4IZ9A

Crystal structure of an acetate kinase from mycobacterium avium bound to an unknown acid-apcpp conjugate and manganese
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
383
structure length
381
Chain Sequence
DGARRVLVINSGSSSLKFQLVDPESGVAASTGIVERIGESPVPDHDAALRRAFDMLAGDGVDLNTAGLVAVGHRVVHGGNTFYRPTVLDDAVIARLHELSELAPLHNPPALLGIEVARRLLPGIAHVAVFDTGFFHDLPPAAATYAIDRELADRWQIRRYGFHGTSHRYVSEQAAAFLDRPLRGLKQIVLHLGNGCSASAIAGTRPLDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPSVVSYLCHTAGMGVDDVESMLNHRSGVVGLSGVRDFRRLRELIESGDGAAQLAYSVFTHRLRKYIGAYLAVLGHTDVISFTAGIGENDAAVRRDAVSGMEELGIVLDERRNLPGAKGARQISADDSPITVLVVPTNEELAIARDCVRVLGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Acetate kinase
publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium avium
total genus 135
structure length 381
sequence length 383
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2013-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iz9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iz9A02
3C7NA 1XUPO 1Z05A 4FSVA 5AR0A 1BOTO 1QQMA 2QWRA 3CQYA 1ZXOA 4CZGA 5LJWA 1E4FT 3M6GA 2NLXA 5FPNA 4RWTA 3A5OC 3G25A 3ZETA 4CZFA 1KAXA 5AQVA 2P9PB 3AAQA 2ASPA 2VWBA 5AQUA 3EKUA 2E2QA 3BF3A 1YUWA 3WUHA 4E1JA 3FFKB 3VEYA 4MLEA 1Y64A 4GNIA 3HTVA 4CJ7A 4BQLA 5BR9A 2IVNA 1ZBSA 2FSKA 5BPMA 4QS7A 2QM1A 1V4TA 2GUPA 2IVPA 1C0FA 4CBXA 1Z6RA 2P9UA 2V7ZA 2YCHA 4JHDA 4I6MB 1LOTB 1BO5O 5FPEA 3QBXA 4PKHA 3C7NB 4BROA 3ULEB 2P9IA 3LM9A 4JNEA 2V51B 3ID8A 5AQPA 4BR7A 1CZAN 1K8KA 2HF4A 2YHWA 1LCUA 3R8EA 2ASOA 4B1VA 4BRAA 4CD3A 4EAHD 4AM6A 4I6MA 3LDPA 5AQNA 5JMVA 3U9DA 1JCEA 2YHYA 4JN4A 2H3GX 3S41A 3CERA 3O8MA 4H0PA 4FWOA 4WQ4C 2FLOA 3EN9A 3H3OB 3EL2A 4BRCA 2Q1NA 3WXIA 3TPQA 5F1XA 3F9MA 1QQNA 1NGHA 3IFRA 2Q97A 4CZHA 4CBWA 3AY9A 3M3ZA 4IWVA 5EVZA 4JD2A 4FOEA 2P9UB 4K41A 3UKRA 4MLHA 3VETA 4WQ5A 4H0VB 4EIAA 3JS6A 2P9IB 3UKUA 3VGKA 4DQ8A 1K8KB 5AQWA 4CZKA 2E88A 3LL3A 3P4IA 