4GC4A

Crystal structure of the mutant r160a.r203a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor bmp
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
DVMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTAPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGASIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Conformational changes in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase: a structure-based explanation for how the 5'-phosphate group activates the enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus str. delta h
total genus 85
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2012-07-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4gc4A00
4JTFA 5HR6A 3WK1A 3DFNA 4AAJA 5FESA 3OIXA 4XKYB 3DHFA 3WK2A 3N2XA 5AC7A 3EXSA 2E6YA 3VE7A 3L5LA 3QMSA 1H61A 1Q6QA 1LRQA 1O95A 3FS2A 5AHLA 1H51A 2DJXA 2Q3OA 1EIXA 3W07A 3CWOX 2WNQA 1ICPA 1W5NA 2DZUA 3G8EA 3TW6A 4GUFA 4O52A 4UFKA 1GT8A 3UWQA 3P84A 5HWJA 3CT7A 3NNTA 1JUEA 1NFBA 4S1FA 2YXGA 1YPIA 2A7RA 4Z08A 1UJPA 2C15A 1PE1A 4HPJA 2QAFA 3O16A 3FEMA 3S1XA 1TO3A 3BO9A 2V2DA 1I2QA 3GDKA 5K9XA 2X1TA 3QYQA 4RXGA 2RDWA 5HINA 3G24A 1O60A 4NJHA 1MEIA 3HPSA 3SGUA 4JDBA 4FO4A 5F2MA 3SJ3A 3QSRA 5KZEA 3NYZA 2DJLA 3NQ6A 1KTBA 4Z1BA 4MIMA 3F1QA 2VEIA 2JKAA 1Z48A 4UMBA 3U2OA 4N4QA 1TPUA 3W1QA 3QW4B 4AHOA 1JQVA 3B03A 4Y9AA 2Z0IA 5BMWA 4JYDA 3PBVA 3UWWA 4TR9A 5D2WA 1G7UA 2C3ZA 3M5ZA 4O1DA 2EGZA 1IXQA 1Q6OA 3PY2A 5I3FA 3W7CA 3UD6A 3N19B 4UFLA 2J6XA 3SIZA 4X2RA 3OHIA 1VRDA 3EWYA 4UTTC 1K7XA 3S42A 4FXSA 1OX6A 3GVGA 2QCLA 2DU2A 1H7OA 4CQ8A 3DH7A 3W2JA 4JIQA 3CU2A 3CEPA 5FF2A 1VR6A 4GE8A 2WJZA 1W8SA 3TIMA 2ZRUA 3AO0A 3G8RA 1ME7A 3C4UA 3ZS4A 2BXVA 4HSNA 4N2YA 3NDOA 3JRKA 3TMLA 3QFEA 1JCMP 1ZAIA 3CIWA 2ZRZA 4O13A 3I7RA 3MW7A 5KMYA 1SZGA 3LI0A 3LX9A 4K37A 4OGZA 4BR1A 1XCFA 3PM6A 