4I93A

Structure of the bsk8 kinase domain (semet labeled)
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
289
structure length
289
Chain Sequence
QFREFSIETIRNATSGFAAENIVSEHGERAPNVVYKGKLENQRRIAVKRFNRKSWPDSRQFLEEAKAVGQLRNHRMANLLGCCYEDEERLLIAEFMPNETLAKHLFHWESQPMKWAMRLRVALHIAQALEYCTSKGRALYHDLNAYRVLFDDDANPRLSCFGLMKNSRDGKSYSTNLAFTPPEYLRTGRVTPESVIYSFGTLLLDLLSGKHIPPSHALDLIRDRNIQMLMDSGLEGQFSSDDGTELIRLASRCLQYEPRERPNPKSLVSAMIPLQKDLEIASHQLLGVP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Probable serine/threonine-protein kinase At5g41260
publication title Structural Characterization of the RLCK Family Member BSK8: A Pseudokinase with an Unprecedented Architecture
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 83
structure length 289
sequence length 289
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4i93A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4i93A01
2ZM3A 2OO8X 1YHSA 2VN9A 3E8NA 2F7ZE 5CXHA 3ZEWA 5IA4A 3AT4A 3D4QA 3DBEA 2JIVA 4P7EA 2QC6A 5AP1A 3ZRLA 3UPZA 4EK8A 3LJ0A 4GRBA 4GVJA 3RALA 4ZIMA 1MRYA 3CY2A 4IDVA 3HA6A 2GMXA 4GYGA 3OWJA 5IEXA 2HZNA 4FKUA 4BDDA 4FSMA 4KIKA 1PXPA 4USFA 4LUEA 3CKWA 2PMIA 5JEBA 2VWVA 4O0RA 4TY1A 4EOLA 4ARKA 4Y8DA 2CNUA 3GU5A 5TKDA 2GQSA 5JKGA 4APPA 4EHEA 3QQFA 4FTQA 4II5A 2HOGA 3POZA 3SOAA 2P2HA 1IA9A 1JSUA 3Q60A 2YM7A 2YM4A 4RZVA 4YJOA 3L8XA 3JY9A 3ODZX 4BCMA 2R3OA 4NCTA 4DFYA 5IA1A 3P79A 4K1BA 3SHEA 5CLPA 2V22A 1Q4LA 2GPHA 3QQKA 1H1SA 4CFWA 2YERA 3F5PA 2QOFA 4PL3A 5CZIA 3TZ7A 4FV6A 3R01A 3M42A 5GZ9A 4BF2A 3COKA 3W2OA 5IQAA 3ZFXA 4CSVA 3SV0A 3CE3A 3KXGA 4LRKA 5HD4A 5L2IA 3V6RA 1HOWA 1H01A 5HHWA 3NWWA 4BDHA 3WZJA 4MBJA 4ZMEA 2A2AA 4O27B 4BGHA 4MNEA 5FM2A 3TNWA 4BB4A 4BDKA 3ZBXA 3RZFA 2B9JA 3QCXA 5EI8A 3TV7A 5DPVA 3DKCA 3LQ5A 3FXWA 5IEVA 2WIHA 5DT3A 3V5WA 5CEPA 5KKRB 4RQKA 2YM3A 1YXTA 3FMEA 3W10A 3WIKA 3L8SA 3HL7A 