2E1ZA 2GEMA 2CH5A 3U8XA 4NO7A 3HSCA 3D2EA 3UE5A 4A61A 4H0XB 2HF3A 5TKYA 2CGJA 2A41A 5JLHA 1HX1A 4HWIA 4H0YB 4BRLA 4CI6A 2A40A 2YJEA 3SJHA 4BRKA 5AQJA 2ITMA 4ISFA 2P9KA 3QICA 4QS8A 1SQKA 4L3QA 3SMPA 2D1KA 3BUZB 3LDOA 4JD2B 4PL8A 3UKRB 3ZEUA 5AFUH 4CZIA 2OANA 3BEXA 3VEVA 1C0GA 1NGGA 4H5NA 3QBWA 4IZ9A 2BUPA 3H1VX 4NB4A 3UKUB 4PKGA 3FR0A 3VF2A 1QHAA 4FWLA 3D2EB 4B1UB 1D4XA 5BREA 2D0OA 5BN8A 3ZX3A 3QFPA 3DXKA 3QDKA 4FPAA 5BN9A 4BR2A 4A62A 2ZGZA 1RGIA 3VERA 2GELA 3R6MA 5AQTA 2D4WA 3VF4A 4F9OA 4XH1A 4CBUA 1X9JA 3R9PA 1GLLO 3FZMA 3TU5A 3CJ7A 2FSNA 5AZIA 4BC5A 2D0PA 3FZKA 4BREA 1ATNA 3ZEUB 4M63C 3ATUA 3MCPA 3L4IA 1IG8A 2Q31A 3ULEA 1NM1A 4EHTA 5I9EB 3I8BA 1U6ZA 3A5MC 1IJJA 1Q18A 4H0OA 3O1WA 2WUSA 1ESVA 1BUPA 3QFUA 1OKJA 1NGBA 3GDQA 1YVNA 3VGLA 4BGBA 5KPRA 2QWOA 4JAXA 5AQGA 3DXKB 3O08A 1ATRA 5ADXH 2V7YA 2GWJA 3FGUA 4K43A 1S22A 4FWKA 3FE1A 4FL9A 5BRFA 1BDGA 5F2RA 5AZIB 4MO4A 2Q2RA 4FO0A 2W40A 3CHWA 1GLEG 4RCHA 3W0LA 3CJBA 5AZJA 4BRPA 4FWRA 4H03B 2I7PA 2QWNA 2QW9A 1GLDG 2YJFA 3FLCO 3IDHA 3LDNA 1P8ZA 2ASMA 3MN7A 1MWKA 1YXQA 1DEJA 2A6AA 5BRDA 3B8AX 1NBWA 2A5XA 4BRFA 2QXLA 4CD1A 5LY3A 1QZ5A 4H5WA 4J8FA 5B8HA 2FXUA 1KAZA 1GLJO 3J8AA 3VENA 1TYQA 3D2FB 4BQZA 3HBTA 1BWFO 3DWLA 4O8KA 3CI5A 4BR9A 4BG8A 3H6EA 4FWMA 5AZJB 4B1XB 1BA0A 5KQ8A 5AQIA 3AAPA 1DGKN 3O4WA 5EX5A 2QWLA 4BRIA 4BRDA 4BGAA 5ELZA 3KZBA 2KHOA 4H5RA 3UB5A 5AQKA 5KQDA 5BRHA 4WQ5C 4HTLA 1HPMA 1X3NA 1TYQB 3M1FA 4H5VA 2UYTA 3BF1A 2V52B 2IVOA 3L0QA 3H1QA 4YDUA 2E2NA 3GE1A 2CGLA 3WXJA 4KBOA 1V4SA 2Q36A 2Q0UA 1ATSA 2P9NB 4ISEA 2HOEA 2PBDA 3VEXA 3GG4A 1QQOA 3SK3A 3SMSA 3WT0A 1G99A 1GLAG 4IJAA 3HI0A 5AQFA 4C23A 4MO5A 1NMDA 2NRHA 2E20A 3A8YA 3ATVA 3VF6A 3ZX2A 1RDWX 4FWSA 3MMVA 4BC4A 1MDUB 4DCHA 1HJOA 1T6CA 4XEIA 3L6QA 4ISGA 5JLFA 2F9TA 3KHYA 3VEOA 3QMLA 3EZWA 4AM7A 2HMPA 3RSEB 1S3XA 3O6WA 2BTFA 4XH5A 2E1YA 4LC9B 3GL1A 4FOIA 2J4RA 3ENOA 3MDQA 3LDQA 3MN6A 3O5BA 4BRHA 1NGJA 4M7XA 3HM8A 1EQYA 