4IWVA

Crystals structure of human glucokinase in complex with small molecule activator
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
449
structure length
443
Chain Sequence
SSNSQVEQILAEFQLQAADLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHAAASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Glucokinase isoform 3
publication title Optimising pharmacokinetics of glucokinase activators with matched triplicate design sets the discovery of AZD3651 and AZD9485
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 168
structure length 443
sequence length 449
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iwvA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4iwvA01
1NGAA 3MN6A 2YHYA 5AQPA 3MK6A 1K8KA 1U6ZA 4H5NA 3MMVA 1S3XA 4MO5A 4LC9B 5BPMA 3I33A 3VEZA 2D0PA 2HMPA 3G25A 3VEVA 4M63C 4BRPA 1T44A 3OHRA 4NO7A 4BVPA 3EZWA 4A2AA 4Y0WA 2ZWHA 3O5BA 1XC3A 5JICA 1IG8A 5I9EB 3D7EO 3FZFA 2GWJA 3C7NA 5AQXA 4PL8A 2EWSA 1NWKA 3UKRA 3H3NO 1NGBA 2ASPA 4KBOA 5KQ8A 3M6GA 3IUCA 2P9LA 1NGJA 3LDPA 4BR2A 3EO3A 4H0VB 2E2NA 3QICA 3U9DA 4B1VA 3HI0A 4B1YB 2FLOA 4EFHA 2QWLA 4BRIA 4JN4A 2NRHA 2V51B 5F2RA 1WOQA 3VF2A 4PKGA 1YVNA 3GOIA 5BREA 4JD2A 2V7ZA 3KHYA 2Q97A 3EKUA 4PL7A 4XEIA 2FXUA 4FPBA 4H0XB 2P9IA 3ZEUA 1GLJO 1NGGA 3DAWA 2A3ZA 3O6WA 2Q2RA 5EY4A 1JCFA 5ADXH 5KPTA 3F9MA 5AQLA 3JS6A 5EXWA 3VPZA 1BA0A 1XUPO 2CH6A 1NGFA 3FR0A 2HF3A 2QWRA 3WXLA 1KAYA 1NGDA 4BC5A 4BRAA 2H3GX 3SMPA 1Z05A 4GY2B 5AQYA 1NGCA 2CGJA 3VOVA 1XQSC 2AP1A 4FO0A 4IZ9A 1GLEG 1D4XA 1QQOA 1DGKN 3ULEB 4BGBA 3DJCA 2E2PA 4FWMA 1T6DA 4WYBA 1ATSA 3MN7A 2E88A 3IDHA 4FWLA 3EL2A 3ZX2A 3RSEB 3FGUA 3HBTA 4A62A 4CD1A 4XH4A 5JLHA 4RTFD 3R6MA 1X9JA 2CGLA 3CJBA 5JMVA 5BN9A 3O1BA 5LY3A 4CBWA 1Z6RA 5AQVA 2W40A 3ENHA 2YCHA 1SZ2A 3L6QA 3VEXA 4ISEA 4BRCA 4CZLA 4BQLA 3O4WA 2P9PB 4CZHA 3QB0A 3LM9A 1MWMA 4H0YB 3HZ6A 1WUAA 2ITMA 2Q31A 2CGKA 3J8AA 5AQNA 3S41A 1V4SA 3QFUA 2P9KB 5AQUA 3VESA 1ZXOA 3CJ1A 1SAZA 1MWKA 2VCPA 3WEEB 3FFKB 2HOEA 4BR0A 1HUXA 1YUWA 4QS9A 3FZLA 1X3MA 1KAXA 1DKGD 2BUPA 4BRGA 3SK3A 2DPNA 