2ETKA 2XH5A 4KA3A 2XKDA 4GJ3A 4RWKA 2BVAA 4BDAA 4ZZMA 5AA8A 4AN3A 1KE8A 5JRQA 1RQQA 5LOHA 5M06A 2UW8A 2I1MA 1MRVA 2XZSA 3DPKA 2IZUA 4FC0A 4I6FA 5TO8A 4UMRA 2QVSE 4CNHA 3ACJA 3DQWA 5CQUA 4E6AA 2WXVA 5CQWA 1QPEA 4EC9A 3OW3A 3CC6A 1ZMUA 3MIAA 1H24A 4S31A 3K3JA 5HU3A 3RK9A 5HCYA 3O17A 3GGFA 3KFAA 5IA3A 4PDSA 4WNPA 3MJ1A 4FV1A 4R8QA 2ACXA 2HY81 5TR6A 3UZPA 4EWQA 2W96B 3C4ZA 4PMSA 3A8XA 4ANNA 4D4YA 1YW2A 5KBQA 4AZWA 4TYEA 2EXMA 2F4JA 2CDZA 3Q32A 2WZJA 5HBHA 3VRYA 4BWKA 5K5NA 1PXIA 3L9NA 4GCJA 3R9DA 3QLFA 3F88A 4R6VA 4IX5A 4ZAUA 3ZUVA 4WD5A 3PIYA 4JDKA 1FBNA 4AA4A 4UV0A 2ZV7A 3QC9A 5H8GA 1XH8A 3VUMA 3QKLA 2VTIA 5FDXA 2GCDA 3BV3A 4MWHA 3GFWA 3FI3A 4AA0A 2BROA 2QOBA 5F1ZA 4JBVA 1JPAA 4PY1A 4ALVA 2B52A 2G9XA 4XH6A 4B9DA 2W7XA 2Y9QA 3DT1A 3PZHA 3P0MA 3LFBA 4K8AA 5D7VA 3SD0A 3PUPA 3UQGA 3NYXA 1J7LA 3O96A 4Y5QA 4IFCA 5FEQA 4BCJA 2A1AB 5HVKA 2UZVA 3Q4TA 4FKJA 1LEZA 5B0XA 2C5NA 4XOYA 3H9RA 4RA5A 4G16A 3IW8A 5FBNC 2NP8A 4O0TA 4FKRA 2BILB 4KIKB 3VVHA 5LVOA 1QPCA 2RG6A 3OF0A 4O38A 3RZBA 4D2RA 4B8MA 4BKYA 4CFNA 5CVHA 5DFPA 2W1ZA 5E92A 5DRDA 2CCIA 2IVSA 2W1DA 4QP3A 5AMNA 4WHZA 5E8SA 2X2KA 2XCKA 4R5SA 2GQRA 3E8EA 3UPXA 4PNKA 3UMWA 3IW6A 4FL1A 3EWHA 3LZBA 3PXFA 2Z7SA 4A4LA 2VX3A 1O6KA 4ASZA 4BDBA 4Z3VA 1KV1A 3KXNA 3GCUA 3LHJA 4ERWA 1CKPA 2PE2A 2BAKA 2XIYA 4IE9A 3Q96A 2W99B 2GNFA 1Q97A 1KE7A 4UWYA 5E8ZA 1JBPE 1ZZLA 3VBXA 4L00A 1OBDA 4MQ2A 4M8TA 2JKKA 5AM7A 5GJDA 5EOLA 3DXQA 2XNPA 3W16A 2QNJA 4FIIA 3UZTA 4I5PA 5BVKA 1RDQE 1AGWA 3VWAA 1L8TA 4BHZA 3GENA 3TZ8A 5LVNA 4Z7HA 4C4JA 3TCPA 2I40A 2Y4IC 2UW9A 3AC4A 3UQCA 3QRTA 3SG9A 1WBWA 4CEGA 3OMVA 5IMXA 3R63A 2CKEA 4NM0A 4FGBA 2J0IA 3LFFA 2IVUA 3QQGA 1U5RA 3VBQA 1F3MC 5AV4A 2H9VA 3PLSA 3VBVA 2XVDA 4C02A 5HQ0A 5C26A 4QP2A 5IH5A 4CGAA 3W2RA 4QP1A 4BDGA 3RPRA 3QALE 4CT2A 4ZZNA 3C0GA 5EW3A 3WE8A 2YDJA 5D9HA 4C4FA 3SW7A 3OHTA 5E8YA 4DT8A 1MQ4A 3TJCA 