4ISGA

Human glucokinase in complex with novel activator (2s)-3-cyclohexyl-2-[4-(methylsulfonyl)-2-oxopiperazin-1-yl]-n-(1,3-thiazol-2-yl)propanamide
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
457
structure length
418
Chain Sequence
KPMPLTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESESGRGAALVSAVACKKACMLGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase activator
molecule keywords Glucokinase
publication title Design, synthesis and SAR of novel glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 150
structure length 418
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4isgA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4isgA01
5AQZA 4ISFA 3WQTA 3IDHA 4BRKA 5AQKA 2P9UA 4CD1A 3EL2A 3L6QA 4MLEA 4FWQA 4ISEA 3GDQA 3ID8A 1HKGA 4H0PA 1NGCA 2ASOA 2FSKA 2FF6A 3DXMB 3H1QA 1BUPA 4EIAA 2GELA 3VEVA 4XH4A 1GLBG 3M3ZA 3DXKA 3L0QA 3D2FA 2D1KA 5F0XA 2FLOA 3VERA 5AFUA 4LC9B 4M7XA 5BPNA 5KQDA 5LY3A 2QWQA 4A2BA 2A40A 1JCFA 4BC3A 3DAWA 1QZ6A 4BRAA 3C7NA 3HSCA 1NGEA 4JD2B 4YDUC 2Q0RA 3VETA 5KPZA 4EFHA 2GTDA 2Q31A 1ESVA 1BOTO 3O1BA 2E2OA 4B1ZA 3LM9A 3D2EA 1E4FT 3WXIA 3SJHA 5F2RA 3HM8A 1T6CA 3FFKB 2Q97A 2FF3B 5B8HA 1X9JA 3B8AX 1HUXA 3FZKA 2ZGZA 3MN7A 1HKBA 3BF3A 5AQHA 1ATSA 3O8MA 5AQUA 1RGIA 1XQSC 3WXLA 3VENA 3VEYA 1NGFA 5AZIA 4WQ4A 2P9SA 4M7YA 2BUPA 2I7NA 1ZC6A 1IG8A 5AQOA 3IFRA 3A5OC 5JICA 4A62A 3KHYA 3GG4A 5EOYA 3CJ7A 3ENOA 3EO3A 2A3ZA 3HZ6A 1BA1A 1HJOA 3A0IX 3UE5A 1OKJA 4J8FA 5ELZA 2HOEA 3UKRA 3ATUA 3CJ1A 3R8EA 2NZTA 2F9WA 3H1VX 3VEXA 1NWKA 3AARA 5BPLA 4BR0A 3BP8A 1TUUA 1BU6O 1ZBSA 4B1UB 3A5LC 3WEEB 3ULEB 4DB3A 1ZXOA 4FWMA 4BQLA 4BRHA 2W41A 1WUAA 5AQQA 4BRNA 1KAXA 5AQJA 2P9KB 2E2PA 4H5VA 5FPNA 3F9MA 4FSVA 3VEWA 1NGBA 3CHWA 2NRHA 4IZ9A 2IIRA 3VF2A 2QXLA 3QB0A 1LCUA 4Z94A 5AZJA 5AQWA 4DCHA 1MWMA 2V52B 3CI5A 4BRIA 4CD3A 2P9UB 4BC5A 4QS7A 3SLCA 4CZIA 4IJNA 4JHDA 1MA9B 3WXKA 3FGUA 1C0FA 3CQXA 2E2NA 4BGAA 2GWJA 1BG3A 3DXKB 4XEIA 3D2FB 4EHUA 3LDNA 4CZGA 2ZGYA 1DKGD 2QWOA 3CJBA 1NGDA 2NLXA 4RWTA 2AP1A 5CE3A 1U2VB 3I33A 4FWSA 4QS9A 