4GRVA

The crystal structure of the neurotensin receptor nts1 in complex with neurotensin (8-13)
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
461
structure length
454
Chain Sequence
NSDLDVNTDIYSKVLVTAIYLALFVVGTVGNSVTLFTLARKSLQSTVHYHLGSLALSDLLILLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYATALNVASLSVARYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAIPMLFTMGLQNRSADGTHPGGLVCTPIVDTATVKVVIQVNTFMSFLFPMLVISILNTVIANKLTVMVNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLNNKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYGSGSVQALRHGVLVARAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQWTTFLFDFYHYFYMLTNALAYASSAINPILYNLVSANFRQV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein/agonist
molecule keywords Neurotensin receptor type 1, lysozyme chimera
publication title Structure of the agonist-bound neurotensin receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 154
structure length 454
sequence length 461
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4grvA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4grvA01
1S52A 166LA 5JJEA 3HAPA 1L92A 196LA 252LA 3HWLA 2PEDA 1OYUA 3DMVA 1CU6A 3ABWA 1GU8A 1F88A 1MGYA 1L44A 214LA 1S8JA 3C9LA 1LW9A 118LA 1P37A 3EH4B 238LA 1C6CA 1S53A 2ZFEA 119LA 1L50A 1X0K1 3RUNA 1L35A 156LA 4LDEA 1L65A 1L94A 1G0QA 1R84A 1XIOA 1QT3A 1L76A 1VGOA 3QBKA 4G70B 3X3BA 3SN6R 2RBRA 184LA 1EPYA 210LA 2KS9A 4AMJA 4BVNA 1JTNA 187LA 164LA 1DYCA 1L01A 3MBVA 3HTFA 2NTHA 1L60A 2O7AA 2OE9X 197LA 3QJTB 1XJUA 5ITEA 4XT3A 2A4TA 5AWZA 143LA 1L57A 3CDVA 3VVKA 1SSYA 1QHJA 2RBQA 4PXKA 1C8SA 222LA 3OE9A 111LA 3C83A 3HUQA 2LNLA 1GZMA 3C9MA 1BRRA 1L62A 213LA 2RB2X 3G3VA 3HASA 1L69A 1C65A 256LA 4UHRA 1L95A 237LA 4XTOA 2YCZA 3AYMA 122LA 1G0JA 1SWZA 3HH5A 3ZPQA 3HU8A 3A7KA 1P56A 3NY9A 1M0LA 3C80A 2F2QA 1GUEA 4L6RA 230LA 4ARQA 1L23A 2WJKA 4ARQB 1QUDA 3NS0A 4PJZA 1PY6A 1L31A 107LA 1ZWNA 139LA 247LA 4I7LA 1IXFA 1P8HA 2G87A 5LWEA 140LA 1M0KA 1LYFA 130LA 1KS3A 3FI5A 1L11A 3F8VA 3D4SA 3BVDB 4QI1A 1C6LA 151LA 1NHBA 2QPEB 168LA 1L83A 1PQOA 1E12A 1P6YA 2J4YA 4IB4A 1QTCA 5F8UA 148LE 1L61A 178LA 3C82A 4BEZA 1PXRA 1L72A 1L59A 4PK0A 3DN1A 5AX0A 4LZMA 2JAGA 165LA 195LA 3ODUA 1L09A 1DYAA 1P46A 2B6XA 198LA 220LA 3CDQA 1IW9A 6LZMA 1S54A 3PBLA 128LA 1C66A 3UTVA 4W59A 2KSBA 129LA 1C64A 1DYBA 1L40A 1QKOA 1HZXA 1EHKB 1L45A 3G3WA 162LA 1C6HA 1CU2A 1T8AA 