4H0VB

Crystal structure of nad+-ia(e378s)-actin complex
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
370
structure length
355
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Toxin/structural protein
molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
total genus 124
structure length 355
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0vB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0vB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0vB03
3HM8A 4H5WA 3MN9A 5AQIA 2ZGZA 4CZFA 5BPLA 3EKUA 2Q31A 3VGLA 2P9IA 3HTVA 4L3QA 3VEZA 1NGFA 3KZBA 3IUCA 5AZIA 5KQDA 5AQGA 2D0OA 3TPQA 1MA9B 5BPMA 2A5XA 3H3NO 2V7YA 1GLEG 4HTLA 5EVZA 3S41A 2QWNA 4WQ5A 1MWKA 4CBUA 5AQKA 3P4IA 4J8FA 1DKGD 1DGKN 3KVGA 3DXKA 5I9EB 5BRDA 5TKYA 5LJVA 3WEEB 5LY3A 3L6QA 2Q0UA 3VF6A 4BC5A 3O8MA 1HKCA 4A61A 4H5TA 4EHTA 4YDUA 3GL1A 4M63C 4B1YB 2GTDA 4FO0A 1TYQA 4XH5A 3A5MC 4BRKA 1NGHA 4M7XA 4E1JA 3L4IA 3TU5A 1NLVA 1IG8A 3ZETA 3W0LA 1R59O 3GDQA 3EL2A 1NBWA 3QBWA 3ATUA 2P9LA 3SJHA 3LDPA 2A3ZA 3CJAA 4FWOA 1YUWA 2E1YA 2Q0RA 2QWMA 3VGKA 4F9OA 3WT0A 3BEXA 3HI0A 3WXKA 1BA0A 2I7PA 1EQYA 2P9UA 2V52B 3J8AA 2HF4A 5E26A 3AARA 2ZF5O 4WQ4A 3D2FB 3VEVA 1K8KB 2A42A 4B1VA 5BN8A 2P9NA 4CZMA 2A40A 3QMLA 1U2VB 2Q97A 5AQMA 1OKJA 2CGKA 4BR4A 2F9WA 1YAGA 2NLXA 4EIAA 4BC3A 1J6ZA 2QW9A 2IIRA 5AQJA 4XH1A 3BF1A 2UYTA 2PAVA 4HWIA 2W40A 4FPAA 2H3GX 3VF4A 5AQRA 5F2RA 5AQHA 4BRQA 5AFUA 5AZJB 2GEMA 3BUZB 3DXMB 1HKBA 3U4LA 4BC2A 4BRIA 3LDOA 3D2EA 4Z94A 4BG9A 2CH6A 4MLEA 4QS8A 4FPBA 5LJWA 3CERA 4K43A 1NMDA 1X3MA 2A6AA 4IZ9A 3H45C 4FWPA 5ELZA 3RSEB 3AAPA 3U9DA 5F0XA 4PKIA 4BRHA 1XC3A 4O5FA 2P9SA 2VYPA 1QZ6A 1TUUA 2IVPA 5BRFA 2ASPA 4ISFA 3MMVA 3FGUA 4H5VA 1H1VA 3UB5A 4CZLA 3R9PA 3VERA 2Q1NA 4B1WB 1HJOA 2E1ZA 1KAZA 2FSJA 3CI5A 3ENOA 3W3DA 3ULEA 1NGCA 3QB0A 2P9PB 3SMPA 5AQPA 4IJAA 3BP8A 2P9KB 1XQSC 1HUXA 2FSNA 2AP1A 2OANA 5AQQA 1BWFO 4H5NA 2FXUA 3HSCA 3ENHA 2E2PA 4JD2B 3H46O 1IJJA 3WQUA 5CE3A 4H0YB 1JCEA 4RCHA 1NGGA 1S3XA 2V7ZA 5AQTA 3WXJA 