4H0YB

Crystal structure of nad+-ia(e380s)-actin complex
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Toxin/structural protein
molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
total genus 127
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0yB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0yB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0yB03
2IVNA 1GLBG 1RGIA 1GLEG 1NM1A 2YHYA 1NGAA 3EZWA 2QWQA 4YDUA 2E1YA 4JNEA 4BROA 4HWIA 1NGCA 3MCPA 2D0OA 3DAWA 4EFHA 1NGDA 4I6MB 1X3MA 1ATRA 3QFPA 2CH5A 3VESA 5EVZA 4FWMA 3DXMB 3EKSA 3WXIA 3SLCA 3SMSA 3A5LC 1YVNA 3A5MC 3HM8A 4H0TB 5EXWA 3VGKA 3LDLA 2FXUA 3D2FA 3JS6A 3LM2A 2FLOA 5AQLA 2FSKA 2P9KA 3EO3A 3ZX0A 1MA9B 3DXKA 4BRQA 2GTDA 1BG3A 4FPBA 1NLVA 3H46O 5FPEA 1TYQA 3O6WA 1U6ZA 1J6ZA 2P9NA 3S41A 3LDNA 3W0LA 2DPNA 1IG8A 1NGEA 4PL7A 1Q18A 4BRLA 4CD3A 5AQNA 1E4GT 1SZ2A 4A2BA 2P9LB 2PAVA 2I7PA 5AQGA 3AY9A 3IUCA 3ZETA 4H5TA 2QWMA 3CIPA 3I33A 4FWQA 1NGHA 4H0PA 4ISEA 1T44A 1HLUA 3D2FB 3MMVA 4B1YB 1Z6RA 4O5FA 3W3DA 2E88A 2A6AA 2P9KB 3FFKB 3JXUA 2E2PA 3DXKB 3GG4A 4BC5A 2D0PA 3KZBA 3O08A 2YHXA 4FPAA 1SAZA 4PKGA 5TKYA 2P9PA 4A61A 1TYQB 1S3XA 3VEYA 4JN4A 3CHWA 1Y64A 4RTFD 2P9NB 1HKBA 1ZBSA 3MK6A 4BVOA 2E1ZA 1V4TA 4BC2A 1YUWA 2KHOA 2QWPA 3UE5A 4BR2A 3L4IA 2E2QA 1JCEA 2HF4A 4B1UB 4CBWA 1BO5O 3LL3A 3ZETB 5BR9A 4M63C 3A5OC 2CGJA 1EQYA 5AQJA 4BRPA 4FO0A 3FGUA 1U2VB 3FLCO 2CGKA 2VCPA 3VF2A 3IMXA 1QHAA 1NGJA 2D1KA 2FF6A 2W40A 2P9IB 5AFUH 4FOEA 1H1VA 5KPRA 4IZ9A 4XH5A 4C23A 5EOYA 1ZXOA 4FWSA 3WEEA 3L0QA 4B1VA 2GEMA 4BGAA 3CJCA 4BR4A 4IXCA 3CQYA 1XQSC 1SQKA 1X9JA 4KBOA 2NRHA 1NGFA 4BC3A 5KPTA 1HJOA 1P8ZA 3CJ7A 5AQWA 4BRIA 2F9TA 5LJVA 3LM9A 5ADXH 1GLAG 2Q0UA 2QW9A 5ELZA 3ZX2A 1T6CA 3GBTA 1HX1A 3FZMA 2A3ZA 5AQIA 2CGLA 3ID8A 4GNIA 4JD2B 4LC9B 3QBWA 5F0XA 3WXKA 3EN9A 5BN8A 3M3ZA 3H1VX 2YJEA 4H0XB 5BN9A 3GL1A 4CZHA 4FWPA 3ULEB 5KQ8A 3CJAA 4H5VA 4AM7A 4NB4A 1BUPA 3DJCA 4FOIA 3A0IX 1QQOA 4BRCA 3R9PA 5JLHA 4MLEA 4BRNA 4NO7A 3VGMA 