The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
YKIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
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| molecule keywords |
Caspase-7 subunit p20
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| publication title |
Design, construction, and characterization of a second-generation DARPin library with reduced hydrophobicity.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
18
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2013-02-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CNN B; 1SC1 B; 3QNW B; 3GJT B; 1RHM B; 2QL9 B; 3R6L B; 3SIP B; 1SC3 B; 3EDR B; 2XYH B; 2Y1L B; 3KJF B; 2QL5 B; 1RHJ B; 2HBY B; 1IBC B; 2H54 B; 3R5J B; 2QLB B; 2HBZ B; 3GJS B; 3P4U B; 1F9E B; 1RWN B; 2HBR B; 4ZVR B; 1SC4 B; 3D6H B; 1RHQ B; 4DCP B; 2CNK B; 1QDU B; 2HBQ B; 2QLJ B; 1I51 B; 1RWM B; 3RJM B; 1RWO B; 4ZVT B; 3KJQ B; 3P45 B; 2H65 B; 3D6F B; 2C2K B; 1RHU B; 1RWV B; 2C2M B; 1RE1 B; 3GJR B; 1BMQ B; 4DCJ B; 2H5J B; 3R6G B; 5IC6 B; 4ZVS B; 4DCO B; 3D6M B; 3IBF B; 3NS7 B; 4JB8 B; 2FQQ B; 2C2Z B; 1RWP B; 2H4Y B; 1I3O B; 1RWK B; 1PAU B; 4ZVO B; 1RWX B; 1NME B; 5IC4 B; 4ZVQ B; 2CJY B; 3EDQ B; 3GJQ B; 3R7S B; 2H4W B; 5K20 B; 4ZVP B; 2XYG B; 3R7N B; 3IBC B; 4ZVU B; 3R7B B; 1RHR B; 4LSZ B; 1ICE B; 2QLF B; 2CJX B; 2C1E B; 3KJN B; 1GFW B; 1QTN B; 1RHK B; 2H5I B; 2Y0B B; 2CDR B; 2H48 B; 1PYO B; 2XZT B; 2XYP B; 2DKO B; 2C2O B; 1RWW B; 2CNO B; 2P2C B; 2QL7 B; 2XZD B; 2H51 B; 2CNL B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4FYW B; 1J27 A; 3PXG a; 1NK8 A; 1VRT A; 1H2T Z; 3A8I A; 3GJT B; 3VTI A; 3OHB A; 1K1S A; 4F2R A; 3A3P B; 3V6K A; 1RA6 A; 3TYT A; 1RBL A; 5KTQ A; 4WZM A; 4DF4 A; 2NQP A; 1RAO A; 3QFW A; 2EK6 A; 4ANC A; 2UXB F; 2KJV A; 4L6V 3; 4UZB A; 4F25 A; 2FHO B; 1H7X A; 3K2Y A; 2ZJR Q; 4J9U E; 2MLY A; 4C6A A; 4LIW A; 1KWM A; 3CXC R; 3GIR A; 2ADB A; 2FQQ B; 5B09 A; 2FHJ A; 4LF6 F; 2RS8 A; 2AGO A; 1DQA A; 3NOC A; 1B7F A; 2XNR A; 1D09 B; 3CT9 A; 3RBX A; 2QE5 A; 2ZEJ A; 1S6Q B; 4LSZ B; 4XO0 A; 3KWM A; 2BQR A; 2VC1 A; 3MZI A; 1FWL A; 3G6Y A; 2E1C A; 2R2S A; 2OEM A; 2XYP B; 2N3O A; 3VF0 B; 5J2P A; 3TUJ C; 2W4D A; 2J0W A; 