3G25A 2QXLA 4BRCA 1QZ5A 2E2QA 3SMSA 4H0VB 5FPMA 4BRFA 3ZX0A 3MCPA 4K42A 2P9IB 5AQLA 3VESA 1NGDA 1X3NA 3UKRA 1P8ZA 3O80A 1QQOA 2A41A 1SAZA 5AZIB 4EHUA 3WQTA 3IDHA 2GWKA 3FZHA 3EZWA 4IWVA 5AQUA 3UE5A 5JMVA 3CQXA 3GE1A 1GLAG 3U8XA 1X9JA 3A5NC 3MN7A 4BGAA 4CJ7A 2E8AA 3UKUA 2D1KA 4H03B 3DXKB 3CIPA 1U6ZA 2KHOA 1HPMA 5ADXA 3WXLA 4BG8A 4IO8A 4BR5A 4CBXA 4CD3A 2GUPA 1BG3A 1NGJA 1RDWX 2YHWA 3A5LC 1JCFA 1HX1A 4BRLA 4AM6A 4FWSA 1ATRA 3LDNA 2ASOA 1V4SA 4FWRA 4QS7A 4AM7A 3ZEUB 1KXPA 4PKHA 3R8EA 4CZKA 3VGMA 5AR0A 1CZAN 4PL7A 5BR9A 5AFUH 3ZETB 4ISEA 2E20A 3H3OB 3CJ1A 2P9LB 1U2VA 1ZC6A 1ESVA 4BR2A 2NZTA 2Q2RA 1NGAA 3VEYA 1C0GA 3A0IX 2VCPA 4JAXA 2QWOA 4WQ5C 4BRMA 4JHDB 3LM2A 1SQKA 4DB3A 4BRDA 4DHYA 4MO4A 4A2BA 1NWKA 1TUYA 3IMXA 2HMPA 1Z05A 3CQYA 3QFUA 2AA4A 1D4XA 4FSVA 4JN4A 3SK3A 3I8BA 4ISGA 4YDUC 3ZX2A 3C7NA 4BRPA 4QS9A 5BREA 2ITMA 1RFQA 3RSEA 3C0BA 1GLDG 3DWLA 3FR0A 3EO3A 1MWMA 2CH5A 5FPEA 3R6MA 2CGLA 5AQYA 1BA1A 1YXQA 5AQWA 3VF2A 4H0TB 2EWSA 2HF3A 4XH4A 4GNIA 3VENA 1NM1A 3CJBA 2E2NA 3D2EB 4CBWA 3DAWA 5JLHA 3CHWA 1QHAA 4I6MB 5AQZA 4CZEA 1MDUB 1ATNA 2YHYA 3VOVA 1T6DA 1NGEA 3O1BA 5BN9A 1T6CA 5AQFA 2I7NA 4WQ4C 5AQSA 2IVOA 4H0XB 2P9SB 3LM9A 1G99A 1QQMA 5BPNA 2BUPA 3B8AX 4NB4A 3FLCO 3MN6A 5AQVA 4JNEA 3U9ZA 1HKGA 3SLCA 2HOEA 4PKGA 5JLFA 3M1FA 1LOTB 5KPTA 3CJCA 3ULEB 3FZMA 4IXCA 3O4WA 4FWLA 4MLHA 3D7EO 4O8KA 2QWQA 3VEXA 2QWRA 1HLUA 4FWKA 1T44A 3CETA 4CZIA 1SZ2A 1RGIA 5E84A 1KAXA 1KAYA 2FLOA 4PL8A 4BQLA 3WUHA 4FOIA 3H6EA 3IFRA 3GG4A 1ZXOA 4BR7A 5ADXH 4CZHA 3FZLA 3ID8A 4B1XB 2ZGYA 3WEEA 2W41A 1Q18A 5KPZA 3M6GA 4IJNA 3F9MA 2BTFA 4A2AA 3O5BA 4NO7A 2IVNA 3FFKB 4B9QA 3KHYA 2F9TA 2J4RA 3I33A 4BGBA 1E4FT 2PBDA 1BU6O 3QDKA 4MO5A 2DPNA 3UKRB 3JXUA 2FF6A 3OHRA 2GELA 4B1UB 5EX5A 4DCHA 2WUSA 4BRAA 3CJ7A 1GLBG 3O1WA 2YJEA 3M3ZA 4RTFD 3A5OC 4A62A 3FZKA 3VETA 4B1ZA 4BQZA 4FWNA 2FF3B 2Q36A 1TYQB 4WYBA 3QICA 3CJ9A 3ZEUA 3UKUB 2CGJA 2YI1A 3D2FA 3DJCA 3QBXA 1K8KA 1BOTO 1DEJA 4H0OA 3L0QA 4RWTA 2E2OA 5FPDA 1Y64A 3GOIA 1QQNA 4BR0A 1WOQA 