4IXXA

Crystal structure of s213g variant dah7ps without tyr bound from neisseria meningitidis
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
340
structure length
340
Chain Sequence
KIKEVKELLPPIAHLYELPISKEASGLVHRTRQEISDLVHGRDKRLLVIIGPCSIHDPKAALEYAERLLKLRKQYENELLIVMRVYFEKPRTTVGWKGLINDPHLDGTFDINFGLRQARSLLLSLNNMGMPASTEFLDMITPQYYADLISWGAIGARTTESQVHRELASGLSCPVGFKNGTDGNLKIAIDAIGAASHSHHFLGVTKAGHSAIVHTGGNPDCHVILRGGKEPNYDAEHVSEAAEQLRAAGVTDKLMIDCSHANSRKDYTRQMEVAQDIAAQLEQDGGNIMGVMVESHLVEGRQDKPEVYGKSITDACIGWGATEELLALLAGANKKRMARA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase
publication title Neisseria meningitidis expresses a single 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase that is inhibited primarily by phenylalanine.
pubmed doi rcsb
source organism Neisseria meningitidis
total genus 127
structure length 340
sequence length 340
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date 2013-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ixxA00
1IIGA 4AHPA 3MHFA 4BR1A 3W75A 1GTEA 3TXVA 3BLIA 3TE9A 1L6SA 5D37A 1LROA 4Z1AA 3W84A 1H50A 8TIMA 1JRCA 3OVQA 4WY0B 4CNPA 4UFJA 1ZJIA 4YWIA 3W7CA 3NPUA 4AF0B 2V2HA 3VE9A 1IXPA 1NEYA 2C1HA 2QJHA 3O06A 3LCXA 5K9DA 1KBJA 4Z0SA 4AAJA 4DO6A 3QSRA 3NQGA 2H3DA 3BLEA 4WOZA 3G3MA 3UPWA 2FFCA 1J5TA 3W9ZA 1OHLA 3NL3A 2YR1A 2TRSA 4IX2A 3TQKA 4YLWA 3FOKA 2A6NA 5I3IA 1PS9A 2QCMA 4MJZA 5G2HA 3WK0A 2ISVA 2PE4A 1NVMA 2R94A 3M7WA 4LRSA 1WOBA 3O6CA 3OVRA 4MLRA 3G0SA 1E51A 4OE7A 2TPSA 4N2YA 4ZL1A 4LS0A 1WBHA 3BW2A 5HWNA 5C5YA 3LERA 1QPNA 1UJPA 2FJKA 1FBAA 3NXFA 1KM2A 3BK0A 1GVQA 4JEQA 4K39A 2C13A 3GK0A 1DJQA 3W1QA 4ZQOA 3FLUA 4R53A 1UUMA 5HNRA 2A4AA 1H60A 1RPXA 2WNQA 4HSNA 4JX6A 3TIMA 4EIVA 4BF9A 2GPTA 2XN0A 5LKYA 3GAKA 3GAYA 2J88A 3OA3A 2GOUA 1FWWA 4O4VA 2WV8A 3HG4A 2EPHA 2YFOA 2G96A 1K03A 2ZBTA 4JS3A 3G1SA 3L65A 2BZNA 1YXDA 3C2RA 5BNKA 5D04C 4JICA 1OFOA 5D33A 1K8XA 2TSYA 4FX6M 2NWSA 5L9FA 3MP3A 4GC4A 3WK3A 3RNDA 3GIYA 3M47A 3UXAA 5LNRA 4CQAA 1O95A 2RDUA 3P62A 3E12A 4UFLA 5DLCA 3VKJA 2FPYA 3NPWA 4WY0F 3A23A 2E68A 1GG1A 3NQFA 4GFSA 3STFA 