4HN4A

Tryptophan synthase in complex with alpha aminoacrylate e(a-a) form and the f9 inhibitor in the alpha site
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGALPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
publication title Allostery and substrate channeling in the tryptophan synthase bienzyme complex: evidence for two subunit conformations and four quaternary states.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 103
structure length 268
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2012-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4hn4A00
2ZZ5A 2J24A 4CQ9A 5DLCA 1R30A 3CIWA 5G2IA 3PC0A 4E2BA 1THFD 4FX8A 3MP4A 3R13A 5DCDA 5I3IA 4LRSA 3FJ6A 1VLIA 5CZJA 3F4NA 2C18A 1LLWA 4N6FA 1YXDA 4WOQA 1R2RA 5LNUA 1QWGA 4PFMA 4ORMA 2CZEA 3IRDA 1KA9F 2QJIA 1W1ZA 2CU0A 1D3HA 5I3HA 1TPB1 3GZ3A 3S42A 3PUDA 4AWUA 2FB2A 2D73A 2RDTA 2VFGA 4MJZA 4PL1A 1LM1A 1U5JA 1XKYA 5DELA 4OWGA 4UTMA 2F84A 2Y62A 2X2GA 3FEMA 3LERA 3NQMA 3LV5A 4UTIA 2V5LA 2Z0IA 3MJYA 2V0TA 3B03A 3M43A 3UZ5A 4UNLA 4O19A 3MBDA 3IGXA 1IIHA 3WJSA 1TTJA 3TW6A 3A24A 3VE9A 1K8YA 1W54A 1FWSA 3BPWA 3OA3A 1O5KA 4R33A 1GG1A 2QCDB 2YDAA 3BK0A 4A21A 4K36A 2H6RA 3S8HA 3CPRA 4WXYA 5D2XA 4Y96A 1DVJA 1CI1A 4QNWA 3HG3A 5EY5A 2VOMA 3OBKA 3LCWA 2WOQA 1FY6A 1YPIA 1LOQA 1I2OA 3BW3A 2CLIA 4X3ZA 1TPEA 2NUXA 1GVSA 2ZDRA 3P8JA 5DCBA 3JRKA 1MXSA 2NV1A 3SIZA 1DJNA 3TE9A 1OFQA 2TYSA 1WXJA 5HUOA 1JCJA 3M9YA 2NX3A 1M6JA 5FF2A 4OQVA 3C2VA 3R12A 2ZZ6A 1EB3A 4LV4A 3UYCA 4P61A 2ZA2A 3RK8A 3GR8A 4MVAA 5CKSA 4CQAA 2ABBA 4IMCA 1SO5A 3KAOA 1NF0A 5AN7A 1H7NA 1JQXA 1KFBA 1LTDA 4GE8A 3VNDA 3W7GA 4AH7A 1R46A 4ICNA 3E49A 5DN1A 3IGSA 3DZ1A 3LBCA 1YYAA 3O16A 3W7JA 5FEWA 1JUEA 4MLJA 2V2CA 3MUXA 3QMRA 5C6MA 1A5SA 3IGUA 1KBIA 7TIMA 2Y7EA 1QAPA 3CLMA 4LTSA 2QUTA 1U83A 