4H0OA

Crystal structure of acetate kinase from entamoeba histolytica
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
391
structure length
383
Chain Sequence
SNVLIFNVGSSSLTYKVFCSDNIVCSGKSNKPFIEHHLNGQIIKIETPILNHPQAAKLIIQFLKENHISIAFVGHRFVHGGSYFKKSAVIDEVVLKELKECLPLAPIHNPSSFGVIEISMKELPTTRQYVAIDTAFHSTISQAERTYAIPQPYQSQYLKFGFHGLSYEYVINSLKNVIDVSHSKIIACHLGTGGSSCCGIVNGKSFDTSMGNSTLAGLVMSTRCGDIDPTIPIDMIQQVGIEKVVDILNKKSGLLGVSELSSDMRDILHEIETRGPKAKTCQLAFDVYIKQLAKTIGGLMVEIGGLDLLVFTDQMGLEVWQVRKAICDKMKFLGIELDDSLNEKSMGKKIEFLTMPSSKVQVCVAPNDEELVILQKGKELFQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Acetate kinase
publication title Crystal structures of acetate kinases from the eukaryotic pathogens Entamoeba histolytica and Cryptococcus neoformans.
pubmed doi rcsb
source organism Entamoeba histolytica
total genus 126
structure length 383
sequence length 391
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.12: Acetate kinase (diphosphate).
pdb deposition date 2012-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0oA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0oA02
4A2AA 3C7NA 1RFQA 1GLBG 3ENHA 4MO5A 1DGKN 3O1WA 3D2FA 5BREA 4BROA 4CZIA 5ADXH 4H0OA 4BRPA 4BRFA 3VETA 1NGHA 3A0IX 3W0LA 1ESVA 4K41A 4BR0A 4KBOA 4A2BA 4AM6A 1MWKA 1G99A 1QHAA 2HF3A 4CBXA 2ZF5O 1K8KB 2A3ZA 2E88A 2CH6A 2HMPA 4IO8A 2YHWA 4FWMA 2KHOA 3FR0A 4MLEA 2F9TA 3QB0A 4C23A 1P8ZA 5E84A 5EX5A 4XH5A 1HPMA 4M7YA 5AQYA 1MDUB 3TPQA 2Q2RA 3CJBA 4FOIA 4H5RA 2GWJA 5JLHA 2NRHA 3O4WA 2D0OA 3MMVA 4BQLA 2P9NA 4EHUA 3H1VX 1X3NA 4BR7A 3D2EB 4Y0WA 2QWPA 1SQKA 2ITMA 5EY4A 1GLFO 5AQMA 3HI0A 4PL8A 4JHDA 3U9DA 4H5TA 1NMDA 3BP8A 3UKUB 4BR5A 4FSVA 5TKYA 3SLCA 5BPMA 2ZGZA 4H03B 1NGFA 1XC3A 5CE3A 4CZGA 3WT0A 4ISFA 3DXKB 4NB4A 3MK6A 4DB3A 4HTLA 4H0VB 3FZHA 3I33A 1NGBA 2QW9A 3ID8A 3VF6A 3BF1A 4DHYA 1NGJA 3CQXA 4BRAA 3MN6A 1LCUA 1K8KA 1HJOA 3O80A 5AQIA 3RSEB 4DQ8A 3FLCO 3CETA 4HWIA 3ZX3A 1OKJA 3SMPA 5F0XA 3HBTA 1BOTO 2CGLA 2PAVA 2YJFA 5BPLA 1U6ZA 4FWNA 4I6MB 3O8MA 4BR2A 5KQDA 3VGLA 3GE1A 1BDGA 3O1BA 3D2EA 1YVNA 3D7EO 3J8AA 4CZHA 4IJAA 2Q0RA 3FE1A 2Q31A 2IVPA 2VCPA 3C7NB 5AQXA 3ULEB 2CGJA 5AFUA 1GLEG 