3GOIA 3QB0A 4BC2A 4DB3A 3CJ1A 5E26A 1XQSC 1KXPA 3MN5A 3FZHA 3DAWA 2QWPA 2FSJA 3H46O 1E4GT 1NLVA 4M7YA 4EFHA 5KPZA 3D2FA 2E2OA 1MA9B 1GLCG 5EOYA 5FPDA 3CIPA 4B9QA 3FZFA 2AA4A 3O1BA 1GLBG 5KPTA 3EO3A 5AQLA 4WYBA 3A0IX 1HKGA 1BG3A 4BRQA 1KAYA 5AQQA 5JICA 3IUCA 5AQSA 4BRNA 1BA1A 4EHUA 4FPBA 4B1YB 1NWKA 2DPNA 2F9WA 3WXKA 1SAZA 1YAGA 1NGCA 3ENHA 2E2PA 1R59O 4PKIA 5CE3A 2QWQA 1DKGD 4BR5A 1NGFA 3FZLA 4WQ4A 5AQHA 5AFUA 3HZ6A 4A2AA 4QS9A 2VYPA 3VESA 2W41A 2ZGYA 4K25A 3CETA 4BVOA 3O80A 2E8AA 1U2VA 5AQOA 3ZETB 3WEEA 2IIRA 1MWMA 4CZLA 3D7EO 1QZ6A 4CZMA 2P9NA 1HKBA 3U4LA 2PAVA 2EWSA 5AQXA 3A5NC 4DHYA 2P9LA 2ZWHA 1NGEA 3LDLA 3KVGA 4BR0A 1J6ZA 4XH4A 1NGIA 4FWPA 4K42A 1RFQA 2VCPA 1HLUA 1SZ2A 3EKSA 4RTFD 4JHDB 1T6DA 2YHXA 1ZC6A 1NGDA 4BC3A 3CJCA 3CJ9A 1JCGA 1WUAA 3VEZA 5BPNA 3H3NO 1U2VB 3RSEA 3WEEB 3DJCA 3VEWA 1TUYA 2GWKA 2QWMA 3CJAA 4BRMA 2P9SA 1H1VA 3W3DA 3SLCA 3WQUA 1BU6O 2P9LB 3A5LC 5AQZA 4GY2B 2YI1A 3ZX0A 5ADXA 3WQTA 2FF6A 5BPLA 5AQMA 3C0BA 5EY4A 5AQRA 4BG9A 3DXMA 1XC3A 3H45C 3AARA 1X3MA 4FWNA 4PL7A 4IXCA 4YDUC 3JXUA 2A3ZA 2Q0RA 3IMXA 3U9ZA 3GBTA 4FWQA 5E84A 4BVPA 4BR4A 4B1ZA 3VGMA 3CQXA 5LJVA 3MN9A 1NGAA 2GTDA 1HKCA 1TUUA 2ZF5O 4H0TB 3I33A 2P9PA 5F0XA 4B1WB 2P9SB 3LM2A 4H5TA 3VPZA 1HUXA 3VOVA 3MK6A 2NZTA 5AQYA 3BP8A 1WOQA 4A2BA 3OHRA 1JCFA 4O5FA 4IO8A 3DXMB 2I7NA 1GLFO 5EXWA 2A42A 2FF3B 4CZEA 2P9KB 4CZJA 2AP1A 4BRGA 4Z94A 1T44A 4Y0WA 4IJNA 3WXLA 2CGKA 2CH6A 5FPMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4C1NK 3OYCA 2XY8A 1OH8A 1ASVA 1BGXT 2D0AA 1VRUA 3KTQA 4CGHA 3RMAA 3CQYA 2O8FB 3HVTA 1IO2A 1E4FT 4FZXC 1KC8O 1NK7A 3MEGA 1KAXA 4JLHA 2X74A 1YHQN 3EKUA 3WUHA 3BF3A 3M8SA 3FFKB 3C94A 3ZSOA 1VSEA 4FJ5A 4CJ7A 3M8QA 3T69A 5GAEP 1C0FA 3PSIA 4FM1A 2F8TA 3EE8A 3SQ4A 2KW4A 3QBXA 3C7NB 1RDBA 3ULEB 1NJYA 1EWQA 2V51B 4BR7A 3OYLA 3SQ2A 2B6AA 3OW2M 2ASOA 3B6PA 4DSEA 3NF6A 4EAHD 4AM6A 4FZZA 5JMVA 3U9DA 1HQUA 4JKGB 3V1RA 3ITHA 1S1TA 3CERA 4FJNA 