4J8FA

Crystal structure of a fusion protein containing the nbd of hsp70 and the middle domain of hip
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
551
structure length
551
Chain Sequence
FMAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGLESDLEIDNEGVIEADTDAPQEMGDENAEITEAMMDEANEKKGAAIDALNDGELQKAIDLFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFVKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAARDLALACKLDYDEDASAMLREVQPRAQKIAEHRRKYERKREE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B, Hsc70-interacting protein
publication title Structure and function of Hip, an attenuator of the Hsp70 chaperone cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 183
structure length 551
sequence length 551
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.25.40.10 Mainly Alpha Alpha Horseshoe Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat 4j8fA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4j8fA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4j8fA01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4j8fA03
1XQSC 4WNFA 2KATA 2YQ8A 4K25A 5AZIA 3ZX2A 3U9ZA 5KJKA 1NGAA 1K8KA 3CJAA 4L3QA 1RGIA 3ZGQA 3LCAA 4G25A 3C7NA 5BN8A 3JXUA 3MN5A 1NMDA 3RU0A 1TUUA 3F9MA 3KHYA 3N71A 3VF6A 2IF4A 3BF1A 3QWWA 3D2FB 4H5NA 3FFLA 5KJLA 4IZ9A 3LKUA 1BA0A 3WEEA 2QWNA 2NC9A 3AARA 3CK7A 3AS4A 4U07A 1U2VA 1HZ4A 2IIRA 1ATRA 3R9AB 3GDQA 2A5XA 1NGDA 1E4GT 1IHGA 3AS8A 2VYIA 4H5WA 3HYMB 3U9DA 3U4LA 2I6HA 3KZBA 3LDPA 3QICA 5KQDA 5AQNA 3GBTA 4EHUA 2GUPA 4E1JA 5AZJA 1BWFO 5JLFA 2VYPA 4XH4A 4N2QA 1KXPA 4H0VB 1P8ZA 3FP3A 2VSYA 4HWIA 4RTFD 3WXIA 2XPIA 4B1VA 2YHYA 4HOSA 3FZLA 1IG8A 1HX1A 5EVZA 3EL2A 1ATSA 3FZMA 2Q97A 4PL7A 3WUHA 4GYYA 2YHXA 4IXCA 5ADXH 3R6MA 4M63C 5CCMA 2QM1A 2VCPA 2FEZA 5HQ8A 3VGKA 1PC2A 1NGEA 4IO8A 