4IAKA

Low temperature x-ray structure of camp dependent protein kinase a in complex with high sr2+ concentration, adp and phosphorylated peptide psp20
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
337
structure length
334
Chain Sequence
SVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/peptide
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
publication title Insights into the Phosphoryl Transfer Catalyzed by cAMP-Dependent Protein Kinase: An X-ray Crystallographic Study of Complexes with Various Metals and Peptide Substrate SP20.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 112
structure length 334
sequence length 337
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4iakA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4iakA02
4FV3A 4L45A 2JKMA 3R73A 4YP8A 3VNTA 4YHFA 1Q8WA 3F3ZA 1MRVA 3KF7A 4FICA 4M7IA 4NH1A 4F1TA 4GKHA 4ZLZA 3TDVA 2Y4PA 4FTCA 3F5UA 3F69A 2X2KA 5FRIA 4UWBA 3KRLA 4YTHA 5BVKA 3HMIA 1IA9A 4KKEA 4U43A 1FINA 4ERWA 4LGGA 3ULZA 3C1XA 5H8BA 3OW4A 3PPKA 3BX5A 3KFAA 3LCSA 3MY0A 1OL1A 4W9WA 4YJVA 2BDWA 4GJ3A 4NJ3A 3IG7A 2E9PA 3GENA 5BVFA 3WBLA 2XIRA 4JS8A 1Q41A 1IRKA 2QOOA 3TZ9A 3WF9A 4F1OA 3E8DA 1BL6A 3P79A 4C4EA 4D4RA 5CNNA 2GHMA 1WZYA 4D2WA 1XJDA 3HL7A 3RPOA 4E4MA 3OUKA 1GIIA 4YZBA 2BTRA 3CQUA 4ZJVA 2W1IA 4AF3A 4EQUA 3GFWA 3PZEA 2HWPA 3CTJA 3FI8A 5JRSA 5B2KA 4G6LA 4X21A 5KMJA 3U9CA 4DA5A 1OI9A 4QP3A 5CSXA 5JQ5A 3UIMA 1S9JA 3DBFA 4GT5A 4BKZA 4E1ZA 4F9AA 3BHTA 5AMNA 3Q32A 3W2RA 4FKTA 5AAEA 2PY3A 2WQEA 3DJ7A 3SX9A 3GNIB 1H1RA 5C4LA 3IW7A 4IBMA 4U44A 5JZNA 3EKKA 3Q4CA 4MX9A 4P5ZA 4ZS0A 5HBJA 2XK9A 4WIHA 2J0KA 3U6JA 4YZMA 4GW8A 2BFXA 3EFKA 4DFUA 5CF5A 1DM2A 2OFUA 2PE1A 2C5XA 1Q62A 2WZJA 1BMKA 4H1JA 4C4JA 2RSVA 4AGCA 3QC4A 1MRUA 3VAPA 3VS5A 4C0TA 2ZM4A 5GJDA 5AR8A 3DU8A 5M08A 5DHJA 5LJJA 3UE4A 4PNKA 