4HTLA

Lmo2764 protein, a putative n-acetylmannosamine kinase, from listeria monocytogenes
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
MKIAAFDIGGTALKMGVVLPHGEIILTKSAEISGSDGDQILAEMKVFLAENTDVTGIAVSAPGYVNPKTGLITMGGAIRRFDNFNLKEWLEAETGLPVAIENDANCALLAEKWLGKGQDLDDFLCLTIGTGIGGGIFSNGELVRGGRFRAGEFGYMFSERPGAFRPGKYTLNETTTMLVLRRQYAELTGRPLEEITGEEIFANYDAHDAVSERLITEFYTGICTGLYNLIYLFDPTHIFIGGGITSRPTFIAELKHHMESFGLRDTIIETATHKNQAGLLGAVYHFLQEEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Beta-glucoside kinase
publication title Lmo2764 protein, a putative N-acetylmannosamine kinase, from Listeria monocytogenes.
rcsb
source organism Listeria monocytogenes
total genus 92
structure length 291
sequence length 291
ec nomenclature ec 2.7.1.85: Beta-glucoside kinase.
pdb deposition date 2012-11-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4htlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4htlA01
2QWPA 2QWOA 5BR9A 3EL2A 4BQLA 1KAYA 4BC2A 5AQSA 4BR9A 5AQVA 2A5XA 4CZLA 4JAXA 5AQLA 4B1YB 1HKCA 3LM9A 4BC4A 4BC5A 1C0GA 2E2NA 2BTFA 5AQUA 3I8BA 4K42A 5EY4A 3VEVA 1QZ5A 5AQFA 3MN5A 3OHRA 4HWIA 2ZGYA 3GE1A 2E2PA 3IDHA 1YAGA 2H3GX 4A2AA 3H1VX 3O1BA 5BRFA 2QWMA 3FLCO 4RTFD 4B1XB 3JXUA 2CGLA 4CZMA 2CH6A 3D2EA 2FF6A 3LM2A 2ASPA 4QS8A 3J8AA 2D4WA 3LDOA 4QS9A 3H46O 1V4SA 1ATRA 5AQPA 5AQIA 1XQSC 2KHOA 1MWMA 3VGMA 3DXMA 5CE3A 4IJAA 3UKUA 3VF6A 2P9IB 3O80A 4CI6A 3WXIA 3L6QA 2ZWHA 5BPNA 1XUPO 3D2EB 4BRCA 3CERA 4PL8A 1GLDG 3H3NO 1GLFO 3CIPA 2QWLA 1Z6RA 1ATNA 3A0IX 2AA4A 3GL1A 3DXMB 5AQOA 3S41A 3UKUB 3H45C 5E26A 3WXLA 5ELZA 5BRDA 5LJVA 3CJBA 4BR5A 2A41A 3WQTA 5E84A 1BUPA 4A2BA 4RCHA 2CGJA 3TU5A 1X3NA 3LDPA 3AY9A 5I9EB 4DCHA 1KAXA 2D0OA 1BO5O 2NLXA 4EHTA 1HUXA 1X3MA 3R9PA 2ASMA 3ENOA 4PKGA 3ID8A 1HPMA 4EHUA 1NGFA 1QQNA 5BN8A 4K43A 3UB5A 3VETA 4CBXA 2E1ZA 3WUHA 4Y0WA 3HSCA 1MDUB 3CJ1A 2HF4A 4BRQA 5F2RA 2PAVA 3HZ6A 3DJCA 5LY3A 2P9SA 3D2FA 4J8FA 1IG8A 3AAQA 3FZMA 4FWRA 5AZJA 1QZ6A 2E2OA 2UYTA 4WQ5A 1YUWA 4FO0A 4FWNA 4BQZA 1BA1A 2NZTA 3A5OC 4CBUA 1Z05A 5JMVA 2Q0UA 4B1VA 4JD2A 1RFQA 2J4RA 4BGBA 1NWKA 1KXPA 1CZAN 1YVNA 3MK6A 