5L6OA 2WTWA 4XX9A 3W1FA 4WOVA 4TWNA 5M56A 4CFMA 3PSBA 4G3EA 4FNYA 4QYEA 3A61A 3KA0A 5M4IA 4BKJA 4OTQA 2JD5A 5A4CA 5FP6A 2OFUA 3OY3A 3K5UA 3PXQA 4K6ZA 5J7BA 2OBJA 5BVFA 4F1MA 3KF7A 2QI8A 4AX8A 3AC5A 1NVQA 1Y8GA 3PIZA 1TQMA 5DRBA 3FPQA 3ZHPC 3SGCA 3U6JA 4ORKA 3TKUA 3NS9A 4OTFA 4O7TA 4O7YA 2B0QA 1WVXA 4YJNA 2H34A 5KX8A 4QMXA 4J71A 3PA3A 5GINE 4XG8A 3JY0A 4FF8A 5HOAA 3GT8A 3OD6X 3HP5A 5CU3A 4C62A 4F6UA 4RPVA 3ACKA 4C2VA 2YLEA 3PP1A 4R5YA 5DE2A 1J91A 5E1EA 3UOKA 1A9UA 2YITA 4BWPA 2GHMA 3F66A 4RFYA 2RL5A 5CENA 5AP7A 4CD0A 2WFYA 3ZO2A 4GKIA 2Z2WA 3UG2A 2OG8A 2PE0A 3BWFA 2XS0A 3LCTA 4I4FA 3HV6A 3R1SA 5HICA 4EOPA 1JWHA 2BHHA 1V1KA 3QA0A 5K0XA 3MBLA 4U42A 1HCLA 4QQCA 2I7QA 2G15A 3NYVA 3QQJA 5J7HA 5FTGA 2V55A 1Y8YA 1H1WA 4QMSA 3VHKA 5AM6A 3IGOA 5FUTA 3PE1A 3LIJA 2H6DA 5ANIA 4A9TA 2XUUA 2WNTA 3HUCA 5F9EA 3LCSA 5CNOA 4S33A 3R8UA 4CKIA 3QRUA 4I24A 3MPAA 3IDPA 5LMAA 1IEPA 1ZRZA 2PVNA 3G51A 3KEXA 2QOQA 4JAIA 5A46A 2PHKA 3HV7A 2JGZA 3V3VA 5JGAA 4Q5HA 3KMMA 3NCGA 3R2BA 3EYHA 3LJ2A 4YC6A 5DWRA 3U9NA 5CAPA 1WVWA 3NW6A 4DG3E 2WMAA 3F3VA 5FRIA 5IUIA 1Y6BA 3VUKA 4ASEA 4EUUA 4QMQA 3CIKA 5HG7A 3BELA 3EFLA 4YZNA 3ZTXA 3LCDA 4QNYA 3VBTA 4GT3A 2B9FA 3CQWA 3BHUA 2E9NA 2WMXA 3H0ZA 2PUIA 3Q4CA 2CLQA 2GFCA 2OIBA 3AG9A 3H0YA 4FV4A 3K54A 4IVDA 4JRVA 4LYNA 3ZLXA 2C1BA 4JBOA 4OLIA 4TNBA 4E6QA 4N0SA 4E4LA 3UO5A 4CG9A 1SVGA 4DBXA 3HLLA 4AGWA 4LMUA 3HVCA 4QTBA 3RHXA 4AE6A 1VZOA 2QCSA 5CX9A 4BI0A 2IO6A 2OW3A 4OTGA 1FQ1B 3FLZA 4AOTA 2C0OA 3QTZA 3BYMA 3EL8A 2V7OA 4YNEA 3O8UA 3NSZA 4NEUA 2VTNA 4KB8A 4DH1A 5ITAA 2WHBA 4RIOA 3WZEA 4HCUA 1Q24A 1XWSA 1JKKA 5C1QB 1XKKA 3G5DA 2XNOA 4GJ2A 4NK9A 3POOA 3ZSIA 3RAHA 3RKBA 2QO9A 5F20A 2UW3A 3QAME 3IPHA 3ET7A 3EYGA 3LAUA 3T3VA 3DK7A 5CU6A 1F0QA 1H00A 3RAIA 1YXVA 4ZY6A 5EW8A 4IWPA 2R3IA 3VUGA 1M17A 4JLCA 5BX0A 5IQBA 1ND4A 4ZP5A 1JKTA 4LMNA 3FHIA 5KMLA 3OG7A 5DHJA 4NH1A 