1QZ5A 4H5TA 3C7NB 1QQMA 4AM6A 4CZEA 2QWMA 3G25A 3OHRA 4FPBA 4BRMA 5FPDA 3CETA 1U2VA 3EN9A 3JXUA 2D0PA 3ATVA 4IO8A 5AQFA 1H1VA 4H0YB 1T44A 4FL9A 1TUYA 4E1JA 4NO7A 3MN9A 3LDLA 1NGHA 2QWNA 2A5XA 2GUPA 3D2EB 3R6MA 1J6ZA 1XUPO 3RSEA 1EQYA 1NLVA 2PBDA 3H46O 5AQVA 3EKSA 5AQMA 4XH5A 4CBUA 4DQ8A 2YI1A 5JLFA 3JS6A 5EY4A 4Y0WA 5AQPA 4IXCA 1Z6RA 4I6MB 3QBWA 3QFUA 1BDGA 2ZWHA 4BR7A 3S41A 5F1XA 5AZIB 1DGKN 2Q36A 3MDQA 5EVZA 2P9SB 2ITMA 3TU5A 3C0BA 4I6MA 4B1WB 2ASPA 1KAYA 2P9IA 1TYQA 3CIPA 4K41A 4M63C 2D4WA 5BRFA 4CZMA 1GLFO 2E88A 3GE1A 5BRHA 3SMSA 2I7PA 2WUSA 2YHYA 5BREA 4CZJA 2Q2RA 4KBOA 2YJEA 3VF4A 4WQ5A 3TPQA 3ZETB 2ZF5O 3H6EA 2Q0UA 3U9DA 3UKRB 3LDQA 3AY9A 4CZLA 1JCEA 3A5NC 3QFPA 2A6AA 5BRDA 3VGMA 3ZETA 1HPMA 3O08A 5JLHA 1YXQA 1D4XA 3FE1A 4CBWA 1S3XA 3SK3A 1JCGA 4O8KA 5AQIA 3AAQA 4GNIA 4BGBA 4H5NA 3CJAA 4JN4A 2VYPA 2A41A 3WXJA 4JAXA 4FWRA 3VGKA 3BUZB 4WQ4C 1S22A 3KZBA 4BC2A 3FZMA 4BG8A 3QBXA 3P4IA 2GEMA 5TKYA 4BQZA 2P9NB 1NGJA 3QDKA 4FPAA 5AZJB 2PAVA 2YJFA 2FSJA 2CH6A 4C23A 4K43A 3O80A 5E26A 4BRCA 3H45C 4PKGA 1LOTB 3CQYA 2IVPA 4BRLA 4A61A 4JHDB 4BRPA 1E4GT 3VEZA 2P9NA 4EHTA 3MK6A 4EAHD 4BR9A 1NBWA 1GLEG 2QW9A 4CZFA 5LJVA 5AFUH 3D7EO 2E2QA 1BO5O 4L3QA 5FPEA 4BRFA 2IVOA 3W3DA 2E1YA 1BWFO 5AQGA 3EZWA 2EWSA 1Z05A 3IMXA 2CGLA 2ASMA 4WYBA 3VPZA 4H5WA 3VESA 1CZAN 3L4IA 2P9PB 5BPMA 3O5BA 3QMLA 3O4WA 5LJWA 1NGGA 5BN8A 1ATRA 3DJCA 4PL7A 3MN6A 1MDUB 2QM1A 3W0LA 1NMDA 4GY2B 1QQOA 2P9PA 4B1VA 4BRDA 2VWBA 4H0VB 3ZX3A 3A5MC 4BREA 2CH5A 2Q1NA 2D0OA 3RSEB 4BG9A 2KHOA 1SZ2A 1YAGA 5AQYA 4AM7A 1NGAA 3MN5A 3BF1A 3CJ9A 3FZHA 3GBTA 2H3GX 4H0XB 1GLLO 5AQRA 3R9PA 1GLDG 3GOIA 5ADXA 4CBXA 5AQLA 4BC4A 3ZEUB 3WUHA 4A2AA 3ZX2A 3DXMA 1MWKA 1QQNA 3IUCA 4K25A 5E84A 1X3NA 5AQNA 4H0TB 4PKHA 2P9IB 1TYQB 3ZEUA 5AQSA 4CZKA 2VCPA 5FPMA 2E8AA 2BTFA 4ISGA 3FZLA 4CI6A 3H3NO 4IJAA 5EX5A 1IJJA 3FR0A 5KPRA 4CJ7A 1KAZA 3FZFA 3LL3A 4PL8A 3HTVA 4JD2A 3UB5A 5JMVA 3LDOA 2IVNA 2AA4A 3LDPA 3U8XA 1GLCG 3HBTA 1R59O 3O6WA 2HF3A 3A8YA 1RDWX 4XH1A 3MMVA 3O1WA 4BRQA 5KQ8A 5BR9A 4MO5A 2J4RA 3H3OB 4MLHA 2CGJA 