1KAXA 4CZMA 3MN5A 1X3NA 3VERA 4ISFA 4MO5A 3HZ6A 3FZFA 1NGGA 2IVOA 3CJ1A 3MN7A 3GE1A 1GLLO 1ZC6A 3O4WA 3VF6A 4CI6A 3QMLA 1WUAA 3J8AA 1BA1A 2Q97A 3ATVA 5AZJA 4H5WA 4BC4A 2E2NA 3H3NO 1BU6O 2E20A 3U9ZA 1DGKN 1XUPO 1HPMA 5I9EB 2QWNA 4H5NA 3VEZA 2QWOA 5AQRA 1NMDA 3U9DA 4CZIA 4QS8A 5AQHA 4A2AA 3R6MA 1ATNA 4FWKA 4CJ7A 2Q0RA 5FPNA 3D7EO 3U4LA 4FWRA 4FWNA 4JHDA 3TPQA 4CD1A 5EX5A 1LOTB 3LDOA 3VENA 1DKGD 1NBWA 4XH1A 5AZIA 3H45C 2YJFA 1C0FA 5AZJB 5EY4A 3VEVA 2ZGZA 2I7NA 1MWKA 4L3QA 4BRFA 5F2RA 2VYPA 1DEJA 3AAPA 3VGLA 4EAHD 3HBTA 2Q31A 5LY3A 3LDQA 3O1BA 4B1ZA 2P9UA 5JMVA 4J8FA 4RCHA 4K42A 4M7XA 5LJWA 4WYBA 3ZEUA 1S22A 2ASPA 3HTVA 5AQXA 4BGBA 4Y0WA 5AQTA 4DB3A 1ATSA 3L6QA 4BQLA 4CZKA 2VWBA 4K43A 2HMPA 2P9PB 3AARA 3O80A 4BRHA 4F9OA 5AR0A 1KAZA 3WXLA 5BRFA 4MO4A 2Q2RA 4QS9A 2PBDA 1NGBA 1IJJA 3D2EA 1QZ6A 3CJBA 1GLJO 3SJHA 2P9SA 1TUUA 4CBUA 2QXLA 1BWFO 3C0BA 3G25A 2A41A 3MN6A 3BF1A 3QBXA 2P9UB 2Q36A 3WQUA 3H1QA 4PKHA 1OKJA 4CBXA 2CH6A 3CQXA 3VOVA 3FE1A 3R8EA 4BRDA 4B1WB 3A8YA 3TU5A 3KVGA 1KAYA 3LDPA 3A5NC 4CZLA 3ZEUB 4EHUA 4BRMA 5AQMA 3SMPA 3KHYA 4I6MA 1WOQA 2F9WA 2QWRA 3ENOA 4H5RA 3VEOA 3EKUA 4BREA 2QWLA 4H03B 3WEEB 2GELA 4K25A 1NWKA 2BTFA 4FWOA 2GWKA 2OANA 3C7NA 3ENHA 4H0VB 5AQPA 1CZAN 1BOTO 5AQVA 1GLFO 4O8KA 5BRHA 3D2EB 2ASMA 4BR0A 1C0GA 1RFQA 2A40A 2HOEA 4H0YB 4WQ4C 5BPMA 2V51B 1LCUA 3CETA 3VF4A 4WQ5C 1KXPA 5AQQA 1K8KA 4BRAA 3U8XA 2ZWHA 2UYTA 5FPMA 4BRGA 3FR0A 3FZHA 5AQKA 4BVPA 2H3GX 3BUZB 2IIRA 2FSNA 2D4WA 3M1FA 3O1WA 4QS7A 4ISGA 2GWJA 1QZ5A 1MWMA 4CZGA 5E26A 3C7NB 2P9LA 2IVPA 1D4XA 5JICA 2YCHA 4XH4A 1QQNA 3B8AX 2HF3A 5B8HA 4B1XB 5BREA 4GY2B 1MDUB 2GUPA 1K8KB 3HSCA 3QDKA 4IWVA 1GLDG 3FZLA 3EL2A 5AQSA 1TUYA 3UKUA 5CE3A 3RSEA 4DCHA 1E4FT 3I8BA 2V7YA 1JCFA 3GDQA 4YDUC 2ASOA 3P4IA 4BRKA 4E1JA 2AP1A 4DQ8A 5E84A 3O8MA 4EIAA 3ATUA 3WXJA 4BR7A 5KPZA 2ZF5O 1XC3A 2V7ZA 5AFUA 2W41A 3HI0A 3AAQA 4M7YA 3VPZA 2EWSA 4A62A 5BPNA 1R59O 2WUSA 2A42A 3FZKA 4IJAA 4CZFA 3CJ9A 1GLCG 4IJNA 4JAXA 1U2VA 3VETA 