3M3ZA 4H0YB 3ATUA 3C0BA 3HZ6A 3D2FB 3A5OC 4PL7A 4RWTA 3CIPA 3ZX0A 1KAYA 2BTFA 2YI1A 1HKBA 2QWQA 5ELZA 1LOTB 1T6CA 3S41A 2FSJA 1CZAN 5AQVA 4BG9A 3OHRA 2HOEA 1R59O 1E4GT 1BA1A 4JAXA 3VPZA 3HTVA 4B1VA 3EO3A 1GLAG 2FLOA 3H1QA 1NLVA 3TU5A 2D1KA 2E2OA 2E20A 2QM1A 4FPBA 4H0TB 1YAGA 3O5BA 3CJ9A 3U9ZA 4EFHA 2A40A 2BUPA 3LL3A 1J6ZA 2P9NB 4BRNA 2J4RA 3U4LA 5AQRA 2P9LA 3ZX2A 3VF4A 2P9IB 4JHDB 4E1JA 2Q97A 3ENOA 5B8HA 3ULEA 1NM1A 4EHTA 5BPNA 3VEYA 2CH5A 3GL1A 4FOEA 4CZLA 3R9PA 2ASPA 3H45C 3DWLA 5AZIA 2DPNA 4CZFA 4XH4A 3WUHA 1TYQA 3CI5A 3MN7A 4BRMA 3VEXA 3EKUA 3WXKA 3FZFA 1ZBSA 3H3NO 3WQUA 2I7PA 3H3OB 4F9OA 2D4WA 1HLUA 3CHWA 3AARA 2H3GX 1SAZA 2YCHA 2P9PB 4BC5A 3H6EA 3FFKB 2P9IA 4MO4A 2GELA 5AQKA 5FPMA 2UYTA 4K25A 2A6AA 3VEZA 1Z6RA 4K42A 4BRCA 2W40A 4CJ7A 4IXCA 3H46O 2ZGYA 1XUPO 3GOIA 1X9JA 4JD2A 3ATVA 4CBUA 2FSNA 1C0GA 3A5MC 4CZMA 1IJJA 2E2NA 5I9EB 3VF2A 2VYPA 4BVOA 2E2PA 5EOYA 5BR9A 5KQ8A 2WUSA 2AA4A 3IMXA 2NZTA 5ADXA 1ZXOA 1XQSC 1BG3A 2Q36A 1SZ2A 4CBWA 5F1XA 1RDWX 3IUCA 1MWMA 4O8KA 2IIRA 5AQOA 2PBDA 2P9LB 2V52B 2GEMA 2P9PA 1RGIA 1ATRA 3QDKA 1EQYA 1KAXA 3A5LC 1BO5O 3F9MA 3EZWA 4QS7A 3UE5A 1H1VA 5AQSA 1QQOA 3EL2A 2P9SB 4IWVA 5JLFA 2FSKA 4B1YB 1Q18A 1QZ5A 5KPZA 1Z05A 4CD1A 1JCGA 1E4FT 4BRQA 3SJHA 4BR4A 3WXLA 3QBXA 3CJ7A 1DEJA 5AZIB 1TYQB 3CERA 3LDOA 5AZJB 1QQMA 1WUAA 4CZKA 5AQJA 2V7ZA 5FPEA 1ZC6A 1NGAA 1NWKA 1ATNA 4BRGA 4IJNA 3LDLA 1V4SA 5LJVA 5AQHA 3LDPA 4WQ4A 4B1WB 1Y64A 4PKIA 1QZ6A 3VGMA 2EWSA 3L0QA 3FZLA 5AQTA 4A62A 2QWRA 3FZMA 3KHYA 4FO0A 3DXMB 1C0FA 2GUPA 5KPTA 3VENA 4PKGA 1GLJO 1BUPA 1TUYA 4B9QA 2OANA 3CJAA 4CZJA 4B1XB 5AQGA 2CGKA 4BREA 3AAPA 5AQLA 2QWNA 5AQPA 2QWLA 4GNIA 4GY2B 2E1YA 3VOVA 4BRKA 3CJCA 4DCHA 3GG4A 5BN9A 1YXQA 2P9SA 5AQNA 2YHYA 4JD2B 1KAZA 4IZ9A 5LY3A 1S22A 3FZKA 3QFPA 5E26A 3SMSA 5AQWA 4O5FA 5AZJA 4A61A 1NBWA 2GWKA 1D4XA 2AP1A 2Q0UA 4PKHA 4RCHA 4B1UB 4BRHA 4BVPA 2E1ZA 2ASOA 3ZEUA 3CJ1A 1JCEA 2VWBA 3DAWA 4BR9A 3LDQA 5AQZA 2NLXA 4XEIA 3WQTA 4FWRA 3LM2A 3WEEB 4FWOA 1BA0A 1NGCA 2A42A 3P4IA 4FWLA 3BUZB 3DXMA 2I7NA 1T44A 2FF3B 4JNEA 1HX1A 4FWPA 2YJEA 2ASMA 2A5XA 3MCPA 3QFUA 3UKRA 2F9WA 3R8EA 5AQQA 4WQ4C 1NGGA 1GLDG 1NGIA 1T6DA 4H0XB 5EXWA 