4H6KA

W116i mutant of oye1
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
SFVKDFKPQALGDTNLFKPIKIGNNELLHRAVIPPLTRMRALHPGNIPNRDWAVEYYTQRAQRPGTMIITEGAFISPQAGGYDNAPGVWSEEQMVEWTKIFNAIHEKKSFVWVQLIVLGWAAFPDNLARDGLRYDSASDNVFMDAEQEAKAKKANNPQHSLTKDEIKQYIKEYVQAAKNSIAAGADGVEIHSANGYLLNQFLDPHSNTRTDEYGGSIENRARFTLEVVDALVEAIGHEKVGLRLSPYGVFNSMSGGAETGIVAQYAYVAGELEKRAKAGKRLAFVHLVEPRVTNPFLTEGEGEYEGGSNDFVYSIWKGPVIRAGNFALHPEVVREEVKDKRTLIGYGRFFISNPDLVDRLEKGLPLNKYDRDTFYQMSAHGYIDYPTYEEALKLGWDKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords NADPH dehydrogenase 1
publication title X‑ray Crystallography Reveals How Subtle Changes Control the Orientation of Substrate Binding in an Alkene Reductase
doi rcsb
source organism Saccharomyces pastorianus
total genus 155
structure length 399
sequence length 399
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4h6kA00
1KM2A 3P7YA 5D09A 1KA9F 1TRIA 1EP2A 2AAMA 5I3IA 4LS2A 2R94A 3TCEA 1JRBA 4GC4A 1DQXA 1YXDA 2NZLA 3BGGA 2ZCGA 1X8FA 4HNUA 3CM4A 2ALDA 3HG5A 4BI7A 1PCKA 5IBXA 4MZ1A 3BARA 1H63A 3QMSA 3FJ6A 1TPWA 1VHNA 1TPB1 3UNDA 4LC6A 3TV8A 2C0AA 5U7SA 5D2VA 4GNJA 5IM51 4I7UA 4O52A 3GXNA 5DELA 3M47A 3OEXA 2Y7FA 3DXIA 2X1RA 1OYAA 4MFDA 5DBTA 1J4EA 4Y8FA 3TAOA 4I9AA 3EB2A 3DKLA 1GPWA 3BG3A 1TQJA 2OMAA 5D30A 2DJLA 1JCLA 5F2MA 3DFNA 1G7UA 3S0CA 2V82A 3LCWA 1BWKA 4LOCA 1SZGA 2P0OA 3UWUA 2P10A 1FXQA 3EWBX 3EWWA 3TSDA 4UFMA 5EKYA 1CI1A 3G0XA 4OGZA 5DY3A 1KM5A 5F2GA 3FLUA 3CEUA 4AWTA 5FI8A 4JTEA 4X9SA 1KM3A 1FWWA 5G5IA 1TO3A 3LBMA 2YDAA 3KVLA 1W3NA 1VR6A 4BR1A 3A21A 3KRSA 5BW6A 3G3MA 3MBFA 5HR6A 1F2JA 3E9AA 4FIQA 2QDHA 3GB6A 1SO3A 4FNRA 1JVNA 2VEPA 4YXGA 5DCEA 4Z08A 1JCJA 3JS3A 3W1QA 3EWXA 3OVPA 1LCOA 3RF9A 3UWQA 2YX0A 3O06A 3HB9A 4HN4A 4IGHA 3U8GA 2W79A 2CLKA 3B0VC 1JCNA 1WBHA 1GVSA 1SW3A 5HMSA 1LLWA 3LTSA 5AN7A 4JTHA 4UR7A 4RK8A 3W6YA 1QFEA 4ICNA 1FDZA 1W5MA 2JBMA 1QPOA 3NL6A 3MBDA 4MKNA 1FXPA 3W3OA 5FEPA 4MPQA 1OX4A 3EWZA 1SPQA 5D32A 3M0ZA 3C6CA 4OQVA 2TYSA 1W0MA 1SSDA 4N9EA 1YLVA 3LHUA 2CLHA 2VFDA 3R2GA 3W2UA 4M7SA 5KTLA 1B3OA 