4HPXA

Crystal structure of tryptophan synthase at 1.65 a resolution in complex with alpha aminoacrylate e(a-a) and benzimidazole in the beta site and the f9 inhibitor in the alpha site
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGALPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
publication title Allostery and substrate channeling in the tryptophan synthase bienzyme complex: evidence for two subunit conformations and four quaternary states.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 103
structure length 268
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2012-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4hpxA00
2C15A 4MJZA 5FEWA 1OVDA 5D2TA 3TSDA 3OEXA 3MYOA 2JKPA 2QF7A 1C29A 1R47A 4IPJA 2NXGA 3CWNA 4ZQMA 5I3HA 2ZDRA 3NQDA 1GEQA 3EX3A 2ZRXA 3ABQA 3DFTA 1LTDA 2QUTA 5SWUA 1Q3NA 3HBLA 3PUDA 1XUUA 4PODA 3C52A 3IIZA 4RCXA 4N6EA 4W9TA 5D02A 1BKSA 3TSBA 4ZQNA 1GTEA 2XN0A 4JYFA 4ZQPA 5D09A 1NF0A 2VKZG 1AL7A 3ATYA 3LB0A 3BW3A 5KZEA 3W23A 3CB8A 2FPYA 1JRBA 1SSDA 1M7OA 4RKAA 1KFEA 1ICSA 3GB6A 4BK9A 1OJXA 3GIYA 1DHPA 2H8XA 3CTLA 1EUAA 2ZTJA 1FXPA 4A2RA 1ME9A 4U4MA 4X9SA 5G1TA 1WBHA 2B7OA 4LS2A 5HMSA 1FY6A 2FLIA 1KV5A 4M6VA 3MHGA 1YPIA 2ZRYA 2VXNA 3BVJA 1J4EA 2UV8G 3M0ZA 1NVMA 2QJGA 2A7PA 3M5YA 3WK1A 4O1CA 2JKAA 5CZ0A 3W1MA 3SR7A 1ALDA 3H55A 4NQ1A 4JTSA 5EPDA 5DXXA 3TR2A 4BF9A 3W2NA 1PVNA 3NA8A 3LCIA 3W2KA 3MJYA 1W37A 2Q8LA 3TMLA 1T96A 4POCA 4EIVA 1I4NA 3T7VA 1R2RA 1YXDA 4S1FA 4Y90A 4I7VA 3LV5A 2GQ8A 2OT1A 3UZJA 2B7PA 3G8RA 4WUIA 3OBKA 1QPQA 3DU0A 1C9DA 4Z1BA 2WNZA 3MI6A 1C8VA 3EKZA 3LBMA 3CQ0A 2NLIA 1RZMA 2V2CA 4OQVA 1VH7A 3IVTA 4UFKA 4MKNA 2A5HA 5KINA 3WJXA 1AW1A 1R2SA 1EX5A 1TV8A 3L68A 5I3GA 3GDRA 2VEMA 3W7MA 4K38A 5GVJA 4WOQA 1WAUA 2GPTA 1GVOA 2B7QA 1AG1O 3DBPA 1MEWA 4DBEA 5LNUA 1LRQA 2CLHA 2GJLA 2CLFA 1AL8A 1LBFA 1O5XA 4MZYA 3V1PA 4IWWA 1RQHA 4IPIA 1VCVA 1LRNA 1W3TA 3TC7A 3YPIA 1TPWA 3GZ3A 4IMEA 3S42A 4LRTA 3TAOA 2C16A 3I7RA 1H51A 1DBTA 4QQ3A 4JNMA 4LV4A 1YADA 3TA6A 