5HULA 1KM0A 5DY3A 3NA8A 1KFJA 1X1ZA 3G1YA 1TPC1 1H7WA 1OX5A 2ZZ7A 4YCPA 2QCFA 2PE4A 4ONVA 1FWRA 3LHWA 2NZLA 4O0KA 4O1AA 1XXXA 2YW3A 2E6AA 1YTDA 1PHWA 1IXNA 2Z6IA 2WKJA 3G0UA 3NQDA 3W7PA 1ZAIA 5F2IA 1OFAA 3YPIA 4IMDA 2YFOA 4I7VA 3HG4A 2ZRZA 4UMAA 3NGJA 3QQ1A 5AYYA 3FOKA 4M6VA 2I1OA 3DKJA 3EKLA 3L5LA 3GDKA 1QPNA 4X9SA 2Y63A 4FX7A 4M5PA 4A2SA 4O54A 3W1MA 1UASA 4BI7A 2FB3A 3TSMA 5KZMA 3W1AA 1H7XA 4S2CA 2HTMA 1DQXA 1YDOA 2QJGA 1BKSA 4ZQCA 3S1UA 3LTYA 4EOUA 3HG5A 2QCDA 4XTIA 3NYZA 1SU5A 3GK0A 1Q6QA 3DAQA 4IUOA 1LYXA 4XTDA 3P5ZA 4JNMA 3Q2DA 1Q6LA 1TO3A 3GX9A 4Z1CA 1TCDA 3EB2A 3NO5A 3CC1A 3L66A 4UR8A 1ALDA 4UFHA 3ABQA 2CWNA 4LVBA 1FDYA 4CNOA 4DPPA 2XN0A 5CZTA 4R53A 3ABSA 1O95A 2GJLA 2B7OA 1JRCA 1KBJA 1S5WA 2ZBTA 1LP6A 1J4EA 3DGRA 1TTIA 1TTQA 4FNUA 4DQWA 4NNBA 3R2GA 2ZRVA 2O7QA 3KRUA 1I2RA 4RK8A 4UFJA 1EPXA 4NU7A 8TIMA 3LCFA 4O15A 1L2UA 3GAKA 1KLZA 1X6UA 3TK7A 3WK3A 3V75A 3WJYA 3TSDA 3I65A 3EWZA 1TYGA 3SW6A 1GVFA 3TJXA 2G97A 2XFWA 1GYNA 2QCGA 4JY9A 1SZNA 1N55A 2CLOA 4N2YA 2DORA 3UQNA 3BVJA 1BWKA 5TIMA 2C14A 1H7RA 1GVRA 5D2YA 2VFHA 3EWUA 4TMBA 5EPDA 2ATMA 4RV8A 4ZVJA 3EWBX 1GWJA 4DPQA 2B7NA 4BWLC 1DV7A 1VYRA 4CQ8A 2ZRXA 3GB6A 3TAKA 2C19A 2R91A 4ZL1A 1EEPA 2PRHA 3DKLA 3QJAA 3BG3A 1JUBA 4PH6A 2GJNA 1VPXA 3O15A 3S0CA 4K7VA 3TNOA 1SZEA 2DJXA 1JRBA 4LRTA 3W7DA 3LI0A 2A0NA 1K7FA 3IVUA 3DFPA 3PBYA 1RVGA 3PBVA 1YTEA 1TQXA 3TV8A 4MFEA 2QR6A 5FESA 3N19B 4GC4A 2O7SA 1LZOA 2WSYA 2QF7A 1YDNA 4FNQA 1TPDA 4RZ6A 3TX9A 4KFNA 3W84A 1TV5A 3LCGA 1KTCA 5G1TA 3HBLA 4LC6A 1MSSA 4O1DA 5FI8A 4B5NA 5I3FA 5F2LA 1VZWA 3KRZA 2GOUA 1PV8A 3W86A 2YGYA 3TH6A 1FWWA 6TIMA 1FDZA 1M7PA 4Q33A 2BX7A 3PG8A 3QYQA 4Z1BA 1KW1A 4MFDA 1I8JA 1V5XA 3C61A 5C55A 5K9CA 3PB2A 2G5WA 4ZQMA 1P4CA 4QIUA 5BMXA 1HL2A 4GJ1A 3W72A 4O12A 5G4EA 2A1YA 3LHUA 1ZAJA 4AWTA 4O14A 