4GJ1A

Crystal structure of 1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5-phosphoribosylamino)methylideneamino] imidazole-4-carboxamide isomerase (hisa).
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
242
structure length
229
Chain Sequence
TQIIPALDLIDGEVVRLVKGDYEQKKVYKYNPLKKFKEYEKAGAKELHLVDLTGAKDPSKRQFALIEKLAKEVSVNLQVGGGIRSKEEVKALLDCGVKRVVIGSMAIKDATLCLEILKEFGSEAIVLALDTILKEDYVVADKKLMEVLDFYSNKGLKHILCTDISKGVNVRLYKLIHEIFPNICIQASGGVASLKDLENLKGICSGVIVGKALLDGVFSVEEGIRCLAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords 1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5-phosphoribosylamino)methylideneam
publication title Crystal structure of 1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5-phosphoribosylamino)methylideneamino] imidazole-4-carboxamide isomerase (hisA).
rcsb
source organism Campylobacter jejuni subsp. jejuni
total genus 72
structure length 229
sequence length 242
ec nomenclature ec 5.3.1.16: 1-(5-phosphoribosyl)-5-
pdb deposition date 2012-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4gj1A00
5FF3A 3C2RA 1MO0A 4NVTA 3BV4A 3HPSA 3DFNA 2CZFA 1ICPA 4ZL1A 3PR2A 1QPNA 3CWOX 4JTEA 3EKZA 2NX3A 4UNLA 2C14A 3HMJG 3G3MA 3N34A 1VPXA 2NUXA 5F1VA 1GPWA 3DHFA 4MY1A 4PCFA 4JEQA 4UFKA 3L9CA 2TRSA 5D04C 4RXGA 3W72A 3NQ6A 2G95A 4OU1A 1SZGA 1LM1A 1ZAIA 1W5QA 4L4MA 4S1FA 2OT1A 3LTSA 2GQAA 1MSSA 2R91A 6TIMA 2QCFA 4TMCA 3W74A 1YTKA 3M5XA 3PVFA 2X2GA 4N4QA 5K2ZA 3GDTA 3O16A 3L0KA 2J9ZA 3F1QA 1TYGA 4NNCA 1JCJA 1TREA 5EBUA 3UY7A 3G1AA 4ZQNA 3NEVA 4O50A 3N9SA 2WSRA 2ZA1A 3KRUA 2A7NA 5I3FA 3LERA 5AOUA 4JYEA 1QFEA 4LV9A 4M6PA 3B04A 3W1PA 3G24A 1FDZA 2BXVA 3FJLA 1W3NA 3C2VA 2GVJA 4HHPA 1GOXA 5DBTA 1OFRA 1GWJA 2CZDA 3QSTA 2P1FA 4PODA 3A5VA 1W31A 1WYIA 1OFOA 2E5BA 3QMRA 2DZVA 3OEXA 4LOCA 1RPXA 4MPQA 1T96A 1K7XA 3NQFA 1IXOA 5AC8A 3BW4A 4K8HA 3KFTA 3NVTA 1Z44A 3EWYA 4Q33A 4JTSA 3FKRA 1IXPA 2QUVA 5CGQA 1F6PA 1FUYA 3O1NA 2CZEA 1WOBA 2E1DA 1SZNA 3N14A 4RZ4A 2ZTJA 1OFDA 3GK0A 3WK3A 1QR7A 4GJ1A 5AYYA 2FJKA 4FXSA 2X1RA 4UTWA 4LS0A 5BRBA 3GXTA 4O1BA 1A5SA 3GXNA 3W88A 1LBLA 5HUOA 3E12A 