4HTYA

Crystal structure of a metagenome-derived cellulase cel5a
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
GWWNASDIPAFDKSKITRQLPLIKVEGNRFVDEQGKTIVFRGVNISDPDKIDKDKRFSKKHFEVIRSWGANVVRVPVHPRAWKERGVKGYLELLDQVVAWNNELGIYTILDWHSIGNLKSEMFQNNSYHTTKGETFDFWRRVSERYNGINSVAFYEIFNEPTVFNGRLGIATWAEWKAINEEAITIIQAHNPKAIALVAGFNWAYDLKEAAANPIDRQNIAYVSHPYPQKVGAPYQANWERDFGFMADKYPVFATEIGYQRATDKGAHIPVIDDGSYGPRITDYFNSKGISWVAWVFDPDWSPQLFTDYQTYTPTMQGEHFRKVMLQDNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Cellulase
publication title Crystal structure and substrate-binding mode of cellulase Cel5A from a metagenome library
rcsb
source organism Uncultured bacterium
total genus 125
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4htyA00
1UA3A 3GNPA 4HA1A 3IK2A 3GH5A 5HNNA 3AS3A 1VIWA 2A3BA 2WMIA 4QCEA 3PZ9A 4PMQA 1QNPA 1TA3B 1M03A 4PUDA 3AIQA 1FOBA 4AZHA 1MFUA 4NRSA 3VUPA 3VIGA 1E6NA 1PPIA 3FXYA 4LYPA 3WENA 4BQ4A 1B3ZA 4RE2A 3ZQ9A 1KCLA 1L8NA 1JZ3A 1G0CA 2D24A 4HU8A 4AYSA 3AMLA 4NI3A 1QI2A 4B9YA 3N17A 3W53A 3SCNA 1FFQA 1V3HA 2CESA 2PI6A 1H3GA 1OCQA 4AMCA 5A2CA 1H2JA 5A8OA 4ACZA 1R7OA 2Y24A 4PBGA 1ZBCA 1UWQA 3VIOA 5I2UA 4J3XA 2VCCA 3CO4A 3FW6A 1CGTA 1UR4A 1E6SM 1V6YA 3ZJ6A 3AHVA 1F4HA 4F66A 2VR5A 4ZFMA 4D6GA 5LA0A 1FHLA 1VFFA 4J27A 3APGA 4PTMA 1J18A 4JFTA 2JF6A 5JBFA 2VMFA 3GXDA 1B9ZA 4KH2A 1J0YA 2NT1A 1JZ5A 2J7BA 2J25A 1JL8A 3OGSA 5E70A 5E0FA 4K68A 1JDDA 4GQRA 2OWCA 3WBEA 2WPGA 4W5UA 1HP5A 3CPUA 3OLIA 4XV0A 1NARA 1FP8A 3AMGA 1ZB5A 2VX7A 1NQ6A 3F5JA 2X0YA 3AJ7A 3K8KA 2Q8XA 5CPQA 1CNVA 3WFZA 1HJVA 3WD2A 1BLIA 4BCEA 1UH3A 3TA9A 3PZQA 2GVYA 1KXTA 2VTFA 2JALA 4ATLA 4P8VA 3WH8A 4W89A 1B30A 1MW2A 5I6SA 5D4YA 2DT0A 1V6VA 1HKKA 5KEZA 3RO8A 1TFVA 4UQDA 1IZJA 3CTTA 3D5HA 2UY2A 2UY3A 2DSKA 1AQHA 4M81A 1WAWA 1GOKA 3OLDA 1H4PA 3MSDA 1GOIA 1W3KA 4CD7A 1J01A 4W88A 1HJSA 