4IXCA

Crystal structure of human glucokinase in complex with a small molecule activator.
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
447
structure length
443
Chain Sequence
NSQVEQILAEFQLQAADLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHAAASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Glucokinase isoform 3
publication title Matched triplicate design sets in the optimisation of glucokinase activators maximising medicinal chemistry information content
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 171
structure length 443
sequence length 447
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ixcA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4ixcA01
3QFPA 1BWFO 3ZX0A 2E8AA 4BQLA 4CZHA 5FPMA 4KBOA 4H0OA 1NWKA 1SQKA 2P9SA 5AQOA 2QWQA 3M3ZA 2HOEA 2QXLA 3O1WA 1HKCA 3H3NO 2Q31A 2P9IA 1DEJA 2HMPA 3EKUA 5EX5A 1JCEA 4CZIA 5AQHA 4BRPA 2CH5A 2P9LA 3RSEA 2V7ZA 2V52B 3H1VX 1T44A 5CE3A 3UB5A 4CZGA 4DCHA 4A2BA 5F1XA 3EL2A 2FSNA 5EVZA 1C0GA 5AZIB 2Q97A 2QM1A 3J8AA 4JNEA 3FZMA 1QHAA 3GBTA 3FZFA 3LDQA 4CZEA 3CERA 3DJCA 1HKBA 4CD1A 1WUAA 1NGCA 4H0XB 2UYTA 3WXLA 5JICA 3AAQA 3H3OB 3O6WA 4BRQA 3IUCA 4BC5A 3FE1A 4B1WB 4RTFD 5B8HA 3SLCA 2YCHA 3A5OC 3M1FA 2YJEA 2Q0RA 5AZJB 4JN4A 3TPQA 3U9ZA 3ATUA 2ZGYA 4A61A 4FPBA 1T6CA 1DGKN 4BQZA 3WEEA 3IFRA 2E2NA 1X3MA 1YVNA 3QBWA 2J4RA 4XH5A 3VENA 4BRAA 3MN7A 5F2RA 4BVOA 3BF3A 2E2OA 4JHDB 4BR5A 3MK6A 2PAVA 3JS6A 3DXKA 2YHYA 2DPNA 2GELA 2VWBA 3ZX2A 2A41A 5AQRA 5AQYA 4EIAA 2I7NA 3I8BA 2D4WA 4ISFA 5BPNA 4NB4A 1ZBSA 5TKYA 2FXUA 4XH4A 4BR4A 4XH1A 4H0PA 2P9KB 1NGFA 4MLHA 3VPZA 1XQSC 4BRGA 3A8YA 3BF1A 2P9UA 4IZ9A 2H3GX 3MCPA 4HWIA 4B9QA 5AQZA 3EN9A 1WOQA 3UKRB 3GOIA 2P9PB 5BRFA 1K8KA 1NGBA 3CIPA 5AFUH 3VEZA 5JLFA 3A5NC 3D2FB 4BRFA 3ENOA 1GLCG 4FWPA 5AQLA 3VESA 3L0QA 2E1YA 5AFUA 3CQYA 3SMSA 2ASMA 1NGJA 2I7PA 3A0IX 4QS8A 1HJOA 1JCGA 1OKJA 1J6ZA 5FPDA 1TYQA 2FF6A 3H1QA 3DWLA 5AQKA 3WT0A 3ZETB 3O80A 2GUPA 4DHYA 1TUUA 3CJCA 3MN5A 4FOIA 3M6GA 5BRHA 3SJHA 4BC2A 3VETA 1GLLO 3VF4A 2ZF5O 4GNIA 3WQUA 3H46O 4I6MB 