3LDQA 3O08A 5EY4A 4H0PA 4XEIA 4BR9A 3MN5A 2P9UB 4H5RA 2D0PA 4JHDA 2D4WA 3A8YA 4FWMA 4K41A 1ZBSA 5AQXA 1S22A 3EN9A 4GY2B 2YCHA 2P9NB 5AZJA 2YJFA 3DXMA 1BDGA 4FWQA 5B8HA 5AQOA 4FOEA 4CZGA 3JS6A 2QM1A 5BRHA 1GLLO 3H1QA 3MDQA 1GLJO 4CZJA 5JICA 4Y0WA 3AAQA 2E88A 4CD1A 1XUPO 4CI6A 1BUPA 3LL3A 4DQ8A 4BRNA 3QFPA 2ASMA 4BROA 3FZFA 3ZX3A 2VWBA 1Z6RA 1WUAA 3MK6A 3VEWA 3ATVA 4M7YA 5FPNA 4EAHD 4K25A 3C7NB 1BO5O 1E4GT 4BVPA 3FE1A 2QWPA 4I6MA 3GBTA 2YHXA 1NGIA 5EOYA 2P9PA 3VPZA 4BRGA 4FL9A 5F1XA 4C23A 1LCUA 1JCGA 4LC9B 1YVNA 2P9KA 3VEOA 2GWJA 3H1VX 4KBOA 1C0FA 3O6WA 1GLCG 1NGBA 4BC4A 2NRHA 2FSKA 5AQNA 3HBTA 4BREA 2V51B 2ZWHA 4JD2A 5EXWA 5KPRA 2QWLA 3BF3A 3LDLA 1GLFO 1V4TA 3EKSA 4EFHA 1ATSA 3AY9A 3WXIA 5KQ8A 4BVOA 3HZ6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DSLA 3HM8A 1BCMA 3ZT0A 2X6SA 5BPLA 3DI6A 3EKUA 3L2WA 2P9IA 4AH9A 4NYFA 4L3QA 1NGFA 4CJRA 5AZIA 1RILA 4DLGA 4OLAA 1EXQA 4JKEA 4DSFA 1EP4A 2I5JA 4CFAA 3T69A 1VRUA 3DLLL 3NF7A 1O13A 1I94K 3S3OA 4OX9K 1N8RO 4HTLA 4UQGA 1QS4A 4IG0A 3S41A 1VK0A 2QWNA 3RTVA 1MWKA 2UUBK 1DGKN 3KVGA 5LJVA 3DXKA 3CMAN 5BRDA 3AO2A 4IEEA 5KRTA 3VF6A 3CCLN 2BDPA 3QESA 4H5TA 5FDLA 4YDUA 1OVYA 4GMJB 3G4SN 5IT9O 3NVKA 3TU5A 1HNVA 3ZETA 4DU1A 2NRVA 4IO9L 2P9LA 3NF8A 2QEXN 3OYHA 4FWOA 2E1YA 5DM6L 3OYEA 3C6TA 3HI0A 4NLCA 3WXKA 3EZ5A 1BA0A 5A2QO 3C6AA 3J80O 2V52B 1XHXA 3J8AA 2HF4A 4H4OA 1OH5A 1NK7A 3DLEA 3CMEN 2ZF5O 4M41A 1K8KB 3N4QA 4BE0A 4CZMA 3T7ZA 4F2SA 4WFNL 1U2VB 2Q97A 5AQMA 3ID6A 5J1EA 4K8XA 2F9WA 3CPWM 2NLXA 4EIAA 2QW9A 2KW4A 3SQ0A 2BH1A 5LMUK 1U49A 3HOTA 3DLRA 2G8IA 2IAJA 3L2UA 3BUZB 3DRRA 4O55A 1YJ9N 4BRIA 3U4LA 4U67L 1QVGM 4BG9A 4FPBA 5LJWA 4DQIA 3RSEB 2A6AA 4A57A 3H45C 2ITGA 3AAPA 4UY8O 2P9SA 4W5NA 2IVPA 1ZBUA 3PIOL 4DTRA 3MMVA 2G8UA 4V19S 3C94A 1HQEA 3ALYA 4B3TK 1O1WA 4W5OA 3K59A 1BGXT 1VHXA 3QLHA 4B1WB 1HJOA 4JKCA 4JKAA 1KAZA 2FSJA 4N47A 3CI5A 4O0JA 3G0ZA 3W3DA 3ULEA 3QB0A 2P9PB 5AQPA 1CXUA 3AGRA 5KI6A 4FZZA 1U04A 5AQQA 2KQ2A 5JVGL 3HSCA 1A5WA 2C1GA 1JL1A 4ID1A 1WSFA 