4GSBA

Monoclinic crystal form of the apo-erk2
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
348
structure length
343
Chain Sequence
PEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGMVCSAYDNLNKVRVAIKKISPFEHQTYQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
publication title Monoclinic crystal form of the apo-ERK2
rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 111
structure length 343
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2012-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4gsbA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4gsbA01
3CKWA 4K11A 3T9TA 3UGCA 1FINA 3LCSA 4FGBA 3ORLA 4AE9A 4BB4A 3ORNA 3LJ1A 4NKSA 4M15A 1WVXA 2ZB0A 3AMBA 3PWYA 1XH5A 2BHHA 4ZJJA 5A4EA 3QCSA 3OG7A 4KAOA 2PMIA 2EB2A 3AOXA 5F9EA 1KOBA 4YJNA 4ITJA 3BYSA 3Q4ZA 3Q9YA 3FMLA 3MI9A 4XCUA 2OJJA 3UBDA 2UW7A 3VS1A 4ASZA 3MESA 3TKHA 4M8TA 5CXHA 3QALE 5KKRC 1PMVA 2WMVA 4LUEA 2ZOQA 3W55A 2X6DA 4IB1A 5GJGA 3PVBA 2PUNA 1Y91A 5CNOA 4LG4A 4YPSA 5FLFA 4CCUA 5KBRA 2B9HA 4Q5HA 5JSMA 3WIKA 3U4UA 5CEQA 3DK6A 2Z2WA 3UQCA 4NKAA 3PG3A 4IB3A 2Z60A 3T3VA 2YIQA 3ZOSA 3MB6A 1PJKA 2VTNA 3DFCB 4NCTA 5HTBA 1A9UA 2YLEA 3FXXA 4YZCA 3CXWA 4FK3A 3F7ZA 5A6OA 4HYIA 1OKWA 2W1ZA 4D2WA 3LFFA 2WTVA 4ZSEA 2XKCA 1H1PA 1MRUA 4JJRA 4FKWA 2HZ4A 2G2FA 4RBLA 2HELA 4PP9A 2QOKA 4W9WA 1WMKA 3PSDA 2J7TA 2QKRA 2C3LA 4GVJA 4RWKA 4U44A 3RBWA 5E4HA 4J96A 5EDPA 2VWZA 4I5HA 1OIRA 4KIKB 1HCLA 3TWJA 4QYHA 4A9RA 4USEA 3MVLA 4JBPA 2DWBA 2OLCA 3HLLA 4F9AA 4RPVA 2I1MA 2X7OA 3FE3A 4QTDA 3WF5A 2EB3A 2FSMX 2IO6A 2ITPA 2RKUA 3F69A 4X2KA 1LPUA 2PWLA 4MXYA 2GQRA 2CLQA 3UC3A 5C26A 3O23A 3OWLA 4MWHA 3EJ1A 5E8ZA 5HVJA 2YISA 1XBAA 2P4IA 3E5AA 3K2LA 1FOTA 4DH1A 2BRBA 2QO2A 3C0IA 3VHEA 2BPMA 4G2FA 5CALA 1URCA 3PE2A 4GG5A 4WNPA 2OJ9A 3F5XA 2UVYA 2GS7A 5JQ5A 3OFMA 2FSLX 2QU5A 4BYIA 4DTKA 4CGAA 3I79A 4UYNA 1OMWA 3QUDA 1Z57A 4R7HA 1UWJA 3LQ8A 4CLIA 5A9UA 5D10A 4TW9A 2Y0AA 3FYKX 4X21A 4AE6A 4RX9A 5JKGA 3R00A 4LOQA 3THBA 3CQUA 4NTTA 4RZWA 