4OBTA 2NV2A 5BMXA 2WPBA 4IUOA 1WA3A 2RKXA 3B0PA 4QITA 3BW4A 1OX6A 3TJLA 4UFIA 3VFLA 4LS1A 3A5VA 4DQWA 5EYWA 4P61A 5TQLA 2E09A 1NF0A 3MMTA 4O13A 1TJRA 3GIYA 1VZWA 4GBUA 4RX0A 2WKJA 3HGOA 1SZNA 1OX4B 1A5AA 4K38A 2NLIA 5E1QA 2WO5A 4HNTA 4D2JA 4BI6A 4UR8A 2KZHA 4RV8A 2CZDA 1KM6A 1L6WA 5H2ZA 3ABQA 3B03A 4LVDA 4O54A 3UY7A 4AWSA 4W9TA 4O8RA 3O05A 5J5DA 2C14A 3E02A 4JTTA 4NT0A 2ATMA 5FF7A 2VELA 1W5OA 3NQAA 2H3BA 3W7QA 2ISVA 1PHWA 1DJQA 3LHWA 3ANYA 4O0KA 5D04C 2J9ZA 2NXHA 2WNNA 1K7XA 3W2MA 3HG3A 5I3JA 1O60A 3W74A 1GJPA 3G0SA 5D2TA 3W23A 3HPSA 2J88A 4HIBA 4DPPA 2BWGA 3A5FA 1SO5A 1XDLA 3C2EA 4IMFA 4FNUA 4Z0SA 1J2WA 4MZ8A 3P81A 3MHUA 2CLMA 1EB3A 4LY8A 4AWUA 4FX6M 2NV1A 4O53A 4XKYB 4UFHA 3O6CA 3EXRA 3W76A 3P60A 3M9YA 4MY8A 4Z1AA 2NX1A 5D2XA 4HPXA 3W2NA 4CNOA 3PUDA 4EF8A 2EF9A 3I65A 4M6PA 3NQEA 4NXSA 4OWGA 3W75A 1H62A 3W22A 3YPIA 4QISA 5LNVA 1R2RA 3W84A 1TV5A 3PG9A 1Q6QA 4LS0A 3TUUA 3M5XA 1T0OA 4NU7A 4LRTA 4YCPA 3I7QA 5H91A 1KW1A 3W1UA 2GPTA 4ZQPA 3BG9A 3W7MA 3UWVA 3VNDA 4ZL1A 1I2RA 4J9JA 3H55A 3G22A 1DJNA 4K7YA 2X1SA 2G95A 3QPYA 3UXAA 1AL8A 1PHQA 2QCEA 4Y9AA 1V7YA 4NJJA 3M1ZA 3S42A 3W73A 2ZRWA 2CLOA 4XZ9A 4A3UA 3ABOA 4OE7A 4M7TA 2ZRZA 2CLEA 5F1VA 3NM3A 4MJZA 3UXDA 1K8YA 2B4GA 3MI6A 3KXQA 3HPZA 4CNPA 4IPJA 2UV8G 1KFJA 3KVJA 1ZENA 2E1DA 4A2RA 1O95A 3LOTA 5AC8A 4GUHA 2YFNA 3QQ0A 2B7NA 2R91A 1KFEA 4NQ1A 1OFAA 1OK6A 4AVFA 3PS7A 3EWYA 5LGZA 2ABAA 3IVSA 4JTGA 4OV9A 1LRTA 1A5BA 1TTPA 4NZFA 3W1TA 2X1TA 4RXGA 1A50A 2ZRYA 3DFOA 4KWVA 3CPRA 2PCQA 4PH6A 1RPXA 2VEMA 2A7PA 3NOEA 3LHYA 1HTIA 4O1BA 3P84A 4UUIA 1YDVA 3UY8A 2IQTA 1R30A 2Z6IA 2H8XA 3L67A 3W7JA 2V30A 1U83A 2FFCA 1W5NA 1H7NA 2OZ0A 4JYDA 2CLIA 2YW3A 3QM3A 2ZZ2A 2DZUA 1OHLA 5EBUA 2H8ZA 1O5KA 4TO8A 4M6QA 1CX9A 3DFQA 3TNOA 2JKPA 3MJYA 2J9XA 3O63A 2C16A 4BI5A 2LLEA 3S1VA 2A7NA 2AGKA 3P5YA 4KFPA 3HQ1A 3S6DA 4CQ9A 3C56A 1SW7A 3B0UX 3P61A 4WQ6A 4RXFA 3GYEA 4JS3A 2OX1A 2OCZA 4RZ5A 1LOSA 3I6RA 3W7DA 3T78A 1RQHA 5BRBA 4LWWA 3Q2DA 5AC7A 1YYAA 2Y6ZA 1G67A 1VS1A 1K3UA 4PTNA 1K8XA 2A85A 5FEZA 4BWLA 3FYOA 3WJYA 3GDMA 1GVRA 3DFTA 4QSHA 