1U6ZA 4H0OA 1T6DA 1XC3A 4FWOA 3CJCA 4NB4A 5EXWA 2E20A 2V7YA 4K42A 2V7ZA 3U4LA 4RCHA 4BROA 1DEJA 5KPTA 1Q18A 5I9EB 1G99A 2YCHA 5BN9A 1K8KB 1V4TA 4FWPA 4H5RA 2QWLA 3U9ZA 3DWLA 3SMPA 4IWVA 4H03B 1NGIA 1SAZA 2UYTA 4BR2A 1HKCA 4B9QA 4DHYA 1P8ZA 3GL1A 1K8KA 2DPNA 2GWKA 3ZX0A 3M1FA 3VOVA 4PKIA 1YUWA 4CZHA 1QHAA 1HX1A 2QWRA 2YHXA 2HF4A 4MO4A 4QS8A 1GLJO 2W40A 4O5FA 2FSNA 4WQ5C 4B1YB 3MCPA 4BRGA 1SQKA 4B1XB 4FOIA 1HLUA 1Y64A 5AQXA 1WOQA 3UKUB 3EKUA 4JNEA 2V51B 1C0GA 1YVNA 2FXUA 4FOEA 3QICA 3VEOA 3FLCO 1V4SA 2CGKA 4HTLA 3UKUA 1NM1A 3WEEA 3ULEA 3BEXA 4RTFD 2F9TA 4FO0A 2E1ZA 3WT0A 4BR5A 4HWIA 4BVOA 2P9LB 1BA0A 3I8BA 3WQUA 4FWKA 2YHWA 3ENHA 4FWLA 4BR4A 1X3MA 2P9KA 2OANA 1RFQA 3HI0A 1ATNA 4F9OA 2HMPA 3VGLA 1GLAG 5AQTA 3AAPA 5AR0A 4BVPA 3LM2A 3VF6A 4FWNA 2P9LA 5ADXH 4YDUA 2QWPA 3J8AA 2A42A 3KVGA 3M6GA 1KXPA 3CERA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AQZA 4OLBA 2W6KA 1HR0K 4CGDA 3L6QA 4FWQA 2GBZA 1HKGA 3PUFA 2ZM6K 3H1QA 3EYZA 1YVUA 3E1YA 2HVIA 4DUYK 5AFUA 2FBYA 4M7XA 4DSFA 5KQDA 2EHGA 3ZT0A 3HXMA 4CF0A 3QEPA 5HRSA 2A40A 1M1KO 5HLFA 4OLAA 4CGHA 3HRGA 3C7NA 3DRRA 3HSCA 5HP1A 3AO4A 3OVNA 3RMBA 1YF5L 1NJXA 4N47A 4FJ8A 3O1BA 2E2OA 3QNNA 4B3TK 3NCIA 3HM8A 3I0RA 3CG7A 3J7AP 3L2VA 5CZ2A 1TAQA 4WE1A 3B8AX 3FZKA 1RILA 3O4QA 1RCHA 5JS2A 3CCLN 3HOSA 1RGIA 3JYTA 3VENA 1TKDA 2IDOA 4ID5A 2WOMA 4M7YA 2BUPA 1XNQK 4LFCK 4DLGA 1KVBA 1NOZA 3D45A 1U49A 1NJYA 1TL1A 3HK2A 2OYQA 2R7YA 2IOCA 3GG4A 3SQ0A 5EOYA 3EO3A 2A3ZA 2YX6A 4JK7A 4GV3A 1RTIA 2Y1JA 3UE5A 4OO1J 5LMNK 3THXB 3CJ1A 2W6LA 3VQ4A 4CE9A 3H1VX 2P5GA 4AILC 2E5LK 3O9QA 4NXNK 4LSNA 4OX9K 1IO2A 4IOCL 3HM9A 4NCAA 2Z1IA 5GAGP 1Q9XA 4H5VA 1J53A 5FPNA 5J2QA 3F9MA 2VGMA 3VEWA 3CHWA 2G8KA 4IZ9A 2BGGA 2KKZA 4IBNA 3MEGA 2E4LA 4Z94A 5AQWA 1VSDA 4KI6A 5K14A 4DR7K 4CZIA 2QA4N 1RNHA 1UOCA 4IJNA 1MU2A 3NF6A 1C0FA 2VWJA 2E2NA 4BGAA 3CMEN 1BG3A 3DI6A 4XEIA 4B3SK 4CZGA 4DTUA 2YKMA 1DKGD 3LPUA 4AHTA 3HVRA 1U2VB 5BR8K 4OVLA 1VQ7N 1HNIA 3RRGA 4H5TA 3VN5A 1S1VA 4FPBA 3OHRA 5FPDA 3C95A 3JXUA 1H1VA 1J5EK 3M8SA 4KFBA 4DS4A 3D2EB 3R6MA 