1L68A 1L05A 223LA 1C6DA 3CDTA 2RAYX 3DNAA 149LA 1L04A 1L12A 260LA 2YDOA 3S3BB 4I7NA 3HAQA 5ITCA 1DYDA 4GPOA 1JQUA 1PXSA 1CX7A 2OU9A 3COCA 2B6TA 2RBPA 1JFPA 3ZPRA 219LA 1JV6A 1L19A 3SB9A 4NC3A 5H2HA 2KSYA 1FBBA 3SB7A 4W56A 2O79A 4BEYA 3S8FB 4EPIA 200LA 1Q5IA 3QJSB 4IAPA 4MD2A 1XJIA 3SBAA 188LA 3C8SA 155LA 2B6ZA 1X0SA 3QJVB 1G07A 4W54A 5AHYA 125LA 1QUHA 4EKRA 1L26A 5AX1A 1T97A 4IAQA 102LA 3C8RA 1CWQA 1L13A 3C7YA 4HWLA 1CUQA 1CVKA 228LA 167LA 1CX6A 1T6HA 5B6XA 1L16A 2Y00A 2HUMA 3GUPA 1X0I1 1P36A 1ZURA 3HH3A 1QUGA 1KMEA 3WQJA 3HT6A 1L51A 261LA 4EKSA 3HAOA 1L15A 2I21A 1D3NA 4IARA 3DMZA 3HARA 1BRXA 4XXJA 1L84A 1L20A 2ZZLA 5H2JA 2Z55A 1L14A 3S8GB 250LA 2B70A 1OV5A 180LA 1PQIA 3RFMA 1XEPA 4XT1A 4G7SB 1C67A 1L00A 1PQMA 4X31A 123LA 3S3DB 3PQRA 1U19A 3F9LA 146LA 248LA 217LA 262LA 4W51A 5B6VA 108LA 4GBRA 1L0JA 239LA 170LA 4W52A 1C63A 5A8EA 1L18A 1QM8A 4QIDA 3GUNA 4I7RA 1L29A 1QTBA 1QTVA 1C6NA 2Z73A 182LA 242LA 2B75A 1C6BA 1LGUA 201LA 4LDLA 171LA 142LA 3AM6A 4AMIA 1LGXA 2HULA 257LA 4DAJA 1L58A 4EKQA 1OWZA 2X72A 4FBZA 104LA 1L79A 4PXFA 1OVHA 1L90A 1PQJA 2Z6BA 1H2SA 5AZDA 3UTXA 5I14A 1L70A 5EN0A 2B73A 189LA 147LA 5BR5A 1P3NA 5H2LA 3LZMA 1F4ZA 7LZMA 1H68A 2JAFA 1C6GA 2YCWA 1L27A 1S8LA 2RBNA 3PWHA 1VJMA 3DQBA 2I20A 2BRDA 3DN4A 2L78A 2L6XA 4FPDA 1SX2A 251LA 4A4MA 4K5YA 1G1VA 3VG9A 1C6IA 1L91A 1D3MA 4G7QB 127LA 2RH1A 2IGCA 2LC9A 3VW7A 4ARPA 3OAXA 4I7OA 4UG2A 2I1XA 3HUAA 1L47A 3UG9A 1DYFA 218LA 1G0GA 1LGWA 3CODA 1FBKA 2Y02A 5B6YA 4G72B 1P7SA 254LA 3GULA 225LA 2F93A 4BUOA 103LA 1CV3A 4W55A 1C6FA 3CAPA 4EA3A 1L25A 4ARMA 4JR8A 3SB8A 1LI2A 2EI4A 1QSQA 192LA 2HPYA 160LA 2YCYA 5B6WA 4I7PA 4S0WA 4ARMB 126LA 1BM1A 3OE6A 141LA 1L49A 4GRVA 1L71A 110LA 1G0KA 4L35A 1E0PA 3HT7A 212LA 5LZMA 1TLAA 3NSBA 4EJ4A 1L48A 1ZYTA 1C6TA 4KLYA 4E97A 5DYSA 1JV7A 2I35A 1R2NA 5H2OA 4I7JA 3REYA 3S3CB 3HH4A 4Y9HA 4WAVA 3P0GA 3HTGA 3SB6A 2M3GA 152LA 2WJLA 3QDCA 1L98A 1WTHA 1S51A 255LA 3PXOA 1L86A 4N6HA 1G06A 1L41A 1L37A 1L73A 241LA 1SWYA 1G1WA 1O0AA 4HYJA 3UTWA 3X3CA 2OU8A 2AT9A 1LYHA 1L21A 199LA 191LA 1L32A 240LA 181LA 157LA 231LA 2RB1X 3GUOA 2YCXA 3QBGA 109LA 1T8GA 3NYAA 1LN6A 2NTWA 3HUKA 1L30A 1P2LA 1L28A 227LA 3DN3A 3DN0A 1KY1A 4W53A 2Y01A 1LWKA 1TN5A 1L96A 4LDOA 1KNIA 1C6PA 114LA 2QARC 3HTDA 3UZCA 1SX7A 2QB0B 1L33A 3FADA 2LCBA 144LA 2KSAA 1OVJA 112LA 169LA 3AYNA 4FAAB 3DDLA 234LA 243LA 5DHHA 5A45A 4EKPA 4YXCA 1L0MA 1CV0A 