIA 4QO9A 4G6LA 2FB8A 4LI5A 3PXQA 3QUEA 3GT8A 4UXQA 4GJ3A 1RQQA 4C4IA 3UPZA 2WD1A 3CTHA 5M56A 2XNMA 3PFQA 4M12A 3EN5A 3PA5A 1GOLA 5DR2A 4RJ4A 1YXSA 3F6XA 5JFVA 1XBBA 2WMRA 4ZY4A 2OZAB 2VWBA 3CQWA 5I9YA 4FGBA 4FTTA 5K4JA 3DA6A 2WMAA 2UVXA 3EH9A 4KB8A 4U45A 4LGDA 3U9NA 5A4LA 4RRVA 5EDRA 4CRSA 5KMOA 2PULA 4AU8A 2XIKA 3F3VA 3GU7A 3HUCA 4R5YA 3ZOSA 4D58A 1Q24A 5JQ8A 4D2WA 4TYEA 3ZRLA 1Y8GA 4IDTA 3ORNA 1PKGA 2QOQA 3LFQA 5EQYA 4DEBA 4IBMA 1MRUA 3HAVA 4I92A 4BFMA 4KKHA 3FI8A 2YACA 1J1BA 4FK6A 5DA3A 3QALE 4E8AA 1PXKA 3BRBA 4YLKA 4EOSA 2QO7A 3FMMA 4XS2A 3SXFA 3G0FA 5LWNA 2UW7A 3E87A 2O8YA 3MA3A 3HZTA 4NM7A 4BICA 4ZLYA 3IO7A 5B2LA 4L6QA 4GSBA 3SG9A 4LFIA 4AX8A 3NNVA 4BKYA 3EOCA 5EM8A 2YISA 4C4HA 2WB8A 4FT0A 2A2AA 3HV6A 5ACBC 3K5VA 4AA0A 4QQJA 2RL5A 2WELA 4FOCA 4MAOA 1ZYCA 4EBWA 2JITA 4YNEA 1H26A 2C1BA 2Y8OA 4FOBA 4QYFA 3U51A 1V0PA 3F66A 5AAFA 1V0OA 3GCSA 5E7RA 4OW8A 1OPJA 1Y91A 4J1RA 4WG5A 4C59A 4DGLC 1JKSA 2JDSA 2ZB1A 3DK7A 3QZFA 4R1VA 4XG3A 5GNKA 3R7EA 1BUHA 3A7FA 3U4WA 3DFCB 4RIWA 3OHTA 3TL8A 4DFYA 2GQSA 2JLDA 4MXAA 5TR6A 5LMKA 4PF4A 4PMTA 2UVYA 2PE2A 3ORKA 5EH0A 1U59A 3NDMA 3UIUA 4NFMA 3MH1A 5LVPA 5E4HA 3CS9A 1UA2A 2R0IA 3ORTA 4Y72A 1FVVA 1R39A 2J0IA 3UIBA 2F57A 5HU3A 2HWOA 3KREA 5GIOE 2ZM1A 3HV4A 1W83A 4MTAA 4C57A 3DS6A 4XLIA 3BHTA 4UWYA 4FZDB 3FLYA 2W7XA 4I93A 3NSZA 4EBVA 4QMXA 3SAYA 1VEBA 3UP2A 3GC0A 4MXXA 3UIMA 4G3CA 5CALA 1RE8A 2QOOA 1GY3A 5CXZA 2IZRA 4X3FA 5KE0A 3I6WA 3D5UA 3HA8A 3VS3A 4UX9A 4D4YA 4L9IA 3QFVA 3VBYA 4HCVA 5FTQA 5ANJA 4ACDA 5B0XA 3RAKA 3BGPA 4ALVA 3NYNA 3ZMMA 4ZMEA 3Q04A 4HOKA 4QOXA 2GS7A 4JOAA 4BIEA 2B54A 1WBTA 2BUJA 3Q9YA 4U97A 2UVZA 3MVJA 4M3QA 5AP3A 2E9NA 4WT6A 2RFSA 3Q5IA 5HCXA 3ZLYA 4CKRA 4EHZA 5FUTA 4QQTA 4F7SA 1MUOA 5HIEA 3PJ8A 3WF7A 4QTEA 1Q3DA 3PRFA 3QKLA 3CGFA 4BDBA 4FL2A 4BKZA 1YOJA 3R9HA 5EOBA 4YURA 5JZJA 4FV4A 4BVUA 4BWXA 4R77A 1BI8A 1P5EA 3CKWA 3UC3A 4APPA 4EYMA 5IH6A 3FDNA 2P2IA 4GT4A 5F1ZA 4EI4A 5AAGA 4MF0A 2XA4A 4QNYA 4EOMA 5M08A 3P5KA 2XJ0A 4IAYA 4EOIA 4X2JA 4FIEA 2ZMCA 5ITAA 2OF4A 2CGXA 2IN6A 2KTYA 3R8LA 1OIRA 4OTPA 4TYHA 3FSKA 4CYJA 5L2WA 3BLRA 3P86A 4UMRA 3AMYA 3AC8A 1HCLA 2GNGA 2R3MA 5HX8A 2C69A 3PA4A 3ZFXA 3IDBA 5IQCA 4FTOA 3U55A 2RF9A 3EWHA 5DIAA 5EI8A 4PTCA 3CCNA 4WUAA 3G51A 3JXWA 3IDPA 4G6NA 1DS5A 3FI2A 4IQ6A 1BMKA 4WBOA 4C35A 5HNBA 4C4GA 2YLFA 4MWIA 4ZP5A 4HW7A 1O6LA 1ZMUA 3C4WA 4FKWA 2PHKA 3E7VA 3WZJA 4BF2A 4B4LA 4C0TA 1W7HA 2AC5A 4RLLA 1WBVA 4XP2A 5JEBA 2CMWA 4FKJA 3UNJA 3BEAA 4F9AA 4LV5A 5EK7A 4IM3A 4DT8A 1ZYDA 1NY3A 5C8MA 3T9TA 5L6PA 1V0BA 3OCGA 4MQ2A 4CFUA 1P4OA 2PVYA 4M66A 5JFSA 4TWCA 5HKMA 4PUZA 5JFWA 4A9UA 3KRXA 3OC1A 4I5HA 3MFTA 2B4SB 4CQGA 1TQMA 2AYPA 4F7LA 5AUYA 3CTJA 5D9HA 3MJ2A 2W0JA 4KA3A 5BNJA 5CU0A 4CQEA 4FKOA 2QVSE 4CLJA 4RA4A 4AGUA 3IS5A 2OJFE 4C3PA 5DMZA 4FZFB 2WTJA 3VUKA 4XP0A 2V0DA 3KXXA 2Z7QA 3PVWA 3RPYA 4EK5A 1OL6A 4UXLA 4BIDA 4D55A 3ZO3A 5FBNC 3ZBXA 1WCCA 5LOHA 1Q97A 2RKUA 2B9FA 1PXNA 3PG1A 3MTFA 4RX8A 3VW6A 4D2PA 2WMUA 5CZHA 2VN9A 4JNWA 4U3YA 5A54A 4PDOA 2XBAA 2XP2A 4BCIA 5EYCA 3SX9A 5HTIA 4BCHA 5C26A 2HY81 5J7HA 2UZDA 2X2LA 2YIWA 2CLXA 3JY0A 4GFGA 4O21A 5DOSA 3RM7A 5KKRC 2C6TA 4FIHA 3N4VA 3PVUA 4D4RA 5ANDA 3MFUA 4FNWA 3Q5ZA 4PV0A 4X3FC 5GJGA 5CF5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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