3UG1A 2C3IB 3NUPA 3BZ3A 4BVUA 3DZQA 1ZMVA 4Y83A 4CCBA 3OS3A 5IQFA 4RLKA 5AADA 4F0GA 2A4LA 4WSYA 5J8IA 5DEWA 2W9ZB 1M7QA 1XBAA 3PVGA 4NW6A 2W1ZA 1PXIA 2BZIB 2QC6A 4IHPA 2BR1A 5E8ZA 2F9GA 3UQGA 4J99A 4YPDA 2UW0A 4XV2A 3TTJA 4FV8A 2UZDA 3K5VA 5C03A 4JG6A 3LQ5A 3D94A 3F3TA 3MS9A 3QTXA 2W06A 4UXLA 4IM3A 5D7VA 4NSTA 5BVDA 5JK3A 4OAVB 4HPTE 4IZYA 5HD7A 4NL0A 1Q3WA 3D0EA 4O6LA 3RPVA 2YERA 4IM2A 3SW4A 1MRYA 4AGUA 4X3FC 4RFYA 1SMHA 1JKSA 1UWHA 5BNJA 5B2LA 4DITA 2JDVA 2QD9A 4MD9E 4EOMA 2VWZA 4G9CA 2YLEA 2ITPA 3MWUA 4JBVA 4K2RA 4W4WA 4U9AA 4BCGA 3ATTA 4PWNA 3VRZA 3FYJX 2C6KA 3QHWA 4ZP5A 3TWJA 2R2PA 2ZDUA 1PXJA 2BUJA 4LOOA 5HG8A 5A3XA 4CRLA 2HZNA 2B55A 2IO6A 2X6DA 2CN8A 3KA0A 4U7ZA 2XEYA 3SLSA 1UU7A 5E1SA 4BWPA 3PZHA 2BRBA 5DT0A 4EHGA 5IH4A 2A27A 2WTDA 4DEIA 2ZB0A 4WKQA 2X39A 3CBLA 5JSMA 1DS5A 1Q4LA 4O0XA 3LCTA 3VJNA 4E73A 4RIWB 3PSDA 5FM3A 4YBJA 3ERKA 3IW4A 3R1QA 5HIDA 1KV1A 3OXTA 5AR7A 2W1DA 2OH0E 2P55A 3OF0A 3PYYA 4JX3A 4TT7A 3OY1A 2J51A 5HU3A 2C0TA 4LV5A 2BILB 3SXSA 3ORZA 3DY7A 4BBMA 2UW9A 3Q60A 5D41A 5ANGA 3VS0A 5IH5A 2G15A 5I9XA 3V8SA 3EN7A 4G16A 4FTJA 3R9DA 5HOAA 4ZXTA 3QWKA 4OTQA 3RVGA 3OEFX 4MH7A 2WTCA 4E26A 1KOAA 4L68A 1IA8A 2BIKB 4FTAA 4GFOA 4JBOA 2JAVA 3C5UA 3MA3A 3N9XA 4X7QA 3MI9A 3CIKA 3O17A 5F9EA 2ETKA 3UGCA 1F0QA 1O6YA 2R0UA 3R8PA 3CSVA 5DR2A 4C4HA 5M57A 2W7XA 3SRVB 4DC2A 1JSVA 4Q9SA 5FBNC 5KMNA 3NUAA 4BHZA 4AA5A 3AD6A 2X7FA 3RPYA 3FXXA 4N6ZA 2FB8A 3BE2A 4YO4A 4CLIA 4JJRA 3LMGA 2J0JA 3ZFXA 3GU5A 4LFIA 4RQVA 4A9SA 5M44A 2P33A 1RE8A 1G8AA 2A19B 3LLTA 2CDZA 4FC0A 4K33A 3A4PA 3R22A 4WNKA 3IGOA 4M67A 4X3JA 3L1SA 2YZLA 4A9UA 3T9TA 2GMXA 1XH9A 2HXQA 4CQGA 2Q0NA 2VTJA 1XH4A 2Y6OA 2PU8A 4AT3A 2PVNA 1RW8A 2H6DA 2RG5A 4FL2A 4IX6A 4KKHA 3SDJA 4O1OA 3Q04A 4PPAA 2PMIA 2QG7A 2OZAA 2BZJA 2WMAA 4X3FA 5DMZA 4PMTA 4YC6A 4MXXA 3WI6A 5GNKA 4EOJA 4XOYA 4FV4A 