5C8MA 4FG8A 5HGIA 2E9NA 2W1GA 2X2KA 4FSUA 4ARKA 4XG4A 3R83A 1ZOGA 2P3GX 2YM7A 4BIBA 4FVPA 3TACA 1DM2A 5AADA 2YITA 4RSSA 2XIKA 3FPMA 3LCOA 4FV6A 3C51A 4FKPA 3OXZA 4EC9A 2ZM3A 2J0IA 3EL7A 4DH7A 3VS0A 2QR7A 1Y6BA 2X39A 4FKSA 3G51A 4GCJA 2PTKA 5IQEA 3NDMA 3VBVA 4F63A 4CMOA 3F3WA 4XP0A 4OAUC 3VRYA 4QMNA 3LQ5A 3MFRA 4FTOA 3COHA 1U5RA 3NEWA 4V04A 3L9NA 3EB0A 4AZWA 2VTJA 4D55A 2X2LA 2WZJA 2B9JA 4MBJA 4MNEB 4GEOA 3E62A 4OTDA 2NNWB 3HV5A 4QMUA 2BAKA 3B8QA 3R71A 3FDNA 3SX9A 3PWDA 2E9UA 4MBIA 5JRSA 3ZLXA 1WFCA 1RW8A 5IUGA 1OGUA 5M4UA 2UW9A 3QFVA 4EC8A 3FV8A 4YJPA 3TZMA 2WOTA 3TUBA 2OBJA 3DJ5A 3R30A 2ZAZA 3O96A 3UPXA 3H9FA 4P4CA 1V0PA 4FF8A 1VYWA 5M44A 3MS9A 2XP2A 2VV9A 2BROA 2UVXA 5FBOA 3W2OA 4AFJA 4AZTA 4BI2A 3G5DA 4FYOA 2JBPA 5HIBA 4ANBA 1A06A 5BNJA 3QRJA 4RIYB 3A7HA 3CPCA 5AAFA 2JBOA 4L42A 1YI4A 1QPEA 4I0TA 4PPCA 5CSXA 4CD0A 5IH4A 3BELA 4YC8A 3ZEWA 4ASDA 3V5WA 3EQDA 4G5PA 5D1JA 3TIYA 2QO7A 4FKVA 5CY3A 5BMSA 1Q8UA 3V8SA 4FV3A 3BLHA 4I3ZA 4J97A 3R01A 2ETRA 3OUNB 2XJ1A 3NVMB 3MSSA 3IKAA 4DEBA 4GYIA 3Q3BA 4RVKA 4ZSAA 3JXWA 5DN3A 4IVDA 2BKZA 5DR2A 5H2UA 2ONLA 4O7ZA 3G2FA 4L7SA 3Q6WA 5E8SA 3AD5A 4PMTA 2X0GA 2QOCA 3TV7A 3NW5A 4XNEA 3ZCLA 2WTCA 2VRXA 2ZMCA 3ZH8A 2PZYA 3LQ3A 3QRIA 3O17A 5D7VA 5ANDA 2XNBA 1JAMA 4Z16A 4ZZOA 3D2IA 3L8PA 4CKRA 2I40A 2PU8A 3ZO2A 4UMPA 4UMQA 3UVRA 4C0TA 4H36A 3VUTA 4AGDA 5IMEA 3P86A 5AX9A 4AA0A 3O7LD 3FMJA 4FNWA 3PIZA 1GY3A 2VWIA 2ITTA 4FSMA 2VNWA 4IM0A 4YC3A 4CQEA 4MBLA 4YJQA 4DH8A 3ZSIA 3FMMA 3BX5A 5IQAA 1FVRA 4HGSA 5E8XA 3T9IA 5CYIA 3OOGA 4KBKA 2WEVA 4D9TA 3VUHA 1RE8A 2O8YA 5AR2A 4ALUA 3NYXA 3OBJA 4BCMA 3VBYA 2RL5A 4BGHA 1SNXA 1ZZLA 1LEWA 5FEDA 3ORPA 3QAME 4XG3A 2ZVAA 4E4MA 5JRQA 1H28A 4FVRA 3H4JA 1XWSA 3BV3A 3FLZA 4CV8A 2GU8A 3MYGA 4GK2A 2GNIA 4PMMA 5DLSA 4BDBA 4O7WA 4MNEA 1Q62A 3QXPA 4D4SA 5LMKC 4DEEA 4JVGA 3R7OA 2WTWA 2XVDA 5CSHA 4KUJA 2VUWA 3I4BA 2W99B 4QMPA 3OCBA 4IWDA 4XV1A 4TYJA 5AX3A 4BZNA 5KHXA 2WKMA 3QTUA 3IDPA 2QNJA 2WU7A 3EFLA 4KWPA 5D12A 3CTQA 4C3FA 2WQMA 