4PSPA 3ARPA 2C7FA 3BXWA 1G9HA 2J7EA 2O9RA 3ZT5A 4MAVA 1A47A 3WUGA 4PCTA 5D9PA 7CGTA 1GHRA 2WCSA 4OJYA 1E1EA 4JHZA 3PZGA 4EE9A 4MDPA 2YLAA 3UCQA 3EBVA 3N18A 5M5DA 1NWRA 3WY1A 1TUXA 1UD3A 1TE1A 4WJXA 4MPKA 1H09A 1CBGA 2Y2WA 3ARQA 4CN1A 4KMQA 1ISVA 3I3BA 1NH6A 2ZOXA 1VENA 2J77A 3RM4A 2WVVA 4P8WA 4UNIA 3VMNA 3MU7A 1BSIA 1UD2A 1CDGA 4V28A 3WQ6A 1E43A 2BS9A 2CIPA 1E40A 1UG6A 3CUGA 5A95A 3CZKA 1KXHA 2VZVA 3K1DA 5A8QA 4OUEA 3CHEA 2G3MA 4GQQA 1GUVA 2WAGA 2WZHA 2CHOA 2GDVA 1OT2A 4CU6A 3SCTA 2WHMA 3BAKA 4MNJA 9CGTA 1GORA 1TR1A 1XD0A 4QLKA 2ZX5A 1ISZA 2WZIA 3DHUA 1OGBA 3AIUA 1BGAA 3UEQA 3GNRA 1JYNA 1WP6A 4H8VA 4Z2KA 4GI9A 3WUBA 1CEOA 3VO0A 4FK9A 2EO7A 3CZGA 3VGDA 1QVBA 5BROA 4ZXOA 3W81A 3CZ8A 4P8UA 4CVUA 1V0KA 5E6YA 1EOKA 3NIYA 2DH2A 1GOMA 4WSJA 3OG2A 3AI0A 1TVNA 1W3LA 3SUTA 2V3FA 4GIAA 1JFHA 3GDBA 1CTNA 3WEMA 5EB8A 1H1NA 3SUUA 5A1AA 2RGLA 3MSGA 5JIWA 4CN6A 2GJPA 3AS0A 3WD0A 5DEZA 3AZSA 1G5AA 3ARZA 2IXUA 4Z2JA 3MUAA 1NWTA 3K46A 3BSHA 4HMEA 4JKKA 1B0IA 3SURA 3II1A 5JBEA 4LPCA 1B3YA 1LQ0A 1KWGA 1HL8A 1CIUA 4ZENA 4CD4A 2XSAA 1E0VA 3CIVA 3MV11 3T2OA 2G41A 1QHOA 2GSJA 4P7LA 4BQ3A 3VDBA 4AW7A 1HJWA 1J0IA 1EOMA 1W3JA 3LPOA 2ZUMA 4MB1A 1TCMA 3RM9A 3MV01 3UG4A 2ZUTA 1QI5A 1E5NA 2G8ZA 3IJ8A 4M1RA 5IHSA 4CGTA 4WKAA 1I75A 1LL6A 3PZOA 4D6DA 3SCRA 4D1IA 2GDUA 1NP0A 1W91A 3W26A 2XPKA 1XH2A 3WH6A 4ZE5A 2GK1B 4MB4A 3M46A 4UR9A 1EQPA 3AICA 3RJYA 1E71M 3IANA 1EO5A 3ARUA 1JGIA 5A6LA 5FD0A 4MNKA 1GZJA 2AOSA 2PBOA 4NRRA 3K4DA 2XGIA 3NCOA 2PWHA 1DWIM 3ALGA 5DT7A 5JBDA 3VD4A 1GJWA 1SMAA 2CETA 5A69A 1ZBVA 3CHFA 3VD5A 4MB3A 2IXVA 1QW8A 3T2QA 1R8LA 3WNOA 4B3LA 2EXOA 2YA2A 1M04A 4J28A 5ABHA 1JDAA 4TXEA 2XG9A 3ZIZA 4PMDA 3T2PA 7TAAA 4DWSD 2TAAA 3MMUA 1VFMA 4PCSA 4CUCA 1W32A 1UH2A 3NYDA 2D2OA 4IISA 3ARRA 3PZIA 4P7OA 2NSXA 1YHTA 1MFVA 3MUZ1 1MQRA 2OSWA 1OBAA 3L4VA 1AVAA 2PWFA 2XTKA 