The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
58
|
structure length |
58
|
Chain Sequence |
NLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVNS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ABL1
|
| publication title |
Crystal structure of the Abl-SH3 domain at pH5
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
10
|
| structure length |
58
|
| sequence length |
58
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2013-03-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1NG2 A; 1K0X A; 2BZX A; 1GFD A; 1OOT A; 1ABO A; 3M0P A; 2BTT A; 1CSK A; 2LCS A; 2A08 A; 2ROL A; 4GBQ A; 1QKX A; 3EG0 A; 2NWM A; 4AFQ C; 2YUQ A; 1E6G A; 1OV3 A; 1U3O A; 3SHW A; 2GTO A; 2L3Q A; 4J9E A; 2GNC A; 3VS7 A; 1VYU A; 1ZX6 A; 5GJV B; 2DL4 A; 2KEA A; 4CC3 A; 2LX7 A; 2W10 A; 2LP5 A; 1NEB A; 4GLM A; 2H8H A; 4LNP A; 2O88 A; 4J9F A; 2O9S A; 4RTV A; 2KYM A; 2ESW A; 2A37 A; 1WIE A; 2CDT A; 4J9D A; 5IHN A; 3THK A; 1T3S A; 1M3C A; 2DIL A; 2GBQ A; 1G83 A; 3GBQ A; 1ZUK A; 2RQT A; 1QWE A; 2CT4 A; 2ED1 A; 1W70 A; 1BB9 A; 1BU1 A; 2J7I A; 2KYB A; 2MOX A; 2J06 A; 1UG1 A; 1RLQ C; 4J9I A; 3NGP A; 4AFU C; 4OMP A; 4J9C A; 2K79 A; 1SRM A; 5L23 A; 2YUP A; 1WI7 A; 2JMA A; 1Y57 A; 2CT3 A; 2FG0 A; 1WXT A; 4J9H A; 4JJC A; 1I0C A; 1YP5 A; 2FPD A; 4Z8A A; 5IH2 A; 3ULR B; 1JU5 C; 4JZ3 A; 1K4U S; 2CSI A; 2DL5 A; 3EHR A; 1N5Z A; 4LUE A; 2RQV A; 1JXO A; 3KFV A; 2GTJ A; 2RQW A; 2D0N A; 4JPB W; 2KRM A; 4AFS C; 1MV0 B; 1NLP C; 2XMF A; 2YSQ A; 1WXU A; 3VS5 A; 1KJW A; 1ABQ A; 4JJD A; 1E6H A; 1B07 A; 4CC7 A; 2DLP A; 1ARK A; 1WX6 A; 2K3B A; 4OMM A; 4IIO A; 2EGE A; 1ZUU A; 2L3P A; 4F14 A; 2VVK A; 2KNB B; 4RTT A; 1Z9Q A; 2F2W A; 4ESR A; 2KGT A; 2OI3 A; 4HVV A; 3UA6 A; 4LUD A; 3NHN A; 4R0K A; 1NLO C; 3CQT A; 1M27 C; 2V1Q A; 5IHK A; 3I5S A; 3QWX X; 2A36 A; 1HD3 A; 1HSQ A; 1OEB A; 2DJQ A; 4RTZ A; 2EYY A; 1AZG B; 2CH4 W; 2CRE A; 2ABL A; 1TG0 A; 4EIK A; 1CKB A; 1JQQ A; 2ROT A; 2C0O A; 2GGR A; 2L2P A; 2KR3 A; 2DMO A; 2EYX A; 3VRY A; 2JMC A; 3NPF A; 2D1X A; 4F16 A; 1X69 A; 4J9G A; 1AVZ C; 2L3S A; 1FMK A; 1UDL A; 1WDX A; 2HEQ A; 1M8M A; 1U5S A; 2EGC A; 2V1R A; 4LE9 A; 1Y0M A; 4A63 B; 1LCK A; 2X3X D; 2DBM