4IPLA

The crystal structure of 6-phospho-beta-glucosidase bgla-2 from streptococcus pneumoniae
Total Genus 178
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
178
sequence length
469
structure length
460
Chain Sequence
TIFPDDFLWGGAVAANQVEGAYNEDGKGLSVQDVLPKGGLGEATENPTEDNLKLIGIDFYHKYKEDISLFSEMGFNVFRTSIAWSRIFPKGDEEEPNEAGLKYYDELFDELHAHGIEPLVTLSHYETPLYLARKYHGWVDRRMIHFYEKFARTVLERYKDKVKYWLTFNEVNSVLELPFTSGGIDIPKENLSKQELYQAIHHELVASSLVTKIAREINSEFKVGCMVLAMPAYPMTPNPKDVWATHEYENLNYLFSDVHVRGYYPNYAKRYFKENDINIEFAAEDAELLKNYTVDFLSFSYYMSVTQSALPTQYGLVNPYLESSEWGWQIDPIGLRIILNRYYDRYQIPLFIVENGLGAKDQLIKDELNNLTVQDDYRIQYMKEHLLQVAEALQDGVEIMGYTSWGCIDCVSMSTAQLSKRYGLIYVDRNDDGSGTLNRYKKMSFTWYKEVIESNGESLF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords 6-phospho-beta-glucosidase
publication title Structural insights into the substrate specificity of a 6-phospho-&[beta]-glucosidase BglA-2 from Streptococcus pneumoniae TIGR4
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 178
structure length 460
sequence length 469
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.86: 6-phospho-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2013-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4iplA00
4P7OA 4FLRA 4GQQA 4PMXA 2RGMA 5A8PA 3SIMA 3K1DA 3AHZA 1TE1A 5AC4A 4H04A 2YBUA 2YL8A 2JFEX 4QP0A 7A3HA 3GNPA 1L8NA 2OSWA 4OIFA 4H41A 4KH2A 1DWFM 2GFTA 2WZIA 3W4RA 2J7CA 1WPCA 1W1VA 3HMCA 2QPUA 2X2YA 4E4PA 5D9PA 4AEFA 1GJWA 3PZGA 3L4YA 3WQ6A 1QBAA 3THDA 1B2YA 3WDHA 3FN9A 1UWUA 1E15A 4IISA 1G0CA 3VPLA 4HOWA 4DUVA 1PZ3A 2ZX5A 2VUYA 4AISA 1QNRA 4CUCA 1UZ1A 3CHEA 5CJ5A 3VGEA 4L4OA 4MJ4A 2XJ7A 1OT2A 4W8AA 2DQXA 2DIEA 4MTVA 3ARRA 4W8BA 3A4WA 3BAYA 5A3HA 5AYBA 3GDBA 3T08A 1CLXA 2YA2A 3VNYA 3N13A 3OGSA 3VDBA 3WF3A 1JFXA 3BXWA 2DDXA 3VGGA 3VD7A 2VC9A 1RH9A 1KQYA 1I75A 1QW8A 2ESCA 1H41A 2DH2A 2MANA 2J7HA 3LMYA 1JG9A 4JHOA 5M03A 1ISWA 2W67A 4HA1A 2YJQA 1U33A 1KGUA 4V2XA 