4BG9A 3SJHA 4K25A 4K43A 4BG8A 4CZJA 5TKYA 5AQZA 3ULEA 4C23A 3ATVA 1HKCA 3DWLA 3VGLA 3QDKA 1ZBSA 3D2EA 2BTFA 3CQXA 3O8MA 1NGHA 3RSEA 4CZMA 1NM1A 3IMXA 2FF3B 5AQTA 3CETA 5ADXA 1QHAA 4PKHA 1GLLO 1GLDG 2IVNA 3D2FB 3MN5A 4AM7A 1QZ5A 4WQ4A 1BA1A 2P9PA 5EOYA 1YXQA 4F9OA 1MA9B 1TYQB 3H3OB 2Q1NA 3QBXA 2IVPA 2QWPA 3A5OC 2D1KA 3ATUA 4O5FA 2E1YA 1BU6O 3GE1A 1BG3A 3SMSA 1TUUA 4B1UB 1GLAG 1KAZA 2P9KA 3HM8A 4H5WA 1MDUB 4BRFA 4EIAA 3CI5A 5AFUH 2FSJA 3LDQA 3WEEA 2PAVA 4ISGA 3QMLA 4BRMA 5AZIB 2FF6A 2GWKA 2W41A 5AQHA 5ELZA 5FPDA 4K42A 2ASMA 4K41A 5AQQA 4FOEA 2A40A 5BRHA 3GG4A 3AAQA 4M7XA 1S22A 4YDUA 5F0XA 4MLEA 2FSNA 3UE5A 3VGMA 3ZETB 5KPRA 1BDGA 4FWOA 2UYTA 1C0GA 4J8FA 5FPEA 3FZMA 4H0OA 3D2EB 4H0TB 3VETA 2YJEA 4FL9A 4DHYA 2QWOA 5BRDA 4IO8A 4EHTA 3ID8A 5AQGA 1GLCG 1RDWX 4CZEA 1HLUA 3CHWA 4H0PA 4I6MB 1X3NA 2A41A 1JCGA 3D2FA 5AQIA 3UKUB 4BC3A 3A5LC 1NGIA 4WQ4C 3IFRA 3B8AX 3A0IX 3GDQA 1RGIA 5FPMA 3WXKA 5LJWA 4BRHA 5CE3A 3MN9A 4XH5A 2NLXA 1ATNA 4L3QA 4FWSA 4ISFA 3WUHA 5BPNA 4B1WB 3I8BA 4PKIA 3TPQA 1QQNA 1TYQA 3VF6A 5AZJB 3H1VX 3KVGA 3KZBA 2J4RA 5AQRA 2Q0UA 1GLBG 4IWVA 2F9WA 2F9TA 1Y64A 1Q18A 1RFQA 4CD3A 3WXIA 5KQDA 4O8KA 3O08A 4JAXA 1GLFO 2OANA 2P9UB 3U4LA 1TUYA 5AZIA 4B1XB 4BRLA 3L0QA 5LJVA 2ASOA 4BRDA 5EVZA 4DQ8A 4JHDB 3O80A 3HSCA 5FPNA 4YDUC 2ZGZA 1JCEA 1C0FA 1U2VB 4IJAA 4EAHD 4FWQA 1HPMA 3M3ZA 4BRNA 1BWFO 4B9QA 3ZETA 3M1FA 3W3DA 4HTLA 4WQ5A 1QZ6A 2YHXA 3LM2A 4CBXA 3GBTA 2IVOA 3BF1A 2QM1A 1HX1A 3GL1A 5JLFA 4I6MA 4BR5A 5AFUA 2A6AA 3UKUA 3LL3A 5E84A 1G99A 2A5XA 4GNIA 4FWNA 5EX5A 3VERA 2E1ZA 4QS7A 3SLCA 3DXKB 2E2QA 3AY9A 5AR0A 5BPLA 2GELA 3TU5A 1J6ZA 3A5MC 3H45C 2QXLA 3L4IA 3EN9A 2P9SB 4NB4A 2ZF5O 3A8YA 3DXMB 5AZJA 1BOTO 5AQKA 1HJOA 2I7NA 1YAGA 4MO4A 2YJFA 3H46O 4XH1A 4A61A 3MCPA 4BR9A 4CI6A 4HWIA 1QQMA 5BR9A 1HKGA 2AA4A 2P9UA 4BGAA 3U8XA 5KPZA 4M7YA 2FSKA 3CJ7A 1E4FT 3H1QA 3JXUA 3QBWA 3ZX3A 3P4IA 2ZGYA 3EKSA 3WQTA 1BO5O 4JHDA 2WUSA 4FWRA 4BQZA 4FWKA 3LDNA 3QFPA 3W0LA 3FZKA 2D4WA 3WT0A 3U9ZA 5BRFA 1U2VA 1CZAN 3CQYA 3BP8A 1P8ZA 1NMDA 2QWMA 3C0BA 4BC4A 1LCUA 2QW9A 5AQMA 