1VB9A 1XSKA 5HPOA 3AZTA 3VILA 4A3HA 3VDHA 4QFUA 4MDOA 2J8FA 3W6MA 4AD5A 4WLCA 1KGUA 1QW9A 1J9YA 3WD3A 2C8NA 3VDAA 1H41A 4H2CA 2V5CA 2YL6A 1JYXA 3KEHA 3RILA 2J74A 2ZXQA 3ZMRA 1E3ZA 2CBIA 3J7HA 3ARSA 1UWSA 2GK1A 5D9NA 2WZEA 1JI2A 1ZU8A 1CECA 4HZ7A 2BHZA 1VBRA 1IZKA 1G1YA 1C8YA 3VOCA 5M3WA 5A94A 5A6JA 2FDMA 1V3MA 1LWHA 3ZR6A 3G6MA 2X0HA 3WQ8A 3AMDA 4PSRA 1BYBA 4OZOA 4W8AA 2G3IA 2ZUNA 3ARVA 1W9VA 3BAYA 3VIHA 1W1VA 5HPCA 3WDRA 1CENA 2CCRA 1ZBKA 5A2BA 4CVWA 1JZ6A 3ZSTA 2UY5A 3WF3A 3MANA 3HU7A 4PMNA 1HVQA 2W5FA 1OGGA 3WFLA 4W93A 2UWFA 2JEPA 3WF0A 1WZKA 4N0RA 1WNOA 1WB0A 3WMBA 2ZICA 3VIPA 5D8ZA 5CG0A 5I77A 1DTUA 2QF8A 2WC4A 3NDYA 1FP9A 1KR0A 1SMDA 1N82A 3O6AA 5JUVA 4UTFA 1XHGA 4H8UA 2YDQA 1GOQA 2XYLA 2J62A 2X09A 1H49A 3ARYA 1JF5A 1UWIA 2ZX7A 5LYRA 1XH1A 1BPLB 2WCGA 1W9XA 3L4XA 3WF4A 4TOQA 3TTSA 2XVNA 3UG5A 3OA5A 6A3HA 1HXJA 1QI4A 5BXTA 2V38A 1D7FA 2BHUA 1NOWA 4DM1A 2J7GA 2PWDA 2IUZA 1CXEA 4D6FA 3U5YA 1ZL1A 2J7DA 2VO5A 4W85A 3AHTA 3VGFA 4JL2A 2GJXB 3VDCA 1EHAA 1BHGA 1MYRA 2J79A 4AEEA 2PC8A 1W3HA 1UD4A 2J47A 1OIMA 1AQ0A 2XIBA 2X2YA 4JFSA 1W9BM 1B3XA 4LGXA 1KXQA 1JYWA 3BAIA 1UYQA 5CSYA 3VTRA 5FKYA 3WL1A 3GXMA 4QLJA 3A4AA 4TX6A 2XM2A 3WSUA 1KQZA 5E0CA 1U30A 1JDCA 3WQVA 2QHAA 2WC3A 3THDA 1CZ1A 3EYPA 2VQUA 1KR1A 1J0ZA 3BAWA 1ODUA 1DHKA 1MVYA 1E1FA 4S3JA 4AD4A 1QBBA 2EPLX 4CU7A 4WF7A 2XVGA 3DYOA 3HN3A 3DHPA 1E6PA 3AQUA 3EDKA 3OLEA 1OT1A 3N04A 4JKLA 1UZ1A 1J0JA 1EDQA 1J0KA 3BH4A 4DUVA 1UR9A 2YDSA 1CWYA 1JG9A 1Q6EA 4FLSA 4R27A 1GVYA 1KFWA 1UUQA 4KRTA 4UZUA 5IFPA 4W5ZA 2DT2A 4TVCA 5D9MA 1U33A 3U7VA 3F5KA 3JUGA 2YA0A 1C7SA 3KZSA 5BXSA 2OYLA 1QPKA 1XH0A 4UOJA 4Z2GA 1BVZA 2E9BA 5A3HA 4LYRA 2WHJA 4J3UA 2ZXDA 2D0HA 3VM5A 1BQCA 1CXIA 3CGTA 3LMYA 3WMSA 5BCAA 3WUFA 4M8UA 4OKDA 4H8HA 2GJXA 2WVVB 1JAEA 4MTVA 1PIGA 3VD7A 4HMDA 4UFIA 2EPOA 3SCQA 3VGBA 3MS8A 1HKMA 3ZJKA 3QOKA 