4JRAA

Crystal structure of the botulinum neurotoxin a receptor-binding domain in complex with the luminal domain of sv2c
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
421
structure length
416
Chain Sequence
TSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
publication title Structural basis for recognition of synaptic vesicle protein 2C by botulinum neurotoxin A.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 93
structure length 416
sequence length 421
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2013-03-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4jraA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4jraA02
2CNAA 1JN2P 3WINC 1APNA 1FMMS 1LECA 4YGBA 1BLDA 1HCDA 1YBIA 3OBTA 1UX6A 3MEPA 3A23A 1CR7A 4XJWA 2F2FC 4U36A 3N7JA 4YM1A 1S1AA 5T52A 3AYAA 4LBOA 3IM5A 3HN1A 2HYKA 2TEPA 5H9SA 5IK4A 2AREA 4FOWA 2A5ZA 4RA0A 1BXHA 1LU1A 1MS0A 2WLQA 3WUCA 1GZCA 1LGBA 4J2SA 2W08A 4M00A 3IM6A 2ZACA 4YZ3A 3ATGA 1RZOB 2FFVA 1UKGA 5HPZA 1AJOA 4JCKA 4NOTA 1Q04A 3D6EA 1LOCA 3FUQA 1IS5A 3MALA 3VT1A 3VSFA 3CA3A 4IHZA 1I3HA 1JT4A 3AK0A 4D8HA 4YG0A 1WW6A 3INAA 3WLUA 2HW9A 3NBNA 4XFTA 4USOA 1W6OB 3AZZA 2E7TA 1WBCA 1BZWA 1M2TB 4OW4A 3BRGC 4DRRA 1LTEA 2ARXA 3OYWA 1TWMA 2ZAAA 1DQ0A 4XJ8A 4G6JA 1ITBA 4J2KA 2P34A 2GNTA 2CWMA 1LULA 2EALA 3FJAA 4XXPA 1SACA 2XG3A 1XQNA 2UWAA 5JOZA 2P39A 2VLCA 4I4QA 2WT0A 1V00A 4LO8B 1LU2A 4D0TA 3M1HA 2YUGA 4ZA3B 1ILR1 1WD4A 4I4UA 3I4IA 2CYFA 2A6ZA 4OZXA 3C9ZA 5CA6A 3WA1A 1PUUB 3RTJB 2FGFA 1KITA 5IT6A 2A3YA 3WDWA 2A6YA 2VH9A 1LGCA 4XTMA 2VUAA 5HCBA 3LLPA 3ZXJA 4Z8SB 5DZEA 4QBCA 2BEAA 3RS6A 1S0IA 4YGCA 3VEQA 3PVEA 3QCWA 2CL2A 4J23B 5JMCA 1Z78A 1LOEA 2ZGRA 4F83A 3O5WB 5T5JA 3WNXA 2LALA 3ZPYA 5GZGA 2ZMLA 4XJUA 3O5SA 5FNXA 5GALA 2IHOA 4LBNA 2NMNA 1V6LA 1HWOB 1RY7A 2W52A 2DU1A 4USPA 1TWEA 4Z9WB 1W6OA 1AVAC 1N1TA 1ISVA 1N47A 1G9AA 2DUPA 4X39A 3VKLA 4OEGA 3FJKA 4GAIA 2PHUA 2RQ9A 3BRFA 2P3JA 3SH4A 4ZBVB 2WT1A 3N36A 3W59A 3WDTA 3POKA 2BQPA 1WLDA 1XHBA 3IKWA 4DFSA 3BA5A 4Y1ZA 4M3CF 4ZKTB 