A; 2LJ1 A; 3TSZ A; 2M51 A; 3JV3 A; 2M0Y A; 5IXF A; 1WLP B; 3TSW A; 1W1F A; 4ZNX A; 1QWF A; 2C0T A; 2LNH B; 3O5Z A; 2CSQ A; 2OJ2 A; 4DEY A; 4X1V A; 1V1C A; 2E5K A; 3IQL A; 1IO6 A; 1QKW A; 2MCN A; 4HVU A; 2FRW A; 4HCK A; 4KRT A; 3VS3 A; 1JXM A; 2FO0 A; 4AFZ C; 2DM1 A; 2KXD A; 1K1Z A; 1FYN A; 2AZV A; 2G6F X; 2DYB A; 1KSW A; 1MUZ A; 2O9V A; 1M3A A; 3EHQ A; 2FPE A; 2QDL A; 2EYZ A; 1H8K A; 2DBK A; 1KIK A; 1UFF A; 5FWC A; 1X2K A; 2RPN A; 5GJW B; 4D8K A; 2O2O A; 1UUE A; 2DF6 A; 2LJ3 A; 2EVR A; 3FJ5 A; 2P4R A; 1WFW A; 1T0J A; 2JS0 A; 2CH4 A; 1GBQ A; 4FSS A; 1PNJ A; 1ZBJ A; 3VS1 A; 2RMO A; 2AKK A; 2BZ8 A; 2DL3 A; 3U23 A; 1X2Q A; 1PKT A; 2DL7 A; 4AG1 C; 2SRC A; 1X43 A; 4J9B A; 2D8H A; 1QLY A; 1QCF A; 1NEG A; 2J6K A; 5IHI A; 1NYG A; 2ECZ A; 2KT1 A; 2CUD A; 2SEM A; 2YT6 A; 4Y92 A; 2HSP A; 2K9G A; 1M30 A; 2F2X A; 2YUO A; 1NYF A; 5I22 A; 1GCP A; 1AOJ A; 1SHG A; 2ENM A; 2KBT A; 2OAW A; 2ED0 A; 2FRY A; 1UTI A; 3EGU A; 3EG1 A; 2EKH A; 1TUD A; 2FPF A; 1BK2 A; 2KE9 A; 5ECA A; 2B86 A; 4ORZ A; 3QWY A; 1AWW A; 1SSH A; 3ZL7 C; 1A0N B; 2RN8 A; 1T3L A; 1JEG A; 2PTK A; 1PHT A; 2LJ0 A; 3H0H A; 1YWP A; 4M4Z A; 2DNU A; 4RTX A; 2IIM A; 1UHC A; 4DEX A; 1MV3 A; 2JT4 A; 4LN2 A; 2KRO A; 1YNZ A; 1G2B A; 1ZUY A; 2JTE A; 1PWT A; 4CC2 A; 2RQR A; 3M0Q A; 4HXJ A; 4RTW A; 2J6F A; 2RNA A; 2YUN A; 2JXB A; 1Z9Z A; 4OMO A; 1WYX A; 1I07 A; 3UAT A; 2JM8 A; 1HJD A; 3I35 A; 3VS2 A; 1B3Q A; 1RUW A; 1UEC A; 2D8J A; 2FEI A; 3H0I A; 3EG2 A; 2KXC A; 3TVT A; 4OMN A; 3PVL A; 1GFC A; 2KRN A; 2DL8 A; 2L0A A; 2K7A A; 1SRL A; 1UHF A; 2KRS A; 5HCK A; 4WCI A; 2K6D A; 2LMJ A; 1X27 A; 3RNJ A; 2VWF A; 1AWJ A; 1H92 A; 1AD5 A; 3NMZ C; 2HCK A; 1YWO A; 3UA7 A; 1J3T A; 1VYV A; 1PRL C; 5IXB A; 2AKL A; 3M0U A; 1GCQ C; 4OML A; 2K2M A; 4Z89 A; 1AEY A; 2EYW A; 3VS0 A; 1AZE A; 3A98 A; 2DX1 A; 2JW4 A; 1GCQ A; 1SPK A; 1RLP C; 2HBW A; 2J6O A; 3I9Q A; 2EW3 A; 3C0C A; 1UE9 A; 1UJY A; 1EFN A; 1T0H A; 2JM9 A; 2DA9 A; 2DE0 X; 1H3H A; 1M3B A; 1SHF A; 1K76 A; 3UF4 A; 4RTY A; 2JS2 A; 1X6G A; 4IIM A; 2LQW A; 2PZ1 A; 2DRK A; 4E6R A; 2I0N A; 2EQI A; 1RI9 A; 2GQI A; 1AWO A; 2DVJ A; 3R6N A; 1PKS A; 2VKN A; 1XOV A; 2PNI A; 4RUG A; 1VYT A; 1WA7 A; 3M0S A; 1BBZ A; 2LZ6 B; 2NUZ A; 1TUC A; 5FWB A; 1WXB A; 1U06 A; 2RF0 A; 2EPD A; 4QT7 A; 4Z88 A; 1VA7 A; 4RTU A; 3PVQ A; 1UGV A; 1ZLM A; 3M0R A; 3I5R A; 3REA B; 3SEM A; 3PE0 A; 1YN8 A; 3REB B; 2LQN A; 3H41 A; 1JO8 A; 1S1N A; 3VS4 A; 2O31 A; 1I1J A; 2DRM A; 1OPK A; 2W0Z A; 5EC7 A; 3RBB B; 2RQU A; 2X3W D; 4JJB A; 4HVW A; 1YCS B; 4F17 A; 3EG3 A; 2EGA A; 1K9A A; 1GBR A; 2CUB A; 2J05 A; 2KT8 A; 1KFZ A; 5I11 A; 1UJ0 A; 1GL5 A; 3M0T A; 1ZSG A; 2C0I A; 1K0S A; 3LH5 A; 1SEM A; 1PRM C; 4OMQ A; 2AZS A; 2BZY A; 3H0F A; 1X6B A; 1GRI A; 1E7O A; 4D8D A; 2F2V A; 3VRZ A; 2EBP A; 1AWX A; 1CKA A; 1NM7 A; 2AK5 A; 2HDA A; 3VS6 A; 4JZ4 A; 2A28 A; 1W6X A; 2MIO A; 4K11 A; 2YDL A; 4AG2 C; 1OPL A; 5FW9 A; 4CC4 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4NL2 A; 5I2S A; 1NG2 A; 2BZX A; 3VV0 A; 1QW1 A; 2KVQ G; 1KD1 C; 1VQK Q; 1D0Y A; 4GBQ A; 4LXC A; 1G3T A; 4JJN K; 3CCU T; 1ZSZ C; 2PQW A; 4LDX A; 2OTJ T; 1OV3 A; 3SD4 A; 3SHW A; 3LH0 A; 2L3Q A; 4J9E A; 3GLX A; 5GAM f; 4XU0 A; 1VQ8 T; 2DL4 A; 2QI2 A; 2LX7 A; 2CP0 A; 1X01 A; 1Q86 C; 2VUB A; 4GLM A; 2H8H A; 4LNP A; 4X9C A; 2O88 A; 2PVG B; 1FX7 A; 2DXB A; 4B6M A; 2CP5 A; 1YIJ Q; 2JUF A; 2MWO A; 4DBQ A; 2CDT A; 2MWP A; 4J9D A; 5IHN A; 4OF1 A; 2P0Q A; 4MZP A; 1G83 A; 1ZUK A; 3JB9 D; 1V29 B; 2RQT A; 3OYG A; 1QWE A; 4J7F A; 2EQM A; 3URG A; 2MOX A; 1VQ7 A; 2J06 A; 4KT0 E; 2QA4 T; 1KC8 R; 1VQ9 Q; 4KGX B; 3MEW A; 3CBM A; 4ZTJ A; 1SRM A; 2YUP A; 4AT1 B; 3G4S Q; 3JCM X; 3RKX A; 3CCR Q; 2CT3 A; 3CME T; 1I0C A; 3CC4 Q; 4OB3 B; 5M9O A; 1NZ9 A; 1JU5 C; 2A0F B; 2LDM A; 4LUE A; 1JXO A; 4A4H A; 2RQW A; 2D0N A; 3UWN A; 4XTZ A; 4AFS C; 1WXU A; 3VS5 A; 4JJD A; 2FZC B; 2OTJ Q; 1O9S A; 2CP3 A; 2EGE A; 1BCO A; 4PJO G; 1RAC B; 3BY7 A; 2KNB B; 3L2R A; 4RTT A; 4J83 A; 1Z9Q A; 1VQ8 Q; 2F2W A; 4ESR A; 2E65 A; 2KGT A; 4HVV A; 4PLI A; 4KUI A; 5GAN 5; 1NLO C; 5IHK A; 3DB3 A; 3EFO A; 2DJQ A; 4XU2 A; 2EYY A; 1AZG B; 2QGG A; 5D6Y A; 3MEU A; 4N4H A; 1RI0 A; 5GAN h; 2VGM A; 1CKB A; 1JQQ A; 3TEE A; 2ROT A; 2C0O A; 3PMT A; 2EYX A; 2BIV A; 2QAZ A; 2YHT A; 4J9G A; 2QA4 Q; 5I2M A; 1AVZ C; 4EMK A; 3V8J A; 4A4G A; 1FMK A; 1UDL A; 3F70 A; 2HEQ A; 1M8M A; 3HP9 A; 1PD1 A; 1Y0M A; 4A63 B; 1LCK A; 