3W7QA 4H6KA 4IX2A 3LB0A 1GPWA 2YZRA 3BGJA 4QNEA 1FXPA 1OX4B 5F4XA 3TQKA 3MI6A 2ZZ2A 3EX1A 3LCLA 2RDUA 1AW1A 4POCA 3NQEA 5KSWA 2DZXA 2OCZA 1XFBA 4NXKA 3WK1A 3WFAA 4RX0A 3S5ZA 1WAUA 3S5NA 1LOSA 3QW4B 1XUUA 3O8AA 4GWEA 5AHNA 5CSRA 1O60A 2C13A 2QCHA 4NZFA 1ICQA 3O6YX 1VCFA 1F2JA 1WBHA 3G1AA 3IVTA 1T99A 4WJEA 2NX9A 3PSWA 3THAA 1XBXA 3DHFA 3E96A 4LS1A 3O05A 3NQGA 3MP3A 4WZHA 1TIMA 4NX0A 3SJ3A 3UXAA 1AK5A 3ZS4A 5C5YA 4LU0A 2CZFA 3A23A 4EWND 4JD4A 2G95A 4FO4A 3TFXA 2A2IA 1E51A 3IIZA 4JX6A 1WQ5A 3LXCA 4Y90A 4CCEA 1VQTA 3HB9A 3PY2A 1SR9A 1F73A 1LRQA 1KM3A 3M5YA 3VCRA 4AXKA 1KM5A 4JX4A 4M6PA 5AHMA 3DBPA 1AW5A 4EF9A 4YWIA 1JJKA 3ATYA 1TV7A 4IXHA 4O4VA 1SUXA 1PIIA 3I7QA 4DBEA 2RH9A 4HN4A 3TAOA 3DHDA 2A21A 5AC8A 1H62A 3C2RA 3L5AA 4PCFA 3BLFA 1LBMA 1ZAHA 4M6QA 4L4LA 3L9CA 4MKNA 2A4AA 2JGQA 1GVOA 3UY8A 5IBXA 3CWNA 2VKZG 4H4IA 1LBFA 4GUHA 3SZ8A 3W2JA 1WYIA 4XZ9A 4BF9A 4QISA 5HMSA 2V5BA 3S1VA 2TPSA 1KV5A 2CZ5A 2DZTA 3NQFA 3NQ7A 1G6CA 4IX0A 4OE7A 1QDSA 1IIGA 5D32A 1WV2A 3GDTA 2H8ZA 2DZUA 4K38A 1VHCA 3M47A 2B7PA 4OHQA 1TPWA 3MHFA 1SW3A 1S5VA 1GZGA 1I4NA 1IGSA 2CLHA 3TR2A 5KMYA 5F4SA 1F6KA 5K9XA 4JDYA 5AC7A 1C29A 4DELA 3RMJA 2VEMA 1SFJA 3LHYA 3A5VA 1OF6A 2C1HA 4N4QA 1KFLA 3LV6A 2CLLA 1GG0A 3O6DA 3EEGA 5LNWA 5DBTA 4NUWA 3OVQA 3CEPA 3TIMA 5FEZA 3PUEA 4UTTA 2JKPA 3PWAA 4O18A 1W37A 2YW4A 5D2VA 3TC6A 3L65A 3H55A 2BZNA 3P81A 5G2HA 4LY8A 3TDFA 1L6WA 3S5OA 1R2SA 3B06A 1EX5A 3KVMA 2Q3RA 4O1CA 3MW7A 2GVGA 4JYEA 4UTWC 2TSYA 3NL2A 3LI1A 3I68A 4ZQOA 3GAYA 2X1SA 4NX5A 2EF9A 1XC4A 2PRLA 2BTMA 3UNDA 1ME9A 3EX2A 1OK4A 2ZZ1A 1I2QA 1QPRA 2DJLA 1ZALA 3L68A 1F6PA 3K30A 4RXFA 4UTJA 2C15A 3ZWTA 3U8GA 3CIXA 1QCWA 2Y7GA 5K4ZA 1F5ZA 1G69A 5LNVA 4O13A 4MZ8A 5AHIA 4ADSA 4ALDA 1O4UA 5EKYA 2RDWA 4WQ6A 1JQVA 4ZQRA 1OF8A 5K7JA 1OJXA 5FF7A 3G24A 5LGZA 3W7MA 