2KM2A 2GNDA 4OWKA 2VXRA 1MC9A 2D6KA 1HQWA 4P9YA 1SLBA 1Q56A 2PHRA 5JOWA 4Y24A 3SITA 1ENSA 1BYHA 3ILFA 3NBDA 1R8NA 1I1BA 1KJRA 1S0DA 4IQPA 1QNYA 3CU1B 1FGAA 1V6IA 2V73A 3RQ0A 1LOAA 2ZQOA 1J1TA 3E8LC 5GZEA 3WO2A 2D7IA 3CRIA 2D43A 1V6XA 3QYDA 2ZABA 1KDMA 1S0EA 5E8AA 1W6MA 3M2MA 1CPMA 5AVAA 2AFGA 3W9TA 1BASA 4LO0C 4Q8KA 5FZYA 3BAQA 1JBCA 3UJ0A 1AX2A 4XMAA 5DUYA 1G9DA 4HANA 2VSAA 1PZ8A 3V0BA 1LGNA 4LO7C 1PZZA 3O0VA 2WSVA 3H6QA 1V6NA 2WRYA 1G8WA 3AYCA 1V6MA 2XB6C 4Z8BA 3APBA 1F9KA 3BAUA 2GMEA 1LJ7A 4YW5A 5BYNA 2I1BA 1DQ4A 1SR4A 3PMEA 4EFQA 3ZSLA 1S0JA 4LO2A 4XIKA 4A7KA 3A07A 4DENA 1N1YA 1BFGA 3CA5A 1W6QB 4IY9A 3H6RB 2DTWA 2AYHA 4FPJA 4I3NA 3WHTA 1HKDA 1L2HA 1RMLA 1Z4SA 2X2SA 1S0CA 4J2XA 1ULDA 2Y9XE 3F1RA 2E7QA 1ONKB 1G82A 5EHAA 3OPZA 1FNYA 3IN9A 1YRZA 2FMDA 2NYYA 6I1BA 1FN0A 1TEIA 3NBEA 2UWCA 5F9TA 1JYIA 3SH3A 1GKBA 4I4RA 3N7LA 4YOLA 1CPNA 2YROA 5FZZA 4LBQB 1N1VA 1A78A 2P37A 4XHBA 1NUNA 3WDVA 1DQ5A 1HWPB 3VV1A 4R6UB 3WOGA 4XZPA 4I0YA 2ZZJA 2PELA 1C1FA 2ZGPA 3NV2A 5LK5A 4XIOA 4FVVA 5BP5C 2E6VA 1Y7BA 2JECA 4JKQA 1W6NB 1GNZA 1S0GA 4DCKC 4EKXB 4A7YA 2NMOA 1DIWA 3KQRA 1ULEA 2PHFA 3RRDA 4Q91A 4BMBA 2YXSA 1RITA 2G4IA 2X2TA 3PVOA 5FNWA 5BQUC 3D4KA 2LTNA 2DRZA 5T54A 3WZ1A 2A70A 1JTCA 3P6JA 2NVHA 2ZGNA 3GALA 2DUQA 2WJSA 5DSSB 1J0SA 5DUVA 3H6RA 2ERFA 3N0KA 3BAVA 4LBQD 2DWRA 2ZGLA 3WCRA 1Q03A 4BOWA 4EEEB 2Z49A 3AX4A 4I4PA 1DYPA 4L4IA 1ULFA 3MW2A 1SCSA 1PWAA 2CWSA 1LENA 3V0AB 1YXWA 2DVGA 4GP3A 3AP6A 2Q3NB 5CBLA 4LO3C 4XOGA 4ZFUB 2Q9XA 3OY8A 2ZGQA 1SLLA 3BX1C 1NZKA 3AH4A 3M3EA 2Z42A 3WINA 1DQOA 3A0KA 4X37A 4UW6A 4LBQA 2C9AA 1KRIA 1BARA 2YZ4A 1QQLA 3O49A 2ES3A 3S8KA 4Y20A 2F2FA 1O4ZA 4H9WA 3Q7XA 1UZYA 3M3CA 3WUDA 1QNWA 4AYUA 41BIA 1D2SA 3NWKA 3O4OA 5DVHA 3CA6A 1Q8OA 2JD4A 3BIWE 1FQ9A 3WG3A 3EF2A 1JT3A 1W6NA 4M3CB 1LOGA 1SLAA 4I2SA 5DUUA 5JVVA 4WBCA 1FAYA 3AP9A 4Q9PA 4AGGA 4RL7A 3BADA 1LCLA 1GGPB 4H04A 4CTEA 5BVPI 1IRPA 1Z0HA 4H55A 1R8OA 1MD6A 3MW3A 4I96A 1JLYA 3O44A 21BIA 1FNZA 3PHZA 1ISWA 5D63A 3I2XA 4GXLA 4PBOA 4UW5A 3QR5A 5JOYA 