3C6CA 2YW3A 1T0OA 2X1SA 1GVSA 2E6YA 1A53A 3W73A 3ZS4A 1XUZA 3C0JA 3UNDA 2NV1A 4OU1A 1YXCA 4JDBA 3TU9A 4FXRA 1H5YA 4UR8A 2WNNA 1Q6LA 3U8GA 3ANYA 4XTIA 3ZR4A 2W0UA 3PWAA 3PUDA 2QJIA 4RZ5A 5D03A 3KFTA 5D32A 5KSWA 1AW5A 1N8FA 1PVNA 3OBKA 4DELA 2NXGA 3P8IA 4RZ6A 2I9EA 3JS3A 5LZLA 3OVPA 3T55A 3W7IA 4ALDA 3NQCA 4WX2A 2VENA 4LRTA 3TR2A 3GDTA 4MOZA 4MYXA 5AHFA 2Q8LA 3G18A 4PL2A 3W7RA 1WQ5A 5K2ZA 3GKFA 2BX7A 3NQDA 5AFDA 1ZALA 5IBXA 1FDYA 2B7PA 3PSWA 3C2VA 3PBVA 4NXKA 2CLEA 4NXSA 3F03K 1AW2A 3KVJA 1G7VA 3B06A 3QQ1A 4RK8A 1K3UA 4JTSA 1HTIA 1G6CA 1SSGA 3ZFHA 1I2QA 4AXKA 2V30A 3DFTA 2JKPA 1OFRA 3W2UA 5J5DA 2Y88A 4PC8A 4LV4A 1JJKA 4UXDA 4TO8A 5I3HA 3BV4A 2CLOA 4CQ9A 4LUJA 2I14A 4JX5A 1M5WA 3L0KA 4LWWA 4QM1A 4NNAA 5IM51 1XBVA 5HR6A 3STEA 5F1VA 1AMKA 5EYWA 1BKSA 3TQVA 2B7OA 3MO7A 3DHDA 3MBFA 3BARA 3G1AA 2Q3OA 5AHLA 3MYPA 4ZZ9A 3N3MA 1EPXA 2ZA2A 4UFKA 3UWZA 3USBA 2EGZA 1KTCA 3MI6A 3LV5A 5CSSA 5AOUA 3L2IA 2O7SA 2J9XA 2AQWA 1EWDA 3W7DA 4IQLA 3PAJA 2ALDA 4HSOA 1Y0EA 2E6AA 3WJXA 2DZTA 1O94A 3FYPA 3LRMA 2IQTA 4ZVJA 4LVDA 3QW4B 1JQXA 1SO4A 2J27A 4AF0A 4OV9A 3NL2A 5DY2A 4I9AA 4O53A 1IXQA 5HINA 2ZTJA 2Y62A 1HFBA 2R14A 1S5TA 3HBLA 1H7WA 3C56A 2VFFA 2ZRUA 2FPTA 1QPRA 1TYGA 3P74A 1TPVA 3G24A 5G4EA 2ZYFA 3GNDA 3LHZA 3NQ6A 5U7SA 2BSLA 1NF0A 2NX1A 5IBXC 2B0MA 3M44A 1U83A 1QO2A 4Y8FA 4LC8A 1M6JA 3MBDA 1VHCA 1WAUA 2WSRA 3GNNA 3SIZA 3EB2A 1PL9A 2JBMA 1YADA 1ZNNA 2Y70A 3GYEA 1SW7A 2OT1A 4DPQA 3CPRA 1HG3A 4XUGA 1XDLA 3SSJA 3QEZA 3C2FA 3CM4A 2QEZA 1B9BA 1MZHA 4ADSA 5D2WA 3NPXA 4CCDA 3N9RA 3LHUA 3L0GA 4M6VA 4GRSA 2QJGA 1PV8A 3CEPA 1VGAA 5G1YA 1QAPA 5K9XA 2V81A 4P61A 3BG9A 1DOSA 3D0CA 4TIMA 3PBWA 7TIMA 3LCGA 5AC8A 5AHIA 3LCHA 3DFSA 4ZQNA 3TROA 3NL6A 3M5XA 2FPVA 2RHGA 2A7NA 4RCXA 2VEKA 3T7VA 1LLWA 2E6FA 3CWOX 1AW1A 4FNQA 1ZCOA 3ATZA 3DENA 1R2TA 1XFBA 4K7YA 4DF1A 4A2SA 1LBLA 5F2LA 1CI1A 3HJZA 2PCQA 4JTFA 3NGJA 3GDMA 1G69A 5J5RA 1YPFA 2X1TA 2VFGA 3O05A 1EIXA 2ABBA 3M41A 1EP3A 4JGDA 3L5LA 1OFQA 3O6YX 4OQVA 3B0VC 3HIJA 3TFXA 1DQXA 4Z0JA 3U6WA 1XDMA 3NQMA 1K02A 2VC6A 4O11A 4ADTA 1W1ZA 3BG5A 1EP2A 3W71A 4EOUA 1YXYA 1LTDA 2ZA3A 