3O8AA 3PS7A 3DKLA 4JTIA 2FQIA 4FX6M 3DFTA 3INPA 5IM51 5LHFA 4LVGA 3G0UA 4ADSA 4QISA 3W3OA 4NT0A 4RLIA 3R89A 3GYEA 3LI1A 1JCYA 1FBAA 4AHQA 2A85A 4XTIA 3WJSA 1KM2A 4QSHA 2BWGA 1B3OA 3TSMA 3UQNA 2QCDA 5AHLA 3DENA 4O57A 1G69A 2E5DA 1M6JA 2YFOA 2H3DA 1H1ZA 3M43A 2YX0A 2CLEA 4AF0B 4ZMGA 4UTLA 3UY8A 3NPUA 5DCEA 1T8XA 1LZOA 1IF2A 3GIYA 3GAKA 1FWRA 4NX0A 2PURA 1D3HA 1HUVA 4QNWA 4AB4A 4FB7A 1EB3A 4O13A 3I65A 3VKJA 4OT7A 4XZ9A 4D2JA 2Q3RA 5AYXA 1SU5A 2YR1A 1K03A 2I14A 4KFNA 1YXDA 3GDRA 5I3KA 3QPYA 1T0OA 3M44A 4FX7A 3IVSA 5HINA 3QQ1A 4X3ZA 1FWNA 1R2RA 2FFCA 2VFEA 3PB0A 3QJAA 4O4WA 4PC8A 2YZRA 3TDFA 1F2JA 2EPHA 2QUTA 5FEXA 2ATMA 3W7DA 2Z6IA 4OWGA 5LNWA 1XXXA 1W56A 4YXGA 3W1NA 1WDWA 2Y85A 5D05A 3MP5A 1FWWA 3RLVA 1LLZA 1LLWA 3DXIA 5AYZA 1P0NA 4NUWA 1RV8A 3G3DA 5AHIA 4O4VA 3RF9A 2H8ZA 5DXXA 3C2FA 3DAQA 2NUWA 4QQ3A 4PH6A 2A0NA 1BKSA 3EEGA 3G8RA 1TIMA 2D73A 1Q3NA 1TTPA 1L9WA 2V30A 1HO1A 5FEWA 5H91A 4PA8A 4GNJA 1M7OA 4LTSA 4I7WA 1OX5A 3H54A 3L21A 3E02A 4IJBA 3W85A 3QMSA 3I7QA 4WJEA 5I3HA 3M16A 2AAMA 3SECA 5K4XA 3TCEA 3MW7A 4M5PA 5CSRA 1SW0A 1YPIA 3KVMA 1QNVA 3KOFA 4K39A 1ME7A 4XKYB 1SW3A 5KZMA 5HULA 3ZWTA 1FQ0A 3BO9A 1YTEA 1XDMA 3VE9A 1ONRA 3S6DA 1RQEA 2ZRZA 1TPWA 4H3DA 2A2IA 3LXBA 1I2QA 1VQTA 4UIOA 3TQ0A 2BLEA 4DO4A 4WY0B 1JCXA 1F05A 3NDOA 4O14A 3Q2DA 1ZALA 3LV5A 3PBYA 5DCBA 3W1MA 3EX4A 4NZJA 4FNSA 2VKZG 4PL2A 2YPIA 3F03K 3WJWA 2H6RA 5BOOA 2E6DA 2A1YA 2CLFA 1I2RA 3TJLA 3BLFA 3P7YA 4MOZA 2CLHA 4NNAA 1Q45A 3UXAA 3TE9A 3E49A 4ZQRA 1KFLA 4CNPA 2YFNA 3M0ZA 1KBIA 4UTTC 2TPSA 4JY9A 1A53A 1L6WA 2QF7A 3R5EA 4IGHA 5E0KA 4LVBA 2C1HA 1GYLA 1EWDA 5DXYA 4UNKA 5FEPA 1O60A 1J2WA 3G1FA 2ZFAA 3Q94A 3M7WA 3TK7A 2ZRXA 4YL2A 2F84A 3MHFA 4EF9A 2OMAA 5D2WA 1X7FA 2VOMA 4TR9A 3DHDA 2NV1A 5A5WA 2RFGA 1LOLA 1WAUA 4E0CA 5LNUA 2VEMA 3KXQA 1W8SA 3W7GA 1K3UA 1LRQA 2ZQ0A 4O1DA 2QCLA 1OABA 4CQ9A 3P67A 1G4PA 2RHGA 2Z1BA 3W2JA 4A22A 4JD4A 1UJPA 3LCFA 3UWUA 5E1QA 3GB6A 1K7FA 1S3HA 3W7EA 1DQXA 4KWVA 1TJPA 3SJ3A 1KA9F 4O17A 3N2MA 3HO8A 3CM4A 3M5ZA 4WY0F 1YLVA 1C8VA 4UC5A 4C1KA 3S1UA 4HNVA 5C2XA 3NAVA 1QCWA 3TFXA 3W70A 1JR1A 4WZHA 1G4EA 3SR7A 5D37A 3CPRA 