4ISFA

Human glucokinase in complex with novel activator (2s)-3-cyclohexyl-2-(6-fluoro-2,4-dioxo-1,4-dihydroquinazolin-3(2h)-yl)-n-(1,3-thiazol-2-yl)propanamide
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
457
structure length
428
Chain Sequence
KPMPLTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKACMLGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase activator
molecule keywords Glucokinase
publication title Design, synthesis and SAR of novel glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 159
structure length 428
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4isfA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4isfA01
1NLVA 2CGLA 4M7XA 4A2BA 5KPTA 2Q0UA 1QQNA 3D2FA 5AZJB 4A62A 3HSCA 3U4LA 5AQLA 3QFUA 4Y0WA 3O08A 4FSVA 2E2NA 4CZFA 3ZX3A 4BRNA 1C0FA 4B1YB 3UKRB 5AQWA 3CHWA 3M6GA 3I33A 4PL8A 3U9DA 5EOYA 1HX1A 3CETA 3VEYA 4BR9A 3IMXA 3LM2A 4O8KA 4O5FA 1G99A 3LDLA 3RSEB 3FZLA 3ULEB 5AQVA 3FGUA 3A5MC 4BR7A 4FOEA 4RWTA 4KBOA 4K41A 1S3XA 3MK6A 3ZETB 3ZX2A 4B9QA 3QB0A 1J6ZA 1LOTB 2NLXA 4BC2A 2Q31A 2E2OA 3VOVA 4JHDB 3AY9A 2E2PA 2I7PA 2W40A 4BGAA 1GLEG 3BEXA 4AM6A 2CGKA 3CI5A 4YDUC 1TYQB 3R6MA 1MA9B 4K43A 1JCEA 3CQYA 3FZHA 4FWKA 4XH4A 3VGKA 4BQLA 1YXQA 2QWRA 2P9SB 3QFPA 5JICA 1ZC6A 3GE1A 3AAQA 1JCFA 2P9LA 3SLCA 1ATNA 2P9KA 3MCPA 5AQHA 4BREA 3DJCA 3O80A 2VCPA 1CZAN 2P9IA 3CJBA 2P9PB 4J8FA 3I8BA 2BTFA 4QS7A 5AFUA 1BU6O 2P9NA 3CIPA 3P4IA 3U9ZA 2WUSA 3W3DA 3DXMB 4F9OA 3CJAA 5LJVA 3ID8A 4H5VA 4DQ8A 1QZ6A 4XH5A 4AM7A 1E4FT 4WQ5A 2QWOA 3UKUA 3VESA 3ATUA 4FWPA 3L0QA 3ENHA 2QWMA 2IVNA 3QDKA 2IIRA 4GNIA 1WUAA 3CERA 1DEJA 4WQ4C 1XC3A 2V52B 3F9MA 4NO7A 5F1XA 5BREA 1QHAA 3VEWA 1U2VB 5FPEA 5E26A 4B1UB 1NGIA 3BUZB 3C7NA 5AZJA 3A5LC 2V7YA 4BR4A 4Z94A 2GELA 1X9JA 1SZ2A 4MO5A 1NGGA 1QQMA 3BF1A 1TUUA 4LC9B 3WQTA 1ESVA 