3FR0A 1BA1A 3VGKA 3HBTA 2D0OA 2A42A 1NGDA 2W41A 3WXJA 1Q18A 4ISEA 4M7XA 3EO3A 3ID8A 3ULEA 2CGKA 4CZLA 2V7YA 2Q1NA 3KVGA 2P9NB 2E1ZA 4EHTA 4H03B 3DXMB 2AA4A 1KAZA 2BUPA 3ZEUA 1H1VA 4FWRA 3UKUB 4EAHD 1Z6RA 3ATVA 3C7NA 3QFUA 1U2VB 4H0VB 3C0BA 1V4TA 2FSJA 4IXCA 1YAGA 1TUYA 2Q0UA 3I33A 4WYBA 1EQYA 3LDNA 2VYPA 4FWQA 4EFHA 4H5NA 1X9JA 1QQOA 3S41A 3CHWA 1HX1A 2FSKA 3CQXA 2YI1A 4H0YB 2AP1A 4FWSA 1HKGA 1HUXA 4FO0A 4BR0A 3AY9A 4DB3A 2E2QA 1MA9B 2V51B 5ADXH 4IJNA 4WQ5A 4WQ4A 5KPRA 4ISGA 1BG3A 4BGBA 4A62A 5LJVA 4CZKA 4BRMA 1NLVA 1U6ZA 1QZ6A 3GL1A 2A3ZA 4PKIA 5ADXA 5AQUA 4O5FA 1GLJO 1XUPO 3IDHA 3D2EB 3G25A 3FLCO 4PKHA 3TU5A 1LOTB 2YHXA 5JMVA 5BRDA 1BA0A 1YXQA 4H5VA 2OANA 2W40A 3VEWA 3CJBA 2QWOA 2F9TA 3UE5A 1LCUA 4BRHA 2A40A 2NZTA 4BC3A 1KAXA 3QBXA 2ZWHA 2QW9A 3GDQA 5KQ8A 4CJ7A 4C23A 3O8MA 4CZMA 1C0FA 2Q36A 3CJ1A 4H5TA 5AZIA 3MN9A 1S3XA 4MO4A 4BREA 3EZWA 5AQFA 2ASPA 1RFQA 4FWNA 3A5LC 5F0XA 3LM2A 4MLEA 4RWTA 5AQMA 4JD2B 3EKSA 4K43A 4BGAA 5KPTA 4HTLA 4FL9A 4J8FA 1P8ZA 1GLFO 2D0PA 2D1KA 5AQVA 3LL3A 1Y64A 5E84A 4QS9A 4K41A 5AQTA 3SK3A 4B1ZA 3AAPA 4F9OA 5AZJA 4K42A 3HM8A 4IWVA 1E4GT 3FZLA 1BO5O 2GWKA 4B1VA 1S22A 4BROA 2QWPA 4WQ4C 4WQ5C 3O5BA 3VGMA 3LDLA 2P9SB 4JAXA 2IVPA 3BP8A 1SZ2A 4PL8A 1GLEG 4YDUA 4JHDA 2P9IB 1RDWX 2CGLA 3HSCA 1QQNA 4H5RA 1NBWA 4Y0WA 2P9LB 3RSEB 1KXPA 1MWMA 1V4SA 3U8XA 4E1JA 2HF4A 3F9MA 4BG9A 2EWSA 2A6AA 2E20A 3MMVA 2YHWA 4BR2A 1ATSA 4BRNA 5AQJA 1ATNA 3GG4A 5AQPA 1Z05A 5EXWA 2P9KA 3KZBA 2IVNA 3KHYA 4B1XB 5KPZA 1ZC6A 3VEOA 4H5WA 4AM7A 5KQDA 2WUSA 3FGUA 4FWMA 5AQIA 2A5XA 1T6DA 4BR9A 2FLOA 1R59O 2CGJA 4RCHA 3UKRA 1D4XA 2P9PA 3CJ7A 3CI5A 3D2FA 3W3DA 2YJFA 3LM9A 1JCFA 1NGIA 3HTVA 3O1BA 3WUHA 3O08A 2E2PA 3VOVA 5BPMA 4FWOA 3WXKA 2QWMA 3U9DA 4A2AA 3VF6A 3WEEB 3O4WA 3ZETA 1IG8A 4BVPA 4PKGA 1QQMA 3R9PA 4CD3A 4BR7A 1X3NA 3A5MC 5E26A 1RGIA 3QB0A 1ESVA 4BRCA 4FSVA 4XEIA 2FF3B 3DXKB 3LDPA 4L3QA 2ITMA 4I6MA 1HPMA 3JXUA 4YDUC 4M7YA 4NO7A 4BRDA 4CI6A 3VEYA 2GWJA 3BUZB 2Q2RA 1QZ5A 5BN9A 2P9NA 2HF3A 3VEXA 4AM6A 5BR9A 3DXMA 2PBDA 5I9EB 3WXIA 1ATRA 2P9UB 3UKUA 4CZFA 