4GIHA 2LAVA 1CDKA 1LP4A 2GHLA 3P7CA 1H1PA 3BQRA 4FT5A 3WOWA 1OZ1A 2ERKA 4GVAA 4YPSA 1OKYA 3VBWA 2C6LA 3JPVA 4OR5A 3QYWA 1J7UA 2BZJA 2VTTA 3ALOA 4DA5A 3BHHA 4IVBA 3WZUA 4BZOA 3HRCA 4WG5A 5EKOA 3HAVA 4X2NA 3ZCLA 4X0MA 5IQCA 5DN3A 3ORIA 1KE9A 1VYZA 5IA0A 3K3IA 2XK4A 3FMLA 4ACCA 3U8WA 1UNHA 4EBVA 2QLUA 4R7HA 3R7IA 4QMPA 4O2ZA 4YJPA 4RIXA 4YNOA 4QMNA 4AZEA 4BR3A 3OBGA 4QP9A 2WQMA 2VTMA 5JZNA 4XLVA 2QR8A 1YQJA 2VWZA 3UIUA 4BGQA 5H8BA 4MQ1A 4BBMA 1M7NA 3VS5A 4CG8A 3EQRA 3EOCA 2R0IA 4I3ZA 1IG1A 3ENHA 4M97A 4Y46A 5KMJA 4BTJA 4CLJA 2W5HA 3SQQA 1JKLA 2YAKA 5FM3A 4RJ7A 4AUAA 3W2QA 1YXSA 1G5SA 5L2QA 1KOAA 3DTCA 4QP8A 3ZZWA 2GNJA 4YJSA 3ZS5A 2QG5A 2ZV2A 3BV2A 2A0CX 4PTEA 4EH2A 4FIHA 4YC8A 4K18A 4HZRA 4QPMA 1PYXA 1U4DA 2NO3A 3MH0A 4ONAA 4C3RA 4LV8A 4YHJA 3O51A 4UZDA 3MH2A 3V5TA 1AD5A 4CVAA 4BTKA 3AGLA 4XG4A 4HW7A 1QPDA 3Q5ZA 2JDSA 2C0TA 2UZDA 1FMOE 3IECA 2J0KA 2WU7A 3D7TA 4RQVA 4YTCA 5CF5A 4U41A 3UIBA 4BFMA 3PIXA 2G1TA 2UW6A 4IVCA 5LARA 4MEDA 1M14A 3VUTA 1H8FA 2RFDA 2UZBA 4NCTC 3E93A 4FEWA 2HXQA 3OOGA 4N57A 3ZO1A 4CCUA 4XRLA 4F70A 2G01A 4YR8A 3OTUA 4ZK5A 4HYSA 1E1XA 4FOBA 4QPAA 2Y6MA 3KN6A 4U43A 4EH5A 4YURA 2OFVA 3QWJA 3MFSA 4NT4A 4LFIA 4G6LA 4IC7A 3BZ3A 3IOPA 1XJDA 1K9AA 5I5ZA 2HAKA 2XKCA 4ANLA 2IPXA 4IZ5A 3R21A 4JRNA 4TTHB 5CAQA 3G2FA 2YEXA 3P9JA 3GNIB 3HKOA 4C34A 1T46A 4WNMA 5HE0A 4E4XA 3ZM9A 5J9LA 1W98A 2QOLA 3PWYA 4EH9A 3NGAA 5ANKA 4F0FA 3G6HA 4IAKA 1OMWA 5L8KA 4GSBA 4RIYA 3MWUA 4IJPA 3FLWA 4HOKA 3KXMA 3IS5A 3SXRA 2HIWA 2DYLA 2NPQA 3NIZA 3W2PA 3KCKA 1WVYA 3FLYA 4BKZA 3N9XA 1ERKA 2WMUA 2W1EA 5IPJA 4LOOA 4RC2A 4EORA 3JS2A 2Z7RA 3BRBA 3C1XA 4FV3A 1P4OA 4FV7A 5F95A 1Q5KA 5L2SA 3HV5A 2B9IA 4ASDA 3QZHA 4FTNA 4YTFA 3TUBA 2WOUA 4FR4A 4ZTSA 4AW1A 1GNGA 4J8MA 4JS8A 5LQFA 3QCYA 4FUXA 4AS0A 4F7JA 3HA8A 3RM7A 4QYFA 4G5JA 4O0XA 3HP2A 3LFDA 4NU1A 3FI8A 2C6DA 5CVFA 4ACDA 3RGFA 4UWBA 1IAHA 