4GE8A

Oye1-w116i complexed with (s)-carvone
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
SFVKDFKPQALGDTNLFKPIKIGNNELLHRAVIPPLTRMRALHPGNIPNRDWAVEYYTQRAQRPGTMIITEGAFISPQAGGYDNAPGVWSEEQMVEWTKIFNAIHEKKSFVWVQLIVLGWAAFPDNLARDGLRYDSASDNVFMDAEQEAKAKKANNPQHSLTKDEIKQYIKEYVQAAKNSIAAGADGVEIHSANGYLLNQFLDPHSNTRTDEYGGSIENRARFTLEVVDALVEAIGHEKVGLRLSPYGVFNSMSGGAETGIVAQYAYVAGELEKRAKAGKRLAFVHLVEPRVTNPFLTEGEGEYEGGSNDFVYSIWKGPVIRAGNFALHPEVVREEVKDKRTLIGYGRFFISNPDLVDRLEKGLPLNKYDRDTFYQMSAHGYIDYPTYEEALKLGWDKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords NADPH dehydrogenase 1
publication title X‑ray Crystallography Reveals How Subtle Changes Control the Orientation of Substrate Binding in an Alkene Reductase
doi rcsb
source organism Saccharomyces pastorianus
total genus 155
structure length 399
sequence length 399
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-08-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ge8A00
3DH7A 4KWVA 4CNOA 4FXRA 3TW7A 3MP5A 4JTSA 2D73A 1KTBA 4H4IA 1HO1A 4JY8A 3LV5A 3PR2A 3P80A 4Z1CA 3RF9A 4O0KA 4OWGA 3GNNA 2JK2A 4FF7A 3RLUA 4DPQA 3A22A 4OBTA 4C1KA 1FCBA 1R46A 1NSJA 4CQAA 1W5PA 2TYSA 5FF0A 2CFFA 4O1BA 1VRDA 1K7FA 1PIIA 3TSDA 1WXJA 2AGKA 1ME8A 3N34A 4JTEA 4WY0F 1S3HA 2JGYA 1SR9A 4ZQRA 2ISVA 3LHUA 3W7CA 4RXFA 3W7RA 4DF1A 1H5YA 1MO0A 2FTPA 4MLJA 2YX0A 1VLIA 1M7OA 3GKFA 1QNVA 2Y61A 3DFPA 4C1LA 2NXGA 3W2MA 4OHQA 2I9EA 5IBXA 2CZDA 1Q6RA 4IPIA 2FJKA 2AQWA 1PHQA 1W31A 3IGXA 1SU5A 1S5WA 3FKKA 4IMGA 3S0CA 4HPXA 1I2RA 2NX9A 1XKYA 3I6RA 5K4XA 3GDRA 3PUEA 1LLZA 3PY2A 5BOOA 2G97A 5AC7A 1WDWA 1Q3NA 3P81A 3VCRA 3DI1A 4HSNA 1W0MA 2O7SA 1W3NA 1TV5A 5AN7A 3I68A 3HG3A 4XZ9A 3LBCA 5E0KA 4ORMA 3OIXA 1GVRA 3TQVA 3NM1A 1FQ0A 1WA3A 2CZ5A 3H55A 3L9CA 2OZ0A 3MJYA 3W83A 1O5KA 2OCZA 4O19A 2Y70A 3IIPA 1VGAA 3STGA 5I3GA 1OFBA 5L9FA 4K37A 4D2JA 3MI3A 3VI2A 3QC3A 4GXMA 5CPLA 3S8HA 5AYXA 3UWWA 3W1TA 2JKEA 3NQAA 1WV2A 1MEIA 1OG0A 1OX4B 5I3JA 3PBUA 4YWIA 3NZ1A 5DN1A 3LHZA 2WOQA 1G67A 2QUVA 4WD0A 3LRMA 4ML9A 3V1PA 2QCCA 1KFEA 4E0CA 2ZZ4A 1QR7A 3W3OA 4U28A 2C13A 3ATZA 3TXVA 