4IQLA

Crystal structure of porphyromonas gingivalis enoyl-acp reductase ii (fabk) with cofactors nadph and fmn
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
313
structure length
312
Chain Sequence
MNRICELLGIEHPIISGGMVWCSGWKLASAVSNGGLGLIGAGSMHPDNLEHHIRSCKAATDKPFGVNVPLLYPEMDKIMEIIMREHVPVVVTSAGSPKVWTAKLKAAGSKVIHVVSSATFARKSEAAGVDAIVAEGFEAGGHNGREETTTLCLIPEVVDAVNIPVVAAGGIASGRAVAAALALGADAVQVGTRFALSEESSAHEDFKAHCRRSVEGDTMLSLKAVSPTRLLKNKFYQDVFAAEQRGASVEELRELLGRGRAKQGIFEGDLHEGELEIGQAVSQISHAETVAEIMVDLVDGYKRSLAGMPTEI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Enoyl-(Acyl-carrier-protein) reductase II
publication title Structural characterization of Porphyromonas gingivalis enoyl-ACP reductase II (FabK).
pubmed doi rcsb
source organism Porphyromonas gingivalis
total genus 110
structure length 312
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.1.9: Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH).
pdb deposition date 2013-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03060 NMO Nitronate monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4iqlA00
1Q45A 1QPQA 3H54A 2CFFA 3O8AA 3W1LA 1QCWA 1SQ7A 3UXAA 3FS2A 2FJKA 3P81A 5F4SA 3P60A 4UFLA 3B03A 3RLUA 3VNDA 2W0UA 3GKFA 4DO6A 3F4NA 3BARA 3UPWA 3BGJA 1I4NA 3G1VA 1XL9A 1V5XA 3UY8A 4PCFA 2EPHA 4GUGA 5DCEA 1LP6A 1EPXA 5A5WA 5CZSA 3W1UA 1W5MA 1XKYA 3QPYA 3KOFA 3LHVA 3W2LA 1X8FA 1D3HA 1IIHA 3OHIA 1SR9A 2Q8ZA 1L2UA 4QSHA 5D2VA 3ZS4A 2BX7A 1GYNA 3GZ3A 3KFTA 5D33A 3LHTA 4I7WA 4JEQA 3M5VA 3HG2A 3N19B 3W74A 4GUIA 1HO4A 4TO8A 1EA0A 4RXFA 2YFNA 1KV5A 1KM5A 1P5BA 4FXRA 3R12A 3NZRA 2Y7FA 3M5XA 5F4XA 3S5NA 4UTTA 2WKJA 1LLWA 4N4QA 3P5ZA 3CB8A 3OG3A 4Z08A 4WZHA 1S5VA 1ZY9A 4LS2A 4LOCA 4RXGA 3IVSA 3TX9A 1DHPA 4I9AA 3NQGA 3R8RA 2VFHA 4UR7A 4IQLA 1KM4A 3PR2A 1O60A 1THFD 1QOPA 2FIQA 5HUPA 4QAIA 3PG8A 2D73A 3O06A 5LKYA 1W5QA 5LNRA 4EF9A 3CM4A 1LRQA 2GQ8A 5DXYA 1B4KA 1W54A 4QJ1A 5ABTA 1KLZA 4ZQOA 3W86A 4RLIA 4O17A 3HPZA 3PULA 1WYIA 4YWIA 3FJLA 3GIYA 1KM0A 1TJRA 3W23A 4JTEA 4BI6A 1K8YA 1ZCOA 3DHFA 3K30A 3S1UA 2JGYA 2QCHA 4MY8A 4HHPA 5E0KA 3SI9A 5IBXA 5KTLA 3LHZA 