2DBM A; 2PUK B; 1M1G A; 2LQ8 A; 2M51 A; 2MK5 A; 1WLP B; 2DIQ A; 4C0D B; 1B34 B; 4DEY A; 3RES A; 4X1V A; 1WJR A; 5LJ5 f; 2MCN A; 1YJ9 T; 1VQO A; 1KC8 C; 4AFZ C; 1VQN T; 2KXD A; 2AZV A; 5L8R E; 2DJZ A; 3QXE B; 1KSW A; 2FVU A; 2O9V A; 3EHQ A; 1QVP A; 3CCE A; 2XDB A; 3QJY A; 2QDL A; 2EYZ A; 1KIK A; 1Y96 B; 1JJ2 A; 4JUV A; 5FWC A; 1X2K A; 5KCO A; 2RPN A; 1EX4 A; 5GJW B; 5LJ3 j; 4N0A C; 3LGF A; 2O2O A; 2CGH A; 1BKB A; 2DF6 A; 2P4R A; 1WFW A; 2GF7 A; 3CD6 A; 2E70 A; 2GFA A; 5CVI A; 3CXC P; 2YLB A; 3M55 A; 1ZBJ A; 1ZA2 B; 3CCM T; 3MPU B; 3L2W A; 2RMO A; 3E19 A; 4FW2 A; 5GAN 4; 1D0X A; 2AKK A; 4E7Z A; 2ZPH B; 1X2Q A; 2DPP B; 4PFP A; 2D6F A; 1QVF S; 4PJM A; 1PKT A; 2QGF B; 5GAN j; 4B9X A; 4O6J A; 1OI1 A; 3MET A; 4J9B A; 4N4I A; 1QCF A; 1NEG A; 2EIF A; 4F7U G; 2YT6 A; 3JCM d; 1SKU B; 2F2X A; 2ZAE A; 1PG5 B; 5I22 A; 2GFU A; 3BW1 A; 2E41 A; 3CPF A; 1AOJ A; 4BDY A; 1RL2 A; 2NUT B; 2OAW A; 2ED0 A; 2FRY A; 1UTI A; 1VQN Q; 2E5Q A; 3E9F A; 3SWN B; 2KE9 A; 5CR2 A; 1WQW A; 2QQR A; 3FLG A; 1MMA A; 1AWW A; 4BDZ A; 3E2U A; 1T3L A; 3OBW A; 1XQH A; 4M4Z A; 1I81 A; 2K5I A; 1K9M U; 2DNU A; 2C06 A; 1UHC A; 1OYX A; 2K3X A; 1MV3 A; 2LQK A; 4LN2 A; 5GMK e; 4M78 F; 2QTX A; 2JTE A; 4C92 A; 4PJO F; 4Y28 E; 4HXJ A; 1WHM A; 2CKK A; 1WHK A; 4RTW A; 1BCM A; 1PSE A; 4OMO A; 3GNF B; 3UAT A; 2JM8 A; 2V8I A; 3I35 A; 1YJN A; 1B3Q A; 2D8J A; 2FEI A; 2K2V A; 3EG2 A; 3CCM Q; 2HQE A; 4M77 G; 3ASK A; 2HKN A; 1H64 1; 1VQ4 Q; 3OBY A; 3P8D A; 2FYK A; 3VU3 C; 1WNL A; 2EJF A; 2LMJ A; 1C1A A; 3RNJ A; 1QQJ A; 4E7S A; 4RCC A; 1H3Z A; 1AD5 A; 4C5G A; 3NMZ C; 2P84 A; 4DQ2 A; 3CCQ T; 1J3T A; 1QCN A; 2JVV A; 4C8Q E; 4M7D A; 2HAX A; 2AKL A; 1W4S A; 1YHQ T; 3M0U A; 1IRE B; 1GCQ C; 4M75 C; 1LJO A; 4J7I A; 4UC4 A; 1ZA1 B; 1D0Z A; 2K2M A; 3V8K A; 4BY6 B; 3TQ7 P; 1NPR A; 5FU6 C; 2FZG B; 1BYM A; 2QYZ A; 1WHL A; 4C92 D; 3MO8 A; 2R58 A; 2LC4 A; 3MP8 A; 5J3B A; 1D1C A; 2KY9 A; 5KYW A; 4FYV B; 2KMT A; 1QVG P; 1UE9 A; 5GAO n; 4L5G A; 4C8Q B; 1UJY A; 1EFN A; 1T0H A; 1H3H A; 4HKE A; 1RAD B; 1K76 A; 3UF4 A; 4X9D A; 4X34 A; 2M16 A; 2PZ1 A; 4Q5W A; 1JB0 E; 3G71 Q; 3L2Z A; 1AWO A; 4BD3 A; 5KYY B; 1EZZ B; 2DER A; 1PKS A; 1ZSZ B; 4FSX A; 3RMQ A; 