1LOFC 1K5VA 1AXZA 1SLCA 4QBVA 5HCAA 4DPNA 4DQAA 3AP4A 4YW3A 1JXNA 1TIEA 2PHWA 3IAGC 5H9PA 3CRGA 4GOVA 1MVEA 3AZVA 4GALA 1FATA 5F8YA 3WV6A 3AFKA 3M3QA 3Q7YA 4FP3A 1QMJA 4J2YA 3AH1A 2P2KA 3LSDA 1EYLA 1OQLB 4C1XA 2KI4A 1N4KA 1CVNA 2WQZC 4GAFA 5I1BA 1M16A 3UDAA 1MS5A 1MVQA 3BTAA 4WVWA 3CQAA 3ILNA 1VCLA 3WCSA 1DFCA 3AKFA 1JUIA 1Q8PA 2YV8A 1LHUA 2DURA 3NV1A 4II0A 1ULGA 3VT0A 4WZFA 5HCFA 3FJDA 3UD8A 2V5YA 3A0NA 1BQPA 3SLIA 5GM0A 4I4OA 5EYXA 1W0OA 2A3XA 1DYKA 2NTDA 4YW2A 1G7YA 5IK7A 2CY6A 1FV2A 5CB7A 1OFSA 3VWCA 2VY0A 3HOMA 4FOVA 2EAKA 4XJ9A 1I1EA 4M3CA 3ZYRA 5T5LA 5FZUA 3WDUA 4ISRA 2VXTI 3AZWA 1IS3A 3N35A 2DUOA 3BAGA 1YI7A 1DQ2A 3P53A 1FWUA 5H9RA 2NN8A 4ATFA 5FRAA 3UL2A 1JW6A 4LO7B 4P0KA 2UURA 4ZFYB 1GSLA 2ZHLA 2R0HA 1YTOA 2ZMKA 2DU0A 1SBFA 3HMYA 4XDQA 1Q1UA 1DQ6A 5GLVA 2BEBA 2FFUA 3O4CA 4ASMB 3AP7A 2VU9A 3A21A 3TC2A 2NP0A 1AFCA 1QF3A 1H30A 3SNMA 4EB2B 4ATEA 4YFWA 4AGVA 1WD3A 1DHKB 1CJPA 4P0JA 4HJJA 3ZC8A 2SLIA 1G9FA 4LO1C 4XBQA 4FPHA 1TFMB 4Q2FA 3I2AA 4YM2A 1DJSB 1IS4A 1A8DA 1WBFA 3NV4A 4ZOTA 5EWSA 4I4SA 3TAYA 1HQLA 2ZBJA 1QOOA 2GDFA 1IOAA 5IUQA 3I29B 2ZHMA 2ZGMA 1GZWB 1C4RA 2WBCA 3ZXEA 4AVTA 1UPSA 2D24A 1ISYA 2BFHA 3POWA 4PCRA 2UWBA 1N3OA 1QXMA 1WCSA 4G6MA 3D7WB 1WW4A 4GKYA 4XJAA 5DG2A 1ONAA 2DVDA 4YW1A 2W39A 3AJYA 2OVUA 1BFCA 5GZCA 2GNBA 5BXSA 2YY1A 3GNEA 2R1BA 4OEEA 3FJBA 4R9CA 3RSJA 3FBYA 4LO0A 3SH5A 5E88A 3O3QA 3DUIA 5T5PA 1IKPA 4R9AA 2AENA 1AVUA 3SNVA 1ZM1A 2AGSA 3O0XA 2QYIB 1GANA 3O4AA 1GLHA 4PBPA 4YZ5A 1DGLA 3VUOA 1T4QA 2W68A 3AYDA 4XFSA 4AVVA 1KDKA 3WO4A 5BOWA 5GLUA 3BRDA 2ENRA 4FPLA 3FGMA 1QDCA 4YZ1A 3ENRA 1UZZA 1IOBA 1Q8SA 3IM0A 1SBDA 2M49A 4OUJA 4ZGRB 7I1BA 1JHNA 5KXEA 2UU8A 1PZ7A 3ZXLA 2OUJA 4FPYA 4FPCA 3VKNA 2E53A 4QKSA 1FX5A 3BAHA 3ZXKA 1EPWA 4YGDA 2Y9GA 1MS8A 3D5OA 3VKFC 2DVBA 3ZXGA 5EYYA 3AZXA 3JUTA 1GICA 1IHKA 4U2AA 4FP2A 3OJMA 1MS4A 3IPVB 3B00A 4QALA 1URXA 3KMVA 2HZ9A 2D3RA 4QD2C 4ZXKA 3DGTA 1BA7A 4QO3A 4AN6A 3UK9A 4C1WA 2D7FA 2DYCA 4P14A 1PZ9A 4ISQA 2RG9B 2A75A 4P0LA 2Q5TA 5DXDA 3B69A 1QU0A 5DZGA 