1JLEA 5D3GA 2OA8A 4CJUA 3H46O 3WQUA 2V7ZA 2O4GA 3G25A 2QXLA 3KWIA 1NJIO 5BR8K 1QZ5A 4A5AA 3SMSA 3P31A 4H0VB 4DV0K 3T1YK 5C15A 1S1UA 3ZX0A 3RMBA 4PUOA 1NK8A 4JI6K 1NGDA 1JL2A 3TTDA 1P8ZA 1HJRA 3O80A 1QQOA 1GOAA 3IDHA 4LFAK 4MDBA 4DTOA 3LP3A 4FLVA 3CF5L 1B92A 4GV6A 3CQXA 3KD1E 4FCYA 3THXA 1GLAG 1UWBA 4O44A 3A5NC 3MN7A 1NKEA 5CY4A 3DLHA 3CG7A 4QCLA 3R3LA 4H03B 3CIPA 4BG8A 3L3UA 3I56N 4IO8A 2FBTA 3IRXA 2D0CA 3CCJN 4CK1A 1NGJA 2WBNA 3OJSA 1I3AA 4JV5K 4FWSA 1TK8A 1ATRA 4ILJA 4CECA 3LDNA 4FJNA 1B9DA 3LWMA 3AVCA 4FWRA 4FZYA 3QINA 2RPIA 1WN7A 4CJKA 4OO1J 1RBUA 3VGMA 5AFUH 1G15A 4DR7K 1ESVA 3RRHA 2Q2RA 1NGAA 1C0GA 1TVRA 4DFKA 1NJYA 4CJSA 1S9EA 3V9UA 3VQPA 1SQKA 4DB3A 4BRDA 5HRSA 2OPQA 4A2BA 5JVHL 1S72N 2O8FA 3IMXA 2HMPA 3ZT3A 1L5UA 2KZMA 3HXMA 5I42A 1WBBA 5M1PA 3AVAA 2AA4A 3ZX2A 4ISGA 3WXMB 1WB9A 4G9ZA 4BRPA 4Q0BA 3HSTB 4YOVA 4QS9A 4C8MA 3FR0A 3DWLA 4YORA 3CCUN 1KLNA 4KTWA 2CH5A 5FPEA 4F3TA 3R6MA 3HPGA 1NOZA 4H0TB 4IFVA 2HF3A 3ZSXA 3CCQN 1YVUA 3CJBA 4CBWA 4I6MB 4CZEA 4KO0A 4Z4FA 1NGEA 1T6CA 3K9JA 4GW6A 4WQ4C 5AQSA 4RW6A 4DV2K 1Q8IA 2FBXA 4KH4A 2UUCK 3THVA 3B8AX 1BIUA 3MN6A 5AQVA 4FJJA 5GIPA 1NK4A 3SLCA 1Y97A 3M1FA 2RF2A 4IXCA 3O4WA 4MLHA 4O8KA 4C1NK 2HHIA 3KKSA 2VQEK 3CPEA 1VRTA 1J5OA 1W9HA 3PIPL 4FLYA 3RMAA 3AA2A 3AO1A 4CZIA 4HUGA 1RGIA 4JI7K 1KAXA 4FOIA 4CZHA 3ID8A 4CEQA 4W5TA 1VQ8N 4M3WA 4CGHA 2ZGYA 4BEBA 4DR3K 3MX2A 4DTMA 3LANA 3M6GA 5JS2A 3RWUA 2BTFA 1FKPA 2IVNA 4B9QA 5KGXA 3LAKA 1IO2A 4B3MK 3NCIA 4Q5VA 3G10A 2HBLA 4KHSA 3OYAA 1N5YA 3ZT4A 2DPNA 2P1JA 3JXUA 1S1WA 4BWMA 2PYLA 3OHRA 3MWTA 4HTUA 4DCHA 3CJ7A 3K57A 5DM7L 1KRPA 1A5XA 1OH6A 3M3ZA 4B9UA 4B1ZA 2ZD1A 5TKWA 3H08A 1C0UA 2RN2A 4WYBA 1FJGK 3CJ9A 1JLCA 3UKUB 1SS6A 3QIPA 3QBXA 1K8KA 4NCAA 4EZ6A 2OPPA 4KREA 4BE7B 3OYNA 1A5VA 1JXBA 1TAQA 1KFDA 3LDQA 4H0PA 4JI2K 4BE1A 3WNHA 3A8YA 5AQXA 4N41A 1KVBA 4FJKA 1N6QA 3CYGA 3OYGA 5B8HA 4QAGA 5AQOA 4FOEA 3JS6A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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