3VGLA 3VEOA 4CBWA 4H5RA 1IG8A 5BPNA 5TKYA 2E88A 3WXIA 3ZX0A 3CJ9A 3JXUA 4H5NA 4IXCA 5AQFA 3GBTA 4CZLA 3O4WA 2A42A 2P9UB 4HWIA 1EQYA 4CD1A 1OKJA 5AQNA 3RSEA 3UB5A 3EN9A 4CI6A 4BQZA 1NBWA 3LL3A 4CZHA 1KXPA 2A6AA 3EO3A 4JN4A 5AQUA 2GWJA 4BG9A 4BRCA 1U6ZA 4JNEA 3QBXA 2E1YA 1NGEA 1HLUA 3DXKB 5ELZA 1NM1A 5BRDA 3ZETA 1WOQA 4H0YB 1GLAG 1NMDA 3VF2A 4BRLA 4CJ7A 3O1WA 3SK3A 3LM9A 5AQSA 1DGKN 1YUWA 4JD2B 1Z05A 4QS9A 5FPMA 5AZIA 4EFHA 2KHOA 3TU5A 5AQKA 4DCHA 4H5TA 2NRHA 1S22A 4DHYA 4CBXA 1NGJA 3A0IX 3KHYA 5BN8A 1GLLO 5AQGA 1NGBA 1NGCA 1ZBSA 4MLHA 3VEZA 3VENA 4M63C 4PKHA 1RGIA 2QWQA 2YHXA 3IUCA 4BRQA 1ZXOA 4XEIA 3CJCA 4IWVA 4BVPA 2A5XA 1BUPA 1GLDG 1Y64A 5FPNA 4B1XB 4H03B 1QQOA 2VWBA 5KQDA 1BG3A 1JCGA 2E8AA 4BRMA 5ADXH 1BWFO 4IO8A 2FXUA 3L6QA 2F9WA 5E84A 1NWKA 3DXMA 3EKUA 2QM1A 3FZFA 3FLCO 2GWKA 4BRAA 3ZEUB 1T44A 4FWQA 3VEVA 2ZF5O 1H1VA 1RFQA 4CZGA 2ITMA 1ATSA 5BPMA 3IDHA 1YAGA 4I6MB 3LDPA 3VERA 1LCUA 2A3ZA 2E1ZA 3A5OC 4E1JA 3JS6A 1U2VA 1GLBG 1SQKA 4H0XB 2GTDA 1YVNA 3B8AX 3C0BA 1HPMA 3HBTA 4BC5A 3R9PA 4XH1A 3J8AA 4QS8A 4CZMA 4FPAA 5BPLA 3TPQA 1T6CA 3KVGA 3H1QA 4CZIA 4B1ZA 2AP1A 3WEEB 5EX5A 1V4TA 3HI0A 4FPBA 2ZGYA 1DKGD 4FOIA 3W0LA 4NB4A 3D2EB 1HKCA 3MN7A 4GY2B 3VGMA 2FF3B 5JLHA 2Q0RA 1BOTO 2FSJA 1NGHA 3FZKA 5KPRA 3FR0A 2IVOA 3CQXA 4FWNA 2ASMA 2UYTA 5EXWA 4EIAA 2QWLA 3EL2A 3MN6A 4BRGA 1V4SA 5AR0A 4YDUA 1MDUB 1E4GT 2GEMA 2P9LB 2Q1NA 2HMPA 3UKRA 2IVPA 3WT0A 2J4RA 2PAVA 3H3NO 2FSNA 4WYBA 1X3NA 3LDOA 4BVOA 2P9IB 3SMPA 2YI1A 5KQ8A 4H0TB 1ATRA 4BRPA 2D4WA 3LDQA 4H0PA 4CD3A 4MO4A 2BUPA 3BF3A 2ZWHA 5EVZA 4ISFA 4H0OA 4BRFA 3ULEA 1K8KB 3AARA 3QICA 2FSKA 3GDQA 1RDWX 3WXJA 1GLFO 2ASOA 3ATVA 3SMSA 4B1VA 5AQTA 3CJ7A 5BR9A 5AQOA 4IZ9A 5AQJA 3DAWA 1XUPO 1GLCG 3A5NC 4BR0A 4DB3A 4JHDA 3R8EA 2NZTA 1X3MA 2D0OA 3MN5A 3VF4A 1TYQA 3C7NB 3L4IA 4WQ4A 4FO0A 5FPDA 5BRFA 1P8ZA 