2PY5A 4GV3A 2QA4N 1JL1A 1TK5A 3WXIA 3SV3A 1SKWA 3F9MA 2Q97A 1NKCA 4C8LA 3F9KA 3AY9A 2VGNA 4IWVA 5EVZA 2P9UB 3LWMA 5J1EA 4EIAA 3HO1A 1SL2A 4ID5A 4BE2A 3KK2A 5K14A 5DM7L 5FRNA 3ID6A 3V9XA 2KLAA 4GV6A 1RTDA 3P4IA 1LV5A 3VQQA 3N4PA 2B4JA 3TARA 1VQON 2O8BA 5MLCQ 5JLHA 4FLWA 1HX1A 1BI4B 4DV3K 1U4BA 4BRLA 2O8EA 4OVLA 2A40A 3V9ZA 3T1YK 2DFFA 3ULDA 2HHTA 4QS8A 1SQKA 4L3QA 3SMPA 4CEFA 2D1KA 4JK9A 3UKRB 1HNVA 3AVCA 4OKKA 4TSXA 3VTHA 3LPUA 2BUPA 1HNXK 3DLBA 2OZSA 3FR0A 1YTUA 4OPHA 3VQCA 4K0KK 3G0ZA 3E1YA 3CFRA 4OPAA 2WTUA 3ZX3A 3A2FA 4QCLA 3JSMA 2OZMA 4FPAA 4RW8A 4BR2A 4CEZA 1Q82O 4A62A 3NVKA 3U3YA 2GELA 4KHUA 4NCGA 5FRMA 4XH1A 4YOTA 3FZMA 4KV8A 3TU5A 2D0PA 4BREA 1ASUA 1W97L 1B9DA 3ZEUB 5M1OA 3AVFA 4IDKA 3QLHA 4FYDA 2Q31A 4FLYA 1XMOK 4U7BA 4DV2K 1RDDA 3F5TA 4JAXA 4KH4A 3THVA 1ATRA 4M3TA 5M1FA 4DF4A 4K43A 4IG0A 5BRFA 3L4QA 3SQ1A 3DLLL 4HCCA 4RW7A 4CFBA 2OTLN 4RCHA 4CK3A 5AZJA 1KTQA 3THWA 4H03B 3WNGA 2QWNA 4CJWA 3WXMB 3LP0A 4CJVA 1JLQA 1I39A 1YXQA 2A6AA 5DMRA 3K0SA 1TKDA 4DSLA 1ZBFA 4NXNK 2A5XA 4BRFA 2QXLA 2PZSA 3QEIA 4H5WA 1T8EA 3RWUA 2FXUA 3J8AA 4BQZA 3ALYA 5AJ3K 3HBTA 4UQGA 4B3RK 3P38A 5HOOA 3TR8A 1TKZA 1RT4A 3TSQA 1FK9A 5M1KA 3AAPA 5C10A 1ITGA 4K8ZA 1TKXA 4IG3A 3KJVA 3DMJA 5ELZA 1YJ9N 4HUEA 3KZBA 2KHOA 1S6QA 3T7ZA 3VQAA 3THXB 1WN7A 3VQ8A 1XC9A 3JYTA 4YDUA 3OYDA 3SQ0A 2VG7A 1V4SA 1C1AA 2G8VA 3AA5X 2P9NB 3MX5A 4ISEA 2PBDA 2E4LA 3VEXA 1VQ9N 4G9ZA 3SK3A 3SMSA 3WT0A 1WSIA 4O55A 3HI0A 5AQFA 3TSUA 5C25A 1NMDA 1U49A 1J54A 2E20A 1YJWN 4FWSA 3MMVA 2YNHA 4GMJB 3KD5E 4Q0BA 1BQNA 2UUAK 4DQRA 4BDPA 3G4SN 1L3VA 2F9TA 3NF8A 3VEOA 3NGYA 4KH6A 4AM7A 1E3MA 1HPZA 3ZSWA 3OJUA 2BTFA 4LC9B 3CPEA 3JAMO 3ENOA 1NK5A 2E5LK 3HM8A 3TTCA 4GVEA 3GOIA 3QB0A 4HUFA 4LSNA 4A5BA 4OPJA 1JLAA 2E6LA 3OS2A 3DOKA 3DLKA 3I0SA 1MA9B 3VN5A 3KIOA 4NYNA 3G6EN 4CGJA 4OGCA 1D9DA 1JKHA 3VQPA 1A5XA 5C24A 2VG6A 3AVKA 3EO3A 4WYBA 5M1QA 1BG3A 1YT3A 4C8NA 5AQQA 4FVUA 4I9LA 4E7HA 1VQ5N 