2BE2 A; 3L3C A; 2CNN B; 2CPH A; 4LFB J; 5IT9 U; 3KK3 A; 4P73 A; 2Y1L B; 2HQ3 A; 5KFD A; 3ETM A; 2BJE A; 1R0C B; 2HK2 A; 3CVK A; 3CJ0 A; 1CJK B; 2Y9H A; 1XNR F; 4M63 A; 1PSD A; 4K4X A; 3NWR A; 8AT1 B; 1ELO A; 2DNK A; 4P6Q A; 3C46 A; 2WON B; 4PG4 A; 1S6Q A; 1RTJ B; 3CCM S; 1BUX A; 3I4P A; 2XWY A; 5KFC A; 1KC8 T; 1Q5Y A; 5C42 B; 1ZS6 A; 1OQ6 A; 3S01 A; 3J7Z T; 3DDK A; 1WOR A; 1IKX B; 2MHN A; 3KG0 A; 4WFZ A; 1HW8 A; 1S59 A; 4WYL A; 1PJ6 A; 3EGN A; 5LSR A; 1RTD B; 4F4Y A; 1Y9O A; 5HMW A; 3CJQ A; 3LAK A; 2X3D A; 3I96 A; 3NGD A; 1RT6 B; 4MK9 A; 2AEM A; 1UJ6 A; 2MQP A; 2UUC J; 1UTA A; 3OTB A; 1KOO A; 1Y00 A; 4JI8 F; 1J5O B; 4LSN B; 1U47 A; 2WON A; 1RTJ A; 2YWF A; 1YK9 A; 2EW9 A; 2NYH A; 2QL5 B; 2YKN B; 2H54 B; 3W3S A; 1X31 C; 3IR5 B; 1U1K A; 3P4U B; 2KN4 A; 1KDN A; 1OSC A; 1B0P A; 1GNK A; 4NMX A; 3HT0 A; 1IKX A; 4OZ5 A; 3QT5 A; 1XR7 A; 1FXD A; 4CP5 A; 2WVC A; 4ED8 A; 2NXN A; 3CJT A; 5L9X A; 2B9Y A; 1WC0 A; 2Z2M A; 4BC7 A; 2MZ1 A; 1Q5V A; 1JLG A; 3LAL A; 5LJ5 Y; 3NGU A; 4LVN P; 3RRG A; 4NOH A; 3PFE A; 1ZH5 A; 4ED6 A; 2V8H A; 4LJM A; 4GVL A; 4LSN A; 2OP5 A; 4Y2I A; 2DY9 A; 4F4X A; 2R3V A; 4QBU A; 1NJW A; 3QWU A; 2YKN A; 4A8W A; 1VQM S; 4DX6 A; 4S0M A; 2KZM A; 3OSP A; 4DU8 A; 4OYO A; 4F0M A; 4W92 B; 2Y0B B; 3TNV A; 1ZYQ A; 2O3D A; 3NBP B; 3BSA A; 1UJ5 A; 4LR7 A; 3JSR A; 4FF1 A; 4M94 A; 3VAH A; 3KG4 A; 2ROP A; 1UCN A; 3QO9 B; 4DSF A; 3R5B A; 5GMD A; 3MFI A; 2W7P A; 4WCE Q; 3LPE A; 2UV8 A; 4MTP A; 2XMW A; 4OZ0 A; 2J0Q D; 3WHI A; 2PI4 A; 5GAG U; 4V19 J; 2PA3 A; 4G65 A; 4H4M B; 5KT5 A; 1RCO B; 3NBP A; 3MCO A; 2AJ1 A; 4C8O A; 3SV3 A; 1U45 A; 1LW0 B; 1SH3 A; 4ZJQ A; 4LFB F; 1IM4 A; 4ILM A; 3R7N B; 2A0F B; 3QO9 A; 1SUQ B; 4PYD A; 2DTJ A; 5ETP A; 3V4I B; 2RRN A; 3KLG B; 2J8A A; 4C0H A; 4EZ9 A; 1FVS A; 1NJY A; 4OHW A; 1FTC A; 2DHH A; 2OEJ A; 2YXL A; 3HHL C; 2G13 A; 1JMT A; 5F9L A; 5F0W A; 1DUR A; 4WIQ A; 3EDR B; 1L3U A; 3BF4 A; 3P8B B; 2OPQ B; 2IY5 B; 1NK4 A; 3G6V A; 3W5Y A; 3D3B J; 3KNG A; 1NZA A; 2EFO A; 1ZTW A; 1LW0 A; 2B3T B; 2VG5 A; 3R27 A; 1BQX A; 3KG1 A; 3SEO A; 3DLG A; 3CIZ A; 3OFF A; 1YTY A; 2WHO A; 1S6P B; 1D8Y A; 1S4F A; 2QFI A; 4I4B A; 3N01 A; 4LRA A; 4C48 A; 3V4I A; 3A12 A; 2QA2 A; 