4DTJA 1KFDA 3T1HK 1K9MO 1RT2A 3RSEA 4FM1A 2PBDA 5AQVA 3EKSA 3OYJA 4BY9C 4XH5A 4DFJA 5T7BA 4CBUA 1N33K 2YI1A 3PV8A 4JI0K 3CXCM 2OA8A 1BI4B 2UXCK 4LFAK 4EP4A 3S41A 2Q36A 1HPZA 5EVZA 1D9FA 4YY3K 2ITMA 4OPAA 4JKEA 4CF2A 4JEPA 1YJ9N 2ASPA 2HB5A 1HYZA 2NUBA 4M63C 4CJ3A 3THYB 3PX6A 5BRHA 2I7PA 2WUSA 2YHYA 4W5TA 2KTQA 4DV0K 2YJEA 3VF4A 3OJSA 3TPQA 2ZF5O 3U6FA 3UKRB 3LDQA 2VG6A 4KHSA 4HUEA 5M1FA 5E41A 3QFPA 4DTMA 3SAGA 3LAMA 4FJNA 3VGMA 4N56A 4E7KA 1B92A 3NF8A 4MQ3A 4LY7A 3FE1A 3K57A 3Q7CA 1JCGA 4GNIA 4H5NA 3CFOA 3CJAA 1KCFA 4CGIA 3OYHA 2HHHK 1S9EA 4FWRA 3BUZB 1S22A 3KZBA 1W7AA 4M41A 1RT1A 3LP3A 4K8XA 2X6NA 1NGJA 3QDKA 4CW7B 4CIFA 1VK0A 3IS9A 3PO4A 1W9HA 3ASMA 4K43A 3U3GA 5E26A 4EZ6A 3NFAA 4BRCA 3LP1A 5LMUK 1LOTB 3CQYA 4LSLA 4BRLA 4M3XA 4UY8O 3VEZA 2XHBA 1C6VA 4EAHD 2QW9A 1GLEG 3IRXA 3O3GA 3D7EO 3OS1A 2O8EB 3NGIA 1BO5O 5FPEA 3MEEA 2E1YA 1BWFO 2EWSA 1Z05A 1N5YA 1VQ4N 5DM6L 3TAPA 1VSKA 3L4IA 3ZSZA 3TAMA 2OPQA 2YHBA 1IBKK 4PL7A 4FJ7A 3MN6A 1MDUB 1ASUA 2QM1A 3W0LA 5CHIA 4FYDA 2P9PA 4DTSA 4GV6A 2QTDA 3WNEA 4BRDA 1X9SA 2VWBA 3ZX3A 3KK7A 1Q81O 2Q1NA 2D0OA 2KZZA 3AVMA 3VMFB 1SZ2A 1YAGA 5AQYA 4E89A 4AM7A 4B9VA 2HBLA 3AVHA 3BF1A 3CJ9A 1NK4A 1QVFM 3F2KA 2H3GX 1ZBHA 1KQSM 4M3TA 1IBMK 1GLLO 1WSGA 2A1RA 4DSKA 3P31A 5AQLA 3EE9A 3HP6A 3IUCA 4A5AA 5M1OA 4LF8K 1TK0A 3TSUA 4IFVA 2KFZA 3V9WA 3NF9A 2VCPA 2NRVA 2E8AA 4ICLA 3LP2A 1O1WA 3H3NO 4IJAA 1YJNN 3TI0A 4JI6K 1KAZA 2G8HA 3PSFA 2HMIA 3UB5A 4HCBA 1JJ2M 4DR4K 4JI1K 4BACA 4FJMA 3M5RA 1KTQA 4FJGA 4YOUA 3V1QA 4BRQA 5KQ8A 3H3OB 1J54A 4H0OA 2YKNA 2GX9A 3AVLA 3EEQA 2ZJQL 4NB4A 2V7YA 3CFPA 2QI2A 1VQON 3AA4A 4RCHA 4BROA 4PA1A 5BN9A 1K8KB 1VAZA 1LAVA 2QKBA 4CEAA 4BR2A 2D0CA 4DSLA 1YITN 3F73A 1ASWA 4AHVA 3RMCA 1EP4A 1HJRA 4J2DA 1DLOA 3AO1A 2YHXA 1Y97A 4CEZA 2W42A 1U4BA 1GLJO 4YOXA 3OYGA 1NKBA 2PYLA 1SQKA 5AQXA 3THXA 5HBMA 3EKUA 3ZCMA 4CGJA 4DMNA 3C94A 5HL7L 4FJ9A 3QICA 3OYDA 4DU4A 3C6AA 5A2QO 4BVOA 3P39A 1BA0A 3WQUA 1KLNA 2YHWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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