3HTVA 1BO5O 5LJWA 4BR2A 2P9SA 5AFUH 4BROA 3ZEUA 1BA0A 2CH5A 4FWLA 3UE5A 4MLEA 4I6MA 2PBDA 5F2RA 5JMVA 2YJEA 1R59O 3H3OB 2D0PA 2DPNA 2P9PA 3AAPA 4BR5A 5AQZA 3KZBA 4IJAA 4B1WB 1Z6RA 3D2FB 4WQ5C 5JLFA 2HF4A 1XQSC 4BG8A 3QBWA 4BRDA 1MWMA 5AQRA 4BC3A 3MDQA 4HTLA 4EAHD 5AQXA 3LDNA 2YHYA 5EY4A 1KAXA 3CJ1A 1IJJA 1TUYA 5B8HA 3HM8A 3WEEA 5BN9A 2Q36A 3DWLA 3O8MA 4BRIA 3D2EA 2YCHA 4EHUA 2Q97A 1SAZA 4FWRA 2F9TA 1C0GA 3FFKB 2CH6A 5AZIB 5CE3A 1NGFA 2FLOA 3WXLA 2CGJA 4H0VB 3H45C 3FE1A 4RCHA 3A8YA 4BRHA 3MMVA 3SJHA 4RTFD 1HUXA 3FZMA 2V7ZA 2Q2RA 3QMLA 5BRHA 2VYPA 2ASPA 2YHWA 5F0XA 2I7NA 4K42A 1BA1A 5AQQA 4CBUA 3ENOA 4FWMA 4IJNA 3EKSA 3GL1A 4BGBA 2HOEA 4JAXA 4K25A 3H1VX 2P9UA 5AQYA 3WQUA 1K8KA 3WXKA 3GOIA 4BC4A 4C23A 5LY3A 1KAYA 4EHTA 2OANA 2HF3A 3S41A 2E2QA 4CZKA 3O6WA 2FF6A 3HZ6A 3U8XA 5KPZA 5AQPA 2A40A 1D4XA 1NGAA 3DXKA 1BDGA 2H3GX 2P9KB 2QWPA 4M7YA 3WUHA 2E20A 2QXLA 5AQMA 4ISGA 1Q18A 5ADXA 3D7EO 1NGDA 2YJFA 4CZJA 4L3QA 1KAZA 2QWNA 3G25A 3H46O 3VETA 1MWKA 2V51B 3GG4A 3MN9A 4FL9A 4FWOA 4H5WA 1HKGA 4JD2A 3O5BA 2P9NB 1HKBA 4CZEA 3H6EA 3M3ZA 3O1BA 4A2AA 5I9EB 1T6DA 4ISEA 2QW9A 3M1FA 3VF6A 4PKIA 4BRKA 1GLJO 2AA4A 2EWSA 4PKGA 3UKUB 2ZGZA 3OHRA 2GUPA 5AQIA 4FWSA 4PL7A 3EZWA 1QZ5A 3VPZA 3BP8A 3VEXA 2W41A 4A61A 2A41A 1HJOA 3IFRA 2D1KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IBLK 3EEQA 4M7XA 2JWLA 4E1NA 2Q0UA 1QQNA 4DF4A 4PQUA 3HSCA 3VA3A 3DLEA 1Z25A 4A59A 1TL3A 3U3GA 1UA1A 3UKRB 3O3FA 4O8UA 3VQ6A 3CFOA 4PL8A 1SKWA 3LAMA 2Q3SA 1VQ4N 4KB0A 4B08A 3LDLA 3ULEB 3FGUA 1JKHA 3A5MC 4O4GA 3R3LA 1GOCA 4WFBL 4DU1A 3RVCA 1Q7YO 1WLJA 3OYAA 3KK1A 2P1JA 2VGMA 3T19A 1EX4A 1TL1A 3ZX2A 3QB0A 1J6ZA 3OJUA 2Q31A 4KV8A 3AGRA 3JYTA 4AILC 2W40A 3SPYA 2WONA 1OVQA 1OH8A 1TYQB 4OGEA 5C2FA 3SUNA 1NKEA 2F7TA 1X9MA 3CD6N 3FZHA 4CESA 4JS4A 3BGRA 1ZC6A 3LANA 1JCFA 5K14A 2P9LA 