3L0NA 4CQ8A 5DY2A 5CPOA 1GVSA 2VFDA 1W3TA 1AW1A 4HSNA 1UB3A 1W37A 4AAJA 3UWQA 1OYBA 3WK3A 2ZZ7A 4IX0A 2Y62A 1T96A 4JYFA 1CX9A 5HR7A 5F2IA 1R2RA 1LRNA 3NQDA 3G0UA 5I3IA 3EXSA 3GVGA 1YDOA 2KZHA 2E5CA 2ZTKA 1G4PA 2Y7EA 1AMKA 1KFBA 1RQHA 5K9CA 2CLFA 2E1DA 2OT1A 4ADTA 2DJLA 1TMHA 3G24A 3NL6A 3DHDA 1OF8A 2VEMA 4RZ5A 4LS0A 3W2MA 1XC4A 4M6QA 1PVNA 1KLYA 1KTCA 5E1QA 3HJZA 4EF8A 4IPJA 2QDGA 4NXKA 2QKFA 2E6DA 4IMFA 2CWNA 2GQ9A 3G3DA 1F74A 5EKYA 5D37A 3L67A 3ANYA 3GYEA 4IGHA 4UTLA 3GDMA 2ALDA 4LC8A 3OBKA 1H1ZA 2CLOA 2G95A 3W2JA 1VLIA 1AL8A 2FTPA 2EAWA 2H8ZA 4Z1AA 1PHQA 2Y85A 3A5FA 1FXPA 4JDBA 4AWUA 4JY8A 4Y90A 3VE7A 2ZRZA 2BZNA 1UUOA 1FUYA 1B57A 4LVDA 1ZAHA 1FX6A 1I45A 3FJ6A 4QIUA 2E09A 3P84A 5AHFA 4LT9A 3RNDA 2BSLA 2CU0A 1O95A 3MI2A 3PY2A 2QAPA 2DZPA 2CZDA 4O13A 1RPXA 4C1LA 3M47A 3M1ZA 2A21A 3STGA 1PS9A 3HGRA 3NOEA 2E6FA 2YW4A 3C8FA 3L5MA 3NQ7A 5AC8A 1XBYA 3W1AA 2TMDA 2TRSA 3LB0A 1J2WA 1H60A 5HMSA 3W7LA 3GXPA 2WOQA 1I2PA 2DP3A 3NL5A 5TBOA 3QM3A 4UTWA 5HNRA 5AC7A 5J5DA 1Y0EA 1W3NA 3BW2A 1JUBA 3GXTA 4HNNA 3LX9A 4MY9A 4WJEA 1SZNA 2C13A 4RR4A 4MOZA 3L0KA 4DO4A 4PL2A 5KZMA 1SW0A 4DF1A 4JTLA 2B0MA 3GX9A 4HT3A 2IQTA 1G4EA 1W1ZA 4GNJA 3G1XA 1MEIA 1JCLA 3B05A 2J9XA 1O5XA 2NXHA 2H3BA 4OV4A 1W3IA 3GLCA 3L66A 4Y8FA 3WK1A 3W2NA 3W22A 5DN1A 4JTTA 3CLMA 4JTFA 4MZ8A 2JGQA 2HTMA 4OBTA 1OFPA 2QCGA 5DBTA 4O15A 4K8EA 1A5SA 1OVDA 3QMTA 3VFLA 5K9XA 4K38A 3VCRA 3M16A 2VFFA 4O1CA 3S8HA 4Z0JA 3PBYA 1VRDA 2H8XA 3W7QA 3FKRA 4FF7A 5I3FA 1RV8A 4GRSA 4NT0A 1RR2A 2OZ0A 4E38A 5D38A 1C29A 2XN1A 3LCFA 3EWBX 4N9BA 4WUIA 3TH6A 2R14A 2VFGA 3N34A 5FEXA 5K9DA 1L6YA 3SGUA 4RZ4A 4BR1A 3E0IA 1BWKA 4JDYA 3TA6A 3LTYA 3C56A 3G18A 4XWUA 2ZDRA 2H6RA 1I2NA 4GWEA 1EUAA 4L4MA 1MSSA 2C16A 2YDAA 4H3DA 2ZCGA 5EMUA 3W6YA 4NX0A 1XCFA 1GT8A 1OFRA 3LLFA 1KM1A 1H7WA 4N9DA 4IMDA 1UCWA 1LTDA 3TDFA 3O16A 1NF7A 1KBIA 4WY0F 1H50A 1BKSA 5LSMA 2QCNA 2HS6A 3WJWA 5AYXA 1EWEA 5D2TA 3ABSA 2GUUA 1DQWA 5F1VA 3U8GA 3HGSA 1ME8A 1OABA 3NDOA 1X1ZA 3OVRA 3PUOA 4K39A 5BMXA 1YTEA 2QCCA 3HQ1A 4UFMA 4MUZA 1JCNA 3VI2A 1T8XA 3W76A 3Q37A 4OE7A 4DBEA 2NXGA 4X2RA 3EX1A 4R53A 4BFAA 4LVFA 2FPVA 1RQBA 