4H0TB

Crystal structure of ia-adpr-actin complex
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Toxin/structural protein
molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
total genus 125
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0tB03
3M1FA 2YHYA 3WXJA 4AM6A 4DQ8A 3LDPA 3CI5A 1NMDA 1U2VA 4BR4A 5AFUA 4BG9A 5E26A 2GWKA 5KPTA 4JHDA 1TUYA 2Q0UA 2V51B 4EIAA 5BPNA 3FE1A 5CE3A 5EVZA 1E4GT 1U2VB 3D2FA 1GLBG 5TKYA 3AY9A 4CZIA 3WUHA 1KAXA 4L3QA 5E84A 5AZIA 4B1UB 1E4FT 2I7NA 3D2FB 5AQWA 4BRQA 3A0IX 4A61A 2W40A 3VF6A 2ASOA 2FXUA 4H0PA 5AZIB 2GELA 5AQMA 4EHTA 4PL8A 4B1WB 4FWRA 3VEXA 2P9KA 2CGKA 2Q97A 4BQZA 3QB0A 3VEYA 3QMLA 1GLCG 4FWSA 2P9IA 3MN5A 3SMSA 5BRDA 1QZ6A 2P9KB 2WUSA 3ENHA 3GBTA 4JD2A 3BP8A 2P9IB 1GLDG 2E2NA 3M6GA 3FGUA 4JAXA 3GE1A 5EY4A 3CJBA 5ADXA 3EKUA 4WYBA 2J4RA 1Y64A 1S22A 3WQTA 4BC5A 1IG8A 3G25A 1GLAG 4EHUA 3O1BA 3AAQA 5AQHA 5ADXH 1KXPA 3CJCA 4CBXA 3J8AA 1XUPO 3ZX0A 4QS8A 1ATNA 1QQNA 1XC3A 2NRHA 4BR9A 4A2AA 4IXCA 3KVGA 3BF3A 2YJFA 4KBOA 5AQYA 3UE5A 2CH6A 1G99A 1TUUA 3B8AX 4QS7A 5BPMA 1T6DA 1MWKA 4WQ4A 1HLUA 3IMXA 4AM7A 2ZWHA 3VF4A 4NB4A 3VERA 4C23A 4NO7A 2E20A 3L6QA 3EKSA 3QFPA 3FZFA 3O80A 3R8EA 1T6CA 2BUPA 3BUZB 3O8MA 4CZMA 5AQXA 1NGEA 2QWRA 1NGDA 3KHYA 5AQPA 1NGIA 2P9UA 3D7EO 2IVOA 4MLEA 3DAWA 3R9PA 3CERA 3VGKA 3WEEA 3HZ6A 3ATUA 2P9UB 3BEXA 2F9WA 3U9ZA 2E88A 2NZTA 5F2RA 5AQKA 3CJAA 3CJ9A 4BRAA 2PBDA 5JLFA 3WEEB 2QWPA 4CZGA 1SAZA 4BRKA 1EQYA 3FFKB 1QHAA 2A40A 4BRCA 4RTFD 4FWPA 2P9LA 5JICA 4H5VA 4H03B 5BREA 2A6AA 5EXWA 1HKGA 2P9LB 4YDUA 5AQNA 1DEJA 1BO5O 2D0OA 4I6MA 3JXUA 3TU5A 5AQSA 1BA1A 1QZ5A 3LDNA 1MDUB 5BRFA 1CZAN 3ZETA 1ZXOA 2W41A 1NLVA 1V4TA 1ZC6A 1Z6RA 1RFQA 3EL2A 3A8YA 4BR5A 3VGLA 2CGLA 1ESVA 3ZETB 4CI6A 4M7YA 3RSEA 5FPEA 3FLCO 3O08A 4JHDB 4JN4A 4H0TB 4J8FA 5LJVA 5KQDA 2QXLA 3LDQA 5LY3A 4M7XA 2E8AA 4CZEA 1NGBA 3RSEB 2CGJA 5AQGA 3TPQA 4ISFA 2YJEA 5F1XA 4FPAA 2D0PA 3FR0A 5AQOA 3CIPA 3KZBA 2UYTA 3AAPA 3IFRA 