4R34A 1H7XA 5D2VA 1Q6QA 2YW3A 4RZ5A 3RU6A 5IBXC 1FDJA 3M1ZA 4BI6A 1O5KA 1YXYA 3HGJA 5G2HA 3NOEA 4IMCA 5G4WA 2ZZ7A 4PFMA 2CLLA 3DU0A 1FWSA 3STCA 3TIMA 2VEIA 4S2BA 2TMDA 3USBA 3L66A 5CPLA 5G5IA 2HS6A 1S5TA 1GTHA 5DY2A 4CNNA 3G1SA 4Q32A 3UXDA 2ABBA 7TIMA 2V5LA 3QH2A 3NZ1A 4M6QA 2QUUA 1SR9A 5I3IA 1AW5A 3ATYA 1AW2A 5G1TA 1PIIA 3TAOA 1AMKA 4FNUA 4UFMA 3SGZA 4NJJA 3M5YA 2TYSA 1PE1A 1EWEA 1RD5A 1TB3A 2XN2A 3W75A 3NNTA 1TSIA 1EIXA 2Y63A 2A7PA 1XC4A 5AC6A 4DPQA 4W9TA 1HG3A 2H3BA 3EWWA 4MFDA 3W86A 1VLWA 5DCDA 1BEUA 1X1ZA 4BK9A 2E68A 3HIJA 1H60A 1Q6OA 1SSDA 4N2YA 1IIGA 1EEPA 3TH6A 2O7QA 2P0OA 4EVZA 2YDAA 2AQWA 3NL6A 1K8YA 3LRMA 1H50A 5ABTA 4FNTA 2Y88A 4RR4A 3HB9A 1Y0EA 2Y61A 1J4EA 3HJZA 4IPJA 4MUZA 1KTNA 4Z1CA 1TPEA 4ICNA 4LRTA 3TAKA 1GT8A 2Q8ZA 2V5BA 4H4IA 3RFAA 3PBWA 3W9ZA 1TPFA 5K3VA 1QO5A 3T7VA 3TFCA 5A8GA 2GVLA 4AMAA 1XFBA 3ZR4A 3HGSA 4HNUA 4MYAA 1W1ZA 1GVFA 4K37A 1EUAA 3FIGA 1JCLA 3EXSA 1TPC1 3CC1A 5F2LA 3TJXA 2ALDA 2NLIA 1A50A 2B7NA 1H61A 3LXCA 2P10A 3H53A 1XL9A 1OHLA 5KZEA 4CLMA 1A5BA 4M6VA 4Z0JA 3HG3A 3SZ8A 1MEWA 3W73A 2B7QA 5K9CA 2GOUA 3BARA 1KTCA 4ORIA 4A29A 1G7UA 3C2OA 5F4WA 5IBXA 1YTDA 1OF6A 1RQHA 2A7RA 2ZZ2A 2WNZA 3CHVA 3S1XA 4UTWC 5KZDA 2E6FA 2RH9A 5EMUA 3W71A 4AEOA 4N6FA 1VCGA 2EHHA 3W7CA 1W5OA 2ZZ5A 1I2OA 3S5OA 2HTMA 4JTUA 1SFJA 1T99A 3CTLA 4DQWA 4JTGA 4JTHA 1V5XA 2B7OA 3OA3A 3V75A 1B9BA 3MMTA 4UFJA 4HKPA 3UNDA 1VYRA 1FXQA 4UUIA 4AHPA 3TKFA 1QPQA 4Y6GA 3P81A 2WQPA 1XUZA 3PSVA 1HO4A 5TBOA 3C2EA 3I7SA 3W07A 2NX1A 2Y62A 4WOZA 3IIPA 3B0UX 1A5AA 1ZAHA 3QZEA 4M7SA 2QCGA 3LCWA 1H7OA 5LNRA 3VI2A 5D02A 2XFWA 1OF8A 2DZXA 1WV2A 3WFAA 3LRLA 4POCA 1OYBA 3LXAA 4UR8A 2QEZA 4O1AA 3MHUA 1SFLA 4NJHA 5AB3A 2C15A 3CB8A 3YPIA 1G4TA 3A23A 5KINA 4JX5A 3SSJA 2E5CA 3W7QA 1KV5A 2V2DA 2GQ9A 5D2TA 2WO5A 3HG5A 3GLCA 3NGJA 1W0MA 5CPMA 4DBDA 1UB3A 3B05A 3U8GA 4I7VA 4DF1A 4DXVA 2QCCA 1XKYA 4NQ1A 1LBMA 4HIBA 3TQVA 3O06A 1ICQA 4XBKA 2X30A 4JYFA 2Y70A 4S2CA 1DBTA 1CX9A 4QITA 3STGA 2YYTA 5CSSA 3LX9A 4RJEA 4JNMA 1F76A 1BTMA 3HF3A 1GEQA 4K6AA 4B5NA 1A5CA 3KRSA 5FEZA 3W7OA 3CEPA 4QNEA 4N4PA 3NQVA 4OV4A 2BSLA 2DJXA 3W1TA 2PRHA 5DN1A 