4JGDA 3R5EA 4PFMA 1H50A 1LBMA 2FPYA 3QRHA 4IWWA 1M7OA 1OJXA 3M5YA 4LVGA 3EXTA 2A1YA 7TIMA 1XUZA 2J27A 4QJ1A 3TQVA 3L0NA 1PS9A 3CWOX 3QJAA 5LGXA 5AB3A 2ZRVA 3K30A 3SW6A 4MVAA 1RQEA 3W7IA 1IXNA 4AF0A 1O4UA 2FPVA 4A22A 2YCEA 2R8WA 4NJGA 3BLEA 4JYEA 3W2KA 3A9IA 5FEWA 4WY0F 1VQTA 2V2CA 3WK0A 4DBDA 3THAA 8TIMA 1OF6A 4UTHA 1RV8A 3H53A 3QPZA 4O19A 1U5JA 3QYQA 4CCDA 2Y89A 5D2WA 2I1OA 3OIXA 2GQ9A 2FIQA 2RH9A 3TR2A 3GAYA 3DENA 3HIJA 3LHTA 2VFHA 4Q33A 3VE9A 3LTYA 2DZVA 5CG7A 4CNNA 2ZTJA 3NQFA 2HS8A 2DZTA 4KFNA 2EGZA 4AF0B 1K7EA 4FXSA 3GKFA 5DCBA 5J5RA 1XC4A 3GZ3A 1JCMP 1I4NA 4O17A 3LLFA 4GUGA 1F74A 5DN1A 3TW6A 2GQ8A 2QF7A 1OFBA 3C2RA 1A53A 3EX1A 4UMAA 3DZ1A 3PBYA 2VFFA 4NJIA 4RKAA 4R34A 4NVTA 3NPXA 1YPFA 2VEKA 3TE9A 4IPIA 1MEWA 3C8FA 5IBXC 4FO4A 4PL1A 3NQCA 1FWSA 2X16A 3SI9A 3C2VA 4X3ZA 3LRKA 3LRLA 1TV7A 1E51A 3UPBA 2ZA3A 4Y90A 1Z44A 2VFIA 1TIMA 1EWDA 2A4AA 3VI2A 1L9WA 1GYLA 3G1SA 3STGA 3PF3A 1OG0A 5F2IA 3CU2A 3OG3A 1JR1A 3W7NA 3GDTA 1WX0A 5EL1A 2QR6A 2ZRUA 2EKCA 5LNUA 1QMLA 2V2DA 2B7PA 4TX9A 3UD6A 4A29A 4RZ6A 1OVDA 3KRUA 3L9CA 1X6UA 3USBA 3FYPA 1JUBA 1QWGA 4DF1A 5KINA 4Z1DA 2XN0A 2V5BA 4XUGA 3W7OA 2ZA1A 1FBAA 3W1LA 4H3DA 1SQ7A 5K3VA 1M5WA 1PL9A 3MP3A 2C3ZA 1Z48A 3CWNA 3IV3A 3TSMA 3LERA 1I2OA 1BKSA 3P5ZA 2FDSA 4NJKA 2B7QA 2B7OA 3OA3A 4DF0A 3S5ZA 1K8ZA 5HQEA 1XCFA 4UTIA 2NUXA 4UFLA 1GTEA 1TQXA 1LRQA 5F2LA 1XI3A 3FKRA 2BX7A 1SUXA 3FS2A 5D05A 3SJ3A 3G8RA 4JR5A 4PL2A 2ATSA 1GVQA 3V1PA 3LCFA 2ISSA 5FEXA 3TROA 4JTUA 2CZFA 3CIXA 3NPVA 1EPXA 1D9EA 3STEA 4XTDA 1WDWA 2TMDA 1F6KA 1BTMA 3NAVA 3MHFA 1JCYA 1TREA 2Q3OA 1FWRA 2BZNA 3W1AA 3B4UA 1SZFA 2QCFA 1KM1A 3M5ZA 2QCNA 1ZY9A 4X2RA 3SZ8A 1JULA 3O07A 3PULA 3WJSA 3EWUA 5DCDA 1SFJA 4UC5A 4LT9A 1N8FA 3NQ8A 3IIZA 1NF7A 4JDBA 2QUUA 1A5CA 2PC4A 1TYGA 1VPXA 4ONVA 4LW7A 3T55A 5CPNA 1HO4A 4OHQA 5LSMA 2A6NA 4JTKA 3EX2A 2YFOA 2NX3A 1RR2A 4WOZA 1G6CA 2XN2A 3TK7A 5D38A 3TSBA 1MZHA 3PB2A 1OFEA 5DBUA 2YR1A 4GWEA 3TFXA 2HS6A 1FCUA 2E77A 3SIZA 3WFAA 1QOQA 1F76A 3PY2A 3DI1A 3NQGA 1YDNA 5C6MA 4OU1A 4UTUA 3TXVA 5FF4A 2GQAA 3T7VA 3QZEA 1XUUA 