4MLHA 3FE1A 2V7YA 4WQ5C 2P9NB 5AQFA 3MDQA 4H5TA 1V4TA 2QWQA 5AQSA 3VEWA 1SQKA 2Q36A 4FWPA 4H5VA 4EHUA 2V52B 4E1JA 4FSVA 1K8KB 3R9PA 3ENOA 3CJ9A 4IJNA 4BC2A 4CJ7A 4BVOA 3AAPA 3WXJA 2YHWA 2I7PA 2A42A 4CZIA 3BF3A 3WQUA 3VEOA 3VF4A 1EQYA 3CJCA 3DXKA 5E26A 4BROA 4BRKA 1T6CA 4JNEA 1ZC6A 5AQJA 2VWBA 3C7NB 2CH5A 4FOIA 4CZFA 3HTVA 3FZHA 3CERA 3H6EA 3UKRB 3CJAA 2P9SA 4BRQA 1H1VA 2GEMA 3VENA 3DXMA 4CBUA 1ESVA 4BREA 1KXPA 2IIRA 4DB3A 2P9LB 2PBDA 5F1XA 2D0OA 2GTDA 3BUZB 3A5NC 4QS8A 3R8EA 4B1ZA 2Q0RA 1NLVA 4A2BA 4DCHA 5BN8A 3BEXA 1OKJA 1DEJA 4FPAA 4RWTA 1IJJA 2HF4A 1LOTB 2E2OA 3VEYA 3AARA 3FLCO 5AQOA 4JD2B 4Z94A 4IXCA 1R59O 1NBWA 2GUPA 3CIPA 1HKBA 3O1WA 4H03B 4H5RA 3ZX0A 4RCHA 3UB5A 2KHOA 2E8AA 4CZKA 2NZTA 5AQWA 4AM6A 2P9IB 3LDOA 3ZEUB 1ATRA 4BR4A 1E4GT 2E20A 4CZGA 1BUPA 2QWNA 5B8HA 2VYPA 2P9NA 3LDLA 1NGEA 3VGKA 4BR7A 2YI1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SKSA 1RILA 1GOBA 4GW6A 2RKIA 3P5JA 4JKHA 4KHPK 4ELTA 1U6ZA 2Z1HA 3J7YP 3L2RA 4MO5A 2NRVA 4LC9B 1JJ2M 3ENBA 4W5TA 3I33A 1B9DA 1RT4A 2HMPA 4FJKA 2YKNA 1VQMN 4FJGA 4M3UA 4CF8A 4FJJA 3K9JA 4A2AA 4OGEA 3ZSQA 1L3SA 4KTWA 2EWSA 1NWKA 1JLFA 3UKRA 1BL3A 1IKWA 3QESA 4FJMA 5KQ8A 4JKGB 1EKEA 3VQEA 3KWIA 1N5YA 4Q0BA 1BIZA 3HI0A 4M3TA 5GIOA 4EFHA 2QWLA 3QERA 4IEIA 5EU7A 4O5BA 3AA3A 3AVNA 1C0MA 1IKYA 4NCBA 3J80O 3TAMA 1YVNA 1QVFM 1ASVA 4HTUA 4PL7A 4CGIA 3EKUA 1L5UA 1WSGA 3HP6A 3KWGA 3HXMA 2BH1A 4FJ7A 4H0XB 2Y1IA 3K9KA 4BDPA 3TARA 1VSMA 1CXQA 3OJSA 1WBBA 1RT1A 3O6WA 4CGGA 3HYFA 3K58A 1JCFA 3IAYA 2HHQA 3A2FA 1X9SA 3JS6A 1BA0A 4AHRA 1XUPO 1KAYA 3OYNA 3Q7BA 4BC5A 4BRAA 3CCVN 3F9KA 3SMPA 4G1QA 3T1YK 2AJQA 2JLEA 3NH2A 5M1KA 1U4BA 1QQOA 2F7TA 4WYBA 1T6DA 3K5OA 3KKSA 3TTDA 1NKCA 2WBNA 3CPWM 3KJVA 1S1TA 3QEIA 3MXMA 4CD1A 2VG6A 4YNQA 1X9JA 2OA8A 1JL2A 3CJBA 4JRQA 1ZBIA 5BN9A 3O1BA 4BDYA 4ILJA 3DLLL 1Z6RA 1W9HA 5DM7L 2W40A 3PY8A 3VEXA 4DV1K 4ISEA 1BCOA 2RE2A 4C8OA 1HMVA 2Q3SA 4CZHA 4FZYA 4FJNA 4DV7K 1IBMK 3HZ6A 4X65K 3BZCA 4J2EA 2P5GA 4CGFA 3QINA 4FVUA 5GINA 1CZ9A 1YT3A 4OKEA 4DG1A 3CXCM 1Q81O 4JS5A 5AQUA 3CJ1A 4Z4CA 