3TT0A 4RIXB 3TV4A 1H25A 3D5WA 3KXNA 2QO9A 5EQEA 4F1MA 3E7OA 4G1WA 3Q52A 3HMMA 3DAKA 3LCDA 4BL1A 1LUFA 4EHEA 3DBQA 4M69A 2ZJWA 3E8EA 2ITNA 3D94A 2WHBA 3HV6A 5C27A 4AGCA 3AC8A 3CD3A 4RIYA 2C5NA 3QRTA 5JFVA 5L4QA 5M56A 3D7ZA 1CM8A 3UJGA 2JFLA 2Z7SA 3C0GA 3DNEA 4R6VA 4NW6A 4PQNA 2HK5A 4TZRA 4UWCA 5AP4A 3R8UA 3T8OA 4FODA 4UX9A 2A1AB 3FWQA 4QPSA 1TQPA 5ACKA 3NLBA 5M57A 4IX3A 4JIKA 4Q5EA 3EYGA 3BEAA 3QX4A 2IZTA 3ERKA 5CXZA 3IO7A 2WQNA 5BVNA 4YZDA 4W4VA 3W8QA 3E3PA 1R1WA 1BL7A 3I1AA 3SOAA 1YHWA 3CE3A 3FLQA 3OTVA 2P2HA 3R8VA 4GW8A 4O0VA 4U8ZA 5AAEA 1H0VA 1OECA 5HIDA 4NCTC 4EH5A 4V05A 2OSCA 3QKLA 2XB7A 5BVEA 5HE3A 3RM7A 4BCJA 4F4PA 4PMPA 3DKOA 3DOGA 4O0RA 4QQJA 1YWNA 4EHVA 4FV7A 2VWYA 5ACBC 3SA0A 3NGAA 3I7BA 4H05A 2EUFB 2RF9A 4I94A 4QYYA 1U59A 4QMYA 3SLSA 2YAAA 3KRRA 4WG4A 1GIIA 5C4KA 3R2BA 4DE4A 3EKNA 3Q6UA 4LOOA 4WUAA 2JKOA 4C4EA 4KRDA 5I9ZA 4OTQA 3AC5A 1H1WA 3RPVA 3UQGA 4ASEA 1RJBA 2FH9A 2VX0A 2W1HA 2ZV7A 4FSQA 1H1SA 3VS5A 2CKEA 1M7QA 4ZOGA 4O0UA 1KSWA 2IVSA 4L45A 2ITYA 4G34A 2H34A 4F70A 2HZIA 5AIKA 5IZFA 1A48A 2QOBA 3GOPA 5KKRB 3KK9A 3W2SA 2YCRA 2WGJA 4GFOA 2F57A 4NFMA 4YHJA 5E1SA 3P0MA 1V0BA 4LV8A 2ITUA 5I9UA 2W1EA 2R4BA 3BZ3A 3BYMA 3EZVA 5K4JA 1ZOEA 2VU3A 4KBAA 4J95A 4E6CA 2C69A 3QD3A 2PE0A 3DLZA 2C5OA 4IWPA 4JLCA 3ULZA 3MGYA 4IB5A 4MXCA 3AD6A 1WBVA 3DGKA 4RWJA 4AF3A 3H0ZA 1YW2A 2WD1A 4FIGA 2YA9A 5AP2A 5EYCA 4A4XA 2VO6A 3C9WA 3GCPA 4QT1A 3DK3A 4WD5A 3O8PA 3AT2A 3GQLA 4EUUA 3HMOA 3ATTA 2QI8A 2ZV8A 4FNYA 3AD4A 4EK4A 5HG5A 1ZMVA 3I0QA 4PTGA 3EFWA 1M2RA 4DFBA 3KRJA 3W2PA 5JFXA 3UQFA 3FQEA 4M68A 3U55A 4UZDA 1P14A 3AT4A 2R3OA 4BCOA 2R2PA 2VTIA 2W5AA 3ZC5A 4APCA 4PWNA 3VJOA 4BWXA 4D1SA 1U4DA 3CQWA 2V0DA 2UZUE 2X81A 3BEGA 3EHAA 3MA3A 4FEWA 4BI0A 4JR7A 2R7IA 3WIGA 4I4EA 4QYFA 3Q4CA 2NP8A 4HNIA 1W8CA 5FXQA 3DDQA 3GNIB 2UW4A 4E5WA 1UNHA 4OTPA 5AM6A 3FQSA 4IXPA 3WILA 4F99A 3DBFA 5HBEA 1XHAA 1Z5MA 3LJ2A 3JVSA 1XH7A 4FKGA 3IQ7A 4XHKB 3VULA 2GFSA 4G9RA 3DBEA 5EKNA 3LFDA 2OG8A 3II5A 3Q53A 3I6UA 5HO8A 1STCE 