2P9UA 4AM7A 3L6QA 5BN8A 1JCFA 3GBTA 3M1FA 4WQ5A 1V4TA 4MLHA 3VERA 3JXUA 4B1ZA 3VGKA 3MN5A 5AFUH 2QXLA 3LDNA 4J8FA 1IG8A 3HM8A 4QS8A 3HSCA 2P9KA 1KXPA 3ZETB 4FWQA 5JICA 4EAHD 3MDQA 3R6MA 2IVNA 4H0PA 4YDUA 5F2RA 3U8XA 5KPRA 4BC3A 1NGEA 3WEEA 1MA9B 5EVZA 1NGDA 4XH1A 1HUXA 3O08A 3IDHA 4FPAA 4EIAA 3O6WA 1U2VB 1YUWA 4JN4A 4K43A 4BC4A 4BGAA 5FPDA 4H5WA 4M7XA 4BRDA 4CI6A 3BF3A 1GLLO 1QQNA 2V7YA 5BRDA 3QMLA 3I8BA 4BC2A 2GTDA 3VEWA 4FWKA 2YHXA 4L3QA 5AQFA 3VEOA 4CD3A 4FL9A 1BWFO 3AY9A 3SK3A 3WXIA 3QICA 4Z94A 5FPNA 3JS6A 4RTFD 3BEXA 1HKCA 1X3MA 4H5VA 4BRLA 3AAQA 4ISEA 3UKUA 3ZETA 4H5NA 3FGUA 3LM9A 4WYBA 3ZEUB 1ATSA 1GLCG 4WQ5C 2FF6A 2E8AA 3IFRA 2IVOA 2A41A 3DXKA 5BRHA 3VESA 2HF4A 3A5NC 2E2QA 2FXUA 5AR0A 3WXJA 1U2VA 2W41A 3KVGA 4NO7A 2V51B 3RSEA 5LJWA 4M63C 3KZBA 1WOQA 4BGBA 2ZWHA 1TUUA 3UB5A 3L4IA 3UKRB 3G25A 4FWSA 4YDUC 3QBWA 3MN9A 3GDQA 4LC9B 5AQUA 3VEVA 2P9UB 1S3XA 4I6MA 4CZEA 4QS9A 1BU6O 4BG8A 3M6GA 2QWOA 3EKSA 3DJCA 3EN9A 3B8AX 2QWMA 1HKGA 5JMVA 4ISGA 4BRIA 5BRFA 3CQYA 3A8YA 1DKGD 2Q1NA 2P9KB 4BQZA 3W3DA 2D0PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KLGA 1GLBG 3SAHA 1HNXK 3ENHA 3D2FA 5BREA 4YFUA 2VQFK 3P83D 1RT4A 3NF6A 4GVEA 4OGCA 5DMRA 4W5TA 1ZBLA 1IBKK 4H0OA 1VSDA 1NG9A 1ESVA 4DV0K 3KLHA 1K73O 4BR0A 1L3SA 1T7PA 3NVKA 1JLEA 1MWKA 1G99A 3SBGA 2HF3A 4DU4A 1NK7A 1HRHA 1VSJA 2B6AA 3HVRA 2F9TA 1D9DA 3ZCMA 3SQ4A 2IC3A 4XH5A 3F9KA 3SUQA 5JLHA 3E9LA 2QI2A 1IBMK 4JI5K 2D0OA 4BQLA 1ZYQA 2P9NA 4BR7A 3TAQA 4Y0WA 2QWPA 3ALYA 4FJIA 4W5QA 5T7BA 3NGIA 3THXB 3M8RA 4CIEA 2E4LA 5BPMA 2D0PA 4YOWA 4FZZA 2BH1A 3AVBA 3MWPA 3E01A 4CZGA 2YNFA 3DXKB 3C95A 3MK6A 3MEEA 3FZHA 2QKKA 3HPHA 2NRXA 2WTUA 1NGJA 1VQ8N 1K8KA 5AQIA 4B3RK 3RSEB 1RBUA 3V1QA 4HCBA 3CETA 3KWIA 1OKJA 3WNGA 1TKTA 1RDAA 2PFUA 5FRMA 1WAFA 2NRRA 5GADP 4I6MB 3O8MA 4CGDA 3KD1E 5GAHP 3GE1A 4JKDA 3D2EA 3ZT3A 3CFOA 1B9DA 4CZHA 2Q0RA 3ULEB 1SS6A 1FKOA 1JLQA 2XY8A 4H0YB 1KLNA 3C0BA 1SUQA 1SKSA 4PL7A 3CIPA 3ZX0A 3A2FA 4IEIA 1KAYA 2YHAA 1LOTB 1T6CA 3NF7A 1X1PA 2PY5A 3LALA 1RILA 1R59O 3WNFA 1EO1A 3EO3A 1N33K 1LW0A 4DR3K 3AVNA 3PSIA 2DFHA 2E20A 4E19A 1QTMA 1KFSA 4RW4A 3RR8A 3O5BA 2O8FA 3U9ZA 4EFHA 4KB1A 5JS2A 2J4RA 