4PL7A 1U2VA 3QDKA 1HLUA 4FWLA 3MDQA 1K8KB 4FOEA 3GE1A 3ZX3A 3VEVA 5LY3A 3MN6A 1NGEA 5AQGA 4LC9B 3L4IA 3R6MA 4CZJA 3DAWA 1NGGA 5BN8A 1NMDA 5BREA 2QWRA 1E4FT 3H6EA 1TYQB 3SMPA 3AARA 2GEMA 3FZKA 3WQTA 3BEXA 3FFKB 4H0TB 1BU6O 3CJ9A 1MDUB 1NGAA 3VERA 3B8AX 5AQXA 2IIRA 5FPNA 2GTDA 3VF2A 3D2EA 5EY4A 2QWNA 1SAZA 4DQ8A 2IVOA 3CJAA 1NM1A 4BRIA 4BRLA 3QICA 1CZAN 3HZ6A 4CBWA 3QMLA 2CH6A 2NLXA 3VGLA 3HI0A 4FPAA 3ULEB 4MO5A 1BOTO 1ZXOA 1BDGA 3L6QA 5AQNA 4EHUA 3ZEUB 2ZGZA 1IJJA 5BPLA 2KHOA 2NRHA 3C7NB 2BTFA 4FWKA 4IJAA 3LDOA 3IMXA 4CBUA 5AQWA 4O8KA 1GLBG 4BC4A 1NGHA 4QS7A 4CBXA 3P4IA 2VCPA 1YUWA 4JD2A 4BRKA 1GLDG 5ELZA 5EOYA 4Z94A 4B1YB 3ENHA 1MWKA 2ASOA 4K25A 1BUPA 1XC3A 3W0LA 2F9WA 1G99A 1KAYA 3OHRA 4B1UB 5JLHA 3R8EA 4IO8A 3U4LA 5LJWA 5FPEA 3CETA 1DKGD 1GLAG 4M63C 4BG8A 5AQQA 5AQSA 2QWLA 3D7EO 5AR0A 2E88A 3FZHA 4GY2B 3H45C
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2UXCK 3WNFA 1BWFO 1QTMA 5HRSA 2E8AA 2ITGA 4KBOA 4AHTA 1U49A 1SQKA 5AQOA 4DR3K 2EHGA 2HOEA 3VA3A 4DQRA 1HKCA 3H08A 3H3NO 3IKMA 3CG7A 2P9LA 3F9KA 4GKKK 4M3ZA 2A1SA 3SUNA 3H1VX 4ILHA 2QEXN 3QO9A 3UB5A 3VQPA 4CJEA 1REVA 4O0JA 3AVHA 2FSNA 5GAGP 2Q97A 1VSFA 2QM1A 4LF7K 1FJGK 4R5PA 4O55A 4JKHA 1W7AA 1T8EA 3BZKA 1W97L 3DJCA 4B3TK 3O4QA 1NGCA 3WXLA 5JICA 3CPEA 4DU1A 4BRQA 3BZCA 4HCBA 1VAZA 3T1HK 3SLCA 3K2PA 3E9PA 3O9QA 3ISNC 5AZJB 3VTHA 1HYSA 3CM5A 3TPQA 4A61A 1B9FA 1DGKN 3V9ZA 1S72N 3RMDA 1YVNA 4M3RA 3QBWA 2KFZA 2OCEA 3AVMA 2J4RA 2W6LA 3OTOK 4BRAA 1BIUA 4JK8A 1J53A 3T19A 1O1WA 4JHDB 3TSQA 1HNVA 4F2SA 3MK6A 2YHYA 1P90A 4KI4A 3ZX2A 4FZXC 4ELVA 1RBUA 1OH5A 1UOCA 3LALA 3LP3A 1IG9A 4IFVA 3QEWA 3OYLA 4BR4A 4E7KA 1NGFA 3VPZA 1XQSC 4QOZB 5TKWA 1HNIA 3A8YA 3SYZA 2H3GX 4HWIA 5M1QA 3L4QA 4CJQA 5GIOA 5BRFA 1K8KA 3CIPA 3CCVN 4KH5A 4UQGA 3QIPA 5AQLA 4MQ3A 4BE1A 1U45A 1QS4A 3AVAA 1T05A 3IS9A 3SMSA 1NK0A 3EYZA 3KK7A 4FJ8A 4M3TA 3A0IX 4QS8A 4CIEA 3OS0A 4CFBA 3OYCA 2FF6A 4DFJA 3CYMA 3H1QA 1RT7A 1LV5A 5AQKA 5FDLA 3V6DA 3AVNA 4DHYA 4DMNA 3K5OA 4FOIA 3M6GA 4CK1A 1C1CA 4HHTA 4CHNA 1GLLO 3FR0A 1SKWA 1IBLK 3E66A 5KTQA 3NH1A 