2P23A 4LO2C 5DUXA 3BODA 1V6UA 2LIQA 9ILBA 4BM8A 3NV3A 1YO8A 3VT2A 1DLLA 4Q1RA 1NLSA 4R9DA 4R9BA 4I6IA 4FQZA 5GLWA 1DFQA 1MS1A 3S8JA 3ZX7A 2EXJA 4UW4A 1V6KA 3LCPA 3FLPA 3VKMA 4YM3A 3SISA 4IYBA 1DQGA 5BP5A 5G00A 4TZDA 1A3KA 2E4MC 2ARBA 1HLCA 1MZ6A 4X3AA 2GN7A 3ZVXA 1BFFA 1Q8QA 5DZFA 4GP0A 1QKQA 4XBNA 2K8RA 2D23A 5BQUA 2JKBA 2RSTA 3CA0A 4HL0A 1AX1A 1U0AA 1XYFA 1PUMB 4ITCA 1LODA 5EC5A 1ULCA 3N7MA 1CQ9A 3ZSKA 2VW0A 4XHXA 1LHVA 1YYNA 2AH2A 3ASIA 2I2SA 4XTPA 4A7ZA 4JKXB 2QN4A 3FJJA 4ZLBB 3IPVA 2AUYA 4GKXA 1W6QA 3WVJA 1G86A 1O4YA 2D20A 1CVSA 1N3QA 4FPOB 5DUWA 1ENRA 1JT5A 3BB2A 3H0OA 1AX0A 5GZDA 4HA2A 5KXBA 3T1LA 3W58A 1TTUA 1II4A 4FOQA 1XG6A 4JC1A 1WW5A 4Y1YA 2MLLB 4L8QA 3HBWA 4GOYA 2J3PA 5EG6C 4P9XA 1MACA 2AAIB 1CIWA 1N3PA 4BLJA 1WBAA 3CNAA 1VAVA 4GA9A 3BA7A 2H0BA 2MC2A 2DVFA 5EXOA 4OWJA 3I8TA 3JUUA 2DREA 2ZGSA 3U4XA 2D3PA 4YZ2A 3T1MA 4L4HA 4IONA 5SV8A 2PHXA 2GO2A 5GJ6A 3ZXDA 2GMPA 2ZGKA 2ET2A 4YW4A 4YM0A 1QOTA 1V6JA 1AF9A 2WT2A 2UUSA 1GYKA 2D6MA 1UL9A 1ZA4A 2ZHNA 4NO4A 1VALA 2SBAA 1AXKA 1YF8B 4AN7B 5JLVA 1LESA 3MW4A 4PQ9A 3OGFA 4KC3A 3NBCA 3R4SA 1G9CA 4Y1UA 3V79C 1SZ6B 1LHOA 3NJ5A 4FPKA 1FYUA 2OW4A 3AZYA 1LOFA 1AJKA 3KM5A 1HWNB 2E51A 1FWVA 4JPZA 2KKIA 4SLIA 4WVVA 3WDYA 4YG3A 1H9PA 3POYA 3A4UA 4LBJA 1H9WA 4UW3A 3ILAA 2A3WA 2VW2A 2ZGUA 2EXIA 2L5XA 4YLZA 2EXHA 2DTYA 2JDZA 1X50A 5D61A 1ENQA 2D6OX 1SFYA 2RHPA 4DEPA 3IM7A 4Y22B 3B01A 4JQ0A 2B7YA 2R16A 3A22A 2IWTB 5FREA 3B3QE 5BXRA 3O12A 4I8MA 3V0AA 2DS0A 1Z2VA 4OEFA 4BLIA 1KNMA 4QC4A 1XZZA 1ISZA 2JE7A 4W65A 1PC8B 4AVSA 4OWLA 2GN3A 3O0WA 2WSUA 1V6OA 4XXAA 4LBLA 1UAIA 2R49A 3ZXFA 1W6PB 4IZEA 3ZYPA 1GZ9A 1AVXB 3FUOA 4FOYA 3R4UA 1QDOA 1TOOA 2A6VA 2HWMA 2MIBA 3N7KA 4EFPA 1QGLA 4GWMA 4AWDA 1GV9A 1F5FA 4I4YA 2YMZA 4P6AA 1WLWA 1DZDA 4FPFA 4PC4A 2R0FA 3H6SE 3FJ9A 2A7AA 1BJQA 1CONA 2ZMNA 2KH2A 5BXPA 3WDXA 3P6IA 1UN1A 1MS3A 1SLTA 2GMMA 5GZFA 3BAOA 2ZHKA 4F34A 4XFUA 2D7RA 3RG0A 4MYEA 4ZFWB 2AXMA 1SLIA 4EFRA 2ZR1B 4G1RA 1EV2A 2AQZA 2NM1A 1W6MB 4D0ZA 3V64A 1AVBA 2A71A 1N1SA 4LO1A 3IMNA 