5JZJA 3KEXA 1Y6AA 4FC0A 2I6LA 3F9NA 3MPAA 4NZWB 5AUUA 1UVRA 1YKRA 5HLWA 2WQOA 2YZAA 4IAYA 2XBAA 3E63A 3GENA 4C4GA 2W7XA 1WVWA 2QD9A 2XNGA 1YXSA 5KMOA 5IH5A 4CVAA 5GNKA 2YIXA 2C3JA 3L8XA 4HZSA 2XEYA 4MQ1A 5AP5A 1T46A 4AW1A 3FI2A 4I5MA 3KY2A 3OD6X 1DAWA 3V6RA 1YXTA 5BUJA 2VTMA 2WPAA 2ONLC 5DBXA 2O0UA 3QLFA 2RG6A 5EW8A 3FMHA 5CQWA 5CT0A 5AV2A 2A19B 5HHWA 2QQ7A 4GU6A 4KKEA 4RJ6A 3V04A 4D28A 4CCBA 3F82A 5L2TA 3UVQA 3DAEA 3MH2A 1JKSA 3R2YA 5KHWA 1NXKA 2VTLA 5CLPA 3WF6A 4FZDB 5LWNA 3ZLYA 1XBBA 3UO6A 4MH7A 2YM6A 4Y5QA 2W4JA 5BUEA 3VNTA 4RX5A 3NRMA 4E1ZA 5EM7A 4NT4A 1YWRA 1J91A 2WTKB 4MAOA 3V51A 5A4CA 4RQVA 5F95A 5L6OA 4AZEA 5KMNA 1XH9A 4I6FA 5LVMA 3RKBA 2PMOX 4FV0A 3F2RA 5D11A 4C2VA 2OI4X 2WB8A 5DT4A 1R0PA 2OK1A 4IIRA 4NIFB 4AT5A 2B54A 2GCDA 5F20A 2ESMA 3PA3A 5M08A 5DG5A 1OB3A 2XK4A 3V5LA 5A3XA 4F6UA 4YLJA 3GT8A 4O0YA 3EN9A 4TY1A 3WF9A 4GK4A 4EH4A 2JITA 5J1WA 3AMYA 3V5PA 4YO4A 4Y46A 1IAHA 3RMFA 1Q8ZA 4D2SA 3O2MA 4DEGA 3DFAA 4NM5A 1YDTE 3GFEA 3EH9A 4FOBA 4BVUA 2IG7A 2B4SB 3P5KA 3I81A 2O64A 3Q2MA 1M2QA 4L68A 1IRKA 5LVNA 4LQMA 2OF2A 2VTAA 4TKSA 4EORA 4CFNA 5KO1A 2UZEA 2JKMA 3ZS5A 2WOUA 3ALOA 1J3HA 1JPAA 4A4OA 3R22A 4DG2E 4E20A 3D83A 4XG7A 4D2VA 4AS0A 5M06A 4BZDA 4C57A 5IISA 5LVLA 3HUCA 3QYZA 2W1FA 3DB8A 3V6SA 5JFWA 2QODA 4FTKA 3VRZA 4W4XA 3AC4A 4AXAA 5E8WA 4I6BA 3KXXA 3GBZA 3EKKA 2CKQA 1BYGA 2BFXA 3E3BX 2FYSA 3DTWA 3R7IA 5M53A 2WNTA 2O3PA 3BWJA 4XG6A 3VBXA 2XKFA 2W9FB 4EH9A 4USFA 3WF8A 4U45A 2ZMDA 2R3GA 3DPKA 4YJOA 2J5FA 4IVAA 3LFCA 4JS8A 2EWAA 1K9AA 4C62A 3BWFA 4PTCA 3GC7A 4Z7HA 2X6EA 3ZM4A 5AMNA 3CJGA 4I20A 2R0IA 4LUDA 1YOJA 5AIRA 3CIKA 4MXAA 2P2IA 3A8WA 3EMGA 2PSQA 4U7ZA 3HDMA 4BTFA 1S9IA 3KMWA 4A9UA 2QCSA 2X8EA 5ETCA 3FXWA 3ZFYA 3UZRA 4GYGA 5CEKA 4GKHA 4YMJA 3TNIA 2R3MA 4RVMA 2PE2A 4MVFA 3OHTA 4QMXA 4YHFA 2VNYA 2Z7RA 3UNKA 4ACGA 4D0WA 4FTJA 4Z55A 2XRWA 4H39A 2JIUA 2XYNA 3QUEA 3TV6A 3QKMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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