3B06A 3TA6A 4YXGA 3CB8A 4MUZA 1MZHA 3QF0A 3W73A 3DI0A 5CZJA 1EA0A 4NU7A 1ML1A 1HUVA 3PWAA 3W7NA 4I9AA 3M5ZA 3IRDA 3LGEA 5D30A 4PC8A 3OEXA 3NPWA 1TV7A 3QQ1A 1SW7A 4MY8A 1GTHA 2ISWA 3TE9A 2QCNA 2F7FA 2A5HA 4GWEA 1J5TA 4EOUA 2QDGA 4NQ1A 3GAKA 3W75A 4E2DA 3LCGA 1XDMA 5C2XA 3LLDA 5FF4A 3KOFA 1QOPA 1GPWA 4FNSA 5K3VA 4X22A 4MYXA 2VXNA 4H3DA 1I8JA 3CLMA 1TTIA 1N8FA 3T7VA 4Y8FA 3W1QA 3DZ1A 3C6CA 2CLEA 3EX6A 4IGHA 1TPFA 4JYDA 3TMQA 4MJMA 2ABBA 3L68A 3EX3A 3M7WA 5TBOA 4Y9AA 2Y6ZA 2ZZ2A 3LHTA 4EF8A 1PS9A 4FIQA 1HG3A 3R5EA 3NPVA 3L66A 4MLRA 4IMEA 1KTNA 2C6QA 2CLOA 1TPDA 2NXIA 1E51A 4ZVJA 1FWSA 2GVLA 1ZAHA 4JR5A 1OFOA 2VFFA 1LTDA 2ATMA 3EX1A 4ORIA 1K7EA 3F1QA 4TU1A 3TC6A 3B03A 3NQ6A 4P2VA 4BWLA 5D2VA 5AHNA 2Q3RA 3TV8A 7TIMA 2A7PA 1FWNA 1H60A 2QR6A 5HINA 1WBJA 3VE7A 5DBTA 1EUNA 2ZRWA 3C2VA 3JS3A 2B7QA 4PCFA 3O07A 2FFCA 1PCKA 5CG7A 3HIJA 5EYWA 3NL2A 3W7KA 3IVUA 5K4ZA 2VC6A 1DVJA 4JDYA 1XBXA 2ZFAA 4HNTA 4NZFA 1VCVA 4Z1BA 2DZWA 1Y0EA 5LNSA 1FXPA 3LB0A 1UUOA 4UNKA 5EBUA 3L5LA 1H7WA 3STCA 3DAQA 3LCHA 3S42A 3M5YA 3W76A 4UTHA 3R8RA 3U8GA 4WUIA 1LOSA 3NOEA 2WV8A 1JVNA 5L6UA 3I7QA 4UTJA 1OFDA 3Q37A 3W84A 2ZRXA 3P74A 4RCXA 4Y6GA 3NQVA 2E09A 3H53A 5D02A 2YW3A 1FCUA 2CZEA 1LRNA 3LXAA 3UWUA 3NEVA 4NNBA 3W88A 4I7WA 2WNQA 5KZDA 2H90A 3THAA 3UWYA 4MZ1A 4Q4KA 5BMXA 2H8ZA 2Z6IA 4JTKA 2FQIA 1ZJIA 4KFPA 4RR4A 2E77A 3B04A 4IX2A 4O57A 5G2HA 1N7KA 4RK8A 3NXFA 1TIMA 4GFSA 1TQJA 1Z48A 1EB3A 5LSMA 2OX1A 3P8JA 5GVJA 4DO6A 4JGDA 1UCWA 2O7QA 4K7VA 3CWOX 3LM7A 3H54A 1KM0A 5FF2A 3G1DA 1RD5A 3ZS4A 3HPXA 4UTWA 2VFIA 3FFSA 3UY7A 1QDSA 4AMAA 2CW6A 1GVQA 1ICPA 4LUIA 3W7OA 3GR7A 3SGUA 4EIVA 3M5XA 3BV4A 4X2RA 3W22A 3W7DA 4FNUA 1TB3A 5AB3A 1YLVA 2V2DA 4QSHA 2J88A 5HMSA 3DHDA 4DQWA 6TIMA 4JTFA 2V9DA 2A85A 3G24A 4GC4A 2R94A 3LCXA 3TROA 3NQEA 4UFMA 3RK8A 3STFA 4GNJA 3NQ2A 2DZVA 1K7XA 3MI2A 4IMCA 4AVFA 3R2GA 1EP1A 1WOAA 2JBMA 3M16A 2LLEA 1JUKA 4ADUA 1QPQA 3DXIA 1VH7A 4CNPA 2VFGA 1L9WA 4JX5A 2NXHA 2Z6JA 4EVZA 3Q94A 4IX0A 2YYTA 4P61A 2NZLA 2QCHA 3MWAA 4FX7A 4UCGA 2HTMA 5DCBA 1F5ZA 3L21A 3UXDA 1JQVA 2YSWA 1L6SA 1OX6A 1DQWA 3LXBA 