1CKJA 3WE4A 2E2BA 3BU6A 1W84A 4KA3A 3DDPA 1BKXA 1YRPA 4E6AA 4QOXA 3S1HA 2ZOQA 1GZOA 5L2IA 1FQ1B 4PY1A 4I0SA 2XVDA 4KWPA 5AA8A 4WNMA 4YSJA 3JPVA 4LRMA 2OXYA 2E9VA 4RVLA 5CQUA 3OG7A 2OIBA 2YISA 4NM3A 2R9SA 3UVQA 3ZONA 5LCKA 5LCJA 4BZDA 5HG9A 4KUJA 4AZTA 2UZEA 3R9NA 2ITXA 1WMKA 3FY0A 1ZYSA 2WMXA 3TZ7A 2QU6A 1GIJA 4M15A 5IEVA 2EXMA 1JSTA 5EOLA 4FL1A 4RJ8A 3JYAA 4IVAA 4O0VA 5IQAA 3WIKA 3PLAE 3PJ2A 1PXOA 1K9AA 5CAQA 4M68A 2OU7A 1JKLA 2OIQA 4IIRA 5CX9A 5BYZA 3ZEPA 4YZNA 2ITVA 5TR6A 3N4UA 3A7GA 2YHVA 3PXFA 3KCFA 4PPBA 4GRBA 3EQGA 4D2TA 1J3HA 4X2JA 3DFAA 2J6MA 3F2NA 3PJCA 4CZYB 3G0EA 3TKHA 2VTIA 1P4FA 2VD5A 3F6XA 5AM7A 2CCIA 2VNWA 2YEXA 4YHJA 5G1XA 2XB7A 1JWHA 3C4WA 1PYXA 5IQEA 2EUFB 4NKSA 5IQBA 3W2QA 3MPMA 2OO8X 4LYNA 5LMAA 2G9XA 3ZFMA 4NUSA 1R78A 1BI7A 2O2UA 4RZWA 3C0GA 4J96A 2WGJA 4EUUA 5I9YA 2WTKB 3FXWA 3BBWA 4DH3A 5A4TA 2VWWA 3Q52A 4P90A 2WNTA 2BAKA 4I0TA 4IADA 3HV5A 1OL6A 1PJKA 2XJ0A 4GJ2A 2QKWB 4P4CA 3DAKA 1Y91A 3NW5A 2F7EE 3CGOA 3L9PA 4FT0A 3BGQA 3W2OA 5K3YA 4JL9A 1GNGA 4AGWA 1PXKA 1J7UA 3UG2A 4IANA 3B2TA 4E5BA 2WOUA 3HDNA 5HTCA 4JQ7A 1KOBA 3P23A 3DLSA 4R77A 3AMYA 5M51A 3MYGA 4QT1A 4U6RA 4ZTSA 3D2IA 1LEWA 4YTIA 2ZDTA 4F64A 4W8DA 2J90A 4GFMA 4JOAA 3VW8A 2QHMA 3U55A 2B52A 5F20A 3VBQA 5HE1A 2QOQA 4EJNA 3ORIA 5IA2A 2UUEA 2W0JA 4JDKA 4BDFA 2WPAA 1MQ4A 4RX8A 1I44A 3FBVA 1ND4A 3ZH8A 3ZRMA 3OZ6A 4EONA 4QMLA 2XMYA 4AWIA 5AUVA 3HMMA 4OUCA 4F9WA 3EKNA 2Z7QA 4ACMA 3OHTA 1OIYA 1TQMA 1JSUA 2RFSA 3KK8A 3ANRA 3NAYA 2RFDA 3KMUA 2F7XE 3EQCA 4GUBA 4USDA 4CT1A 5A6OA 4CG8A 3PSBA 4MBLA 2CJMA 4ANLA 3PLSA 1CMKE 3COMA 3UOKA 4O2ZA 1YI6A 1ATPE 4OLIA 3OMVA 3UTOA 5M09A 3WE8A 1W8CA 1WVYA 5EQEA 4GYGA 2YM8A 4OTDA 1XBCA 2WMBA 3SD0A 5LXMA 4R78A 3R01A 5C01A 2VX0A 1QL6A 2XF0A 4DCEA 5CLPA 4HOKA 3SG9A 2FUMA 4AZSA 1SVHA 4F63A 1UU8A 1TVOA 3PY3A 4RT7A 5DGZA 3ZLXA 3MDYA 3IQ7A 2P4IA 3BELA 