3FWVA 2GWKA 3ULEB 5FT9A 3FLCO 4BRCA 3UUXA 4JA7A 4AIFA 1JCFA 3VPZA 5AQTA 3A8YA 3UQ3A 1V4SA 2FF3B 3S41A 1MA9B 2E88A 4IWVA 3IMXA 5F2RA 1Y64A 3D2FA 3WT0A 2NZTA 3O1WA 4WNEA 1KAZA 3VEXA 2NRHA 3W3DA 5ADXA 3SF4A 2E1ZA 5A6CA 4I6MB 4GPKA 2Q2RA 1YUWA 2W40A 4CGVA 4BRGA 3IUCA 1WUAA 1ZC6A 4H5RA 4W9RA 3UKUB 1HJOA 4KBOA 2Y4TA 4JHRA 1Z05A 5FPMA 5FZSA 4AM9A 2Q31A 4GA0A 2JLBA 3SLCA 4JL0A 4G26A 4BQLA 4G2VA 4H7XA 4XH5A 4A1SA 1OKJA 4B1WB 4B94A 4BC2A 2P9SA 4BT9A 5AQFA 2BTFA 1ELRA 3WQUA 4NRHB 3VEWA 1NGBA 3QDKA 1YAGA 5AQQA 4EAHD 3RO3A 4J8DA 2FSKA 2E2EA 3ATUA 2H3GX 2V7YA 2GW1A 1C0FA 3ULEA 2E1YA 2A41A 2BUPA 3GW4A 2KCLA 2D0OA 3QOUA 3D7EO 4ABNA 3Q49B 1JCGA 1FCHA 4NQ0A 4N2SA 4GA2A 1BDGA 4FOEA 4BR2A 2CGLA 5JLHA 1ZXOA 3VEOA 5BN9A 1ZBSA 4H5VA 2HOEA 4WYBA 4BVOA 2KCVA 4IJAA 2P9UB 4I6MA 2LSUA 4G24A 5EKQD 3CERA 4I2WA 3FGUA 3IDHA 3VETA 3DAWA 3ZEUB 2IVPA 4BRHA 3CVPA 1SZ2A 3UKUA 1P5QA 1IYGA 4BWRA 3QFPA 3OXGA 1CZAN 2FBNA 3A5OC 1GLDG 2QWRA 3EZWA 4YDUA 1KAXA 2A6AA 1G99A 4JD2B 3RJVA 1HKCA 2PQRA 2GELA 3VERA 1KT1A 3MA5A 4BROA 2ONDA 1J6ZA 3RIBA 2XGOA 4KBQA 3CKBA 5BT1A 1DEJA 2AA4A 2DPNA 2E2NA 2E20A 3RO2A 3ASGA 4BR9A 4WNDA 3PE3A 1LOTB 1S22A 3MKRA 4FOIA 2V7ZA 5C1DA 2KHOA 2Y4UA 4KYOB 4BRIA 4CZEA 4XIFA 5EXWA 5JJ6A 3VF4A 3URZA 2PAVA 3M3ZA 5EX5A 3CQXA 4HTLA 2E2QA 2A40A 4PKIA 5F0XA 2Q36A 4FWRA 2WUSA 4BRPA 4RWTA 2FO7A 2C0LA 1GLJO 3I8BA 3TU5A 4GYOA 3GL1A 3VOVA 4N3CA 3H1VX 3GOIA 3O1BA 4H0YB 4B1UB 5AQPA 4BC5A 3JYSA 3LM2A 4QS8A 3J8AA 4RG6A 2P9UA 4M7XA 2ZGZA 5JICA 5EX3A 3K9IA 5AQHA 5D0QD 4PL8A 4UQZA 3HZ6A 1NA3A 1NGCA 1U6ZA 3DWLA 4FPBA 3EKUA 1XUPO 3HM8A 2UYTA 4LC9B 4BR7A 3HTVA 1X9JA 4CBUA 1LCUA 3HBTA 4JD2A 2FF6A 3CVQA 3GZ2A 3H3OB 4NO7A 3ASDA 2FSJA 2AP1A 4GZ6A 3CQYA 4IJNA 3FE1A 2HMPA 3TG5A 3UPVA 4GCOA 3HI0A 2XGSA 4FWNA 4A61A 1X3MA 4NB4A 3C0BA 3GE1A 4JHDB 4K43A 3UKRB 3MK6A 3ZETA 5KJMA 