2EGZA 5F2IA 4R33A 5FESA 3DAQA 1XI3A 4JR5A 3W7PA 3F03K 3LDVA 4DELA 1SQ7A 2O7SA 1D9EA 4KKXA 1W0MA 3FKKA 3W1NA 1VCGA 5CPMA 3W1XA 3V75A 2G95A 2ZRWA 2C19A 4H4IA 1X1OA 3QH2A 3TX9A 3TDFA 5E1QA 1SO5A 5AC8A 1O60A 1VGAA 3SSJA 2C3ZA 3HPZA 5CZSA 2HS8A 3PULA 2WSQA 3DFOA 3C6CA 3CIXA 2FB2A 5D05A 3TIMA 4GFSA 4IXHA 1KFLA 3MWAA 1LBMA 5F2MA 1KLZA 2ZZ6A 4MLJA 5D03A 4Y96A 4MFDA 1IXQA 2WV8A 3EXSA 3O6CA 1FWTA 3G1XA 3M5VA 2VFHA 2NUWA 2ZZ2A 2TRSA 3W22A 5C5YA 1ZFJA 1ZALA 2GOUA 3HG3A 5FF2A 5C6MA 3NQCA 2X16A 2WKJA 3LTSA 2YCEA 4NNBA 4UUIA 2DZPA 2J9XA 4LY8A 4O54A 3CLMA 2NXHA 3GDLA 5CPLA 1W56A 2WSYA 1OX4B 2JGYA 4PL2A 4A21A 4DO5A 4WZHA 3OG3A 1K02A 4NU7A 1A5CA 1HO1A 4TU1A 1I2QA 1OFRA 1DVJA 1W5PA 4QJ1A 5K9CA 4AB4A 3L67A 3ZWSA 3CEPA 5U4NA 1UUOA 3BGJA 4JD4A 3GDTA 4YCPA 2Y7DA 2A6NA 1ZHAA 2ZRUA 4LC8A 2A4AA 3NO5A 3DHDA 1TPVA 1K7EA 5CZTA 2YR1A 3W7RA 5AFDA 4U28A 3W7DA 1QMLA 4RZ6A 1LRTA 3GR7A 3FIGA 3TK7A 3QQ1A 3TROA 3KRSA 2JBMA 4HKPA 4UFLA 1WQ5A 4Q32A 3KRUA 3N19B 3S5OA 1L9WA 3F1QA 5H91A 4JEQA 2QCDA 3EXTA 3EWYA 4O1BA 4NJGA 2ATMA 2QJIA 4JTFA 5D2YA 4CQ9A 5LGXA 2VFFA 3DENA 2R14A 3THQA 3GKAA 2JKEA 4CQ8A 3DH7A 4NJIA 5KMYA 4WD0A 3B04A 1B4KA 3LHVA 4AF0A 3C56A 3K30A 3O05A 1XFBA 1LOLA 2LLEA 2YW3A 1NSJA 4FIRA 3NQGA 4R7JA 3LOTA 4ADSA 3L0KA 2NUXA 3LV6A 1HL2A 4ADTA 1ZAHA 3TAKA 4O1DA 4MZ1A 2PURA 1VZWA 1ML1A 2J88A 1AW2A 3A9IA 4Z08A 3W6YA 3DKJA 4PFMA 3NPUA 3WJYA 4ZL1A 3IVUA 1K7XA 4HPXA 3L5MA 3TXVA 3W2LA 2CFFA 2ZZ1A 1EPXA 5HULA 5DY2A 3GAKA 1UBSA 1QCWA 1S3HA 4N9BA 3QJAA 3S1XA 2Y85A 4LNYA 3WJSA 5CPNA 1F6KA 1G6CA 1YYAA 4MPQA 4ZVJA 4A3UA 3S1WA 4GBUA 2OJPA 1YXCA 3T78A 3BLIA 2WSRA 5BRBA 1YTDA 3SIZA 1TJPA 4Y8FA 3A22A 4M7SA 3L9CA 1SFJA 1PHWA 1SZGA 1WBJA 1XCFA 3E49A 2GVGA 4A22A 4CCDA 2ZTKA 3LHTA 1Q6QA 4UFHA 2QDGA 3DFSA 1VLIA 3CWOX 3ABRA 3PM6A 4O53A 3A5FA 3STEA 4UR8A 5HJLA 4UMAA 3EEGA 1Z48A 1CW2A 2DZSA 1XBZA 3SFKA 4O52A 3QZEA 2NX9A 3UPWA 1KFKA 3UD6A 5HNRA 4MOZA 1RVGA 2ZA1A 4N4PA 4RJEA 3S9YA 1TV7A 3NAVA 4HSNA 2CZFA 4HPJA 5AB3A 3UZ5A 2B0MA 4JTEA 4O18A 4N9EA 3O6YX 3LLDA 2FTPA 