3C7NA 1WUAA 1SZ2A 2VWBA 5AQQA 1G99A 4A61A 3GG4A 3VGKA 2P9SB 3D2FB 2ZF5O 5AQMA 5AZJB 2ZGZA 2W40A 4CD3A 1HJOA 3D7EO 2FSKA 3H3OB 4WQ5C 3QFPA 3RSEA 3ZX0A 3FZLA 1DGKN 3H1QA 1GLLO 4BC3A 1BDGA 3FFKB 5ADXA 3IMXA 3DXKB 4BRHA 4CZJA 3C7NB 1U6ZA 2V52B 1NBWA 1YXQA 3VESA 3W0LA 3QB0A 3BP8A 4H5NA 4MLHA 2HOEA 2YHXA 3DAWA 4FOEA 4FPAA 3MN9A 4FPBA 2F9WA 3HI0A 1HKGA 5B8HA 3VEWA 1SQKA 2HMPA 1ZXOA 3O8MA 4XH1A 3CJ7A 3RSEB 4GNIA 3SMSA 3M6GA 1NM1A 1C0FA 2GTDA 5BPMA 1P8ZA 2QWQA 4B1UB 4BRLA 4BVOA 1E4FT 3BF1A 1NGJA 4FWSA 3VEOA 3FE1A 2P9IA 4FWKA 2ITMA 3QICA 2QWRA 2W41A 4H5RA 1J6ZA 3U8XA 2IVNA 5KPTA 4XEIA 4BG8A 2A40A 2VCPA 2EWSA 1QHAA 2AP1A 3EZWA 3VENA 1U2VA 2E1YA 4K41A 3WXJA 1ZBSA 3VEYA 3ULEB 1DKGD 4QS7A 5BREA 3ZETA 2E20A 1K8KA 3P4IA 4H0TB 2QM1A 2A42A 1DEJA 4H0YB 3GBTA 4DB3A 5AZIA 1JCFA 2P9PA 4EAHD 5EX5A 3O08A 5JLFA 1U2VB 4FWMA 4F9OA 1QQOA 4JHDA 1Q18A 3ZX3A 4BR2A 2E2QA 4BROA 3ZETB 3O6WA 3I33A 3MN7A 1K8KB 4YDUA 4CZKA 2YJEA 4FWLA 1MWKA 4FWQA 4BR4A 5AZIB 2E8AA 2P9PB 3R8EA 4CBWA 1X9JA 1HLUA 5KQDA 4JHDB 5JICA 4PKHA 2IVPA 5FPDA 3R6MA 1NGEA 4M7XA 4O5FA 5KQ8A 2CGKA 2YI1A 3A5NC 2QW9A 3WXKA 4I6MB 3EO3A 5EOYA 5TKYA 1WOQA 2GEMA 3L0QA 3UE5A 4YDUC 4M7YA 4ISGA 3ZEUB 3M1FA 4EFHA 3VGLA 1NMDA 3SK3A 4E1JA 3U9ZA 3W3DA 3CQYA 3MDQA 4H5WA 3LDLA 1E4GT 4MO4A 4WYBA 1D4XA 3AAPA 3FZFA 3MMVA 4CJ7A 1T6CA 4JN4A 3DXKA 2IVOA 1IJJA 2VYPA 4AM7A 2V7ZA 4H5TA 4O8KA 2I7NA 4K25A 5LJWA 5ADXH 3DWLA 2E88A 1HKBA 3FZHA 4AM6A 1OKJA 1JCEA 4H5VA 3LDNA 4BR7A 3HTVA 1ESVA 3ATUA 3VEZA 5KPZA 4BREA 3HBTA 3GDQA 2Q36A 1NGGA 2P9NA 4CD1A 4PL7A 3QFUA 3VF4A 4PKIA 1GLEG 4JNEA 2PBDA 3VEXA 2Q2RA 3KZBA 3UKRA 1Y64A 2YHWA 3WT0A 3EKSA 3LDQA 1S22A 5BRHA 4IWVA 1GLJO 4XH5A 2NRHA 4NB4A 5AFUA 1TUUA 1S3XA 2D0PA 5AQXA 1BA0A 1MA9B 3CQXA 2GUPA 4ISEA 3ULEA 2YJFA 1LOTB 2FLOA 2P9NB 3HM8A 2P9UA 3CI5A 2V51B 3MN6A 4XH4A 3KHYA 3CHWA 3MCPA 2FF3B 3FGUA 1LCUA 1NGDA 3UKRB 4IO8A 5FPMA 3WQUA 1NGBA 1NGIA 2A3ZA 3BF3A 3O1WA 4H0OA 1GLAG 4H0VB 3EKUA 2QWNA 2Q31A 2I7PA 5EVZA 3U9DA 5F0XA 5AQHA 1XC3A 1BG3A 4BR0A 3H6EA 1BU6O 1BWFO 2BUPA 2FSJA 2P9UB 4BRPA 2GELA 4EIAA 4FSVA 5AQGA 3M3ZA 1QQMA 1ZC6A 3IUCA 5AQWA 1T6DA 3FZKA 1TYQA 