4AD0A 1WZKA 3ARWA 4MJ2A 5E9AA 4F79A 1GW1A 2BFGA 5D9OA 5I6SA 3VNZA 5FL1A 1WZMA 1OIFA 2CYGA 2V3FA 1ECEA 3DHPA 2WPGA 2J7FA 4WSJA 5A2AA 1QNPA 1JZ8A 4MAVA 1LL4A 5A69A 1UH4A 2YIHA 5HXMA 4M56A 4QLKA 2D3NA 3WN6A 1U2YA 4M80A 2WHJA 3FHQA 1EO5A 2YDSA 5D9MA 1FH8A 1WE5A 6TAAA 1CIUA 5D8ZA 5DF0A 2FGZA 5JBDA 2ZUWA 1A47A 3BLPX 4CD7A 1GVYA 2GJPA 4DM1A 4AEEA 5EFDA 1UKSA 2D0FA 2ZXQA 3G6MA 1B30A 1OIMA 4P8VA 2XUCA 4Z2KA 4XZBA 1JF5A 4GKLA 1W3KA 5JBEA 3EMCA 1B31A 1W1TA 3WQ4A 2JEQA 3CUJA 4FLOA 4JIEA 5A6SA 1E6QM 4WIWA 4EAMA 3PZOA 3L4XA 4QAWA 1KGWA 3WEOA 3WFLA 1GOQA 3EDKA 1XSJA 1KR1A 1D2KA 1NOFA 2YA0A 1OWQA 1CZ1A 3L4VA 4TVUA 5A8QA 1E1FA 3WSUA 5BRPA 1QI3A 4ZEPA 4AZCB 3ARQA 1V6XA 3GZAA 1GJUA 3W28A 4W7WA 1QNSA 1PZ2A 1G1YA 3AS0A 3WQ5A 4BQ2A 2QHAA 2J77A 2W66A 2FH8A 1B0IA 5DO8A 2J7GA 5EBAA 2WMIB 3WY1A 1GQJA 1LG1A 3CLWA 2C0HA 1E6NA 2WAGA 4LXFA 2BS9A 2XSAA 4FK9A 1UKQA 3ALGA 1PX3A 2FH6A 1FH7A 3W82A 3CBWA 4OKDA 1OSEA 1TA3A 3CZ8A 3MUY1 5ABHA 3MS8A 1NQ6A 3FXYA 1S46A 3AIBA 4LYQA 2E8YA 2WSPA 3PTMA 4ATDA 2JIWA 3CGTA 1C8QA 1M04A 2VZOA 4D1IA 1NM9A 1QNQA 2XSBA 2BXYA 1US2A 3PBGA 1PX4A 2VZUA 4UFKA 5AC5A 1P6WA 3QHMA 3LPPA 4YPJA 3N12A 3VD9A 1W32A 2X09A 4U2YA 1EDTA 5CGMA 2VVNA 4IPLA 3ZMRA 2WWCA 1HVQA 3HU7A 2J79A 3AMCA 2Y24A 3ARZA 3EMQA 1E40A 4E2OA 5BWFA 2ZUMA 3W0KA 4UQDA 3KL0A 4HMDA 4RE2A 3W6MA 4JFUA 2GUYA 1UA3A 1J01A 3OLEA 4UR9A 3CO4A 5CQ1A 2VNCA 1CWYA 2WM0A 3KE0A 2V3EA 1BTCA 1J11A 2OSYA 5DFAA 2WMHA 5D4YA 3GM8A 3WL0A 3GNOA 3A6OA 2J75A 1V03A 3SCUA 1WO2A 1BYCA 4KGJA 1MQPA 2DSZA 3KL3A 4LYPA 1JZ6A 1XD0A 4N0RA 4B15A 2OWCA 1XHGA 4R5EA 2EPMX 3WH6A 5A95A 4PCSA 2O9PA 3DYMA 2W5FA 1H0IA 1W3LA 2WC7A 2VX5A 2VL4A 1ITXA 1J9YA 1GUVA 4PYSA 1XH2A 2NW0A 1IT0A 1QBBA 1DWGM 3OA5A 3EYPA 3PZTA 4URIA 3MSGA 4OUEA 3VILA 3E1F1 5CLWA 4UOQA 2EQDA 3W25A 1PX8A 3WD1A 2CXGA 2YL5A 3K8MA 3A4AA 5CPSA 4A4AA 3GH7A 3AJ7A 4JKKA 3UESA 3MMWA 4CD6A 1VAHA 3RJYA 3NSMA 3TTQA 3JUGA 1GPFA 3II1A 1J0YA 1J18A 1NP2A 1BHGA 5LA2A 1GQIA 