5D37A 3RU6A 5IBXC 3TUUA 4K7YA 1SPQA 1W8SA 3EX4A 1V7YA 3ABOA 2E5DA 1JCYA 3N3MA 4WY0B 2NXIA 2QCCA 4FNUA 5AHEA 1EIXA 1H63A 3NL6A 3W1LA 3NNTA 1UCWA 3C2RA 1CI1A 3HPXA 3NDOA 3WK3A 3QC3A 2QCNA 2CZ5A 1XBYA 3GNDA 1TREA 4JIPA 4NXKA 1KFCA 4JTLA 2Z0IA 1SZNA 2CLLA 3LLFA 3TSMA 4IOTA 3W2JA 3W7EA 3LCXA 4RLIA 3W7IA 2YX0A 2CLMA 1QOQA 4QNWA 5DBUA 4JIQA 1QWGA 5BMWA 2FFCA 4BWLA 4AHQA 4JXCA 3DFNA 1VR6A 3O16A 4XKYA 1LDCA 3TC6A 4XZ9A 3O6DA 1XM3A 4C1KA 3DXIA 3I6RA 5D2XA 5C2XA 2RDUA 3U8GA 5CSRA 3NPWA 2WO5A 1L6YA 3T44A 4PA8A 2HTMA 1W5MA 2V5LA 1LOQA 3DI0A 3MHUA 4PC8A 1EA0A 4I9AA 4TIMA 3KAOA 2Y6ZA 2B7NA 1W5QA 4N6FA 4YXGA 4MUZA 3LM7A 4QISA 4EF9A 3EWXA 3TW7A 4NX0A 5F2LA 3C2OA 3BG3A 5F4SA 4FB7A 2PRLA 3ANYA 4UTWC 3DFQA 2GVLA 1SR9A 1HG3A 3DFPA 1RQEA 1RD5A 3TQVA 4X3ZA 1XDLA 2VFGA 4TO8A 3TJLA 1PE1A 5HINA 2CZDA 4G1KA 2E5BA 3TH6A 4UTTC 1W3NA 3C2EA 1O5KA 3E9AA 3NQMA 1PV8A 1SW7A 1QPOA 4RXFA 3LCFA 4N9DA 1H7RA 1VYSX 1VYRA 5HUOA 4NX5A 3H54A 4GUIA 2IQTA 3TCEA 1JCJA 3PY2A 1SZEA 1MZHA 1K3UA 3BLFA 3TFXA 4O13A 2QCEA 2YSWA 3OVRA 1BTMA 3KVLA 3R89A 1Q45A 4X22A 1J5TA 4UR7A 1VJIA 2ZCGA 4RX0A 3W1RA 2Z1BA 4ORIA 2RKXA 1ZY9A 4KWVA 1TQJA 1IIGA 2WNQA 1YDOA 3JS3A 3PUEA 1BEUA 3FJ6A 4JX4A 3B0UX 3G1VA 4IUOA 1QDSA 2AAMA 4LVFA 3HO8A 3LRKA 3UWVA 3UPBA 4LT9A 4LVAA 4FX8A 5DCEA 2JK2A 1FCQA 1UASA 1H1ZA 1AK5A 2H90A 2VEKA 2R8WA 4GE8A 5L9FA 4OV9A 2P1FA 3B8DA 1KM4A 3LHZA 2YYTA 2DZTA 4GJ1A 4QNEA 1Q6RA 3UWQA 5K2ZA 1SZFA 4CQAA 3NZRA 3WFAA 3QF0A 2DZVA 4FIQA 1SUXA 3SECA 3VE9A 4DF1A 1LROA 4NJKA 1LZOA 3N9SA 5U7SA 4O8RA 4EWND 3L0GA 5LZLA 2FIQA 1ZNNA 4E38A 3P5YA 1ZENA 2TSYA 3D0CA 2D73A 4CLMA 3KX6A 1IGSA 1KLYA 3EX2A 1JUBA 2RDTA 4FX7A 3W83A 4UTKA 1TPB1 1W54A 3IEBA 4UTIA 1K8YA 3WJWA 1B9BA 2QUUA 4P61A 3W85A 3QPYA 3UYCA 1MEHA 2CU0A 5HR6A 5DELA 1M6JA 5DCBA 3W76A 1R30A 3M44A 1A53A 1I8JA 3GLCA 2DZUA 2OCZA 2RHGA 3JR2A 4CCCA 3B0VC 4AWSA 3GK0A 3QMSA 3M41A 3P60A 1M5WA 2W6RA 3HMJG 2OMAA 2Z6JA 3G22A 4FNSA 3STFA 3HQ1A 2Q3RA 5CSSA 2VC6A 4JTJA 2Y70A 1WX0A 2E77A 1S5WA 3L65A 3AO0A 3TV8A 3G3MA 3PBVA 