3VENA 3WXKA 1SQKA 1BWFO 2E2QA 1U6ZA 1GLJO 2D1KA 4CZKA 1NGCA 4MO4A 4BRNA 2ZGYA 4FL9A 2YCHA 1YVNA 4WQ4C 3HM8A 5AQFA 3W0LA 1JCEA 3U4LA 4H0OA 2V7ZA 2A3ZA 4BRLA 4H0VB 4WQ5A 1QQOA 1V4SA 3H3OB 1H1VA 4BRMA 2GWJA 3O4WA 4H0YB 4JD2B 3FZLA 1BOTO 4XH1A 4FPBA 4Z94A 4JNEA 4E1JA 4CD3A 3DXMA 2E1YA 4CZHA 1S3XA 5AQQA 3CQYA 4Y0WA 1NM1A 1JCFA 4BRDA 3WQUA 3DWLA 3O1WA 4LC9B 3DXMB 2V52B 2VWBA 2ASMA 1C0FA 4CZLA 4O8KA 4BREA 5AQUA 3UKRA 3IDHA 3U9DA 3GG4A 5BN9A 2QWNA 3FZHA 3L4IA 5EOYA 4FWOA 2GTDA 3UKRB 4DB3A 1ZBSA 1Z05A 2D4WA 3A5LC 3LDOA 2ZF5O 3IUCA 4IWVA 4YDUC 2HF4A 2FLOA 3I8BA 4FOEA 4H5RA 5KQ8A 3S41A 1HKBA 4FWKA 3VESA 1HX1A 4CBUA 3CQXA 2IVNA 5AQJA 4BRFA 3D2EA 1BG3A 3MN7A 4B1VA 4EAHD 2HOEA 5KPRA 2Q1NA 5BPLA 3QBWA 4A2BA 1HPMA 3P4IA 4HWIA 4XH4A 4IJNA 2IIRA 4BR0A 1BA0A 2QM1A 3D2EB 4FO0A 2Q31A 3EZWA 2E2PA 3HTVA 5F0XA 1WUAA 3ENOA 3ZX3A 4CBWA 1X9JA 1BDGA 3BF1A 5AQRA 5LJWA 3A5MC 2E1ZA 4FWNA 3M3ZA 2FSNA 4BGBA 4BG8A 2BTFA 2P9NA 3SLCA 4GY2B 2A42A 2IVPA 3U8XA 2AA4A 3SK3A 1GLEG 2P9NB 2AP1A 4B1ZA 1T44A 1YXQA 3A5OC 3WT0A 1RDWX 4H5WA 2ZGZA 1MWMA 3ZEUA 3DXKA 4B1XB 4MO5A 4CZFA 1C0GA 4WQ5C 1XQSC 1OKJA 3C0BA 1YUWA 1HJOA 4BGAA 4FSVA 4XH5A 3A5NC 4I6MB 3ZEUB 3DXKB 5JLHA 5KPZA 5I9EB 4PKGA 5AQIA 2HF3A 2DPNA 3FZMA 3VETA 1NGGA 2PAVA 2FSJA 1R59O 2A5XA 1HKCA 2QW9A 1QQMA 3WXIA 3CHWA 2VYPA 1MA9B 3MK6A 2VCPA 1WOQA 3VF2A 1TYQA 1ATSA 1ATRA 3UKUA 5ELZA 1JCGA 3VEWA 3FZKA 2OANA 4A62A 1K8KA 1X3NA 3QFUA 1TYQB 3ZX2A 3UKUB 4CD1A 4BVOA 1K8KB 2QWLA 2V7YA 5FPDA 4BRHA 1SZ2A 5AFUH 3VOVA 5AQVA 4IJAA 4PKHA 4QS9A 1DGKN 1X3MA 3MMVA 3ATVA 5JMVA 2GUPA 2HMPA 4BC3A 4BROA 4BRGA 4DHYA 3CJ1A 4FWQA 5AQZA 5AQTA 2FF6A 4BRIA 2P9SA 3MCPA 3QICA 4FWLA 4CZJA 2E2OA 3VEZA 3I33A 1GLLO 2EWSA 3R6MA 2Q36A 2P9SB 2A41A 1GLFO 4IO8A 1HUXA 3MN6A 3HSCA 5BRHA 2P9PA 4F9OA 1NWKA 5BR9A 3SJHA 1BUPA 1RGIA 4K43A 2ASPA 2P9PB 3H1QA 4ISGA 1IJJA 4IZ9A 3UB5A 2I7PA 3AARA 4BC4A 3GL1A 4FWMA 3HI0A 3ID8A 3LDLA 3LM9A 4MLHA 5BN8A 5B8HA 4M63C 3H45C 3O5BA 5FPNA 