4IKF A; 1D1A A; 1MMN A; 4VUB A; 1BBZ A; 1MND A; 5FWB A; 1WXB A; 1ZBX A; 3LWH A; 3CCJ T; 3ER0 A; 2OTL T; 4RTU A; 2E6N A; 1UGV A; 3GIB A; 5CQX A; 4LDY A; 3M0R A; 3I5R A; 1YJW A; 4L59 A; 4BE1 A; 4HCZ A; 1YHQ Q; 3JCM J; 3VS4 A; 2O31 A; 2DRM A; 1VQ6 A; 2E10 A; 3JSC A; 1YIT Q; 2A7Y A; 3H6Z A; 4JJB A; 4ELZ C; 1YCS B; 4F7U F; 2MPX C; 3EG3 A; 1GBR A; 1K9M R; 2CUB A; 1KFZ A; 4HCC A; 4JRK A; 1ZSG A; 1I4K 1; 2V8J A; 4M7A F; 1S72 T; 4MZM A; 2MAM A; 3LH5 A; 4CI0 C; 1SEM A; 2AZS A; 2L8D A; 1Y07 A; 2RHI A; 3CCV Q; 3QBY A; 1E7O A; 2F2V A; 2EBP A; 1OZ2 A; 3VUZ A; 1MNE A; 1NM7 A; 4E7H A; 7AT1 B; 2QTV A; 3HRU A; 3S6W A; 1IB8 A; 3L2U A; 3CCU A; 3GOX A; 4AG2 C; 3OYB A; 3EGD A; 1IXD A; 1LOJ A; 1OOT A; 2DK3 A; 1VQM T; 3M0P A; 2L3R A; 1CSK A; 2LCS A; 2A08 A; 3H9N A; 1YI2 T; 1QKX A; 3EG0 A; 4KGV B; 2YUQ A; 1E6G A; 1TTH B; 1GXI E; 2X35 A; 2GTO A; 4A4K A; 2HL3 A; 2GNC A; 4JS4 A; 3BE3 A; 1VYU A; 5GJV B; 2NUP B; 1M2V A; 5LJ3 f; 3JB9 G; 4J9F A; 2O9S A; 2KYM A; 1WHJ A; 1VQL Q; 3THK A; 3V7R A; 2DIL A; 2F1L A; 2ED1 A; 1S72 Q; 3PNW C; 1W70 A; 1BU1 A; 3CME A; 2KYB A; 4J9I A; 4II1 A; 5GAN f; 2VYT A; 4QQ6 A; 5FU7 C; 4AFU C; 1QVF P; 3OW2 P; 4J9C A; 5L23 A; 4E2F B; 2RHZ A; 3OYI A; 1IRX A; 3QSU A; 1VQK T; 4BAC A; 1WXT A; 2FPD A; 1YP5 A; 1K9M C; 4Z8A A; 2BUD A; 3D7S B; 3CPW S; 1K4U S; 3EHR A; 3QHS A; 1NPP A; 4QVD A; 2ZZD A; 1MV0 B; 1NLP C; 4KUD K; 2CZ0 B; 1KJW A; 4M75 D; 5DLQ E; 3PGG A; 3VYH B; 3V7S A; 1YI2 Q; 1B07 A; 3CEY A; 1ARK A; 1WX6 A; 4HT8 A; 3A8L B; 2XU8 A; 2QEX A; 4FYW B; 1YIJ T; 2EQU A; 2VVK A; 4M77 E; 2OI3 A; 3CXC A; 4C0G A; 3MP1 A; 2A3L A; 2K5L A; 2COY A; 4LUD A; 5KYN A; 4R0K A; 5CO7 A; 2XHC A; 3H8Z A; 3I56 A; 1M27 C; 5HK0 A; 1HD3 A; 1OEB A; 1Q7Y U; 3M58 A; 4RTZ A; 2EJ9 A; 5CQY A; 4MMK A; 5GMK l; 2CH4 W; 4EMK C; 3QG1 A; 1VQ9 T; 4DBH A; 1TG0 A; 4EIK A; 1U1T A; 3G4S T; 4XTX A; 4A54 A; 4WF2 A; 2GGR A; 2L2P A; 2KR3 A; 1RAF B; 3CCR T; 3OS2 A; 3G7Z A; 5A0G A; 1X69 A; 4FT2 A; 3DLL A; 3FJP A; 4M77 B; 3OQ5 A; 3CC4 T; 5LJ3 e; 1WDX A; 5LJ5 g; 1U5S A; 1QMC A; 2DTO A; 1OX8 A; 1YJ9 A; 3TSZ A; 3JV3 A; 3JB9 I; 5IXF A; 2YRC A; 3CC2 A; 3HFN A; 1QWF A; 2C0T A; 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