2HAF A; 2RNE A; 3NKY A; 1KLM A; 4ZLP A; 1EET B; 2IJR A; 1ARO P; 1DQ9 A; 4B3O A; 4MAK A; 1RWX B; 1HI8 A; 3UD3 P; 4J90 A; 3W65 A; 3D6T B; 4I56 A; 2VC0 A; 1AYE A; 1FT8 A; 4YR0 A; 1YRT A; 4IH7 A; 1C0U B; 2V8V A; 2C22 A; 1EAR A; 3I32 A; 4EFA C; 1R0A A; 4BCA A; 2OPQ A; 2HGN A; 4USJ C; 5ETQ A; 3PEH A; 2WVB A; 1WKJ A; 5IFM A; 4RUA A; 2IFX A; 3HT3 A; 4NLP A; 2P9G A; 3FUY A; 2EPI A; 4DR3 J; 4ZLJ A; 4Y0F A; 1VS3 A; 2KO1 A; 2V2K A; 3THP A; 3KUG A; 1NK9 A; 2CG4 A; 1IBC B; 5I3P A; 2RT3 A; 4OLP A; 3PRD A; 4L73 A; 1EET A; 5I42 B; 4IO1 A; 1SQG A; 1NKC A; 4B02 A; 3I0R A; 3NCP A; 4O0N A; 4KT0 C; 2COL A; 1S0O A; 4WXO A; 1MRO A; 4DLE A; 3LW5 C; 3NCR A; 2ROE A; 5JMN A; 4KGV B; 3M32 B; 2DNG A; 1TU0 B; 2VF3 A; 3G8T A; 2CPE A; 5DG9 A; 4ED7 A; 2MYF A; 1RBA A; 3HP6 A; 3VGU A; 1DJ0 A; 1OSD A; 3JQK A; 1EB0 A; 5H9E J; 2G2Z A; 2IVF B; 4LR8 A; 5GAE I; 1SQE A; 4MK8 A; 4O3R A; 1U0S A; 1X4B A; 1Y4Z B; 1WSR A; 3LUY A; 2Z2Z A; 2RH3 A; 1TUG B; 3M8R A; 3GIL A; 2GC8 A; 5HL7 Q; 3JTN A; 4RX6 A; 3PNI A; 2DGU A; 2GGP B; 3DN9 A; 3PW7 A; 2DRB A; 4IFY A; 2Z2Y B; 2JVR A; 1WI6 A; 1AXQ A; 5B0B A; 3Q89 A; 5J1N A; 3M32 A; 5E5N A; 2XY7 A; 3FEY B; 4WYW A; 2W2N P; 2KI2 A; 2LU1 A; 4DX5 A; 2QA1 A; 1HPZ B; 1C1C B; 3ZXW A; 1ZPW X; 2NRE A; 3DRR B; 4OL8 A; 1VQK S; 1UA0 A; 4UUX A; 3ZZZ A; 4CZC A; 2UVU A; 1FF2 A; 3CDE A; 2WCX A; 3K58 A; 3MDF A; 1T9W A; 4Q7A A; 2EXU A; 1XBW A; 4EWT A; 2GGP A; 2FD2 A; 3J7A 1; 4KHR A; 4MYU A; 2R7U A; 5B7W A; 2GO9 A; 2R7W A; 3BPD A; 2HQF A; 3AXM A; 1X5T A; 2CFX A; 4QIE A; 1KVI A; 1HPZ A; 2GIF A; 3R6L B; 5E3R A; 5H9F K; 3DRR A; 2HPU A; 1ACM B; 2JFK A; 3CPW R; 5A6P A; 2HLU A; 3SSS A; 4ID5 B; 3GFH A; 1K1Q A; 2HFV A; 2NCK L; 5GAG I; 4OJ1 A; 3OHA A; 3OR2 B; 3TJ9 A; 4BC9 A; 1RK8 A; 1S10 A; 2DEI A; 2FC9 A; 4ZPV R; 1LFW A; 1LEO A; 2B9E A; 2WAQ D; 4X62 J; 1QE1 B; 4RBT A; 1YJ7 A; 3TUP A; 2IC3 B; 2K3I A; 2N7C A; 1R0B G; 4WWS A; 3GIJ A; 5CYJ A; 1B4S A; 1N5Y B; 2B4P A; 4KPY A; 1DQ8 A; 3QGI A; 5SZT A; 2UXC J; 2N82 B; 2H4W B; 4C8Y A; 3MR7 A; 5DDQ C; 1WHX A; 2PMZ D; 1Z2L A; 4RBV A; 1FXR A; 1FJG F; 4FNH A; 4NEZ A; 3B54 A; 2ZWO A; 1RTH B; 4DS4 A; 2ZOM A; 1DY3 A; 2XS7 A; 3RTV A; 3IRW P; 4EYH B; 2JEG A; 4OZ1 A; 2H51 B; 2WTF A; 4A8F