4BG9A 2NLXA 4CZJA 2Q1NA 3MN9A 1QQMA 5BRDA 5AQFA 1BDGA 3UKUB 2P9IA 3RSEB 3UKRA 4K41A 2YI1A 4RWTA 3O5BA 5ADXA 3BP8A 4JHDB 4XEIA 3WUHA 3CI5A 4BR5A 3SK3A 1HKGA 2AA4A 4FWLA 3IDHA 5AZIB 4B9QA 4Z94A 1HKCA 3QICA 3QB0A 4FL9A 2E8AA 4HTLA 3WT0A 1BA0A 3IFRA 4PL8A 5KQDA 3F9MA 1JCGA 4WQ4A 3CERA 2ITMA 4WQ5A 5AQYA 3M6GA 3MDQA 2BUPA 4CZEA 2ZGYA 4BR9A 2FF3B 4AM6A 1YAGA 4JD2A 3GOIA 1YXQA 3QFUA 3UKRB 2V52B 4PKIA 3BEXA 2NZTA 5AQZA 3ULEA 3H6EA 1ESVA 4MLHA 2E2OA 3OHRA 5FPDA 5F1XA 3DWLA 5AQUA 3ZX3A 2FSJA 4BG8A 1V4SA 3DXMA 5JLFA 1G99A 3BF3A 4DHYA 4BQZA 4EHTA 3H3OB 3WQTA 3UB5A 2P9SB 1T6DA 5BPLA 4H0OA 1HUXA 1NGIA 1RDWX 5AQOA 2YHWA 3VEWA 4FSVA 3VEXA 2QM1A 4IO8A 2A5XA 2J4RA 1Z05A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2IVNA 1GLBG 1RGIA 3SAGA 1VQPN 2QWQA 3TABA 2E1YA 4JNEA 2HMIA 4HWIA 4FLVA 3MCPA 2D0OA 2NRWA 3DAWA 4DV2K 3PIOL 4EFHA 3LP0A 3QNNA 2RF2A 3MEGA 3OS0A 3DLEA 3VESA 4B3MK 3K2PA 3SMSA 4H0TB 3HM8A 4Z4CA 3VGKA 3OYJA 2HHXA 4ELVA 4LSLA 3QETA 2NRZA 3JS6A 5C10A 5I3UA 5HBMA 3DRPA 3ZX0A 1JLAA 3QERA 3V6DA 3DXKA 3PIPL 3OYIA 3OTOK 1NLVA 5CYQA 1TYQA 4V19S 2HBKA 3HJFA 1UA0A 4LFAK 1U6ZA 4DQRA 2GX9A 4F2SA 3LDNA 3W0LA 1KRPA 2DPNA 2B4JA 3KKRA 3P39A 1Q81O 1Q18A 4BRLA 3J7ZO 3K59A 2O8BB 1IKXA 5AQGA 3AY9A 4M41A 2YKNA 2WTUA 4KHUA 4H0PA 4FWQA 5JENA 1T44A 4I9LA 1KLNA 1HLUA 4B1YB 4CGDA 4A5BA 2C1GA 4DTJA 3VQAA 2XY5A 3D6RA 3GG4A 4BWMA 2D0PA 4AILC 3L2RA 4FXDA 4PKGA 1I94K 4RTFD 1HKBA 1HQUA 1YUWA 2QWPA 2WONA 4CCHA 2ZE2A 2KTQA 1RBSA 4M3RA 3QEIA 1JCEA 4RW8A 1VQ4N 3LL3A 3ZETB 5FROA 5BR9A 3QEPA 4CIFA 3FLCO 2G8KA 2VCPA 1NGJA 4JKHA 2W40A 2P9IB 5AFUH 4FOEA 4XH5A 2W00A 5EOYA 1JLFA 1X1PA 3L0QA 1S1XA 3ISNC 4FW2A 4B08A 1OVQA 4B1VA 3U3YA 5FDLA 3KLFA 4KB1A 4CK1A 3NF6A 1EWRA 1WSFA 5KPTA 1P8ZA 4LY7A 1TKTA 4DR1K 2NUBA 4BRIA 5LJVA 1BI4A 2G8WA 4LD0A 1ZBFA 1IKWA 4X65K 1T6CA 1HNIA 3KD5E 1HX1A 5AQIA 4CVNE 2CGLA 3QESA 4Y1CA 4C8OA 4IO9L 5JS1A 5F0XA 4DTOA 1L5UA 3WXKA 3EN9A 1NJWA 4H0XB 4U7BA 2NRXA 3CJAA 3CFRA 1BUPA 4DTRA 2NRVA 1QQOA 4Z4FA 4BE2A 4BRNA 4NO7A 2YX6A 3ZLJA 5M1OA 3VGMA 3MN5A 4W5TA 4DV6K 1HNZK 3RRGA 1JLEA 3RMCA 3CCLN 4FJNA 3S3NA 4QAGA 1GLLO 3VF6A 1W9HA 1RBRA 4E72A 5FRNA 1C6VA 4DV4K 3QMLA 1WUAA 2KW4A 3J8AA 3ZSWA 3MX5A 3ATVA 2E2NA 1BU6O 1XUPO 3K58A 3V1QA 1KFDA 5AQRA 3L2WA 4M3YA 4CZIA 4QS8A 5AQHA 4DR2K 4CJ7A 5T7BA 4I9QA 4KTQA 3C94A 1NJYA 1VSKA 3DLHA 4JYAK 4FJ5A 1T3VA 1HYSA 2B6AA 1Q82O 3DLBA 3VQQA 3TTFA 4CEAA 3RMDA 1C1BA 4G1QA 1KCFA 4BWJA 4CJTA 3T1AA 2F4VK 1XI1A 1MWKA 4W5RA 3AAPA 3QLHA 4KAZA 3VGLA 3PO4A 4PY5A 2Q31A 5LY3A 1S1WA 3O1BA 4LFCK 3RR8A 3LWMA 2HHWA 4RCHA 4JS5A 3QIPA 4OLBA 1JKHA 4DTMA 3ZEUA 3DLLL 2HBJA 2G8FA 3HTVA 4Y0WA 4CEZA 2VWJA 1KQSM 1ATSA 1L3SA 1T03A 2P9PB 5GADP 4FK4A 4DTSA 3P1GA 3AARA 4ILHA 3S5TA 1KAZA 4O55A 3WXLA 3ALYA 5BRFA 2Q2RA 1X9MA 1NGBA 1HR0K 1B9DA 3C0BA 2DFEA 1CZ9A 4KB0A 4CIGA 3QBXA 4Z0UA 1HPZA 4CEDA 4KHNA 1A5VA 1O1WA 1OKJA 3CQXA 3VOVA 3A8YA 3HSTB 3L3VA 1XWLA 3A5NC 1YJWN 4KHWA 3SMPA 3KHYA 4I6MA 1U45A 1WB9A 2F9WA 3ENOA 3NBPA 3VEOA 1ASVA 1U47A 3WEEB 2QKKA 4FWOA 4FJLA 2OANA 1P90A 4MDAA 4HUFA 4OKEA 1VSDA 4XJXA 1CZAN 3OBWA 4CEEA 3KLGA 1GLFO 5BRHA 3D2EB 4BR0A 3IRXA 4HUGA 4H0YB 1SL1A 4YY3K 3MEDA 3THXB 1EXQA 3K5LA 1WSHA 1C1CA 3F9KA 4BE7B 3E66A 3MAQA 2ZWHA 3SV3A 5FPMA 1DT9A 4BRGA 3FR0A 4JI7K 4BVPA 3NH0A 3BUZB 2BDPA 3PV8A 5JVHL 2D4WA 3O1WA 4ISGA 3AO1A 1QZ5A 1VAZA 1KC8O 4LH5A 3DLRA 4K0KK 3C7NB 4JLHA 4FM2A 3HPOA 5JICA 3CCQN 2YCHA 1TK5A 4NXMK 3TAQA 4AHRA 1QVGM 2HHSA 4WE1A 2HF3A 3EYZA 3QDKA 4IWVA 1C0UA 3M8PA 4DTUA 4DCHA 3AVHA 4IOXA 3SQ1A 4J2AA 3P38A 3AVMA 4AHCA 2ASOA 4HUEA 1RT4A 3KTQA 3O8MA 1SKSA 3ATUA 4JI8K 1GOBA 1XC3A 4E7KA 4DR7K 2QTDA 3HI0A 4KH5A 4A57A 4M7YA 3VPZA 1TL1A 5BPNA 4YHHK 3WXMB 2WUSA 2A42A 3VQPA 4IJAA 1GLCG 4JAXA 2VQEK 2NLXA 3DLKA 4B9TA 4WCEL 5AQFA 4LF4K 3FFIA 4RWTA 3JSMA 4JKDA 4DFPA 1IKYA 1S6QA 1UOCA 4OKKA 4KRFA 1Q9YA 3QB0A 4FL9A 1HMVA 3QIOA 1BA0A 1RTDA 2WBNA 4DTPA 3F9MA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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