4DPPA 3CTLA 2A6NA 1LROA 3CIXA 3TQKA 1A50A 3HGOA 4NQ1A 4C1KA 3C3NA 1KM3A 4ZL1A 3NQFA 3JS3A 2CLMA 4Y6GA 1UJPA 1GVOA 1JRCA 3PM6A 1DORA 3NO5A 1EP2A 5G1YA 2FB3A 4YCOA 1KW1A 1K03A 1N7KA 2PRMA 4FIQA 4PC8A 5AOUA 3WJSA 3ZWTA 3UXDA 3HG5A 2YSWA 3CHVA 4O19A 3NQ6A 3NL2A 3TU9A 3SGZA 3L65A 5FF7A 3MO7A 1NFBA 3PB2A 1W56A 1TSIA 3MHGA 3TQ0A 4QISA 4JXCA 1R30A 4JN6A 4YMZA 5EYWA 4UCGA 3W7MA 1EIXA 3W75A 1TRDA 3UQNA 3G1FA 1MEHA 2W6RA 3PBUA 5E93A 4JGDA 5LNVA 4M19A 2Y61A 3W1RA 1EUNA 1M7OA 4NZJA 4JTJA 2OX1A 2V9DA 1J5TA 3SW6A 4A29A 1Q3NA 1VYSX 3QSRA 3MHUA 1UBSA 1M5WA 4FNPA 3G1DA 3TSDA 2R8WA 3PB0A 3BVJA 1TPFA 4DXVA 3ZR4A 1CI1A 2DZWA 5C6MA 1H5YA 4M7SA 3HOJA 4JS3A 1TV7A 3HF3A 1P4CA 1K8XA 3W07A 1DOSA 1FY6A 5HJLA 3C61A 3W84A 4YXGA 1QO2A 5D02A 2Z2UA 3KHJA 3S9YA 2GJLA 2X16A 3FFSA 3NEVA 3LLDA 4JY9A 3A23A 3DI1A 1YADA 5G2IA 1B3OA 1WQ5A 4MJMA 2A85A 4K7VA 1B4EA 3EEGA 1F73A 3TSBA 2QUUA 1ZAIA 3FOKA 4LUIA 2GVGA 3LHUA 3W7CA 1G7UA 3W9ZA 1V7YA 3HBLA 4K7YA 3TJXA 2FFCA 4MZ1A 2J88A 2XN2A 4AF0B 1Q6LA 4FNSA 4AEOA 4NJJA 1W5PA 3O05A 2QCLA 5AN7A 1M6JA 1AG1O 1KFCA 2C1HA 3SJ3A 4ICNA 5D30A 4LV9A 4FNUA 2C18A 3W3OA 1VHCA 4GXMA 3LHYA 2YCEA 1HL2A 3NM3A 3LV5A 4AHOA 4DF2A 3ATZA 2ZTJA 3EXTA 3PF3A 4HNVA 1L9WA 2E68A 4KKXA 1C8VA 3UD6A 3TFXA 2A1YA 1MXSA 1CW2A 4MPQA 3W1PA 3ABOA 4OV9A 4LS1A 1ME9A 2JBMA 4JTHA 4OU1A 4KFPA 1DVJA 1KFEA 4XUGA 3MWAA 4MIMA 3QC3A 5L9FA 3SIZA 1Q6RA 4X9SA 5CZJA 8TIMA 3TUUA 2J27A 4E2DA 3JR2A 3NG3A 2GVLA 4MLJA 3LCXA 4HNTA 2RDTA 2NX9A 4DF0A 5AFDA 5KSWA 1N8FA 1KA9F 1JCJA 3PWAA 2CLLA 1PCKA 4JIPA 5T26A 1L6WA 3LDVA 4LNYA 3W7GA 5G1TA 3R13A 1F2JA 1GVFA 2C14A 3G3MA 4FNRA 3NQVA 4QQ3A 2VEKA 3MMTA 2J24A 3WFAA 3WJZA 3A9IA 5LNWA 3M5ZA 3LXBA 5HQEA 4K6AA 3MP5A 4RV8A 1XBVA 5GVJA 3S1XA 1K7EA 3L68A 3LBCA 1KFJA 1ZALA 2X2GA 4CCEA 3DENA 1WXJA 4XTIA 3C2EA 3EKLA 5LHEA 5HWMA 2WQPA 2F7FA 4TR9A 4UXDA 1TTQA 3BLEA 4XZ9A 1OFQA 2DZSA 1QMLA 1H7NA 5SWUA 1FWNA 3LXCA 1FCBA 2DZXA 2WNQA 4DBDA 4LRTA 1Z44A 5KINA 2AQWA 1FDJA 3MP3A 4W9TA 1OF6A 2JKAA 4QITA 3KXQA 5D09A 2B7QA 2V30A 3VE9A 3MW7A 3A5VA 1TQXA 4H6KA 5AHNA 2AGKA 3ABQA 3HG4A 3BG3A 4GUJA 3GK0A 4OT7A 2YZRA 2E6AA 5I3GA 1TTIA 4IPIA 4WY0B 4ML9A 3NVTA 3P80A 3EX6A 2Y7GA 2ZA1A 1JJKA 2TSYA 1TIMA 7TIMA 2G96A 3MBFA 4S1FA 4S2CA 2WNNA 3PUDA 3R2GA 4O1BA 4KFNA 3PSWA 4NNAA 3GDKA 1LBMA 4LUJA 3W7DA 1GOXA 1OK6A 1OFBA 3UPBA 4OQVA 1MO0A 1G6CA 4CCCA 1JR1A 1GPWA 1DJNA 1RZMA 1JVNA 4J9JA 2C3ZA 2QCEA 2QJIA 4GC4A 2VFIA 1OFOA 4WY0A 2YYTA 4NU7A 3CEUA 3B8DA 3TSMA 2YFOA 2A7NA 5D04C 3CWOX 1JCMP 5G2HA 3P61A 3JRKA 2DZUA 3T55A 4ADSA 5G5IA 4ORMA 1QPOA 4JIQA 3MBDA 3C2VA 1YXCA 1DL3A 1Z42A 4NXSA 1R46A 3LCWA 1TPH1 5CKSA 4UUIA 1PHWA 1BTMA 1HTIA 3H53A 4L4LA 2C0AA 4TX9A 1LRTA 4PFMA 4PH6A 3TAKA 4AHPA 1EB3A 2ZA3A 1I2QA 4N6EA 2ISVA 3W7IA 5C5YA 1H62A 1OYCA 2WSYA 2A5HA 3IV3A 3RU6A 5DY3A 2RDUA 3CIWA 5CGQA 4DPQA 3B4UA 3UWUA 3TKFA 1S3HA 4O10A 3HMJG 1A53A 1ADOA 1GEQA 3QSTA 2C6QA 1ME7A 4JYEA 5BRBA 5D2XA 2A7RA 4G1KA 4P2VA 5EBUA 1K7FA 4RX0A 1M7PA 3ATYA 4Y9AA 3T7VA 3DFPA 3W7EA 5IM51 3SSJA 2Q8LA 1AL7A 2JK2A 3KRSA 3L21A 1FWSA 3DXIA 2O7QA 3S5OA 2V81A 4XQ6A 3MI6A 5DLCA 1IXPA 1RVGA 4BI7A 4EOUA 1GJPA 1FCVA 3PG9A 4O57A 1X1OA 3TCEA 5AHIA 3UWZA 4WOQA 3DFQA 1XUZA 1VH7A 3LRLA 3TIMA 2YW3A 1W0MA 4MY1A 4Z1BA 4NJHA 4UNLA 5HWJA 3W1MA 2NLIA 1WAUA 1RD5A 2V0TA 3DI0A 3STEA 1A5AA 3NAVA 2A4AA 4XBKA 5DBUA 1LDCA 2QAFA 3AJXA 4YCPA 2V82A 3KVMA 3MHFA 2C15A 3DFOA 3S5ZA 3A21A 1TV5A 1ZHAA 3BLIA 4NJIA 2WJZA 1QPRA 4Y96A 3DAQA 5FEPA 1HFBA 1LOLA 1LORA 1OX4B 4IUOA 4U4MA 1QWGA 5C2XA 3MYPA 3OA3A 3M5YA 3BG9A 3DFNA 1DJQA 1WBJA 4A21A 2O7SA 4O4VA 2FPYA 4CCDA 4ZQRA 1IXOA 2VENA 3P67A 3GDTA 4GBUA 1G4SA 1IXNA 2CZFA 2B7OA 4JTKA 4IJBA 4N9CA 2Y88A 4DEFA 1IIGA 1OFAA 4JTUA 3N3MA 1PE1A 1P0NA 1PCWA 3DKJA 4FNTA 5F2GA 2AAMA 2WSRA 3LRMA 1OX4A 2OCZA 4ZQMA 3G1AA 1C9DA 1TPWA 4GUHA 3NYZA 3PC0A 3EWUA 2FDSA 1F5ZA 5LZLA 2ABAA 3UZJA 3F1QA 2FQIA 3GB6A 3IIVA 3UWWA 2ZRUA 1O4UA 1GVRA 3QH2A 4A2SA 3IIOA 5BW6A 1TRIA 3Q58A 4JR5A 4ZMGA 1H1YA 3HGJA 3QPZA 3W2UA 4IMCA 4HKPA 3BPWA 4X22A 1YTKA 4BK9A 3C2FA 2E5BA 1W8SA 3RLVA 3W1XA 3TC6A 3LERA 2RDWA 3TMQA 1PV8A 3LHWA 5C55A 2A7PA 4O0KA 1OFEA 2RKXA 3TQVA 3IVUA 1FQ0A 1LCOA 2ZZ2A 2YR1A 1R47A 3HB9A 3A22A 4ORIA 2H3DA 5F2MA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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