4JKMA 2D22A 2PBOA 2UY5A 4FLQA 5A8OA 3ZR6A 5IFTA 4W89A 3SUUA 1E6XM 3WD3A 1C7TA 1B3VA 5M5DA 3WQ8A 3T2PA 4FF5A 2VCCA 1FH9A 1XRVA 4IUGA 2WMIA 3WQVA 2WBKA 4BA0A 1HF6A 2E9MA 2V3DA 3CHFA 3BSHA 1MXGA 4S3JA 2J74A 4PSPA 1HP5A 1HVXA 4CD4A 2V3GA 3M46A 3VIPA 3KZSA 1JL8A 2WYSA 1H3GA 1XCXA 3RJXA 4QLLA 2CEQA 2ZX9A 2CIPA 1CLVA 5I24A 4P8XA 5I3DA 3ZQ9A 4LPCA 3WF1A 2XHYA 3OB8A 5CXPA 3O9NA 4AY1A 2XVPA 1UD5A 5BRQA 3CMGA 5FKYA 1KQZA 1ISXA 3B9AA 2DH3A 4LQ1A 1TG7A 3AIUA 1WAWA 5GNZA 3SUSA 2ZICA 1EOKA 4RL3A 3BSGA 1MXDA 1LWJA 4B9ZA 3BMWA 4EK7A 2EPNA 1ZS2A 3W81A 1L0PA 3BAWA 1VEPA 4CCEA 7CGTA 1FHDA 1W9PA 2E9LA 1DEDA 4PN2A 2E4TA 3ALFA 5EB8A 3WEMA 8CGTA 1GNXA 2E3ZA 3AQUA 3SCRA 2QV4A 5KEZA 1GOOA 1UR2A 3UR7A 3EDFA 1XGZA 2XTKA 2A3BA 3W53A 4GZJA 5DT5A 1JYWA 1MW2A 1K9EA 4QCFA 3U57A 5FCZA 3PZ9A 4IPNB 3AISA 3DC0A 3K4AA 1E5JA 2VZVA 3POHA 2O9TA 5HBFA 1WP6A 1MQRA 3VIFA 3AS2A 5I0DA 4HA4A 1H0GA 2YDQA 4HTYA 2GSJA 1QI2A 3DYOA 3SUTA 1W3JA 3EBVA 2BHZA 4UFHA 5I79A 4GO8A 1CXEA 1JFHA 4TX6A 3WF4A 1WCGA 1XYFA 2YBTA 1HT6A 2ZUVA 5E0FA 4NF7A 4HA3A 3GH4A 3CMJA 2FHCA 3G6LA 3OZOA 2J78A 2WXDM 2GJXB 4M82A 4ZXOA 1JYNA 2VURA 1MW1A 3A47A 5CGTA 3WF2A 2CHNA 3PTKA 1OBAA 2BY2A 3SCVA 1E6PA 1VF8A 4UOJA 2YA1A 4P7NA 1EHAA 4JCLA 3THCA 3AXHA 3GBDA 1X1NA 2DSKA 1E5NA 4UQBA 4MPKA 4GI9A 1U30A 3WDIA 3VX0A 1TVPA 4OOUA 2AOSA 3T0BA 1K9FA 5HOSA 4PMRA 3WKZA 4BF7A 2WC4A 3GBEA 1TUXA 5IDIA 1J10A 1XSKA 2Y2WA 2ZIDA 1GCYA 3T09A 1W3HA 1HNYA 1VB9A 2WCAA 2CERA 4UTFA 1WKYA 4X0NA 2ZXAA 3FAWA 1GHSA 2WSKA 1K9DA 2VRKA 5JBFA 4HOZA 1BYAA 1OCQA 2GK1A 3NYDA 3WELA 4B3KA 3CUIA 5I78A 4UFLA 5GPRA 4TX8A 4D6CA 3ARSA 3WDRA 4PSRA 1W91A 4AD3A 1KGXA 1BVZA 1TA3B 2G4FA 2WHKA 5E6YA 2BXZA 1CNVA 1JI2A 1H2JA 1H49A 2G3IA 1Z32X 5KZ6A 1WZLA 2AMGA 1ISVA 2PWFA 2D1ZA 5CSUA 4F8XA 1NP0A 4IM4A 1EXPA 2ZX8A 1QW9A 1UR0A 4M29A 3WQWA 3FNDA 1HJVA 3SCSA 5DEZA 1HP4A 5BXRA 3WNLA 4PMDA 2XFFA 4B3LA 3EDDA 4PMNA 1BYBA 1RPKA 2JEPA 1TZ7A 4OOZA 2E40A 2WHLA 1HJQA 2UY3A 3GXFA 