1CV4A 1QT8A 1LYDA 3SB5A 1DZEA 1L0KA 1L77A 1C6AA 4EXMA 4TL3A 1CV1A 1C3WA 1AP9A 1L99A 1CU5A 2O4WA 4I7TA 4N4YB 4MBSA 3HDEA 1L55A 2OE4X 163LA 3C7WA 1M0MA 4WW3A 5G2AA 1L34A 3GUIA 1PQDA 185LA 3T45A 1QS9A 1L43A 2F47A 1L38A 4DJHA 2Y03A 186LA 2OE7X 1D9WA 4G7RB 3C81A 1LYIA 5H2KA 138LA 1C60A 1L87A 4I7SA 4BWBA 113LA 1L80A 3UZAA 1JGJA 205LA 3DN6A 1L63A 1L06A 5G36A 5H2IA 4BV0A 4J4QA 2F32A 249LA 3GUMA 4W58A 216LA 3CDOA 1L82A 1LYJA 2RB0X 1L17A 1AT9A 3QBIA 4GBRB 1QTHA 1KW5A 5DHGA 5B2NA 1QT6A 2CUUA 3HDFA 1IW6A 5KKHA 1L39A 1QT4A 3HANA 4MQTA 1L10A 5ETZA 5G53A 172LA 1I6SA 3EMLA 3QJRB 4GYCA 4XTLA 258LA 245LA 4JKVA 1L89A 190LA 1C6KA 224LA 1L97A 1D3JA 1D2WA 1KY0A 4EIYA 5G2CA 3L2XA 3NY8A 159LA 1SSWA 1LWGA 2R4SA 1C6JA 259LA 2OEAX 206LA 1L52A 229LA 2R4RA 5G54A 145LA 3DMXA 1PQKA 1KG9A 1LI6A 4I7KA 4G71B 3VGAA 1Q5JA 1UAZA 173LA 1CU3A 1L24A 3VHZA 4ZPUA 4W57A 1K28A 1QT5A 1T8FA 1L56A 1LPYA 5C1MA 1CV6A 1KGBA 2F95A 3QBLA 2B7XA 1L85A 1G0MA 3KJ6A 5H2NA 5TGZA 2VT4A 4GP4B 5B0WA 4HYXA 5BR2A 4KNFA 1L67A 1QKPA 158LA 3HH6A 4XTNA 3QJUB 1L03A 233LA 1L07A 1C69A 1LYGA 3OE8A 1L75A 4YXAC 1L46A 1L54A 2YDVA 5B35A 3CDRA 3DKEX 161LA 2Q9DA 1KG8A 1C62A 5G28A 1QTDA 5H2PA 3RZEA 221LA 3EH3B 3OE0A 1L74A 5G2DA 3GUJA 1P8IA 1QS5A 4X32A 2OU0X 5AHZA 2B6YA 1DYGA 150LA 1L02A 5JJNA 4YX7C 3HT8A 1P8UA 5A44A 1P5CA 1QUOA 235LA 211LA 3DN8A 253LA 3SBBC 1TN0A 2B74A 3PDSA 1C61A 1KW7A 1C68A 4MQSA 3VI0A 174LA 3UTYA 1C6EA 1P2RA 2RBOA 4N4WA 1LLHA 246LA 3HTBA 1QT7A 3JR6A 5B6ZA 1C6QA 3ZEVA 2LZMA 244LA 3HU9A 177LA 4EPFA 1CU0A 1QSBA 4GP8B 4OV0A 3L64A 2OTYX 2Q9EA 2ANXA 3GUKA 215LA 175LA 137LA 1XMEB 3G3XA 1F50A 1L22A 3QAKA 1L08A 2ANVA 5J7AA 183LA 1DYEA 2QPDB 3C7ZA 1UCQA 1L9HA 1BRDA 4FA7B 115LA 2HUKA 4I7MA 5FJGA 3FA0A 2OTZX 232LA 4ARJA 4JQ6A 4I7QA 1OV7A 120LA 1XJTA 4OO9A 1JTMA 1L64A 1OVKA 1L42A 1CV5A 1P64A 4ARLA 3HT9A 1B6IA 2RBSA 1L36A 1D3FA 2NTUA 1C6MA 5JJJA 3EH5B 1L81A 2B6WA 1L88A 1L66A 4MD1A 4DKLA 1LYEA 2Y04A 1G0LA 1G0PA 1CTWA 2RAZX 4AQNA 3DN2A 3UONA 209LA 3V2YA 5H2MA 1LI3A 3K2RA 5B34A 1D2YA 131LA 1L53A 4QRYA 3QAPA 4X1HA 1OWYA 3QJQB 1QTZA 3C8QA 2B72A 2ZIYA 226LA 236LA 1L93A 3V2WA 4GP5B 1C8RA 1CUPA 176LA 2NTGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HTKA 3WUAA 1WQOA 1HERA 3G3AB 1CU6A 1GWDA 3ABWA 1MGYA 214LA 3EBAB 2EQLA 4NGIA 1DPWA 1S53A 4U3XB 2HEEA 156LA 1CKDA 1LZTA 1L76A 1VGOA 2Z18A 4NGJA 184LA 1HEOA 2H5ZA 1BB3A 1L01A 1BWHA 4GCDA 4PGJB 2O7AA 4HJZA 