2QJHA 2QCNA 2WO5A 2B0MA 4CCCA 2ZZ3A 3TA6A 4LVFA 4O11A 5CG7A 3UZJA 3LLFA 1Z44A 4R34A 3G1VA 3TFCA 2OZ0A 3IVSA 1PS9A 2G96A 4JXCA 4GFSA 5EL1A 5L9FA 4PL2A 1ZFJA 2BXVA 4LVDA 1W8SA 1XUZA 2A7RA 3DXIA 3STCA 2W6RA 3L67A 4NJJA 3NQ6A 2ZTKA 2OT0A 2FJKA 3INPA 4FF7A 1KLYA 1ML1A 1W5NA 5BW6A 1JCNA 4A3UA 1SFLA 1SZGA 3B05A 5AC6A 2OMAA 1LDCA 5FF4A 1NAL1 3C56A 2YXGA 3BV4A 3STEA 2E6DA 4MIMA 1KM4A 1VCGA 2E6YA 2YSWA 2AAMA 5FEXA 4WXZA 3QH2A 3MI2A 4GUFA 3MI3A 2J6XA 1P0KA 1RQEA 3ZR4A 1Q6OA 1L6SA 4AAJA 3W2KA 1N7KA 1XCFA 2VFEA 5IM51 1H50A 1LCOA 2CLMA 2Q8ZA 3RNDA 2FIQA 1W3TA 3GKAA 1WX0A 1T8XA 2C0AA 4N9BA 3F4WA 1AL8A 4WUIA 4K8EA 4NJHA 3HO8A 5U4NA 1FDJA 3M7WA 3UY7A 1FBAA 5D37A 4N9CA 5F2MA 2W79A 1IXOA 1DORA 2VENA 1Q3NA 3G1DA 2TMDA 4FHAA 3SY5A 3CQ0A 1KFKA 3SR7A 2JKEA 4KFPA 1H51A 5G5IA 3S5YA 2Y61A 1B3OA 3QW3A 3EWXA 4JTEA 3G1HA 4MOZA 4RZ4A 2VXNA 4NXSA 3HMJG 3NNTA 1GTHA 5D2WA 3PBUA 1F74A 3TW7A 1T96A 1DJQA 3OHIA 3FA5A 1FX6A 4FXRA 3SSJA 4NJKA 3PG9A 5HWNA 3GYEA 4N4PA 4GUJA 1MZHA 4ADTA 1I2NA 5HJLA 4EF8A 1LOLA 3CB8A 1TPH1 4IPIA 3VE7A 1TTPA 4N9DA 4UTWA 4ZZ9A 3W7KA 3TQVA 2JBMA 1FWNA 1UUOA 3MYPA 1OG0A 4ZMGA 4DF2A 4CNNA 2VEPA 3NQCA 4HSNA 1JCMP 5KITA 3P67A 4Y8FA 3T44A 5HQEA 1G7VA 1Z41A 1YADA 3BLEA 3MWAA 4L4MA 3GDRA 4O16A 3W22A 3W2MA 3E12A 4DO5A 1G4SA 1XDMA 1JR1A 1C8VA 5AHFA 4JTUA 1OFBA 3B0PA 3TQ0A 3LCIA 3H53A 2A6NA 3LRLA 5D2TA 3UWZA 2XN2A 3QPZA 1EWDA 1B57A 4DF0A 1A5CA 3FKRA 3N34A 4RZ5A 4UFKA 2YYUA 4CCDA 4UNKA 1QOQA 3LRMA 3SFKA 2C3ZA 3VI2A 4WD0A 3L0NA 4UTKA 1KFCA 3QPYA 5KZDA 4XQ6A 3QMTA 1H7PA 3TCEA 3PS7A 2NXHA 4TU1A 4O10A 1K03A 2A7NA 2EHHA 1A5AA 4TMCA 2A85A 1W5MA 1OFRA 5F4WA 3Q58A 3L2IA 1RPXA 5I3KA 1L9WA 5LHFA 4DEFA 3GIYA 3RU6A 4JTSA 2DZSA 2FFCA 3G22A 4WY0A 3W3OA 2A7PA 3P5YA 4Y6GA 1I2PA 2HS8A 3SECA 3M1ZA 3DFNA 1G4TA 3O1NA 5C2XA 1L6YA 1G4EA 4KWVA 3NPXA 