2CFFA 4RZ6A 2Y6ZA 1SO6A 4DXVA 2R91A 3NQMA 3UWUA 3INPA 2ZQ0A 4UXDA 1FDJA 1LBFA 3C3NA 2AAMA 4K36A 1TPDA 1JCLA 5BW6A 1PHQA 2Y7GA 1Q3NA 3W87A 2E6FA 3LCGA 3S1UA 1K02A 3G0UA 4ZVJA 3HF3A 3MUXA 3NZ1A 4MY1A 2CZ5A 2V2HA 2J9XA 4LRSA 4M7TA 3SECA 3DGRA 4A22A 1LLZA 3NXFA 3W88A 4UR7A 1TTQA 1T96A 3IIXA 3HGJA 1KFLA 1R2RA 4KFOA 4R53A 2CLLA 2VOMA 3BW3A 3FJ6A 4ONVA 2C13A 4UFMA 4ZZ9A 1GYNA 3W6YA 4E0CA 2CZDA 2YCEA 4PL2A 2QUVA 2YFNA 3UY7A 3EB2A 3IVUA 1W31A 2DZVA 1B4EA 3WK0A 1OF8A 1PHWA 1SU5A 3L0GA 3G1AA 1AG1O 2ZZ6A 3D0CA 1TTPA 2ZYFA 2G97A 3L0NA 1R2SA 1TV8A 5HWNA 4LOCA 4UR8A 1FBAA 1I2RA 5D2TA 1F2JA 3MBFA 4IQLA 4XUGA 4XKYA 2JGYA 2VENA 3LCXA 2E68A 3W7KA 3G0SA 3FJLA 3HO8A 1FXQA 1GG1A 2ATMA 1LYXA 3BG5A 2X1RA 1OG0A 2E77A 2GPTA 2ZRWA 3RFAA 3W76A 5I3KA 1BWLA 1TPWA 1VHCA 1WOAA 3DZ1A 1ZAJA 1SW3A 3A21A 1S5WA 2XN1A 4G1KA 3DHDA 3KRSA 3R12A 4ZQNA 3M9YA 5I3IA 5G5IA 3SSJA 3LHTA 4KWVA 5K9DA 5CPOA 1TPB1 3W73A 1DJQA 3TXZA 1XKYA 5K4XA 4FNTA 5A5WA 4AF0B 1ZNNA 1W5OA 2ZCGA 1ADOA 2JBMA 3W1AA 3O63A 1ZALA 3E96A 4FNSA 2NX9A 2VFFA 3O6DA 3WJYA 2CW6A 8TIMA 3NQ7A 2FIQA 2W6RA 4AWUA 3GZ3A 3RK8A 1YTKA 3PUDA 3G1XA 3O6CA 3T4CA 1H7WA 3GKAA 4YL2A 1NVMA 2HS6A 1DJNA 2CZFA 1QOPA 5HULA 1YPFA 2W79A 2I9EA 1QPRA 2VC6A 4FNPA 4UFIA 4UTMA 1X1ZA 2DZSA 1MSSA 3A22A 5F1UA 1XUZA 1IF2A 5AC8A 5SWUA 3HGOA 3LB0A 1KW1A 3GB6A 3DFPA 4GXMA 1RQEA 4M5PA 3PSWA 4LV4A 3GNDA 4DF0A 4A2SA 3MI3A 1V7YA 4ICNA 2ABAA 5DN1A 4X9SA 3DI1A 4NJKA 5DY3A 5G2WA 4DPPA 3TQKA 2C0AA 4JTGA 1YDNA 1HL2A 1JRBA 2GVGA 3BG9A 1JUBA 3STGA 1TRDA 3W85A 1KFEA 1B4KA 1FX6A 5DCDA 2C1HA 5K4ZA 5TQLA 1LM1A 4I7UA 3UXDA 1JVNA 1OABA 3R8RA 1MEHA 3EX2A 1VCGA 3BLIA 3NZRA 2E5CA 2ALDA 4O0KA 5FI8A 3N3MA 1VH7A 4FF7A 5D2XA 3T44A 3TC6A 3P82A 3TUUA 5LHFA 3TFXA 2WSYA 5AN7A 1BWKA 1NEYA 1G4TA 4FX7A 4ZMGA 4NXSA 3L21A 2I1OA 3U8GA 4GC4A 3W7NA 1GG0A 5H91A 2YW3A 3LHVA 1DHPA 3LOTA 