5H8GA 5BX0A 1ZYCA 4OBQA 3D14A 4ACHA 2PHKA 1DI9A 5B0XA 3EN6A 3PY0A 2ZJWA 5EW3A 4O82A 2BTSA 4W9XA 2YIWA 4IWDA 4QMVA 4XP2A 3ENMA 5E8XA 3ZUTA 4BGGA 1H0VA 3LFSA 3JY9A 2UVZA 2VTMA 4HZSA 4YJNA 4BTKA 3QTWA 1ERKA 3FKOA 3QUPA 4FA2A 4BI1A 2QONA 2RFNA 5CEKA 1ZYLA 3P9JA 2R3LA 3A8WA 3LCDA 1VZOA 5CI6A 1BI8A 4YLKA 5EK7A 3BWFA 3TL8A 1PRYA 5HIBA 2WMQA 2YIYA 3LOKA 2HY81 4FTMA 4NM0A 4OTFA 4UYAA 3FMKA 3MJ1A 2GCDA 3ET7A 3H4JA 2XK4A 1IEPA 4EEVA 5IA1A 3F2RA 2OF2A 3VC4A 4EKLA 5K5NA 5M07A 3CS9A 3UYTA 5JMSA 1V0OA 2IWIA 4HCTA 5D11A 3UZRA 1GZKA 5A4CA 3NIZA 3Q6WA 4QTDA 5J1VA 4QP1A 1J91A 4BICA 5AP5A 4W4YA 2GQSA 4D9UA 5EDQA 4AA0A 2X8DA 3DKOA 3LFEA 2UZWE 1MQBA 4M8TA 4PP9A 3QRUA 3DOGA 1OPLA 5AV2A 3RHXA 4KIKA 5LVPA 3BQCA 4F70A 3UNZA 2X4ZA 5FD2A 3FHIA 5K4JA 1H4LA 4FNZA 3ID6C 1XH5A 5EKOA 4H1MA 1ZYJA 4XCUA 1Y8GA 4MTAA 2FVDA 5F95A 3W8QA 4YBKA 4FKQA 4LL5A 2CLXA 4CRSA 5I9UA 4CMTA 3ZDUA 3NX8A 5FXSA 5ICPA 5LWMA 2QNJA 3GQIA 4WO5A 3TNQB 5T6KA 3VF8A 4B6LA 4BZOA 3GCVA 4Y46A 4I21A 4OBOA 3U4WA 4YJRA 2R7IA 4LL0A 4YNOA 4XMOA 4CNHA 2V55A 1T45A 4EH9A 5E8SA 1H8FA 4Q2AA 5LMKC 3T8OA 4C2WA 4EOKA 4EOQA 3RZFA 3QQFA 4RG0A 4DF3A 1UVRA 4TL0A 4O7LA 4FKVA 2YZAA 4L9IA 2Y7JA 3VBTA 3E64A 2ONLA 3BHHA 5CI7A 3A7JA 5IUGA 3K5UA 4I5HA 3PE2A 5KCVA 5KHWA 4O7SA 5BYLA 4YJOA 4QMMA 3L9NA 1KE9A 3R8ZA 3UIBA 4FTNA 5L8JA 3ZHPC 1OB3A 3MFUA 1WVWA 5F4NA 3RBWA 2B9HA 3E63A 4W4XA 3LMIA 1R3CA 3C0IA 2XK7A 4XBRA 5FP5A 3NNUA 3TTIA 4MQ2A 2Q83A 2PZRA 3T3UA 5E8TA 3R1YA 5IUIA 3VBWA 4LMUA 5CAVA 2YJRA 3OCSA 4E4LA 1PMEA 4AE9A 1U46A 2JDOA 3OCGA 4YTCA 3CGFA 3NCZA 2ERZE 4AFEA 4MBJA 3ENHA 3FPQA 3W55A 1ZMUA 2UVYA 2V0DA 3DBDA 3FUPA 1ZZ2A 3PTGA 3KXXA 4B4LA 3SOAA 4KSQA 3LAUA 2GSFA 3NSZA 3QQGA 2CSNA 5EW9A 5C9CA 4HJOA 5IMXA 4BCPA 4O0TA 4BHNA 3NVMB 3O8PA 4G3EA 4IB3A 4JAIA 2JLDA 2AUHA 4DTBA 1OBGA 2WMUA 4C38A 3F61A 4JRNA 4OTWA 1ZOHA 3SV0A 2QOHA 5EKNA 