4PL7A 3GDQA 5AZJA 1LCUA 3VPZA 3LM2A 3OHRA 1J6ZA 3CJ7A 3W3DA 4FOIA 2FSKA 4RCHA 5AZJB 3QDKA 2F9TA 5EX5A 2QWOA 4H5NA 3QBXA 3F9MA 3GOIA 3H3NO 5AQLA 2KHOA 1NGHA 1KAZA 4K25A 3MDQA 2QWMA 4DCHA 1NBWA 4CJ7A 3ULEA 1Q18A 1D4XA 2ITMA 3VEOA 4H0XB 3MN9A 4PKIA 3LL3A 1LOTB 3C7NA 3ULEB 4BRPA 3DJCA 4RWTA 5AR0A 4O5FA 2CH5A 4GNIA 3C7NB 5FPMA 1NGAA 3VEVA 4BC2A 3EN9A 4K41A 1KAYA 4K42A 3VGMA 3SMPA 2Q0RA 2YHWA 2FF3B 3H46O 3H1VX 3HBTA 4BR7A 4ISEA 4EFHA 3WXLA 4BR2A 3EO3A 2QWQA 2NLXA 3L0QA 4HTLA 1YAGA 4B9QA 3JS6A 2YHXA 1NGFA 4XEIA 1BU6O 2H3GX 2YI1A 1NGJA 2GEMA 1DKGD 4BVPA 4BQLA 4B1YB 3CETA 1P8ZA 4H5TA 3H6EA 2Q2RA 3O6WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CJLA 3ULDA 4DTOA 2LSNA 3KK1A 4AM6A 2RKIA 4DQ8A 4PY5A 2OZSA 4BR4A 4F8RA 4YY3K 2Q0UA 3NGZA 3OBWA 3DOKA 3TR8A 1U2VB 4CJKA 4DG1A 4JKGA 1RTIA 1KAXA 4C8KA 3S3OA 4NLCA 3VA0A 4C8OA 4CF2A 3CCMN 4KH6A 2ZM6K 2OZMA 2GELA 3LZIA 3VQ5A 4DLEA 4NCBA 1RT6A 4EHTA 3TABA 3QIOA 4FWRA 3RVCA 3VEXA 4DV4K 4DR7K 1OH8A 3AA2A 1D8YA 1NOZA 5LMUK 1L3VA 2P9IA 4GV9A 1CXUA 2P9KB 3ENHA 3GBTA 1C1AA 3BP8A 4KFBA 2Z1JA 3DLBA 4A5AA 3MXIA 3OS2A 2Q3SA 5HROA 3P5JA 1TK0A 1C0MA 4IFYA 3WQTA 1TAUA 4ID5A 4XIUA 3G25A 1Z26A 1ITGA 4CF1A 3AAQA 2HNYA 2O8BA 4B3SK 3RR8A 4M42A 1YI2N 3ZX0A 5CHIA 4JI4K 3LZJA 1HNZK 4CEAA 3LAKA 5M1PA 3IKMA 4J2BA 5M1NA 1X1PA 4KBOA 1YT3A 3UE5A 4FJ8A 4JV5K 4QS7A 3MAQA 1MWKA 4AM7A 2IOCA 4KHSA 3AO5A 4NCAA 3VERA 1C1BA 3ZSOA 2E20A 4O0IA 3QFPA 1BHLA 5C10A 2ZJRL 3O80A 3VQBA 1KVCA 3O8MA 3M8QA 5J2QA 4I2PA 1NGDA 1BIUA 1BCOA 3AVHA 3ZT2A 4DWIA 4F2SA 3ZYYX 3IRXA 4DUYK 1NGIA 1JXBA 4ID1A 3PO4A 2VG5A 4B3RK 1WAFA 3R9PA 3WEEA 2RHKA 3ATUA 4CIGA 2X74A 3CFOA 2F9WA 1VRTA 5A2QO 3CJ9A 4ZHRA 4W5TA 3TAQA 3K5OA 2PBDA 3K5MA 1EQYA 3J81O 2D0CA 3HYFA 4RTFD 4CIFA 4JI2K 3AGKA 3SPZA 4WE1A 4H03B 2HMIA 3C95A 3NMUA 1CXQA 5EXWA 1WBBA 3KKRA 4FJHA 3AA3A 4LH5A 4FLUA 2D0OA 1UA0A 3TTCA 2O8DB 3C65A 3QEVA 3LDNA 2G8VA 2O4GA 1ZXOA 3PLAA 1V4TA 1RDDA 4FM2A 1ZC6A 1S9GA 3EL2A 