4Q8LA 3POSA 1JOJA 3AXDA 3FJIA 3IIRA 3UD9A 1JLXA 1WW7A 5GLZA 1FV3A 3HR9A 1IILA 2P3KA 3B9CA 5JDBA 3BA4A 4TLPA 1RG8A 2ZKNA 4Y22A 4D69A 3V0BB 3K1XA 3AKIA 3UD7A 1DQ1A 1G9BA 1C1LA 5F90A 4YZ4A 4QD2B 2HWAA 4DRVA 5F5QA 2WKKA 4XMIA 3CA1A 1JQZA 4KEIA 5DG1A 4FPEA 1RIRA 1D0HA 4KEJA 5E24E 3TB0A 5JOXA 1RINA 3AJ5A 4PF5A 1KQRA 1T9FA 2Y9WC 2P3IA 4AGRA 3OJVA 1W6PA 5GLTA 2D6PA 3AJZA 5DZUA 1WLCA 3FJ8A 5IK5A 2DVAA 2D3SA 3JRRA 2A6WA 5B2HA 3LTQA 2GALA 2WNEA 3LSEA 4XYXA 4CRQA 3Q9OA 4M3CE 2F8XC 1EVTA 2CTVA 1MS9A 3JU9A 2KLLA 4BPZA 3OJ2A 4QKRA 1E0OA 4KBBA 3MPPG 1FMZA 2JE9A 3N3HA 3R05A 4K20A 3ZC9A 2K4AB 3FJFA 3C2UA 3PG0A 1LEMA 4Y26A 3WMVA 4M01A 4I4VA 2AR6A 1IKQA 3UJQA 3RMXA 3AYEA 2ZGOA 1TP0A 3FJEA 3M3OA 4JP0A 3WG1A 4FQ4A 4YFZA 4FPGA 4Q9GA 4XBLA 3WG4A 3ZSMA 1GBGA 5T55A 3RTIB 1V6VA 1HWMB 4I1EA 1DZCA 1LHWA 1HKNA 4IZXA 1B09A 3VSZA 3FJCA 5IK8A 2ZQNA 5F8SA 8I1BA 3RMYA 4CZSA 4XJZA 2ERMA 1S0FA 4X38A 3AXEA 31BIA 4Q27A 1AZDA 4K21A 2NZ9A 1GZWA 1JT7A 3PUBA 1MR5A 4I4XA 4K1ZA 1LHNA 2D6LX 3AKHA 4DS0A 3OJBA 3ILRA 4K1YA 1WBLA 3CA4A 4BQ1A 4I1BA 3L2YA 1VLNA 3T2TA 1P63A 5KXDA 3CRHA 4IY8A 2GNMA 3VKOA 4HR6C 1BLAA 4G9MA 1KJLA 1SR4C 1NXD1 3HSMA 5GAQA 2EXKA 2D44A 3OBRA 1HCEA 1LOBA 5F8WA 3USUB 1CN1A 5H9QA 2D6NA 1GNHA 2PHTA 2C5DA 4XKIA 3WHUA 2ZA9A 2E4MA 2FDBM 3OY8B 1VAMA 2FHRA 2A6XA 1K5UA 3PVNA 5T50A 1F31A 1ABRB 4TYSA 1W3AA 4YGEA 2LIEA 3FLRA 4JAWA 1JY0A 3FFZA 2EIGA 5E89A 3WG2A 5CAZA 1IS6A 3O4DA 3UJ4A 2FO1A 2XOAA 2EF6A 1ISXA 4P9WA 4Y20B 2D22A 2R1DA 1IT0A 1S0LA 3BOPA 1IJTA 3UJOA 2ESUA 1SBEA 5L73A 4YG6A 1IRAX 3HALA 1VIWB 1WUVA 4FGFA 3T8SA 1QOSA 3Q7WA 2JJ6A 1BFBA 4XE9A 3AP5A 3ZSJA 1CESA 5KXCA 1BKZA 3WMUA 1DZQA 4GWNA 1AVWB 4G9NA 5D62A 2KI6B 1S0BA 5CNAA 4LO3A 4XILA 4CJMA 5T5OA 1SCRA 1W3GA 4I30A 3F62B 1C57A 2ZGTA 4KEKA 2R9KB 1Q8VA 2DRYA 1OQ1A 2DV9A 4JRAA 1MZ5A 1QQKA 3USUA 1DBNA 2GZBA 1HDKA 1HIBA 3QLQA 3FJHA 4ENDA 2D1ZA 4BMEA 1JYCA 3CAHA 1LEDA 2Y9FA 4I7IA 3FLTA 4WV8A 1W0PA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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