3VPZA 2YCHA 5JLHA 3CJCA 4M63C 3QBWA 2P9KA 3QMLA 1H1VA 4MO5A 4RWTA 2F9TA 5BPLA 4FOIA 5BN9A 3A8YA 1RDWX 3F9MA 4B1ZA 2GWJA 3SJHA 4H0PA 2WUSA 3CJAA 4I6MA 2OANA 3BUZB 3O5BA 1TYQB 4FWPA 4CZGA 2QXLA 3VOVA 3ZEUA 5AQYA 3EN9A 2P9KB 5AR0A 4H03B 1SAZA 3WEEA 4BRKA 5F1XA 4GY2B 3A5MC 5FPEA 5AQZA 4BVPA 3O4WA 2FSNA 4WQ4A 4MLEA 4B1WB 4BRAA 3TPQA 2V7YA 2HF3A 1EQYA 1JCGA 3FR0A 2IIRA 4CZFA 4BRIA 5FPNA 4BRNA 3AARA 3ATVA 4BG9A 5AQJA 2Q97A 4CZHA 4HTLA 3C0BA 3BEXA 1NGHA 4FL9A 3CJ9A 3WEEB 3G25A 2DPNA 1NGAA 3SLCA 1BOTO 4C23A 2FXUA 4BRDA 4WQ4C 2Q1NA 2YHYA 3LL3A 2D1KA 3QDKA 3ZX2A 1KAZA 5EXWA 2A6AA 4ISFA 1NGCA 4KBOA 3B8AX 4CZIA 3QBXA 1GLCG 1TUYA 4H0XB 5AQRA 4IJNA 5AQNA 2P9LA 4Z94A 4BRMA 3ENHA 3IFRA 4A62A 4IZ9A 3A5LC 4DQ8A 4FWOA 4BRFA 4BGAA 3L4IA 1V4TA 2CH5A 4NO7A 3VF2A 5KPRA 2ASOA 3U4LA 3JS6A 1HX1A 1GLBG 4CZEA 3VERA 3GOIA 4L3QA 1T44A 2P9LB 1R59O 5AQKA 5AFUH 4LC9B 1ATSA 4B9QA 5AQTA 1RGIA 3CETA 3SMPA 1NLVA 4DHYA 2Q0RA 4BRGA 4JD2B 4IXCA 2GWKA 3KVGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YJNN 2QWOA 5CR4A 3EL2A 4BQLA 1YT3A 4J2AA 4Z4FA 4BC2A 5AQSA 4BR9A 3CCLN 4FLXA 3LM9A 4HUGA 2E2NA 1RCHA 1XWLA 1RTHA 3I8BA 4K42A 3ZSRA 1WSHA 4ELVA 2X74A 1WBBA 3KK7A 2HMIA 5AQFA 2VWJA 3OHRA 2E6MA 3M5RA 4CFDA 2IC3A 4M3YA 1DTQA 3ZT4A 1BCMA 4BE1A 1VSIA 4DV0K 1N5YA 3SUOA 2QWMA 4CGJA 4CHPA 4OVLA 4CEEA 3JXUA 4YORA 5DMRA 2OZMA 2FBXA 4EZ6A 1FKPA 2OTLN 3LDOA 2D4WA 4QS9A 1NKEA 2DFEA 4IKFA 1BIZA 3VQ8A 5AQPA 1WSFA 2KHOA 2ZD1A 4F4KA 5CE3A 3D0PA 2JWKA 4WCEL 3I8DA 3L6QA 5BPNA 1D9FA 3SAFA 3HL8A 3H3NO 1GLFO 3CIPA 2HB5A 4E7JA 2HBLA 2AA4A 4ZTFA 2P51A 2O8CA 4AH9A 3V81A 5BRDA 5LJVA 1S9GA 5E84A 3L2WA 4CHZA 4LD0A 1T03A 3Q7BA 5I9EB 3Q7CA 4C8KA 2FBTA 4EHTA 1NKCA 4LF4K 5C10A 3D45A 1HPMA 3V9XA 3SNNA 2O8CB 1NGFA 1R0AA 3BZKA 5BN8A 3ZSOA 3VETA 4UY8O 4BRQA 3QEIA 2PY5A 4I9QA 2PYLA 4ELTA 4J8FA 1U49A 5M1QA 3RR7A 3F5TA 1QZ6A 1LWEA 2UYTA 3LAMA 3VQ5A 5JS2A 3K5OA 3NF7A 1KRPA 3A5OC 1RT1A 2Q0UA 2ZJQL 3I0RA 1RFQA 2J4RA 1ASWA 1S9EA 1YVNA 3VQ7A 1B92A 4F2SA 1SZ2A 2VWBA 5AQQA 1U48A 3NF9A 1N36K 5AQMA 4KPYA 4FJ5A 1Y97A 2W40A 1IV0A 2FBVA 3QEXA 2KKZA 3DLRA 3H3OB 3ZYYX 1C0UA 3QEPA 3K9KA 3RSEA 