2C2LA 1A17A 3H3NO 4I1AA 2DBAA 3QBWA 4M7YA 4BG8A 1ZBPA 4GZ5A 4YDUC 3L0QA 2P9KB 3QKYA 3A5LC 5AFUH 2ZF5O 4CJ7A 4N5CA 5AQIA 2E8AA 3AAPA 5ARFA 3LDNA 3LDLA 4PKHA 1TJCA 4UQXA 3S7BA 2VGXA 4ME2A 4BTBA 5JJ7A 1ELWA 3TAXA 2PL2A 4N3BA 1XNFA 3MV2B 5G04J 2YHCA 4UI9K 2CGKA 3LY7A 4O5FA 2Q1NA 3L6QA 5FJYA 4BRKA 2YJEA 3LPZA 1SAZA 4KXKB 3CVNA 4AY6A 1QZ6A 3I33A 2ZWHA 2KC7A 5AFUA 2WPVA 2VGYA 3MV3B 4GCNA 4H0PA 1NLVA 2C0MA 3ID8A 3LM9A 3LDQA 2QWOA 4H0OA 4MLHA 2AVPA 3W0LA 4BRAA 3NF1A 3LYAA 1GLAG 2F9WA 5LJWA 2W41A 5G04C 1ATNA 2ASMA 3ZX0A 4CZFA 2BUGA 2XCCA 3VTYA 3WXXA 1NBWA 2ASPA 5AQJA 4BR0A 1OUVA 3ENHA 5LY3A 3CEQA 2PZIA 3DJCA 4G23A 2P9KA 4GYWA 4BRQA 2V5FA 5BW8C 2YCHA 4I9EA 1MWMA 3BP8A 4XEIA 5JJTA 4U04A 2OANA 4JN4A 4PKGA 5AQUA 3WXKA 3AY9A 4BC3A 4BGAA 4Y6WA 3E4BA 1Q18A 5FZRA 2XGMA 3SK3A 3FZHA 1Z6RA 1GLCG 4J0UA 3Q5MA 1SQKA 3QB0A 5BRHA 5CE3A 5BREA 3CIPA 1WM5A 4N3AA 3VTXA 1WOQA 4IN3B 2EWSA 2FXUA 4O8KA 3ZHEB 3EDTB 2LNIA 3VEZA 4RG9A 3O48A 5AR0A 5ARGA 4FWMA 5AQOA 4BGBA 3SMPA 3ASFA 2P9LB 5HI7A 5AQSA 5KJNA 1EQYA 2D4WA 5LJVA 4XI9A 5FPDA 1QQOA 2GEMA 4J8FA 2P58C 4F3VA 2MHKA 2GWJA 5BRDA 3DXKB 3U3WA 1MWKA 5AQYA 4CZJA 4WUYA 4FO0A 4WQ4A 4MO4A 5F1XA 4FPAA 5AQGA 4EFHA 3CV0A 5KPZA 3EO3A 4FWSA 2HF3A 1V4TA 4HOUA 3CETA 2GTDA 3ZFWA 3D2EB 4WNGA 3QBXA 4WQ5A 3SMSA 4U0ZA 4Y6CA 3L4IA 3ZN3A 1GLLO 1YVNA 3FFKB 3KVGA 2A42A 3RKVA 3HSCA 3C7NB 3O8MA 3WXJA 4H5TA 4JAXA 2NLXA 1RFQA 4GNIA 2A3ZA 4YNDA 5D0OD 1ZU2A 3RSEB 4U0UA 5BRFA 1NGJA 4FWPA 4CBXA 2LSVA 3ZHEA 3CHWA 3ZPJA 1NWKA 5B8HA 5AQWA 3VF2A 3GYZA 3PDNA 4A2BA 2PQNA 2F9TA 4B1XB 1U2VB 5EX0A 3WXLA 4CD3A 3CK8A 1TYQB 2P9LA 2HYZA 2ZGYA 3O6WA 3ZEUA 2IVOA 4MLEA 3PE4A 5G05J 2YJFA 3ASHA 1HKGA 3BEXA 3O5BA 5CHEE 2VWBA 4BVPA 1GLFO 5BPNA 5KQ8A 5JMVA 3MN9A 3R8EA 3M1FA 3IEGA 4ISFA 3BEEA 3H6EA 2QWPA 2Q0RA 3H45C 4CZHA 5AQZA 2ITMA 4QS7A 5AQXA 4BC4A 