4HSOA 1AW2A 3G22A 1GWJA 1K8ZA 1VYPX 2Z1BA 4NVTA 1FY6A 3GDTA 4OHQA 1K8XA 2I14A 2QCGA 3DI0A 4OV4A 3P67A 3M5XA 3A9IA 4OU1A 1D9EA 4M6VA 4U4MA 1LLWA 3HG2A 1UUMA 4O54A 3C0JA 3PB0A 3WFAA 1IGSA 5FF3A 3MYPA 1B57A 5J5RA 3MJYA 1GZGA 1A53A 3MWAA 3G1SA 3W84A 4GUHA 1WXJA 4EWND 1EX5A 2GJLA 1B9BA 4EVZA 3M7WA 1P4CA 1K8YA 1O94A 3IRDA 5DCEA 3JS3A 4WY0B 3P5ZA 2FLIA 5TIMA 4DBEA 5D2VA 4TMBA 4JX4A 5DELA 4MYAA 4PEKA 3M0ZA 1IXOA 1G4SA 1H7PA 3W23A 4ZQOA 3TSDA 2VKZG 2RFGA 4JY8A 5HUPA 3TR2A 3GDRA 3HJZA 4MYXA 3N14A 4NX0A 4E2DA 4O28A 2O7QA 4MJZA 1L9WA 5D05A 1Y0EA 3DXIA 1J4EA 2E6DA 1Q6LA 3PULA 5GVJA 1LRNA 4QIUA 1JCYA 4GJ1A 5F1VA 4OV9A 1JRCA 4DF2A 1CW2A 3MMTA 5IBXA 1OFOA 1HUVA 3NQFA 4DBDA 3W2NA 1TJPA 3NPWA 1RPXA 1TPH1 1EB3A 2ZZ1A 1W1ZA 5J5DA 5G4EA 3EX1A 1A50A 2QDGA 3F03K 4LW7A 2Y63A 3W22A 3CWNA 2UV8G 3UZ5A 1FWSA 4HNUA 3EWXA 3O05A 2DZXA 2H6RA 1DBTA 4QNWA 4IXHA 5F2IA 2X1SA 1P1XA 4JTUA 1EP1A 2QDHA 3LCLA 4BI5A 1NSJA 4N02A 3P5YA 4AF0A 1VZWA 1X1OA 1Z41A 4RXFA 1GVRA 5KINA 4HIBA 5HJLA 1RVGA 5LNUA 3N9SA 2BX7A 1AL7A 5KZMA 4JY9A 3KAOA 1QOQA 2YDAA 3PG8A 1KM6A 3S5YA 4N9CA 6TIMA 1FQ0A 4NNBA 5K9CA 2VXNA 2ZA1A 1AK5A 2FQIA 3QMRA 1ZFJA 5EA9A 1SUXA 1FWNA 3S8HA 3O07A 1HG3A 1H7RA 2RKXA 1TREA 3ATYA 2YX0A 4UUIA 3UWZA 2AGKA 1OHLA 3BK0A 2Z6IA 4TX9A 1UBSA 3O6YX 2V2CA 1TSIA 3W1MA 4R33A 2VEMA 1C9DA 2WNZA 3S5ZA 3DENA 3C2EA 4O11A 4EOUA 2A4AA 2KZHA 3W1TA 4ORMA 3TAOA 4JEQA 2V5LA 2V30A 2YYTA 3WJSA 4BI7A 3MP3A 3NL5A 3TCEA 5DBUA 4JYEA 3ZFHA 3GLCA 1F7BA 3PUEA 1J5TA 3LBCA 1GTEA 4RKAA 1OYCA 1AW1A 1TJRA 2J24A 4CNPA 4B5NA 1H1YA 2FPTA 4YCPA 2G5WA 1XBYA 3W71A 3LTSA 4O1BA 4O0ZA 2ZZ3A 1RR2A 3NQVA 4P61A 5DXYA 4MFEA 1KFBA 1KV8A 2Y89A 4NXKA 4YXGA 3F4WA 4AHQA 4NU7A 4R34A 5D03A 2ZZ4A 1NAL1 3MI2A 1QFEA 5CG7A 2BZNA 3LBMA 3B4UA 4IXXA 3CC1A 1R46A 1DKWA 1SR9A 1VJIA 4H6KA 2XFWA 4XZ9A 1X7FA 4JTEA 1PCKA 1VLIA 1VCFA 2QCHA 4E2BA 