3SI6A 2A42A 3WXJA 1Q18A 4M7XA 4I9QA 3ID8A 1YHQN 1EWRA 4OGCA 4QAGA 1YIJN 2JWLA 2V7YA 4RW8A 4GW6A 2Q1NA 3RMCA 4H03B 4OO1J 4FLTA 2AA4A 2BUPA 3ZEUA 3Q7CA 4C1NK 5LL6Z 2UXBK 4H0VB 2F96A 3HL8A 5HRRA 4B9NA 2O8BB 3MAQA 2Q0UA 4B3RK 1TKXA 1RBRA 5MLCQ 1QQOA 4O4GA 4DS5A 1HX1A 1XHZA 1RDBA 4DFMA 3CQXA 3TAMA 4DF8A 2YI1A 1OH8A 2AP1A 4OPJA 1VQMN 1LW0A 4KTQA 2NRZA 4DB3A 2XY5A 5ADXH 4HCCA 4WQ5A 4FW2A 3F2KA 3ITHA 4N47A 3L2UA 1T7PA 1NLVA 1Q81O 1R0AA 3GL1A 2A3ZA 3J80O 5GADP 4WFNL 3ZCMA 1CLQA 3L3VA 3DLKA 4CK3A 2BANA 1QSSA 2KZZA 3FLCO 4PKHA 2I5JA 4KKOA 4X64K 4JI5K 4IG0A 2QWOA 4X62K 1BCOA 2NZTA 4YOVA 4FZYA 3QBXA 3GDQA 5KQ8A 3QNOA 3V1QA 4CJ7A 1N6QA 3CD6N 4WF9L 4YHHK 3VQ4A 1TK5A 2QK9A 4BREA 1G15A 3Q7BA 5M1PA 4K8XA 3AA3A 3KKSA 4B9TA 4L8RB 2QKBA 2IGIA 4RWTA 3K5LA 3TSPA 3EKSA 4MDBA 4DTUA 1HYZA 3T3FA 1SUQA 2D1KA 5AQVA 4FJGA 1JLAA 4CEDA 3F73A 3VQ7A 4CJWA 1VSLA 5AQTA 3SK3A 4B1ZA 4K42A 4CK2A 1CXQA 3HM8A 4IWVA 1E4GT 2WBNA 3HM9A 2HBJA 2XY8A 1B92A 2GWKA 4X66K 4WQ4C 3M5RA 3F5TA 1KLNA 4W5NA 3MCAB 3TAEA 1YF5L 4HVJA 1I3AA 1SZ2A 4PL8A 2HBLA 3OYGA 1C1AA 4YDUA 4KREA 1ZBUA 4KHWA 3HSCA 1QQNA 4H5RA 4Y0WA 2P9LB 3OA9A 1TV6A 4E1JA 3OBWA 3OVNA 2A6AA 2PYLA 4LFCK 4BR2A 4DV3K 2D0CA 3NE6A 5AQJA 4OPHA 5AQPA 1Z05A 3I55N 1UA0A 2P9KA 4FLWA 1FXXA 5KPZA 3VEOA 4H5WA 3ULDA 4CJVA 1SS6A 2WUSA 4CHPA 1T6DA 4BR9A 4N56A 1D8YA 1L5UA 3HVRA 4KHQA 2CGJA 4CEEA 3UKRA 4IKFA 2P9PA 3CJ7A 2W6KA 2P5OA 3ZT1A 2YJFA 2ATQA 3L3UA 4A5AA 3QLHA 3O9TA 1JCFA 3SUPA 3IRXA 4CGIA 4DTJA 4DUZK 1WSEA 3U9DA 3CMEN 2ZJRL 2LSNA 1IG8A 4PKGA 5HRPA 3R9PA 3HSTB 4DG1A 3A5MC 5E26A 4CHZA 1WSFA 2BGGA 2VG5A 2F8SA 4DV2K 2AJQA 4YOUA 1RTIA 4FSVA 4JKFA 4XEIA 2D0BA 1EX4A 4I6MA 3CQ8A 3DLGA 2BE2A 3ENBA 2F8TA 4CI6A 3TAPA 3CCJN 4IDHA 5C0YA 3OYHA 2OPPA 1QVFM 1HR0K 1QZ5A 3T7ZA 3CC4N 4AM6A 2X78A 3PX0A 1QVGM 1CXUA 4PL7A 3QDKA 1HLUA 4FWLA 4E19A 1K8KB 3B6PA 4JKBA 3T1YK 3VEVA 1VSMA 2ZE2A 3MN6A 5AQGA 5AJ3K 1YVUA 1NGGA 5BN8A 4CECA 1YI2N 2OZSA 4KHSA 1Q9YA 4FJ5A 1RDCA 3SMPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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