1KLXA 5M72A 2QXLA 1ESVA 1KT0A 3CJBA 3D2EA 3MEKA 2IVNA 4CZLA 1NGIA 4GY2B 2PBDA 4MO5A 5I9EB 4DCHA 1W3BA 3QMLA 4CI6A 5G05C 4FWQA 1DGKN 2CH6A 5FPNA 4HORA 3VGMA 1NGHA 4WQ4C 3BUZB 3TG4A 3RSEA 3ZX3A 4B1ZA 1QZ2A 2QWLA 3IFRA 5FZQA 1HPMA 4Z94A 5BPLA 4H7YA 1NGFA 1H1VA 1NGGA 4A2AA 2YHWA 4EHTA 4JA9A 1QQMA 4WQ5C 4J8EA 3GG4A 1QQEA 1TYQA 2QWMA 2Q7FA 4I9CA 4UI9J 4JNEA 5EY4A 4DHYA 4F9OA 3O4WA 4FWLA 5DBKA 4B9QA 3A5NC 3A5MC 4AY5A 3KAEA 1T6DA 4CZKA 4CGWA 1TUYA 3CJ9A 1BG3A 3Q15A 2Q0UA 3VENA 2YI1A 2P9SB 1HLUA 2FI7A 2VQ2A 3LY9A 1BOTO 3OXLA 5LCWJ 3MN7A 3FR0A 4BRMA 3CKCA 4I17A 3LY8A 1QZ5A 3OHRA 1WAO1 3QDNA 1D4XA 5E84A 1T44A 4APOA 2QW9A 4UI9C 2V52B 3ATVA 4JHDA 3UKRA 4CZGA 2P9NB 3UB5A 4FWOA 2HF4A 2FF4A 3UE5A 3H46O 3S7DA 3O08A 5AQLA 4N39A 4BRNA 1HH8A 4BTAA 3CJCA 4CD1A 3Q4AB 4HOQA 1X3NA 5KPRA 1NZNA 3EKSA 3G25A 1MDUB 3R9PA 4XI0A 1T6CA 3ENOA 4CZMA 3AS5A 5LCWC 4I2ZA 4LEUA 4BT8A 2V51B 2OOEA 2E2PA 4AM6A 1GLBG 4BRLA 5EOYA 4BG9A 3DXMB 4BRDA 3MN6A 5ELZA 5FTPA 4EIAA 1Y8MA 5E26A 4G1TA 2D1KA 3VEYA 4ISGA 4GZ3A 2UY1B 2P9PB 2P9IB 3CJ1A 1JCEA 3TPQA 2VSNA 2HO1A 2I7PA 1R59O 1XC3A 3KS2A 5AQMA 3EN9A 1E4FT 4CBWA 5BNWA 1HXIA 4DQ8A 4GA1A 3CI5A 4BQZA 2XEVA 1YXQA 2J4RA 4K42A 3QWVA 4RCHA 2L6JA 2E2OA 3CJ7A 1BU6O 1QQNA 5FPEA 5AYWD 1HKBA 3QFUA 2P9NA 3U4TA 4FWKA 4QS9A 3QWPA 2CGJA 1DKGD 3MDQA 3JS6A 4YVQC 4BR4A 5TKYA 5AQVA 4B1YB 1C0GA 4CZIA 1KAYA 4BRFA 3OXFA 2XCBA 4H03B 3VGLA 4Y0WA 4DB3A 3KD7A 3U8XA 4HOTA 2HR2A 1HUXA 3S7FA 3LDOA 5A7DB 4FL9A 2D0PA 5AZIB 4H0TB 3S7JA 2J9QA 3H1QA 3CK9A 4CDRA 1K8KB 2ASOA 4U0SA 2CH5A 3DXMA 5CCLA 3ULQA 1NM1A 3A0IX 1BO5O 5AQRA 3FZKA 1E96B 1IJJA 2IFUA 1YA0A 2UY1A 2P9PA 2P9IA 5AQKA 4K41A 4C23A 3CVLA 3TGOA 1RDWX 1NA0A 3ESKA 4YVOA 3LL3A 3WEEB 1BA1A 3MCPA 3VEVA 3BF3A 4A62A 1S3XA 2FLOA 2R5SA 3M6GA 3Q47B 4UQYA 2QFCA 3P4IA 1BUPA 4BR5A 2UWJG 4EQFA 1GLEG 4ISEA 2WQHA 