4HKPA 4CCCA 2NUXA 3F4NA 1V5XA 5CGQA 2FTPA 1L6WA 3TDFA 4PL1A 1VCVA 3TK7A 3PF3A 1ONRA 2ISWA 2PC4A 4K6AA 3FKKA 1D3HA 3HPZA 3E0IA 2X1UA 5FEWA 4X3ZA 3VKJA 3EWZA 4XTIA 2VFDA 3P81A 4ZQMA 3G1HA 4UTIA 4JTJA 1QNVA 1GOXA 3TH6A 2A6LA 5AYZA 2RH9A 2NWSA 4K39A 1FWTA 3KVLA 5A8GA 4O4VA 4WY0A 3NL2A 1JQXA 4NZFA 3W1PA 3L0KA 1TQXA 2XN2A 1H50A 2ZZ7A 4C1KA 2OT1A 3L65A 3LXAA 2V8ZA 5EPDA 5DLCA 5K2ZA 3BV4A 3TA6A 3EWWA 2F84A 2Y7EA 4QJ1A 4RV8A 3GIYA 3ELFA 5AOUA 1DVJA 2HTMA 3EWUA 3HB9A 4RJEA 4R7JA 4Y96A 1CX9A 1QPNA 1A5BA 4O57A 1OVDA 1WV2A 2QCDB 5D32A 1MXSA 4XTDA 3M16A 2NXIA 4DO4A 1LROA 4W9TA 4PA8A 3W1XA 3DFSA 3M43A 1DQXA 3NVTA 3SI9A 4AEOA 5CZJA 4Q4KA 3LTPA 3PAJA 3O1NA 3WJWA 1PCWA 4M6QA 4EF9A 2QCFA 2V9DA 4AH7A 3LXBA 3LDVA 4K7YA 3QEZA 4A2RA 4Q32A 1OFQA 2QUUA 3MI6A 5C6MA 1FUYA 5CPNA 4L4LA 1E51A 2A6NA 4DQWA 3W75A 5D33A 1KTNA 2CLHA 4FX8A 4QQ3A 3M47A 3TMQA 2RDUA 3W7GA 3KFTA 4RCXA 1G4PA 1WQ5A 3KVKA 4CCDA 1OFAA 3QQ0A 2EAWA 1IIHA 4E38A 4TIMA 1P0NA 4MVAA 1W3TA 4LS2A 3LRLA 2ZA2A 2C16A 1VYSX 2ZZ2A 4N9DA 3L68A 1EP2A 1Q6RA 3EXRA 1LTDA 4UCGA 1N55A 4WD0A 1WYIA 1XL9A 3ABQA 2PRLA 1FWWA 2A7NA 5I3JA 3LHWA 2J88A 3ZR4A 2NX3A 3NL3A 3PUOA 1W54A 2FFCA 3KHJA 1LDCA 5EYWA 3N9RA 3MP5A 5G4WA 1TPC1 4K8HA 5DY2A 3L2IA 4JX5A 2BWGA 3B0PA 5CPLA 1QWGA 1G6CA 1QAPA 4LC6A 3SW6A 4HNVA 4RLIA 3TNOA 1NF7A 1VC4A 3QW3A 3GR8A 3W7DA 3MBDA 2H8XA 1RQBA 3P8JA 2J9ZA 2ISVA 3LERA 5BOOA 5D37A 3T7VA 4JYFA 3TE9A 2HS8A 4HHPA 2PRMA 1GJPA 2Y70A 5BNKA 5KZDA 1XI3A 3P7YA 5FF4A 3GKFA 1X8FA 4IOTA 5D09A 1QMLA 4GWEA 5KITA 2DZWA 3FKRA 3YPIA 2B0MA 1FDYA 4JTIA 3CTLA 4X22A 5AHEA 4O15A 5C2XA 4IMGA 1OK6A 2H90A 4HPXA 2Y88A 4JICA 3EKLA 3W7HA 4AXKA 1PVNA 3LRMA 1FDZA 1A5CA 2ATSA 4YLWA 4WZHA 3QRHA 1WA3A 4JNMA 3R13A 1ME8A 5C55A 1G69A 5IBXC 3W7QA 2LLEA 3MHUA 3LI1A 3LHYA 1GTHA 1I8JA 1FWRA 3STEA 2ZRXA 3KVJA 4A21A 2A7PA 2A2IA 2GVJA 3EX4A 5AFDA 