4LI5A 4QMWA 4J97A 2PUPA 4L3JA 4LUDA 4RIXB 5H8EA 4JBPA 3DOGA 5KMOA 1FPUA 5JT2A 2XJ0A 5IUHA 1OUKA 3U4UA 3QUDA 1YHVA 3F2AA 4R3CA 4H1MA 4EONA 3D7ZA 4E5AX 1H1RA 4AT3A 1QCFA 4ZS0A 3K2LA 4AXAA 4M68A 4IZAA 4YMJA 4A06A 3EQPA 3RVGA 4YHTA 1Z9XA 2BPMA 5JGDA 3GVUA 4GS6A 3EN5A 1H0VA 3FKNA 4K0YA 4DGOA 4Y72A 4CYIA 1JVPP 2C6MA 2R3NA 2ZM1A 2WTKB 4QMTA 3ORPA 3MA3A 5M44A 5HNGA 4G1WA 3R00A 4FL2A 4CTBA 4BDIA 4D1ZA 2XK7A 3LFSA 3LFQA 2PPQA 2DS1A 4CMTA 2YDKA 3C4CA 4Q5EA 4YJVA 3I60A 1WAKA 3A2CA 3R7EA 5E4HA 1Q61A 3IGGA 4AZTA 1PXLA 1OL2A 3U55A 1OVEA 3OROA 3D7TB 4DLIA 5FP5A 2VWXA 1M52A 3GI3A 4EI4A 2XB7A 4G2FA 3VO3A 2GTMA 3TJDA 3FXZA 2UZWE 4GH2A 4JQ7A 4B0GA 4TYHA 2C1AA 4ANQA 4IX4A 4W4XA 2RF9A 4JDHA 3TIZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2ZM3 A;  2OO8 X;  1YHS A;  2VN9 A;  3E8N A;  2F7Z E;  5CXH A;  3ZEW A;  5IA4 A;  3AT4 A;  3D4Q A;  3DBE A;  2JIV A;  4P7E A;  2QC6 A;  5AP1 A;  3ZRL A;  3UPZ A;  4EK8 A;  3LJ0 A;  4GRB A;  4GVJ A;  3RAL A;  4ZIM A;  1MRY A;  3CY2 A;  4IDV A;  3HA6 A;  2GMX A;  4GYG A;  3OWJ A;  5IEX A;  2HZN A;  4FKU A;  4BDD A;  4FSM A;  4KIK A;  1PXP A;  4USF A;  4LUE A;  3CKW A;  2PMI A;  5JEB A;  2VWV A;  4O0R A;  4TY1 A;  4EOL A;  4ARK A;  4Y8D A;  2CNU A;  3GU5 A;  5TKD A;  2GQS A;  5JKG A;  4APP A;  4EHE A;  3QQF A;  4FTQ A;  4II5 A;  2HOG A;  3POZ A;  3SOA A;  2P2H A;  1IA9 A;  1JSU A;  3Q60 A;  2YM7 A;  2YM4 A;  4RZV A;  4YJO A;  3L8X A;  3JY9 A;  3ODZ X;  4BCM A;  2R3O A;  4NCT A;  4DFY A;  5IA1 A;  3P79 A;  4K1B A;  3SHE A;  5CLP A;  2V22 A;  1Q4L A;  2GPH A;  3QQK A;  1H1S A;  4CFW A;  3W0N A;  2YER A;  3F5P A;  2QOF A;  4PL3 A;  5CZI A;  3TZ7 A;  4FV6 A;  3R01 A;  3M42 A;  5GZ9 A;  4BF2 A;  3COK A;  3W2O A;  5IQA A;  3ZFX A;  4CSV A;  3SV0 A;  3CE3 A;  3KXG A;  4LRK A;  5HD4 A;  5L2I A;  3V6R A; 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