2YLLA 4KGJA 2C0HA 1HL9A 3SEPA 5I23A 2OLHA 1LLOA 1RPKA 4KWUA 2D3LA 1WZAA 3RCNA 3UETA 3A6OA 2WK2A 2CXGA 2CBUA 4AIOA 1MW1A 1JF6A 1UKOA 1V6XA 1KGXA 1CGYA 2XWDA 4TUFA 1JI1A 1WZLA 2ZUSA 1LG2A 3KWXA 3OB8A 3W6LA 3FN9A 2CKSA 1JFXA 4PMXA 1X1NA 2EPKX 2VOTA 1H0IA 2J4GA 4M24A 1YQ2A 3L4ZA 1V3KA 3LPPA 2XUCA 3AOFA 1LG1A 1PJ9A 2G3JA 5CLWA 2EPNA 4J3WA 2V3EA 3D3AA 1V02E 1B1YA 2VR4A 1GQJA 5EFDA 1ESWA 1E5JA 3WEZA 1XD1A 3VGEA 1QHPA 3CHDA 5GNYA 2YIHA 4CD8A 1V0MA 3WNNA 3PZTA 4WK9A 4C7DA 5KZ6A 4PN2A 3WH9A 4AD0A 2F61A 5I3DA 4H7VA 3L4YA 3VD9A 4XUYA 4LQ1A 2E9MA 4NZCA 5HXMA 2BVTA 2J7CA 1CGUA 4U2YA 1DWJM 1W9UA 1VFOA 1QNQA 2DSZA 4PYSA 5A6KA 8CGTA 5I78A 1V3JA 2J8GA 3G6LA 4ATDA 2V3DA 1C92A 2WVTA 4OIFA 1M7XA 3WDIA 3CH9A 4HMCA 3PHAA 1WDRA 2VUYA 1WDQA 3WDHA 3N1AA 1WDSA 4QDMA 4AZ7A 4GI6A 2VZOA 3AROA 1J0HA 1E9LA 1BYCA 1VRXA 4XB3A 1NM9A 4UFHA 1XV8A 5EMYA 2WMFA 1DWGM 3AS1A 1UR2A 3DC0A 4ACYA 2XVKA 5CSUA 3RDKA 1ISWA 2ZWZA 2VRKA 4GPNA 3VIMA 1FH8A 4HPGA 5A6BA 1G01A 5HBFA 2DDXA 5AC4A 2ZUWA 2GJRA 4AZBA 4D1JA 4F9JA 1C3FA 1DP0A 3GXFA 1HJUA 1HNYA 2WNWA 4TVUA 3L4TA 1ODZA 5BXRA 4DM2A 5GNZA 2PBGA 2DSWA 4UFKA 1UQZA 4AD1A 4CD5A 3TTOA 2A3HA 1W9DM 3QHNA 4IPLA 1ISYA 1K9DA 5A2AA 3AIWA 5CZKA 4YN5A 4CCDA 3AYRA 1VEMA 5CPTA 3HMCA 4H04A 1B90A 5TD4A 3WNLA 1U2YA 1WKYA 1GOWA 1D3CA 3ARXA 4E2OA 1E56A 2DIEA 1AQMA 1ZBWA 1B3VA 4RE4A 2VJXA 5D8WA 2ZIDA 2WM0A 4JFUA 1W1PA 4GXPA 4L4PA 1OB0A 4D6HA 1HT6A 2CBVA 1W1TA 5E9AA 2PF0A 3AS2A 3AISA 1HKIA 4JAWA 1MWOA 1ITCA 1E6RA 4A4AA 3CUHA 3WBAA 2BY1A 4U33A 2XFRA 3WUEA 1QI0A 4KGLA 4M80A 1GONA 4HOWA 4W8BA 5GNXA 2CBJA 2PB1A 1LL4A 3QHOA 2O9TA 1KXVA 4PMRA 3QHMA 4ML4A 1GHSA 3BSGA 3NSNA 1BAGA 1AMYA 4OBSA 2DIJA 3THCA 4XX6A 1NP2A 1S46A 4XZWA 2ZX9A 4OOUA 1J11A 2WCAA 4UQBA 3WD1A 1OSEA 3VU2A 3NSXA 4TX8A 1J12A 2CPUA 1BG4A 3SUVA 5EFFA 1W2VA 4LYQA 5AY7A 4D6JA 1E70M 2CYGA 4BQ2A 2VZTA 3N11A 1MW3A 