1L2UA 4LRSA 1CI1A 1OJXA 4ML9A 1DKWA 3C4UA 2ZA2A 2ATSA 2QCHA 1OK6A 3WJXA 2WSYA 1PL9A 5EL1A 1H62A 1GVSA 1OX4B 1FXPA 2ZZ6A 3PG9A 2G5WA 3CU2A 1OFAA 4DPPA 4O18A 1TTQA 3W2LA 2ISVA 3KRZA 1RZMA 2ZBTA 4FNQA 2NUYA 3HOJA 4E2DA 3BK0A 4J9JA 4JS3A 1W5NA 3EXRA 4QM1A 4CQAA 4PTNA 3MP4A 3LHTA 3TMLA 1KFEA 1JCMP 3S8HA 3TXVA 2H8XA 3QFEA 3QSRA 3I68A 3S1WA 4O19A 1SO6A 4JX6A 4AH7A 3PBVA 1B57A 4EIVA 5LGZA 3MI6A 3DH7A 1M7PA 1U5JA 1R47A 1O4UA 3HQ1A 1GQNA 2JKPA 3OHIA 1TO3A 1ZFJA 5HWJA 3UD6A 3BG3A 1J5TA 4K38A 2X16A 4O10A 4GFSA 1H7RA 5K9DA 2ZCGA 1F74A 1K7EA 1P1XA 3P8JA 5FF7A 3WK0A 3K30A 3EX3A 5HUPA 1NAL1 3FKKA 5CPNA 2C3ZA 5LSMA 4HT3A 1GVOA 1H7WA 1UUOA 2QCMA 2VFGA 4FIRA 1O5XA 3LB0A 3VFLA 3AO0A 1TCDA 1VR6A 2CWNA 4O12A 5GVJA 3BLIA 3DFPA 3BG5A 3B06A 3E96A 1N7KA 1WX0A 2C16A 2EGZA 3GDMA 2XN1A 2V82A 3W1RA 5KITA 3FLUA 5HWNA 5EA9A 3TW7A 4LVFA 4WXZA 4JTTA 4KKXA 3CLMA 2QAPA 3SIZA 5H2ZA 3UWZA 3NG3A 5AHEA 3NR0A 1F6KA 1V7YA 3TV8A 2AGKA 1AL7A 2X1SA 3W83A 4UFLA 3GR7A 4NJIA 1ME9A 4NXKA 3EWUA 3EKLA 3EX1A 1DHPA 1GVQA 5FESA 1H5YA 3NO5A 3FS2A 5D33A 3B4UA 4GUGA 1H7PA 2WV8A 2FDSA 1HTIA 3A9IA 3D0CA 1R2SA 5F2GA 3OG3A 3OVRA 1YYAA 3P62A 4X9SA 1DORA 3L5AA 4GRSA 3IGSA 3TQKA 1ALDA 3L0GA 4BWLA 4IOTA 3HBLA 1SO3A 4QIUA 4FIQA 2ZZ1A 1YDNA 3QM3A 5J5DA 3WJZA 1O94A 3NA8A 2Z0IA 2JGYA 3WK2A 2ZZ4A 3MUXA 2FTPA 4DEFA 2FB2A 5K4ZA 4MKNA 5LNVA 3JRKA 1UASA 3SFKA 5HMSA 1JQXA 1MXSA 2Z2UA 3EX6A 3W1UA 3EWZA 3SGUA 2YXGA 1VRDA 4JICA 1ZCOA 3NPXA 1KTBA 4MFEA 4JR5A 1PCWA 5F2IA 1EPXA 4LY8A 2EF9A 2ZDRA 1HFBA 5AN7A 1XUUA 3N19B 4JTJA 4BI7A 4Y8FA 3C52A 2EKCA 1I2NA 3TUUA 5E93A 2NXGA 4R53A 3S5YA 1HL2A 1I4NA 1PS9A 5K9XA 4G1KA 2V0TA 4O53A 3G18A 4DO6A 3KHJA 3B0PA 3QEZA 3DI1A 3M41A 5FF4A 1NSJA 4H6KA 3HGRA 3P61A 1MZHA 4KFPA 5C54A 1UUMA 4R33A 3DFSA 4MLRA 4GUIA 5D30A 3GNDA 3EWXA 1W5MA 3W84A 5AHFA 1KLYA 1PVNA 2WPBA 3W7LA 2WJZA 1LYXA 4FNPA 4JY8A 3NQDA 3G1YA 1W3TA 3U2OA 2WNNA 3G1HA 1D9EA 4LUJA 4OE7A 1KV8A 2TSYA 1ZJIA 1NEYA 3QMTA 1KM6A 2PRLA 4LNYA 1LRTA 3I6RA 2CLOA 1JRCA 3NPWA 3B8DA 5EKYA 1C9DA 2DZPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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