4MFEA 4N9BA 3DBPA 2H6RA 2QAPA 1PE1A 4FHAA 4Z0JA 3QMRA 4E38A 3QMTA 1ADOA 4JEQA 3NZRA 3LCIA 5HUOA 5AHNA 2X1UA 2Q8LA 1UCWA 4O50A 2XN1A 4QNWA 5K4XA 5LZLA 1S5WA 5LHFA 5HNRA 1JUKA 3GLCA 2TSYA 3GK0A 2HSAA 1JRCA 2WSRA 1KFBA 1KFCA 5D03A 1LYXA 5EA9A 4MY1A 4TIMA 2WOQA 1Q3NA 2V8ZA 3G1YA 4KFOA 4ALDA 1WXJA 1G7VA 1H7WA 3LTPA 3HO8A 1KBJA 4RR4A 5CPMA 1UJPA 3UWWA 2YYTA 4BF9A 4UTWC 3P74A 3CC1A 1GVFA 1JJKA 3D0CA 5F4SA 3NQ7A 3W87A 2C13A 2JGQA 1DBTA 2VFEA 1C9DA 4MYAA 4K8HA 4UTTC 3LRMA 2J9YA 2WNZA 3G18A 3W86A 4FX8A 4N6FA 2Y62A 1A5SA 1EEPA 3F4NA 4HSOA 2CZ5A 1ZFJA 2A21A 2YPIA 1HUVA 5HR7A 5CKSA 3RLUA 3F4WA 1QAPA 4UIOA 1WV2A 2QUTA 1VHCA 3LXAA 3MO7A 1EA0A 3R89A 2H90A 3VKJA 3PR2A 2WQPA 3M16A 3BO9A 5HUPA 4MJMA 4U4MA 1ONRA 1M7PA 1K7FA 2Z2UA 3FOKA 4FNQA 1YADA 4N4QA 1VYSX 3LCHA 3QFEA 3NGJA 4GXMA 1GG1A 3NQMA 4HKPA 2QCMA 1OFDA 1VGAA 3P8JA 2BXVA 2B0MA 2Y70A 2QCDA 2ZDRA 4JIPA 4XTIA 4QQ3A 3B05A 1KFKA 1GVOA 2E6AA 4NZJA 3C52A 3HG4A 3W1RA 3N19B 4O1DA 1D3HA 4FIRA 1VYPX 2JK2A 2DZPA 5I3KA 4LVAA 3CHVA 5G4EA 3PB0A 4DXVA 3NQ2A 5CSSA 3STCA 1W5QA 6TIMA 1DVJA 3NPUA 3B06A 1NVMA 3VE7A 4S1FA 2FTPA 2A7RA 3FA5A 3NL3A 1LZOA 2GUUA 3DHDA 4N02A 5AHFA 4UCGA 3W7KA 4BK9A 1Q6LA 2PRHA 2JKEA 2ZZ6A 4PEKA 2YW4A 3TJXA 4AMAA 2E5CA 1EP3A 1OFOA 3NQVA 4ZMGA 3S5NA 3ATZA 4NXKA 4N6EA 3WJWA 4AEOA 1VLIA 4O10A 5MHBA 4A21A 2YGYA 1KTNA 4ADSA 1H51A 1VCGA 2C1HA 2CFFA 4N9CA 3CTLA 3NR0A 1RQBA 1UASA 3QC3A 3Q94A 1H7PA 2DJXA 1H7OA 4UNLA 5U4NA 1AW1A 2ZZ4A 3OVRA 3N9RA 4IMGA 3STFA 2Y61A 1F7BA 3N14A 3KHJA 4E2DA 3HGSA 1MSSA 1W56A 1M6JA 3SY5A 1SR9A 3DFSA 3ELFA 3SGUA 1P4CA 1F05A 1TSIA 4O57A 1BWLA 1SFLA 2PRLA 4WXZA 5EPDA 3L66A 3C2FA 4IMCA 4IXXA 4MLJA 4NNCA 2RHGA 1L2UA 3FKKA 3GDLA 1JQVA 1ZJIA 3M6YA 4MUZA 5EMUA 2CLLA 1WOBA 3PG8A 4WOQA 4UFJA 2NXIA 3W9ZA 2ZQ0A 4MY9A 4O4WA 1LP6A 4WJEA 4Z1CA 5BMWA 3CQ0A 3BLIA 4K8EA 1W37A 1EIXA 2P1FA 2NWSA 1HL2A 4POCA 1HG3A 4LVBA 4ORMA 1V5XA 4TU1A 5BOOA 3TQKA 2V0TA 1ICPA 1NFBA 1W31A 3HGRA 3LX9A 1TPUA 4O18A 1Z41A 1TPDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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