5BR9A 1QHAA 3AAQA 2KCKA 5BPMA 3ZETB 4AM7A 4BREA 4O6FA 3SJHA 5AZJB 2QWQA 3B8AX 3GZ1A 5DIZA 5KPTA 3O80A 3FZFA 3DXKA 2I7NA 2FSNA 3MMVA 3WQTA 4FSVA 3VESA 4XH1A 2VGXB 4H0XB 1B89A 3SZ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3F5TA 1OH5A 4WNFA 4FVUA 4K25A 2DWZA 3PUJA 5JMND 5KJKA 1NK0A 3CJAA 1RGIA 3ZGQA 4ELUA 4G25A 3UMVA 1OVYA 3MN5A 2ETBA 4B3RK 3CHQA 3F9MA 5CR4A 3PH0C 3N71A 3QWWA 2GV9A 3D2FB 4DKWA 1X9MA 3EHNA 3FFLA 5KJLA 4M3ZA 2QWNA 4O1OA 3AO1A 3LVQE 3AS4A 3TANA 1RDUA 4CT0A 3PIOL 4DR7K 1ATRA 3C6TA 3M8SA 1CLQA 3FUDA 4UWLA 1YCSB 4V3IA 2Y1IA 1IHGA 3DMJA 2VYIA 4FHKA 3HYMB 3CF5L 4JKEA 3U4LA 1W2BM 3X2QE 5AQNA 4EHUA 3VQ6A 5BV1A 5LL6Z 4N2QA 4OPJA 4MRUA 4H0VB 1HYSA 3FP3A 4PUOA 1XI1A 1HG5A 1N34K 2J08A 3HRAA 3L22A 3KLGA 3EL2A 3FZMA 3K5OA 3T1HK 2X6NA 3MECA 2HM8A 4BESA 2BH1A 4IXCA 4CGJA 2O8DA 3FUNA 4M63C 5CCMA 5M1KA 5CZ2A 5FQ4A 4MKTA 4HCCA 4DU3A 1OVQA 1PC2A 1NGEA 4P29A 2ETJA 2GWKA 4KRFA 1OWLA 3V9WA 4AIFA 4JA7A 1TR4A 1TEZA 3APFA 1U48A 3UQ3A 2FF3B 2CFUA 4DSFA 3IMXA 3T8KA 1Y64A 4KHNA 2C1IA 1SZAA 2EIKE 2NZTA 4CFAA 3JUEA 3EYZA 4LF7K 3SF4A 4BETA 1P90A 1YUWA 1OT8A 4BRGA 4H5RA 1DLOA 5JVHL 4OO1J 3UKUB 1HJOA 4AXHA 3FUJA 2JLBA 5T3RA 4G1QA 1U49A 2F8XK 4G2VA 4CDMA 2P5OA 4CJKA 4AJWA 3EJNA 2G8HA 4RW7A 2P9SA 3VQ8A 1ELRA 4A1GA 2ZQBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4PS7 A;  1DCQ A;  4UUC A;  5G2N A;  2FLO A;  2R5S A;  5IY5 E;  1KVC A;  5EIB E;  1NKC A;  4B8A B;  1BUP A;  5CY4 A;  4EQF A;  1GLE G;  5BUZ A;  4M3Y A;  2H6H A;  5BPM A;  2RKI A;  4BRE A;  4CEQ A;  1ZBU A;  2R02 A;  2LXL A;  4CHY A;  3FU0 A;  3GZ1 A;  2DZO A;  3PZ2 A;  3K5M A;  1J54 A;  2VSX E;  5HBM A;  3MMV A;  4YHH K;  3VES A;  1L3U A;  4H0X B;  1HX8 A;  3FTU A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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