1BA1A 3OJSA 4DV6K 4HHTA 2DPNA 3WXKA 3AO1A 3SCXA 2NRRA 3DRPA 2E2PA 4B9SA 5CE3A 3RMDA 4CGDA 4DR5K 3FZLA 1OVQA 4AF1A 2I5JA 4A2AA 2VYPA 2ZGYA 4DTOA 2YX6A 4PWDA 4KHYA 3CG7A 3ZETB 1KFSA 4CEDA 3D7EO 3U4LA 1NNEA 1N32K 4DHYA 1YTAA 2ZWHA 1NGEA 3V9UA 2RN2A 3PIPL 1ILYA 3DLGA 3CCMN 4N76A 4FJ8A 1UAXA 4XH4A 4FWPA 1Q9YA 1JJ2M 1HLUA 5I3UA 3EYZA 3OYMA 1IKYA 4FLXA 4WE1A 3P83D 4LF7K 3LP3A 1VSLA 3DLRA 2YKNA 5C12A 1NGDA 3E9OA 5T7BA 5BPNA 4JRPA 2AJQA 3H3NO 1IH7A 1TV6A 3VEWA 1K9MO 2GWKA 4EZ9A 2P9SA 1TK8A 3W3DA 2RF2A 3K5NA 3SLCA 3WQUA 3F73A 4C1NI 5BPLA 5AQMA 4WFAL 5EY4A 4CJUA 3H45C 1X3MA 1LWEA 2A3ZA 3O9QA 3TABA 4FWQA 3SI6A 1BCMA 5E84A 4ZTFA 3O3GA 2O8FA 3I0RA 4KRFA 3VGMA 3NGIA 1HKCA 3RR7A 2WBNA 3I33A 3RMCA 1MU2A 3VOVA 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4DTNA 1D4XA 4H8KA 4X66K 3SAHA 3CC2N 1RT6A 1X1PA 3QFPA 1FW6A 5BN9A 5C2DA 4JI1K 4J2AA 1YITN 1GOBA 3R6MA 4YNQA 3VF4A 5JVHL 3CFOA 3CJ7A 2G8UA 1C0MA 1ATNA 4CHYA 2FBYA 3ZSYA 1HQEA 4FJHA 3L4IA 4DV7K 1NM1A 4EHTA 3L2QA 4IO9L 3TI0A 3I8BA 3KLHA 1U6ZA 4GVMA 2QEXN 4F3OA 5CHIA 1OKJA 5CY4A 3CCUN 3LZIA 1NGBA 1YVNA 3VGLA 4ID1A 4CF0A 4CE9A 3O08A 4CIGA 3AGRA 3FE1A 3K5LA 3PX0A 1BDGA 3NF9A 4DG1A 1RT1A 5FROA 1FKOA 2Q2RA 2KTQA 3W0LA 3QNOA 3SAFA 4BRPA 2XY7A 4FWRA 4QOZB 3HVRA 2I7PA 4HVJA 4B9NA 1GLDG 3FLCO 4B3OA 2ASMA 1WSFA 3MN7A 2HNYA 4AHVA 4AILC 1D5AA 2VGMA 5BRDA 1NJIO 1NBWA 4CD1A 1N5YA 3HRGA 1KSPA 1VK0A 5B8HA 1KAZA 2XO7A 3NFAA 4E7LA 3THXA 5JVGL 4FLUA 1BWFO 2E6MA 2Z1IA 1N8RO 1HRHA 2HSTA 2ETJA 3H6EA 1S9EA 4BG8A 4FWMA 4DSFA 5HRRA 4MFBA 4IKFA 2DY4A 3SAGA 4CJQA 3OA9A 4DU1A 3AVMA 5EX5A 2JWKA 3AO2A 2KQ2A 3C6AA 3OYNA 3DI6A 3CC7N 5AQKA 5KQDA 5BRHA 3AA3A 1VSFA 1WAJA 3AVGA 4CESA 1VQPN 2E2NA 3GE1A 5HRSA 4N56A 1CXQA 4CERA 2YV0X 1I3AA 3KK1A 3ZT0A 4JI5K 1QQOA 4CF1A 1W2BM 4C23A 3AA2A 2HNDA 2NRHA 2XY6A 2NUBA 2OPRA 5C42A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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