4LXFA 3PZMA 4E8CA 3ECQA 3KL3A 5BRPA 4HOXA 1XRVA 4BQ5A 3EDJA 4Z2IA 1D2KA 3WDQA 1Q6CA 5IDIA 2PWEA 3AXXA 1EGZA 1GNXA 4L4OA 4EKJA 3KL5A 1E4NA 3SIMA 4MNMA 4AD2A 1UKQA 4HZ6A 2OWWA 4DUXA 2QMKA 4GKLA 1ECEA 4AC1X 1W1YA 5ABFA 5BYWA 5CPSA 3NDZA 3TP4A 1R85A 2XGBA 3W28A 2W91A 3EDFA 4RE3A 5M17A 1BTCA 1UR0A 2WHKA 4LX4A 4AY1A 4EAMA 4D6IA 1XYFA 2WXDM 3FHAA 5LA1A 3K8MA 1H0GA 1KB3A 2WMKA 5FOOA 3N15A 1HJQA 2VRQA 1SFSA 1E0XA 3S6TA 5BWFA 3RMEA 2JE8A 4V2XA 1PZ3A 6TAAA 1JAKA 2HISA 2WMGA 2DGAA 4HZ8A 3GH7A 3UG3A 5HOSA 4JL1A 4MB5A 4JCLA 1DWHM 2ZE0A 3QGVA 2D23A 3POCA 1BYAA 3AMCA 1OIFA 1HX0A 1V6UA 1Q6FA 3SCOA 1V08A 1QNSA 4JKMA 1GQKA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UA3 A;  3GNP A;  4HA1 A;  3IK2 A;  3GH5 A;  5HNN A;  3AS3 A;  1VIW A;  2A3B A;  2WMI A;  4QCE A;  3PZ9 A;  4PMQ A;  1QNP A;  1TA3 B;  1M03 A;  4PUD A;  3AIQ A;  1FOB A;  4AZH A;  1MFU A;  4NRS A;  3VUP A;  3VIG A;  1E6N A;  1PPI A;  3FXY A;  4LYP A;  3WEN A;  4BQ4 A;  1B3Z A;  4RE2 A;  3ZQ9 A;  1KCL A;  1L8N A;  1JZ3 A;  1G0C A;  2D24 A;  4HU8 A;  4AYS A;  3AML A;  4NI3 A;  1QI2 A;  4B9Y A;  3N17 A;  3W53 A;  3SCN A;  1FFQ A;  1V3H A;  2CES A;  2PI6 A;  1H3G A;  1OCQ A;  4AMC A;  5A2C A;  1H2J A;  5A8O A;  4ACZ A;  1R7O A;  2Y24 A;  4PBG A;  1ZBC A;  1UWQ A;  3VIO A;  5I2U A;  4J3X A;  2VCC A;  3CO4 A;  3FW6 A;  1CGT A;  1UR4 A;  1E6S M;  1V6Y A;  3ZJ6 A;  3AHV A;  1F4H A;  4F66 A;  2VR5 A;  4ZFM A;  4D6G A;  5LA0 A;  1FHL A;  1VFF A;  4J27 A;  3APG A;  4PTM A;  1J18 A;  4JFT A;  2JF6 A;  5JBF A;  2VMF A;  3GXD A;  1B9Z A;  4KH2 A;  1J0Y A;  2NT1 A;  1JZ5 A;  2J7B A;  2J25 A;  1JL8 A;  3OGS A;  5E70 A;  5E0F A;  4K68 A;  1JDD A;  4GQR A;  2OWC A;  3WBE A;  2WPG A;  4W5U A;  1HP5 A;  3CPU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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