3OS1A 3OYAA 4JI1K 1GLLO 3ZLJA 3U3GA 5ADXA 3T1HK 3AVKA 4BRHA 5C15A 2V52B 3CFPA 1NBWA 1W7AA 4MLHA 2O8BA 2HOEA 2YNHA 3D6RA 2B4JA 1TAQA 3HI0A 4LF6K 3SUNA 3RSEB 3CJ7A 4QOZB 3SMSA 3MEGA 3M6GA 3E9PA 4Z4HA 3HVRA 4FJ8A 2GTDA 3THWA 1WN7A 4OJRA 2Z1HA 2QWQA 4BVOA 4KI6A 1Q81O 1QVFM 4FWSA 4RG8A 4OPAA 3NHGA 2O8BB 4H5RA 4NXMK 3VQPA 4CJEA 3U8XA 3CXCM 1FW6A 4BG8A 3P31A 4DV5K 3CCQN 3EZWA 3AVJA 2W6KA 3R1XA 3WXJA 3THWB 2HW3A 2VG7A 3VEYA 4QS7A 3HPOA 4FJJA 1JKHA 2A42A 2DFHA 1WAFA 4JS5A 4DB3A 1JCFA 4EAHD 4CF0A 3LP2A 4FWMA 1HNZK 4CEAA 3NMUA 1DTTA 1QSYA 4KHPK 3O6WA 1KCFA 4HTUA 3MN7A 4LFCK 3LPTA 5J1EA 4DV7K 1NJYA 4YDUA 1Q9YA 4FWQA 3NF6A 4BDZA 1TK8A 3R8EA 4CBWA 4KH6A 4WFBL 4FLUA 5KQDA 3TAMA 4CEOA 2HHHK 1S72N 1VK0A 4M7XA 4DQSA 3HP9A 1YVUA 4KHUA 3TAPA 2ETJA 3LWMA 4I6MB 3AGRA 3VN5A 4TSXA 5E41A 4JKAA 4FLTA 3L0QA 2GEMA 3ZSWA 3UE5A 3LZIA 4N56A 2D0AA 4M7YA 5GIOA 3ZEUB 3DOKA 3M1FA 4EFHA 4JKDA 4IOCL 3KK1A 3SK3A 3SBGA 4E7HA 3BDPA 1L3UA 4CJVA 3DMJA 4NYFA 3QEWA 1HNXK 2WONA 3OTOK 4B3MK 2R7YA 3DXKA 1HQUA 1IJJA 4RW6A 3N4PA 4KHSA 5I3UA 2VYPA 4IEEA 1S6PA 4JK7A 1OH6A 1NMNA 2RKIA 4B9TA 3ZT3A 4CIFA 5HP1A 3FZHA 4O8UA 2KZZA 2HNDA 4FJIA 3OJSA 1YTUA 3THXB 4NCGA 5KPZA 3H08A 4BREA 4CIEA 5D3GA 2RF2A 4M42A 4CERA 3RWUA 2P9NA 3EE8A 4AILC 2PBDA 4I9LA 3IKMA 4B9LA 3KZBA 4DSFA 4B9MA 2VGMA 2KLAA 4YOXA 3EKSA 3SV4A 3KKSA 3LDQA 4IG0A 1XHXA 2NRHA 4NB4A 2D0PA 5AQXA 3O4NA 2KQ2A 2W42A 4G9ZA 5KGXA 4PHTX 2YJFA 4AQYK 2FLOA 3TSPA 1K6YA 1LAWA 2P9NB 2V51B 3CCEN 3FGUA 3U6FA 4BDYA 1NGBA 5GAHP 5CYMA 4IOAL 4DR2K 2Q31A 4HCBA 5F0XA 3PO4A 1RTJA 4BE0A 2FSJA 2BUPA 1RT7A 1YITN 3MEEA 5AQGA 1ZC6A 5GINA 2KFNA 1T6DA 3FZKA 3ID6A 3VQ6A 5JLHA 2IGIA 2IDOA 4FK0A 4YHHK 1RTIA 2G8VA 4J2DA 3MXJA 1H1VA 4QAGA 2BDPA 2F9TA 1WLJA 1X1PA 5C42A 3K58A 3ALYA 5BN9A 2GWJA 1NK5A 1KVBA 4DFPA 1A5VA 1HMVA 2OANA 3O5BA 4FWPA 3KK2A 4BWMA 2F4VK 1TL1A 2YX6A 5AQZA 4EZ9A 4B3OA 1K73O 1J53A 4B1WB 3CC2N 4CK1A 3MX5A 4CZFA 3KKRA 4BRNA 4BG9A 3ATVA 4JKCA 2Q97A 3BEXA 3CJ9A 2Z1JA 3VMFB 3G25A 1NGAA 4N76A 3PIOL 4FJ7A 5FROA 4DKWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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