4KO0A 2Z1HA 3ZSZA 4DR1K 5HL7L 2OPPA 4H0TB 5LJVA 3QO9A 3NGIA 3RSEB 2UXDK 3K9JA 1XNQK 5AQGA 3AO2A 3CIPA 2UYTA 4E1MA 3VENA 3C6UA 1U6ZA 1GLJO 1Q8IA 4CZKA 1QSYA 3VTHA 4F3OA 4WQ4C 5AQFA 3HP6A 5JENA 2DFEA 3SAHA 4CF8A 1IKVA 1NKBA 4H0VB 3E9PA 3O9QA 1C1CA 2P51A 3DOLA 4FJ9A 3RTVA 4PWDA 1H1VA 4BRMA 4H0YB 4YOXA 4ILHA 4DFJA 1K9MO 3RRHA 3OYNA 4Z94A 2BE2A 4CD3A 1TK8A 4KHUA 4CZHA 1S3XA 4K8ZA 4BRDA 1NM1A 3WQUA 4CJFA 2O4IA 4CZLA 2YNFA 2PZSA 3CG7A 2XHBA 3IDHA 1JLAA 4KHYA 4CEDA 1CLQA 3K5LA 3FZHA 2ATQA 2RPIA 3UKRB 1KQSM 1RT1A 3BGRA 3A5LC 1WSIA 3N4QA 3IUCA 4IWVA 4ZTJA 2FLOA 4H5RA 3T1AA 5KQ8A 3LANA 1RDCA 1XNRK 1HX1A 1WLJA 5GAEP 5CZ2A 3NF8A 3CQXA 3RMCA 3D2EA 4EAHD 2Q1NA 4FW2A 3VQ4A 1WSHA 2OA8A 2QM1A 2VG7A 3R1XA 5M1OA 4Z4FA 2Q31A 1TL1A 5M1FA 4L8RB 2UUAK 1WUAA 3ENOA 2OTJN 1IBLK 1BDGA 3BF1A 5AQRA 4Z4CA 1QSLA 4OVLA 4FWNA 3M3ZA 1QVFM 1ZBHA 5J2MA 4B3MK 4FJXA 3QETA 2O8EA 4CJ3A 4DR2K 1TKZA 4IOCL 4CHPA 5J1EA 4B1ZA 1U47A 4DTMA 3WT0A 4U7BA 4JKHA 3CMEN 4H5WA 1Q82O 1MWMA 3L2UA 4MO5A 1C0GA 3AVFA 1ZBFA 1JL2A 1OKJA 2IS3A 3SAFA 1HJOA 5DK5A 1LW0A 4I6MB 3CM6A 4E89A 3PIOL 2DPNA 1FKPA 2FSJA 1K6YA 4DTXA 5GAHP 1HKCA 2WTUA 3J7YP 3MK6A 1WOQA 3CYMA 4DR3K 3AVNA 1ATSA 3HP9A 4KB0A 4LFAK 3HSTB 3SQ1A 2P5OA 1WN7A 3OYBA 3UKUB 4DU4A 3T19A 4CD1A 4Z4IA 4JRPA 4E7JA 4B9UA 1K8KB 2QKBA 3PX6A 3SQ2A 4O55A 2KZMA 4B9VA 4BRHA 1SZ2A 4NLBA 3ZSVA 5AFUH 4YOYA 1LAVA 3SCXA 1U49A 4CIEA 3EE9A 3CJ1A 4FWQA 5JVGL 3O4NA 4B9LA 2FF6A 2P9SA 1TAQA 4FWLA 1TL3A 4CE9A 1QHTA 2E2OA 3KLEA 3I33A 2EWSA 3KLIA 1GLFO 3O3FA 2P1JA 2G8HA 1Q86O 2E5LK 1IBMK 4CFCA 3SJHA 1RGIA 1L3TA 4JKCA 3T1YK 2ASPA 4H4OA 3K59A 1VSLA 1IJJA 1K8AO 1HR0K 4IFEA 3SBGA 3NE6A 3HI0A 3LDLA 3G0ZA 3LM9A 4E7HA 3H45C 4X64K 1VQ5N 1E3MA 2XY5A 1HNIA 4MDBA 1M90O 2JWLA 4JI6K 3AVAA 3AVIA 3PO5A 3DLKA 1L3UA 3V9WA 3KKSA 3CFPA 3SUPA 3O9TA 3KWIA 4AHVA 3F9MA 4FJGA 5AQLA 1NGHA 3OTOK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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