4K6AA 3PUOA 4S1FA 5ABTA 3TSBA 4AWSA 1W56A 1J2WA 3B4UA 1YDVA 4E38A 1KV8A 1OHLA 3ELFA 3GNNA 1XI3A 1A50A 3BGGA 3KVKA 1MEWA 3LHZA 4AF0B 1TJRA 1LLZA 1LROA 3W2LA 3NL3A 2OT1A 2J27A 3OVRA 2Z1BA 1SSGA 4O8RA 1FWTA 3ATZA 3A21A 1SZFA 3GNDA 5AHEA 4LWWA 1QO5A 3M5ZA 2J9XA 1ZNNA 3KOFA 1UCWA 5BMWA 2V2DA 2R14A 2A6LA 3Q37A 2QEZA 3W23A 2NXIA 1ONRA 3W71A 4CNPA 3UWWA 2QAFA 2DZPA 3IIPA 4MYXA 2C6QA 3G8RA 2E5DA 2ZRWA 4J9JA 1OYAA 4FEZA 3C4UA 2Q8LA 4Z1AA 2ZTJA 2ZYFA 4GUGA 3BO9A 1OVDA 4MYAA 1YPFA 2PC4A 3NAVA 2EPHA 3L5MA 1SW7A 4NJGA 3RLUA 3HPSA 4G1KA 4N6EA 3UPBA 4Q4KA 1WOAA 2ZA3A 3FFSA 3GVGA 3JS3A 3BLIA 4BR1A 3UWUA 1RQHA 3EX6A 1R47A 3LM7A 4UCGA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CQ9 A;  1Q85 A;  3GW3 A;  3C5Q A;  3CIW A;  3K8K A;  1EGM A;  4LRS A;  1JDC A;  4HB7 A;  4Q8Q A;  3B8W A;  1U5H A;  4MKV A;  1QWG A;  4PFM A;  2OTD A;  1XLC A;  1NJJ A;  1XRV A;  3WN6 A;  2EKG A;  1KA9 F;  2QJI A;  2CU0 A;  1TPB 1;  1J0Y A;  1WP6 A;  4RDY A;  1FWF C;  1DJI A;  3TP4 A;  2VGI A;  2W61 A;  2D73 A;  4EAC A;  5DEL A;  4LXF A;  4J2M A;  4I9M A;  2Y62 A;  4J3X A;  4DBS A;  3BDK A;  5ABH A;  1PTA A;  4UTI A;  1CBG A;  1VFS A;  1VEO A;  4O19 A;  4GKL A;  4DWS A;  4HU4 A;  1ZS2 A;  4TOQ A;  3OA3 A;  3GFZ A;  5MKG B;  2OWX A;  4J3Z A;  4A21 A;  3N4E A;  2HV5 A;  2Z1V A;  4M29 A;  5D2X A;  4IL0 A;  3QZ6 A;  2D23 A;  4GIN A;  4Y96 A;  1XII A;  3EB4 A;  4J3U A;  2Y5S A;  3CXO A;  5EY5 A;  1RJQ A;  1YPI A;  5JH2 A;  2CLI A;  4D8A A;  1QHO A;  2WHJ A;  3UET A;  1JPH A;  3ENL A;  4XB3 A;  2QJM A;  2ACS A;  3AAM A;  4H7V A;  3SIZ A;  2WZI A;  1TVP A;  1OFQ A;  2TYS A;  1WXJ A;  2VRQ A;  1QI0 A;  1JCJ A;  4HPG A;  1MQP A;  1M6J A;  1XG4 A;  1XIE A;  3R12 A;  3SCS A;  3BAI A;  4BQ5 A;  4Z1Y A; 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