4HTNA 5JENB 1LCNA 4OWCA 5AWZA 1L57A 4PXKA 1CJ7A 1RI8B 3C83A 1Z55A 2I25L 1UIFA 2IFFY 1IR7A 1L69A 1LJJA 256LA 237LA 4XTOA 3W6CA 4EOFA 122LA 3ZPQA 3HH5A 1GE4A 1GUEA 2AUBA 4FDYA 1D6PA 3A92A 1EQEA 2FYCA 1KIQC 4I7LA 1VDQA 1IXFA 2XBSA 1LYFA 2A7FA 4RW1A 1KS3A 1L11A 3F8VA 3D4SA 4HV2A 1QSWA 151LA 2QPEB 4OWHA 1GB8A 1P6YA 2J4YA 1QQYA 3C82A 1L59A 2YBIA 1SQ2L 5F81A 1L09A 1DYAA 220LA 3KAMA 3CDQA 6LZMA 1C66A 2CWIA 8LYZA 1DYBA 1GFTA 1L45A 4LZTA 1LAAA 3W6BA 3G3BB 1XEKA 1T8AA 3CDTA 1L05A 1C6DA 4HPIA 1D0MA 1LSPA 2YBJA 4B4JA 1D9UA 2YDOA 2BQMA 1GFRA 5ITCA 1PXSA 1JTOL 4W96A 3TXDA 2OU9A 133LA 1DI3A 2ZYCA 1IY3A 219LA 2KSYA 1C43A 1E8LA 2O79A 1LSMA 4IAPA 3TXKA 1XJIA 1LSZA 155LA 3QJVB 1WTNA 1T97A 4H8YA 3C8RA 1B5UA 1L13A 3C7YA 1CWQA 228LA 167LA 1T6HA 5B05A 2D6BA 4Z41A 1GAZA 3HH3A 4GCFA 3WQJA 4EKSA 3HAOA 2I21A 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 3OE0 A;  1L74 A;  5G2D A;  3GUJ A;  1P8I A;  1QS5 A;  4X32 A;  2OU0 X;  5AHZ A;  2B6Y A;  1DYG A;  150L A;  1L02 A;  5JJN A;  4YX7 C;  3HT8 A;  1P8U A;  5A44 A;  1P5C A;  1QUO A;  235L A;  211L A;  3DN8 A;  253L A;  3SBB C;  1TN0 A;  2B74 A;  3PDS A;  1C61 A;  1KW7 A;  1C68 A;  4MQS A;  3VI0 A;  174L A;  3UTY A;  1C6E A;  1P2R A;  2RBO A;  4N4W A;  1LLH A;  246L A;  3HTB A;  1QT7 A;  3JR6 A;  5B6Z A;  1C6Q A;  3ZEV A;  2LZM A;  244L A;  3HU9 A;  177L A;  4EPF A;  1CU0 A;  1QSB A;  4GP8 B;  4OV0 A;  3L64 A;  2OTY X;  2Q9E A;  2ANX A;  3GUK A;  215L A;  175L A;  137L A;  1XME B;  3G3X A;  1F50 A;  1L22 A;  3QAK A;  1L08 A;  2ANV A;  5J7A A;  183L A;  1DYE A;  2QPD B;  3C7Z A;  1UCQ A;  1L9H A;  1BRD A;  4FA7 B;  115L A;  2HUK A;  4I7M A;  5FJG A;  3FA0 A;  2OTZ X;  232L A;  4ARJ A;  4JQ6 A;  4I7Q A;  1OV7 A;  120L A;  1XJT A;  4OO9 A;  1JTM A;  1L64 A;  1OVK A;  1L42 A;  1CV5 A;  1P64 A;  4ARL A;  3HT9 A;  1B6I A;  2RBS A;  1L36 A;  1D3F A;  2NTU A;  1C6M A;  5JJJ A;  3EH5 B;  1L81 A;  2B6W A;  1L88 A;  1L66 A;  4MD1 A;  4DKL A;  1LYE A;  2Y04 A;  1G0L A;  1G0P A;  1CTW A;  2RAZ X;  4AQN A;  3DN2 A;  3UON A;  209L A;  3V2Y A;  5H2M A;  1LI3 A;  3K2R A;  5B34 A;  1D2Y A;  131L A;  1L53 A;  4QRY A;  3QAP A;  4X1H A;  1OWY A;  3QJQ B;  1QTZ A;  3C8Q A;  2B72 A;  2ZIY A;  226L A;  236L A;  1L93 A;  3V2W A;  4GP5 B;  1C8R A;  1CUP A;  176L A;  2NTG A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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