3W7GA 1JCMP 1FWTA 4IJBA 1FXQA 3VE7A 4PH6A 4AVFA 1S5WA 1I2NA 1VZWA 3O15A 1FCQA 3LHVA 3LHYA 5BMXA 3G1HA 3WK2A 1TTPA 3LOTA 1W54A 1OK4A 1O60A 3N2MA 4CQ8A 3IGSA 2V9DA 3EX1A 2HTMA 2CFFA 2ABAA 2ZRZA 1ME9A 3DFPA 5G2IA 3EWYA 2HSAA 4OBTA 1P1XA 1HO1A 2F84A 3N73A 2VFDA 2GQ8A 1W37A 1R2RA 2QCHA 2GVLA 1LBMA 3S0CA 3BGJA 3MI3A 3W70A 1LORA 4JY9A 1L6YA 1T96A 1TTIA 2RDWA 3L67A 4O18A 1OK6A 4NX0A 4O54A 3W7PA 4UC5A 2NUXA 4NJIA 1UASA 4NNBA 3G1XA 1KM5A 3SI9A 4A3UA 2JKAA 4FIQA 3QPYA 3TW6A 4EF9A 1OABA 3W86A 1SSDA 3CIWA 1HO4A 1BTMA 4JY8A 4M7SA 1ZAIA 4K37A 3HB9A 3KVLA 4LVFA 1PIIA 1GT8A 3PBYA 1F7BA 4KWVA 1TTQA 5DXYA 3W2LA 4UMCA 2H90A 1FCUA 4O0ZA 2QDGA 3MHUA 3GVGA 4Q4KA 1W3IA 3W7JA 2C14A 3GDLA 1SZEA 1WBJA 3T40A 1MEIA 2ZDRA 4X3ZA 1GWJA 4UMAA 3GXNA 1QO5A 3S6DA 1THFD 4Q33A 5BW6A 2VEMA 3JR2A 3P60A 1HUVA 2FB3A 3W74A 4UTHA 2YSWA 1A5BA 3PF3A 4K6AA 4DO5A 4O14A 3EWWA 4UNKA 1F74A 3TMLA 1TPWA 1SZGA 4FB7A 4IOTA 4NT0A 4PA8A 3W22A 3BW4A 4UFIA 4IMEA 1W56A 3S1VA 1Z48A 3QPZA 4UTIA 5EMUA 3PR2A 3IGXA 1H51A 4GUJA 5LHFA 3FS2A 3LX9A 2AAMA 1GEQA 3SZ8A 2NX3A 3GLCA 1G4SA 2A85A 3W2NA 4N9CA 2WO5A 4HNVA 1MXSA 3CHVA 1TB3A 1QPQA 4JYEA 2Z6JA 3DFNA 3NQAA 3BVJA 4WD0A 3UWUA 5LGZA 3P5YA 4FF7A 1H7NA 2Y63A 4O13A 5DCDA 5BOOA 5G2WA 5AHNA 1QNVA 4IMGA 3PSVA 1W5PA 5HUPA 2A1YA 2JKEA 1KW1A 2X16A 3E02A 5H2ZA 4M6QA 2PRLA 5C6MA 3ABQA 4QNWA 3W1RA 4AHOA 1OFAA 3HG2A 1W5OA 4RR4A 3NA8A 1UUOA 4YCPA 1VYSX 3BW3A 2Q8ZA 2ZZ4A 4HKPA 5F4WA 3MYOA 1YYAA 5D2XA 3G0XA 3VFLA 3SGUA 4WUIA 1JULA 2C16A 2ZA1A 4MZ1A 4ONVA 3WK1A 3G0UA 2VFIA 4L4LA 2C0AA 2YZRA 1XI3A 4UTJA 3L5AA 2QAFA 3DAQA 4JIPA 2J24A 3EWXA 1XBYA 4UTMA 5D2VA 5CG7A 3IEBA 3TC7A 4A29A 4JNMA 2ZZ6A 3UWYA 3M0ZA 1QCWA 5HJLA 3B04A 1QPOA 3TC6A 2QR6A 1R30A 1LRTA 2EKCA 4FIRA 1VS1A 3BO9A 4O12A 3SGZA 4AB4A 1JR1A 2W6RA 1XBXA 4LVBA 2VEIA 4O50A 3LTYA 2DORA 3W2JA 2CZDA 4O52A 3NEVA 4BI7A 3NR0A 2FQIA 3TX9A 1WYIA 3L68A 1C29A 1JUBA 4FX8A 1TV5A 4IMDA 4MFEA 1L6WA 3I7SA 2BWGA 3LCWA 1OX6A 4NQ1A 3LCFA 1LRQA 3WJZA 1XKYA 1DVJA 1P0KA 1KV5A 3ABRA 3BPWA 4ORIA 5H91A 5CSRA 1TPC1 4GBUA 3SY5A 3W1NA 4GUHA 2FLIA 3LM7A 4O1CA 2YCEA 1JCLA 5F2MA 2VELA 