A; 3TX0 A; 3UD4 P; 1SXL A; 3ET6 B; 2HNZ B; 2AEJ A; 1HQU A; 1IWA A; 2IC3 A; 2FJA B; 3J81 Y; 4UOC A; 2FJX A; 3OBI A; 3DRS B; 1F60 B; 3CE8 A; 4I6W A; 5KFM A; 1N5Y A; 1F6T A; 2JFD A; 3SCK E; 3OSN A; 3EMT A; 3ZZ0 A; 4QPT A; 2QRR A; 2BKP A; 3FGV A; 1FD2 A; 4I64 A; 3CO0 P; 1RLC L; 1RTH A; 3WIU A; 4M1K A; 1MW7 A; 2MKS A; 4IOB A; 4XK8 C; 1YDL A; 2LLZ A; 5KFL A; 3O5T B; 1I3O B; 2NZC A; 1WDT A; 5LSL A; 3ET6 A; 4ECU A; 2G1D A; 3R7S B; 3MI7 X; 2WK4 A; 2HNZ A; 4N77 A; 4DL7 A; 3DRS A; 4CWB A; 4L72 B; 2KU7 A; 1FXL A; 1PYT A; 1X5O A; 2DKO B; 5GME A; 2FHJ D; 1M5K C; 3Q2S C; 1FRL A; 2IM2 A; 2HHT A; 1NH7 A; 4ZCL A; 3H2L A; 2CPI A; 4JI1 F; 3VVU A; 4QZV B; 3IXQ A; 4IDK A; 1SC4 B; 5HVF A; 4DBQ A; 4KGM A; 3HHD A; 1X9W A; 4U67 Q; 2MST A; 3BQ0 A; 2X1B A; 2DO4 A; 2HVE A; 3RRK A; 4OFZ A; 2DBB A; 3AT1 B; 3RBZ A; 4RJV A; 1VC0 A; 3AOB A; 3EIC A; 4KE5 A; 4DV2 F; 1VK8 A; 2DGO A; 4WII A; 4WFA Q; 4JB8 B; 4HR2 A; 1FI4 A; 2MDA A; 2V5H G; 4X4O A; 1FWP A; 1NPK A; 2J76 E; 1KR4 A; 4HH1 A; 3GU0 A; 4ATN A; 5I4M A; 4ZCI A; 3GG0 A; 2QLF B; 1URR A; 2BJ9 A; 1O51 A; 1QVF R; 2POK A; 1PBA A; 4DR6 J; 2VL1 A; 2HGL A; 5B08 A; 1YQH A; 4RNH A; 3T19 A; 3A3N B; 2VZ9 A; 2CPY A; 2CQ4 A; 3CDW A; 1FRH A; 2NSB A; 2ZE2 A; 4X62 F; 5K8N A; 2YWH A; 5KFU A; 2UZA A; 3ZZP A; 1EQ0 A; 3D1H A; 2HMI B; 4YB5 A; 2P5V A; 4NZ0 A; 3D6H B; 5I3U B; 4N8O A; 1MU2 B; 2PI5 A; 2ZH5 A; 4P72 A; 2ATL A; 3DLE B; 1N54 B; 4ZN1 A; 2YQ3 A; 2UXC F; 2JLG A; 3FSY A; 2UP1 A; 5HAN A; 2F4V J; 5F8I A; 4U6P A; 1DLO A; 2M70 A; 1RP5 A; 1D8Z A; 3IBF B; 3ICL A; 4IUF A; 3GYG A; 5IC4 B; 2KM8 B; 1DAR A; 1YHQ S; 2J6T A; 1T0T V; 3HI9 A; 3GJQ B; 2B0G A; 3FCH A; 3HPO A; 5KFP A; 2CJQ A; 5LXR A; 3HMJ G; 5MAO A; 1DBD A; 2HMI A; 1ZAV A; 2EC2 A; 4K5R A; 1H2V Z; 4DXL A; 2Y8W A; 2C3O A; 2KXH A; 3DXB A; 3DLE A; 2R8J A; 1BQN B; 3NRB A; 3ENV A; 1QAX A; 1LFP A; 1N6Q B; 4K4U A; 3H25 A; 3KXD A; 4PXE A; 5F3T A; 5BYQ A; 3OJU A; 1YJW S; 5F8J A; 1RT1 B; 2DNM A; 3M6X A; 3CC4 S; 4UUW A; 2DD8 S; 3HZG A; 4CLT A; 1U6F A; 2YX1 A; 4YME A; 4WFN Q; 4DR2 J; 2ASD A; 3GCX P; 4U8Y A; 3W66 A; 2KB2 A; 4GVB B; 1UMJ A; 3CC7 S; 2CVE A; 4KRW A; 4LRF A; 5DGB A; 2EVZ A; 4ZCM A; 1X4F A; 3A1Y G; 1N6Q A; 2VB6 A; 1JJC B; 3FEZ A; 3DRP B; 2C3U A; 2FLO A; 2OIH A; 5KG1 A; 2F4F A; 1SKS A; 2VG7 B; 1B0T A; 1KLN A; 4DWI A; 2BQU A; 2V4Q A; 4O23 A; 1RAF B; 1OS5 A; 3BJY A; 3PW0 A; 2H9Z A; 4ERD A; 3BH7 B; 3DRX A; 2BZ2 A; 1OMS A; 1YGY A; 3W8P A; 4FBU A; 5DS7 A; 1WG1 A; 1IBM J; 2LA6 A; 2EFQ A; 4XIU A; 4GVB A; 3UDV A; 2ZOG A; 5EUH A; 1FRI A; 1RGV A; 4DPO A; 1TK0 A; 1P9Q C; 4G1Q B; 5C25 B; 1WEX A; 2XQC A; 2NYI A; 4LF5 J; 4JI5 J; 3DRP A; 1Z4U A; 3Q22 A; 1JXL A; 1EX8 A; 3AB4 B; 1LWC A; 1UWB B; 1SJF A; 3TAN A; 3MEK A; 4IG0 B; 4U7C A; 3N28 A; 1QY7 A; 1HBM B; 1S0V A; 5AXN A; 2PGC A; 1UEK A; 1YJ9 S; 1U1M A; 5C24 B; 4ZPT R; 3TO8 A; 2IHR 1; 2QMU B; 2DHS A; 5KT7 A; 3KTQ A; 4OHV A; 1MWZ A; 5HVG A; 1JLQ B; 5KG7 A; 3CED A; 2HIY A; 4AYB D; 4KB7 A; 4G1Q A; 5C25 A; 1YIT S; 4PG7 A; 2HHX A; 1M1H A; 4RW9 A; 3TAQ A; 3ADA C; 4QW8 A; 4USH A; 1UVK A; 1T94 A; 2XMA A; 1CJU B; 1HBM A; 2PMH A; 5IWA J; 1NSP A; 5D4L A; 4AQY J; 5D0E A; 5K8M A; 2B4V A; 5C24 A; 3EVW A; 3THV A; 1RAH B; 3N9U C; 2HVD A; 1FE4 A; 3NGT A; 1NJX A; 2HK3 A; 1JLQ A; 2WB4 A; 4DR7 J; 2MZR A; 3ZTS A; 3GYX B; 3TAM A; 1NPR A; 4RNF A; 3QJL A; 1MML A; 1M5V C; 2P9E A; 4GC7 A; 3IS9 B; 3VZI A; 2D3Z A; 2ZKT A; 5F41 A; 2VD3 A; 4X4P A; 1TZ0 A; 1CQN A; 4BWM A; 2E9Z A; 4UOF A; 5M2R A; 4PZV A; 3AY0 A; 4NEY A; 1MN9 A; 3CJK B; 3QSY B; 3D4J A; 4JI0 F; 1FEH A; 1RHR B; 1AZS B; 4EYI B; 3ONQ A; 3PO5 A; 1X0F A; 2MMY A; 3C14 B; 3PYD A; 1XR5 A; 1ZET A; 2ZJQ Q; 1S1T B; 3QBC A; 2GAH C; 2VFR A; 2Z0G A; 1B7Y B; 1GXL A; 5DO2 A; 3TJA A; 3W2W B; 2BOP A; 4DR2 F; 2XZD B; 5B0A A; 5MLC V; 4UQG A; 1UVN A; 1L3V A; 2DIT A; 2CVI A; 2E66 A; 3PAC A; 1MG7 A; 2Z57 B; 2DCL A; 1F9E B; 3SI8 A; 5CQG A; 3Q0A A; 3IS9 A; 4IQM A; 3K7R A; 1WNE A; 1NB2 A; 2V63 A; 3U1M A; 1U2F A; 1IBL J; 1NO8 A; 2JZ5 A; 5GVQ A; 1D9F A; 3CJK A; 2IA0 A; 1AZS A; 2B4O A; 4FS1 A; 3HFZ B; 1M90 T; 4DCJ B; 1R31 A; 3IBW A; 1KS2 A; 2D7S A; 4NI2 B; 5AJ3 J; 1QJH A; 3BZQ A; 3OUY B; 2CQ0 A; 3W2W A; 3WC2 A; 4I1T A; 4EGL A; 3TJ8 A; 1X4H A; 2QX0 A; 5D77 A; 1TEL A; 3R1L A; 1CVJ A; 1IBM F; 1S7I A; 1AT1 B; 4RW7 B; 1Q86 T; 3FDS A; 1J2V A; 3CME S; 3MMJ A; 5A2Q U; 4FF3 A; 3KOA A; 3GE9 A; 2MQ8 A; 3JSY A; 2V67 A; 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