5CYMA 3TAPA 1JKHA 1YTAA 2RF2A 4E1JA 3L8BA 1ASUA 1JLBA 4DR1K 1VK0A 3VQ4A 1IKXA 3VEYA 1NJXA 2CH5A 3N4QA 4UQGA 3DWLA 1OH7A 1TYQA 2VG7A 1YITN 1M1KO 1S6PA 3K57A 4CHNA 3M8QA 3DLEA 3EKUA 3NCIA 4KREA 3H3NO 3WQUA 3CCSN 2O8DB 4F9OA 4CJEA 3AARA 2H3GX 5DK5A 5FDLA 2P9IA 4MO4A 2GELA 4DTXA 4KHWA 5FPMA 2UYTA 3I56N 4DQQA 4K42A 4CJ7A 4IXCA 3SUPA 1VSLA 1Q7YO 2UXCK 4IG0A 3DMJA 2O8EB 4JI0K 4JD2A 4CBUA 4CE9A 4O4GA 3VA0A 3AA5X 3AVCA 1IJJA 4FJMA 2VYPA 2E2PA 5BR9A 3S3MA 2AA4A 5C42A 1C1AA 1XQSC 1B92A 3AVFA 5HRRA 3F73A 2WC9A 3SCXA 3J80O 4KHQA 1MWMA 4DV5K 2V52B 2GEMA 2P9PA 3EY1A 3G6EN 3CCRN 2QKBA 4E7LA 3BDPA 1ATRA 3EYZA 1RT3A 3QLHA 4DR7K 4U67L 1KAXA 4KTZA 1YTUA 1BO5O 3F9MA 4A5BA 3P5JA 3THYA 2KKZA 3CQ8A 1QZ5A 4DV6K 3CMEN 4CD1A 1DEJA 2KQ2A 3T7ZA 4CF2A 1YJ9N 3LDOA 3K5MA 1WUAA 5AQJA 3I55N 2G8UA 4OLBA 2Z1HA 4DMNA 1NGAA 1ATNA 3LDLA 1UWBA 1O13A 1GOCA 4WQ4A 4B1WB 1Y64A 4PKIA 4MFBA 2HNYA 4JI8K 4CGFA 1NJZA 3FZLA 3CCJN 1NKCA 3OTOK 4KRFA 1GLJO 1TUYA 4JK9A 1KTQA 4CZJA 5M1KA 3OJUA 3AVGA 3PLAA 2HSTA 3R1XA 2QWLA 4GNIA 4GY2B 2E1YA 1IH7A 4HCCA 3CJCA 3GG4A 5BN9A 1YXQA 4M45A 1VSFA 2YHYA 4BDPA 1KAZA 1MU2A 4ILHA 4BWMA 3QFPA 2PYLA 5AZJA 1NBWA 1N36K 4PKHA 4RCHA 2E1ZA 1YVUA 3ZEUA 3CJ1A 4PWDA 3KK7A 1Q9XA 2VWBA 5AQZA 2HHHK 2OPSA 3L2QA 4FWRA 4DR6K 5C12A 3WEEB 3OYMA 2P51A 4JKFA 1NK4A 1A5WA 3SV3A 4DV3K 2I7NA 4OJRA 4FWPA 2YJEA 3S9HA 3THVA 2HHSA 4ELUA 3O9UA 4B9TA 4HUFA 5GAEP 3V6DA 4H0XB 3J81O 5FRNA 5EXWA 4YOUA 4Z0UA 3K59A 5BN8A 3VQAA 1HNVA 3TTCA 4FM1A 3B6OA 3VGKA 3MN5A 2WOMA 1LV5A 4IKFA 3LAMA 3Q7BA 2O8BB 4FK4A 3T3FA 1K8AO 4EAHD 3MDQA 4FLTA 4DFKA 3U3GA 2A1SA 5F2RA 4BC3A 4EZ6A 4M3WA 4C8OA 1NKBA 2ZD1A 3SAFA 4M41A 5MLCQ 4FYDA 4X64K 1XC9A 4XH1A 4DQPA 4CF1A 5HRNA 1RT7A 1S1XA 3IDHA 3O6WA 4JN4A 1S6QA 1YUWA 4JLHA 4K43A 1IKWA 1D8YA 4FJHA 4N41A 5FPDA 4H5WA 5LL6Z 4RW8A 3BF3A 1VQNN 5CR4A 4E7JA 1TK0A 4O44A 1QVGM 4CGGA 3KLIA 4CJKA 3QMLA 3L4QA 3VEWA 4FWKA 4L3QA 3QESA 1S5JA 3QICA 5KRTA 2G8VA 1X3MA 4H5VA 4BRLA 4PHTX 3T1HK 3T1AA 3UKUA 4H5NA 1TL1A 3FGUA 4FK0A 3C6AA 1GLCG 4WQ5C 1M90O 3IFRA 2IVOA 4IOXA 4YY3K 2W42A 5BRHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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