3HPZA 1XM3A 3FIGA 4M6PA 2QCFA 3NL5A 1TV8A 1TPUA 3R12A 4QAIA 1K8YA 3STGA 3I7QA 4C1LA 3QC3A 3TW7A 3KVKA 1H7PA 3B03A 1KM6A 2Z1BA 1XL9A 4NJKA 1GVFA 1IIHA 2A5HA 3ATYA 3LCLA 1G4TA 2DZUA 4M5PA 1ADOA 5F2IA 5HWJA 3JRKA 1VR6A 1JCXA 1QFEA 4ZMGA 3MP5A 3S8HA 1Z44A 3HGSA 5CZJA 2B4GA 5HR7A 3S5NA 2DZXA 1TRIA 1FDZA 5D02A 3R2GA 3NQ7A 3OG3A 1MO0A 1CX9A 3S5ZA 4FNSA 1XUUA 4PTNA 4B5NA 4BFAA 3IVSA 4RV8A 4OV4A 3UPBA 1W5QA 5LHEA 1B4EA 4XQ6A 3HG5A 1AL8A 1VQTA 3NO5A 3ZWTA 4JD4A 4O28A 4XKYA 1QDSA 3EX4A 3W1AA 4JYFA 3P84A 4EVZA 3UZJA 5D2YA 2V2DA 1H1YA 1OVDA 1LOQA 3E96A 3GR7A 2NUWA 1DKWA 3DBPA 3W1TA 4H6KA 5E0KA 3PB2A 1O5XA 4O16A 4O1DA 1JUEA 4J9JA 1M7PA 3G22A 2Q3RA 2QCCA 2BXVA 3THQA 4QITA 2WOQA 1C8VA 1KM1A 3WJSA 1Q6OA 4HPXA 4HN4A 2WSQA 3LTSA 3LBMA 3AJXA 1QWGA 5KZDA 4OT7A 4GJ1A 3TSDA 4HNUA 1NF7A 4Z1DA 2NXIA 2WJZA 1PHQA 3STCA 5G4WA 3U2OA 2XN1A 3QMSA 2E6DA 1SZFA 4ZQCA 2DU2A 4NNCA 3Q58A 4RKAA 2NUYA 4QSHA 5LNWA 1LBFA 3PC0A 1OF6A 1CW2A 2Y7DA 2A0NA 4RXGA 1YLVA 3KRSA 5CPOA 5EL1A 1V7YA 3NZ1A 3GKAA 3P8JA 4N9BA 4ZQPA 2RH9A 4FNTA 3HOJA 2J6XA 5SWUA 4QIUA 3B8DA 3W76A 3RK8A 2OMAA 1VHNA 2ISWA 1GYLA 3TDFA 1SW0A 1I2OA 1VH7A 3EKZA 1I8JA 5C55A 2ATMA 3NM1A 3W7OA 3KX6A 5LNSA 1L9WA 4D2JA 3TQ0A 1UBSA 4FXSA 1GG0A 2Y7FA 1F5ZA 1LRNA 1YTDA 3GZ3A 4FNUA 3HF3A 4WOQA 4WJEA 2RFGA 4PL1A 1KLZA 1YPIA 4E2DA 3FKKA 3G1YA 1Z41A 3N9SA 2ZTKA 3L66A 2GJNA 5HMSA 1ONRA 1RQBA 1D3GA 3T78A 3LHWA 3G8EA 4LW7A 3H53A 3N2XA 5GVJA 1F05A 3SR7A 2PRHA 4NVTA 4S2BA 1XC4A 3L5MA 2GVJA 1SUXA 2NWRA 5FESA 3HPXA 2E5DA 1G4PA 1AK5A 1LLZA 1EP1A 1MSSA 2PRMA 5AC6A 4UFHA 1JCJA 2CLLA 3NQ8A 3PULA 3IIVA 3QRHA 2TMDA 1G4EA 1O4UA 4O10A 2RDTA 4PODA 1TV7A 2B7QA 2W79A 3O63A 3FFSA 4LS2A 1KFKA 2ZQ0A 4L4MA 3H54A 5DY3A 1KM0A 1C9DA 3A5VA 4BWLA 2WSYA 1ZAHA 3W3OA 2Y85A 2QAPA 3O07A 5AYYA 2FDSA 3MI2A 1LYXA 3LXBA 3TSBA 1KA9F 1H7RA 3C8FA 1R47A 2GVGA 2NV2A 3CT7A 3LB0A 1DORA 1F73A 4KFOA 1DHPA 3PUEA 1FWSA 4RJEA 4MLJA 3W1UA 3PM6A 1A50A 3QJAA 5HUOA 3TV8A 5KZEA 4JDYA 1GYNA 4UTLA 3TJLA 1EUNA 3INPA 3LI0A 1VLIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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