1ICQA 4UXDA 3G1FA 1DV7A 1SO6A 1W31A 4P2VA 4S2CA 3I68A 5BMXA 3PAJA 1ME7A 1JUEA 3CPRA 2BSLA 1KA9F 3M43A 1H50A 3PBWA 4Z0JA 1RPXA 2FDSA 2NUYA 4HNUA 3RF9A 3U2OA 1Z44A 2KZHA 4HNVA 1N8FA 1YXYA 1DOSA 3KVKA 5EL1A 1IIHA 4AWTA 1I2OA 3LBCA 2YFNA 1B57A 1WOBA 4WQ6A 3W7KA 4PL1A 3S5YA 4IJBA 3IIXA 1PS9A 1X6UA 4D2JA 3LHYA 2G5WA 1CX9A 4H6KA 3MYPA 4N4QA 1QNVA 4LU0A 1OABA 3VI2A 3W2UA 4DPQA 5A5WA 2Z6IA 5D2VA 4FF7A 1O4UA 4QSHA 1FXQA 1M7PA 3AJXA 4UFIA 2WQPA 2DZXA 3NQ8A 4ML9A 5LHFA 1QPNA 1QO5A 1FBAA 1LP6A 2GQ9A 3W1AA 2Y7FA 5AYYA 2NX1A 3FOKA 3UXDA 3MP4A 3W7HA 3WK2A 1YPFA 3M1ZA 4JTTA 5D30A 4WJEA 3QYQA 5AHMA 1TO3A 3QW4B 3C61A 3C3NA 2ISSA 1OX6A 3NPXA 1MO0A 3O15A 4AF0B 1BWKA 5LNSA 5KSWA 1GOXA 3IIPA 5D32A 4BI6A 1N55A 3P61A 5K7JA 2NWSA 1OHLA 4UIOA 1FWSA 2EPHA 2QEZA 3FEMA 2E6AA 1OF6A 3LCLA 1TV5A 3N34A 1FCBA 2CLKA 3NXFA 1R46A 4I7WA 4JICA 4NJHA 1UUMA 2B4GA 2VEIA 3NQFA 4UMBA 1TPUA 1GG0A 2A2IA 3L0NA 5AYZA 1KTCA 1TCDA 1QR7A 2H3BA 5DN1A 1TRIA 1G69A 1K8XA 4NT0A 3O1NA 3BW2A 5FF7A 3LERA 2CW6A 4KWWA 4GNJA 4O17A 2XN2A 4YWIA 2E1DA 1Q6LA 3GDKA 1KTBA 2YZRA 2RH9A 5LNWA 4WOZA 1XKYA 1P0NA 1VHNA 2H6RA 2VFDA 5K4XA 5K4ZA 1AMKA 5T26A 4LVDA 1B3OA 4XWUA 2Y7EA 1GWJA 4O4WA 1GVFA 3EX6A 3E12A 3W1PA 3JRKA 3W07A 4TR9A 3NM1A 3G18A 4WXZA 1ZJIA 3GDMA 1THFD 4FHAA 4FNRA 5AC7A 5I3JA 5EA9A 4Z0SA 5AOUA 4JX5A 1FCUA 3S5ZA 2C14A 1QOPA 4O1AA 3F4NA 3G1YA 2ZA2A 5DLCA 3NGJA 1VCFA 1LM1A 3G24A 4LTSA 3G3DA 2V0TA 2C1HA 1K7FA 3LRMA 1EP2A 5LKYA 2CLOA 1H5YA 1LLWA 4GC4A 2G96A 2C18A 5EYWA 2QCHA 5DCDA 4OV4A 4JTGA 3DKLA 3TW6A 1JCMP 2O7QA 4XBSA 1B4EA 5FF3A 3BLEA 5LNRA 4UTJA 5FF0A 1ZAIA 4M7TA 4HT3A 4UFMA 4GUJA 2A1YA 3KVJA 3R13A 4UNKA 1GTHA 1TRDA 3KXQA 3RLUA 3FLUA 3QMRA 2ABAA 3T4CA 3B06A 3PB2A 1F05A 3UWYA 1SW0A 3W86A 2DZWA 3UWWA 4XKYB 1PHQA 3B0PA 4QIUA 1G4PA 4LS0A 1A5SA 1IXOA 3QPZA 4RV8A 1GPWA 4WY0F 4O10A 5K9XA 1XDMA 1VLWA 4IX0A 4LVBA 5DY3A 4Y6GA 4C1LA 4HNNA 1VRDA 3C0JA 1JCNA 2X1UA 3UWZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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