1O5KA 4H4IA 4NQ1A 1WOBA 3P74A 3P60A 3QSTA 3TU9A 2OX1A 3IGSA 1KFKA 3N73A 3L5MA 1XBXA 3SZ8A 3GK0A 2R8WA 1M7OA 4WY0F 3G3MA 4JTTA 1C8VA 1LORA 2BLEA 2O7SA 4M7SA 2PCQA 1VGAA 4IJBA 4PCFA 2QF7A 4MJMA 2V5BA 5K7JA 1YDVA 1RD5A 3HBLA 1K3UA 4IUOA 1RZMA 4EIVA 5HMSA 3BVJA 3M44A 1TMHA 2ZRYA 3NQ8A 5EY5A 2QCNA 4JD4A 3NEVA 3KVMA 2QCDA 4OBTA 3W2MA 4LC8A 3STFA 1WBJA 2OZ0A 4ADUA 1K03A 1THFD 3WJZA 3GXNA 3MHFA 3W7OA 5FEPA 3M41A 3DFTA 3Q58A 3BGGA 1JJKA 1KLYA 4RZ4A 4QISA 4WQ6A 4UMCA 3S0CA 4A29A 3R89A 5T26A 4ADSA 4TMCA 2X30A 3NM1A 3DFOA 1QO2A 1GQNA 3TSMA 3B0UX 1QO5A 3C2FA 4CLMA 4AWSA 3KRUA 5U4NA 3NQGA 1VLWA 4O12A 3BPWA 4BK9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3CIV A;  1XSI A;  4JTF A;  5HR6 A;  5FES A;  5AC4 A;  3OIX A;  1FKX A;  3WK2 A;  3N2X A;  4US6 A;  5JH1 A;  2E6Y A;  4KCV A;  2CLP A;  4Q7N A;  3L4T A;  1KCL A;  1LRQ A;  2WLZ A;  1PTA A;  3IAN A;  3B0Y A;  5AHL A;  2F2H A;  1KXH A;  1EIX A;  3AIE A;  2P3Z A;  3CUI A;  3SQM A;  5REQ B;  2Z28 A;  4TQT A;  4QEE A;  1YNQ A;  3T81 A;  2YCK X;  3VKB A;  1TV3 A;  4U5K A;  1E0X A;  4PMX A;  3T1G A;  1GKR A;  2ZX8 A;  2C15 A;  3CV2 A;  4HNL A;  4C6Q A;  5E6Z A;  8A3H A;  4EPE C;  1TO3 A;  3PJT A;  2PTX A;  3M0V A;  1DTN A;  3H7U A;  2VQU A;  4RXG A;  2RDW A;  5C2C A;  3NSX A;  4E4F A;  3HPS A;  4YTT A;  4B4H A;  3SAZ A;  1KRB C;  4JDB A;  3SJ3 A;  1JYN A;  3EOS A;  1OGG A;  3AZS A;  2JKA A;  4HA0 A;  3W1Q A;  3QW4 B;  1BPL B;  3EDE A;  1UR4 A;  3S47 A;  5CAK A;  4P8V A;  4NIL A;  4YU1 A;  3WUB A;  4ACZ A;  4H8N A;  1CYG A;  4H6Q A;  2EGZ A;  3WNK A;  3CNY A;  2AQV A;  4ZO8 A;  3AUO A;  4X2R A;  3OHI A;  3NOY A;  4AZB A;  3DDM A;  4RW5 A;  2WBK A;  2XWE A;  6PTD A;  3F2C A;  4GI6 A;  1HL8 A;  4LAK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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