4FXSA 2EF9A 3R13A 1T8XA 3CHVA 3SIZA 3ABSA 3SSJA 2NUXA 1WQ5A 4HSOA 1AW2A 4LS0A 3LTYA 4PA8A 3NYZA 3GYEA 3GIYA 3HQ1A 4LRSA 4LVAA 1IIGA 2E6DA 5CKSA 1KLYA 3BGGA 4FNQA 1K8XA 4IXXA 2P1FA 2WPBA 4N9DA 2TPSA 4FB7A 4AB4A 3C2OA 5AHLA 1RQEA 2QCGA 5HWJA 4YLWA 1OF8A 4JEQA 3PC0A 3W2NA 2P10A 3NL6A 3W87A 1X1OA 5AHMA 4DO5A 4RZ6A 3C4UA 1H7XA 3G1VA 1W5QA 4GBUA 1T0OA 4PTNA 3EWXA 4XKYA 3IIZA 4GUJA 3UZJA 4ZMGA 5H91A 2XN0A 3W2KA 5FESA 4MY9A 3T44A 1XDLA 3W1PA 1VQTA 2J6XA 3HGRA 3WJSA 3DKJA 3WJXA 2VFHA 5I3FA 2ZCGA 1OFEA 2QJIA 4JYEA 1W5OA 3ATYA 4JIPA 5KZMA 1JUBA 3W7LA 5D05A 4LS1A 1F76A 1TPWA 1VYSX 3MHGA 1TO3A 1W37A 4XBKA 4U4MA 1SSDA 1I2PA 3WK0A 4JTIA 4MOZA 4WJEA 4AXKA 5E93A 3IEBA 3P82A 3TXZA 3WK1A 1GJPA 1OFQA 4RKAA 1GVOA 3F03K 1LBFA 4LUJA 3LCIA 1VLWA 2NX3A 3GKAA 1KFLA 1W54A 5F1UA 4QAIA 5IBXC 3I7RA 3NG3A 5J5DA 1Z42A 2PRLA 3FLUA 4Z0SA 3TUUA 4LY8A 3QEZA 4HNVA 3FKRA 5K9CA 3M0ZA 4Z0JA 2A7RA 3HJZA 5G1TA 2H3BA 1F05A 3LCWA 4BI7A 3E12A 3FJLA 5G4WA 2HS8A 4QJ1A 4HNUA 3LRLA 3NQFA 4I7VA 5CZTA 2EGZA 2V5BA 2EKCA 2G95A 1KM5A 2WKJA 3PULA 3W1UA 3F4NA 3U6WA 1AW1A 1JRCA 1KM2A 4Z08A 2BZNA 3LX9A 4JYFA 4TO8A 1VR6A 3WJWA 3EXRA 2J9ZA 4LOCA 1AL7A 1W56A 3SY5A 3UPBA 3MI6A 4BI5A 4NJGA 3DKLA 3QPYA 1NAL1 3BW2A 1I2OA 3W2LA 3TX9A 4JX6A 1AG1O 3N19B 5LZLA 1GOXA 4K36A 1TCDA 3QRHA 4L4LA 3NQ7A 5CZ0A 3QW3A 3CU2A 4M7SA 3BO9A 4TIMA 2BWGA 2RKXA 2YR1A 4UTUA 1I2QA 5LNVA 2ZA3A 1ALDA 2WSQA 4N6FA 1P1XA 3M1ZA 4DELA 1WOBA 6ALDA 1NF0A 2JKPA 2I14A 3A24A 1SFJA 1LLWA 3W71A 3E02A 4A22A 4UFKA 2WQPA 3I7SA 5D2YA 2H8XA 1ZAJA 2DZSA 3LHWA 4AWSA 5F1VA 2NX1A 1X8FA 2Z2UA 1TJPA 1LZOA 1UBSA 1K8YA 3O8AA 2CLMA 5J5RA 5AHIA 2B4GA 2QKFA 4UFLA 2V0TA 2QCFA 4M19A 1K8ZA 3C2RA 5CGQA 2ZZ7A 3PSWA 2R14A 1U83A 5LGZA 3R12A 1WAUA 3IIVA 2ZZ3A 3L2IA 1R2SA 4MKNA 2VEMA 3FIGA 4CQ9A 2Y7FA 1V5XA 3GDKA 1B4KA 3LTPA 4RLIA 1ZHAA 2BXVA 2X2GA 2VEIA 3TC7A 5U4NA 2E5DA 4ONVA 3HG2A 1AK5A 3EEGA 4GUIA 4JN6A 2QCMA 2XFWA 2FPVA 4O15A 2PURA 2QDHA 4MPQA 2EPHA 5FEPA 1R30A 5AYYA 4Z1AA 1DKWA 1EX5A 1OFAA 4YL2A 4S2CA 4TMCA 5D33A 3NM3A 3P67A 1XC4A 1WX0A 5F4XA 1TTPA 5HR6A 1LDCA 4M6PA 3B0VC 3LI0A 1H7NA 3EWBX 