3RO8A 1CGTA 1JF6A 1C7SA 4GPNA 5F7UA 1E0VA 2QLYA 1RP9A 1K9TA 3BLKA 3OG2A 5A6BD 4AXNA 5D9NA 2VRQA 3PZUA 2PI6A 2Z1SA 1DWJM 1EHNA 4V28A 4RE3A 3VGDA 4Z2IA 1JZ2A 1UWRA 3CUFA 4W85A 2WKGA 3VD3A 4W87A 3RM9A 1RD6A 3UG4A 2J25A 5HPCA 2PWEA 3IANA 4MNKA 2J8GA 1V6WA 7TAAA 2WMKA 3GTNA 1ZBKA 2YL6A 9CGTA 2FGLA 2WLYA 4UQCA 4N42A 1VBUA 2FDMA 2PWGA 4J3WA 5BCAA 3NUKA 3CH9A 3CHCA 1SYTA 4W7UA 3W38A 3BAXA 4NRSA 3HN3A 1ODZA 3AS1A 4X9YA 3ARXA 3TP4A 4GI8A 4AZ6A 1CECA 5E0CA 3VMNA 3PN8A 4WKFA 2DSVA 3BMVA 3K46A 4D1JA 2GJXA 2VX7A 4C7FA 1VBRA 1Y7VA 1XC6A 3AROA 4W5ZA 5CLTA 1M01A 1HL9A 2ZOXA 3MSDA 1UWTA 1EDQA 1E72M 3OGRA 6CGTA 4MADA 2CKSA 1W9BM 3L4TA 3L4ZA 4BQ5A 1C3FA 5M3WA 2JE8A 1ESWA 4H8VA 3K8KA 2XVLA 4H8HA 3AHYA 4AD5A 3EDJA 1ZBVA 4M8UA 3S2CA 4Z2LA 4XUYA 2X0HA 3M6DA 4MNLA 3ZR5A 4D71A 3T0AA 2WMFA 1GQKA 1KWKA 1VJZA 3SEPA 2BVTA 5CPQA 3B9DA 1DWIM 4RE4A 1DWAM 4QLJA 3QHOA 5JIWA 1KCKA 2WVUA 2O9RA 1E1EA 3WMBA 1UKOA 1GZJA 1I1XA 4H8UA 2E9BA 1EGZA 3W37A 4P8UA 1E43A 2GDUA 4CCDA 2VR4A 2WVTA 4AIUA 1MYRA 5E09A 4ACZA 4MB1A 5DMYA 2JALA 3F5JA 1XCWA 3VIKA 3U5UA 1NH6A 3BC9A 2VX4A 1QHZA 1ZJBA 2YDRA 2J7BA 5CG0A 1BG4A 1R7OA 1V3MA 1X6LA 2W91A 2EO7A 3J7HA 1UKPA 3WH7A 3L2MA 1HXJA 1KFWA 3LPGA 1CGXA 1CXKA 4HOXA 3IJ7A 5IHRA 2ZX7A 3W26A 3VO0A 2HISA 1JGIA 4KRUA 2G3JA 3AHTA 3VD4A 1IZJA 4WJXA 4JCMA 1BYDA 1WDQA 3ZJ7A 3N17A 5I5RA 3UR8A 2VI0A 4UQ9A 1Q4NX 3MV01 1V02E 2G8ZA 3ARUA 1C90A 2WW5A 4EE9A 2D0GA 3GNRA 1IV8A 1EA9C 4OZOA 1W9UA 2ZUTA 4Q22A 3BCDA 4MDOA 4P8WA 3N15A 3GYCA 3W6LA 1J0KA 1AVAA 1VIWA 2WZEA 2DSUA 4W5UA 2DIJA 1JDAA 5BXTA 4WK9A 3UG3A 4PMVA 5HDRA 3N1AA 5A2BA 1XYZA 1KWGA 2VTFA 3M7SA 1TR1A 1E9LA 1UOKA 4U2ZA 3RM4A 2WMJA 1LJYA 3BGAA 4CGTA 1G9HA 2W61A 3N18A 2UY2A 2VZTA 2RGLA 3NSXA 2E0PA 3BAIA 1DTUA 5LYRA 1VRXA 1NWSA 3OBAA 1WDSA 3WDQA 1E4IA 3WD4A 3WMCA 4TOQA 4JL1A 4AIOA 1JZ3A 3MMUA 1LL7A 4J3XA 3RDKA 4D6IA 1V0MA 3IAQA 1JZ4A 3PZMA 4W7VA 3AICA 1FOBA 4CVWA 5EFFA 3TTSA 1HKKA 1E4NA 3T0DA 1O7AA 4OBRA 2J47A 