4DR2K 1Q8IA 1YI2N 4FK4A 3VQ6A 1WLJA 1GOAA 1DKGD 3DLBA 1RDDA 2YNIA 4K25A 4OKKA 2UXCK 2P1JA 4CJ4A 4CZJA 5TKYA 1ZBLA 3QO9A 3ULEA 1HKCA 3ZSZA 4DUZK 3P83D 3OBWA 4QCLA 3WNEA 1NM1A 1KSPA 1VQ7N 4PQUA 3CETA 4DSKA 5M1QA 4CJVA 1LAVA 3S3OA 5LL6Z 3K5MA 1RTIA 3ZSWA 4FW2A 1JXEA 2OPPA 4YOTA 4CK1A 1BA1A 2E4LA 3PX0A 3OVNA 4E7IA 3L3VA 3TTFA 3H3OB 3NBPA 2Z1IA 2QWPA 1RBVA 3A5OC 2D1KA 4M45A 1S6PA 1TUUA 1EWRA 3SUOA 3AVIA 1L3VA 4NXMK 3FFIA 3E1YA 4EIAA 4LD0A 3F5TA 4EP5A 4IOXA 2OZSA 3NAEA 1G15A 4BRMA 4DS5A 2W41A 5AQHA 5C2DA 3SJJA 5FDLA 4B3RK 4K42A 5AQQA 2NRRA 3Q7CA 5K14A 1S72N 3PUFA 1FXXA 4DU1A 1HR0K 4DV4K 1WNSA 1NG9A 1BDGA 1LWFA 1TV6A 1C0GA 3CCMN 4AHVA 1C1BA 1XMOK 3DLGA 4J8FA 4H0OA 4H0TB 1TL3A 2YJEA 3BY5A 2UU9K 1U45A 1GLCG 3T7ZA 5IWAK 4CZEA 4H0PA 5J2PA 3CFOA 3VA3A 5AQIA 3D2FA 2HB5A 4BC3A 3A5LC 1YJWN 1NGIA 4WQ4C 4B9LA 2Z1GA 3AA5X 5LJWA 1B9FA 4XH5A 4YHHK 2VQEK 5GAHP 4Y1DA 4FWSA 3WUHA 5GAEP 4JI7K 3KK2A 1QQNA 3KKRA 3J81O 3D6RA 4FJLA 4KFBA 5AQRA 1GLBG 4IWVA 1RFQA 1HNVA 4O8KA 3LWLA 1O1WA 2IDOA 4JKFA 4GVMA 4BWJA 3SYZA 4DTOA 1TUYA 5AZIA 3P1GA 5LJVA 4BRDA 4O44A 1TKDA 4FJIA 1WSJA 5FPNA 3DMJA 4YDUC 3MX5A 2OPSA 4FK2A 2YV0X 4IJAA 2ZJRL 1NJZA 3HSTB 3VQPA 4JRPA 3W3DA 3H08A 4A5AA 1IBKK 2OPQA 3LM2A 3T69A 4CBXA 3GBTA 4LH4A 2HVHA 3GL1A 4B8CA 4O55A 2A6AA 3PO5A 3AA2A 4L8RB 5LMUK 4CERA 4B9TA 4BACA 4JI5K 3ID6A 1VSJA 4PY5A 3DXKB 5C0YA 1S1XA 3LP0A 4ICLA 1EXQA 2NUBA 3VN5A 4FLUA 1JLQA 4AILC 5LMNK 3EN9A 1RBRA 1RDCA 4B3MK 2OPRA 3DXMB 4M3ZA 4FM1A 3RMCA 4DR1K 1BCMA 4OJRA 2YJFA 5C12A 3ZSVA 1NJWA 3O4NA 4XH1A 2HW3A 4BR9A 1SKRA 2QKBA 1VSEA 3V9ZA 3VQ7A 3U8XA 1A5XA 4YOWA 5GIPA 4M7YA 3AVKA 1IG9A 3H1QA 3JXUA 3WXMB 2WFBA 3WQTA 4BQZA 4JHDA 4R5PA 2WUSA 3QFPA 2YKMA 4U7BA 5BRFA 2D4WA 4A59A 1NOZA 5H1SQ 4CEAA 2VWJA 3SZ2A 4FJ9A 3BP8A 3HPHA 4DQIA 5JVGL 1EO1A 4WQ5C 2JWKA 2B5JA 4CFAA 4ID1A 2GBZA 4H5VA 5FLXO 5T7BA 5HROA 4B3SK 2NRTA 3NHGA 3ENOA 4BC2A 3AAPA 5JS1A 1Q86O 1C0TA 3VA0A 1EQYA 3ZT1A 3DM2A 3KLFA 4CK3A 2UXBK 4E19A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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