2HSAA 4TMBA 4DBDA 3W72A 1A53A 5D04C 3E9AA 8TIMA 1G6CA 2H6RA 3B05A 5KSWA 3T55A 4FIRA 1FDZA 4IQLA 4XKYB 5HUPA 3EKLA 1TRDA 5CZSA 3RLVA 1U5JA 3NQ8A 1AL8A 4GE8A 4QM1A 1B4EA 4PFMA 3KRZA 1JR1A 3LCLA 1SW3A 3QJAA 3QM3A 3NR0A 2NUYA 1BWKA 2YPIA 5HUOA 2ATSA 1P4CA 3LDVA 1P0NA 3KRSA 1OYBA 3CTLA 3LCFA 2GOUA 4GUFA 3A21A 1KM1A 4JTLA 3LRKA 3UYCA 1SPQA 2ZTKA 3VNDA 4BWLC 4M7TA 4L4MA 3BG3A 1F7BA 2B7OA 4ZQMA 3EWZA 2Q8ZA 5F2IA 3PB0A 3FYPA 1DORA 3O6YX 4OGZA 5DY2A 4IXHA 1KLZA 2YCEA 4JNMA 4QITA 1ICSA 5ABTA 4FEZA 4BR1A 1QOQA 2DU2A 2CLKA 1ONRA 3U2OA 2FLIA 4RV8A 3KVKA 5AC6A 4OU1A 3MYOA 1PE1A 1RQHA 2F84A 4R34A 3RFAA 2YZRA 2PE4A 4K6AA 3G1SA 4ADTA 1GYLA 1PHWA 1KM4A 3EXSA 1FX6A 1EP3A 2DZPA 4FX8A 4R53A 4XTDA 1J4EA 2X16A 3UWVA 2X1RA 1FWTA 4AHOA 1JJKA 5D2XA 3HPZA 4MFEA 4WOZA 1QFEA 1VYRA 3SFKA 1VZWA 2ZRYA 1YXYA 4BFAA 1F6KA 4NT0A 4O12A 1EP2A 1EUAA 1L6WA 5DCDA 1EPXA 1T96A 3DFSA 3QW4B 1DQXA 2R91A 1M7PA 3G3MA 4KFNA 5DY3A 4NX5A 3C2FA 3S1WA 2OT1A 4DO4A 4UR8A 4Y96A 3ABOA 3C3NA 3S9YA 2AAMA 3MP4A 4O1CA 4ZL1A 1QO2A 1ZNNA 2HMCA 1D9EA 3QH2A 3S5NA 5HR7A 2X1UA 3Q2DA 3TIMA 2RDWA 4GRSA 5MHBA 1FXQA 5F2MA 1A5AA 1TPEA 4LU0A 1GVFA 3TQKA 1W3IA 3UQNA 3W1MA 3W7IA 1PCWA 4IJBA 3TK7A 2DJXA 3N9SA 4Q32A 2VELA 3W7EA 1G69A 3W1NA 1JRBA 2ABAA 4HN4A 4BK9A 4JICA 4UTWC 1K02A 3IVSA 1H1YA 1KBIA 3GVGA 4K8EA 1XL9A 2E5CA 4JDBA 4JY9A 3W7QA 3O06A 4MYAA 1AW5A 3NL3A 4LC6A 2C16A 1DBTA 3G3DA 4LTSA 3NNTA 5G2IA 3MMTA 4HPJA 3HG4A 3GDTA 3OVPA 1D3HA 3CEUA 4BI6A 3GB6A 1NVMA 3ABRA 3TR2A 2X30A 4OV4A 1F2JA 5LKYA 3EKZA 3L5AA 3JR2A 3FS2A 3P8IA 3W7PA 1ME9A 4K38A 1NF7A 4NJIA 3C2EA 3EX4A 1W5MA 2V30A 3C8FA 4LC8A 1Q6LA 2Y7EA 3STEA 4A3UA 1MEWA 4UIOA 5G2WA 1TYGA 2BLEA 1LRQA 3N2MA 2PRMA 3HGJA 3K30A 1GZGA 4WQ6A 1OFPA 3GXPA 3SJ3A 3G0SA 1M5WA 2A6NA 1M6JA 1SW0A 4K7YA 1DHPA 1VJIA 1F6PA 4DF0A 2C18A 1SFLA 2Y88A 2DP3A 3IIXA 3IVTA 1J2WA 1W1ZA 1VPXA 2CLHA 3PBWA 1Q6OA 1OFRA 5BMWA 2J9YA 3O16A 3W23A 3LTSA 1GVSA 2G5WA 2A4AA 4QIUA 4LNYA 4MVAA 4N02A 2RDUA 2Y7GA 1LOLA 1PVNA 3L65A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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