3HMOA 4JG7A 2OJIA 3A99A 4X6QC 3MTLA 3BYOA 4ANMA 3NUSA 5FGKA 3MVMA 3DXQA 2ZMCA 3FMLA 4XS2A 1OKVA 3KULB 2C69A 4KNBA 5A4EA 4J8NA 5EHOA 2C5YA 2PZPA 3HGKA 4J98A 3A62A 4RFZA 3HRBA 4AP7A 5I9WA 4CFUA 4PP7A 4BF2A 1A48A 1PXMA 2RF9A 4BCQA 3TXOA 4AT4A 3QZFA 2B4SB 4L3LA 2IW8A 1KE7A 3O7LB 3R1SA 4IAKA 1R1WA 3AC3A 3VRYA 3WF5A 4D4SA 5HE0A 3ACKA 2GPHA 3A61A 2UW6A 3NLBA 1K2PA 5AP2A 4IQ6A 2HWOA 3ODZX 4BDEA 4KIKB 4H3PA 5DPVA 1Q3DA 4ZS4A 1RDQE 3EN5A 2YDJA 3OVVA 5M55A 3LXPA 4FNWA 3WZEA 1PXNA 2J7TA 2YCSA 3FMMA 2G2HA 2Y8OA 3DXNA 1WCCA 4I22A 1S9IA 2XYUA 3ZLWA 5EHYA 3PVWA 4PPCA 3C51A 4J95A 2RGPA 2UV2A 3NNWA 4R7IA 3FI3A 3G2FA 3O23A 3KREA 1U5RA 5CS6A 3H3CA 1M7NA 2J5EA 3VVHA 5IA3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FV3 A;  4L45 A;  2JKM A;  3R73 A;  4YP8 A;  3VNT A;  4YHF A;  1Q8W A;  3F3Z A;  1MRV A;  3KF7 A;  4FIC A;  4M7I A;  4NH1 A;  4F1T A;  4GKH A;  4ZLZ A;  3TDV A;  2Y4P A;  4FTC A;  3F5U A;  3F69 A;  2X2K A;  5FRI A;  4QDE A;  4UWB A;  3KRL A;  4YTH A;  5BVK A;  3HMI A;  1IA9 A;  4KKE A;  4U43 A;  1FIN A;  4ERW A;  4LGG A;  3ULZ A;  3C1X A;  5H8B A;  3OW4 A;  3PPK A;  3BX5 A;  3KFA A;  3LCS A;  3MY0 A;  1OL1 A;  4W9W A;  4YJV A;  2BDW A;  4GJ3 A;  4NJ3 A;  3IG7 A;  2E9P A;  3GEN A;  5BVF A;  3WBL A;  2XIR A;  4JS8 A;  1Q41 A;  1IRK A;  2QOO A;  3TZ9 A;  3WF9 A;  4F1O A;  3E8D A;  1BL6 A;  3P79 A;  4C4E A;  4D4R A;  5CNN A;  2GHM A;  1WZY A;  4D2W A;  1XJD A;  3HL7 A;  3RPO A;  4E4M A;  3OUK A;  1GII A;  4YZB A;  2BTR A;  3CQU A;  4ZJV A;  2W1I A;  4AF3 A;  4EQU A;  3GFW A;  3PZE A;  2HWP A;  3CTJ A;  3FI8 A;  5JRS A;  5B2K A;  4G6L A;  4X21 A;  5KMJ A;  3U9C A;  4DA5 A;  1OI9 A;  4QP3 A;  5CSX A;  5JQ5 A;  3UIM A;  1S9J A;  3DBF A;  4GT5 A;  4BKZ A;  4E1Z A;  4F9A A;  3BHT A;  5AMN A;  3Q32 A; 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