3K5NA 2E5LK 2P9KA 2HNZA 4OKJA 2VCPA 3E9OA 1NJXA 4DG1A 2W42A 4GVEA 1CZ9A 1VQ8N 3I8BA 4QS7A 5M1PA 5AFUA 3ID8A 2NNWA 2QEXN 4I7FA 1QZ6A 4KTZA 3FFIA 3AGKA 1YI2N 1OH7A 2E6MA 3UKUA 5KTQA 3VESA 2O8CA 1VRUA 4IEEA 3QDKA 4KHYA 4Z4IA 4CJPA 5BREA 3VEWA 1Q9XA 5FPEA 2OPPA 3TR8A 3ZSZA 2YKNA 1NGIA 2OTJN 3LP3A 3P31A 4Z94A 2A1RA 2UXDK 3G6EN 1QVFM 2GUIA 3BF1A 4LC9B 1VK0A 1ESVA 3I55N 1Y97A 3VEOA 4H5RA 5BPNA 5TKYA 4CK2A 4JKAA 3SBTA 3ZX0A 1U47A 4IXCA 4FZYA 4CZLA 2P9UB 4CD1A 1EQYA 1OKJA 5AQNA 1K73O 3RSEA 2O4GA 1L3UA 2EX3A 4CI6A 3C6TA 3LL3A 4CZHA 4X66K 4JN4A 1RT5A 3EO3A 2ZJQL 1J53A 4BG9A 1OH6A 5CR4A 5LMNK 2E1YA 1NGEA 5D3GA 4DR2K 2GV9A 4G1QA 3G0ZA 1WOQA 1W2BM 1NMDA 2Z1IA 3K5OA 4QAGA 4BRLA 3HT3A 4E3SA 4JKHA 4GMJB 3IG1A 1EKEA 1YUWA 1I3AA 4JD2B 1FKPA 3KK2A 4CGHA 2WFBA 5J2PA 2F96A 1NK7A 1N6QA 2HBJA 1HQEA 3OVNA 4FM0A 2UXBK 4DCHA 2NRHA 1S22A 4JI2K 1NGJA 3A0IX 3R1XA 5HL7L 3LP0A 1ZBSA 3NFAA 4R5PA 4KHNA 1RGIA 4BRQA 4BY9C 2ZE2A 4X64K 4BVPA 1A5WA 3THYA 3S3NA 1Y64A 5FPNA 4B1XB 4H03B 1QQOA 4JI3K 4A5BA 1JCGA 5ADXH 2OPSA 4A57A 4CEQA 1XHXA 3ZT0A 1NWKA 3VQ5A 3BZCA 3V9WA 3K9KA 4DR1K 3D0PA 3OYMA 1T44A 4FWQA 3VEVA 2ZF5O 1S5JA 2D0BA 2HHWA 4KFBA 1TAQA 2BH1A 2G8KA 4KREA 1IV0A 1B9FA 2XY8A 2OA8A 2O8EA 4C8MA 4KHSA 3JS6A 3ID6A 1EWRA 3VA0A 1U2VA 1FW6A 1SQKA 4H0XB 3B8AX 3PLAA 3QO9A 1S1WA 3M5RA 4BC5A 1C0TA 5GAGP 4XH1A 4CZMA 2E4LA 1T05A 4IKFA 1T6CA 4GW6A 3KVGA 1SS6A 2DFEA 3VTIA 1JL2A 1BI4B 3ZCMA 1V4TA 2ZGYA 4FOIA 4OPJA 4UQGA 1IO2A 4NCBA 3THXA 2PFUA 3MN7A 4GY2B 4IOCL 3AVCA 2FF3B 5JLHA 2FSJA 4DFMA 1O13A 1WAJA 3FZKA 1DTQA 3WNFA 3OYIA 1BGXT 3O4NA 1G15A 4E7LA 2ASMA 2UYTA 5EXWA 4JKGA 4EIAA 1N5YA 2QWLA 1T3VA 3TTFA 2P9LB 4DMNA 3HP9A 3OYNA 5J2MA 4OLBA 1XHZA 2ETJA 5KGWA 1W9HA 2J4RA 4OX9K 2FSNA 4AHTA 1GOBA 3AVNA 3OS2A 3EE9A 2PY5A 2HB5A 3BF3A 1HYZA 2ZWHA 1L5UA 3F9KA 5GIOA 5EVZA 4H0OA 3V4IA 3CMAN 4CJ3A 