2CHOA 4AD1A 3DECA 5A1AA 4OBSA 1QI0A 1NOWA 2W92A 4WKAA 2CBVA 1TMQA 2AAAA 4MAZA 1JDCA 3WFZA 4NSBA 3ZT7A 2XWDA 4UCFA 2DT0A 3T2OA 3APGA 4A3HA 1HJSA 1Q6DA 4TXEA 5ABGA 3NSNA 4PUEA 1W2VA 1E0XA 4CN1A 1R7AA 3OLIA 3WD2A 4HPHA 2XWEA 4L4PA 4AD4A 2OWWA 4HMCA 2A3HA 1JYVA 2CBJA 3ARPA 1BVNP 1XSIA 1OB0A 1QI4A 2WHMA 2A3CA 4TVCA 1V0NA 1UQYA 4WF7A 8A3HA 3W24A 3WH5A 2GK1B 2PB1A 3CZKA 1G01A 1SFSA 1EH9A 3ZJKA 1VEMA 1UR9A 3GXIA 4J3SA 3VGBA 3ZT5A 3VIGA 3WNOA 2CETA 3AYSA 2YOCA 4HZ7A 2EJ1A 3B9EA 1CDGA 4PTWA 1J0IA 1BPLB 3WD0A 2DSWA 4HP5A 4JFSA 3SCPA 1XH0A 1UZ4A 1B3ZA 4AZ7A 4J28A 1UWQA 3VGFA 3I3EA 1AMYA 1KCLA 3VIHA 2VQTA 3WBAA 3D5HA 3PZIA 2VOTA 1CGVA 1LL6A 5A6MA 4D6FA 3DHUA 1CYGA 2V5CA 3WDJA 3MU7A 3AMLA 1F4AA 2EXOA 1CGYA 3T2QA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4P7O A;  4FLR A;  4GQQ A;  4PMX A;  2RGM A;  5A8P A;  3SIM A;  3K1D A;  3AHZ A;  1TE1 A;  5AC4 A;  4H04 A;  2YBU A;  2YL8 A;  2JFE X;  4QP0 A;  7A3H A;  3GNP A;  1L8N A;  2OSW A;  4OIF A;  4H41 A;  4KH2 A;  1DWF M;  2GFT A;  2WZI A;  3W4R A;  2J7C A;  1WPC A;  1W1V A;  3HMC A;  2QPU A;  2X2Y A;  4E4P A;  5D9P A;  4AEF A;  1GJW A;  3PZG A;  3L4Y A;  3WQ6 A;  1QBA A;  3THD A;  1B2Y A;  3WDH A;  3FN9 A;  1UWU A;  1E15 A;  4IIS A;  1G0C A;  3VPL A;  4HOW A;  4DUV A;  1PZ3 A;  2ZX5 A;  2VUY A;  4AIS A;  1QNR A;  4CUC A;  1UZ1 A;  3CHE A;  5CJ5 A;  3VGE A;  4L4O A;  4MJ4 A;  2XJ7 A;  1OT2 A;  4W8A A;  2DQX A;  2DIE A;  4MTV A;  3ARR A;  4W8B A;  3A4W A;  3BAY A;  5A3H A;  5AYB A;  3GDB A;  3T08 A;  1CLX A;  2YA2 A;  3VNY A;  3N13 A;  3OGS A;  3VDB A;  3WF3 A;  1JFX A;  3BXW A;  2DDX A;  3VGG A;  3VD7 A;  2VC9 A;  1RH9 A;  1KQY A;  1I75 A;  1QW8 A;  2ESC A;  1H41 A;  2DH2 A;  2MAN A;  2J7H A;  3LMY A;  1JG9 A;  4JHO A;  5M03 A;  1ISW A;  2W67 A;  4HA1 A;  2YJQ A;  1U33 A;  1KGU A;  4V2X A;  4AD0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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