3GDQA 3THWA 2YHAA 1BL3A 3WXJA 1GLFO 2ASOA 1U4BA 2HNDA 3E9PA 5AQTA 2QI2A 1RBVA 2O8CB 1RTJA 5AQJA 2YNFA 1J9AA 4CJKA 4BR0A 3CFPA 4DB3A 4JHDA 4AH9A 3RMBA 3L2UA 3VQAA 2RE2A 5CY4A 4M3UA 5FPDA 4M42A 4A5AA 5IWAK 3C6HA 4DQPA 5AFUH 3CC4N 3ZEUA 4MDAA 2FBTA 3V6DA 4ZTJA 3PY8A 1L3SA 3UE5A 3KJVA 1JXBA 3J81O 5HRNA 3LWLA 4I6MA 5CZ1A 1R59O 3H3OB 1RBSA 3V9ZA 2DPNA 3HRGA 1ASWA 2P9PA 3ZSRA 3KZBA 4IJAA 4DS4A 1KLMA 4BG8A 1MWMA 1NK9A 4HTLA 4EAHD 3PIOL 4B3OA 3M8QA 4FVUA 2YHYA 3TARA 3CCUN 4CJUA 1TUYA 3HM8A 4DSKA 3DWLA 2WTUA 4BRIA 1K6YA 1UAXA 3D2EA 4JI6K 4FWRA 3V1OA 3FFKB 1SUQA 3LWMA 4CF8A 1JL1A 2NRWA 4RW7A 4RCHA 1VAZA 3CPWM 1YF5L 3SJHA 1HUXA 4CGGA 3FZMA 2V7ZA 4JI0K 3HPGA 2NRZA 1IH7A 2VYPA 1J54A 2ASPA 5C0YA 3TAGA 3THYB 4CERA 3LALA 4IJNA 3RRHA 4DSJA 4BGBA 4JAXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3EYZ A;  3TAN A;  4OKK A;  2JGU A;  3KLF A;  3CME N;  2YHW A;  4HUE A;  4K42 A;  1BA1 A;  4N47 A;  4CBU A;  3ENO A;  1UA0 A;  4B9L A;  1LW0 A;  3OJS A;  1VSK A;  2HOE A;  4AHV A;  2QTD A;  4GV6 A;  2P9U A;  4KKO A;  1RNH A;  3M8R A;  1M1K O;  3WQU A;  1K8K A;  2B5J A;  4Q0B A;  5HRO A;  3RMC A;  2HHU A;  2E2Q A;  2FF6 A;  3U8X A;  4JI7 K;  5KPZ A;  1KRP A;  5AQP A;  4FLX A;  1D4X A;  3J7Y P;  1QSY A;  1SKS A;  2QXL A;  4DV7 K;  3O9R A;  5AQM A;  3TTC A;  2HHS A;  1DLO A;  5ADX A;  2WC9 A;  1JLA A;  1LAV A;  1KAZ A;  3G25 A;  3H46 O;  4BR9 A;  4H5W A;  4JD2 A;  4DQI A;  2P9N B;  1HKB A;  4ILG B;  3M3Z A;  3O1B A;  4JYA K;  2KTQ A;  3AVA A;  3HST B;  2GX9 A;  3OBY A;  3VF6 A;  4YHH K;  4NLB A;  4PY5 A;  1MU2 A;  2OZM A;  4ZHR A;  2AA4 A;  1TVR A;  4PKG A;  1K9M O;  2ZGZ A;  3AA5 X;  4B9S A;  5DMR A;  5GIP A;  3QEV A;  1WSJ A;  4A61 A;  3QES A;  2D1K A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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